王小瑋 高軍 任艷 顧俊駿 金震東 杜奕奇 湛先保 陳潔 黃浩杰 李兆申
·論著·
胰腺細針穿刺活檢組織K-ras突變檢測的診斷價值
王小瑋 高軍 任艷 顧俊駿 金震東 杜奕奇 湛先保 陳潔 黃浩杰 李兆申
目的檢測內(nèi)鏡超聲引導(dǎo)下細針穿刺穿刺物中K-ras基因的突變,探討其對胰腺癌早期診斷的價值。方法收集27例胰腺癌、9例其他惡性腫瘤及14例良性胰腺占位患者的細針穿刺物,應(yīng)用肽核酸(PNA)鉗制PCR法檢測K-ras突變。結(jié)果胰腺癌患者K-ras突變陽性率為88.9%,其他惡性腫瘤為44.4%,良性胰腺占位為35.7%,胰腺癌與其他兩種病變差異顯著(P=0.013,P=0.001)。胰腺癌與其他惡性腫瘤比較,K-ras基因突變的敏感性、特異性、陽性預(yù)測率、陰性預(yù)測率、準確率分別為88.9%、55.6%、85.7%、62.5%、80.6%,差異顯著(P=0.013);與良性胰腺占位病變比較,分別為88.9%、64.3%、82.8%、75.0%、80.5%,差異亦顯著(P=0.001)。聯(lián)合穿刺物細胞學檢查和K-ras基因突變檢測,胰腺癌的陽性率高達96.3%。結(jié)論胰腺組織穿刺物的K-ras基因突變檢測可提高胰腺癌診斷的陽性率。
胰腺腫瘤; K-ras基因; 肽核酸類; 基因診斷
超聲內(nèi)鏡引導(dǎo)下細針穿刺術(shù)(EUS-FNA)可簡單、安全地獲得胰腺組織的細胞標本。但由于不易操作等多個因素,使EUS-FNA對胰腺癌診斷的敏感性、特異性及準確性存在較大差異[1-2]。 K-ras基因突變與胰腺癌的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[3],在手術(shù)切除的胰腺癌組織中突變率可達95%[4],且?guī)缀醵技杏诘?外顯子的12密碼子,以CGT、GTT和GAT三種突變類型最為常見[5]。本文建立一種新的K-ras基因突變的肽核酸(PNA)鉗制PCR檢測方法,提高了檢測靈敏度,現(xiàn)報道如下。
一、一般資料
收集我院2008年9月至2009年6月對胰腺及鄰近臟器占位性病變進行EUS-FNA檢查的50例患者,其中男26例,女24例,平均年齡59歲。所有患者均檢測血CA19-9和CEA,并行其他影像學檢查。最后確診胰腺癌27例,其他惡性腫瘤9例(肝癌1例,惡性胃間質(zhì)瘤3例,后腹膜腺癌2例,壺腹癌3例),良性胰腺占位14例(導(dǎo)管內(nèi)乳頭狀黏液性腫瘤5例,胰腺囊腺瘤3例,非慢性胰腺炎的炎性改變4例,慢性胰腺炎2例)。
二、 FNA標本的收集及DNA的抽提
EUS-FNA由專職醫(yī)師完成。當EUS在胃內(nèi)清楚顯示病灶后,按與病灶最近的距離確定穿刺路徑。用探頭靠近并緊壓病灶相對應(yīng)的胃壁,經(jīng)活檢鉗道插入穿刺套針,用19G或22G穿刺針刺破胃壁至病灶內(nèi),在10 ml注射器負壓下對腫塊來回抽吸5~10次。細針穿刺所得大部分組織置于10%多聚甲醛中固定,常規(guī)行病理檢查,剩余組織置液氮中保存?zhèn)溆谩N茨塬@得組織時,用0.5~1 ml的生理鹽水將穿刺物沖入20 ml的液積溶液(安必平,中國),混勻后取5 ml,離心,沉淀置-80℃冰箱凍存?zhèn)溆谩JS嘁悍e溶液離心,取沉淀涂片行細胞學檢查。術(shù)后給予患者口服抗生素,無1例出現(xiàn)穿刺并發(fā)癥。
采用QIAamp DNA Micro Kit試劑盒(德國QIAGEN公司)抽提凍存組織或液積沉淀細胞的DNA。應(yīng)用分光光度計測A260和A280值,計算DNA濃度,-20℃冰箱中凍存?zhèn)溆谩?/p>
三、K-ras基因突變檢測
采用肽核酸鉗制(PNA)PCR方法。由韓國PNAGENE公司設(shè)計、合成與野生型K-ras基因12、13密碼子完全匹配的PNA。根據(jù)人K-ras基因序列用Primer5.0軟件自行設(shè)計引物序列,P1:ATAGTGTATTAACCTTATGTGTGA,P2:CCTTATGTGTGACATGTTCTAATATAGTC, P3:TTAGCTGTATCGTCAAGGCACTC,由Invitrogen公司合成。第一輪行鉗制PCR,反應(yīng)體系中含引物P1、P3和PNA。擴增條件:95℃ 3 min,94℃ 20 s、70℃PNA結(jié)合15 s、58℃ 20 s、72℃ 30 s,40個循環(huán),最后72℃ 5 min。取第一輪產(chǎn)物作為模板進行第二輪PCR,反應(yīng)體系中含引物P3和P2。擴增條件:95℃ 3 min,94℃ 20 s、58℃ 20 s、72℃ 30 s, 35個循環(huán),最后72℃ 5 min。擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳、自動成像系統(tǒng)攝影。并將擴增條帶送Invitrogen公司測序。
四、統(tǒng)計學方法
采用統(tǒng)計軟件SPSS16.0進行數(shù)據(jù)分析,采用Fisher′s Exact Test方法檢驗各自率之間的差異,顯著性差異水準為P<0.05。
一、細針穿刺物K-ras基因突變率
胰腺癌的K-ras突變陽性率為88.9%(24/27),其中GGT→GAT 12例,GGT→GTT 10例,GGT→GCT 1例,GGT→CGT 1例,測序圖見圖1。其他惡性腫瘤的突變陽性率為44.4%(4/9),其中GGT→GAT 2例,GGT→GTT 1例,GGT→GCT 1例。良性胰腺占位的突變陽性率為35.7%(5/14),GGT→GAT 3例,GGT→GTT 2例。
圖1 檢測到的4種代表性K-ras 12密碼子突變的測序圖
二、K-ras突變對胰腺占位的診斷價值
本組胰腺癌、其他惡性腫瘤、良性胰腺占位患者的CA19-9的陽性率(≥37 U/L)分別為55.6%(15/27)、22.2%(2/9)、28.6%(4/14),CEA陽性率(≥10 U/L)分別為25.9%(7/27)、44.4%(4/9)、7.1%(1/14);其他影像學檢查診斷準確率分別為55.6%(15/27)、22.2%(2/9)、28.6%(4/14);FNA穿刺物組織細胞學診斷陽性率分別為59.3%(16/27)、22.2%(2/9)、0。聯(lián)合細胞學檢查和K-ras基因突變檢測,胰腺癌的陽性率高達96.3%。胰腺癌與其他惡性腫瘤比較,穿刺物K-ras突變的敏感性、特異性、陽性預(yù)測率、陰性預(yù)測率、準確率分別為88.9%、55.6%、85.7%、62.5%、80.6%,相差顯著(P=0.013);與良性胰腺占位病變比較,分別為88.9%、64.3%、82.8%、75.0%、80.5%,差異亦顯著(P=0.001)。而其他惡性腫瘤與良性胰腺占位的K-ras突變無顯著差異(P=1.00)。
由于胰腺癌缺乏特異性癥狀,約有85%的患者失去手術(shù)機會,故如何提高胰腺癌的診斷水平成為改善胰腺癌患者預(yù)后的主要環(huán)節(jié)。腫瘤相關(guān)基因的分子生物學檢測與內(nèi)鏡影像學檢查聯(lián)合診斷方法可能是目前發(fā)現(xiàn)早期胰腺癌的有效方法之一。既往報道[6],胰腺癌K-ras基因突變率在75%~95%,癌前病變PanIN-1a、1b及2-3標本中K-ras的突變率分別為 36%、44%和87%,所以檢測胰腺組織K-ras突變有助于早期胰腺癌的發(fā)現(xiàn)。
檢測K-ras突變的方法較多,對于EUS-FNA穿刺物主要采用PCR-SSCP和PCR-RELP方法。PCR-RELP僅可檢測12密碼子的突變,需要兩次PCR和兩次酶切,步驟繁瑣[7-8];PCR-SSCP對于混有大量正常組織的檢測標本易出現(xiàn)假陰性[9]。本研究采用肽核酸鉗制PCR技術(shù)[10],利用PNA與完全匹配的DNA結(jié)合的穩(wěn)定性遠遠高于不能完全匹配的DNA這一特性[11],在第一輪PCR引物退火之前引入PNA,使PNA與野生型模板結(jié)合,從而在退火期和延伸期抑制野生型模板的擴增。通過設(shè)計套式擴增引物,在第二輪PCR時將第一輪擴增產(chǎn)物有效放大,且同時檢測K-ras12、13密碼子的突變。應(yīng)用該法,本組胰腺癌的檢測靈敏度為88.9%,明顯高于以往文獻報道,聯(lián)合組織細胞學結(jié)果,靈敏度高達96.3%。在EUS-FNA活檢物檢測K-ras突變對以下患者具有潛在的診斷價值:(1)當找到可疑細胞時,K-ras突變陽性幾乎可確定為惡性腫瘤; (2)當細胞學樣品不足或未找到惡性細胞時,K-ras突變陽性可高度提示惡性腫瘤的診斷,但必須聯(lián)合其他臨床檢測進行綜合診斷。
本組2例未獲得影像學、血清學或組織細胞學的明確診斷,通過檢測穿刺物的K-ras突變而明確診斷,提高了胰腺癌的診斷率。
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2009-10-23)
(本文編輯:呂芳萍)
ThevalueoftheK-rasmutationsinFNAsamplesofpancreasonthediagnosisofpancreaticcancer
WANGXiao-wei,GAOJun,RENYan,GUJun-jun,JINZhen-dong,DUYi-qi,ZHANXian-bao,CHENJie,HUANGHao-jie,LIZhao-shen.
DepartmentofGastroenterology,ChanghaiHospital,SecondMilitaryMedicalUniversity,Shanghai200433,China
LIZhao-shen,Email:lizhaoshen111@yahoo.com.cn
ObjectiveTo investigate the diagnostic value of the K-ras mutations in FNA samples for early detection of pancreatic cancer.MethodsFNA samples of 27 patients with pancreatic cancers, 9 patients with other malignant tumors and 14 patients with non malignant pancreatic mass (NMPM) were collected. DNA was extracted, and K-ras gene was amplified through PNA-mediated PCR clamping, the products were sequenced to determine the mutation type.ResultsThe positive rate of K-ras mutations in pancreatic cancers, other malignant tumors and NMPM were 88.9%, 44.4%, 35.7%. There was significant difference in K-ras gene mutations in FNA samples between pancreatic cancer and other malignant tumors (P=0.013) and NMPM (P=0.001). The sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, accuracy of K-ras mutations in FNA samples of pancreatic cancers were 88.9%, 55.6%, 85.7%, 62.5%, 80.6% when compared with other malignant tumors, and the difference between the two groups was significant (P=0.013);Those were 88.9%, 64.3%, 82.8%, 75.0%, 80.5% when compared with NMPM, and the difference between the two groups was significant (P=0.001). When cytology of FNA samples and K-ras mutations was combined, the positive rate of pancreatic cancer was up to 96.3%.ConclusionsThe detection of K-ras mutations in EUS-FNA samples helped improve the positive diagnostic rate of pancreatic cancer.
Pancreatic neoplasms; K-ras gene; Peptide nucleic acids; Gene diagnosis
10.3760/cma.j.issn.1674-1935.2010.05.008
國家自然科學基金(2006BAI02A12)
200433 上海,第二軍醫(yī)大學長海醫(yī)院消化內(nèi)科
李兆申,Email:lizhaoshen111@yahoo.com.cn