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    植物非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系及其應(yīng)用

    2025-04-06 00:00:00馮夢(mèng)琦王若雨司馬璐姜楠翟曉巧趙振利范國(guó)強(qiáng)

    關(guān)鍵詞植物遺傳轉(zhuǎn)化;非組培;農(nóng)桿菌;基因編輯;基因型不依賴

    高效穩(wěn)定的植物遺傳轉(zhuǎn)化體系是解析基因功能、定向改良植物性狀的重要工具和關(guān)鍵手段[1-2]。常規(guī)雜交育種存在生殖隔離、育種周期長(zhǎng)等障礙,而利用基于植物遺傳轉(zhuǎn)化的基因編輯技術(shù),可以定向操作基因,改良性狀,有效規(guī)避上述問(wèn)題,加速育種進(jìn)程[3-4]?,F(xiàn)有的植物遺傳轉(zhuǎn)化方法包括農(nóng)桿菌介導(dǎo)法[4]、花器官侵染法[4]、病毒載體傳遞法[5-8]、粒子轟擊法[1]、花粉管通道法[1]、納米傳遞法等[9]。其中,農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化由于效率高、拷貝數(shù)低、可靠性高,應(yīng)用最廣泛[4]。用于植物遺傳轉(zhuǎn)化的農(nóng)桿菌主要有根癌農(nóng)桿菌和發(fā)根農(nóng)桿菌2種類型,分別含有Ti質(zhì)粒和Ri質(zhì)粒,其上有一段T-DNA,農(nóng)桿菌通過(guò)侵染植物傷口進(jìn)入細(xì)胞后,將T-DNA插入到植物基因組,2類農(nóng)桿菌誘導(dǎo)的器官類型不同,其中發(fā)根農(nóng)桿菌主要誘導(dǎo)再生陽(yáng)性根,而根癌農(nóng)桿菌誘導(dǎo)再生陽(yáng)性芽[10]。由于植物細(xì)胞具有多能性和全能性,多種細(xì)胞具備發(fā)育成各種器官和完整植株的潛能[11]。傳統(tǒng)的農(nóng)桿菌介導(dǎo)的植物遺傳轉(zhuǎn)化的受體材料多為離體植物組織,包括無(wú)菌種子、幼胚、葉片、上胚軸、下胚軸、愈傷組織等[1]。然而該方法受多種因素限制,首先需要建立高效穩(wěn)定的離體再生體系,其次該方法對(duì)植物基因型也有一定的偏好性,且轉(zhuǎn)化細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程昂貴、復(fù)雜、持續(xù)時(shí)間長(zhǎng)、轉(zhuǎn)化效率低。目前在37萬(wàn)個(gè)植物物種中,僅0.1%建立了穩(wěn)定的遺傳轉(zhuǎn)化體系,大量植物仍未建立組培條件下根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化體系[12]。擬南芥利用浸花法進(jìn)行穩(wěn)定的遺傳轉(zhuǎn)化,有效避免了繁瑣的組培過(guò)程,為非組培遺傳轉(zhuǎn)化提供了重要參考[13]。早期發(fā)現(xiàn)在非組培條件下利用發(fā)根農(nóng)桿菌懸浮液注射菜豆葉結(jié)節(jié)處,可以形成大量的毛狀根,轉(zhuǎn)化效率高達(dá)70%~90%,該方法為發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)遺傳轉(zhuǎn)化提供了重要參考[14]。近年隨著基因編輯技術(shù)快速發(fā)展,利用遺傳轉(zhuǎn)化和基因編輯技術(shù)創(chuàng)制優(yōu)良新種質(zhì)取得了顯著成效[15]。雖然植物細(xì)胞具有多能性和全能性,但并非所有細(xì)胞都能再生,生殖器官或分生組織由于細(xì)胞分化程度低而具有較強(qiáng)再生能力[16-17]。非組培條件下生長(zhǎng)的植物,其腋芽分生組織、莖分生組織都具有強(qiáng)再生能力,可作為遺傳轉(zhuǎn)化的受體材料。近年非組培遺傳轉(zhuǎn)化方法不斷被建立和優(yōu)化[4]。本文總結(jié)了近年來(lái)建立的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系及其在植物基因編輯中的應(yīng)用,并展望非組培遺傳轉(zhuǎn)化的發(fā)展趨勢(shì),旨在為更多物種建立高效、簡(jiǎn)便、基因型不依賴的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系提供參考。

    1 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系

    農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化主要借助植物有性和無(wú)性繁殖方式,利用植物自身再生能力,獲得轉(zhuǎn)基因再生器官或再生植株,其遺傳轉(zhuǎn)化效率高,在植物中應(yīng)用廣泛[4]。目前常用的農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化主要包括:花器官侵染法、切-浸-芽(cutdip-budding,CDB)遞送法、依賴再生活力的活體注射遞送法(regenerativeactivity-dependentinplantain?jectiondelivery,RAPID)、種子侵染法、發(fā)育調(diào)控基因(developmentregulatory,DR)輔助轉(zhuǎn)化法和病毒遞送法。

    1.1 花器官侵染法

    花器官侵染法最早在擬南芥中建立,其做法是將開(kāi)花早期的擬南芥花序浸泡在農(nóng)桿菌菌液中,并進(jìn)行真空滲透處理,農(nóng)桿菌進(jìn)入子房將攜帶目的基因的T-DNA插入卵細(xì)胞基因組,借助有性生殖方式直接獲得轉(zhuǎn)基因種子(圖1A)。該方法無(wú)需組織培養(yǎng)和再生步驟,操作簡(jiǎn)單,周期短[13]。在擬南芥中利用該方法創(chuàng)制了大量(gt;2萬(wàn))T-DNA插入系,構(gòu)建了多個(gè)突變體庫(kù),突變位點(diǎn)幾乎覆蓋擬南芥基因組中的全部基因,為正向遺傳學(xué)研究和基因功能互補(bǔ)驗(yàn)證提供了可靠材料[18-19]。我國(guó)研究人員利用噴霧法代替花序浸泡,成功創(chuàng)制了2萬(wàn)個(gè)獨(dú)立轉(zhuǎn)化株系,構(gòu)建了攜帶激活標(biāo)簽的功能獲得型擬南芥突變體庫(kù)[20]。噴霧法代替浸花法,為大規(guī)模轉(zhuǎn)化提供了便利,且轉(zhuǎn)化效率相當(dāng)[21]?;ㄐ蚯秩痉ǔ龖?yīng)用于十字花科植物北方小油菜[22]、甘藍(lán)型油菜[23-24]、蘿卜[25]、芥菜[26]、白菜[27]和鹽芥[28]外,也被應(yīng)用于重要的農(nóng)作物小麥[29-30]和大豆[31],以及經(jīng)濟(jì)作物苜蓿[32]等。盡管浸花法遺傳轉(zhuǎn)化體系已在多個(gè)物種中被建立,但由于其轉(zhuǎn)化效率較低,普遍在0.01%~4%之間[18-32](表1),且受植物發(fā)育時(shí)期影響較大,多數(shù)植物以初花期最佳,轉(zhuǎn)基因后代需自交篩選獲得純合體,耗時(shí)較長(zhǎng),因此該方法適用于生長(zhǎng)周期短且自交親和植物?;ㄆ鞴偾秩痉ǔㄐ蛲?,花藥、花粉、花梗和柱頭也被用作農(nóng)桿菌介導(dǎo)遺傳轉(zhuǎn)化的外植體。報(bào)春花以花梗作為外植體進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化,由于活體再生能力差,仍需通過(guò)組織培養(yǎng)途徑獲得轉(zhuǎn)基因再生植株[33]。農(nóng)桿菌介導(dǎo)的花器官浸染法目前仍是擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化應(yīng)用最廣泛的方法,該方法為非組培遺傳轉(zhuǎn)化提供了重要借鑒,為后期非組培遺傳轉(zhuǎn)化的快速發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。

    1.2 切-浸-芽遞送法

    花器官侵染法在外植體選擇上具有一定的局限性,研究人員開(kāi)發(fā)了以植物營(yíng)養(yǎng)器官為外植體的普適性更廣的遺傳轉(zhuǎn)化方法,稱為切-浸-芽(CDB)遞送法[12],該方法主要是借助于植物無(wú)性繁殖方式進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化。CDB遞送法最早在橡膠草中建立,該方法主要包括4步:切取根段-蘸菌-誘導(dǎo)生根-根誘導(dǎo)生芽,最終獲得完整的轉(zhuǎn)基因植株(圖1B)[12]。橡膠草的根具有芽原基,當(dāng)根系與母體分離后,芽原基分化形成不定芽伸出地面形成完整植株。利用根進(jìn)行無(wú)性繁殖的草本植物繡球小冠花、塊根植物甘薯和木本植物臭椿、遼東楤木和臭茉莉等均能通過(guò)CDB法獲得轉(zhuǎn)基因植株[12]。CDB轉(zhuǎn)化效率雖在不同物種中存在較大差異,但在多個(gè)物種中均表現(xiàn)出極高的轉(zhuǎn)化效率,再生陽(yáng)性根的效率普遍在10%~90%之間,再生陽(yáng)性芽的效率在2%~80%(表1),相較于浸花法提高10倍左右,為高通量遺傳轉(zhuǎn)化提供了有利的技術(shù)保障[12]。CDB方式包括4個(gè)步驟,周期約為14周,耗時(shí)相對(duì)較長(zhǎng),為了進(jìn)一步縮短轉(zhuǎn)化周期,研究者開(kāi)發(fā)了更加簡(jiǎn)便的3步侵染法,稱為極簡(jiǎn)切-浸-芽系統(tǒng)(extremelysimplifiedcut-dip-budding,ES-CDB)(圖1C),該方法直接以橡膠草的根作為外植體,蘸取固體培養(yǎng)基中的發(fā)根農(nóng)桿菌,放在濕潤(rùn)的蛭石上直接誘導(dǎo)不定芽,省略了誘導(dǎo)毛狀根的步驟,將遺傳轉(zhuǎn)化周期縮短至2周左右,ES-CDS相較于傳統(tǒng)CDB,更加簡(jiǎn)便且快速[34]。CDB在多個(gè)具有無(wú)性繁殖能力的物種中也得到了應(yīng)用,包括藥用植株荊芥、地黃、丹參和蒙古蒲公英[35],以及多肉植物雙子葉長(zhǎng)壽花、玉樹(shù)和單子葉虎尾蘭[36]。自然界中有許多植物可利用根進(jìn)行無(wú)性繁殖,特別是具有根蘗繁殖能力的植物,例如菊科植物和木本植物尤為普遍,包括紫莖澤蘭、萬(wàn)壽菊、楊樹(shù)、棗樹(shù)等,盡管這些植物都已建立了遺傳轉(zhuǎn)化體系,但均需要經(jīng)歷組織培養(yǎng)過(guò)程,且部分物種存在轉(zhuǎn)化效率低的問(wèn)題[37-41],因此有必要建立CBD遞送法,簡(jiǎn)化操作、提高效率、縮短周期。

    發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)的CDB遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng),具有操作簡(jiǎn)便、轉(zhuǎn)化效率高的特點(diǎn),在無(wú)性繁殖能力弱或不具有根蘗繁殖能力的植物中得到了廣泛的應(yīng)用,如木本果樹(shù)柑橘[42-44]、桃[45]、杜梨[46]、茶樹(shù)[47]以及十字花科的大白菜[48]等,這些植物通過(guò)CDB遞送法獲得了陽(yáng)性根,但由于其根系難再生芽,無(wú)法獲得完整的轉(zhuǎn)基因再生植株,嚴(yán)重阻礙了其在分子育種中的應(yīng)用。但對(duì)于根系生物學(xué)特性的研究,由于其不必獲得完整的再生轉(zhuǎn)基因植株,利用發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化,可在短時(shí)間內(nèi)獲得大量的轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性根,可應(yīng)用于研究根系的抗寒、抗旱等抗逆相關(guān)性狀[44]。在麻風(fēng)樹(shù)和柑橘中也利用類似于CDB的方法進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化,通過(guò)去除地上部頂端分生組織,在傷口處蘸取菌液,誘導(dǎo)分生組織再生陽(yáng)性芽,待陽(yáng)性芽長(zhǎng)大后觀察地上部表型,該方法也被稱為植物原位轉(zhuǎn)化法(圖1D);可有效規(guī)避根再生芽的過(guò)程,比較適用于無(wú)根蘗繁殖能力且僅需觀察地上部性狀的木本果樹(shù)等[49-51]。CDB相比于浸花法,可以選擇根段、莖和葉片等多種營(yíng)養(yǎng)器官作為外植體,不經(jīng)歷有性生殖過(guò)程,后代無(wú)需多代自交,具有應(yīng)用范圍廣、周期短、操作簡(jiǎn)便等特點(diǎn);特別是針對(duì)難轉(zhuǎn)化的多年生木本植株具有極大的應(yīng)用潛力,且利用發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化,再生根或再生芽來(lái)源于單細(xì)胞,有效避免了轉(zhuǎn)基因嵌合現(xiàn)象。

    1.3 依賴再生力的活體注射遞送法

    依賴再生力的活體注射遞送法(RAPID)也屬于植物原位轉(zhuǎn)化的一種,主要依賴于植物細(xì)胞本身的再生能力,該方法根據(jù)植物分生組織再生能力強(qiáng)的特點(diǎn),在去除原有分生組織基礎(chǔ)上,利用注射器將農(nóng)桿菌遞送至分生組織周?chē)@得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性芽或陽(yáng)性根[52]。注射侵染后的莖切面觀察發(fā)現(xiàn)新生組織(轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性芽或陽(yáng)性根)起始于韌皮部的分生組織[53]。該方法與CDB方法類似,借助于植物無(wú)性繁殖方式,誘導(dǎo)轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性芽或陽(yáng)性根形成完整的轉(zhuǎn)基因植株[12,53]。在甘薯中,通過(guò)莖節(jié)的上端或下端注射根癌農(nóng)桿菌,直至菌液從其他針孔或切口處流出,以保證農(nóng)桿菌被遞送至韌皮部,韌皮部的分生組織被感染后再生陽(yáng)性根或陽(yáng)性芽,切取再生陽(yáng)性根或芽,利用莖扦插或塊根無(wú)性繁殖方式獲得再生植株(圖1E)[53]。該方法在甘薯6種不同基因型品種中都具有較高的轉(zhuǎn)化效率(12.5%~37.5%)(表1),表現(xiàn)出基因型不依賴潛力。該方法在馬鈴薯、月桂草、三七和百合等多種植物均成功獲得了轉(zhuǎn)基因植株[53-54]。在煙草、金魚(yú)草和番茄中,注射農(nóng)桿菌進(jìn)行侵染,再生陽(yáng)性芽效率較低,利用Wuschel(WUS)或PLETHORAs(PLT5)等發(fā)育調(diào)控基因協(xié)助轉(zhuǎn)化,可顯著提高獲得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性芽的效率[52,55]。在甘薯中比較RAPID與傳統(tǒng)的組培遺傳轉(zhuǎn)化方法,發(fā)現(xiàn)RAPID轉(zhuǎn)化周期僅需3~10周,組培方法需24~40周,轉(zhuǎn)化周期至少縮短75%;RAPID轉(zhuǎn)化效率為28%~40%,組培方法則為0.004%~0.2%,轉(zhuǎn)化效率至少提高100倍;可見(jiàn),RAPID相比組培方法更簡(jiǎn)便和高效。相較于CDB只是將農(nóng)桿菌涂在傷口處,RAPID的農(nóng)桿菌在后續(xù)共培養(yǎng)過(guò)程中再遞送至分生組織,且利用注射器施加外壓將菌液直接遞送至植物分生組織,侵染效果更佳。

    1.4 種子侵染法

    基因型依賴是植物遺傳轉(zhuǎn)化應(yīng)用于分子育種的主要障礙,盡管在許多物種中已建立了穩(wěn)定的遺傳轉(zhuǎn)化體系,但僅在少數(shù)基因型中適用,打破基因型依賴是遺傳轉(zhuǎn)化廣泛應(yīng)用于分子育種的前提[56]。植物種子中的胚包含有初生分生組織,具有發(fā)育成完整植株的能力,常作為遺傳轉(zhuǎn)化的受體材料[4]。以萌發(fā)種子作外植體的非組培遺傳轉(zhuǎn)化方法最早在擬南芥中建立,將萌發(fā)的擬南芥種子與農(nóng)桿菌菌液共同浸泡24h,將侵染后的種子轉(zhuǎn)移到濕潤(rùn)的蛭石進(jìn)行培養(yǎng),可獲得轉(zhuǎn)基因植株并收獲轉(zhuǎn)基因種子,該方法操作簡(jiǎn)便且有效避免了漫長(zhǎng)的組織培養(yǎng)過(guò)程,但其轉(zhuǎn)化效率最高僅有0.32%,顯著低于擬南芥浸花法(4%),未成為擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化的主流方法[57]。但該方法相較于花器官侵染法不受花發(fā)育時(shí)期的影響,相較于切-浸-芽方法可應(yīng)用于再生能力弱的植物。對(duì)于大多數(shù)通過(guò)種子繁殖的植物特別是農(nóng)作物和經(jīng)濟(jì)作物,種子作為遺傳轉(zhuǎn)化外植體可以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模侵染(一次可侵染幾千到幾萬(wàn)顆種子)[57],方便構(gòu)建突變體庫(kù),創(chuàng)制大量轉(zhuǎn)基因新種質(zhì),培育優(yōu)良新品種。在菌液浸泡種子時(shí),利用超聲波和真空滲透處理可有效提高種子的轉(zhuǎn)化效率,在花生[58]、大豆[59]、棉花[60]和柑橘[44]等植物中都有應(yīng)用,且都表現(xiàn)出不受基因型限制的潛力(圖1F)。以花生萌發(fā)后的半種子(胚和一半胚乳)作為外植體,通過(guò)超聲處理和真空滲透法結(jié)合,顯著提高轉(zhuǎn)化效率至31.3%~38.6%(表1),相較于早期擬南芥種子侵染法效率提高100倍左右,且該方法對(duì)花生5種基因型均適用,不受基因型限制[58]。利用該方法在50多個(gè)品質(zhì)優(yōu)良的商業(yè)化大豆品種中進(jìn)行轉(zhuǎn)化,均獲得轉(zhuǎn)基因再生植株,轉(zhuǎn)化效率可達(dá)30%左右(表1),充分表明該方法在大豆中不受基因型依賴,可用于遺傳改良[59]。在檸檬、枳殼、甜橙和柚子4個(gè)不同基因型的柑橘中,以萌發(fā)的種子作為外植體,利用發(fā)根農(nóng)桿菌進(jìn)行侵染,并抽真空10min,可獲得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性根,轉(zhuǎn)化效率均高于50%,其中檸檬和柚子的轉(zhuǎn)化效率高達(dá)90%以上[44](表1)。該遺傳轉(zhuǎn)化方法在多個(gè)物種中都表現(xiàn)出轉(zhuǎn)化效率高和基因型不依賴的特性,被命名為不依賴基因型的轉(zhuǎn)化方法(GIFT)。然而該方法并非適用于所有的物種,例如在單子葉植物玉米[61]、高粱[62],以及果樹(shù)葡萄[63]中利用未成熟的胚或敗育的胚作為外植體,在無(wú)外界輔助條件下,仍難獲得高效的轉(zhuǎn)化效率。此外,對(duì)于高度雜合的植物,后代會(huì)出現(xiàn)性狀分離,所以不同轉(zhuǎn)基因植株之間的性狀分離會(huì)影響轉(zhuǎn)基因植物表型分析的準(zhǔn)確性。盡管GIFT存在一些弊端,但由于其具有操作簡(jiǎn)便,轉(zhuǎn)化外植體基數(shù)大,不受再生能力和基因型限制等優(yōu)勢(shì),在植物遺傳改良和分子育種中具有廣泛的應(yīng)用前景。

    1.5 發(fā)育調(diào)控(DR)基因輔助轉(zhuǎn)化法

    盡管依靠植物無(wú)性繁殖的特點(diǎn)和自身的強(qiáng)再生能力,在多個(gè)物種中建立了非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系,但自然界仍有許多植物由于再生能力弱,而無(wú)法建立高效的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系。植物發(fā)育調(diào)控基因輔助轉(zhuǎn)化,可以打破基因型限制,顯著提高了植物的再生能力和轉(zhuǎn)化效率[55-56,64]。利用發(fā)育相關(guān)基因輔助轉(zhuǎn)化,許多難轉(zhuǎn)化的單子葉植物或基因型建立了高效穩(wěn)定的轉(zhuǎn)化體系,例如高粱、水稻和玉米等[64]。隨后,大量發(fā)育調(diào)控基因被報(bào)道可以提高轉(zhuǎn)化效率,包括Babyboom(BBM)[64]、WUS[64]、WUSCHELRE?LATEDHOMEOBOX5(WOX5)[65]、PTL[55]、iso?pentenyltransferase(ipt)[52]、WOUNDINDUCEDDEDIFFERENTIATION1(WIND1)[55]、EN?HANCEDSHOOTREGENERATION(ESR1)、growthregulatorfactor?GRFinteractingprotein(GRF?GIF)[56,61]等。在難轉(zhuǎn)化的玉米自交系中過(guò)量表達(dá)ZmBBM和ZmWUS,成功獲得了轉(zhuǎn)基因再生植株,轉(zhuǎn)化效率超40%[64]。在單子葉植株高粱未成熟胚、甘蔗愈傷組織和水稻愈傷組織中異源表達(dá)ZmBBM和ZmWUS,也可以提高轉(zhuǎn)化效率[64]。BBM和WUS單獨(dú)或同時(shí)過(guò)表達(dá),已被廣泛應(yīng)用在多個(gè)物種中以提高轉(zhuǎn)化效率,例如果樹(shù)葡萄[63]和禾本科植物畫(huà)眉草、柳枝稷、美洲千尾草、狐尾草、先鋒春小麥、黑麥、大麥等[66]。過(guò)量表達(dá)WOX5可以顯著提高蘋(píng)果和獼猴桃遺傳轉(zhuǎn)化再生效率和轉(zhuǎn)化效率[65]。然而,持續(xù)過(guò)表達(dá)BBM和WUS2會(huì)產(chǎn)生葉片扭曲、降低育性等影響植物正常發(fā)育的不利性狀[67-68]。為解決以上問(wèn)題,可通過(guò)切除輔助轉(zhuǎn)化的發(fā)育相關(guān)基因或?qū)⑤o助轉(zhuǎn)化的基因和轉(zhuǎn)化的目標(biāo)基因分別插入不同載體,篩選獲得目標(biāo)轉(zhuǎn)化基因卻不攜帶輔助轉(zhuǎn)化子的轉(zhuǎn)基因植株[67],但以上方法均存在一定隨機(jī)性和工作量大等問(wèn)題。而GRF-GIF嵌合基因或GRF5在促進(jìn)遺傳轉(zhuǎn)化的同時(shí)不會(huì)使植物發(fā)育異常,在多個(gè)物種中被報(bào)道,包括小麥[69]、柑橘[69]、大麻[70]、高粱[62]、大豆[71],且BBM-GRF-GIF(BGG)組合在提高玉米轉(zhuǎn)化效率的同時(shí)也未引起發(fā)育異常[72]。因此,GRF-GIF嵌合基因具備輔助難轉(zhuǎn)化植物遺傳轉(zhuǎn)化的優(yōu)良屬性。以上研究多在組培條件下促進(jìn)轉(zhuǎn)化效率的提升。在非組培條件下,將WUS2與細(xì)胞分裂素生物合成基因異戊烯基轉(zhuǎn)移酶(ipt)組合,即過(guò)量表達(dá)Wus2-ipt組合顯著提高煙草再生芽能力[52](表1);在金魚(yú)草和番茄中,利用農(nóng)桿菌在莖尖分生組織處注射攜帶PLT5、WIND1和ESR1基因的過(guò)量表達(dá)載體,顯著促進(jìn)了傷口部位愈傷組織形成和芽再生[55]。PTL5在組培條件下促進(jìn)甘藍(lán)的再生和遺傳轉(zhuǎn)化,以及甜椒體胚的形成,表明發(fā)育調(diào)控因子在組培和非組培的應(yīng)用具有普適性[55](表1),其他發(fā)育調(diào)控相關(guān)基因也可嘗試應(yīng)用于提高非組培遺傳轉(zhuǎn)化效率。

    1.6 病毒遞送法

    病毒遞送法是基于RNA病毒防御機(jī)制開(kāi)發(fā)出來(lái)的病毒誘導(dǎo)的基因沉默(virusinducedgenesilenc?ing,VIGS),通過(guò)將目的基因序列重組至病毒載體,遞送至植物組織,引起植物內(nèi)源同源mRNA降解或表觀修飾,誘導(dǎo)植物內(nèi)源基因沉默,引起表型變化[6]。VIGS無(wú)需組培操作,可以使用幼苗、葉片、果實(shí)等作為受體材料,通過(guò)農(nóng)桿菌攜帶病毒載體進(jìn)入植物組織和細(xì)胞并瞬時(shí)表達(dá),在植物中被廣泛應(yīng)用于基因功能瞬時(shí)驗(yàn)證[73-74]。辣椒、桃等轉(zhuǎn)基因頑拗植物目前尚未構(gòu)建出農(nóng)桿菌介導(dǎo)的穩(wěn)定轉(zhuǎn)化體系以獲得轉(zhuǎn)基因再生植株,常采用VIGS系統(tǒng)驗(yàn)證基因功能[73,75]。對(duì)于童期長(zhǎng)的果樹(shù),研究調(diào)控果實(shí)品質(zhì)基因的功能也常采用VIGS瞬時(shí)驗(yàn)證方法[76]。病毒遞送效率明顯高于傳統(tǒng)質(zhì)粒,但大多數(shù)病毒無(wú)法感染生殖細(xì)胞或分生組織,因而無(wú)法穩(wěn)定遺傳給后代,僅用于瞬時(shí)表達(dá)研究。將FT(floweringlocusT)基因融合至煙草脆裂病毒載體(tobaccorattlevirus,TRV)或棉花葉皺病毒(cottonleafcrumplevirus,CLCrV),可以引導(dǎo)病毒RNA載體移動(dòng)至頂端分生組織和花器官,可利用病毒遞送法無(wú)需經(jīng)過(guò)組織培育即可獲得轉(zhuǎn)基因苗[5,77]。病毒遞送相較于雙元載體,其遞送效率更高,不產(chǎn)生外源基因插入,利用FT基因輔助轉(zhuǎn)化能產(chǎn)生可遺傳變異,有潛力用于創(chuàng)制非轉(zhuǎn)基因可穩(wěn)定遺傳的基因編輯植株。

    2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)非組培遺傳轉(zhuǎn)化的影響因素

    農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化具有操作簡(jiǎn)便、周期短、效率高等特點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于基因功能驗(yàn)證和分子育種[12]。然而,目前仍有許多物種未建立農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系,或轉(zhuǎn)化效率較低。農(nóng)桿菌介導(dǎo)非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系能否成功主要受外植體、農(nóng)桿菌、侵染方式和篩選方法等多種因素影響。了解農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化的影響因素,將為更多物種建立高效非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系提供參考。

    2.1 外植體類型與狀態(tài)

    非組培遺傳轉(zhuǎn)化使用的外植體類型分為生殖器官和營(yíng)養(yǎng)器官2種,其中花器官侵染法是利用生殖器官并借助有性生殖過(guò)程完成轉(zhuǎn)化,種子侵染法是利用生殖器官但借助發(fā)育過(guò)程完成轉(zhuǎn)化,而CDB、RAPID和病毒遞送都是利用營(yíng)養(yǎng)器官并借助無(wú)性繁殖過(guò)程完成轉(zhuǎn)化。用于非組培遺傳轉(zhuǎn)化的外植體種類廣泛,包括種子、根、莖(葉芽分生組織和莖基部)、葉、花和果實(shí)等,一般選擇植物再生能力強(qiáng)的器官或部位作為外植體進(jìn)行農(nóng)桿菌侵染。浸花法以花器官作為外植體進(jìn)行農(nóng)桿菌侵染,在十字花科植物尤其擬南芥中應(yīng)用較多,轉(zhuǎn)化效率0.1%~4%。以種子作為外植體,多選用萌發(fā)的種子,并使用超聲波和真空滲透處理,轉(zhuǎn)化效率在30%以上[78]。利用根作為外植體通常使用具有根蘗繁殖能力的植物[12]。莖是非組培條件遺傳轉(zhuǎn)化應(yīng)用最廣泛的外植體之一,利用頂芽、腋芽分生組織和莖基部的再生能力獲得轉(zhuǎn)化植株。大豆[59]和馬鞭草[79]通過(guò)頂芽侵染,金魚(yú)草和番茄通過(guò)腋芽注射均獲得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性芽[55],甘薯[53]和金魚(yú)草[53]通過(guò)腋芽注射獲得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性根。農(nóng)桿菌侵染莖基部后誘導(dǎo)獲得陽(yáng)性毛狀根或不定芽應(yīng)用最廣泛,在多種一年生草本和多年生木本植物中被應(yīng)用[12,42,46,48]。利用VIGS進(jìn)行瞬時(shí)轉(zhuǎn)化也常使用葉片作為外植體,但由于多數(shù)葉片分化程度高,再生能力差,難以通過(guò)非組培途徑獲得再生芽或根[73]。但多肉植物葉片具有強(qiáng)再生能力,自然條件下可進(jìn)行插葉繁殖,由此建立了以葉片作為外植體的多肉植物非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系[36]。外植體類型的選擇,主要依據(jù)植物繁殖方式,選擇分化程度低,再生能力強(qiáng)的器官或組織作為非組培遺傳轉(zhuǎn)化的受體材料。對(duì)于以有性繁殖為主的糧食作物或經(jīng)濟(jì)作物可選擇花器官或種子作為外植體,對(duì)于以營(yíng)養(yǎng)繁殖為主的多年生木本或草本植物則可選擇根、莖和葉片等營(yíng)養(yǎng)器官作為外植體。

    外植體的生長(zhǎng)狀態(tài)和發(fā)育階段也對(duì)轉(zhuǎn)化效率具有重要影響,一般情況下隨著植物年齡的增強(qiáng),植物分裂能力降低,分化程度升高,再生能力發(fā)生不可逆減弱,盡管一些外源的刺激或處理可以使植物表現(xiàn)出幼齡期表型,但難以恢復(fù)到幼齡期狀態(tài)[80]。幼嫩材料具有較好的再生效果,能顯著提高植物的再生率。然而幼嫩植物本身對(duì)逆境抵抗能力差,因此過(guò)于幼嫩的植物受到農(nóng)桿菌侵染,容易褐化或死亡。因此,選擇幼嫩且生活力強(qiáng)的外植作為受體材料尤為重要。例如橡膠草選擇播種后3周左右幼苗,甘薯選擇塊根定植15d的莖作為遺傳轉(zhuǎn)化外植體[12]。

    2.2 菌株類型

    植物遺傳轉(zhuǎn)化常見(jiàn)的農(nóng)桿菌類型主要包括根癌農(nóng)桿菌和發(fā)根農(nóng)桿菌,其中根癌農(nóng)桿菌有GV3101、EHA105、EHA101、AGL1和LBA4404菌株,發(fā)根農(nóng)桿菌有K599、C85C1、MSU440、Ar.A4、Ar.Qual和Ar.1193菌株。這些菌株在基因型上存在一定差異,對(duì)不同物種具有一定的偏好性,侵染效率也有較大差異。甘薯RAPID方法中使用4種根癌農(nóng)桿菌GV3101、EHA105、EHA101、AGL1和1種發(fā)根農(nóng)桿菌K599分別注射至甘薯莖分生組織,比較發(fā)現(xiàn)AGL1菌株轉(zhuǎn)化效率最高可達(dá)28%,K599轉(zhuǎn)化效率小于2%[53]。而采用CDB方法進(jìn)行的遺傳轉(zhuǎn)化都使用K599菌株[12,35],在甘薯中轉(zhuǎn)化效率均在90%以上,最高可達(dá)100%[81]。甘薯RAPID法和CDB法均使用了K599菌株,但轉(zhuǎn)化效率卻相差極大,表明對(duì)于同一個(gè)物種,侵染方式和外植體不同,菌株侵染效果也可能存在差異[12,35,53]。目前非組培條件下常用的菌株為K599發(fā)根農(nóng)桿菌菌株,該菌株宿主范圍較廣、轉(zhuǎn)化效率高。

    2.3 菌液濃度和侵染時(shí)間

    農(nóng)桿菌菌液濃度過(guò)高或侵染時(shí)間過(guò)長(zhǎng),都會(huì)引起細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng),導(dǎo)致外植體壞死、轉(zhuǎn)化效率降低,但侵染濃度過(guò)低或時(shí)間過(guò)短又會(huì)使外植體與農(nóng)桿菌接觸不充分,導(dǎo)致侵染效果變差,因此選擇合適的侵染濃度和時(shí)間很重要。當(dāng)菌液懸浮液OD600nm值為0.5時(shí),對(duì)甘薯的侵染效果最好,轉(zhuǎn)化效率為25%,而當(dāng)OD600nm值為0.01時(shí),侵染效果不佳,未獲得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性根[53]。一般情況下侵染液OD600nm值為0.6~1.0時(shí),侵染效果最佳。侵染時(shí)間過(guò)長(zhǎng)不僅會(huì)使農(nóng)桿菌在外植體中過(guò)度殘留,也會(huì)對(duì)植物組織造成損傷,引起細(xì)胞壞死;但侵染時(shí)間過(guò)短,則會(huì)導(dǎo)致農(nóng)桿菌與植物組織接觸不完全,轉(zhuǎn)化效率過(guò)低。最佳侵染時(shí)間因外植體的類型不同而有所差異,例如柳樹(shù)葉片外植體的侵染時(shí)間為10~20min時(shí),陽(yáng)性率最高為41.3%~44.4%,莖段的侵染時(shí)間大多在10~30min;芽苗侵染15min;種子侵染30min效果較好[82]。侵染時(shí)間與外植體類型和外植體狀態(tài)有關(guān),但一般侵染時(shí)間在10~30min時(shí),陽(yáng)性率較高,且不易造成組織壞死。

    2.4 侵染方式

    常見(jiàn)的侵染方式包括浸泡、真空滲透、注射、超聲損傷和蘸菌法等。以甘薯莖做為外植體,分別嘗試浸泡、真空滲透、注射多種方式進(jìn)行非組培遺傳轉(zhuǎn)化,僅注射法獲得轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性根[53]。在傳統(tǒng)的組培遺傳轉(zhuǎn)化中,浸泡法應(yīng)用最廣泛,將外植體浸泡在農(nóng)桿菌懸浮液中,操作簡(jiǎn)便。但該方法侵染時(shí)間較長(zhǎng),菌液進(jìn)入植物細(xì)胞效率較低,而且外植體長(zhǎng)時(shí)間浸泡在農(nóng)桿菌懸浮液中,容易造成細(xì)胞滲透壓失衡,出現(xiàn)組織壞死[52]。為促使菌液進(jìn)入植物細(xì)胞,常采取2種策略,一是通過(guò)真空滲透和注射施加外部壓力,在杜梨、柑橘和甘薯等植物中使用[46,52-53],二是通過(guò)超聲波處理給植物制造微小傷口,在大豆、棉花和百合中使用[58-60]。蘸菌法主要利用發(fā)根和根癌農(nóng)桿菌可以在土壤中生存的特點(diǎn),外植體蘸菌后插入基質(zhì),待陽(yáng)性轉(zhuǎn)化根長(zhǎng)出[12,35-36,48]。在實(shí)際轉(zhuǎn)化過(guò)程中,可以使用單一的侵染方式或采用多種方式結(jié)合,減少對(duì)植物損傷的同時(shí)提高轉(zhuǎn)化效率[36]。使用CDB遺傳轉(zhuǎn)化法,外植體蘸菌處理后插入潮濕的蛭石,每個(gè)外植體再澆灌3~5mL菌液,提高轉(zhuǎn)化效率[12]。

    2.5 篩選方式

    轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性組織或器官的篩選方式主要包括抗性基因和可視化基因篩選,常用的抗性基因包括卡那霉素、潮霉素和抗除草劑基因[83]等;常用的可視化基因主要包括葡萄糖苷酶基因GUS、熒光素酶報(bào)告基因(LUC)、熒光蛋白基因(GFP、RFP、mCherry)和甜菜堿合成酶基因Ruby等[12,52-53]。在大豆非組培遺傳轉(zhuǎn)化過(guò)程利用乙酰乳酸合成酶基因(ALS)或5-烯醇丙酮莽草酸-3-磷酸合酶基因(EPSPS)作為篩選基因,通過(guò)噴施除草劑進(jìn)行抗性篩選[59]。盡管抗生素在一定程度上能抑制非陽(yáng)性組織生長(zhǎng),但抗生素濃度過(guò)低對(duì)陽(yáng)性組織篩選效果差,濃度過(guò)高抑制植物生長(zhǎng),因此利用抗性基因進(jìn)行陽(yáng)性篩選,必須先明確抗生素篩選濃度,且避免出現(xiàn)假陽(yáng)性現(xiàn)象。為了解決這一問(wèn)題,可視化報(bào)告基因被廣泛應(yīng)用于植物遺傳轉(zhuǎn)化篩查。在甘薯中攜帶GUS基因的轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性根被染成明顯的藍(lán)色[53],在擬南芥和煙草中攜帶LUC基因的葉片使用化學(xué)試劑涂抹,在化學(xué)發(fā)光儀下有明顯的信號(hào),但GUS染色或LUC處理后植物組織無(wú)法繼續(xù)生長(zhǎng);轉(zhuǎn)而選擇綠色熒光蛋白(GFP)、紅色熒光蛋白(RFP或mCherry)作為報(bào)告基因[35,54],在相應(yīng)激發(fā)光下,可以看到明顯的綠色熒光或紅色熒光,該篩選方法對(duì)植物組織無(wú)損傷,且可以及時(shí)去除非陽(yáng)性組織,避免與陽(yáng)性組織競(jìng)爭(zhēng)營(yíng)養(yǎng),促進(jìn)陽(yáng)性組織生長(zhǎng);且便于統(tǒng)計(jì)轉(zhuǎn)化效率和篩選陽(yáng)性組織,目前大多數(shù)載體都會(huì)插入GFP、RFP或mCherry報(bào)告基因,用于轉(zhuǎn)基因篩選;該方法在杜梨[46]、大白菜[48]、長(zhǎng)壽花、玉樹(shù)以及單子葉虎尾蘭[36]和棉花[60]等多個(gè)物種中得到應(yīng)用。熒光蛋白做報(bào)告基因需熒光燈設(shè)備輔助篩選,且有些植物存在自發(fā)熒光,干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。甜菜堿合成酶基因(Ruby)可以合成顏色紫紅色的甜菜堿,在遺傳轉(zhuǎn)化中用作報(bào)告基因,在轉(zhuǎn)化成功的組織或器官表現(xiàn)出肉眼可見(jiàn)的紫紅色,該報(bào)告基因相比于熒光蛋白,無(wú)需熒光燈照射,觀察起來(lái)更加方便,在甘薯[12,53]、金魚(yú)草[55]和番茄[55]等多個(gè)物種被用于構(gòu)建高效遺傳轉(zhuǎn)化體系。利用可視化報(bào)告基因篩選遺傳轉(zhuǎn)化陽(yáng)性組織、器官和植株更為簡(jiǎn)單高效,在植物非組培遺傳轉(zhuǎn)化中被大量應(yīng)用。

    3 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化在基因編輯中的應(yīng)用

    基因編輯技術(shù)在植物中快速發(fā)展,高效簡(jiǎn)便的農(nóng)桿菌介導(dǎo)的非組培遺傳轉(zhuǎn)化被廣泛應(yīng)用于基因編輯[12,52-53,59]。植物缺失八氫番茄紅素脫氫酶基因(phytoenedesaturase,PDS),表現(xiàn)明顯的白化表型,因此在基因編輯體系建立時(shí)常采用該基因作為靶基因設(shè)計(jì)guideRNA(gRNA);通過(guò)觀察植物白化現(xiàn)象,分析基因編輯效果,進(jìn)而構(gòu)建和優(yōu)化植物基因編輯體系。攜帶PDS基因gRNA的編輯載體通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的高效非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系CDB、RAPID和GIFT進(jìn)行轉(zhuǎn)化,都獲得了白化芽或白化苗,且編輯效率可在T1代中穩(wěn)定遺傳,表明這些高效遺傳轉(zhuǎn)化體系能與基因編輯結(jié)合創(chuàng)制穩(wěn)定遺傳的新種質(zhì)[12,52-53,59]。在菊花中將CDB非組培遺傳轉(zhuǎn)化與表觀基因編輯CRISPR/dCas9結(jié)合,表觀調(diào)控花青素合成關(guān)鍵基因CmMYB6的啟動(dòng)子,實(shí)現(xiàn)對(duì)菊花花色深淺雙向調(diào)控[84]。發(fā)育調(diào)控基因也被應(yīng)用于提高基因編輯效率,將WUS2-ipt構(gòu)建至攜帶PDS基因gRNA的CRISPR-Cas9載體,侵染煙草葉芽分生組織,再生白化芽,且基因編輯效果能傳遞給下一代[52]。GRF-GIF嵌合基因過(guò)量表達(dá)不引起發(fā)育異常表型,在遺傳轉(zhuǎn)化中被廣泛用于提高轉(zhuǎn)化效率。在組培條件下GRF-GIF嵌合基因也被重組至基因編輯載體,提高轉(zhuǎn)化效率和編輯效率。大麻[70]、西瓜[83]、玉米自交系[72]、高粱[62]和大豆[71]等植物均已通過(guò)該方法獲得了基因編輯植株。過(guò)表達(dá)不引起發(fā)育異常的發(fā)育調(diào)控基因GRF-GIF有望被應(yīng)用到更多的植物物種或基因型中,為基因編輯精準(zhǔn)創(chuàng)制新種質(zhì)提供技術(shù)支持。

    病毒載體遞送基因編輯組件獲得非轉(zhuǎn)基因的基因編輯植株稱為病毒誘導(dǎo)的基因組編輯(virus-in?ducedgenomeediting,VIGE)。植物病毒載體具有遞送效率高、寄主范圍廣等特點(diǎn),利用病毒誘導(dǎo)基因沉默在植物基因功能驗(yàn)證中被廣泛應(yīng)用[74]。傳統(tǒng)的病毒載體可以遞送小的核酸元件,通常在1kb以內(nèi),而CRISPR-Cas9骨架大約4kb,超過(guò)了其容量限制。針對(duì)該問(wèn)題,首先創(chuàng)制出Cas9轉(zhuǎn)基因植物,再將gRNA重組至病毒載體,遞送至Cas9轉(zhuǎn)基因植物,進(jìn)而獲得基因編輯植株[5-6,85]。然而,對(duì)于遺傳轉(zhuǎn)化效率低的植物,難以創(chuàng)制Cas9轉(zhuǎn)基因植物,利用病毒載體直接遞送整個(gè)CRISPR-Cas組件可以有效避免外源基因插入,創(chuàng)制非轉(zhuǎn)基因的基因編輯植株,因此挖掘和開(kāi)發(fā)大容量病毒載體是將病毒載體廣泛應(yīng)用于基因編輯的關(guān)鍵。目前開(kāi)發(fā)的具有較大轉(zhuǎn)運(yùn)容量的病毒載體有馬鈴薯X病毒(PVX)、大麥黃條紋花葉病毒(BYSMV)、苦苣菜黃網(wǎng)病毒(SYNV)和番茄斑萎病毒(TSWV)等[86-87]。PVX是一種彎曲棒狀病毒,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將插入CRISPR-Cas9組件的PVX接種煙草葉片,通過(guò)組織培養(yǎng)獲得的再生芽60%具有編輯效果[88]。SYNV和BYSMV屬于植物負(fù)鏈RNA病毒,相較正鏈RNA病毒與DNA病毒具有更強(qiáng)大的承載能力和基因穩(wěn)定性。在煙草中利用SYNV和BYSMV攜帶CRISPR-Cas9相關(guān)組件,實(shí)現(xiàn)了煙草基因組編輯[9]。TSWV也是天然的大容量病毒載體,其宿主范圍廣,多達(dá)1000多個(gè),在難轉(zhuǎn)化植物辣椒中利用TSWA載體攜帶CRISPR-Cas9組件,轉(zhuǎn)化辣椒組培苗,獲得的再生植株77.9%具有可遺傳突變[8,86]。由于病毒載體難以進(jìn)入分生組織,目前用病毒載體遞送CRISPR-Cas9等基因編輯組件多通過(guò)組培途徑再生基因編輯植株,鑒于FT基因可協(xié)助病毒載體移動(dòng)至分生組織[5],利用FT基因輔助轉(zhuǎn)化結(jié)合大容量病毒載體遞送,可以創(chuàng)制非組培、可穩(wěn)定遺傳、非轉(zhuǎn)基因的基因編輯種質(zhì)。

    4 其他非組培遺傳轉(zhuǎn)化方法

    4.1 花粉管通道法

    花粉管通道法主要是利用植物授粉完成后形成花粉管,外源DNA或外源基因順著花粉管進(jìn)入不具有細(xì)胞壁或細(xì)胞壁不完整的胚囊,整合到卵細(xì)胞、合子或早期胚胎的轉(zhuǎn)化方式[89]。1983年花粉管通道法首先在棉花中建立[89],由于該方法無(wú)需建立組培體系且不依賴基因型,在許多物種中被廣泛應(yīng)用,包括草本植物小麥[90-91]和玉米[92]以及木本植物月季[93]、石榴[93]和茶樹(shù)[94]等?;ǚ酃芡ǖ婪▽?dǎo)入外源DNA的方式主要分為3種,花粉粒攜帶法、子房注射法和柱頭切除法[95]。棉花中主要以子房注射法為主[96],利用花粉管通道法已培育了大量轉(zhuǎn)基因棉花新品種[97]。水稻花粉管通道法起步較早,早在1985年利用該方法獲得具有紫色穎殼的轉(zhuǎn)基因水稻[98]。目前該方法在水稻遺傳改良中已應(yīng)用40多年,成功培育出多個(gè)具有早熟、晚熟、優(yōu)質(zhì)和抗性優(yōu)良的水稻新品系和新品種。小麥利用花粉管通道法獲得了抗蟲(chóng)、葉片衰老延緩和品質(zhì)改良的轉(zhuǎn)基因材料[99-100]。在玉米自交系中通過(guò)花粉管通道法轉(zhuǎn)化EPSPS基因,成功創(chuàng)制耐草甘膦玉米新種質(zhì),轉(zhuǎn)化效率為1.03%[92]。花粉管通道法雖然在多個(gè)物種中用于遺傳育種,但要求的條件相對(duì)嚴(yán)苛,重復(fù)性差、效率低,且結(jié)果受環(huán)境因子影響明顯。

    4.2 粒子轟擊法

    粒子轟擊又稱基因槍,其原理主要是利用高速氣體沖擊波將表面吸附包含目的基因DNA序列的金粉或鎢粉進(jìn)行射擊,使其穿透細(xì)胞壁和細(xì)胞膜到達(dá)細(xì)胞核,最終整合至基因組,完成轉(zhuǎn)基因。粒子轟擊不受基因型限制,適用的物種范圍更廣泛,尤其被廣泛應(yīng)用于難轉(zhuǎn)化的禾本作物水稻[101]、小麥[102]、玉米[103]、高粱[104]和甘蔗[105]等的遺傳改良。粒子轟擊介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化,常使用愈傷組織、未成熟的胚作為受體材料,通過(guò)組織培養(yǎng)過(guò)程獲得轉(zhuǎn)基因再生植株,在大麥中利用非組培條件下的種子作為外植體進(jìn)行基因瞬時(shí)表達(dá)分析[106],但利用粒子轟擊進(jìn)行非組培條件下的穩(wěn)定遺傳轉(zhuǎn)化鮮有報(bào)道。利用粒子轟擊遞送基因編輯CRISPR/Cpf1或ZFNs骨架至植物組織中已在水稻[101]和大豆[107]中被報(bào)道。盡管粒子轟擊具有不受基因型依賴、操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),但是其仍存在一些缺點(diǎn),如設(shè)備昂貴導(dǎo)致轉(zhuǎn)化成本高、轟擊隨機(jī)性強(qiáng)使轉(zhuǎn)化效率低、且容易對(duì)植物組織造成損傷,這些因素都限制了粒子轟擊在植物遺傳轉(zhuǎn)化中的廣泛應(yīng)用。

    4.3 納米遞送法

    納米顆粒在無(wú)外力的情況下能穿透植物細(xì)胞壁,使其成為外源分子遞送的理想材料。納米材料遞送外源分子或者核酸無(wú)需外力作用,只需要簡(jiǎn)單的注射或者噴灑即可實(shí)現(xiàn)納米基因載體的遞送和表達(dá),且不受物種限制。近年嘗試將納米材料應(yīng)用于植物遺傳轉(zhuǎn)化領(lǐng)域,在煙草、棉花、水稻等植物中作為核酸載體得以應(yīng)用[108]。納米材料遞送外源核酸分子進(jìn)入植物細(xì)胞,不像農(nóng)桿菌介導(dǎo)一般整合到基因組上遺傳給后代,所以常用于瞬時(shí)表達(dá)熒光蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位[109]或者遞送小干擾RNA(smallin?terferingRNA,siRNA)[110]、RNA干擾(RNAinter?ference,RNAi)[7]和雙鏈RNA(doublestrandRNA,dsRNA)[111]等非編碼RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后基因沉默。利用納米材料遞送CRISPR-Cas基因編輯載體,可在無(wú)外源基因插入的情況下,在基因組上進(jìn)行基因編輯等修飾,并使基因編輯效果穩(wěn)定遺傳給后代,是創(chuàng)制非轉(zhuǎn)基因基因編輯材料的有效手段。在動(dòng)物細(xì)胞中,通過(guò)脂質(zhì)納米顆粒遞送穩(wěn)定的CRISPR-Cas9核糖核蛋白對(duì)肺和肝臟組織中致病的SFTPC基因進(jìn)行編輯,編輯效率高達(dá)19%[112]。利用納米材料遞送CRISPR-Cas組件在植物基因工程領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景。

    5 總結(jié)與展望

    高效穩(wěn)定的遺傳轉(zhuǎn)化和基因編輯技術(shù)是分子設(shè)計(jì)育種的關(guān)鍵,盡管目前已建立了多個(gè)高效的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系,且在基因編輯中得到應(yīng)用,但這些方法仍未在多種植物中推廣。限制植物遺傳轉(zhuǎn)化成功的關(guān)鍵原因有植物再生能力差、遞送效率低和農(nóng)桿菌不敏感等問(wèn)題。結(jié)合目前已有的非組培遺傳轉(zhuǎn)化體系,對(duì)植物未來(lái)選擇合適的遺傳轉(zhuǎn)化方式進(jìn)行展望。

    針對(duì)植物再生能力差的問(wèn)題,植物細(xì)胞都具有發(fā)育成完整植株的潛能,但隨著植物年齡的增長(zhǎng)和分化程度提高,再生能力不斷減弱。植物分生組織中存在著分生干細(xì)胞,這些細(xì)胞分化程度低,再生能力強(qiáng),在遺傳轉(zhuǎn)化過(guò)程中應(yīng)充分利用植株分生組織再生能力強(qiáng)這一特點(diǎn),設(shè)計(jì)轉(zhuǎn)化方法,例如選擇包含分生組織的莖尖作為外植體,或者利用注射器、真空滲透等方式,將農(nóng)桿菌滲透至分生組織,以提高轉(zhuǎn)化效率;針對(duì)無(wú)性繁殖能力強(qiáng)的植物,依據(jù)其無(wú)性繁殖規(guī)律,選擇莖基部或根作為受體材料,可以顯著提高轉(zhuǎn)化效率。當(dāng)這2種方式都無(wú)法提高轉(zhuǎn)化效率時(shí),可借助發(fā)育相關(guān)基因輔助遺傳轉(zhuǎn)化,特別是持續(xù)過(guò)量表達(dá)不會(huì)引起發(fā)育缺陷的GRF-GIF嵌合基因。不同植物發(fā)育調(diào)控基因促進(jìn)轉(zhuǎn)化的效果并不一樣,可以通過(guò)嘗試使用多種發(fā)育調(diào)控基因或組合成不同的嵌合序列進(jìn)行輔助轉(zhuǎn)化。

    針對(duì)遞送效率低的問(wèn)題,在植物遺傳轉(zhuǎn)化中常使用的質(zhì)粒是由雙鏈DNA形成的環(huán)狀雙元載體,大小在1000kb左右,其遞送片段的效果遠(yuǎn)低于RNA病毒載體,因此選擇大容量病毒載體攜帶基因編輯組件進(jìn)入植物細(xì)胞進(jìn)行編輯,可有效解決編輯效果差的問(wèn)題。針對(duì)陽(yáng)性篩選的問(wèn)題,利用可視化的陽(yáng)性植物篩選標(biāo)記例如GFP熒光標(biāo)記或Ruby等,可以在無(wú)損情況下,無(wú)需復(fù)雜儀器,無(wú)損觀察轉(zhuǎn)基因效果,便于早期篩選轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性組織。針對(duì)農(nóng)桿菌不敏感型植物,可結(jié)合納米材料遞送法和粒子轟擊法進(jìn)行基因型不依賴的遺傳轉(zhuǎn)化。綜上,通過(guò)強(qiáng)再生能力外植體選擇、發(fā)育基因輔助、病毒載體、可視化篩選編輯、粒子轟擊和納米材料遞送等方式,可以有效解決遺傳轉(zhuǎn)化困難的問(wèn)題。未來(lái)將高效轉(zhuǎn)基因技術(shù)與基因編輯結(jié)合,在植物中實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)分子設(shè)計(jì)育種。

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