摘""要:紅陽獼猴桃屬于我國自主培育的優(yōu)良品種,具有獨特的紅色性狀和高糖低酸特性,因其香氣濃郁,味道獨特而備受歡迎。其果實的生長發(fā)育受到多種因素的影響,其中植物的蔗糖非發(fā)酵-1-相關(guān)蛋白激酶1(SnRK1)在調(diào)控碳水化合物代謝以及應(yīng)對生物和非生物脅迫方面起重要的開關(guān)作用。因此,本研究以紅陽獼猴桃為材料,克隆得到紅陽獼猴桃SnRK1家族2個基因的全長cDNA,分別命名為AcSnRK1.1和AcSnRK1.2,利用生物信息學(xué)方法分析AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、蛋白保守結(jié)構(gòu)域及順式作用元件等,并采用實時熒光定量檢測AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在不同組織和果實不同處理下的表達(dá)特性。結(jié)果表明:AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因分別含有1548、1545"bp的開放閱讀框,編碼515、514個氨基酸。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的氨基酸序列與其他植物SnRK1蛋白具有較高同源性;氨基酸序列顯示,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2包含了SnRK1家族特有的結(jié)構(gòu)STKc_AMPK_alpha、AMPK_C、UBA_SnRK1_plant;進(jìn)化樹分析表明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因?qū)儆赟nRK1家族;組織特異性分析顯示,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在紅陽獼猴桃各個組織中均有表達(dá),在果實中表達(dá)豐度最高;在果實發(fā)育過程中,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)量均呈先下降后上升的趨勢;qRT-PCR分析表明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)受ABA、GA3、ET、CPPU的調(diào)控。隨著貯藏時間的增加,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)量呈先下降后上升的趨勢,推測AcSnRK1基因可能調(diào)控蔗糖合酶的表達(dá)。本研究結(jié)果表明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在紅陽獼猴桃果實發(fā)育和貯藏過程中發(fā)揮重要作用,為進(jìn)一步闡述AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的功能奠定基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:紅陽獼猴桃;SnRK1;基因克??;生物信息學(xué)分析;表達(dá)分析中圖分類號:S663.4""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
Cloning"and"Expression"Analysis"of"SnRK1"in"Actinidia"chinensis"var."Hongyang
JIANG"Kaixiu1,2,"LIU"Linya2,"HE"Bin2,"SONG"Shuyi2,"GONG"Xiaojian1*,"HUANG"Yacheng2*
1."Key"Laboratory"for"Information"System"of"Mountainous"Areas"and"Protection"of"Ecological"Environment,"Guizhou"Normal"University,"Guiyang,"Guizhou"550001,"China;"2."School"of"Biological"Science"and"Technology,"Liupanshui"Normal"University,"Liupanshui,"Guizhou"553004,"China
Abstract:"Hongyang"kiwifruit"is"a"distinguished"variety"independently"developed"in"China."It"features"a"distinctive"red"coloration,"possesses"high"sugar"content"and"low"acidity,"and"is"favored"for"its"rich"aroma"and"unique"flavor"profile."The"growth"and"development"of"fruits"are"influenced"by"a"multitude"of"factors,"among"which"sucrose"non-fermenta tion-1-associated"protein"kinase"1"(SnRK1)"plays"a"pivotal"role"in"the"regulation"of"carbohydrate"metabolism"and"the"response"to"both"biotic"and"abiotic"stresses."Therefore,"in"this"study,"we"cloned"the"full-length"cDNA"of"2"genes"in"the"SnRK1"family"of"Hongyang"kiwifruit,"named"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2."The"physical"and"chemical"properties,"gene"structure,"conserved"motifs,"protein"conserved"domains,"and"cis-acting"elements"of"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"were"systematically"analyzed"using"bioinformatics"approaches."The"expression"characteristics"of"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"genes"in"different"tissues"and"fruits"were"quantitatively"detected"by"real-time"fluorescence."AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"genes"contained"an"open"reading"frame"of"1548"bp"and"1545"bp,"respectively,"encoding"proteins"containing"515"and"514"amino"acids"with"highly"consistent"sequences"(96.31%)"respectively."Both"genes"contained"10"exons"and"2"introns."Bioinformatics"analysis"showed"that"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"had"high"homology"with"other"plant"SnRK1"proteins."The"amino"acid"sequence"showed"that"STKc_AMPK_alpha,"AMPK_C"and"UBA_SnRK1_plant"were"unique"to"the"SnRK1"family."Evolutionary"tree"analysis"showed"that"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"belonged"to"the"SnRK1"family."Tissue"specific"analysis"showed"that"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"were"expressed"in"all"tissues"of"Hongyang"Kiwifruit,"but"the"expression"abundance"was"the"highest"in"fruit."During"fruit"development,"the"expression"levels"of"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"decreased"first"and"then"increased."qRT-PCR"analysis"showed"that"the"expression"of"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"was"responsive"to"ABA,"GA3,"ET"and"CPPU."With"the"increase"of"storage"time,"the"expression"levels"of"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"showed"a"downward"trend"first"and"then"an"upward"trend,"suggesting"that"AcSnRK1"gene"might"regulate"the"expression"of"sucrose"synthase."The"results"of"this"study"indicate"that"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"genes"play"an"important"role"in"the"development"and"storage"of"Hongyang"kiwifruit,"which"would"lay"a"foundation"for"further"elucidation"of"the"functions"of"AcSnRK1.1"and"AcSnRK1.2"genes.
Keywords:"Actinidia"chinensis"var."Hongyang;"SnRK1;"gene"cloning;"bioinformatics"analysis;"expression"analysis
DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2025.02.006
蔗糖非發(fā)酵-1相關(guān)蛋白激酶1(sucrose"non-"fermenting"1-related"protein"kinase,"SnRK1)蛋白是一類廣泛存在于植物中的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,是酵母中SNF1和動物中AMPK的同源蛋白,是一個能量感受器,可被能量缺乏所激活[1]。SnRK1基因是由3個亞基組成的異三聚體,包括催化α亞基、支架β亞基和腺嘌呤核苷酸AMP或ADP締合γ亞基[2-3]。SnRK1是SnRK超家族中的一個重要分支,在植物中高度保守且廣泛參與了調(diào)控多種生理過程,主要參與了植物的生長發(fā)育[4]。在草莓中的研究表明,F(xiàn)aSnRK1a基因可以上調(diào)FaSUS1和FaSUS3基因表達(dá)提高蔗糖合酶(SUS)活性,促進(jìn)果實中蔗糖的積累,從而影響果實的發(fā)育[5]。馬鈴薯中的反義表達(dá)SnRK1基因可使其蔗糖合成酶基因表達(dá)急劇下調(diào),并且導(dǎo)致蔗糖合成酶的活性降低了30%,說明SnRK1在轉(zhuǎn)錄水平上能對蔗糖合成酶基因進(jìn)行調(diào)節(jié),影響蔗糖合成酶的活性,從而降低塊莖中淀粉含量[6]。將大麥中SnRK1進(jìn)行沉默表達(dá),導(dǎo)致其花粉發(fā)育受阻,花粉中只含有少量或不含有淀粉,這可能與不能利用輸入的蔗糖有關(guān),即沉默表達(dá)后的SnRK1無法激活蔗糖合成酶的活性[7]。番茄中過表達(dá)mhSnRK1基因可增加番茄葉片和成熟果實中淀粉含量[8]。以上結(jié)果表明,SnRK1通過調(diào)控蔗糖合酶的表達(dá),在源和庫組織之間對蔗糖分配發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。此外,SnRK1還參與激素信號傳導(dǎo)、生物脅迫和非生物脅迫等過程,如在小麥萌發(fā)和幼苗早期生長過程中,SnRK1受到ABA的負(fù)調(diào)控[5];在擬南芥中,SnRK1通過調(diào)控脅迫應(yīng)答基因的表達(dá)和ABA信號通路參與糖和黑暗的響應(yīng)[9]。
獼猴桃也稱奇異果,含有豐富的維生素C、微量元素、氨基酸和膳食纖維,此外,還具有重要的保健功能,有“水果之王”的美稱[10-12],深受消費者喜愛,具有極高的經(jīng)濟(jì)效益[13-14]?,F(xiàn)有研究在獼猴桃果實中鑒定到較多與果實發(fā)育和品質(zhì)形成有關(guān)的基因,這些基因的調(diào)控機(jī)制為果實品質(zhì)和產(chǎn)量的改善提供了一定的基礎(chǔ)。本課題組前期研究已經(jīng)證實蔗糖合酶與果實發(fā)育密切相關(guān)[15],且已有的研究也表明,SnRK1能夠調(diào)控蔗糖合酶的活性,影響果實的產(chǎn)量和品質(zhì)。本研究以紅陽獼猴桃為材料,克隆得到了2個SnRK1成員,對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并分析其在紅陽獼猴桃不同組織、果實發(fā)育時期和后熟軟化階段的表達(dá)特性,以期為深入研究紅陽獼猴桃SnRK1蛋白激酶的生理功能奠定基礎(chǔ)。
1.1""材料
1.1.1""植物材料""供試品種為種植在貴州省六盤水市米籮鄉(xiāng)的8年生的紅陽獼猴桃。激素處理材料的采集參照劉林婭等[16]的方法。不同組織和果實不同發(fā)育時期材料的采集參照任東立等[15]的方法。后熟軟化時期的果實于花后138"d采集,分別在采集后2、4、6、8、15、17、19"d取樣。每個實驗均設(shè)置3個生物學(xué)重復(fù),樣品采集后立即用錫箔紙包裹置于液氮中速凍,置于–80"℃冰箱保存,用于后續(xù)RNA的提取。
1.1.2""菌株與試劑""逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、大腸桿菌(Escherichia"coli)"DH5α均購自天根生化科技(北京)有限公司;Trans"Taq?"HiFi"DNA"Polymerase"High"Fidelity(HiFi)購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;Phanta"Max"Super-Fidelity"DNA"Polymerase"(P505)購自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;SYBR試劑盒購自生工生物工程(上海)股份有限公司;其他生化試劑為進(jìn)口或國產(chǎn)分析純試劑。
DNA序列測序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
1.2""方法
1.2.1""AcSnRK1基因全長cDNA克隆""紅陽獼猴桃總RNA提取參照實驗室改良的CTAB法,濃度和質(zhì)量檢測符合實驗要求,可用于下一步實驗[17]。按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒操作說明書合成cDNA第一鏈?;诩t陽獼猴桃轉(zhuǎn)錄組測序信息,設(shè)計SnRK1基因序列的特異引物(表1),以逆轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物為模板,利用PCR法對SnRK1基因進(jìn)行cDNA全長擴(kuò)增。反應(yīng)條件:95"℃預(yù)變性5"min;95"℃變性30"s,55"℃退火30"s,72"℃延伸1.5"min,28次循環(huán);72"℃延伸10"min。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測目的條帶,并按照TIANGEN公司凝膠回收試劑盒說明書進(jìn)行凝膠回收,回收產(chǎn)物連接到PEASY-T1載體送公司測序。
1.2.2""AcSnRK1基因的生物信息學(xué)分析""在NCBI網(wǎng)站相關(guān)程序中對SnRK1蛋白序列進(jìn)行BLAST比對和保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測,利用其他在線網(wǎng)站和軟件預(yù)測SnRK1蛋白的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位預(yù)測、跨膜結(jié)構(gòu)域以及進(jìn)行氨基酸同源比對和構(gòu)建進(jìn)化樹。
(1)AcSnRK1基因的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位和染色體定位。利用ExPASY(https://www.expasy."org/tools)在線軟件預(yù)測SnRK1氨基酸數(shù)量、相對分子質(zhì)量(MW)、理論等電點(pI),不穩(wěn)定系數(shù)(instability"index)、脂溶性系數(shù)(aliphatic"index)和疏水性(grand"average"of"hydropathicity)。使用WOLF"PSORT"(https://wolfpsort.hgc.jp/)在線軟件預(yù)測SnRK1編碼蛋白的亞細(xì)胞定位。將紅陽獼猴桃基因結(jié)構(gòu)注釋信息和基因ID上傳至TBtools軟件的Gene"Location"Visualize"from"GTF/GFF工具中,分析染色體定位。
(2)SnRK1系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建。使用MEGA11軟件的Clustal"W算法的默認(rèn)參數(shù)進(jìn)行序列比對,利用Neighbor-Joining法,設(shè)置1000次bootstrap檢驗重復(fù),其他參數(shù)默認(rèn),將得到的建樹信息導(dǎo)入EvolView"2(https://evolgenius.info//evolview-"v2/#login)在線軟件中對進(jìn)化樹進(jìn)行美化。
(3)AcSnRK1結(jié)構(gòu)域序列分析。將在Pfam(http://pfam-legacy.xfam.org/)數(shù)據(jù)庫下載TCP轉(zhuǎn)錄因子的隱馬爾可夫模型(HMM)和NCBI的CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd)結(jié)果利用TBtools軟件進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域可視化,進(jìn)一步確定目的序列均含有SnRK1蛋白結(jié)構(gòu)域。將在Clustal"X序列比對后的結(jié)果導(dǎo)入DNAMAN軟件中進(jìn)行編輯,僅保留保守結(jié)構(gòu)域序列,導(dǎo)出圖片,使用PowerPoint軟件進(jìn)行標(biāo)注,并使用WebLogo(http://weblogo.berkeley.edu/)在線軟件生成一致的序列標(biāo)識。
(4)AcSnRK1基因結(jié)構(gòu)及保守基序分析。在MEME(https://meme-suite.org/meme/tools/meme)網(wǎng)站中上傳AcSnRK1和AcSnRK2氨基酸序列,分析紅陽獼猴桃基因家族轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)保守基序,motif最大檢索數(shù)設(shè)置為6個,其他參數(shù)為默認(rèn)值。將保守基序結(jié)果、Clustal"X序列比對后的結(jié)果、紅陽獼猴桃基因結(jié)構(gòu)注釋信息和蛋白信息導(dǎo)入TBtools軟件的Gene"Structure"View(Advanced)工具中,將目標(biāo)基因的基因結(jié)構(gòu)及保守基序進(jìn)行可視化分析。
(5)AcSnRK1基因的順式作用元件分析。將紅陽獼猴桃基因組全序列提交到TBtools軟件中,截取起始密碼子上游2000"bp序列作為基因的啟動子區(qū),使用PlantCare(http://bioinformatics.psb."ugent.be/webtools/plantcare/html/)在線軟件進(jìn)行順式作用元件預(yù)測,再利用TBtools軟件進(jìn)行可視化分析。
1.2.3""實時熒光定量PCR分析""采用伯樂公司的CFX96"Touch實時熒光定量PCR儀分析不同處理對AcSnRK1基因表達(dá)的影響,具體的操作步驟參照儀器使用說明書。取不同處理樣品的RNA為材料,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈后用于實時熒光定量分析。選用18S和GAPDH作為內(nèi)參基因,基因的熒光定量引物見表1,按照生工生物工程(上海)股份有限公司的TBgreenII說明書設(shè)計反應(yīng)程序。
1.3""數(shù)據(jù)處理
所有試驗數(shù)據(jù)均由3次重復(fù)試驗獲得,并與18s和GADPH的表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行了歸一化處理,以3個生物重復(fù)和3個技術(shù)重復(fù)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤差表示。實驗結(jié)果采用E–ΔΔCt算法進(jìn)行分析,使用GraphPad"Prism"9.5軟件進(jìn)行單因素方差分析。
2.1""AcSnRK1基因的克隆與序列分析
通過其他物種的SnRK1基因序列,在獼猴桃基因組網(wǎng)站(http://kiwifruitgenome.org/)上進(jìn)行Blast檢索,獲得該基因的基因組序列。根據(jù)已知序列設(shè)計引物,通過反轉(zhuǎn)錄PCR擴(kuò)增得到目的基因,命名為AcSnRK1.1(PSS35124)和AcSnRK1.2(PSS33671),其全長分別為2189、2056"bp(圖1),開放閱讀框分別為1548、1545"bp,分別編碼515、514個氨基酸。氨基酸序列比對表明2個基因的氨基酸序列相似性為96.31%(圖2)。
綠色水平橫線表示STKc_AMPK_alpha保守結(jié)構(gòu)域,紫色水平橫線表示UBA_SnRK1_plant保守結(jié)構(gòu)域,紅色水平橫線表示AMPK_C保守結(jié)構(gòu)域。
2.2""AcSnRK1基因的生物信息學(xué)分析
2.2.1""AcSnRK1的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位及染色體定位""使用ExPASy軟件對SnRK1家族成員進(jìn)行蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因分別編碼515、514個氨基酸,相對分子質(zhì)量為58.68、58.75"kDa,等電點為8.22、
8.56,呈堿性,不穩(wěn)定系數(shù)為45.61、45.92。Wolf亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果顯示,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2均定位在細(xì)胞質(zhì)中。AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在染色體定位結(jié)果顯示,2個基因隨機(jī)分布在2條染色體上,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2分別分布在2號和3號染色體上。
2.2.2""SnRK1的系統(tǒng)發(fā)育分析""利用MEGA"11軟件,采用NJ法構(gòu)建AcSnRK1.1、AcSnRK1.2與其他物種SnRK氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,AcSnRK1.1、AcSnRK1.2與同一分支的平邑甜茶(Malus"hupehensis)、桃(Prunus"persica"L.)的親源關(guān)系較近,且19個SnRK蛋白明顯聚為3個不同的組,分別對應(yīng)于SnRK蛋白家族的3個亞家族。而AcSnRK1.1和AcSnRK1.2均聚在SnRK1亞家族中(圖3),由此推斷AcSnRK1.1和AcSnRK1.2均屬于紅陽獼猴桃SnRK1亞家族成員。
2.2.3""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的基因結(jié)構(gòu)、蛋白保守結(jié)構(gòu)域及保守序列分析""利用TBtools軟件對AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果表明,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因均含有2個內(nèi)含子和10個外顯子(圖4)。此外,對AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的蛋白保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),AcSnRK1.1和AcSnRK1.2蛋白均含有SnRK1家族特有的保守結(jié)構(gòu)域:STKc_AMPK_alpha、AMPK_C、UBA_"SnRK1_plant結(jié)構(gòu)域(圖4)。對AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的保守基序進(jìn)行分析,結(jié)果顯示AcSnRK1.1和AcSnRK1.2蛋白均含有6個motif元件(圖4)。綜上可知同一個亞族中的成員具有高度相似的基因結(jié)構(gòu)與保守基序列,該結(jié)果與系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹分類結(jié)果一致。
2.2.4""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的啟動子順式作用元件分析""為更好地了解紅陽獼猴桃的AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控及潛在功能,利用PlantCARE軟件分析AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的啟動子區(qū)域(起始密碼子上游2000"bp)的順式調(diào)控元件。結(jié)果顯示,所有啟動子序列中共有36個順式作用元件,從中篩選出17個與激素信號通路及生長發(fā)育相關(guān)順式元件[主要包含脫落酸響應(yīng)元件、赤霉素響應(yīng)元件、水楊酸響應(yīng)元件、茉莉酸甲酯(MeJA)響應(yīng)元件、生長素響應(yīng)元件、光響應(yīng)元件、生長調(diào)節(jié)、干旱、低溫應(yīng)答元件]分析發(fā)現(xiàn),AcSnRK1基因中的順式作用元件大多與生長調(diào)節(jié)(生長素、糖代謝)、激素響應(yīng)(脫落酸、赤霉素等)、脅迫應(yīng)答(脫水脅迫、創(chuàng)傷)和光響應(yīng)(光信號)等相關(guān)(圖5)。表明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的功能相對保守,每個亞族成員的表達(dá)模式比較相近。
2.3""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因表達(dá)模式分析
2.3.1""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在不同組織中的表達(dá)分析""為了分析AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在紅陽獼猴桃不同組織中的表達(dá)模式,利用qRT-PCR技術(shù)檢測其在紅陽獼猴桃的雌花、雄花、芽、樹皮、葉和果實中的表達(dá)量。結(jié)果表明:AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在紅陽獼猴桃的6個組織或器官中均有表達(dá),但表達(dá)量存在差異,2個基因在果實中的表達(dá)量顯著高于其他組織(圖6),說明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因可能在果實的生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。
2.3.2""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在果實發(fā)育時期的表達(dá)分析""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在紅陽獼猴桃果實不同發(fā)育時期的表達(dá)模式如圖7所示,隨著果實的發(fā)育,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)量均呈先下降后上升的趨勢,在花后38~118"d的果實中的表達(dá)量明顯上升,差異顯著,表明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的表達(dá)和果實生長發(fā)育可能存在相關(guān)性。
2.3.3""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在不同激素中的表達(dá)分析""紅陽獼猴桃果實經(jīng)不同激素(ABA、GA3、ET、CPPU)處理后,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的表達(dá)模式如圖8所示,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在GA3處理0~6"h時,表達(dá)量明顯上調(diào),6"h時表達(dá)量最高,6"h之后表達(dá)量開始下調(diào);AcSnRK1.1在ET處理前期,表達(dá)量無明顯變化,9"h時表達(dá)量開始下調(diào);AcSnRK1.2在ET處理3~6"h時,表達(dá)量呈上升趨勢,6"h后表達(dá)量開始下調(diào);AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在CPPU處理3~9"h時表達(dá)量明顯上升,9"h后表達(dá)量開始下降;ABA處理后,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在ABA處理前期下調(diào)表達(dá),其中,AcSnRK1.1持續(xù)下調(diào)表達(dá),AcSnRK1.2后期上調(diào)表達(dá)但總體呈現(xiàn)下降趨勢。
2.3.4""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在果實后熟軟化階段的表達(dá)分析""AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在紅陽獼猴桃果實后熟軟化階段的表達(dá)模式如圖9所示,隨著貯藏時間的增加,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)量呈先下降后上升的趨勢,在第6天表達(dá)量最低,6"d后表達(dá)量逐漸升高,說明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在果實后熟軟化時期也發(fā)揮重要作用。
SnRK1是植物體內(nèi)復(fù)雜信號網(wǎng)絡(luò)的中心樞紐之一[18],參與植物碳氮代謝、生長發(fā)育、脅迫應(yīng)答等多種生理過程的調(diào)控[19]。SnRK1屬于保守的基因家族[20],本研究克隆得到紅陽獼猴桃SnRK1家族的2個基因,命名為AcSnRK1.1和AcSnRK1.2,不同小寫字母表示差異顯著(Plt;0.05)。
分別含有1548、1545"bp的開放閱讀框,分別編碼515和514個氨基酸,預(yù)測其主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。迄今為止,已在多種植物中克隆得到SnRK1蛋白家族成員,如擬南芥3個[21]、水稻4個[22]。草莓FaSnRK1α在葉片中表達(dá)量最高,果實中表達(dá)量最低[20]。番茄SlSnRK1.2在根和莖中表達(dá)量較高,在幼嫩葉片中表達(dá)量較低[13]。PdSnRK1α在桃的根尖中表達(dá)量最高,在花蕊、韌皮部、雄蕊、葉中表達(dá)水平較低[23]。在平邑甜茶中,MhSnRK1和MhAKINβγ基因均在葉中表達(dá)量最高[24]。而AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在紅陽獼猴桃的6種組織中均有表達(dá),在果實中表達(dá)量最高。本研究只對紅陽獼猴桃AcSnRK1家族中與果實發(fā)育最相關(guān)的2個基因進(jìn)行了分析,在紅陽獼猴桃中可能還有成員尚未被鑒定。
相關(guān)研究表明,SnRK1基因與激素信號存在緊密聯(lián)系,尤其是ABA信號[19]。本研究分析AcSnRK1.1和AcSnRK1.2對ABA、GA3、ET、CPPU處理的響應(yīng)發(fā)現(xiàn),果實中的AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在ABA處理前期下調(diào)表達(dá),其中AcSnRK1.1持續(xù)下調(diào)表達(dá),AcSnRK1.2在ABA處理后期上調(diào)表達(dá),這與小麥中SnRK1基因受ABA負(fù)調(diào)控的結(jié)果一致[7]。但羅靜靜等[20]研究表明,草莓果實中FaSnRK1α在ABA處理后表達(dá)量上調(diào),說明不同物種中SnRK1基因?qū)BA是存在應(yīng)答,但是應(yīng)答模式存在差異。AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在GA3處理時呈先上升后下降的趨勢,處理6"h的表達(dá)量最高,6"h后表達(dá)量開始下調(diào);AcSnRK1.1在ET處理時整體表達(dá)量呈下降趨勢,AcSnRK1.2在ET處理3~6"h時,表達(dá)量呈上升趨勢,6"h后表達(dá)量開始下調(diào);AcSnRK1.1和AcSnRK1.2在CPPU處理3~9"h時表達(dá)量呈上升趨勢,9"h后表達(dá)量開始下調(diào)。這表明AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)受ABA、GA3、ET、CPPU的調(diào)控。AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的順式作用元件中包括響應(yīng)脫落酸、赤霉素、水楊酸、茉莉酸甲酯、生長素、光響應(yīng)、生長調(diào)節(jié)、干旱、低溫等應(yīng)答元件。該結(jié)果表明,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2受ABA、GA3、ET、CPPU的調(diào)控,為后續(xù)紅陽獼猴桃通過外源激素調(diào)控SnRK1基因的表達(dá)提供了理論基礎(chǔ)。
FaSnRK1α在果實發(fā)育過程中的表達(dá)量不斷升高,到果實成熟后表達(dá)量略有下降,在果實發(fā)育過程中,F(xiàn)aSnRK1a基因可以上調(diào)FaSUS1和FaSUS3基因的表達(dá),表明該基因在果實發(fā)育時期調(diào)控了蔗糖合酶的表達(dá),促進(jìn)了果實的發(fā)育進(jìn)程[20]。MdSnRK1.1在番茄中過表達(dá)會影響碳氮代謝,在果實成熟進(jìn)程中起重要作用[25]。本研究中AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)量在果實發(fā)育時期和后熟軟化階段表達(dá)量均呈先下降后上升的趨勢。在果實發(fā)育過程中,花后38~118"d屬于果實快速膨大期,需要提供大量的蔗糖,AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)量在這個階段明顯上調(diào)。本實驗室前期對蔗糖合酶的研究結(jié)果表明,紅陽獼猴桃中蔗糖合酶家族的成員中存在果實快速膨大期明顯上調(diào)的基因,在后熟軟化階段也存在表達(dá)量先下降后上升的基因(數(shù)據(jù)未發(fā)表),與本研究結(jié)果一致。因此,推測AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在果實快速膨大期和果實后熟軟化階段都參與了蔗糖合酶的調(diào)控,在果實快速膨大期和果實后熟軟化階段起著重要的作用。
本研究探討了AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因在紅陽獼猴桃果實發(fā)育和貯藏過程中可能調(diào)控蔗糖合酶的表達(dá),并且AcSnRK1.1和AcSnRK1.2的表達(dá)受ABA、GA3、ET、CPPU的調(diào)控,為進(jìn)一步闡述AcSnRK1.1和AcSnRK1.2基因的功能奠定基礎(chǔ)。
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