鄭欽生,周樂(lè)松,張俊林,鄒曉君,曹庸,劉曉娟
(華南農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,廣東省功能食品活性物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東廣州 510642)
蝦青素(Astaxanthin,AST)是一種含氧類(lèi)胡蘿卜素,其分子結(jié)構(gòu)是一條兩端連接β-紫羅蘭酮環(huán)的共軛雙鍵長(zhǎng)鏈,并且環(huán)上各含有一個(gè)羥基和酮基(圖1)?;谶@些結(jié)構(gòu)特性,蝦青素被賦予超強(qiáng)的抗氧化特性[1]。在自然界中,AST 主要以全反式的形式存在。由于具有手性碳原子,AST 產(chǎn)生了左旋(3S,3’S)、右旋(3R,3’R)和內(nèi)消旋(3S,3’R)三種立體異構(gòu)體,并分別存在于不同的生物體中,如雨生紅球藻中主要存在左旋AST,而紅法夫酵母中主要存在右旋AST。此外,也發(fā)現(xiàn)了部分生物體(南極磷蝦、紅蟹、尼瓦利亞衣藻等)同時(shí)存在三種AST 立體異構(gòu)體。值得注意的是,這些AST 異構(gòu)體在抗氧化、抗衰老和免疫調(diào)節(jié)活性等方面表現(xiàn)出不同的健康效應(yīng)[2]。眾所周知,生物體內(nèi)的各種生理活動(dòng)都離不開(kāi)蛋白質(zhì)的參與,活性物生理活性的發(fā)揮也需要通過(guò)與蛋白質(zhì)的相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn)。一般來(lái)說(shuō),AST 進(jìn)入血液后會(huì)與血清白蛋白發(fā)生結(jié)合,進(jìn)而被轉(zhuǎn)運(yùn)到各個(gè)組織中并作用于靶蛋白來(lái)發(fā)揮功能活性[3]。若AST 異構(gòu)體與血清白蛋白之間的結(jié)合機(jī)制存在差異,則可能會(huì)觸發(fā)“結(jié)合-轉(zhuǎn)運(yùn)-功效”的鏈?zhǔn)接绊憽G耶?dāng)AST 異構(gòu)體在蛋白中具有相同的結(jié)合位點(diǎn)時(shí),還會(huì)表現(xiàn)出潛在的競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系,這也會(huì)影響到最終功效的發(fā)揮[4,5]。因此研究AST 異構(gòu)體與血清白蛋白的相互作用機(jī)制具有重要意義。
圖1 AST立體異構(gòu)體的分子結(jié)構(gòu)Fig.1 Molecular structure of AST optical isomers
牛血清白蛋白(Bovine Serum Albumin,BSA)是研究最為廣泛的血清白蛋白之一,不僅因?yàn)槠渚哂袠?gòu)象清晰、成本低、易獲取等優(yōu)點(diǎn),而且還與人血清白蛋白(Human Serum Albumin,HSA)有較高的結(jié)構(gòu)同源性(76%)[6]。BSA 的空間結(jié)構(gòu)由三個(gè)同源結(jié)構(gòu)域(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ)組成,每個(gè)結(jié)構(gòu)域各包含兩個(gè)亞結(jié)構(gòu)域(A 和B),其中亞結(jié)構(gòu)域ⅡA 和ⅢA 的疏水口袋是小分子配體的主要特異性結(jié)合位點(diǎn)[7]。作為一種模式結(jié)合和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,BSA 可以與許多內(nèi)源性和外源性物質(zhì)發(fā)生相互作用,進(jìn)而起到儲(chǔ)存和運(yùn)輸作用。并且它自身的手性識(shí)別功能可以將活性物立體異構(gòu)體的微小結(jié)構(gòu)差異通過(guò)結(jié)合親和力、互作氨基酸殘基、相互作用力等指標(biāo)呈現(xiàn)出來(lái)。如在人參皂苷Rh2 與BSA 的相互作用中,左旋和右旋人參皂苷Rh2 在結(jié)合位點(diǎn)以及互作氨基酸殘基上表現(xiàn)出明顯的立體選擇性,并且左旋人參皂苷Rh 2 具有更高的結(jié)合常數(shù)[8]。另一項(xiàng)基于多光譜和分子對(duì)接的研究發(fā)現(xiàn),相比于左旋地克珠利,右旋地克珠利與血清白蛋白具有更強(qiáng)的結(jié)合親和力,并且它們的結(jié)合均會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)構(gòu)象發(fā)生輕微變化[9]。由此可見(jiàn),研究手性分子與BSA 的相互作用有助于闡明其立體選擇性結(jié)合機(jī)制。然而,目前對(duì)于AST立體異構(gòu)體與BSA 的結(jié)合機(jī)制仍未有報(bào)道。
本研究系統(tǒng)地探究了AST 立體異構(gòu)體與BSA的相互作用。通過(guò)多光譜、表面等離子共振、分子對(duì)接等方法獲得AST-BSA 復(fù)合物的結(jié)合信息,包括熒光猝滅機(jī)制、結(jié)合常數(shù)、熱力學(xué)參數(shù)、相互作用力、蛋白構(gòu)象變化和結(jié)合位點(diǎn)等。這些相互作用信息有助于闡明AST 立體異構(gòu)體與BSA 的結(jié)合機(jī)制,并且對(duì)揭示AST 異構(gòu)體在血液循環(huán)中潛在的轉(zhuǎn)運(yùn)、分布和代謝情況具有重要的理論指導(dǎo)意義。
左旋蝦青素(純度>94%)、右旋蝦青素(純度>96%)由實(shí)驗(yàn)室制備(圖2),分別從雨生紅球藻(Haematococcus pluvialis)和紅法夫酵母(Phaffia rhodozyma)中提?。慌Q灏椎鞍祝兌?8%)、吲哚美辛(純度>99%)、布洛芬(純度>98%)、0.1 mol/L 磷酸緩沖鹽溶液(Phosphate Buffer Solution,PBS),上海源葉生物科技有限公司;氨基偶聯(lián)試劑盒、10×PBS-P+溶液、CM5 芯片,美國(guó)GE Healthcare 公司;二甲基亞砜(Dimethyl Sulfoxide,DMSO),天津天茂化工試劑廠;無(wú)水乙酸鈉,上海易恩化學(xué)技術(shù)有限公司;其它化學(xué)品為試劑級(jí);上述PBS 和10×PBS-P+的pH 值均為7.4。
圖2 左旋AST(a)、右旋AST(b)及其手性鑒定(c)的高效液相色譜圖Fig.2 High performance liquid chromatogram of (3S,3’S)-AST (a),(3R,3’R)-AST (b) and their chiral identification (c)
熒光分光光度計(jì)RF-6000,日本島津公司;表面等離子共振儀Biacore T200,美國(guó)GE Healthcare公司;圓二色譜儀Chirascan,英國(guó)應(yīng)用光物理公司;恒溫磁力攪拌水浴鍋,常州澳華儀器有限公司。
1.3.1 內(nèi)源熒光光譜
取BSA 溶解于0.01 mol/L PBS 中得到10 μmol/L BSA 溶液;用DMSO 配制200 μmol/L 的左旋和右旋AST 溶液并用0.45 μm 針孔濾膜過(guò)濾。取干凈離心管,依次加入600 μL BSA 溶液、2 250 μL PBS、30 μL 乙醇和0~120 μL 蝦青素溶液,充分渦旋混勻后,在303 K 和310 K 下孵育20 min,結(jié)束后立即采用熒光分光光度計(jì)測(cè)定熒光強(qiáng)度。BSA 終濃度為2 μmol/L,蝦青素終濃度為0~8 μmol/L,溶液總體積為3 mL,所含有機(jī)溶劑的體積分?jǐn)?shù)小于5%。儀器設(shè)置的激發(fā)波長(zhǎng)為280 nm,發(fā)射波長(zhǎng)為300~400 nm,狹縫寬度為5 nm,以200 nm/min 的掃描速率進(jìn)行測(cè)定。
由于小分子配體的存在會(huì)影響蛋白質(zhì)對(duì)激發(fā)光的吸收和發(fā)射光的傳播,這種現(xiàn)象稱(chēng)為內(nèi)濾效應(yīng)。因此需要利用方程(1)來(lái)校正熒光強(qiáng)度[10]。然后通過(guò)方程(2~5)對(duì)校正后的熒光強(qiáng)度進(jìn)行進(jìn)一步計(jì)算得到相互作用信息。
式中:
Fcor——校正后的熒光強(qiáng)度;
Fobs——實(shí)際測(cè)得的熒光強(qiáng)度;
Aex——蛋白質(zhì)配體復(fù)合物在激發(fā)波長(zhǎng)處的吸光度;
Aem——蛋白質(zhì)配體復(fù)合物在發(fā)射波長(zhǎng)處的吸光度。
式中:
F0——蛋白質(zhì)的原始熒光強(qiáng)度;
F——存在猝滅劑時(shí)蛋白質(zhì)的熒光強(qiáng)度;
Kq——雙分子猝滅速率常數(shù),L/(mol·s);
τ0——BSA 的熒光壽命,3×10-9s[11];
Ksv——Stern-Volmer 淬滅常數(shù),L/mol;
[Q]——淬滅劑的濃度,μmol/L;
KA——結(jié)合常數(shù),L/mol;
n——結(jié)合位點(diǎn)數(shù);
R——?dú)怏w常數(shù),8.314 J/(mol·K);
T——溫度,K;
ΔH——焓變,kJ/mol;
ΔS——熵變,J/(mol·K);
ΔG——吉布斯自由能,kJ/mol。
1.3.2 同步熒光光譜
按照1.3.1 節(jié)方法配制樣品,反應(yīng)溫度為303 K。儀器設(shè)置激發(fā)波長(zhǎng)和發(fā)射波長(zhǎng)的間隔Δλ分別為15 nm(發(fā)射波長(zhǎng)280~330 nm)和60 nm(發(fā)射波長(zhǎng)310~380 nm),其他參數(shù)不變。
1.3.3 位點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)
按照1.3.1 節(jié)方法配制BSA、AST 溶液和設(shè)置熒光分光光度計(jì)參數(shù)。布洛芬和吲哚美辛溶于無(wú)水乙醇中得到500 μmol/L 的溶液,采用0.45 μm 針孔濾膜過(guò)濾溶液。取干凈離心管,先加入600 μL BSA 溶液、2 250 μL PBS 和30 μL 布洛芬或吲哚美辛溶液,混勻后在303 K 下反應(yīng)20 min。之后加入0~120 μL AST 溶液,混勻后再次在303 K 下反應(yīng)20 min,孵育結(jié)束后立即檢測(cè)。布洛芬和吲哚美辛終濃度為3 μmol/L。
1.3.4 表面等離子共振
通過(guò)氨基偶聯(lián)法將BSA 固定在CM5 傳感器芯片的通道Fc2 上,獲得7 058.3 RU 的密度。然后活化并封閉通道Fc1,以其作為不偶聯(lián)蛋白的參比通道。在DMSO 中配制左旋和右旋AST 母液,然后用1.5×PBS-P+溶液進(jìn)行首次稀釋?zhuān)儆煤w積分?jǐn)?shù)5% DMSO 的1.5×PBS-P+溶液進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)罱K濃度范圍為0~2.67 μmol/L,樣品溶液中DMSO體積分?jǐn)?shù)為5%。按照儀器操作說(shuō)明書(shū)將1.5×PBS-P+溶液和DMSO 混合配制校正溶液。以含體積分?jǐn)?shù)5%DMSO 的1.5×PBS-P+溶液為運(yùn)行緩沖液,在室溫、30 μL/min 流速下進(jìn)行檢測(cè)。利用儀器自帶軟件對(duì)所得曲線進(jìn)行擬合分析,得到結(jié)合速率常數(shù)ka、解離速率常數(shù)kd和解離平衡常數(shù)KD。
1.3.5 圓二色譜
按照1.3.1 節(jié)方法配制樣品,其中AST 終濃度為2 μmol/L,反應(yīng)溫度為298 K。儀器掃描范圍190~260 nm,掃描速度100 nm/min。相同溶劑組成的PBS 作為空白對(duì)照組。利用Pro-Data 和CDNN 軟件對(duì)數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)行擬合曲線和解析二級(jí)結(jié)構(gòu)含量。
1.3.6 分子對(duì)接模擬
采用AutoDock Vina 軟件進(jìn)行分子對(duì)接模擬。BSA的原始晶體結(jié)構(gòu)文件在RCSB蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB ID:4F5S[12])中下載,左旋AST(PubChem CID:5281224)和右旋AST(PubChem CID:12358421)在PubChem 數(shù)據(jù)庫(kù)中下載。在對(duì)接開(kāi)始前,將BSA 的水分子和配體分子全部去除,并補(bǔ)充電荷和原子。為確定所有可能的結(jié)合位點(diǎn),首先對(duì)AST進(jìn)行盲對(duì)接。在AutoDock Tool 界面,將對(duì)接范圍擴(kuò)大至覆蓋BSA 的所有氨基酸殘基,對(duì)接得到10個(gè)最優(yōu)的結(jié)合位點(diǎn),它們可作為下一次對(duì)接的預(yù)測(cè)結(jié)合位點(diǎn)。然后進(jìn)行第二次對(duì)接,將對(duì)接范圍覆蓋上一步盲對(duì)接所得到的10 個(gè)最優(yōu)位點(diǎn),通過(guò)縮小范圍來(lái)獲得更準(zhǔn)確的結(jié)果。最后,從第二次對(duì)接的結(jié)果中選擇最優(yōu)結(jié)合模式的結(jié)果,通過(guò)Open Babel GUI、PyMOL 和Discovery Studio 軟件進(jìn)行處理,得到三維空間圖和二維相互作用力圖。
以上實(shí)驗(yàn)均平行測(cè)定3 次。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)用IBM SPSS Statistics 25.0 和OriginPro 2022b 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析和繪圖。采用方差分析(ANOVA)確定統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,P<0.05 為顯著性差異。
由于BSA 內(nèi)部的色氨酸(Tryptophan,Trp)、酪氨酸(Tyrosine,Tyr)和苯丙氨酸(Phenylalanine,Phe)熒光團(tuán)對(duì)周?chē)h(huán)境的極性很敏感,因此可通過(guò)內(nèi)源熒光光譜(Intrinsic Fluorescence Emission Spectroscopy,IFES)得到關(guān)于分子間相互作用的可靠信息。如圖3 所示,在加入AST 異構(gòu)體后,334 nm 處的熒光發(fā)射峰明顯下降,并且表現(xiàn)出濃度依賴的猝滅效果,這表明AST 與BSA 發(fā)生相互作用導(dǎo)致BSA 的熒光猝滅。
為了進(jìn)一步闡明AST 異構(gòu)體和BSA 之間的熒光猝滅機(jī)制,采用Stern-Volmer 方程(2)進(jìn)行計(jì)算分析,結(jié)果如圖4 和表1 所示。隨著溫度從303 K升高到310 K,左旋和右旋AST 的Stern-Volmer 淬滅常數(shù)Ksv分別從1.95×104和2.11×104L/mol 下降到1.14×104和1.29×104L/mol(P<0.05)。一般來(lái)說(shuō),熒光猝滅機(jī)制可分為靜態(tài)猝滅和動(dòng)態(tài)猝滅兩種機(jī)制。若蛋白質(zhì)受體與小分子配體之間結(jié)合形成復(fù)合物,其Ksv會(huì)表現(xiàn)出隨溫度升高而降低的趨勢(shì),稱(chēng)為靜態(tài)猝滅機(jī)制。而動(dòng)態(tài)猝滅是由于受體與配體之間發(fā)生運(yùn)動(dòng)碰撞引起的,表現(xiàn)為Ksv隨溫度升高而增加[13]。研究結(jié)果顯示,左旋和右旋AST 的Ksv都隨著溫度升高而下降,表明AST 異構(gòu)體與BSA發(fā)生結(jié)合,靜態(tài)猝滅是主要的熒光猝滅機(jī)制。此外,異構(gòu)體的雙分子猝滅速率常數(shù)Kq均達(dá)到1012L/(mol·s),遠(yuǎn)高于生物分子的最大散射碰撞猝滅常數(shù)[2.00×1010L/(mol·s)],再一次支持靜態(tài)猝滅機(jī)制的結(jié)果[14]。
表1 AST異構(gòu)體與BSA相互作用的雙分子猝滅速率常數(shù)和Stern-Volmer猝滅常數(shù)Table 1 Bimoecular quenching constant and Stern-Volmer quenching constant of interaction between AST isomers and BSA
圖4 左旋AST(a)和右旋AST(b)與BSA相互作用的Stern-Volmer方程擬合圖Fig.4 Stern-Volmer plot of BSA interacting with (3S,3’S)-AST(a) and (3R,3’R)-AST (b)
為進(jìn)一步探究AST 異構(gòu)體和BSA 結(jié)合常數(shù)KA和結(jié)合位點(diǎn)數(shù)n,使用雙對(duì)數(shù)方程(3)對(duì)上述所得熒光強(qiáng)度進(jìn)行分析,結(jié)果如表2 和圖5 所示。一般情況下,當(dāng)小分子配體-蛋白受體復(fù)合物的結(jié)合常數(shù)KA在107~109L/mol 之間時(shí)代表較強(qiáng)的結(jié)合親和力,而低于106L/mol 時(shí)則代表較弱的結(jié)合親和力[15]。如表2 所示,AST-BSA 的KA均為103L/mol,可以推測(cè)BSA 對(duì)AST 異構(gòu)體具有較弱的結(jié)合親和力。其中左旋與右旋AST 在303 K 時(shí)的KA分別為8.14×103和8.53×103L/mol。雖然右旋AST 比左旋AST 具有更高的KA,但結(jié)果沒(méi)有顯著性差異(P>0.05),表明二者對(duì)BSA 具有相似的結(jié)合親和力。此外,左旋和右旋AST 在303 K 時(shí)的n值分別為0.92 和0.93,它們均小于1,表明AST異構(gòu)體在BSA 中均只有一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)。
表2 AST異構(gòu)體與BSA相互作用的結(jié)合常數(shù)和結(jié)合位點(diǎn)數(shù)Table 2 Number of binding sites and binding constants of interaction between AST isomers and BSA
圖5 左旋AST(a)和右旋AST(b)與BSA相互作用的雙對(duì)數(shù)方程擬合圖Fig.5 Double logarithmic plots of BSA interacting with(3S,3’S)-AST (a) and (3R,3’R)-AST (b)
雖然內(nèi)源熒光光譜具有研究結(jié)合常數(shù)的潛力,但該技術(shù)依賴于周?chē)h(huán)境對(duì)生色氨基酸的影響程度來(lái)計(jì)算結(jié)合常數(shù),排除了其他氨基酸對(duì)結(jié)合的貢獻(xiàn)。因此,為進(jìn)一步確定AST 異構(gòu)體與BSA 的結(jié)合參數(shù),我們選擇表面等離子共振技術(shù)(Surface Plasma Resonance,SPR)來(lái)測(cè)定AST-BSA 的結(jié)合親和力和結(jié)合動(dòng)力學(xué)。如圖6 所示,注入AST 溶液后,儀器的響應(yīng)值隨時(shí)間變化而逐漸增加,說(shuō)明AST 與偶聯(lián)在芯片上的BSA 發(fā)生結(jié)合。表3 顯示AST 異構(gòu)體與BSA 的解離平衡常數(shù)KD均達(dá)到10-7mol/L(KA=1/KD,相當(dāng)于106L/mol 的KA),說(shuō)明AST 與BSA 具有中等強(qiáng)度的結(jié)合親和力。其中右旋AST(3.91×10-7mol/L)與左旋AST(4.17×10-7mol/L)表現(xiàn)出相近的KD(P>0.05),與前面IFES 的結(jié)果一致表明AST 立體異構(gòu)體與BSA 的結(jié)合沒(méi)有表現(xiàn)出明顯的立體選擇性[16]。此前已有學(xué)者[17]研究了血清白蛋白對(duì)人工合成全反式AST(左旋:內(nèi)消旋:右旋=1:2:1)的結(jié)合親和力(1.47×10-6mol/L),與我們的SPR 結(jié)果(10-7mol/L)較為接近,進(jìn)一步證明了SPR 數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。此外,從整體的動(dòng)力學(xué)曲線來(lái)看,AST 異構(gòu)體的結(jié)合和解離曲線較為相似,都呈現(xiàn)慢結(jié)合與慢解離狀態(tài),但是左旋和右旋AST的結(jié)合速率常數(shù)[4.76×103和3.27×103L/(mol·s)]和解離速率常數(shù)(2.00×10-3和1.28×10-31/s)存在較大差異(P<0.05)。并且當(dāng)AST 濃度為0.35、0.53、0.79、1.19 和1.78 μmol/L 時(shí),左旋和右旋AST的最高結(jié)合響應(yīng)值分別為13.84、20.60、25.93、40.58、57.22 RU 和13.20、17.14、19.22、24.81、33.19 RU??梢钥吹皆谙嗤珹ST 濃度下左旋AST的響應(yīng)值均高于右旋AST,這種由于手性結(jié)構(gòu)表現(xiàn)出的差異在其它研究中也有所發(fā)現(xiàn)[18],表明左旋和右旋AST 與BSA 的結(jié)合存在差異。
表3 AST異構(gòu)體與BSA相互作用的結(jié)合速率常數(shù)、解離速率常數(shù)及解離平衡常數(shù)Table 3 Association rate constant,dissociation rate constant and equilibrium constants values of AST isomers interacting with BSA
圖6 左旋AST(a)和右旋AST(b)與固定化BSA相互作用的傳感圖Fig.6 Sensing diagram of immobilized BSA interacting with(3S,3’S)-AST (a) and (3R,3’R)-AST) (b)
對(duì)比以上兩種方法所得到的結(jié)果,發(fā)現(xiàn)采用SPR(106L/mol)得到的結(jié)合親和力約為IFES(103L/mol)的103倍。這是由于除生色氨基酸之外,SPR 還可以同時(shí)檢測(cè)到BSA 其它氨基酸的相互作用信息[19]。由此可見(jiàn),SPR 獲得的結(jié)合親和力更加真實(shí),在Afkham 等[20]和Maleki 等[21]研究中也得到一致的看法。雖然IFES 受限于檢測(cè)原理,但這個(gè)方法可作為SPR 的輔助驗(yàn)證手段,并且它還可以獲得其它方面的相互作用信息,如蛋白質(zhì)構(gòu)象變化、相互作用力等,這些結(jié)果將在以下實(shí)驗(yàn)得到驗(yàn)證。
AST 具有多種官能團(tuán),如芳香環(huán)、酮基和羥基,因此AST 異構(gòu)體可能會(huì)以不同的結(jié)合模式與BSA發(fā)生相互作用,并在熱力學(xué)參數(shù)上表現(xiàn)出差異。此外,熱力學(xué)參數(shù)是判斷相互作用力的重要依據(jù)。為了確定AST 異構(gòu)體與BSA 結(jié)合的相互作用力,我們使用了方程(4)和(5)分析了第2.2 節(jié)中IFES的結(jié)合親和力。
左旋和右旋AST 與BSA 相互作用的焓變?chǔ)分別為-175.09 和-149.42 kJ/mol,熵變?chǔ)分別為-502.72 和-417.65 J/(mol·K)(表4)。AST 立體異構(gòu)體均呈現(xiàn)負(fù)值的ΔH和ΔS,表明驅(qū)使它們與BSA 發(fā)生結(jié)合的主要相互作用力是氫鍵和范德華力[22],這與之前關(guān)于類(lèi)胡蘿卜素-BSA 相互作用的報(bào)道一致[23]。產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因主要是因?yàn)锳ST 異構(gòu)體具有的相同官能團(tuán),而手性結(jié)構(gòu)的差異并不會(huì)改變主要相互作用力類(lèi)型,這在其它異構(gòu)體的研究中也有相同的結(jié)果[24]。盡管如此,左旋AST 比右旋AST 具有更小的ΔH和ΔS表明二者存在結(jié)合差異。
表4 AST異構(gòu)體與BSA相互作用的熱力學(xué)參數(shù)Table 4 Thermodynamic parameters of AST isomers interacting with BSA
現(xiàn)有研究表明,BSA 與小分子配體結(jié)合的主要位點(diǎn)位于亞結(jié)構(gòu)域ⅡA(位點(diǎn)Ⅰ)和ⅢA(位點(diǎn)Ⅱ)的疏水腔內(nèi),而吲哚美辛和布洛芬分別是位點(diǎn)Ⅰ或Ⅱ的典型配體[23]。因此選擇這兩種典配體進(jìn)行位點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)(Site Marker Experiments,SME),并通過(guò)方程(3)來(lái)計(jì)算存在位點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)物質(zhì)時(shí)AST-BSA的結(jié)合常數(shù),以此來(lái)確定AST 異構(gòu)體在BSA 上的結(jié)合位點(diǎn)。
結(jié)果如表5 所示,左旋和右旋AST 與BSA的結(jié)合常數(shù)分別為8.14×103和8.53×103L/mol。當(dāng)加入吲哚美辛后,左旋和右旋AST 的結(jié)合常數(shù)分別降低至0.55×103和0.14×103L/mol。在加入布洛芬后,左旋和右旋AST 的結(jié)合常數(shù)分別為0.54×103和0.57×103L/mol??梢钥吹竭胚崦佬粱虿悸宸业拇嬖跁?huì)使AST 異構(gòu)體的結(jié)合常數(shù)顯著降低(P<0.05),這個(gè)現(xiàn)象表明兩個(gè)競(jìng)爭(zhēng)物質(zhì)都會(huì)影響B(tài)SA 與AST 異構(gòu)體的結(jié)合。與此同時(shí),發(fā)現(xiàn)布洛芬和吲哚美辛在兩種AST 異構(gòu)體中的結(jié)合常數(shù)都沒(méi)有表現(xiàn)出顯著差異。由此可推斷左旋和右旋AST 的結(jié)合位點(diǎn)均位于亞結(jié)構(gòu)域ⅡA 和ⅢA 之間的交界處,在Li 等[25]課題組的研究中也發(fā)現(xiàn)相似的結(jié)果,原因可能是受到AST 長(zhǎng)鏈結(jié)構(gòu)的影響。
表5 競(jìng)爭(zhēng)性實(shí)驗(yàn)中AST異構(gòu)體與BSA相互作用的結(jié)合常數(shù)Table 5 Binding constants for the interaction of BSA with AST isomers in competitive experiments
蛋白質(zhì)(特別是血清白蛋白)是動(dòng)態(tài)柔性物體,它能夠根據(jù)自身所處環(huán)境的微小變化,自發(fā)地進(jìn)行分子構(gòu)象轉(zhuǎn)變。因此,小分子與蛋白質(zhì)的相互作用不僅會(huì)影響蛋白質(zhì)在結(jié)合口袋處的結(jié)構(gòu),而且對(duì)其整體二級(jí)結(jié)構(gòu)也可能造成較大影響[26]。為了探究AST 異構(gòu)體對(duì)BSA 結(jié)構(gòu)的影響,采用了圓二色譜(Circular Dichroism,CD)和同步熒光光譜(Synchronous Fluorescence Emission Spectra,SFES)進(jìn)行測(cè)定。CD 可以在190~260 nm 波長(zhǎng)下直接分析BSA 的二級(jí)結(jié)構(gòu)含量,結(jié)果如圖7 和表6 所示。天然BSA 的CD 光譜分別在209 nm 和221 nm附近出現(xiàn)α-螺旋的波谷,解析得到其二級(jí)結(jié)構(gòu)組成為56.83%α-螺旋、8.63%β-折疊、13.70%β-轉(zhuǎn)角和22.27%無(wú)規(guī)則卷曲,表明BSA 的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要是α-螺旋[27]。當(dāng)加入左旋和右旋AST 后,BSA的CD 波谷僅輕微下降,α-螺旋分別變?yōu)?6.80%和57.23%。然而二級(jí)結(jié)構(gòu)含量并沒(méi)有明顯變化(P>0.05),表明AST 異構(gòu)體與BSA 的結(jié)合不會(huì)明顯改變蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)。這一結(jié)果有助于BSA 維持其原有的生理功能。
表6 存在和不存在AST異構(gòu)體時(shí)BSA的二級(jí)結(jié)構(gòu)含量Table 6 Secondary structure content of BSA in the presence and absence of AST isomers
圖7 存在和不存在AST異構(gòu)體時(shí)BSA的CD光譜Fig.7 CD spectra of BSA in the absence and presence of AST isomers
對(duì)于SFES,光譜中最大發(fā)射波長(zhǎng)位置的變化可以反映生色氨基酸周?chē)h(huán)境極性的變化,以此來(lái)觀察AST 異構(gòu)體對(duì)BSA 微環(huán)境的影響。當(dāng)激發(fā)和發(fā)射波長(zhǎng)的間隔Δλ固定為15 或60 nm 時(shí),可以分別獲得Tyr 或Trp 殘基的微環(huán)境信息[28]。對(duì)于天然BSA,Tyr 和Trp 的最大發(fā)射波長(zhǎng)分別在300 和340 nm(圖8)。隨著左旋和右旋AST 的加入,Tyr和Trp 的最大發(fā)射波長(zhǎng)均沒(méi)有發(fā)生位移變化,說(shuō)明AST-BSA 相互作用不會(huì)改變BSA 的微環(huán)境。由此可見(jiàn),CD 和SFES 一致表明AST 與BSA 的相互作用不會(huì)明顯改變蛋白構(gòu)象。從第2.4 節(jié)中可以得到一個(gè)合理的解釋?zhuān)碅ST 沒(méi)有結(jié)合到BSA 內(nèi)部的疏水口袋,因此對(duì)蛋白質(zhì)構(gòu)象的影響較小。
圖8 左旋AST(a)和右旋AST(b)與BSA相互作用的同步熒光光譜Fig.8 Synchronous fluorescence emission spectroscopy of BSA interacting with (3S,3’S)-AST (a) and (3R,3’R)-AST (b)
分子對(duì)接(Molecular Docking,MD)可以預(yù)測(cè)小分子與蛋白質(zhì)的相互作用信息并呈現(xiàn)出可視化的結(jié)果,有助于進(jìn)一步了解AST 異構(gòu)體與BSA 之間的結(jié)合機(jī)制。表7 顯示左旋AST、右旋AST 與BSA 的結(jié)合自由能均為-8.9 kcal/mol,表明二者具有相等的結(jié)合親和力。如圖9 所示,最優(yōu)的對(duì)接模式表明AST 異構(gòu)體具有相似的結(jié)合模式,二者均結(jié)合在BSA 三個(gè)結(jié)構(gòu)域的交界處,并且與BSA 結(jié)合的相互作用力類(lèi)型為氫鍵、范德華力和疏水相互作用力。這與第2.2~2.4節(jié)的研究結(jié)果較為一致,在理論層面提供了進(jìn)一步的支持。雖然左旋和右旋AST 在上述方面具有相似的結(jié)果,但在形成氫鍵的數(shù)目和鍵長(zhǎng)方面表現(xiàn)結(jié)合差異。其中左旋AST與Lys504、Thr190殘基形成鍵長(zhǎng)為2.0 ?、2.7 ? 的氫鍵,而右旋AST 與Arg435 殘基形成鍵長(zhǎng)為2.9 ? 的氫鍵。此外,還發(fā)現(xiàn)AST 立體異構(gòu)體都是通過(guò)酮基或羥基與氨基酸形成氫鍵,可見(jiàn)這兩個(gè)官能團(tuán)對(duì)AST 的結(jié)合起到重要作用。
表7 AST異構(gòu)體與BSA的分子對(duì)接結(jié)合參數(shù)Table 7 Binding parameters of BSA with AST isomers obtained by molecular docking
圖9 左旋AST(a)和右旋AST(b)與BSA相互作用的分子對(duì)接結(jié)果及對(duì)比分析(c、d)Fig.9 Molecular docking results of BSA interacting with (3S,3’S)-AST (a) as well as (3R,3’R)-AST (b) and comparative analysis (c,d)
左旋和右旋AST 與BSA 相似的結(jié)合自由能再一次反映出它們之間的結(jié)合沒(méi)有明顯的立體選擇性,這種情況可以從AST 的分子結(jié)構(gòu)和結(jié)合位點(diǎn)兩方面來(lái)解釋。AST 立體異構(gòu)體的結(jié)構(gòu)差異在于兩端環(huán)上的羥基,由于AST 的長(zhǎng)鏈結(jié)構(gòu)限制了它們可選擇的結(jié)合位點(diǎn),導(dǎo)致無(wú)法像其他小分子異構(gòu)體那樣自由調(diào)整分子朝向來(lái)選擇最合適的結(jié)合口袋[8,29]。此外,結(jié)合位點(diǎn)處芳香族氨基酸殘基(Trp、Tyr 和Phe)的存在對(duì)手性分子的立體選擇性具有較大影響[30],然而分子對(duì)接結(jié)果顯示AST-BSA 的互作氨基酸殘基中僅出現(xiàn)一個(gè)Tyr 殘基,這不利于展現(xiàn)AST 立體異構(gòu)體的立體選擇性作用。
本研究通過(guò)IFES、SFES、SME、CD、SPR 和MD 方法研究了AST 立體異構(gòu)體與BSA 的相互作用。SME 表明AST 異構(gòu)體的結(jié)合位點(diǎn)均位于BSA亞結(jié)構(gòu)域ⅡA 和ⅢA 的交界處,相同的結(jié)合位點(diǎn)導(dǎo)致AST 異構(gòu)體具有相似的相互作用力(氫鍵和范德華力)和結(jié)合親和力,這在IFES 和SPR 中得到了證明。SPR 還表明AST-BSA 的結(jié)合動(dòng)力學(xué)都表現(xiàn)為慢結(jié)合、慢解離狀態(tài),左旋AST 的最高結(jié)合響應(yīng)值高于右旋AST。IFES 的結(jié)果還顯示左旋AST 具有更低的ΔH和ΔS。MD 模擬結(jié)果與上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果具有較高符合度,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)AST 立體異構(gòu)體在氫鍵數(shù)目和鍵長(zhǎng)上表現(xiàn)結(jié)合差異。此外,CD 和SFES一致證明AST 與BSA 的相互作用不會(huì)對(duì)蛋白構(gòu)象造成較大影響??傊笮陀倚鼳ST 對(duì)BSA 的結(jié)合沒(méi)有明顯的立體選擇性,但在最高結(jié)合響應(yīng)值、熱力學(xué)參數(shù)和氫鍵數(shù)表現(xiàn)出結(jié)合差異。這些相互作用參數(shù)有助于闡明AST 立體異構(gòu)體與BSA 的結(jié)合機(jī)制,并為AST 異構(gòu)體在血液循環(huán)中潛在的藥代動(dòng)力學(xué)提供重要的理論指導(dǎo)信息。