邵雪花 李桂蘭 肖維強(qiáng) 賴多 莊慶禮 秦健
(1.廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部南亞熱帶果樹生物學(xué)與遺傳資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 廣東省熱帶亞熱帶果樹研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州 510640;2.長江大學(xué)園藝園林學(xué)院,荊州 434000)
番石榴(Psidium guajava Linn.)別名芭樂、雞矢果等,系桃金娘科(Myrtaceae)番石榴屬(Psidium),原產(chǎn)于南美洲,現(xiàn)廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)[1]。番石榴果實(shí)芳香、甘甜,具有很高的營養(yǎng)價(jià)值[2]。另外,長期以來民間用其葉做茶,對(duì)腹瀉、糖尿病、口腔潰瘍等均有一定的治療效果[3-5]。經(jīng)藥理研究證實(shí),番石榴富含酚類、黃酮類、萜類、多糖等生物活性物質(zhì),具有抗氧化、護(hù)肝、抗菌、抗糖尿病、抗炎和抗癌活性[1,6-8]。正因?yàn)榉竦氖秤煤退幱脙r(jià)值高,2019 年全球番石榴產(chǎn)量就已達(dá)5 585 萬t[9]。目前,我國福建、廣東、廣西等地均有大量栽培[10],其總產(chǎn)量僅次于印度,排名世界第二[2]。然而,當(dāng)前我國番石榴主栽品種單一,品種資源匱乏,不利于我國的番石榴產(chǎn)業(yè)發(fā)展,因此,選育出更多的番石榴新品種刻不容緩。
對(duì)于植物的育性研究和新品種選育工作而言,其染色體的倍性鑒定尤為重要[11]。流式細(xì)胞術(shù)是一種利用流式細(xì)胞儀快速多次參數(shù)分析流體中單個(gè)細(xì)胞的技術(shù)[12]。近年來,流式細(xì)胞術(shù)因其操作技術(shù)簡單、用時(shí)短、效率高、鑒定結(jié)果準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),被普遍用于檢測(cè)植物的基因組大小和染色體倍性,如馬鈴薯[13]、大豆[14]、菊芋[15]和棉花[16]等。目前,有關(guān)番石榴倍性的研究尚未見報(bào)道,嚴(yán)重限制了番石榴的倍性育種和雜交育種工作。本研究通過比較離心處理、樣本部位和保存方式等對(duì)番石榴倍性鑒定效果的影響,建立基于流式細(xì)胞術(shù)的番石榴倍性鑒定方法,并用該方法對(duì)33 種番石榴種質(zhì)資源進(jìn)行倍性鑒定,旨為后續(xù)番石榴倍性鑒定以及推動(dòng)番石榴育種工作奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 供試材料 33 份番石榴種質(zhì)資源的嫩葉、花瓣、芽均采自于廣東省農(nóng)科院果樹研究所優(yōu)稀水果研究室番石榴資源圃。
1.1.2 試劑及儀器設(shè)備 mGb 解離液購自南京博巧生物科技有限公司、碘化丙啶(propidium iodide,PI)染液購自北京索萊寶科技有限公司、BD FACSVerse 流式細(xì)胞儀購自上海土森視覺科技有限公司。
1.2.1 流式細(xì)胞術(shù)方法的建立
1.2.1.1 樣本部位的選擇 分別取番石榴嫩葉、芽、花瓣,按照以下方法進(jìn)行處理,比較不同組織提取細(xì)胞核的含量。每個(gè)處理重復(fù)3 次。
處理方法:取0.50-1.00 cm2待測(cè)樣本,置于培養(yǎng)皿中,加入1 mL 預(yù)冷的mGb 解離液,使待測(cè)樣品完全浸沒在解離液中。使用刀片垂直快速切碎樣品,此過程盡量將待測(cè)樣品浸沒于解離液中,靜置1 min 以獲取完整的細(xì)胞核。吸取培養(yǎng)皿內(nèi)的混合溶液,用400 目濾膜將懸濁液過濾至流式管內(nèi),再加入30 μL 預(yù)冷的PI 染料,混勻后4℃避光染色10 min。最后使用流式細(xì)胞儀上機(jī)檢測(cè),以二倍體番石榴品種‘珍珠’細(xì)胞組織的DNA 含量作為參照,每次檢測(cè)收集約100 000 個(gè)細(xì)胞,以CV 值(DNA 含量峰值的變異系數(shù))的大小作為評(píng)價(jià)流式測(cè)定結(jié)果的參數(shù)。用FlowJo 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
1.2.1.2 離心方案的優(yōu)化 分別取0.50-1.00 cm2待測(cè)樣本,加入1 mL 預(yù)冷的mGb 解離液,快速切碎后用400 目濾膜將懸濁液過濾至1.50 mL 離心管中。4℃離心后去上清,保留200 μL 沉淀,分別加入預(yù)冷后的100 μL 解離液和30 μL PI 染料,混勻后4℃避光染色10 min,上機(jī)檢測(cè)。共設(shè)置4 個(gè)處理,分別 為:1 000 r/min 離 心5 min(L1),1 000 r/min 離心10 min(L2),2 000 r/min 離 心5 min(L3)和2 000 r/min 離心10 min(L4),以未離心組作為對(duì)照(CK)組。每個(gè)處理重復(fù)3 次。
1.2.1.3 樣本保存方式的比較 按照1.2.1 的處理方法,選取新鮮樣本作為對(duì)照(CK)組,冷藏(4℃)和冷凍(-20℃、-40℃、-80℃)4 種保存方式(均保存7 d)的花瓣,比較不同溫度處理后花瓣的細(xì)胞核含量。每個(gè)處理重復(fù)3 次。
1.2.2 番石榴種質(zhì)資源倍性鑒定 取33 份番石榴種質(zhì)資源的新鮮花瓣,采用建立的流式細(xì)胞術(shù)方法對(duì)其倍性進(jìn)行檢測(cè)。
1.2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 采用FlowJo 軟件分析細(xì)胞流式數(shù)據(jù)。以CV 值(DNA 含量峰值的變異系數(shù))的大小作為評(píng)價(jià)結(jié)果好壞的參數(shù)。
本文分別取番石榴的嫩葉、芽和花瓣進(jìn)行測(cè)定。結(jié)果(圖1)表明,花瓣作為檢測(cè)部位時(shí)收集到的細(xì)胞核數(shù)目最多,CV 值為1.96%,峰形效果最佳,噪音峰小且主峰明顯;嫩葉作為檢測(cè)部位時(shí)峰形效果次之,有噪音峰,碎片增多,CV 值為2.32%;芽作為檢測(cè)部位時(shí)可檢測(cè)到的細(xì)胞核數(shù)目明顯減少,雜峰較多,噪音峰干擾大,主峰不清晰。綜上表明,番石榴的花瓣更適宜作為倍性檢測(cè)的材料。
圖1 番石榴不同組織流式圖Fig.1 Flow chart of different tissues of guava
以番石榴花瓣為材料,將獲得的細(xì)胞核懸浮液分別設(shè)置不同離心轉(zhuǎn)速和離心時(shí)間。番石榴花瓣的細(xì)胞核相對(duì)DNA 含量結(jié)果如圖2 所示,CK 組獲得的細(xì)胞核DNA 含量最多且染色均勻,相對(duì)熒光強(qiáng)度集中,噪音峰少,主峰明顯,CV 值為1.97%;而離心后則導(dǎo)致細(xì)胞核DNA 大量損失,收集到的細(xì)胞碎片較多,主峰周圍噪音增多,無法形成明顯的主峰;L1 和L3 組由于離心時(shí)間過短,細(xì)胞碎片沒有得到有效分離,CV 值低于其他處理組;L2 組1 000 r/min離心10 min,熒光強(qiáng)度較為集中,獲得的細(xì)胞數(shù)量較多,CV 值為1.96%,在離心處理組中表現(xiàn)最好;L4 組2 000 r/min 離心10 min 后收集的樣本細(xì)胞數(shù)量較少,峰值降低明顯。因此,在制備細(xì)胞核懸浮液時(shí),過濾后無需離心,染色后直接上機(jī)測(cè)定效果最佳。
圖2 番石榴不同離心方式的比較Fig.2 Comparison of different centrifugation methods of guava
取不經(jīng)低溫保存的新鮮番石榴花瓣作對(duì)照(CK)組,冷藏(4℃)和冷凍(-20℃、-40℃和-80℃)保存方式對(duì)番石榴花瓣各保存7 d 后進(jìn)行測(cè)定。結(jié)果(圖3)表明,CK 組的檢測(cè)效果最好,收集到的細(xì)胞核DNA 含量最高,CV 值為1.96%,背景碎片少,主峰明顯;冷藏和各級(jí)冷凍處理下,只有-80℃冷凍處理對(duì)樣本的破壞性最小,獲取的細(xì)胞核DNA 含量明顯高于其他組,CV 值為1.88%,主峰明顯,但與對(duì)照組相比有少量偏鋒;冷藏(4℃)處理后,主峰較好,噪音峰少,但細(xì)胞核DNA 含量較低,CV 值升高為2.04%;-20℃和-40℃冷凍處理后造成峰圖噪音峰明顯增多,雜峰較多,收集到的細(xì)胞核DNA含量較低。綜上可見,新鮮番石榴花瓣染色后直接上機(jī)測(cè)定效果最佳。
圖3 番石榴不同保存溫度流式圖Fig.3 Flow diagram of different storage temperatures of P.guajava
利用建立的流式細(xì)胞術(shù)分析方法,對(duì)33 份試驗(yàn)樣本進(jìn)行處理后上機(jī)檢測(cè)(圖4),其中縱坐標(biāo)軸代表測(cè)定細(xì)胞數(shù)的相對(duì)值,橫坐標(biāo)軸代表熒光的通道值,峰值的位置反應(yīng)的是測(cè)試樣品的倍性,若峰值在50 左右,判定該品種為二倍體,峰值在100 左右,判定該品種為四倍體,峰值在150 左右,則判定該品種為六倍體。
圖4 不同倍性番石榴花瓣的相對(duì)DNA 含量Fig.4 Relative DNA contents of P.guajava petals with different ploidy levels
在本研究中,以已知的二倍體番石榴品種‘珍珠’做參照,采用流式細(xì)胞術(shù)對(duì)33 種番石榴樹種資源進(jìn)行倍性鑒定,結(jié)果如表1 可得,變異系數(shù)CV 值(DNA含量峰值的變異系數(shù))為1.68%-2.36%。其中,‘草莓’番石榴判斷為六倍體,其余32 份樣品(包括‘帝王’‘水蜜’‘金斗香’‘翡翠’‘紫果’等番石榴種質(zhì)資源)均為二倍體,倍性系數(shù)介于0.42-0.59,倍性估算值為1.68-2.36。
倍性分析是研究遺傳進(jìn)化、開展倍性育種和雜交育種工作的基礎(chǔ)[11]。目前,流式細(xì)胞術(shù)因其制樣簡單、靈敏度高和準(zhǔn)確性高等優(yōu)點(diǎn)已成為鑒定植物倍性的首選方法[17]。然而,對(duì)于不同植物而言,采用不同組織部位、離心漂洗方式、保存溫度等均會(huì)影響倍性鑒定的結(jié)果可靠性[18-19]。
根據(jù)其他植物材料已有的研究報(bào)道,植物材料選取不當(dāng),會(huì)造成細(xì)胞核顆粒提取不足且雜質(zhì)較多,影響倍性檢測(cè)效果。例如,趙孟良等[15]比較菊芋塊莖、根、老葉和嫩葉的倍性檢測(cè)效果發(fā)現(xiàn),嫩葉是其倍性鑒定的理想材料;王婭麗等[16]發(fā)現(xiàn)以棉花嫩葉作為檢測(cè)材料的倍性鑒定效果優(yōu)于老葉。本研究發(fā)現(xiàn),花瓣作為檢測(cè)材料時(shí)熒光信號(hào)集中,受到的干擾最少,峰形效果最好;嫩葉作為測(cè)試材料時(shí)熒光信號(hào)較為集中,有少量干擾但不影響峰形判斷,效果次之;芽作為測(cè)試材料時(shí)熒光信號(hào)比較分散,主峰前后都有干擾增多,峰形效果差;故推薦番石榴花瓣作為其倍性鑒定的首選材料。
離心漂洗常被用于減少細(xì)胞核懸浮液的雜質(zhì)成分對(duì)結(jié)果的干擾,但因植物材料不同導(dǎo)致離心的轉(zhuǎn)速及時(shí)間存在差異。例如,張桂芳等[20]比較不同離心時(shí)間對(duì)鐵皮石斛倍性檢測(cè)效果的影響,認(rèn)為2 000 r/min 離心8 min 效果最佳;楊靜等[21]對(duì)桑樹的研究表明,不離心與離心漂洗1-2 次對(duì)其倍性檢測(cè)效果無差異。本研究中,離心處理后的番石榴細(xì)胞核懸浮液峰圖質(zhì)量差,原因可能是細(xì)胞核DNA 鏈斷裂,導(dǎo)致碎片增加和熒光信號(hào)分散,因此番石榴細(xì)胞核懸浮液直接經(jīng)400 目濾膜過濾后即可染色測(cè)定,無需離心,可顯著縮短樣品的制備時(shí)間,并提高其測(cè)定效率。
在收集野外番石榴資源,利用流式細(xì)胞術(shù)鑒定其染色體倍性時(shí),從采集到實(shí)驗(yàn)室測(cè)定的過程中,往往無法實(shí)現(xiàn)樣品即采即測(cè),因此保存樣本以確保細(xì)胞懸浮液的有效制備對(duì)其倍性鑒定至關(guān)重要[21]。目前,對(duì)于部分無法在數(shù)日內(nèi)檢測(cè)的樣本,低溫保存是植物倍性鑒定樣本保存的最常用方式[21-22]。本研究結(jié)果表明,新鮮番石榴花瓣得到的細(xì)胞核懸浮液最好,其次為-80℃冷凍處理組,該處理對(duì)樣本的破壞性最小,獲取的細(xì)胞核DNA 含量明顯高于冷藏和其他冷凍處理組,且主峰明顯,效果較好。冷藏(4℃)處理后會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞核DNA 含量降低,而-20℃和-40℃保存,可能是因?yàn)槔鋬鲈斐煞窕ò杲M織中產(chǎn)生過多細(xì)胞碎片,雖不影響倍性鑒定正確性,但雜峰較多,效果不佳。
CV 值是判斷倍性檢測(cè)結(jié)果可靠與否的關(guān)鍵指標(biāo)。Georgiev 等[23]認(rèn)為,流式細(xì)胞儀檢測(cè)的CV 值在9.00%以內(nèi),其檢測(cè)結(jié)果就比較可靠。呂順等[17]也認(rèn)為,對(duì)于含有較多酚類物質(zhì)的植物,CV 值<10.00%可達(dá)到理想結(jié)果。本研究采用優(yōu)化的流式細(xì)胞術(shù)對(duì)33 份番石榴種質(zhì)資源進(jìn)行倍性鑒定,測(cè)定CV 值低于2.36%,表明優(yōu)化的流式細(xì)胞術(shù)可以確保番石榴倍性鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性。
本研究建立了番石榴種質(zhì)資源流式細(xì)胞術(shù)鑒定其倍性的方法,該方法檢測(cè)條件為:選取番石榴新鮮花瓣或-80℃冷凍保存的花瓣,加入1 mL 的mGb裂解液中混合切碎,400 目濾膜過濾后加入30 μL PI 染色1 min 即可上機(jī)檢測(cè)。33 份番石榴種質(zhì)資源倍性整體變異系數(shù)為1.68%-2.36%,二倍體32 份,六倍體1 份。該體系的建立及番石榴種質(zhì)資源倍性的明確對(duì)下一步番石榴倍性育種和雜交育種奠定了基礎(chǔ)。