李建男,郝若堯,樊麗婷,李玉萌,張勝男,孟建宇
(1. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院旱寒區(qū)環(huán)境微生物學(xué)與技術(shù)實(shí)驗(yàn)室,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010011;2. 內(nèi)蒙古自治區(qū)林業(yè)科學(xué)研究院,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010010)
磷是植物生長必需的第二營養(yǎng)元素, 對植物的生長發(fā)育有著重要作用, 磷可以加速植物的根系和幼芽的生長,促進(jìn)細(xì)胞分裂,促進(jìn)植物的呼吸作用和養(yǎng)分和水分的吸收;促進(jìn)植物脂肪、蛋白質(zhì)、碳水化合物的代謝、合成、運(yùn)轉(zhuǎn);提高植物的抗旱、抗寒、抗病和抗鹽堿的能力,并增強(qiáng)植物的抗逆性,改善產(chǎn)品的品質(zhì);縮短根瘤的發(fā)育和存活時(shí)間,增加根瘤的體積、數(shù)量和氮素同化量,促進(jìn)豆科植物根系的生長,提高豆科植物產(chǎn)品的含氮量和產(chǎn)量。 磷元素往往以難溶性磷的形式存在,植物很難吸收利用,所以在低水平可利用磷素的樟子松林地, 可利用磷的缺失必定會嚴(yán)重影響其幼苗的生長[1]。
樟子松 (Pinus sylvestris) 是一種具有抗旱、耐寒、耐貧瘠、抗病蟲害等抗逆能力的針葉樹種[2],在我國西北、華北、東北地區(qū)廣泛分布,在遏制土地荒漠化、保護(hù)當(dāng)?shù)氐霓r(nóng)牧生態(tài)系統(tǒng)中起著重要的作用。但是,近幾年樟子松固沙林出現(xiàn)了嚴(yán)重的退化[3]。 有研究表明, 樟子松固沙林土壤含磷量處于我國森林生態(tài)系統(tǒng)土壤磷素含量的最低水平[4],生長在荒漠地區(qū)的樟子松生長本就受干旱脅迫影響, 再加上土壤中可利用的磷含量較低,嚴(yán)重影響了樟子松的生長。
大量研究表明, 土壤中存在大量的溶磷菌(Phosphate Solubilizing Bacteria,PSB), 溶磷菌是指能夠?qū)⑼寥乐胁蝗苄粤邹D(zhuǎn)化為可被植物吸收利用的磷的一類細(xì)菌。 目前發(fā)現(xiàn)具有溶磷作用的細(xì)菌有芽孢桿菌(Bacillus)、假單胞桿菌(Pseudomonas)、歐文氏菌(Erwinia)、土壤桿菌(Agrobacterium)、沙雷氏菌(Serratia)、 黃桿菌 (Flavobacterium)、 腸桿菌(Enterbacter)、 微球菌 (Micrococcus)、 固氮菌(Azotobacter)、慢生根瘤菌(Bradyrhizobium)、沙門氏菌(Saimonella)、色桿菌(Clromobacterium)、產(chǎn)堿菌(Alcaligenes)、 節(jié)桿菌 (Arthrobacter)、 硫桿菌(Thiobacillus)、埃希氏菌(Escherichia)[5-6]等。 有研究發(fā)現(xiàn),將溶磷菌接種于植物后能顯著增加土壤及植株的磷、鉀、鎂等礦質(zhì)元素含量[7-9],而且溶磷菌還可以改善植物根際微生物群落結(jié)構(gòu),并對植物生理指標(biāo)有積極影響[10]。 邢芳芳等[11]分離得到的解磷菌枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)對白菜具有明顯的促生作用,經(jīng)其處理后,白菜葉片數(shù)、葉綠素,以及產(chǎn)量都得到明顯提高,這說明本研究具有一定的可行性。
鑒于此, 本研究對遼寧省彰武縣樟子松固沙林的土壤樣品中的溶磷菌進(jìn)行分離鑒定、 測定溶磷能力、分析固沙林土壤中的溶磷菌類群,旨在為后續(xù)溶磷菌能否對植物尤其是生存環(huán)境較差的植物產(chǎn)生促生效果提供理論基礎(chǔ), 在不破環(huán)生態(tài)環(huán)境的基礎(chǔ)上使用微生物對植物的生長產(chǎn)生積極影響, 并且可以豐富功能根際促生細(xì)菌資源庫以及開發(fā)新的改善土壤磷素營養(yǎng)的途徑, 并為后續(xù)微生物肥料研發(fā)及樟子松固沙林修復(fù)提供理論依據(jù)。
1.1.1 樣品采集 土壤樣品采自遼寧省彰武縣章古臺試驗(yàn)基地,利用多點(diǎn)采樣法,選取7 點(diǎn)去除土壤表面枯枝落葉,收集深度為0~20 cm 的土壤,裝入無菌采樣袋,混合均勻后,置于4 ℃車載冰箱中,運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行溶磷細(xì)菌的分離和純化。
1.1.2 培養(yǎng)基配方[12]無機(jī)磷固體培養(yǎng)基:葡萄糖10 g·L-1,硫酸銨0.5 g·L-1,氯化鈉0.3 g·L-1,氯化鉀0.3 g·L-1,七水硫酸鎂0.3 g·L-1,磷酸鈣5 g·L-1,七水硫酸亞鐵0.03 g·L-1, 一水硫酸錳0.03 g·L-1, 瓊脂20 g·L-1,蒸餾水1 000 mL,pH 值7.4~7.6。
R2A 液體培養(yǎng)基:酵母粉0.5 g·L-1,蛋白胨0.5 g·L-1,酸水解酪蛋白胨0.5 g·L-1,葡萄糖0.5 g·L-1,淀粉0.5 g·L-1,磷酸氫二鉀0.3 g·L-1,丙酮酸鈉0.3 g·L-1,七水硫酸鎂0.05 g·L-1,TES 2 mL,蒸餾水1 000 mL。
1.2.1 土壤細(xì)菌分離 稱取土樣1 g,加入100 mL,無菌水,放入搖床中振蕩30 min,靜置至土壤全部沉淀,吸取上清液依次按照1∶10 的比例稀釋。 取土壤懸浮液100 μL, 分別涂布在無機(jī)磷固體培養(yǎng)基上,每個(gè)梯度的稀釋液做3 組重復(fù),倒置放入培養(yǎng)箱中,在28 ℃條件下,培養(yǎng)3~5 d。挑取形態(tài)不同的單一菌落進(jìn)行劃線純化培養(yǎng)。
1.2.2 菌株的16S rDNA 的鑒定及其同源性分析按照試劑盒TIANamp Bacteria DNA Kit(China)的操作步驟提取DNA。 取細(xì)菌培養(yǎng)液3 mL,10 000 r·min-1離心1 min,吸上清液。 向沉淀物中加入200 μL 緩沖液GA,振蕩至菌體徹底懸浮。 向離心管中加入20 μL proteinase K 溶液,混勻。加入緩沖液GB 220 μL,振蕩15 s,在70 ℃水浴鍋中放置10 min,待離心管中溶液變清澈后, 短暫離心。 加入無水乙醇220 μL,振蕩15 s。將之前獲得的溶液及絮狀沉淀加入到一個(gè)CB3 吸附柱中,然后放入離心管中,12 000 r·min-1離心30 s, 倒掉廢液, 將吸附柱放入收集管中。 向CB3 吸附柱中加入緩沖液GD 500 μL,12 000 r·min-1離心30 s,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。 向CB3 吸附.柱加入漂洗液PW 500 μL,12 000 r·min-1離心30 s,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中。 將吸附柱放入收集管中,12 000 r·min-1離心2 min,倒掉廢液,將CB3 吸附柱置.于室溫放置數(shù)分鐘,徹底晾干吸附柱中的漂洗液。 將CB3 吸附柱放入一個(gè)干凈的離心管中, 向吸附膜的中間懸空滴加洗脫緩沖液TE 120 μL, 室溫靜置5 min,12 000 r·min-1離心2 min,將溶液收集到離心管中。 至此對細(xì)菌DNA 提取完成。 接下來對菌株的16S rDNA 進(jìn)行擴(kuò)增。 菌株的16S rDNA 基因擴(kuò)增引物為細(xì)菌通用引物27F 和1492R。 PCR 產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序,將測序得到的16S rDNA 序列通過Blast-n (Nucleotide BLAST: Search nucleotide databases using a nucleotide query(nih.gov))與Nucleotidecollection(Home-Nucleotide-NCBI(nih.gov))數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,用MEGA 6.0 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.3 菌株的溶磷能力測定 將分離純化的溶磷菌接種至R2A 液體培養(yǎng)基中, 待菌株濃度生長至1×108CFU·mL-1時(shí), 按1%接種量接種至無機(jī)磷液體培養(yǎng)基中, 放入溫度為28.5 ℃, 轉(zhuǎn)速為180 r·min-1的振蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2 d。 吸取上清液10.00 mL 于25 mL 比色管中, 緩慢加入鉬銻抗顯色劑5.00 mL,緩慢搖動(dòng),排出二氧化碳后,加水定容至25.00 mL,充分搖勻。 在室溫高于20 ℃處, 放置30 min, 用1 cm 光徑玻璃比色皿在波長880 nm 處比色,測量吸光度。
吸取磷標(biāo)準(zhǔn)溶液 (磷標(biāo)準(zhǔn)使用液)0.00、0.50、1.00、1.50、2.00、2.50、3.00 mL, 于25 mL 色管中,加入NaHCO3浸提劑10.00 mL, 鉬銻抗顯色劑5.00 mL,慢慢搖動(dòng),排出二氧化碳,后加水定容至25.00 mL。此系列溶液中磷的濃度依次為0.00、0.10、0.20、0.30、0.40、0.50、0.60 μg·mL-1。 將溶液放置在室溫高于20~30 ℃處,放置30 min,用1 cm 光徑玻璃比色皿在波長880 nm 處比色,用系列溶液的零濃度調(diào)節(jié)儀器零點(diǎn),測量吸光值,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線并計(jì)算回歸方程。 計(jì)算公式如下:
有效磷測定值(mg·kg-1)=(ρ×V×D)/(m×103)×103式中,ρ 為溶液中磷的質(zhì)量濃度 (μg·mL-1);V 為顯色液體積,25 mL;D 為分取倍數(shù), 即試樣提取液體積/顯色時(shí)分取體積,本試驗(yàn)為50/10;M 為風(fēng)干試樣質(zhì)量(g)。
本研究從遼寧省彰武縣樟子松固沙林地土壤樣本中共分離獲得3 株具有較強(qiáng)溶磷能力的細(xì)菌,其編號分別為30-3、30-4 和36-5(表1)。 其中,菌株30-3 和30-4 的溶磷能力較強(qiáng), 溶磷量均為37.63 mg·L-1;菌株36-5 的溶磷能力相對較弱,其溶磷量為32.24 mg·L-1。本研究分離到的菌株都是常見的具有溶磷能力的菌屬,溶磷能力屬于中等水平。
根據(jù)16S rDNA 的測序結(jié)果與NCBI 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對, 對菌株30-3、30-4、36-5 進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(圖1)。 由圖1 可知,菌株30-3 與Bacillus aryabhattai處于同一分支,親緣關(guān)系較近,其序列同源性為99%;菌株30-4 與Paenibacillus tyrfis處于同一分支,親緣關(guān)系較近,其序列同源性為99%;菌株36-5 與Rhizobium jaguaris處于同一分支, 親緣關(guān)系較近, 其序列同源性為99%。 因此,3 株菌株分屬芽孢桿菌屬(Bacillus)、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)和根瘤菌屬(Rhizobium)。
圖1 基于16SrDNA 序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
本研究對遼寧省彰武縣樟子松固沙林土壤中的可培養(yǎng)溶磷細(xì)菌進(jìn)行分離純化和鑒定, 獲得3 株具有較強(qiáng)溶磷能力的細(xì)菌, 其編號和近緣種分別為30-3(Bacillus aryabhattai)、30-4(Paenibacillustyrfis)和36-5(Rhizobium jaguaris)。 藺寶珺等[13]從高寒草甸土壤中分離出數(shù)量最多的溶磷菌為芽孢桿菌屬(Bacillus.sp);孟建宇等[14]從內(nèi)蒙古荒漠灌木根內(nèi)分離出12 株具有溶磷能力的菌株,其中有5 株細(xì)菌屬于芽孢桿菌屬 (Bacillus.sp), 占分離總菌株數(shù)的41.67%;孟建宇等[15]從內(nèi)蒙古鄂爾多斯荒漠5 種灌木根際土中分離出62 株具有溶磷能力的細(xì)菌,其中芽孢桿菌屬(Bacillus.sp)為優(yōu)勢屬,占分離總菌株數(shù)的17.74%。 本研究也分離得到一株芽孢桿菌,說明芽孢桿菌屬可能在溶磷菌中占有較大的百分比。 本研究結(jié)果表明, 菌株30-3 (Bacillus aryabhattai)和30-4(Paenibacillus tyrfis)具有較強(qiáng)的溶磷能力,且溶磷量都為37.63 mg·L-1; 菌株36-5(Rhizobium jaguaris)也具有一定的溶磷能力,其溶磷量為32.24 mg·L-1,說明芽孢桿菌屬(Bacillus)與類芽孢桿菌屬(Paenibacillus) 的溶磷能力可能強(qiáng)于根瘤菌屬(Rhizobium)。 有研究表明,Bacillus對難溶性磷酸鹽的溶解量為647.8 mg·L-1, 溶解有機(jī)磷的溶磷量為26.6 mg·L-1[16]。陳俊等[17]從紅樹林植物根際中分離出Paenibacillus ginsengagri,溶磷量為52.88 mg·L-1。 李劍鋒等[18]從蘭州市西北部屬溫帶半干旱大陸性氣候分離出Rhizobiumsp.,溶磷量為6.98 mg·L-1。通過以上的研究結(jié)果對比可知, 篩選出來的溶磷菌溶磷能力差異可能與其生存環(huán)境有關(guān)。 有研究表明,Bacillus除了具有溶磷作用之外,還具有一定的耐鹽性,可在20%NaCl 濃度下生長[19]。周妍等[20]發(fā)現(xiàn),從綠豆根際土中分離的溶磷菌能夠促進(jìn)植物在鹽脅迫下生長。 閆楊等[21]發(fā)現(xiàn),Bacillus對土壤關(guān)鍵酶活性有一定的影響;Paenibacillus具有解鉀能力[22],可以分泌植物體內(nèi)重要的激素-吲哚乙酸 (IAA)[23],IAA不僅可以促進(jìn)植物生長同時(shí)可以增強(qiáng)植物干旱脅迫抗性[24]。 王志剛等[25]從齊齊哈爾龍江縣辣椒根際土中得到3 株具有產(chǎn)IAA 能力的溶磷菌;Rhizobium具有耐堿能力[26]以及固氮能力[27]。根據(jù)16S rDNA的測序結(jié)果與NCBI BLAST 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對, 對菌株30-3、30-4 和36-5 進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹, 本研究發(fā)現(xiàn)菌株30-3 與Bacillusaryabhattai親緣關(guān)系較近;菌株30-4 與Paenibacillus tyrfis親緣關(guān)系較近; 菌株36-5 與Rhizobium jaguaris親緣關(guān)系較近。 吳倩倩等[28]在荒漠地區(qū)錦雞兒屬植物中篩選出Bacillus,且是6 種不同錦雞兒內(nèi)生菌的優(yōu)勢菌群。 李麗[29]從中國西北地區(qū)分離到159 株根瘤內(nèi)生細(xì)菌, 其中Paenibacillus有31 株,而且除了具有溶磷能力之外還具有產(chǎn)蛋白酶的能力;Rhizobium有25 株,除了具有溶磷能力之外,還具有固氮的能力,對植物生長都有著積極的影響,但是其能力是隨機(jī)的而且不穩(wěn)定。 綜上所述,土壤中存在具有溶磷能力的細(xì)菌,這些溶磷菌不僅可以提高土壤中可溶磷的含量,同時(shí)還能通過分泌自身代謝產(chǎn)物來促進(jìn)植物生長,并提高植物的抗逆能力。
本研究從遼寧省彰武縣樟子松固沙林中分離出3 株溶磷細(xì)菌, 編號分別為30-3、30-4 和36-5,其最近緣物種分別為Bacillus aryabhattai、Paenibacillus tyrfis和Rhizobium tropici, 經(jīng)過測定均具有較強(qiáng)的溶磷能力。由此可知,遼寧省彰武縣樟子松固沙林土壤中具有較多種類的溶磷細(xì)菌, 將溶磷菌用于微生物肥料, 可為微生物磷肥的生產(chǎn)和開發(fā)提供菌種資源, 為解決樟子松人工固沙林土壤可溶磷含量低的問題提供理論依據(jù), 對促進(jìn)綠色農(nóng)業(yè)的發(fā)展具有重要意義。