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      m6A甲基轉(zhuǎn)移酶家族Fiona/METT-10/METTL16的功能

      2023-11-23 12:30:10黃武強容益康
      關(guān)鍵詞:殘基基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物

      龔 娟 黃武強 容益康

      (1)南華大學(xué)衡陽醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院,衡陽 421001;2)南華大學(xué)衡陽醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院,衡陽 421001;3)南華大學(xué)衡陽醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,衡陽 421001)

      化學(xué)修飾是調(diào)控生命活動的重要手段,廣泛見于DNA、RNA和蛋白質(zhì)中,其中RNA上的化學(xué)修飾最為豐富,迄今為止人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了上百種不同類型的RNA 修飾,包括脫氨基、異構(gòu)化、糖基化和甲基化等[1]。其中甲基化修飾幾乎占據(jù)2/3[2],尤其是腺苷上第6 位氮原子的甲基化修飾N6-甲基腺苷化(N6-methyladenosine,m6A)是目前數(shù)量最多且研究最充分的修飾之一,它幾乎存在于所有類型的RNA 中。1970 年就已經(jīng)發(fā)現(xiàn)m6A 是mRNA 上最豐富的內(nèi)部修飾,而且?guī)缀趺總€mRNA 中都有2~3 個m6A 修飾位點[3],主要靠近終止密碼子和3'非翻譯區(qū)(UTR)區(qū)域[4]。

      轉(zhuǎn)錄后的m6A 修飾能從多方面調(diào)控RNA 的功能,它對RNA 的二級結(jié)構(gòu)會產(chǎn)生不同的影響,在雙鏈中會降低其穩(wěn)定性,而未配對腺嘌呤上的m6A修飾會增加臨近螺旋的穩(wěn)定性[5]。m6A 會被某些m6A 識 別 蛋白識別,在pre-mRNA 的 剪 接[6]、降解[7]和翻譯[8]等過程中起關(guān)鍵作用。此外,m6A的修飾是一個動態(tài)過程,它可以被m6A去甲基轉(zhuǎn)移酶如FTO[9]和ALKBH5[10]去除,調(diào)控RNA 代謝的這種動態(tài)變化會影響哺乳動物的晝夜節(jié)律[11]、干細(xì)胞發(fā)育分化[12]以及腫瘤的發(fā)生[13]等。

      METTL3/METTL14 是最早被鑒定出來的m6A甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合物,它們負(fù)責(zé)真核生物mRNA 中大部分的m6A修飾[14-15]。METTL3在該復(fù)合物中起著核心作用,它能利用S-腺苷基甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)甲基化腺苷酸[16],而METTL14 主要是在維持復(fù)合物穩(wěn)定性和識別RNA 底物方面起作用[17]。一系列研究表明,WTAP、RBM15/15B 和KIAA1429 等 蛋 白 質(zhì) 和METTL3/14 復(fù)合物一起發(fā)揮作用[18],而且這些蛋白質(zhì)的缺失都會造成m6A水平的降低[19]。

      近年來發(fā)現(xiàn)的另外一種甲基轉(zhuǎn)移酶METTL16,是一種從低等生物到高等生物均高度保守的蛋白質(zhì)[20],METTL16 和METTL3/14 復(fù)合物雖然都是m6A甲基轉(zhuǎn)移酶,但它們之間的結(jié)構(gòu)以及識別底物的特異性有較大的差異。與METTL3/14 復(fù)合物相比,METTL16 蛋白可以獨立發(fā)揮其甲基化功能。METTL3/14傾向于甲基化單鏈RNA,而METTL16更傾向于識別共識序列附近包含雙鏈的RNA 底物[21-22]。作為SAM依賴的甲基轉(zhuǎn)移酶METTL16和METTL3/14復(fù)合物都屬于I類甲基轉(zhuǎn)移酶,并帶有保守的由β折疊和α 螺旋組成的羅斯曼折疊,它們之間的整體三維空間結(jié)構(gòu)類似,但其β折疊明顯不同,這可能就是它們之間底物序列偏好性不同的原因[23]。

      目前已知METTL16 是SAM 合成酶MAT2A(methionine adenosyltransferase 2)的pre-mRNA 和小核RNA(small nuclear RNA,snRNA)U6 的甲基轉(zhuǎn)移酶[22,24],也發(fā)現(xiàn)METTL16可以特異性識別肺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)lncRNA 的三螺旋結(jié)構(gòu)[25],但其甲基化作用并未被證實,猜測METTL16 除了甲基轉(zhuǎn)移酶活性外可能還有別的作用,最新研究發(fā)現(xiàn)METTL16 以不依賴其甲基酶活性的方式促進(jìn)翻譯也說明了這一點[26]。本綜述除了主要討論m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶——METTL16,還簡單介紹了其他的m6A甲基轉(zhuǎn)移酶(表1)。

      Table 1 m6A Methyltransferases表1 m6A甲基轉(zhuǎn)移酶

      1 METTL16及其同源蛋白的結(jié)構(gòu)

      METTL16 是一個保守蛋白質(zhì),在哺乳動物中有562 個氨基酸,可以分為N 端RNA 結(jié)合域(RBD)、甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域和脊椎動物保守區(qū)(VCR)(圖1)[24],而在大腸桿菌、線蟲和果蠅等低等生物中只有N 端的兩個結(jié)構(gòu)域,沒有VCR 區(qū)域[20]。不同于METTL3/14 復(fù)合物的異源二聚體,全長的METTL16是以同源二聚體形式存在[33],而且METTL16在沒有VCR域的情況下是單體,并且其甲基化活性也不會消除。

      1.1 甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域

      METTL16 蛋白N 端殘基1~291 一直以來都被認(rèn)為是甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域, 直到2018 年Ruszkowska 等[23]才發(fā)現(xiàn)它是由殘基40~291 組成。該結(jié)構(gòu)域高度保守(圖2),其結(jié)構(gòu)中有一個由正電荷簇形成的寬溝槽[24],該溝槽主要是與RNA中帶負(fù)電的磷酸主鏈相互作用。SAM 的腺苷部分由Thr164 殘基識別,結(jié)合在甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域的疏水袋中,通過氫鍵與其殘基相互作用[24]。METTL16中殘基184~187 NPPF是活性位點,在所有生物體中都保守,位于SAM 結(jié)合位點和正電荷溝槽之間,將這些殘基進(jìn)行突變(如PP185/186AA和F187G)則會破壞METTL16 的甲基化活性[22]。METTL16中的Arg200是組成構(gòu)象的關(guān)鍵殘基,它能和RNA 直接接觸,在大腸癌患者中該氨基酸突變?yōu)楣劝滨0?,Doxtader 等[33]發(fā)現(xiàn),R200Q 突變會顯著提高其甲基化活性,但不影響其與RNA 的親和力。在這段區(qū)域中還包含一段由190~218殘基組成的無序環(huán),將其刪除會破壞其甲基化活性,而突變3 個氨基酸(即RRR-200-203-204-EEE)就可以恢復(fù)其甲基化作用[22]。

      METTL16 的甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域中一個比較特別的方面是殘基163~167 會形成一個有序多肽環(huán)(K-Loop),METTL16 可以通過K-Loop 阻斷SAM進(jìn)入疏水袋從而降低甲基化效率。當(dāng)沒有結(jié)合RNA 時Lys163 暴露在外,其他的疏水側(cè)鏈如Met167也遠(yuǎn)離SAM結(jié)合位點,而結(jié)合RNA后會通過疏水作用將K-Loop 靶向至甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域,導(dǎo)致Lys163的側(cè)鏈占據(jù)SAM催化袋從而封閉SAM結(jié)合位,所以在不同SAM濃度下METTL16會通過調(diào)節(jié)K-Loop 構(gòu)象從而調(diào)節(jié)其甲基化效率。用丙氨酸取代K-Loop的氨基酸會顯著增加其甲基化活性,即使在較低濃度的SAM 條件下也能表現(xiàn)較高的甲基化水平,而對RNA的親和力影響微乎其微[33]。

      1.2 N端RNA結(jié)合域

      Mendel 等[22]把N 端前40 個殘基歸為RNA 結(jié)合域,因為他們發(fā)現(xiàn)敲除METTL16前40個殘基后無法與RNA相互作用從而進(jìn)行甲基化。METTL16的N端結(jié)構(gòu)域中存在幾個高度保守的極性正電荷殘基,這些殘基形成了一個足以容納雙鏈RNA 的溝槽,該溝槽可以和RNA 帶負(fù)電的磷酸主鏈相互作用。即使甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域中也包含一個正電荷溝槽,溝槽內(nèi)排列著能夠吸引帶負(fù)電荷RNA 的氨基酸,但它本身并不足以將RNA 保留在溝槽內(nèi),所以N端的RNA結(jié)合域?qū)τ贛ETTL16的甲基化作用至關(guān)重要,將該結(jié)構(gòu)域的帶電殘基突變會影響與RNA的結(jié)合,進(jìn)而破壞對RNA的甲基化[22-23]。

      1.3 高等生物特有的VCR結(jié)構(gòu)域

      VCR 結(jié)構(gòu)域是高等生物中特有的一段區(qū)域,位于人METTL16 蛋白C 端的310~562 殘基,該區(qū)域包括VCR1(殘基310~400)、VCR2(殘基514~562)以及兩者連接區(qū)域(殘基401~513)。由于VCR 之間跨越了殘基514~562 這一段長的無序區(qū)域,所以直到2020 年才通過去除兩個VCR 之間的連接區(qū)域確定了該區(qū)域的晶體結(jié)構(gòu)[21]。Aoyama等[21]發(fā)現(xiàn),METTL16的N端殘基1~291的蛋白質(zhì)就具有甲基化活性,而C 端VCR 結(jié)構(gòu)域能夠進(jìn)一步提高N端片段對底物的親和力從而增強甲基化效率。METTL16 富含精氨酸的“RRR”區(qū)域(殘基382~388)缺失會影響METTL16 與RNA 的結(jié)合活性從而使其甲基化活性降低,VCR 在拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)上與U6特異性末端尿苷酰轉(zhuǎn)移酶(TUT1)的激酶相關(guān)1(KA1)結(jié)構(gòu)域同源,它主要是通過與RNA結(jié)合發(fā)揮作用[34-35]。Aoyama 等[21]在體外純化了N端結(jié)構(gòu)域和KA1 的重組蛋白,發(fā)現(xiàn)這個蛋白質(zhì)的甲基化效率比單獨的N 端蛋白質(zhì)高,而且突變KA1 的RNA 結(jié)合位點明顯降低了其甲基化效率,所以他們認(rèn)為在METTL16中VCR域作為一個鉗子結(jié)合雙鏈RNA。雖然這些結(jié)構(gòu)域在結(jié)構(gòu)上有高度同源性,但是在序列上并沒有很高的相似性[36]。目前關(guān)于METTL16 的VCR 靶向RNA 的序列特異性并不清楚。

      2 METTL16的甲基化功能

      目前為止已經(jīng)證實了METTL16 的底物,包括哺乳動物MAT2A、線蟲sams 的pre-mRNA、U6 snRNA 以及擬南芥中若干mRNA,其中SAM 合成酶的pre-mRNA 和U6 底物中都包含保守的UACAGAGAA 序列(下劃線處是甲基化位點),但是在人類中具有這個序列的mRNA 大部分都沒有被甲基化[20]。為了尋找底物特征,研究者們針對U6 和MAT2A pre-mRNA 構(gòu)建了一系列的突變,發(fā)現(xiàn)它們都需要這9個保守堿基和莖環(huán)結(jié)構(gòu)才能被甲基化[22,33],但最新的研究卻發(fā)現(xiàn),在擬南芥中METTL16 同源蛋白FIONA1 的甲基化作用既不需要這9 個保守堿基也不需要二級結(jié)構(gòu)[30],目前發(fā)現(xiàn)的METTL16 的靶點還十分有限,其底物共性尚不明確。

      2.1 U6 snRNA

      U6 是一個非編碼的snRNA,它與其他snRNA和蛋白質(zhì)組裝成一個剪接體復(fù)合物參與pre-mRNA的剪接過程。大約40年前就發(fā)現(xiàn)U6的A43處有一個m6A 修飾,并位于發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖突處[37],在酵母中突變該位點會導(dǎo)致死亡[38]。直到2017 年才證明了METTL16 是其甲基轉(zhuǎn)移酶[24],Warda 等[39]認(rèn)為METTL16 很有可能是在U6 與其他部分結(jié)合之前發(fā)揮其甲基化作用。

      除了釀酒酵母的U6 上沒有該修飾外,裂殖酵母以及更高級的生物中均有該修飾,盡管U6 中m6A 附近區(qū)域?qū)τ谥笇?dǎo)剪接是很有必要的,但其m6A 修飾的具體作用仍然不明確[40]。Warda 等[39]發(fā)現(xiàn),在細(xì)胞中敲低METTL16 并不會影響U6 的整體表達(dá)水平,而U6 上的m6A 水平明顯降低了。在小鼠、細(xì)胞和擬南芥中發(fā)現(xiàn)敲除METTL16 后并沒有發(fā)現(xiàn)明顯的整體剪接變化,但最近在裂殖酵母中發(fā)現(xiàn)U6 上的m6A 修飾對5'端剪接位點為非“AAG”且第4 位內(nèi)含子為“A”堿基的剪接有促進(jìn)作用[40]。這是目前唯一關(guān)于U6上m6A修飾作用的研究,而在其他生物中的作用目前尚不可知。

      2.2 MAT2A pre-mRNA 3'UTR

      SAM 作為細(xì)胞內(nèi)一種重要代謝物,是DNA、RNA 和蛋白質(zhì)大多數(shù)甲基化反應(yīng)的甲基供體,對基因的正常調(diào)控至關(guān)重要。細(xì)胞內(nèi)SAM 的水平受到嚴(yán)格調(diào)控,這與細(xì)胞增殖、免疫和衰老有關(guān)。MAT2A 是催化甲硫氨酸和三磷酸腺苷(ATP)生成SAM的關(guān)鍵酶[41]。2017年的研究發(fā)現(xiàn)在細(xì)胞中METTL16 通過負(fù)反饋機制調(diào)節(jié)MAT2A pre-mRNA的剪接以調(diào)控細(xì)胞內(nèi)的SAM穩(wěn)態(tài)[24](圖3)。而且敲除METTL16的小鼠能發(fā)育到囊胚時期,但在著床前后會停止發(fā)育死亡,轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)在該小鼠中MAT2A含量顯著降低,并且著床前清除了基因的大量甲基化,而著床后要恢復(fù)其正常水平,所以作者認(rèn)為MAT2A 的降低造成了小鼠的死亡[22]。MAT2A 的3'UTR 處包含6 個發(fā)夾結(jié)構(gòu)(hp1~6),其序列、結(jié)構(gòu)和位置都很相似[42],環(huán)中都有近乎不變的“UACAGAGAA”序列,這些發(fā)夾結(jié)構(gòu)通過不同的機制參與METTL16介導(dǎo)的細(xì)胞調(diào)控。在體外METTL16 能分別對這6 個發(fā)夾結(jié)構(gòu)進(jìn)行甲基化,但其效率不同,其中hp5 的效率最高[33]。METTL16 能夠直接結(jié)合hp1,根據(jù)細(xì)胞內(nèi)SAM 濃度調(diào)控MAT2A 的剪接。當(dāng)SAM 濃度較高時,METTL16 會結(jié)合hp1 并進(jìn)行甲基化,然后快速解離以保留有內(nèi)含子的亞型,隨后該亞型被YTHDC1 識 別 并 降 解[43],可 能m6A 修飾 會 降 低METTL16 與RNA 的結(jié)合能力從而引發(fā)了這一現(xiàn)象。而當(dāng)SAM濃度較低時,METTL16雖然無法對hp1 進(jìn)行甲基化,但會增加在pre-mRNA 的滯留時間導(dǎo)致內(nèi)含子剪接變多,從而表達(dá)更多成熟的mRNA 用來 翻 譯MAT2A 蛋白。METTL16 酶活 位點突變不影響成熟mRNA 的形成,而RNA 結(jié)合位點突變則會對它產(chǎn)生影響,這就說明了METTL16的結(jié)合作用對于誘導(dǎo)MAT2A pre-mRNA 的剪接至關(guān)重要[24]。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析敘述了METTL16 的VCR 結(jié)構(gòu)域是通過促進(jìn)蛋白質(zhì)與RNA 結(jié)合發(fā)揮作用,而這段區(qū)域只存在脊椎動物中,這可能是METTL16 只在高等動物中才能驅(qū)動剪接,而在低等動物中目前還沒發(fā)現(xiàn)這個作用的原因。

      2.3 線蟲sams pre-mRNA

      線蟲METT-10是METTL16的同源蛋白質(zhì),都是SAM 合成酶pre-mRNA 的甲基轉(zhuǎn)移酶。但與哺乳動物不同的是,在線蟲sams pre-mRNA的內(nèi)含子2 和外顯子3 連接處發(fā)現(xiàn)有一個m6A 修飾,并且將METT-10 敲除后就檢測不到該修飾了,體外實驗也證實了METT-10能對該位點進(jìn)行甲基化(圖3)。與METTL16 甲基化底物中都包含的保守序列UACm6AGAGAA 相 比,sams 的m6A 位 點 附 近UACm6AGAAAC 序列有一個堿基的差別,這個修飾位于剪接位點而且在低等生物中這段區(qū)域比較保守。在線蟲的剪接過程中,U2 輔助因子35(U2 auxiliary factor 35,U2AF35)需要結(jié)合3'端的AG二核苷酸以招募U2AF 復(fù)合體從而剪接出成熟的mRNA。當(dāng)SAM 含量不足時,METT-10 無法對sams的pre-mRNA進(jìn)行m6A甲基化從而能合成編碼蛋白質(zhì)的mRNA,而SAM 含量較高時,METT-10會對sams pre-mRNA 的3'剪接位點AG 的腺嘌呤上進(jìn)行m6A甲基化,U2AF35與有m6A修飾位點的親和力降低從而會影響其正確剪接,進(jìn)而導(dǎo)致它的降解,以此調(diào)控機體內(nèi)SAM 的穩(wěn)態(tài)[44-45]。目前針對線蟲中sams 的降解機制有兩種,其中一種機制是U2AF35 雖然無法結(jié)合到正確的剪接位點進(jìn)行剪接,但是它會結(jié)合另一個近3'端剪接位點進(jìn)行剪接產(chǎn)生無意義的mRNA 亞型,從而被降解(圖3),另一種則是沒有剪接過程而是pre-mRNA直接進(jìn)行降解,這兩種降解機制雖然有些許差異,但其生物學(xué)意義一致。其他無脊椎動物的SAM 合成酶是否也符合上述的剪接調(diào)控機制需要進(jìn)一步證實[44]。在擬南芥中METTL16 同源蛋白FIONA1 無論是在低或者高SAM 條件下,都不會對SAM 合成酶的pre-mRNA 進(jìn)行甲基化,也不會影響它的轉(zhuǎn)錄水平[30]。

      雖然在哺乳動物和線蟲中METTL16 及其同源蛋白質(zhì)調(diào)控SAM 的機制不一樣,但調(diào)控的生物學(xué)功能一樣(圖3)。在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)METTL16還有幫助MAT2A pre-mRNA 剪接的功能,所以METTL16的敲除會使機體中的SAM含量減少,研究者們猜測VCR結(jié)構(gòu)域?qū)ETTL16的剪接功能至關(guān)重要。線蟲中并無這一結(jié)構(gòu)域,敲除METT-10遠(yuǎn)3'端剪接位點缺少甲基化修飾,從而能正確剪接合成成熟的mRNA使SAM含量增多[44],關(guān)于這一現(xiàn)象目前并沒有一個合理的解釋,猜測可能是因為物種進(jìn)化導(dǎo)致的。

      3 METTL16非酶活功能

      METTL16 的甲基轉(zhuǎn)移酶和非酶活功能一直以來備受關(guān)注。與MALAT1 lncRNA之間的相互作用很早就發(fā)現(xiàn)了,但其是否依賴甲基轉(zhuǎn)移酶活性尚不明確。另外還發(fā)現(xiàn),METTL16 以一種不依賴甲基轉(zhuǎn)移酶功能促進(jìn)翻譯,這都說明METTL16 擁有除了甲基轉(zhuǎn)移酶功能以外的其他作用。

      3.1 MALAT1 lncRNA

      MALAT1 是一種在哺乳動物中常見的高度保守的核保留lncRNA,2003 年首次發(fā)現(xiàn)于非小細(xì)胞肺癌中,它在多種腫瘤中高表達(dá),能促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、轉(zhuǎn)移和侵襲等。研究發(fā)現(xiàn),MALAT1 3'端形成的三螺旋結(jié)構(gòu)可以保護(hù)MALAT1免受3'→5'核酸外切酶的剪切,從而維持MALAT1 的完整性,并使其在細(xì)胞中積累[46-47]。體內(nèi)外實驗均證明METTL16 能特異性識別MALAT1 的3'端三螺旋結(jié)構(gòu)[25],而且MALAT1 與METTL16 同源二聚體相互作用,而不與無VCR結(jié)構(gòu)域的METTL16相互作用。雖然發(fā)現(xiàn)MALAT1與METTL16相互作用的位點附近有一個m6A 修飾的腺苷[48],但它們之間的結(jié)合是否涉及甲基化尚不清楚[23]。

      3.2 METTL16促進(jìn)蛋白質(zhì)翻譯

      METTL16 在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中皆存在,且其定位不依賴甲基轉(zhuǎn)移酶活性,其甲基化修飾作用在細(xì)胞核中完成,而在胞質(zhì)中它可能發(fā)揮其他功能。在人細(xì)胞中觀察發(fā)現(xiàn),敲除METTL16 會顯著降低翻譯效率,進(jìn)一步研究也表明METTL16 促進(jìn)翻譯的功能不依賴于其甲基轉(zhuǎn)移酶功能。mRNA的5'端m7G 帽子和真核翻譯起始因子3 (eukaryotic translation initiation factor 3 subunit,eIF3)在翻譯起始過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,METTL16 以不依賴RNA 的方式與eIF3a/b 和m7G 特異性結(jié)合,表明METTL16 可能參與翻譯起始。對METTL16的結(jié)構(gòu)進(jìn)行突變后發(fā)現(xiàn),其甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域?qū)τ谂ceIF3a/b 和5'帽區(qū)的相互作用以及促進(jìn)翻譯起始是必需的,同時研究也發(fā)現(xiàn)METTL16 與核糖體RNA 相互作用,且有助于翻譯起始復(fù)合物的組裝并促進(jìn)4 000多個mRNA轉(zhuǎn)錄本的翻譯[26]。

      4 METTL16其他功能

      MAT2A pre-mRNA、U6 snRNA 和MALAT1 lncRNA是目前比較明確的與METTL16有相互作用的RNA,還有其他幾種類型的RNA 也認(rèn)為是METTL16 潛在的相互作用者,其中rRNA 在METTL16 的免疫沉淀中大量富集,但敲除METTL16 并不會導(dǎo)致rRNA 總體表達(dá)出現(xiàn)差異,猜測可能是rRNA在細(xì)胞中含量太多而導(dǎo)致的非特異結(jié)合[39]。在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)METTL16的同源基因編碼的RlmF 和RlmJ 蛋白對23S rRNA 進(jìn)行m6A甲基化[49],然而在脊椎動物中卻發(fā)現(xiàn)rRNA 上的m6A 修飾是由另外兩種甲基轉(zhuǎn)移酶介導(dǎo)的[32,50],所以目前METTL16 與rRNA 的關(guān)系還不明確。MAT2A 是METTL16 在mRNA 中研究較多的一個靶點,在老鼠和擬南芥中也發(fā)現(xiàn)METTL16 能甲基化幾種mRNA,但其共性和具體功能尚不明確,同時還發(fā)現(xiàn)了一些其他潛在的mRNA 結(jié)合靶點,包括RBM3、STUB1 和NT5DC2 以及β2M、HIF-1α和MYC等,但需要進(jìn)一步研究明確[39]。

      5 METTL16在癌癥中的作用

      m6A修飾影響許多生物學(xué)過程,越來越多的研究表明與m6A相關(guān)的蛋白質(zhì)在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起著重要作用,如宮頸癌[51]、前列腺癌[52]、乳腺癌[53]等。METTL3 已成為肝癌預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物[54],并且針對METTL3 開發(fā)出了能有效緩解急性髓系白血病的小分子抑制劑[55]。一些報告表明METTL16 也與癌癥有關(guān),如在肝癌和乳腺癌中METTL16 異常過表達(dá),而且其表達(dá)的增加與不良預(yù)后相關(guān)[26,56-57];在大腸癌中存在METTL16 重要殘基的突變[58];在胃癌中METTL16 表達(dá)水平升高,并通過增強cyclin D1 mRNA 的穩(wěn)定性促進(jìn)胃癌 細(xì) 胞 的 增 殖[59]。與METTL16 相 互 作 用 的MALAT1 能特異性識別致癌基因,但目前關(guān)于這一方面的作用是未知的,有推測認(rèn)為這與腫瘤發(fā)生相關(guān)[25]。

      6 結(jié)語與展望

      綜上所述,METTL16 的功能總結(jié)如表2,但依然還有很多未知,目前針對它甲基化SAM 合成酶的 pre-mRNA 和U6 snRNA 研究較多,其是否存在其他的底物以及底物特異性和共性是什么,都需要進(jìn)一步的研究。U6 是剪接復(fù)合體的酶活中心,其m6A位點處高度保守,但僅在酵母中發(fā)現(xiàn)其影響某一類RNA 的剪接,在其他模式生物中是否也適用這一機制或者有別的具體調(diào)控機制還需要探索。METTL16 可能也直接參與MAT2A pre-mRNA 剪接過程,但具體機制尚不明確。最新研究發(fā)現(xiàn),METTL16 缺失顯著抑制了人肝癌細(xì)胞的生長、遷移和侵襲,而且METTL16 的甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域?qū)ζ浼谆蕾嚭头羌谆钚远贾陵P(guān)重要,開發(fā)針對該結(jié)構(gòu)域的有效抑制劑在癌癥治療中具有巨大的治療潛力[26]。

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