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    基于液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法的胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移差異的血清代謝組學(xué)研究

    2023-11-13 09:24:50黃湘平吳玲譚超超
    腫瘤防治研究 2023年10期
    關(guān)鍵詞:苯丙氨酸負離子代謝物

    黃湘平,吳玲,譚超超

    0 引言

    胰腺癌是一種消化系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,因其具有早期癥狀隱匿、惡性程度高、預(yù)后差等特點,患者的五年生存率不到8%[1]。胰腺導(dǎo)管腺癌(pancreatic ductal carcinoma, PDAC)是最常見的胰腺腫瘤類型,占所有惡性胰腺腫瘤的80%~85%[2],該類患者生存率較低,確診晚,手術(shù)切除后預(yù)后效果不甚理想,腫瘤易復(fù)發(fā),而淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是患者術(shù)后腫瘤復(fù)發(fā)的主要原因之一[3],因此,早期發(fā)現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移對于改善患者預(yù)后、提高患者生存率具有重大的意義。

    目前臨床診斷PDAC主要通過影像學(xué)和傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)生物標志物檢查,影像學(xué)檢查在PDAC的早期階段敏感度和特異性較低[4]。代謝組學(xué)(metabolomics)是通過對參與疾病代謝的小分子物質(zhì)進行研究,其價值從傳統(tǒng)的尋找疾病診斷和預(yù)測的生物標志物到進一步進展為尋找異常的代謝通路,它能夠?qū)ο鄬Ψ肿淤|(zhì)量<1 000的內(nèi)源性代謝物進行全面測量,是了解生理和病理反應(yīng)中已知的代謝途徑和生物功能改變的一種有效方法[5]。本研究擬采用代謝組學(xué)篩選出胰腺導(dǎo)管腺癌患者淋巴轉(zhuǎn)移差異代謝物,尋找異常代謝通路,探索胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴轉(zhuǎn)移的潛在生物標志物,為胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的早期診斷、治療提供參考依據(jù)。

    1 資料與方法

    1.1 主要實驗材料與儀器

    甲醇(賽默飛世爾科技中國有限公司);乙腈(賽默飛世爾科技中國有限公司);蒸餾水(屈臣氏集團);EP管(湖州中銳精密科技有限公司);液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀(美國Thermo scientific公司);液相質(zhì)譜分析儀(美國Bruker公司);G-560E型漩渦振動器(美國ThermoScientific公司);低溫高速臺式離心機(廣州吉迪儀器有限公司);-80℃超低溫冰箱(山東博科科學(xué)儀器有限公司)。

    1.2 研究對象

    本試驗采用前瞻性隊列研究,收集湖南省人民醫(yī)院2020年8月—2021年3月住院期間確診為胰腺導(dǎo)管腺癌的血清標本40例,以及健康對照組血清標本31例。本研究經(jīng)湖南省人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(批準號:{2022-}-21)。

    胰腺導(dǎo)管腺癌患者納入標準:(1)術(shù)后組織經(jīng)病理確診為PDAC;(2)無代謝性和免疫性疾病(如糖尿病、高血壓、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、甲狀腺功能亢進等疾?。?;(3)既往無其他惡性腫瘤病史。排除標準:(1)有過術(shù)前放化療史;(2)病例資料缺失嚴重者;健康對照組:肝、腎、電解質(zhì)、血糖、血脂等體檢檢測結(jié)果正常,無明顯疾病、無胰腺相關(guān)疾病病史、無胰腺相關(guān)疾病家族史的健康成年人。胰腺導(dǎo)管腺癌患者是否出現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移均經(jīng)術(shù)后淋巴結(jié)組織病理結(jié)果證實。

    1.3 標本采集與處理

    1.3.1 標本采集 收集患者術(shù)后24 h之內(nèi)采集的靜脈血3~4 ml,離心取血清,術(shù)后經(jīng)病理檢測證實為胰腺導(dǎo)管腺癌(均為4℃冰箱保存不超過7天的血清樣本)。

    1.3.2 標本處理 吸取100 μl血清樣本,加入10 μl內(nèi)標(0.3 mg/ml的L-2-氯苯丙氨酸,甲醇配置),渦旋振蕩10 s;加入300 μl蛋白沉淀劑即甲醇-乙腈(2:1,v/v),渦旋振蕩1 min;在冰水浴中超聲提取10~15 min;-20℃冰箱中靜置30 min;4℃ 13 000 r/min離心15 min,取200 μl的上清液,作LC-MS分析。

    1.3.3 質(zhì)控的制備 QC用于評價進樣前的儀器、色譜質(zhì)譜系統(tǒng)和實驗過程中系統(tǒng)的穩(wěn)定性,確保得到的實驗數(shù)據(jù)真實可靠;所有樣品各吸取10 μl于EP管中,渦旋混勻10 s,分裝成每管100 μl,共6管,其余步驟按照1.3.2標本處理的方法進行處理。

    1.4 液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法分析

    以液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(liquid chromatographytandem mass spectrometry, LC-MS)作為代謝物分離檢測平臺,研究胰腺導(dǎo)管腺癌患者與健康對照組血清的代謝差異,在質(zhì)譜正、負離子模式下收集數(shù)據(jù);液相色譜條件:AcclainmTMRSLC120-C18色譜柱(100 mm×2.1 mm), 柱溫保持在40℃,進樣量3 μl。流動相A0.1%(體積分數(shù))甲酸/水(含2 mmol/L甲酸銨),流動相B為0.1%(體積分數(shù))乙腈/水,梯度設(shè)置:2%B持續(xù)0~2 min,50%B持續(xù)2~12 min,90%B持續(xù)10~30 min,98%B繼續(xù)持續(xù)作用30~60 min;流速維持在400 μl/min;質(zhì)譜條件為:電噴霧離子源(electrospray ion source, ESI±),采用正負離子模式檢測,使用高純N2輔助噴霧電離與脫溶劑,流速為1.2 L/min,質(zhì)量掃描范圍20~1 000 m/z,干燥氣溫度200℃。

    1.5 質(zhì)控驗證

    為了檢驗儀器的穩(wěn)定性和實驗的重復(fù)性,對本次實驗的6份QC樣本進行了驗證,驗證結(jié)果提示6份QC樣本的偏差均在2SD范圍內(nèi),說明儀器的穩(wěn)定性和實驗的重復(fù)性均較好,實驗數(shù)據(jù)穩(wěn)定可靠且能反映不同組別之間代謝組學(xué)上的差異。

    1.6 數(shù)據(jù)預(yù)處理及統(tǒng)計學(xué)方法

    通過Metaboscape 3.0軟件對原始數(shù)據(jù)進行峰提取、除噪、標準化、導(dǎo)出等預(yù)處理,再將數(shù)據(jù)上傳至HMDB數(shù)據(jù)庫進行匹配,最后得到代謝物的保留時間、質(zhì)荷比、峰值等信息。

    將預(yù)處理得到的數(shù)據(jù)導(dǎo)入MetaboAnalyst 5.0進行分析,首先對數(shù)據(jù)進行歸一化處理,使分析的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)正態(tài)分布,以排除個體間差異和外界多重因素的影響,使各代謝物之間在數(shù)值上具有一定可比性;通過單變量分析,采用火山圖(Volcano Plot)顯示兩組樣本的差異性代謝物,通過t檢驗即P<0.05和差異性倍數(shù)(FC)>1.5為標準篩選差異性代謝物;通過主成分分析(principal component analysis, PCA)來對數(shù)據(jù)進行概述和離群值檢測;然后構(gòu)建偏最小二乘判別分析(partial least squares-discriminant analysis, PLS-DA)模型來進行分類,并通過K折交互驗證和100次置換檢驗對模型進行評價,了解模型的可靠性;通過PLS-DA得到的變量權(quán)重值(variable important in projection,VIP),以VIP>1.0篩選潛在的差異性代謝物;通過聚類分析評價不同代謝物的相關(guān)性及聚類程度;最終將得到的差異代謝物進行代謝通路分析。

    2 結(jié)果

    2.1 臨床資料

    胰腺導(dǎo)管腺癌患者的臨床資料見表1,其中40例胰腺導(dǎo)管腺癌患者中,有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移18例,無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移22例。

    表1 胰腺導(dǎo)管腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組與無轉(zhuǎn)移組臨床資料比較(n(%))Table 1 Comparison of clinical information between lymph node metastasis and non- metastasis groups of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (n(%))

    2.2 單變量分析

    采用單變量統(tǒng)計學(xué)分析方法篩選健康對照組和PDAC患者中血清潛在差異性代謝物,在正、負離子模式下,分別篩選出123和37種差異代謝物;PDAC患者中有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的潛在差異性代謝物,各自篩選出4種差異代謝物,見圖1。

    圖1 PDAC組與健康對照組(A, B)及PDAC組中淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與無轉(zhuǎn)移組(C, D)在正負離子模式下的差異代謝物火山圖Figure 1 Volcano plots of differential metabolites in PDAC and healthy control groups(A, B), lymph node metastasis and non-metastasis groups(C, D) under positive and negative ions

    2.3 多變量統(tǒng)計分析

    利用主成分分析方法對健康體檢組和PDAC患者血清樣本的代謝物輪廓進行分析。在正、負離子模式下,健康體檢組和PDAC患者血清樣本的組內(nèi)代謝物差異比較小,且組間差異較顯著,兩組間的代謝輪廓存在明顯差異;利用PLS-DA方法對兩組之間的血清標本代謝物輪廓進行分析,結(jié)果顯示,正、負離子模式下,二者之間的代謝組學(xué)的組間存在顯著差異,見圖2。

    圖2 胰腺導(dǎo)管腺癌與健康體檢組多變量統(tǒng)計分析散點圖Figure 2 Scatterplot of multivariate statistical analysis of pancreatic ductal adenocarcinoma and healthy control groups

    對構(gòu)建好的模型進行驗證以評價模型的可靠性,以R2評價模型的解釋度,Q2評價模型的預(yù)測值,在正負離子下,R2、Q2均>0.5,說明模型擬合效果好,再對模型進行100次置換檢驗,得到P值,P值均<0.1,提示不存在過擬合的情況。

    在成功構(gòu)建了正、負離子下健康體檢組與PDAC患者的血清標本模型下,進一步根據(jù)VIP值來篩選潛在的差異性代謝物,在正、負離子模式下,分別篩選出差異代謝物92和46種。同樣條件下,在正、負離子模式下,分別篩選出PDAC有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組之間的差異代謝物12和8種。

    對健康對照組和PDAC組、PDAC患者有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組的血清代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進行聚類分析,從而更加直觀體現(xiàn)出血清差異代謝物的聚類程度。在正、負離子模式下,健康對照組和PDAC患者血清代謝物均呈現(xiàn)出較為明顯的聚類,而淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組與未轉(zhuǎn)移組聚類效果較好。

    2.4 差異代謝物以及代謝通路分析結(jié)果

    最終,在成功構(gòu)建了正、負離子模型下,以FC>1.5、P<0.05且VIP>1.0進行篩選。

    2.4.1 健康對照組與PDAC患者血清代謝物分析結(jié)果 在正離子模式下篩選出47種差異代謝物,其中升高的有30種:3-氨基-2-惡唑烷酮、L-苯丙氨酸、乙丙嗪、3-磷酸甘油、對稱二甲基精氨酸、單硝酸異山梨酯、3-羥基馬尿酸、2-吡咯烷酮、4-羥脯氨酸、苯基丙酮酸、L-辛酰基肉堿、L-酪氨酸、蘋果酸、硫酸吲哚酚、氫化可的酯、尿囊素、槲皮素3_-硫酸鹽、D-α-氨基丁酸、L-精氨酸、4-羥基甲苯磺丁脲、磷酰膽堿、4-三甲基氨基丁酸、苯乙酸、乙基葡糖苷酸、2-丙基-2,4-戊二烯酸、半乳糖醇、3-_3-羥基苯基_-2-甲基乳酸、根皮素、鞘氨醇、2,3-丁二醇;降低的有17種:戊糖苷、前列腺素B2、加拉敏三硫醚、脯氨酸甜菜堿、丙烯酰肉堿、γ-亞麻酸、四氫脫氧皮質(zhì)酮、3-羥基丁酸、α-酮異戊酸、蛋氨酸亞砜、L-脯氨酸、十一烷二酸、氧烯洛爾、維生素A、丙酮、黃嘌呤酸、3-甲基組氨酸。

    在負離子模式下最終得出29種差異代謝物:升高的有10種:8-羥基韋拉平葡萄糖醛酸、丙酮酸、11-氧代雄酮葡萄糖醛酸苷、苯丙氨酸、4-乙基苯基硫酸鹽、11-脫氫皮質(zhì)酮、前列腺素B2、降草酸、苯甲酸芐酯、雌酮;降低的有19種:2-羥基地昔帕明葡糖苷酸、硫酸雄酮、4-乙烯基苯酚硫酸鹽、丙氨酸、瓦拉尼酸、根皮素2_-O-葡糖苷酸、十五烷酸、3-硝基酪氨酸、L-組氨酸、rac-5,6-環(huán)氧-視黃酰-β-D-葡糖苷酸、2-苯基-1,3-丙二醇單氨基甲酸酯、羥基去甲基多塞平葡萄糖醛酸、5-十四碳烯酸、呋喃西林、索萊羅、6-硫尿酸、二氫黃豆苷元7-O-葡糖苷酸、二氫速甾醇、25-羥基維生素D2。

    利用MetaboAnalyst 5.0對在正、負離子模式下篩選出的顯著差異性代謝物進行代謝通路分析。依據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫,匹配到了26條代謝通路,再以-log(p)>0.5且Pathway impact值>0.05篩選出11條代謝通路,見表2;從圖3可以觀察到兩組之間差異代謝物濃度相差較大,重復(fù)性較好。

    圖3 PDAC患者與健康對照組之間排前五的差異代謝物Figure 3 The top five differential metabolites between PDAC and healthy control groups

    2.4.2 PDAC患者有無淋巴轉(zhuǎn)移兩組之間血清代謝物分析結(jié)果 在正離子模式下篩選出3種差異代謝物,其中升高的有乙丙嗪(Ethopropazine),降低的有四氫脫氧皮質(zhì)酮(Tetrahydrodeoxycorticoste rone)、氧烯洛爾(Oxprenolol);在負離子模式下篩選出1種差異代謝物,其中升高的是苯丙氨酸(Phenylalanine)。幾種差異代謝物的ROC曲線見圖4、表3,顯示兩組之間差異代謝物濃度相差較大,重復(fù)性較好。

    表3 胰腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的差異代謝物的ROC診斷效能比較Table 3 Comparison of ROC diagnostic efficacy of differential metabolites for lymph node metastasis in pancreatic cancer

    3 討論

    本研究基于LC-MS平臺對40例胰腺導(dǎo)管腺癌患者以及31例健康體檢組的血清學(xué)代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)了76種差異代謝物和11條相關(guān)的差異代謝通路。其中戊糖苷、丙烯酰肉堿、前列腺素B2、苯乙酸、L-苯丙氨酸為排前五的血清差異代謝物,影響較大的兩條代謝通路為苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成和苯丙氨酸代謝,兩條差異代謝通路均匹配到了苯丙氨酸、L-苯丙氨酸、L-酪氨酸三種差異代謝物。

    van Dijk等[6]研究表明胰腺癌患者基礎(chǔ)蛋白周轉(zhuǎn)率明顯高于健康體檢組,從而在胰腺癌患者中會出現(xiàn)高水平的L-苯丙氨酸和L-酪氨酸,這與本實驗得出的結(jié)果L-苯丙氨酸在PDAC患者中水平升高相符合,癌細胞可能通過體內(nèi)高水平的蛋白合成與分解,促進癌細胞的大量增殖從而加強其對淋巴和器官的侵潤能力。黏蛋白1(MUC1)是一種異常糖基化的膜結(jié)合糖蛋白,在大于80%的PDAC病例中過度表達,與不良預(yù)后相關(guān),MUC1通過其胞質(zhì)尾(MUC1-CT)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)并與其他致癌信號分子相互作用,促進腫瘤進展和轉(zhuǎn)移;Grover等[7]研究表明MUC1-CT中的酪氨酸突變?yōu)楸彼崮軌蛞种妻D(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β)誘導(dǎo)的腫瘤轉(zhuǎn)化,本研究中出現(xiàn)血清酪氨酸水平的升高和丙氨酸的降低,胰腺細胞是否也可通過此種突變從而誘導(dǎo)腫瘤的轉(zhuǎn)化尚需進一步的研究。

    本研究中,丙酮酸在胰腺癌患者中處于高表達,并參與了4條差異代謝通路,糖酵解/糖代謝在胰腺癌細胞的生長中發(fā)揮重要的作用。腫瘤細胞能夠在氧氣充足的情況下,在相關(guān)催化酶的催化作用下消耗大量葡萄糖產(chǎn)生乳酸,這種現(xiàn)象被稱為Warburg效應(yīng)或有氧糖酵解[8]。研究表明[9],丙酮酸激酶M2(PKM2)在胰腺癌組織中過表達,這可能是Warburg效應(yīng)發(fā)生的機制之一,同時糖酵解中高表達的關(guān)鍵酶如PKM2和乳酸脫氫酶A(LDHA)與胰腺癌的不良預(yù)后相關(guān)[10],這兩種酶活性在胰腺癌患者的表達增加,導(dǎo)致患者血清代謝物丙酮酸水平升高。Jiang等[11]研究發(fā)現(xiàn),胰腺癌患者LDHA的過度表達導(dǎo)致其丙酮酸和乳酸的水平異常,其中4種相關(guān)代謝物(葡萄糖、乳酸、丙酮酸和檸檬酸)能夠作為胰腺癌的早期診斷和療效監(jiān)測的生物標志物。

    在此基礎(chǔ)上,本研究通過進一步對40例胰腺癌患者淋巴結(jié)出現(xiàn)轉(zhuǎn)移的血清代謝組學(xué)分析,得出了四種在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中存在差異的代謝物,其中在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中升高的有:乙丙嗪、苯丙氨酸;降低的有:四氫脫氧皮質(zhì)酮、氧烯洛爾。四種差異代謝物的AUC值分別為:0.798、0.780、0.753、0.742,可見四種差異代謝物對于區(qū)分患者淋巴結(jié)是否轉(zhuǎn)移有較好的區(qū)分。苯丙氨酸的代謝能夠抑制T細胞參與的免疫反應(yīng),苯丙氨酸被IL-4誘導(dǎo)基因1(IL4I1)編碼的苯丙氨酸氧化酶氧化脫氨基,導(dǎo)致其減少和過氧化氫(H2O2)增加,進一步導(dǎo)致T細胞增殖抑制,而T細胞是機體清除癌細胞和其他異常細胞的關(guān)鍵,因此,癌細胞可通過大量合成苯丙氨酸,從而逃脫T細胞的清除[12]。同時,苯丙氨酸作為一種在原發(fā)性腫瘤中高度存在的保護性氨基酸,能夠加強腫瘤的浸潤和轉(zhuǎn)移的能力[13],而在本研究中,苯丙氨酸在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中水平明顯升高,因此,苯丙氨酸可以作為二者之間一種較好的潛在標志物。有研究表明[14]乙丙嗪能夠促進小細胞肺癌中癌細胞的增殖,其可能的機制為乙丙嗪通過促進膽堿轉(zhuǎn)運體CTL1對乙酰膽堿的合成作用,從而為癌細胞的大量增殖提供物質(zhì)基礎(chǔ),而在本研究中,乙丙嗪在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中的水平高于未轉(zhuǎn)移組,其具體的作用機制尚未明確,是否有可能通過這一機制導(dǎo)致癌細胞出現(xiàn)淋巴結(jié)的轉(zhuǎn)移需待進一步的研究;在本研究中,四氫脫氧皮質(zhì)酮在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組處于低水平,代謝重編程為癌細胞的特性之一,各種因子,如信號蛋白(S)、miRNA和轉(zhuǎn)錄因子(TFs),通過加強蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用以及代謝酶相互作用,在改變癌細胞的代謝狀態(tài)中發(fā)揮重要作用;有研究發(fā)現(xiàn)[15]子宮頸癌代謝物(L-賴氨酸和四氫脫氧皮質(zhì)酮)可在多種信號蛋白調(diào)節(jié)代謝酶的作用下改變代謝物的狀態(tài),這些信號蛋白是否可在PDAC患者中通過改變癌細胞的代謝狀態(tài),從而加強癌細胞的增殖以及轉(zhuǎn)移尚需證實。

    關(guān)于PDAC的發(fā)生、發(fā)展以及預(yù)后相關(guān)的機制,尚需進一步的研究,后續(xù)有望通過補充患者的胰腺癌組織標本,對PDAC患者的代謝組學(xué)進行更深一步的研究,尋找到更加有意義的生物標志物,為PDAC的治療提供新靶點。

    利益沖突聲明:

    所有作者均聲明不存在利益沖突。

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