鄒 銓?zhuān)瑥?敏,李 擎,郭 壯,王玉榮*
(1.湖北文理學(xué)院 湖北省食品配料工程技術(shù)研究中心,湖北 襄陽(yáng) 441053;2.內(nèi)蒙古河套酒業(yè)集團(tuán)股份有限公司,內(nèi)蒙古 巴彥淖爾 015400)
中國(guó)白酒的傳統(tǒng)工藝主要包括大曲制備、淀粉糖化、酒精發(fā)酵、固態(tài)蒸餾和陳化[1]。白酒發(fā)酵過(guò)程中的品質(zhì)與釀酒大曲微生物類(lèi)群、釀酒原材料和釀造工藝息息相關(guān)[2]。大曲是中國(guó)傳統(tǒng)白酒發(fā)酵曲的一種,在白酒發(fā)酵過(guò)程中作為微生物載體之一,主要以高粱、大麥或豌豆等谷物為原料,經(jīng)過(guò)潤(rùn)糧粉碎、原料堆積、曲塊成型、固態(tài)培養(yǎng)和成熟干燥等步驟制成,可為白酒發(fā)酵提供豐富的微生物群和酶系,進(jìn)而影響發(fā)酵過(guò)程中乙醇和風(fēng)味的產(chǎn)生,對(duì)白酒的質(zhì)量有著決定性作用[3-4]。細(xì)菌是大曲微生物群落中的重要類(lèi)群之一,其中芽孢桿菌屬(Bacillus)可以分泌多種酶,如淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶等,對(duì)大曲中微生物群落的調(diào)節(jié)和風(fēng)味化合物的生產(chǎn)具有重要作用[5]。因此,解析大曲中細(xì)菌類(lèi)群,探究Bacillus分布情況對(duì)白酒品質(zhì)的改善具有重要意義。
高通量測(cè)序(high-throughput sequencing,HTS)技術(shù)具有通量高、測(cè)序快且無(wú)需培養(yǎng)的優(yōu)點(diǎn),可以有效對(duì)樣品中屬水平及其以上分類(lèi)學(xué)地位的微生物進(jìn)行解析與注釋?zhuān)S多學(xué)者利用HTS技術(shù)解析釀酒大曲中微生物群落結(jié)構(gòu),對(duì)大曲中微生物資源的開(kāi)發(fā)與利用提供了參考與指導(dǎo)[6-7]。風(fēng)味是評(píng)價(jià)白酒質(zhì)量的關(guān)鍵指標(biāo),電子鼻則是模擬動(dòng)物嗅覺(jué)器官開(kāi)發(fā)的一種快速識(shí)別食品氣味的儀器,利用電子傳感器陣列的響應(yīng)值提供樣品的風(fēng)味信息[8],具有操作簡(jiǎn)單、分析快速、成本低及結(jié)果直觀的優(yōu)點(diǎn),對(duì)食品風(fēng)味的解析及品質(zhì)的改善具有重要作用,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于發(fā)酵食品和飲料研究中[9]。因此,通過(guò)HTS和電子鼻技術(shù)聯(lián)合,解析大曲中微生物多樣性和風(fēng)味物質(zhì)對(duì)改善大曲品質(zhì)具有明顯的優(yōu)勢(shì)。
內(nèi)蒙古自治區(qū)以溫帶大陸性氣候?yàn)橹?,地理環(huán)境和水資源獨(dú)特[10]?;诖?,本研究使用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)采集自?xún)?nèi)蒙古河套地區(qū)中溫大曲的細(xì)菌菌群多樣性進(jìn)行分析,采用電子鼻技術(shù)對(duì)大曲風(fēng)味品質(zhì)進(jìn)行分析,并對(duì)優(yōu)勢(shì)菌屬和風(fēng)味品質(zhì)之間的相關(guān)性進(jìn)行解析與探討,然后采用PICRUSt軟件對(duì)菌群基因功能進(jìn)行預(yù)測(cè),同時(shí)結(jié)合可培養(yǎng)技術(shù)對(duì)大曲中芽孢桿菌進(jìn)行分離鑒定,以期為進(jìn)一步解析內(nèi)蒙古地區(qū)中溫大曲微生物結(jié)構(gòu)和品質(zhì)提供參考,從而為改善大曲品質(zhì)提供數(shù)據(jù)支撐。
中溫大曲樣品:內(nèi)蒙古自治區(qū)河套地區(qū)H酒廠;DNeasy mericon Food Kit脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)基因組提取試劑盒:德國(guó)QIAGEN公司;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)清潔試劑盒:Axygen生物技術(shù)(杭州)有限公司;引物338F/806R、27F/1495R、M13F(-47)/M13R(-48):武漢天一輝遠(yuǎn)生物科技有限公司;5×TransStartTMFastPfu Buffer、脫氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleoside triphosphates,dNTPs)、FastPfu Fly DNA Polymerase、牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)、2×PCR Buffer、rTaq酶和克隆載體pMDR18-T Vector:寶生物工程大連有限公司;大腸桿菌(Escherichia coli)top10感受態(tài)細(xì)胞:湖北省食品配料工程技術(shù)研究中心制備;營(yíng)養(yǎng)瓊脂(nutrient agar,NA)培養(yǎng)基:青島海博生物技術(shù)有限公司;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
BF-10小型高速粉碎機(jī):河北本辰科技有限公司;5810R型離心機(jī)(冷凍型):德國(guó)Eppendorf公司;DYY-12型電泳儀:北京六一儀器廠;veritiFAST梯度PCR擴(kuò)增儀:美國(guó)AB公司;Fluor Chem FC3型化學(xué)發(fā)光凝膠成像系統(tǒng):美國(guó)Protein Simple公司;ND-2000C微量紫外分光光度計(jì):美國(guó)Nano Drop公司;Illumina MiSeq高通量測(cè)序平臺(tái):美國(guó)Illumina公司;R920型機(jī)架式服務(wù)器:美國(guó)DELL公司;PEN3電子鼻:德國(guó)Airsense公司;HR40-IIB2生物安全柜:海爾集團(tuán)電子商務(wù)有限公司。
1.3.1 中溫大曲樣品采集和預(yù)處理
中溫大曲樣品于2022年10月采集自河套地區(qū)(111°45′20″E、39°54′39″N)H酒廠的制曲車(chē)間,以?xún)?yōu)質(zhì)冬小麥為制曲原料,經(jīng)過(guò)潤(rùn)糧、粉碎、拌料壓曲、入房臥曲、培曲翻曲和入庫(kù)貯存等工藝制成[11],選擇同一批次、相同條件下制備的無(wú)斷裂[12]、表面無(wú)霉斑、厚度適中、有特殊香氣[13]的中溫大曲曲塊共5份,編號(hào)為BMZW1~BMZW5。在實(shí)驗(yàn)室條件下切割粉碎曲塊,并通過(guò)20目篩子處理大曲粉末,以獲取品質(zhì)均一的大曲粉樣品,將樣品轉(zhuǎn)移到無(wú)菌自封袋于4 ℃貯存。
1.3.2 中溫大曲樣品宏基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增和Illumina MiSeq高通量測(cè)序
按照試劑盒說(shuō)明書(shū)中的步驟,使用DNeasy mericon Food Kit DNA基因組提取試劑盒對(duì)大曲樣品中宏基因組DNA進(jìn)行提取,以其為模板,使用引物338F(5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3')和806R(5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')對(duì)檢測(cè)合格的宏基因組DNA的16S rRNA V3-V4區(qū)基因序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增[14],將合格的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物委托上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司完成Illumina MiSeq高通量測(cè)序。
1.3.3 序列質(zhì)控和生物信息學(xué)分析
使用QIIME v1.9.1平臺(tái)對(duì)Illumina MiSeq測(cè)序返回的原始序列進(jìn)行質(zhì)量控制和生物信息學(xué)分析,具體分析流程包括:對(duì)齊并合并雙端序列,刪減低質(zhì)量序列、引物序列和嵌合體序列[15];劃分操作分類(lèi)單元(operational taxonomic unit,OTU)[16],通過(guò)RDPv11.5、Greengenev13.5和SILVA v132數(shù)據(jù)庫(kù)[17]進(jìn)行細(xì)菌物種注釋?zhuān)唤y(tǒng)計(jì)各樣品中細(xì)菌在門(mén)和屬水平的相對(duì)含量;計(jì)算相同測(cè)序深度下樣品的超1(Chao1)指數(shù)和香農(nóng)(Shannon)指數(shù)[18];使用PICRUSt軟件對(duì)中溫大曲中細(xì)菌菌群的基因功能進(jìn)行預(yù)測(cè)[19],參考蛋白質(zhì)直系同源簇?cái)?shù)據(jù)庫(kù)(clusters of orthologous groups of proteins,COGs)進(jìn)行基因功能注釋[20]。
1.3.4 大曲風(fēng)味品質(zhì)分析
參考文獻(xiàn)[21]對(duì)中溫大曲樣品進(jìn)行預(yù)處理,測(cè)量樣品前,以空氣為載體清潔注射針95 s,調(diào)零時(shí)間5 s,預(yù)備時(shí)間5 s,具體測(cè)量參數(shù)參考趙慧君等[22]的研究并略做調(diào)整。樣品測(cè)試時(shí)間為60 s,選取49 s、50 s和51 s時(shí)的測(cè)試響應(yīng)值作為有效數(shù)據(jù)進(jìn)行后續(xù)分析,每個(gè)樣品測(cè)試3個(gè)平行。
1.3.5 大曲中芽孢桿菌的分離及鑒定
分離與純化:取10 g大曲粉末加入到裝有90 mL無(wú)菌生理鹽水的錐形瓶中,置于37 ℃搖床中220 r/min振蕩30 min。采用梯度稀釋法和平板涂布法對(duì)樣品中可培養(yǎng)芽孢桿菌進(jìn)行分離[23],并通過(guò)平板劃線法對(duì)分離株進(jìn)行多代純化[24],根據(jù)菌落和細(xì)胞形態(tài)將純化菌株保藏于-80 ℃超低溫冰箱。
鑒定:參考文獻(xiàn)[25]提取分離株的DNA,使用1%瓊脂糖凝膠電泳對(duì)提取的DNA進(jìn)行檢測(cè),將檢測(cè)合格的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增、清潔、連接和轉(zhuǎn)化[26],選取鑒定結(jié)果為陽(yáng)性的單克隆委托上海桑尼生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序,將返回的測(cè)序序列進(jìn)行拼接與去引物后,提交至美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)的Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行基本局部比對(duì)搜索工具(basic local alignment search tool,BLAST)同源性比對(duì),明確分離株的分類(lèi)學(xué)地位。
1.3.6 數(shù)據(jù)處理與可視化
使用Excel 2016進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,使用SAS軟件(v9.4)中的Spearman相關(guān)系數(shù)法計(jì)算優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬和大曲風(fēng)味物質(zhì)之間的相關(guān)系數(shù);使用R軟件繪制棒棒圖、瀑布圖和熱圖;使用jvenn(http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html)繪制韋恩圖;使用在線網(wǎng)站(https://www.genescloud.cn/chart/chartOverview)繪制箱型圖;使用MEGA7軟件中的鄰接法(neighbor joining,NJ)繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),并采用R軟件包ggtree美化系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
對(duì)采集自河套地區(qū)的5份中溫大曲細(xì)菌菌群的16S rRNA V3-V4區(qū)域基因序列進(jìn)行高通量測(cè)序,在測(cè)序量44 010 bp條件下獲得超1(Chao1)指數(shù)和香農(nóng)(Shannon)指數(shù),對(duì)樣品中細(xì)菌菌群的豐富度和多樣性進(jìn)行解析,結(jié)果見(jiàn)圖1。
圖1 中溫大曲樣品中細(xì)菌菌群的超1指數(shù)(A)和香農(nóng)指數(shù)(B)Fig.1 Chao 1 index (A) and shannon index (B) of bacterial groups in medium-temperature Daqu samples
由圖1可知,樣品BMZW1的超1指數(shù)和香農(nóng)指數(shù)均最小,表明樣品BMZW1的細(xì)菌物種數(shù)最少且物種多樣性最低;樣品BMZW2的超1指數(shù)最大,樣品BMZW5的香農(nóng)指數(shù)最大,表明樣品BMZW2細(xì)菌物種數(shù)最多,BMZW5細(xì)菌物種多樣性最高。由此表明,不同中溫大曲樣品之間細(xì)菌物種數(shù)和多樣性存在差異。
從不同中溫大曲樣品中選擇具有代表性的細(xì)菌OTU序列與數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行同源性比對(duì),完成OTU序列物種注釋。本研究將僅存在于其中一個(gè)樣品中的OTU稱(chēng)為特有OTU,將存在于所有樣品中的OTU稱(chēng)為核心OTU,將平均相對(duì)含量>1%的核心OTU稱(chēng)為核心優(yōu)勢(shì)OTU。中溫大曲樣品中OTU分布及核心優(yōu)勢(shì)OTU分析結(jié)果見(jiàn)圖2。
圖2 中溫大曲樣品的OTU韋恩圖(A)和核心優(yōu)勢(shì)OTU瀑布圖(B)Fig.2 OTU Venn diagram (A) and waterfall diagram of core advantage OTU (B) of medium-temperature Daqu samples
由圖2A可知,中溫大曲樣品中共注釋到3 094個(gè)OTU,包含197 041條有效序列。樣品中共含有612個(gè)特有OTU,包含2 999條序列,占總測(cè)序量的1.52%;核心OTU有96個(gè),包含173 246條序列,占總測(cè)序量的87.92%。由此表明,河套中溫大曲樣品中核心細(xì)菌總量占較大比重。
為進(jìn)一步解析樣品中核心細(xì)菌類(lèi)群,對(duì)核心優(yōu)勢(shì)OTU進(jìn)行數(shù)據(jù)可視化分析。由圖2B可知,核心優(yōu)勢(shì)OTU相對(duì)含量為73.10%,包括隸屬于高溫放線菌屬(Thermoactinomyces)(32.80%)的OTU2759,隸屬于魏斯氏菌屬(Weissella)(6.62%)的OTU4389,隸屬于葡萄球菌屬(Staphylococcus)(8.12%)的OTU4590、OTU167和OTU672,隸屬于乳桿菌屬(Lactobacillus)(7.27%)的OTU1612、OTU4041和OTU384,隸屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)(3.01%)的OTU2631,隸屬于明串珠球菌屬(Leuconostoc)(1.54%)的OTU2985,隸屬于糖多孢菌屬(Saccharopolyspora)(4.52%)的OTU1261,隸屬于放線多孢菌科(Actinopolysporaceae)(2.32%)的OTU22,隸屬于水桿菌屬(Aquabacterium)(3.48%)的OTU3988和OTU4795,隸屬于嗜糖假單胞菌屬(Pelomonas)(2.22%)的OTU578和隸屬于青枯菌屬(Ralstonia)(1.21%)的OTU1271。綜上表明,河套中溫大曲樣品中優(yōu)勢(shì)菌群類(lèi)群豐富且相對(duì)含量較高。
為進(jìn)一步解析不同樣品中核心細(xì)菌類(lèi)群,基于細(xì)菌門(mén)和屬水平對(duì)樣品中細(xì)菌群落進(jìn)行分析。其中,本研究將樣品中平均相對(duì)含量>1%的細(xì)菌門(mén)和屬稱(chēng)為優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門(mén)和屬,各樣品中細(xì)菌門(mén)、屬分布見(jiàn)圖3。
圖3 基于門(mén)(A)和屬(B)水平中溫大曲樣品中細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)Fig.3 Bacterial community structure of medium-temperature Daqu samples based on phylum (A) and genus (B) levels
由圖3A可知,中溫大曲樣品中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門(mén)主要隸屬于厚壁菌門(mén)(Firmicutes)(73.23%)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)(12.85%)和變形菌門(mén)(Proteobacteria)(12.56%),累計(jì)平均相對(duì)含量達(dá)98.64%。Firmicutes是大曲中具有絕對(duì)優(yōu)勢(shì)的細(xì)菌類(lèi)群,由此可推測(cè),本研究河套中溫大曲的生產(chǎn)工藝、制曲原料等條件更適合Firmicutes類(lèi)細(xì)菌的富集。
由圖3B可知,中溫大曲樣品中優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬有11個(gè),分別為T(mén)hermoactinomyces、Lactobacillus、Staphylococcus、Saccharopolyspora、Weissella、Aquabacterium、Bacillus、Pelomonas、Leuconostoc、片球菌屬(Pediococcus)和Ralstonia,平均相對(duì)含量分別為35.88%、12.29%、10.36%、10.07%、6.82%、3.78%、3.33%、2.22%、2 07%、1.28%和1.21%。馮佳婷等[27]通過(guò)對(duì)瀘州老窖大曲微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析顯示,Bacillus(63.53%)、Thermoactinomyces(7.0%)和Saccharopolyspora(9.7%)是高溫曲中高豐度菌群,Lactobacillus(35.8%)、Weissella(35.9%)和Thermoactinomyces(13.77%)是中溫曲中高豐度菌群。與本研究結(jié)論相比,釀酒大曲中菌群構(gòu)成具有一定的相似性,但菌群豐度受到制曲溫度、地域條件等因素的影響存在差異。
為進(jìn)一步解析中溫大曲品質(zhì),本研究基于電子鼻技術(shù)對(duì)大曲樣品中的風(fēng)味物質(zhì)進(jìn)行分析,結(jié)果見(jiàn)圖4。
圖4 中溫大曲樣品風(fēng)味電子鼻分析結(jié)果Fig.4 Electronic nose analysis results of flavor of mediumtemperature Daqu samples
由圖4可知,W1W、W5S和W1S傳感器響應(yīng)值較大,表明大曲樣品中含量較高的風(fēng)味物質(zhì)包括有機(jī)硫化物、萜類(lèi)物質(zhì)、氮氧化物和甲烷,其次為乙醇和烷烴等風(fēng)味物質(zhì)。此外,對(duì)芳香類(lèi)物質(zhì)靈敏的傳感器W1C、W3C和W5C的響應(yīng)值偏低,表明大曲樣品中芳香類(lèi)物質(zhì)強(qiáng)度較低。
為進(jìn)一步探究大曲風(fēng)味品質(zhì)與優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬之間的關(guān)聯(lián)性,本研究對(duì)其進(jìn)行Spearman相關(guān)性分析,結(jié)果見(jiàn)圖5。
圖5 中溫大曲樣品風(fēng)味品質(zhì)與優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬相關(guān)性分析熱圖Fig.5 Heatmap of correlation analysis between flavor quality and dominant bacterial genera in medium-temperature Daqu samples
由圖5可知,Bacillus與W3C和W5C呈顯著正相關(guān)(P<0.05),與W5S呈顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05),與W1W呈極顯著負(fù)相關(guān)(P<0.01),Saccharopolyspora與W2W呈顯著正相關(guān)(P<0.05)。由此表明,Bacillus與大曲中有機(jī)硫化物、萜類(lèi)物質(zhì)、氮氧化物和芳香類(lèi)物質(zhì)等風(fēng)味物質(zhì)之間存在顯著相關(guān)性(P<0.05),這可能與芽孢桿菌可以分泌多種酶有關(guān)[28],如淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶等,對(duì)大曲中風(fēng)味化合物的產(chǎn)生發(fā)揮重要作用。Saccharopolyspora與有機(jī)硫化物之間存在顯著相關(guān)性(P<0.05),Saccharopolyspora中存在能產(chǎn)生抗生素、酶類(lèi)、免疫抑制劑等生物活性物質(zhì)的物種,是尋找新的生物活性物質(zhì)的重要菌源[29]。
本研究使用PICRUSt軟件對(duì)大曲樣品中細(xì)菌菌群的基因功能進(jìn)行預(yù)測(cè),從而探索大曲微生物的潛在功能,所有細(xì)菌序列注釋到4 092個(gè)COG,分別隸屬于23個(gè)功能大類(lèi),結(jié)果見(jiàn)圖6。
由圖6可知,中溫大曲樣品中細(xì)菌菌群基因除了在轉(zhuǎn)錄、翻譯、核糖體結(jié)構(gòu)與生物發(fā)生、復(fù)制、重組和修復(fù)等與自身生長(zhǎng)繁殖功能相關(guān)方面具有較高豐度(25.15%),在氨基酸運(yùn)輸與代謝、碳水化合物運(yùn)輸與代謝和能源生產(chǎn)與轉(zhuǎn)換等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)生產(chǎn)與代謝功能上也呈現(xiàn)高豐度分布狀態(tài),占總豐度的22.03%。由此表明,大曲中細(xì)菌群落在原料降解和風(fēng)味物質(zhì)代謝方面具有較大潛力,且樣品中細(xì)菌基因的生長(zhǎng)繁殖功能具有較高豐度,伴隨著其能量產(chǎn)生與轉(zhuǎn)換功能具有較高的豐度。CAI W C等[30]研究顯示,大曲的發(fā)酵依賴(lài)氨基酸和碳水化合物的運(yùn)輸與代謝,氨基酸作為微生物生長(zhǎng)所需的氮源,影響微生物的生長(zhǎng)和代謝,是大曲揮發(fā)性芳香物質(zhì)產(chǎn)生的基礎(chǔ),同時(shí)氨基酸與碳水化合物反應(yīng)會(huì)賦予大曲獨(dú)特的香氣。大曲中的細(xì)菌還存在高豐度的一般功能預(yù)測(cè)和未知功能的基因,分別占總豐度的12.96%和10.16%。結(jié)合圖3B可知,大曲中存在一定豐度的未鑒定細(xì)菌屬,平均相對(duì)含量達(dá)6.58%。由此推測(cè),樣品中未知功能的基因可能與這些未研究的細(xì)菌相關(guān)[31]。
上述分析已表明,Bacillus是中溫大曲中的優(yōu)勢(shì)菌群,與大曲中多種風(fēng)味物質(zhì)具有顯著相關(guān)性,為進(jìn)一步解析中溫大曲中芽孢桿菌的分布情況,本研究對(duì)樣品中可培養(yǎng)芽孢桿菌進(jìn)行分離純化。根據(jù)菌落形態(tài)、顏色、大小和邊緣情況,從大曲樣品中共分離純化出30株疑似芽孢桿菌菌株,并對(duì)分離菌株進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定,經(jīng)同源性比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),分離菌株隸屬于7個(gè)種,其菌落形態(tài)和細(xì)胞形態(tài)見(jiàn)圖7。
圖7 7種分離菌株的菌落形態(tài)(A)和細(xì)胞形態(tài)(B)Fig.7 Colony morphology (A) and cell morphology (B) of 7 isolated strains
由圖7可知,隸屬于不同種的芽孢桿菌其菌落形態(tài)呈現(xiàn)明顯差異,細(xì)胞形態(tài)均呈現(xiàn)桿狀,但菌體粗細(xì)和長(zhǎng)短不盡相同。為進(jìn)一步呈現(xiàn)30株分離菌株中芽孢桿菌的分布情況,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析,結(jié)果見(jiàn)圖8。
圖8 基于16S rRNA基因序列30株分離菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.8 Phylogenetic tree of 30 isolated strains based on 16S rRNA gene sequence
由圖8可知,分離菌株與其對(duì)應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)菌株之間形成明顯的聚類(lèi)樹(shù)形,且位于同一聚類(lèi)的分離株與標(biāo)準(zhǔn)菌株之間的相似度均≥99%。由此表明,30株分離菌株被鑒定為7個(gè)細(xì)菌種。其中,14株被鑒定為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis),占總分離株數(shù)的36.67%,為大曲中可培養(yǎng)芽孢桿菌的第一大優(yōu)勢(shì)菌種。8株被鑒定為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis),占總分離株數(shù)的26.67%,為第二大優(yōu)勢(shì)菌種。3株被鑒定為暹羅芽孢桿菌(Bacillus siamensis),2株被鑒定為假蕈狀芽孢桿菌(Bacillus pseudomycoides),其余3株分別被鑒定為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)、索諾氏芽孢桿菌(Bacillus sonorensis)和副地衣芽孢桿菌(Bacillus paralicheniformis)。不同芽孢桿菌可在大曲發(fā)酵中影響其特征風(fēng)味物質(zhì)的合成,HE G Q等[32]研究顯示,接種Bacillus subtilis和Bacillus velezensis可以增加大曲中己酸、己酸乙酯和己酸己基酯等風(fēng)味代謝物的含量,改善大曲品質(zhì)。XU B Y等[33]研究表明,接種Bacillus licheniformis和Bacillus velezensis可以改變大曲中微生物豐度,控制微生物代謝,使大曲中醇類(lèi)、酸類(lèi)和酮類(lèi)等風(fēng)味物質(zhì)的含量有所提高。
納入研究的河套中溫大曲樣品細(xì)菌菌群豐富,優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門(mén)包括Firmicutes、Actinobacteria和Proteobacteria,優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬主要隸屬于Thermoactinomyces、Lactobacillus、Staphylococcus、Saccharopolyspora、Weissella、Aquabacteri um、Bacillus、Pelomonas、Leuconostoc、Pediococcus和Ralstonia。其中,Bacillus與有機(jī)硫化物、萜類(lèi)物質(zhì)、氮氧化物和芳香類(lèi)物質(zhì)之間存在顯著相關(guān)性(P<0.05),Saccharopolyspora與有機(jī)硫化物呈顯著正相關(guān)(P<0.05),且細(xì)菌菌群基因在氨基酸運(yùn)輸與代謝、碳水化合物運(yùn)輸與代謝和能源生產(chǎn)與轉(zhuǎn)換功能上有較高豐度。大曲中可培養(yǎng)芽孢桿菌種類(lèi)豐富,分離的30株芽孢桿菌分別隸屬于7個(gè)種,其中Bacillus subtilis(36.67%)和Bacillus licheniformis(26.67%)相對(duì)含量較高,對(duì)大曲中風(fēng)味物質(zhì)的形成及中溫大曲品質(zhì)的改善具有不可忽視的作用。