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    宏基因組二代測序技術(shù)在肺結(jié)核診斷中應(yīng)用價(jià)值的meta分析

    2023-07-25 11:58:40沃拉孜汗瑪?shù)履醽喬?/span>迪力夏提圖爾迪麥麥提李夢晨拜合提尼沙吐爾地
    臨床薈萃 2023年5期
    關(guān)鍵詞:敏感度異質(zhì)性檢索

    沃拉孜汗·瑪?shù)履醽喬?迪力夏提·圖爾迪麥麥提,李夢晨,拜合提尼沙·吐爾地

    (新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院 呼吸重癥監(jiān)護(hù)室,新疆 烏魯木齊 830000)

    肺結(jié)核(pulmonary tuberculosis,PTB)是由結(jié)核分枝桿菌(mycobacterium tuberculosis,MTb)感染并破壞肺組織而起病的一種慢性呼吸道疾病[1]。根據(jù)WHO最新報(bào)告顯示[2],2020年約990萬例新發(fā)結(jié)核病患者和約150萬死亡患者,新報(bào)告PTB患者為476萬例,提示全球在防治結(jié)核病方面進(jìn)展緩慢,且相當(dāng)大比例的PTB病例仍然是臨床診斷,而不是細(xì)菌學(xué)證實(shí)[3]。因此早期準(zhǔn)確檢測MTb對于PTB診斷、及時(shí)治療和預(yù)防傳播具有重要意義。傳統(tǒng)的抗酸桿菌染色法(acid fast bacteria ,AFB)雖操作簡單且快速,但敏感度較低而受限制。分枝桿菌培養(yǎng)方法耗時(shí),一般需要2~8周,且標(biāo)本容易受到污染[4]。T-SPOT TB試驗(yàn)敏感度和特異度優(yōu)于傳統(tǒng)方法,但其檢測結(jié)果可能會受到年齡、BMI、免疫狀態(tài)和其他因素的影響[5]。Xpert MTb/RIF具有較高敏感度和特異度,然而Xpert MTb/RIF檢測技術(shù)的可用性依賴于復(fù)雜儀器并且成本高,且2020年全球數(shù)據(jù)顯示[6],僅59%的PTB病例經(jīng)細(xì)菌學(xué)確診,提示MTb檢測仍有較大差距,有必要開發(fā)快速檢測MTb以進(jìn)行PTB診斷的方法。

    宏基因組二代測序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)是一種快速檢測包括MTb在內(nèi)的各種病原體的新技術(shù)[7],mNGS不需要對病原體進(jìn)分離培養(yǎng)和純化,直接從臨床樣本中提取所有遺傳物質(zhì)片段(DNA或RNA)并同時(shí)獨(dú)立測序,構(gòu)建生物參考數(shù)據(jù)庫和嚴(yán)格的序列讀取映射來識別可能的病原體[8]。迄今為止,已有多項(xiàng)研究探討了mNGS在發(fā)現(xiàn)致病病原體和指導(dǎo)靶向抗菌治療方面的價(jià)值[9],多數(shù)研究結(jié)果顯示mNGS診斷PTB敏感度優(yōu)于培養(yǎng)和AFB,同時(shí)與Xpert相似[10]。然而鑒于研究樣本量、標(biāo)本類型以及研究方法的限制,我們檢索目前國內(nèi)外應(yīng)用mNGS技術(shù)診斷PTB的相關(guān)研究,采用meta分析方法評價(jià)mNGS應(yīng)用于不同肺標(biāo)本檢測對PTB診斷的價(jià)值。

    1 資料與方法

    1.1檢索策略

    1.1.1計(jì)算機(jī)檢索 PubMed、Embase、Cochrane Library、CNKI數(shù)據(jù)庫、萬方、維普等數(shù)據(jù)庫,收集采用mNGS技術(shù)診斷PTB的診斷性試驗(yàn),檢索時(shí)間為建庫至2022年11月。

    1.1.2檢索詞選擇 在CNKI數(shù)據(jù)庫、萬方、維普中文檢索詞:結(jié)核、肺結(jié)核等,宏基因組二代測序、宏基因二代測序、mNGS等。在PubMed、Embase、Cochrane Library數(shù)據(jù)庫中英文檢索詞:tuberculosis、Tuberculoses、Kochs Disease、Mycobacterium tuberculosis Infection等,Tuberculosis, Pulmonary、Tuberculoses, Pulmonary、Pulmonary Tuberculoses、Pulmonary Tuberculosis、Pulmonary Consumption、Consumption, Pulmonary、Pulmonary Consumptions、Pulmonary Phthisis、Phthises, Pulmonary、Pulmonary Phthises等,Metagenomic Next-Generation Sequencing、mNGS等。中文檢索策略(以知網(wǎng)為例):(主題=肺結(jié)核+結(jié)核)AND(主題=二代測序+mNGS+宏基因二代測序+宏基因組二代測序);英文檢索策略(以PubMed為例):((tuberculosis[Title/Abstract])OR((Tuberculoses, Pulmonary[Title/Abstract])OR(Pulmonary Tuberculoses[Title/Abstract])OR(Pulmonary Tuberculosis[Title/Abstract])OR(Pulmonary Consumption[Title/Abstract])OR(Consumption, Pulmonary[Title/Abstract]))OR(Consumptions, Pulmonary[Title/Abstract])OR(Consumptions, Pulmonary[Title/Abstract])OR(Pulmonary Phthisis[Title/Abstract])OR(Phthises, Pulmonary[Title/Abstract])OR(Phthisis, Pulmonary[Title/Abstract]))OR(Pulmonary Phthises[Title/Abstract])AND(Metagenomic Next-Generation Sequencing[Title/Abstract])OR(mNGS[Title/Abstract])。

    1.1.3檢索方法 在上述數(shù)據(jù)庫中檢索相關(guān)的原始論文,并對文獻(xiàn)所用的關(guān)鍵詞及主題詞進(jìn)行分析,進(jìn)一步確定文獻(xiàn)檢索關(guān)鍵詞,并采用主題詞結(jié)合自由詞的方法進(jìn)行文獻(xiàn)搜索,對所得文獻(xiàn)、文體、摘要按照納入排除標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選,符合標(biāo)準(zhǔn)的文章經(jīng)全文閱讀進(jìn)一步確定納入文獻(xiàn),并對相關(guān)文獻(xiàn)的參考文獻(xiàn)進(jìn)行篩選保證文獻(xiàn)查全。

    1.2文獻(xiàn)納入和排除標(biāo)準(zhǔn)

    1.2.1納入標(biāo)準(zhǔn) ①采用mNGS技術(shù)診斷PTB的研究,能直接或間接獲取四格表數(shù)據(jù)。②研究對象為臨床上疑似PTB或肺部感染的成人患者,且有明確的診斷標(biāo)準(zhǔn)。肺結(jié)核診斷標(biāo)準(zhǔn)參照《肺結(jié)核診斷》(WS 288-2017),臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)為結(jié)合影像特征和結(jié)核免疫學(xué)檢測陽性,排除其他疾病,且抗結(jié)核藥物治療經(jīng)評估有效。確診標(biāo)準(zhǔn)為具有病原學(xué)或者病理診斷依據(jù),或采用現(xiàn)代分子生物學(xué)檢測手段(PCR法、基因檢測等)結(jié)合臨床資料等進(jìn)行綜合分析的確診患者。③詳細(xì)提供mNGS技術(shù)操作流程的研究,標(biāo)本類型不限。

    1.2.2排除標(biāo)準(zhǔn) ①相關(guān)數(shù)據(jù)不完整,無法獲取四格表數(shù)據(jù)的研究文獻(xiàn)。②研究病例數(shù)不足10例的文獻(xiàn)。③病例報(bào)告、綜述、會議論文等。④排除診斷標(biāo)準(zhǔn)不一致的文獻(xiàn)。

    1.3文獻(xiàn)的篩選與資料提取 由2名研究者先分別獨(dú)立對初檢文獻(xiàn)和摘要獨(dú)立閱讀,再根據(jù)納入與排除標(biāo)準(zhǔn)對檢索出的文獻(xiàn)獨(dú)立進(jìn)行篩選,對可能納入分析的文章閱讀全文,并進(jìn)行質(zhì)量評價(jià)和相關(guān)資料提取。提取內(nèi)容包括研究的一般信息(作者、年份、樣本量、研究方法)、標(biāo)本類型、診斷標(biāo)準(zhǔn)、mNGS測序方法和測序條件、四格表數(shù)據(jù)即真陽性值(TP)、假陽性值(FP)、假陰性值(FN)、真陰性值(TN)。

    1.4文獻(xiàn)質(zhì)量評價(jià) 本次研究嚴(yán)格進(jìn)行質(zhì)量評價(jià),由2名研究員在RevMan5.3軟件上按照Cochrane-2偏倚風(fēng)險(xiǎn)評估工具進(jìn)行評分,意見若不同,則與第三方進(jìn)行商討后決定,并用“高風(fēng)險(xiǎn)”“不確定風(fēng)險(xiǎn)”“低風(fēng)險(xiǎn)”對文章質(zhì)量進(jìn)行評估。

    1.5統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用Revman5.3軟件對納入研究進(jìn)行質(zhì)量評價(jià)。使用StataSE16軟件進(jìn)行分析,提取各獨(dú)立研究的診斷性實(shí)驗(yàn)四格表數(shù)據(jù),繪制敏感度與特異度的森林圖,根據(jù)P值和I2值評估異質(zhì)性。I2≤50%,異質(zhì)性較小,采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析;I2>50%為異質(zhì)性較大,采用隨機(jī)效應(yīng)模型。分析計(jì)算納入研究的敏感度、特異度、陽性似然比(positive likelihood ratio,PLR)、陰性似然比(negative likelihood ratio,NLR)、診斷比值比(diagnostic odds ratio, DOR)及其95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。繪制匯總受試者工作特征(Summary receiver operating characteristic curve,SROC)曲線,并計(jì)算曲線下面積(area under the curve, AUC)。針對明顯的異質(zhì)性尋找產(chǎn)生異質(zhì)性的可能來源,分組并采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行亞組分析。敏感度分析使用Cook距離用于識別強(qiáng)烈影響的研究,以及標(biāo)準(zhǔn)化殘差的散點(diǎn)圖用于檢測異常值。Deeks’漏斗圖不對稱性檢驗(yàn)用于評估發(fā)表偏倚,雙尾P值<0.05差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    2 結(jié) 果

    2.1文獻(xiàn)檢索結(jié)果 檢索到文獻(xiàn)共447篇,剔除重復(fù)文獻(xiàn)后得到初始文獻(xiàn)314篇,瀏覽文題及摘要后排除不相關(guān)研究、綜述和病例報(bào)告等文獻(xiàn)302篇,納入12篇文獻(xiàn);通過閱讀全文,排除無法提取四格表數(shù)據(jù)的文獻(xiàn)1篇,最終納入11篇[11-21]符合標(biāo)準(zhǔn)的文獻(xiàn)進(jìn)行meta分析,見圖1。

    圖1 文獻(xiàn)檢索流程圖

    2.2納入研究的基本特征 納入11篇研究文獻(xiàn),發(fā)表年份在2019-2022年,研究地區(qū)均為中國,PTB組734例,非PTB組1261例,研究中包含了易混淆的疾病并給出了明確的PTB診斷標(biāo)準(zhǔn)。2篇文獻(xiàn)明確研究mNGS在痰菌陰性PTB中的診斷價(jià)值,其余9篇文獻(xiàn)研究疾病為疑似PTB或肺部感染患者。為闡明mNGS技術(shù)應(yīng)用于不同標(biāo)本類型中診斷PTB的價(jià)值,本研究未對標(biāo)本類型進(jìn)行限制,在納入研究的7篇文獻(xiàn)中可獲得mNGS應(yīng)用于肺標(biāo)本[包括痰、肺組織、支氣管肺泡灌洗液(Broncho alveolar Lavage Fluid,BALF)、血液、胸腔積液等]檢測PTB的診斷價(jià)值,8篇文獻(xiàn)中可獲得mNGS應(yīng)用于BALF檢測診斷PTB的應(yīng)用價(jià)值,3篇文獻(xiàn)中可獲得mNGS在肺組織中的診斷價(jià)值,因此我們對不同的標(biāo)本類型均進(jìn)行了meta分析。另外,mNGS的操作方法和測序條件不規(guī)范,我們嚴(yán)格納入使用宏基因組二代測序方法檢測MTb的研究,并對mNGS測序方法及測序平臺進(jìn)行了總結(jié),11篇研究文獻(xiàn)測序方法均選擇了DNA序列,只有1篇文獻(xiàn)中未提及測序方法及測序平臺,7篇文獻(xiàn)測序條件均在BGISEQ平臺上進(jìn)行測序,3篇文獻(xiàn)在其他平臺(主要是Illumina NextSeq平臺)上進(jìn)行測序。納入研究的特征表見表1,mNGS檢測3種標(biāo)本診斷PTB的四格表數(shù)據(jù)見表2。

    表1 納入研究文獻(xiàn)特征

    表2 mNGS檢測不同臨床標(biāo)本診斷PTB的四格表數(shù)據(jù)

    2.3質(zhì)量評價(jià) 11篇文獻(xiàn)中3篇為中文文獻(xiàn),8篇為英文文獻(xiàn);Shi等[12]的研究中金標(biāo)準(zhǔn)包含了mNGS結(jié)果,故評價(jià)為“高風(fēng)險(xiǎn)”,其余所有研究未說明金標(biāo)準(zhǔn)診斷是否在不知曉mNGS的結(jié)果下進(jìn)行的,故評為“不確定風(fēng)險(xiǎn)”;除了Zhou等[11]的研究外,其余研究未說明納入研究的病例是否為連續(xù)或隨機(jī),故評為“不確定風(fēng)險(xiǎn)”;所有研究臨床適用性評為“低風(fēng)險(xiǎn)”。見圖2~3。

    圖2 質(zhì)量評估詳細(xì)結(jié)果

    圖3 風(fēng)險(xiǎn)偏倚評估圖

    2.4mNGS技術(shù)診斷PTB的應(yīng)用價(jià)值

    2.4.1異質(zhì)性檢驗(yàn) SROC曲線形狀不呈現(xiàn)典型的“肩臂狀”,且在發(fā)表偏倚中P>0.05, 表明不存在閾值效應(yīng)。在mNGS檢測肺標(biāo)本的異質(zhì)性結(jié)果顯示,敏感度I2=80.36,特異度I2=53.33;在BALF中,敏感度I2=86.04,均采用隨機(jī)模型進(jìn)行合并。在肺組織中I2均為0,表明不存在顯著異質(zhì)性。

    2.4.2診斷價(jià)值參數(shù)匯總分析 Meta分析結(jié)果示,mNGS檢測肺標(biāo)本診斷PTB敏感度為70%(95%CI:58%~79%),特異度為99%(95%CI:98%~100%),PLR為106.9(95%CI:31.1~366.6),NLR為0.31(95%CI:0.21~0.43),DOR為350(95%CI:81~1512);mNGS檢測BALF診斷PTB敏感度為71%(95%CI:55%~83%),特異度為99%(95%CI:97%~100%), PLR為76.4(95%CI:26.6~218.9),NLR為0.30(95%CI: 0.18~0.48),DOR為258(95%CI:75~895);mNGS檢測肺組織診斷PTB敏感度為81%(95%CI:69%~89%),特異度為97%(95%CI:88%~99%),PLR為26.0(95%CI:6.6~102.4),NLR為0.19(95%CI:0.11~0.33),DOR為135(95%CI:29~639)。見表3,圖4~6。

    表3 mNGS在不同標(biāo)本類型中診斷PTB的參數(shù)匯總

    圖4 mNGS檢測肺標(biāo)本診斷PTB的靈敏度和特異度森林圖

    圖5 mNGS檢測BALF診斷PTB的靈敏度和特異度森林圖

    圖6 mNGS檢測肺組織診斷PTB的靈敏度和特異度森林圖

    2.4.3SROC分析 繪制mNGS檢測不同標(biāo)本診斷PTB的SROC曲線,結(jié)果顯示:mNGS檢測肺標(biāo)本的AUC為0.97(0.95~0.98),mNGS檢測BALF的AUC為0.99(0.98~1.00),mNGS檢測肺組織標(biāo)本的的AUC為0.97(0.95~0.98)。見圖7。

    圖7 不同標(biāo)本診斷PTB的SROC曲線 a.mNGS檢測肺標(biāo)本診斷PTB的SROC曲線(圖中對應(yīng)研究編號依次為:①Chen等[13],②Fu等[21],③Jin等[14],④Zhou等[11],⑤Zhu等[16],⑥孫雯雯等[18],⑦王春等[17]);b.mNGS檢測BALF診斷PTB的SROC曲線(圖中對應(yīng)研究編號依次為:①Chen 等[13],②jin等[14],③Liu等[15],④Shi等[12],⑤Xu等[20],⑥Zhu等[16],⑦王春等[17],⑧趙素娥等[19]);c.mNGS檢測肺組織診斷PTB的SROC曲線(圖中對應(yīng)研究標(biāo)號依次為:①Jin等[14],②Zhu等[16],③王春等[17])

    2.4.4亞組分析和敏感度分析 為探討異質(zhì)性來源,我們對mNGS檢測BALF標(biāo)本檢測的研究按照研究類型、mNGS測序平臺、痰涂片狀況進(jìn)行亞組分析,結(jié)果顯示研究類型和mNGS測序平臺亞組間敏感度值一致(P>0.05);然而,痰菌陰性PTB研究的敏感度[89%(81%~97%)]顯著高于痰菌陽性PTB研究的敏感度[64%(54%~73%)](P<0.05)。敏感度分析表明,整體研究結(jié)果穩(wěn)定,沒有明確的異常值,但可看出Zhu等[16]和Xu等[20]的研究在目前的工作中影響較大,這與我們亞組分析結(jié)果一致。亞組分析及敏感度分析結(jié)果見表4和圖8。

    表4 mNGS檢測 BALF的亞組分析

    圖8 mNGS檢測BALF的敏感性分析 a.擬合優(yōu)度分析;b.雙變量正態(tài)性分析;c.影響分析;d.異常值檢測,圖中對應(yīng)研究編號依次為:①Chen等[13],②jin等[14],③Liu等[15],④Shi等[12],⑤Xu等[20],⑥Zhu等[16],⑦王春等[17],⑧趙素娥等[19]

    2.4.5發(fā)表偏倚 我們繪制了mNGS檢測3種標(biāo)本的Deeks’漏斗圖,未發(fā)現(xiàn)發(fā)表偏倚(P>0.05),見圖9。

    圖9 mNGS檢測3種標(biāo)本的Deeks'漏斗圖 a.mNGS檢測肺標(biāo)本診斷PTB的Deeks'漏斗圖; b.mNGS檢測BALF診斷PTB的Deeks'漏斗圖; c.mNGS檢測肺組織診斷PTB的Deeks'漏斗圖

    3 討 論

    MTb作為細(xì)胞內(nèi)病原體,生長緩慢、較難培養(yǎng)[22],如何快速、準(zhǔn)確檢測MTb已成為近幾年的研究熱點(diǎn)。mNGS通過非靶向DNA/RNA測序?qū)?xì)菌、真菌、病毒和寄生蟲序列的檢測,促進(jìn)了病原體的快速鑒別[23-24],既往研究顯示mNGS診斷感染性疾病的敏感度和特異度分別為50.7%和85.7%[9],并且受先前抗生素使用的影響較小,被認(rèn)為是檢測感染性疾病有前途的技術(shù)。

    我們的meta分析結(jié)果顯示,mNGS檢測BALF診斷PTB的敏感度(71% 95%CI:55%~83%)低于已報(bào)道的Xpert MTb/RIF的敏感度(87% 95%CI:84%~90%)[25],但特異度(99% 95%CI:97%~100%)高于Xpert MTb/RIF(92% 95%CI:91%~93%),且在不同的標(biāo)本中mNGS檢測的AUC值均接近于1,且SROC曲線均靠近左上角,說明mNGS具有很高的診斷價(jià)值,DOR值均大于1,提示mNGS的判別效果較好,然而,PLR(>10)和NLR(>0.1)說明mNGS的診斷優(yōu)勢在于確診疾病而非排除疾病,因此對于mNGS檢測MTb陰性的結(jié)果不能完全排除MTb感染,應(yīng)慎重解讀。在我們的研究中mNGS應(yīng)用于肺標(biāo)本和BALF檢測對于PTB的診斷效應(yīng)相當(dāng),但值得一提的是,mNGS檢測肺組織標(biāo)本中的敏感度[81%(95%CI:69%~89%)]高于BALF標(biāo)本[71%(95%CI:55%~83%)],可能原因?yàn)榛顧z會導(dǎo)致組織和細(xì)胞的破壞,細(xì)胞內(nèi)的MTb被完全暴露,因此檢測MTb的敏感度將會提高,這與Fu等[21]結(jié)果一致,mNGS檢測肺組織診斷MTb的效應(yīng)比BALF標(biāo)本更敏感,但由于肺活檢對人體侵入傷害性更大,因此在臨床工作中更應(yīng)該權(quán)衡利弊。

    在我們的meta分析中,既沒有觀察到閾值效應(yīng)也沒有觀察到發(fā)表偏倚。然而,研究之間的敏感度存在很大的異質(zhì)性。由于肺標(biāo)本組包括了BALF、肺組織、痰、血液等各種臨床標(biāo)本,并且各研究納入所包含的標(biāo)本類型不盡相同,異質(zhì)性來源因素本就較多,因此我們對BALF組進(jìn)行了亞組分析,發(fā)現(xiàn)mNGS測序平臺和研究類型并不是異質(zhì)性的主要來源。然而,痰菌陰性PTB的2篇研究敏感度值很高(P<0.05),在剔除這兩篇文獻(xiàn)后匯總敏感度,發(fā)現(xiàn)異質(zhì)性降為0,因此我們有理由懷疑這2篇研究為導(dǎo)致異質(zhì)性的主要來源,但這也提示mNGS應(yīng)用于BALF檢測對于痰菌陰性PTB的診斷價(jià)值更高,這一結(jié)果證實(shí)了Jin等[14]研究結(jié)果,mNGS對痰液檢測沒有優(yōu)勢,而在痰菌陰性PTB中的表現(xiàn)優(yōu)于痰菌陽性PTB,而與已發(fā)表的數(shù)據(jù)對比可知,診斷痰菌陰性PTB的敏感度(89% 95%CI:81%~97%)高于Xpert MTb/RIF檢測痰菌陰性PTB的敏感度(86% 95%CI:80%~92%)[25],證實(shí)了mNGS檢測BALF對菌陰性PTB具有很高的診斷價(jià)值。

    mNGS作為一種無偏倚測序方法,理論上可以檢測臨床樣本中所有的病原菌,因此,除了具有很高的敏感度和特異度的優(yōu)勢外,在鑒別混合感染方面具有更大的潛能。既往研究表明[26],mNGS 診斷混合性肺部感染的敏感度為97.2%,遠(yuǎn)高于常規(guī)檢測(13.9%,P<0.05),并且mNGS的病原體檢測范圍比傳統(tǒng)檢測更廣。Xu等[27]的研究結(jié)果也表明mNGS是檢測混合感染的強(qiáng)大工具,最常見的組合是細(xì)菌-細(xì)菌共感染,他們發(fā)現(xiàn)mNGS除了能夠檢測常見病原體外,也能夠檢測諾卡氏菌、肺孢子菌等罕見且難以培養(yǎng)的病原體,為進(jìn)一步了解肺部感染患者的微生物分布特征和病原體溯源提供幫助,為此類患者的抗生素治療提供了更深入的了解。mNGS還可以通過對抗生素耐藥基因進(jìn)行測序,在耐藥性預(yù)測方面也具有巨大潛力,對指導(dǎo)治療方案和改善抗生素管理提供了新的診斷證據(jù)[28]。總而言之,mNGS在病原體檢測方面具有很大的優(yōu)勢,能為診療混合感染的PTB提供更多的臨床價(jià)值。然而,mNGS檢測費(fèi)用較高,導(dǎo)致在臨床上廣泛使用受限制,并且由于mNGS讀數(shù)豐度低,在耐藥性檢測方面也存在一定的缺陷[29],需要不斷地探索和完善mNGS檢測功能。

    本研究存在以下不足:(1)多數(shù)研究為回顧性研究,前瞻性研究很少,研究方法學(xué)質(zhì)量不高;(2)納入的研究樣本量較小,mNGS診斷痰菌陰性PTB的研究文獻(xiàn)較少,評估診斷準(zhǔn)確性的能力不足;(3)有些研究文獻(xiàn)對標(biāo)本類型未進(jìn)行明確規(guī)定,有些研究未明確說明納入研究的患者曾經(jīng)是否用過抗結(jié)核藥物,導(dǎo)致評估m(xù)NGS診斷效應(yīng)存在誤差。我們的meta分析研究顯示,mNGS檢測肺標(biāo)本、BALF、肺組織對于PTB具有很高的診斷性能,可作為一種快速診斷的輔助工具,尤其在痰菌陰性PTB的診斷價(jià)值更突出,對于難以診斷以及合并感染的PTB可選擇mNGS進(jìn)行診療。針對本研究存在的局限性,今后仍需更多的前瞻性、大樣本及多中心的研究進(jìn)一步證實(shí)mNGS的診斷價(jià)值。

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