徐剛,冉鑫,肖大瑾,熊英,龔甜
(江西省疾病預(yù)防控制中心,江西 南昌 330029)
2020 年初,新型冠狀病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19),簡稱"新冠肺炎"迅速蔓延,席卷全世界,對全球的經(jīng)濟、社會造成了巨大的沖擊。截至12 月2 日,全球確診病例超6 400 萬例,死亡破147 萬例,新冠肺炎疫情防控形式依然十分嚴(yán)峻。為了及時甄別新冠肺炎疫情,為不明原因發(fā)熱等暴發(fā)疫情的早期發(fā)現(xiàn)及預(yù)警預(yù)測提供實驗室關(guān)鍵數(shù)據(jù),本實驗室對新冠肺炎疫情后4 月份(2020 年第18 周)至10 月份哨點醫(yī)院的流感樣病例進行了6 種引起呼吸道傳染病的重要病毒進行監(jiān)測,并對期間進行2 起暴發(fā)疫情進行實驗室檢測,了解江西省新冠肺炎疫情后急性病毒性呼吸道傳染病的病原譜,為暴發(fā)疫情預(yù)警預(yù)測和防控提供實驗室證據(jù),現(xiàn)將研究結(jié)果報告如下。
1.1 樣本采集 每周采集江西省流感監(jiān)測哨點醫(yī)院 (南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院)出現(xiàn)發(fā)熱 (體溫≧38℃),伴咳嗽或咽痛等呼吸道感染的流感樣病例咽拭子樣本不少于20 份;及時采集呼吸道感染暴發(fā)疫情病例。
1.2 樣本檢測
1.2.1 病原核酸提取 使用核酸自動提取儀(QIAxtractor,Qiagen 公司)和Cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit(Cat No:54161,Qiagen 公司)對200μL 樣本進行樣本核酸提取,按試劑盒說明書進行操作。
1.2.2 病毒核酸檢測 運用本實驗室前期建立的Real-time RT-PCR 和Real-time PCR 方法[1]對樣本進行6 種引起呼吸道傳染病的重要病毒核酸快速檢測, 其中包括新冠肺炎病毒、流感病毒(甲型和乙型)、鼻病毒、腺病毒、博卡病毒和偏肺病毒。
2.1 多病原監(jiān)測結(jié)果 2020 年4 月份至10 月份共采集樣本670 份,5 月14 日開始檢出陽性樣本,共檢出陽性樣本91 份(13.58%),其中鼻病毒70 份(10.45%),流感病毒12 份(1.79%),腺病毒7 份(1.04%),博卡病毒2 份(0.03%)。鼻病毒自5 月14日開始每周均檢出陽性樣本,在2020 年第27 周(6 月1 日至6 月7 日)出現(xiàn)高峰,見圖1。
圖1 流感樣病例多病原檢測結(jié)果
2.2 病毒性呼吸道傳染病暴發(fā)疫情監(jiān)測結(jié)果 共發(fā)生三起發(fā)熱呼吸道感染暴發(fā)疫情,其中2020 年5 月27 日至2020 年6 月6 日兩起發(fā)生于江西省兩地,分別采集樣本16 份和13 份,檢出鼻病毒陽性樣本分別為7 份和8 份,陽性率分別為43.75%和61.54%;2020 年8 月的一起疫情采集標(biāo)本3份,均檢出腺病毒陽性。
急性病毒性呼吸道傳染病是一種由新冠肺炎病毒、流感病毒(甲型和乙型)、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠狀病毒、偏肺病毒和腸道病毒等病毒引起的,早期臨床癥狀相似,為發(fā)熱等流感樣癥狀[2-10]。
本研究對2020 年4 月至10 月份流感哨點醫(yī)院流感樣病例標(biāo)本進行新冠肺炎病毒、流感病毒等18 種引起呼吸道傳染病的病原核酸快速檢測,發(fā)現(xiàn)新冠肺炎疫情后2020 年第24 周 (5 月11 日至5 月17 日)開始出現(xiàn)急性病毒性呼吸道感染病例,發(fā)病率為13.58%,病毒類型主要為鼻病毒(10.45%)、流感病毒(1.79%)和腺病毒(1.04%)。鼻病毒感染率遠(yuǎn)高于其他病毒,鼻病毒主要引起普通感冒,本研究結(jié)果中,自2020 年第24 周(5 月11 日至5 月17 日)開始一直出現(xiàn)鼻病毒感染病例,在5 月底發(fā)生了兩起由鼻病毒感染引起的急性病毒性呼吸道感染暴發(fā)疫情,也是我省首次發(fā)現(xiàn)首次由實驗鼻病毒感染引起的暴發(fā)疫情。而腺病毒在第34 周(6 月29 日至7 月3 日)開始檢出陽性樣本,在8 月發(fā)生了一起由腺病毒感染引起的急性發(fā)熱呼吸道感染暴發(fā)疫情。急性病毒性呼吸道感染暴發(fā)疫情前半個月至一個月均監(jiān)測到相應(yīng)病原開始流行,提示發(fā)熱呼吸道感染多病原監(jiān)測可以對疫情暴發(fā)起到預(yù)警預(yù)測作用。
目前,我國除流感病毒外,尚未建立腺病毒等其他呼吸道病毒的監(jiān)測系統(tǒng),其他呼吸道病毒的流行特征不清楚,不利于急性病毒性呼吸道傳染病暴發(fā)疫情的早期發(fā)現(xiàn)及預(yù)警預(yù)測。根據(jù)本研究結(jié)果,建議依托全國省市兩級流感實驗室網(wǎng)絡(luò),進行每周一次新冠肺炎病毒、流感病毒(甲型和乙型)、腺病毒、鼻病毒、博卡病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠狀病毒、偏肺病毒和腸道病毒等多病原監(jiān)測,對急性病毒性呼吸道傳染病疫情的防治、不明原因發(fā)熱等暴發(fā)疫情的早期發(fā)現(xiàn)及預(yù)警預(yù)測和減少社會恐慌具有非常重要的意義。