不同魚類和采樣時間的養(yǎng)殖池塘環(huán)境微生物群落研究

王淼　黃秋標(biāo)　李慶勇　朱德興　王瑞寧　衣萌萌　盧邁新

摘要：微生物群落是養(yǎng)殖池塘生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分，了解環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)和功能，可有針對性地進(jìn)行養(yǎng)殖環(huán)境微生態(tài)調(diào)控。在不同季節(jié)采集尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）和斑點(diǎn)叉尾鮰（Ictalurus punctatus）池塘水樣，分析硝酸鹽氮（NO3-N）、亞硝酸鹽氮（NO2-N）、氨氮（NH4-N）、總氮（TN）和總磷（TP）等理化指標(biāo)，利用Biolog-Eco微平板技術(shù)分析水體中微生物對各類碳源代謝的平均顏色變化率，利用高通量測序技術(shù)分析其菌群結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明，1月淡水養(yǎng)殖池塘水質(zhì)和菌群結(jié)構(gòu)不同于其他采樣時間，養(yǎng)殖魚類種類對池塘理化指標(biāo)和微生物菌群結(jié)構(gòu)影響不大。不同采樣時間的池塘理化指標(biāo)差異顯著，同一采樣時間不同養(yǎng)殖魚類池塘的理化指標(biāo)之間無顯著差異。其中，1月尼羅羅非魚池塘中的NH4-N含量高于其他月份，且顯著高于4月和7月（P<0.05）；1月TP含量顯著高于4月、7月和10月（P<0.05）。1月斑點(diǎn)叉尾鮰池塘的TP和NO3-N含量顯著高于其他3個月份（P<0.05）。Biolog-Eco微平板技術(shù)檢測到尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘中的微生物群落對碳水化合物和氨基酸的利用能力較強(qiáng)，對酚胺類化合物的利用能力較弱，4月斑點(diǎn)叉尾鮰池塘微生物對碳源的利用率高于尼羅羅非魚池塘。高通量測序發(fā)現(xiàn)，厚壁菌門（Firmicutes）和擬桿菌門（Bacteroidetes）是尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘的絕對優(yōu)勢菌門。hgcI clade、CL500-29 marine group和C39等是參與池塘水體氮磷循環(huán)的主要菌屬。研究結(jié)果可為了解淡水養(yǎng)殖環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)與變化規(guī)律、更有針對性地構(gòu)建養(yǎng)殖池塘尾水的生態(tài)化處理方法提供科學(xué)依據(jù)。

關(guān)鍵詞：尼羅羅非魚；斑點(diǎn)叉尾鮰；養(yǎng)殖池塘；微生物群落

中圖分類號：X172? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A? ? ? ? 文章編號：1674-3075（2023）03-0120-09

我國淡水漁業(yè)以池塘養(yǎng)殖模式為主。2020年我國淡水池塘養(yǎng)殖面積為262.54萬hm2，占淡水養(yǎng)殖總面積的52.09%，養(yǎng)殖水產(chǎn)品產(chǎn)量為2 279.76萬t，占淡水養(yǎng)殖總產(chǎn)量的73.81%；廣東省淡水池塘養(yǎng)殖面積占全國淡水池塘總面積的9.41%，淡水養(yǎng)殖產(chǎn)量為415.41萬t，其中池塘養(yǎng)殖產(chǎn)量占91.74%（農(nóng)業(yè)農(nóng)村部漁業(yè)漁政管理局，2021）。由于養(yǎng)殖過程不換水或換水不及時，亞硝酸鹽（NO2-N）、氨氮（NH4-N）等有害物質(zhì)不斷累積，進(jìn)而引起水質(zhì)惡化，導(dǎo)致魚類病害暴發(fā)。研究表明，水產(chǎn)養(yǎng)殖病害的發(fā)生大都與水質(zhì)惡化相關(guān)（胡大勝，2011）。水質(zhì)惡化使致病微生物快速繁殖，引起養(yǎng)殖魚類因應(yīng)激而導(dǎo)致抗病能力下降。如何改善養(yǎng)殖環(huán)境已成為池塘養(yǎng)殖的研究熱點(diǎn)，養(yǎng)殖尾水的生態(tài)化處理需求也日益增加，目前已在全國很多地區(qū)推廣“三池兩壩”池塘養(yǎng)殖尾水處理系統(tǒng)（劉梅等，2021）。淡水養(yǎng)殖尾水處理也是廣東省2021年漁業(yè)主推技術(shù)，掌握池塘不同養(yǎng)殖種類和不同季節(jié)水質(zhì)狀況及菌群結(jié)構(gòu)，可為養(yǎng)殖尾水的生態(tài)化處理提供科學(xué)依據(jù)。

水產(chǎn)養(yǎng)殖飼料中氮的利用率只有11.7%～27.7%（Zhang et al，2015），水體中大量的NH4-N堆積影響魚類健康，且易污染環(huán)境，NH4-N經(jīng)微生物的硝化作用會轉(zhuǎn)化為NO2-N，過量的NO2-N同樣會危害養(yǎng)殖魚類（肖煒等，2020）。微生物作為分解者，轉(zhuǎn)化養(yǎng)殖池塘生態(tài)系統(tǒng)中的有機(jī)物和無機(jī)物，調(diào)節(jié)養(yǎng)殖環(huán)境條件（魏祥東等，2002）；另一方面，有害微生物的增殖可改變水體菌相組成、影響水質(zhì)，并導(dǎo)致養(yǎng)殖魚類粘膜系統(tǒng)菌群失衡，增加其感病風(fēng)險。因此，微生物群落對養(yǎng)殖池塘生態(tài)系統(tǒng)的健康有著重要作用。傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)等研究方法只能獲得少量信息，無法全面揭示菌群結(jié)構(gòu)。Biolog-ECO微平板技術(shù)操作方便，用來測定菌群對31種單一碳源的利用能力，從而反應(yīng)樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)組成和功能多樣性，是目前研究養(yǎng)殖池塘微生物群落代謝特征的一種有效方法（楊鶯鶯等，2014; Kurten & Barkoh，2016;趙瓊等，2020）。隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展，高通量測序技術(shù)能夠更加全面準(zhǔn)確地獲得樣品中微生物相對豐度的信息，也被廣泛應(yīng)用于養(yǎng)殖環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)和功能研究（Li et al，2020;Deng et al，2021）。

本研究以尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）和斑點(diǎn)叉尾鮰（Ictalurus punctatus）養(yǎng)殖池塘為實(shí)驗(yàn)對象，分析水體理化指標(biāo)的動態(tài)變化；利用Biolog-ECO微平板技術(shù)，研究不同采樣時間和不同養(yǎng)殖種類淡水池塘微生物群落的碳源代謝功能，并采用高通量測序技術(shù)，探究不同采樣時間和不同養(yǎng)殖種類池塘微生物的群落結(jié)構(gòu)差異，以期了解養(yǎng)殖環(huán)境中菌群結(jié)構(gòu)和功能，為更有針對性地調(diào)控養(yǎng)殖環(huán)境微生物提供參考。

1? ?材料與方法

1.1? ?養(yǎng)殖品種與數(shù)量

本實(shí)驗(yàn)樣品采自廣東惠州振華漁業(yè)有限公司養(yǎng)殖池塘，監(jiān)測8個池塘的水體理化指標(biāo)及微生物變化，包括4個尼羅羅非魚養(yǎng)殖池塘和4個斑點(diǎn)叉尾鮰養(yǎng)殖池塘。池塘平均水深約1.3 m，面積及放養(yǎng)量見表1。按照魚體重的2%～3%進(jìn)行投喂，每天投喂2次，養(yǎng)殖期間不換水，溶氧保持在3 mg/L以上。

1.2? ?樣品采集與理化指標(biāo)測定

本次實(shí)驗(yàn)分別于2019年1月、4月、7月和10月從2個不同品種的養(yǎng)殖池塘中采集水樣。采集信息見表2。按照連華環(huán)?？萍加邢薰緳z測試劑盒說明書，測定水樣中NO3-N、NO2-N、NH4-N、TN、TP的濃度。

1.3? ?微生物功能多樣性測定

用無菌水將待測水樣稀釋10倍，加入到Biolog-ECO板中，28℃恒溫培養(yǎng)216 h。每隔24 h使用多功能酶標(biāo)儀（BioTek，US）記錄ECO微平板在590 nm和750 nm下的光密度值。根據(jù)每孔的顏色變化，測定吸光值反映菌群對碳源底物的利用情況。單孔顏色平均值（average well colour development， AWCD）計算公式（Garland，1996）如下：

AWCD=∑[（Ci－R）590－（Ci－R）750]/n? ①

式中：Ci為測定的第i個碳源孔光密度值，R為對照孔光密度值，n為碳源種類數(shù)，n值隨所研究碳源種類數(shù)變化，分別為31（全部碳源）、12（碳水化合物）、6（氨基酸）、5（羧酸類）、4（多聚物）、2（酚胺類）、2（胺類）。

1.4? ?菌群16S rRNA測序分析

采用環(huán)境樣本DNA純化試劑盒（ZYMO Research 公司）提取樣本總DNA。引物序列為：515F（5-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3）和806R （5-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3）。PCR擴(kuò)增程序：起始94℃、1 min，94℃變性20 s，54℃退火30 s，72℃延伸30 s，循環(huán)30次；72℃延伸5 min。每個樣本重復(fù)3次。將PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測。使用QIAquick Gel Extraction Kit（QIAGEN）試劑盒回收目的條帶。使用Qubit@ 2.0 Fluorometer （Thermo Scientific）定量，等摩爾量混合。建庫用TruSeq DNA PCR-Free Sample Prep Kit，測序用羅寧生物的Hiseq 2500平臺PE250模式。對16S rRNA測序原始數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接（FLASH軟件），用Uchime算法去除嵌合體，得到高質(zhì)量的優(yōu)化序列（Tags）。用Usearch軟件對Tags在97%的相似度水平下進(jìn)行聚類，得到操作分類單元（Operational Taxonomic Units， OTUs），基于Silva（Release132）和UNITE分類學(xué)數(shù)據(jù)庫對OTUs進(jìn)行分類學(xué)注釋。測序結(jié)果使用R（v.3.2.0）進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計和作圖。

1.5? ?數(shù)據(jù)分析

數(shù)據(jù)采用（X-±SE）表示。用Sigmoplot軟件對水質(zhì)理化指標(biāo)和菌群碳源代謝強(qiáng)度作圖。用SPSS 21軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行雙因素方差分析（Two way-ANOVA）。用Shapiro Test檢驗(yàn)其正態(tài)性，或使用Levene Test檢驗(yàn)數(shù)據(jù)的方差齊性，發(fā)現(xiàn)部分?jǐn)?shù)據(jù)不具有正態(tài)性或者方差齊次性。因此采用兩種方法，一是進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換，使其正態(tài)或方差齊次；二是使用非參數(shù)檢驗(yàn)方法，如卡方檢驗(yàn)。使用第一種方法進(jìn)行嘗試，數(shù)據(jù)經(jīng)過log10、開方等方法轉(zhuǎn)換之后，再進(jìn)行Shapiro檢驗(yàn)或Levene檢驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)部分?jǐn)?shù)據(jù)仍不具有正態(tài)性和方差齊性，無法進(jìn)行方差分析。使用非參數(shù)的雙因素差異檢驗(yàn)方法Scheirer-Ray-Hare。

2? ?結(jié)果與分析

2.1? ?池塘水質(zhì)理化指標(biāo)

通過雙因素方差分析季節(jié)和養(yǎng)殖種類對池塘水質(zhì)的影響。結(jié)果表明，不同采樣時間的池塘水體理化指標(biāo)差異顯著，同一采樣時間、不同魚類養(yǎng)殖池塘水體理化指標(biāo)之間無顯著差異（圖1，圖2，表3）。其中，1月尼羅羅非魚養(yǎng)殖池塘中的NH4-N含量高于其他3個月份，并顯著高于4月和7月（P<0.05）；4月的NO3-N含量顯著高于1月和10月（P<0.05）；1月TP含量顯著高于4月、7月和10月（P<0.05）。1月斑點(diǎn)叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體中的TP和NO3-N含量顯著高于其他3個月份（P<0.05）。

2.2? ?池塘水體菌群對碳源的代謝強(qiáng)度

池塘水體中微生物AWCD值在各月之間相差不大（圖3，表4），說明池塘水體微生物在各月之間的代謝活性相似。尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘微生物對碳水化合物的利用率最高，對氨基酸、羧酸類和多聚物的利用率較高，對酚胺類的利用率最低。斑點(diǎn)叉尾鮰池塘微生物對碳源的利用率高于尼羅羅非魚池塘，其中4月斑點(diǎn)叉尾鮰池塘微生物對全部碳源總和、碳水化合物、氨基酸、羧酸類和酚胺類的利用率顯著高于尼羅羅非魚池塘（P<0.05），4月和10月斑點(diǎn)叉尾鮰池塘微生物對胺類的利用率顯著高于尼羅羅非魚（P<0.05）。

2.3? ?養(yǎng)殖池塘水體菌群結(jié)構(gòu)變化

2.3.1? ?測序深度及多樣性? ?稀釋曲線表明，本研究中的測序深度基本覆蓋到各樣品中的所有物種（圖4）。利用PD、Chao、Shannon、Simpson等指數(shù)對池塘菌群的α多樣性進(jìn)行評估。結(jié)果表明，1月尼羅羅非魚池塘菌群的PD和Chao指數(shù)平均值最低，說明1月養(yǎng)殖池塘菌群的物種豐富度最低（圖5）。利用主坐標(biāo)（PCoA）對池塘水體菌群的β多樣性進(jìn)行評估，結(jié)果表明，4月、7月和10月尼羅羅非魚池塘的樣點(diǎn)有明顯聚集，1月的菌群與其他月份存在較大差異。斑點(diǎn)叉尾鮰池塘樣點(diǎn)未出現(xiàn)明顯聚集（圖6）。

2.3.2? ?門水平的水體微生物群落結(jié)構(gòu)? ?尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘水體中均以變形菌門（Proteobacteria）和放線菌門（Actinobacteria）的相對豐度最高，其次為藍(lán)菌門（Cyanobacteria）、擬桿菌門（Bacteroidetes）、浮霉菌門（Planctomycetes）、綠彎菌門（Chloroflexi）、疣微菌門（Verrucomicrobia）、厚壁菌門（Firmicutes）和梭桿菌門（Fusobacteria）（圖7）。

2.3.3? ?屬水平的水體微生物群落結(jié)構(gòu)? ?尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘水體中藍(lán)細(xì)菌屬（Cyanobium PCC-6307）、hgcI clade（魚孢菌科Sporichthyaceae）、CL500-29 marine group（Ilumatobacteraceae）、C39（紅環(huán)菌科Rhodocyclaceae）、Mycobacterium（分枝桿菌屬）、Polynucleobacter、LD29（Chthoniobacteraceae）、鯨桿菌屬（Cetobacterium）、微囊藻屬（Microcystis PCC-7914）和小梨形菌屬（Pirellula）為主要菌屬（圖8）。CL500-29 marine group的相對豐度在1月最低，C39的相對豐度在1月最高，C39也是1月尼羅羅非魚養(yǎng)殖池塘水體中的差異標(biāo)記微生物（圖9）。

2.3.4? ?屬水平的細(xì)菌群落相關(guān)性? ?相關(guān)性分析結(jié)果表明（表5），C39與NH4-N具有極顯著相關(guān)性（r=0.68， P<0.01），C39與TN具有顯著相關(guān)性（r=0.45， P<0.05），hgcI clade與NO2-N具有極顯著相關(guān)性（r=0.51， P<0.01），C39與LD29和TP具有極顯著相關(guān)性（r=0.60， P<0.01；r=0.52， P<0.01），hgcI clade與TP具有顯著相關(guān)性（r=-0.37， P<0.05），CL500-29 marine group與TP具有極顯著相關(guān)性（r=-0.56， P<0.01）。

3? ?討論

3.1? ?不同養(yǎng)殖品種的池塘水質(zhì)變化趨勢比較

尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體中各理化指標(biāo)的變化趨勢基本相同，NH4-N和TP含量在1月最高，NO2-N含量在4月最低。尼羅羅非魚池塘中的NO3-N含量在4月最高，而斑點(diǎn)叉尾鮰池塘的NO3-N含量在1月最高。廣東地區(qū)淡水養(yǎng)殖池塘水質(zhì)在冬季較差，這和董玉峰等（2014）對團(tuán)頭魴養(yǎng)殖的季節(jié)變化研究結(jié)果一致。隨著養(yǎng)殖時間的增加，尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰養(yǎng)殖池塘的氮磷等含量并未顯著增加，說明在養(yǎng)殖密度合理的情況下，傳統(tǒng)養(yǎng)殖池塘本身具有一定的自凈能力。朱莉飛等（2020）研究也發(fā)現(xiàn)，羅非魚在中等養(yǎng)殖密度下，保證足夠的供氧量可促進(jìn)水體中無機(jī)氮的降解。羅非魚池塘中的無機(jī)氮在1月以NH4-N為主要形式，在4月和7月以NO3-N為主要形式。斑點(diǎn)叉尾鮰池塘中的無機(jī)氮以NH4-N和NO3-N為主要形式，鐘立強(qiáng)等（2020）認(rèn)為南京地區(qū)斑點(diǎn)叉尾鮰池塘的氮源也以這兩種形式為主。相關(guān)分析也發(fā)現(xiàn)，養(yǎng)殖池塘水體中的TN與NH4-N、NO3-N含量呈正相關(guān)（表5）。這兩種形式的氮鹽是養(yǎng)殖尾水中需要去除的主要對象。

3.2? ?養(yǎng)殖池塘水體菌群對碳源的代謝強(qiáng)度比較

在碳源利用方面，尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰養(yǎng)殖池塘的菌群結(jié)構(gòu)具有明顯共性，其能更好地利用碳水化合物和氨基酸，而對酚胺類化合物的利用能力較低。隨著時間的變化（1月、4月、7月和10月），尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘微生物的主要群落組成大體穩(wěn)定，但相對豐度卻在不斷變化，這解釋了微生物群落代謝功能在不同月份之間具有差異的原因。曹煜成等（2014）研究了羅非魚池塘中微生物碳源代謝的動態(tài)變化，發(fā)現(xiàn)在整個養(yǎng)殖季節(jié)（5-10月），雖然水體中微生物群落在對不同類型的碳源選擇方面有所不同，但池塘微生物數(shù)量和碳源代謝水平處于較穩(wěn)定狀態(tài)。

3.3? ?養(yǎng)殖池塘水體菌群結(jié)構(gòu)變化特征比較

高通量測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)，變形菌門和放線菌門是尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘中的優(yōu)勢菌門，這與之前對羅非魚池塘的研究結(jié)果一致（王淼等，2020）；南京地區(qū)斑點(diǎn)叉尾鮰池塘中相對豐度最高的菌門為藍(lán)藻門，其次為放線菌門和變形菌門（鐘立強(qiáng)等，2020）。在屬水平上，尼羅羅非魚和斑點(diǎn)叉尾鮰池塘中藍(lán)細(xì)菌屬、hgcI clade、CL500-29 marine group和C39為主要菌屬。研究表明，CL500-29 marine group 可以利用多種碳源（Lindh et al，2015）。hgcI clade是凡納濱對蝦養(yǎng)殖水體的優(yōu)勢菌屬（金若晨等，2020）。藍(lán)細(xì)菌屬、hgcI clade和C39是東加爾各答濕地魚塘尾水的主要菌屬，且hgcI clade和C39的相對豐度與水中的COD含量呈正相關(guān)（Tyagi et al，2021）。本研究也發(fā)現(xiàn)了這2個菌屬的相對豐度與水中的氮鹽含量呈正相關(guān)關(guān)系，表明水中營養(yǎng)物質(zhì)的含量影響了池塘養(yǎng)殖尾水中的微生物群落結(jié)構(gòu)。在污水處理中，紅環(huán)菌目細(xì)菌具有除氮、除磷等功能（葉正芳等，2013；王崢嶸等，2019）。本研究發(fā)現(xiàn)紅環(huán)菌科細(xì)菌C39的相對豐度與水體TP呈正相關(guān)關(guān)系，C39在冬季池塘的相對豐度較高，也是冬季尼羅羅非魚養(yǎng)殖池塘中具有顯著差異的標(biāo)記物；可能由于冬季淡水養(yǎng)殖池塘的總磷含量較高，C39成為池塘中的主要菌屬。在草魚混養(yǎng)池塘的相關(guān)研究中發(fā)現(xiàn)，蜜糖的添加提高了水體中hgcI clade的相對豐度，降低了NO2-N含量（郭小澤等，2019），hgcI clade可以吸收碳水化合物和富氮化合物（Ghylin et al，2014）；本研究也發(fā)現(xiàn)hgcI clade和NO2-N具有極顯著的相關(guān)性。

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（責(zé)任編輯? ?萬月華）

Environmental Microbial Community of Different Fish Aquaculture

Ponds at Different Sampling Times

WANG Miao1， HUANG Qiu‐biao2， LI Qing‐yong2， ZHU De‐xing2，

WANG Rui‐ning1， YI Meng‐meng1， LU Mai‐xin1

（1. Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application & Cultivation，

Ministry of Agriculture and Rural Affairs， Guangdong Provincial Key Laboratory of Aquatic Animal Immunology and Sustainable Aquaculture， Pearl River Fisheries Research Institute，

Chinese Academy of Fishery Science， Guangzhou? ?510380， P.R. China;

2. Fisheries Research and Extension Center of Huizhou， Huizhou? ?516002， P.R. China）

Abstract：The microbial community is crucial for maintaining aquaculture pond ecosystems. In this study， water samples from Nile tilapia （Oreochromis niloticus） and channel catfish （Ictalurus punctatus） aquaculture ponds were collected in different seasons to characterize the variation in microbial community structure and water physicochemical parameters， aiming to understand how the environmental microbial community functions in different types of aquaculture ponds. In January， April， July and October 2019， water samples were collected in four aquaculture ponds of each fish species for the analysis of microbial community and the determination of physicochemical parameters， including total nitrogen， ammonia nitrogen， nitrate nitrogen， nitrite nitrogen and total phosphorus. The microbial community structure in water was analyzed by high-throughput sequencing technology and average well color development （AWCD） of the aquatic microorganisms， using various carbon sources， was analyzed by Biolog ECO-plate technology. Results show that water quality and microbial community structure of the aquaculture ponds in January were different from those in other investigation time， and the fish species had little effect on the water quality and microbial community structure of pond water. There were significant differences in the physicochemical parameters in aquaculture ponds among sampling times， but there were no significant differences in the physicochemical parameters of Nile tilapia and channel fish ponds at the same sampling time. Among them， the content of NH4-N in Nile tilapia aquaculture ponds in January was higher than in other months， significantly higher than that in April and July （P<0.05）， and the content of TP in January was significantly higher than that in April， July and October （P<0.05）. The contents of NO3-N and TP in channel catfish aquaculture ponds in January were significantly higher than those in other months （P<0.05）. Biolog-ECO plate detected that microorganisms in Nile tilapia and channel fish aquaculture ponds had high utilization rate of carbohydrates and amino acids and low utilization rate of phenolic amines. In April， the utilization rate of carbon sources by microorganisms in channel catfish ponds was higher than that in Nile tilapia ponds. High throughput sequencing shows that Firmicutes and Bacteroidetes were the dominant phyla in both Nile tilapia and channel catfish ponds. Actinobacteria （hgcl clade）， the CL500-29 marine group and C39 were the primary genera involved in nitrogen and phosphorus cycling in the freshwater ponds. Our study helps to understand microbial community structure and variation in the aquaculture environment and provides scientific evidence for developing targeted measures for ecological treatment of wastewater in aquaculture.

Key words：Oreochromis niloticus; Ictalurus punctatus; aquaculture pond; microbial community

收稿日期：2021-09-15? ? ?修回日期：2023-01-09

基金項(xiàng)目：財政部和農(nóng)業(yè)農(nóng)村部：國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系（No. CARS-46）；廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金（2019A1515111046）；中國水產(chǎn)科學(xué)研究院中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)（2021ZX04）。

作者簡介：王淼，1984年生，女，博士，主要從事水產(chǎn)健康養(yǎng)殖研究。E-mail：miaowfly@163.com

通信作者：盧邁新，1962年生，男，研究員，博士生導(dǎo)師，主要從事羅非魚健康養(yǎng)殖與選育種研究。 E-mail：mx-lu@163.com