姚帥濤,吳文靜,王少瓷,詹為民,劉 通,姜良良,2,楊建平
(1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院/省部共建小麥玉米作物學(xué)國家重點實驗室/作物分子育種國家工程中心,河南 鄭州 450046;2.河南科技學(xué)院,河南 新鄉(xiāng) 453003)
光是植物光合作用的能量來源,調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育中的多個環(huán)節(jié),如種子萌發(fā)、幼苗生長、莖葉伸長、避蔭反應(yīng)、開花結(jié)實等[1-2]。植物體內(nèi)包含多種光受體,其能夠感知不同波長的光,如光敏色素(Phytochrome,PHY)感知紅光(600~700 nm)和遠(yuǎn)紅光(700~750 nm),隱花色素(Cryptochrome,CRY)和向光素(Phototropin,PHOT)感知藍光(400~500 nm),UVR8(UV resistance locus 8)感 知 紫 外 光(290~400 nm)[3-7]。這些光受體將感知到的光信號轉(zhuǎn)化為植物信號調(diào)控下游基因的表達,進而調(diào)控植物的生長和發(fā)育[8-10]。
HY5(Elongated hypocotyl 5)是調(diào)控光形態(tài)建成轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)的中心樞紐[11]。HY5屬于堿性亮氨酸拉鏈(Basic leucine zipper,bZIP)轉(zhuǎn)錄因子家族,其二級結(jié)構(gòu)由氨基端結(jié)構(gòu)域和包含卷曲螺旋的LZ 結(jié)構(gòu)域的羧基端結(jié)構(gòu)域組成[11];其由168 個氨基酸組成,分子質(zhì)量為18.5 ku。HY5 通過直接結(jié)合靶標(biāo)基因啟動子上的G-box 元件來調(diào)節(jié)靶標(biāo)基因的轉(zhuǎn)錄[12-14]。研究表明,HY5 能調(diào)節(jié)擬南芥(Arabidopsis thaliana)約33%基因的表達,可以直接組合調(diào)控約3 000 個基因[13,15]。HY5 的靶標(biāo)基因包括光響應(yīng)基因,如COP1(Constitutive photomorphogenic 1)、FHY1(Far-red elongated hypocotyl 1)、CAB1(Light-harvesting chlorophyll A/B 1)、HFR1(Long hypocotyl in far-red 1)、BBX22(B-box domain protein 22),晝夜節(jié)律時鐘調(diào)節(jié)基因,如ELF4(Early flowering 4)、LHY(Late elongated hypocotyl)、CCA1(Circadian clock associated 1)[3,13,16-20]。
HY5 是光形態(tài)建成過程中重要的轉(zhuǎn)錄因子,但在黑暗時會被降解而失去功能。HY5 通過與COP1的WD-40 結(jié)構(gòu)域互作,被泛素化后再被26S 蛋白酶體降解[12,21]。SPAs(Suppressor of phytochromes)可通過與COP1 互作促進HY5 降解[22]。此外,光形態(tài)建成負(fù)調(diào)控因子SHW1(Short hypocotyl in white light 1)作用于COP1 促進HY5 降解[23]。在植物體內(nèi)HY5 存在磷酸化和非磷酸化2種形式,COP1與非磷酸化形式HY5 的互作能力強于磷酸化形式HY5[24]。因此,在黑暗中磷酸化的HY5形態(tài)可以作為一個能量池,轉(zhuǎn)向光的進程中可以快速轉(zhuǎn)向非磷酸化,為幼苗光形態(tài)建成提供營養(yǎng)[25]。HY5 除了參與光形態(tài)建成外,還參與種子萌發(fā)、抗逆、花青素合成和果實品質(zhì)形成等過程,例如:光作為一種重要的外源信號,可以 影 響 種 子 中 的 ABA(Abscisic acid)/GA(Gibberellin acid)平 衡 ,通 過 HY5-ABI5(ABA-insensitive 5)途徑抑制擬南芥種子萌發(fā)[26]。在擬南芥中,光觸發(fā)HY5 積累,在土壤生長條件下積極調(diào)節(jié)根系生長和發(fā)育[27-28]。低溫促進磷酸化藍光感受器CRY2 蛋白穩(wěn)定,進而抑制COP1 與HY5的相互作用,HY5 得以大量積累并激活BBX7 和BBX8 的表達,進而調(diào)節(jié)冷響應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄,提高擬南芥的冷凍耐受性[9]。在蘋果中,MdHY5 與MdBBX22 相互作用促進花青素生物合成基因的表達[29]。HY5 在番茄苗期影響弱光導(dǎo)致的徒長,在果實中促進大量代謝物的合成和積累,進而影響番茄果實品質(zhì)[30]。在擬南芥中,通過異源表達ZmHY5基因,可以恢復(fù)擬南芥hy5突變體的表型[31]。目前,關(guān)于擬南芥HY5 基因的功能研究較多[9,11,13,15-28],但玉米(Zea mays)HY5 基因功能研究很少[31],尚未見關(guān)于ZmHY5基因?qū)Σ煌赓|(zhì)的響應(yīng)研究。為此,克隆ZmHY5和ZmHY5L基因,并對其在不同部位、持續(xù)光照、轉(zhuǎn)換光及長短日照處理下的表達量進行分析,確定ZmHY5和ZmHY5L基因響應(yīng)光處理的能力,為利用光信號途徑進行玉米品種改良提供借鑒。
供試玉米材料為自交系B73,由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院李海博老師惠贈,本實驗室保存繁育。供試克隆載體pEASY 購自北京全式金生物技術(shù)有限公司,大腸桿菌菌株為DH5α。
RNA 提 取 試 劑 盒FastPure?Universal Plant Total RNA Isolation Kit 和反轉(zhuǎn)錄試劑盒HiScript?ⅢRT SuperMix for qPCR(+gDNA wiper)購自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;熒光定量試劑盒PerfectStart Green qPCR SuperMix 購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;2×FastTaqPremix購自吐露港生物科技有限公司。
1.2.1 組織特異性表達樣品采集 取田間正常生長55 d 玉米的根、莖、葉、葉枕、葉鞘、花絲、雄花、苞葉和幼穗,迅速置于液氮中,轉(zhuǎn)移到-80 ℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 持續(xù)光質(zhì)處理 將玉米種子滅菌后置于培養(yǎng)皿中培養(yǎng)2 d,選取長勢均勻的種子種于營養(yǎng)土中,每盆均勻點播4 粒。然后放在持續(xù)黑暗(Dark,Dk)、遠(yuǎn)紅光[Far-red light,F(xiàn)R:0.44 μmol/(m2s)]、紅光[Red light,R:22.84 μmol/(m2s)]、藍光[Blue light,B:12.74 μmol/(m2s)]和白光[While light,W:17.56 μmol/(m2s)]培養(yǎng)箱中(28 ℃),培養(yǎng)8 d 后對幼苗葉片進行取樣保存,方法同1.2.1。
1.2.3 黑暗轉(zhuǎn)換不同光質(zhì)處理 將28 ℃培養(yǎng)箱中黑暗生長8 d的玉米分別轉(zhuǎn)到1.2.2中各種光質(zhì)下生長,分別在轉(zhuǎn)換后0.25、0.5、1、2、4、8、12、24 h 取幼苗葉片,方法同1.2.1。
1.2.4 長日照和短日照處理 28 ℃條件下將玉米播種后放置于長日照(Long day,LD:16 h光照/8 h黑暗)和短日照(Short day,SD:8 h 光照/16 h 黑暗)培養(yǎng)箱中,8 d 后每隔2 h 取一次幼苗葉片,光照交替時提前3 min取樣,方法同1.2.1。
1.3.1 RNA 提 取 和cDNA 合 成 使 用FastPure?Universal Plant Total RNA Isolation Kit 提取樣品的總RNA,檢測質(zhì)量合格后使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒HiScript?ⅢRT SuperMix for qPCR(+gDNA wiper)將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,保存于-20 ℃冰箱備用。
1.3.2ZmHY5和ZmHY5L基因的克隆 根據(jù)擬南芥HY5蛋白序列在MaizeGDB(https://www.maizegdb.org/)數(shù)據(jù)庫中經(jīng)BLAST得到玉米2個HY5同源基因HY5(Zm00001d015743)和HY5L(Zm00001d039658),以上述2 個基因的cDNA 序列設(shè)計引物(表1),以玉米cDNA為模板,經(jīng)PCR擴增后連接到pEASY,轉(zhuǎn)入DH5α,經(jīng)菌落PCR 和雙酶切鑒定正確后,由北京擎科生物科技有限公司測序。PCR 擴增程序:95 ℃3 min;95 ℃30 s,57 ℃30 s,72 ℃45 s,32 個循環(huán);72 ℃5 min;15 ℃5 min。
表1 基因克隆所用引物Tab.1 Primers for genes cloning
1.3.3 ZmHY5和ZmHY5L的氨基酸序列比對、結(jié)構(gòu)域分析與系統(tǒng)發(fā)育分析 在NCBI 數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)獲 得 玉 米、谷 子(Setaria italica)、高粱(Sorghum bicolor)、南荻(Miscanthus lutarioriparius)、糜 子(Panicum hallii)、柳 枝 稷(Panicum virgatum)、野生稻(Oryza brachyantha)、擬南芥和毛白楊(Populus tomentosa)HY5 的氨基酸序列。使用ExPASy ProtParam 網(wǎng)站(https://web.expasy.org/protparam/)分析蛋白質(zhì)的分子質(zhì)量和等電點等理化性質(zhì)。用MEGA 及Evolview(www.evolgenius.info/evolview)網(wǎng)站進行系統(tǒng)發(fā)育分析,分別使用DNAMAN 9 軟件和Pfam(http://pfam.xfam.org/)網(wǎng)站進行氨基酸多序列比對和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析[32]。
1.3.4ZmHY5和ZmHY5L基因的實時熒光定量PCR(qRT-PCR)分析 依據(jù)ZmHY5和ZmHY5L基因序列,使用Primer Premier 5.0 軟件設(shè)計qRT-PCR引物(表2),內(nèi)參基因為Tubulin(Zm00001d013367)。使用PerfectStart Green qPCR SuperMix 在Roche 480熒光定量PCR 儀(瑞士)上進行qRT-PCR 擴增。PCR 程 序:94 ℃30 s;94 ℃5 s,60 ℃15 s,72 ℃15 s,循環(huán)次數(shù)為45次。3次重復(fù)后,根據(jù)2-ΔΔCT方法計算表達量[33]。
根 據(jù)MaizeGDB 中HY5(Zm00001d015743)和HY5L(Zm00001d039658)基因的cDNA 序列設(shè)計引物,以玉米cDNA 為模板,通過RT-PCR 擴增得到約510 bp 和576 bp 的DNA 片段(圖1),與預(yù)計目的片段長度一致。將目的片段回收測序,發(fā)現(xiàn)序列結(jié)果與MaizeGDB 網(wǎng) 站 中HY5(Zm00001d015743)和HY5L(Zm00001d039658)基因的cDNA序列一致。
圖1 ZmHY5和ZmHY5L基因的PCR擴增結(jié)果Fig.1 PCR amplification results of ZmHY5 and ZmHY5L genes
本試驗通過測序發(fā)現(xiàn),玉米ZmHY5、ZmHY5L基因CDS 序列分別為510、576 bp,分別編碼169、191個氨基酸,等電點分別為9.89、10.03,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量分別為18.7、20.2 ku。在NCBI 網(wǎng)站獲得玉米、谷子、高粱、南荻和擬南芥等HY5 蛋白序列并進行系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果(圖2)顯示,玉米ZmHY5 與高粱、南荻、谷子等禾本科植物的HY5親緣關(guān)系更近,與糜子、柳枝稷等禾本科植物的HY5 親緣關(guān)系較遠(yuǎn),ZmHY5L 與其他物種HY5 親緣關(guān)系比較遠(yuǎn),而ZmHY5L 和AtHYH 類似,都表現(xiàn)出特殊的進化方式。
圖2 玉米與其他植物HY5蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.2 Phylogenetic analysis of HY5 proteins in maize and other plants
對玉米、谷子、南荻、高粱和擬南芥HY5氨基酸序列進行比對,結(jié)果表明,ZmHY5與高粱、南荻和谷子HY5 序列一致性為73.15%、71.76%和70.83%,ZmHY5L 與高粱、南荻和谷子HY5 序列一致性為43.98%、43.06%和43.98%。通過Pfam 網(wǎng)站發(fā)現(xiàn),玉米、谷子、南荻、高粱和擬南芥HY5都包含bZIP結(jié)構(gòu)域,在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)上是保守的(圖3)。表明植物HY5 蛋白具有相似的序列和相同的結(jié)構(gòu)域,意味著HY5蛋白在不同植物中可能擁有類似的功能。
圖3 玉米與其他植物HY5蛋白的氨基酸序列比對和結(jié)構(gòu)域分析Fig.3 Sequence alignment of amino acids and analysis of function domains of HY5 proteins in maize and other plants
為探究ZmHY5和ZmHY5L基因在玉米生長發(fā)育中所起的作用,對ZmHY5和ZmHY5L基因在玉米的根、莖、葉、葉枕、葉鞘、花絲、雄花、苞葉和幼穗中的表達水平進行定量分析。結(jié)果(圖4)表明,ZmHY5和ZmHY5L基因在苞葉中的表達量最低,在幼穗、根中的表達量較低;在葉片中的表達量最高,在葉枕中的表達量較高。其中,ZmHY5基因在莖、葉鞘、花絲中的表達量相近,分別為參照(根ZmHY5基因表達量)的10.24、8.37、11.67 倍,在雄花中的表達量為參照的3.87倍。同樣的,ZmHY5L基因在莖、葉鞘中的表達量也相近,分別為參照的1.79、1.24倍,在雄花、花絲的表達量分別為參照的0.20、0.70 倍。另外,ZmHY5基因表達量明顯高于ZmHY5L基因。綜上,ZmHY5和ZmHY5L基因都在玉米葉片和葉枕中表達量較高,且ZmHY5基因表達量明顯高于ZmHY5L基因,推測ZmHY5基因可能參與玉米的光合作用過程。
圖4 ZmHY5和ZmHY5L基因在玉米不同組織中的表達量分析Fig.4 Relative expression levels of ZmHY5 and ZmHY5L genes in different tissues of maize
2.4.1ZmHY5和ZmHY5L基因?qū)Σ煌掷m(xù)光質(zhì)處理的響應(yīng) 為了研究ZmHY5和ZmHY5L基因?qū)Σ煌掷m(xù)光質(zhì)的響應(yīng),分析ZmHY5和ZmHY5L基因在持續(xù)黑暗、白光、藍光、遠(yuǎn)紅光和紅光條件下的表達水平。結(jié)果(圖5)表明,ZmHY5和ZmHY5L基因在黑暗中的表達量較低,故以ZmHY5基因在黑暗中的表達量為參照。ZmHY5基因在持續(xù)藍光下的表達量最高,其次為遠(yuǎn)紅光下的表達量,分別為參照的19.75 倍和4.64 倍;在紅光和白光下的表達量為參照的1.62 倍和2.08 倍。在黑暗條件下,ZmHY5L基因的表達量為參照的1.01 倍,其在藍光、遠(yuǎn)紅光、紅光及白光下的表達量分別為參照的11%、30%、4.4%、3.8%,均低于相同條件下ZmHY5基因的表達量。綜上,ZmHY5基因?qū)Σ煌掷m(xù)光質(zhì)處理均有很強的響應(yīng),這與擬南芥HY5基因[8]在持續(xù)黑暗和藍光條件下的表達量相似,但ZmHY5L基因在持續(xù)光質(zhì)下表達量均較低。ZmHY5和ZmHY5L基因在不同持續(xù)光質(zhì)下均有響應(yīng),推測ZmHY5和ZmHY5L基因可能參與玉米的光形態(tài)建成。
圖5 ZmHY5和ZmHY5L基因在不同持續(xù)光質(zhì)下的表達量Fig.5 Relative expression levels of ZmHY5 and ZmHY5L genes under different continuous light condition
2.4.2ZmHY5和ZmHY5L基因?qū)诎缔D(zhuǎn)到不同光質(zhì)的響應(yīng) 由圖6 可知,以黑暗條件下ZmHY5基因的表達量為參照,在黑暗條件下,ZmHY5L基因的表達量為參照的0.99倍。
圖6 ZmHY5和ZmHY5L基因在黑暗轉(zhuǎn)換到不同光質(zhì)下的表達量分析Fig.6 Relative expression levels of ZmHY5 and ZmHY5L genes during darkness to different light conditions
由圖6A 可知,在黑暗轉(zhuǎn)到遠(yuǎn)紅光0.5 h 時,ZmHY5基因的表達量達到首個峰值,是參照的2.6倍;隨后在1~8 h 表達量持續(xù)下降,在8 h 時表達量最低,僅為參照的0.87 倍;在12 h 時表達量達到最大值,為參照的5.36 倍;在24 h 時降到參照的0.96倍。ZmHY5L基因在4 h表達量達到最大值,為參照的2.94倍,晚于ZmHY5基因表達量達到首個峰值的時間;在8 h 時降至參照的0.71 倍,隨后持續(xù)上升;在12 h時表達量達到第2個峰值,為參照的1.54倍;之后持續(xù)下降,24 h 時表達量僅為參照的0.82 倍。表明由黑暗轉(zhuǎn)到遠(yuǎn)紅光后,ZmHY5基因響應(yīng)較強烈。
由圖6B 可知,從黑暗轉(zhuǎn)向紅光后,ZmHY5基因表達量持續(xù)上升,在1 h 時達到最大值,為參照的7.03 倍;隨后持續(xù)下降,在4 h 時表達量僅為參照的0.96 倍;在4~12 h 表達量逐漸上升,在12 h 時達到第2個峰值,為參照的3.62倍;在24 h時降至參照的1.69 倍。ZmHY5L基因在0.25 h 時達到第1 個峰值,為參照的2.30 倍,在0.5 h 時降至參照的1.76 倍;隨后在1 h 時升至最大值,為參照的3.82 倍;之后逐漸下降,在4 h 時僅為參照的0.25 倍;在4~24 h 時逐步上升,在24 h 時表達量為參照的1.12 倍。表明由黑暗轉(zhuǎn)到紅光后,ZmHY5L基因響應(yīng)更迅速,但ZmHY5基因響應(yīng)更強烈。
由圖6C 可知,在黑暗轉(zhuǎn)向藍光后,ZmHY5基因表達量在0.5 h時達到最高值,為參照的27.92倍;在1 h 時有所回調(diào),為參照的17.08 倍;隨后在2 h 時達到第2個峰值,上升至參照的23.01倍;在2~24 h時,表達量緩慢下降,在24 h 時僅為參照的0.14 倍。ZmHY5L基因在0.25 h 時表達量達到最大值,為參照的5.17 倍;在0.5~8 h 逐步下降至參照的0.32 倍,在8~12 h 表達量緩慢上升到第2 個峰值,為參照水平的0.87 倍;在24 h 時降至參照的0.78 倍,但為同時期ZmHY5基因的5.57倍。
由圖6D 可知,從黑暗轉(zhuǎn)到白光后,ZmHY5基因表達量在2 h 時達到最大值,為參照的41.21 倍;隨后急劇下降,在8 h 時僅為參照的1.70 倍;在12 h 時達到第2個峰值,回調(diào)至參照水平的9.36倍;之后緩慢下降,在24 h 時為參照的3.06 倍。ZmHY5L基因在1 h 時達到最大值,為參照的5.96 倍;在1~8 h 時逐步下降至參照的0.25 倍;在8~24 h 緩慢上調(diào),在24 h時達到第2個峰值,為參照的3.59倍。
通過不同光質(zhì)轉(zhuǎn)換比較分析發(fā)現(xiàn),玉米HY5 基因?qū)λ{光和白光響應(yīng)比較強烈,ZmHY5基因比ZmHY5L基因響應(yīng)程度更強烈。
2.4.3ZmHY5和ZmHY5L基因?qū)庵芷诘捻憫?yīng)
為研究ZmHY5和ZmHY5L基因?qū)庵芷诘捻憫?yīng)能力,分析了ZmHY5和ZmHY5L基因在長、短日照下的表達量,以ZmHY5基因在黑暗轉(zhuǎn)光照的臨界期的表達量為參照。
由圖7A 可知,在長日照條件下,ZmHY5基因在由黑暗轉(zhuǎn)到光照時,達到最大表達量;轉(zhuǎn)到光照后6 h 時,表達量急劇下降,為參照的0.08 倍;隨后2 h內(nèi)其表達量小幅度回調(diào);在8~14 h 時表達量為平緩狀態(tài);由光照轉(zhuǎn)入黑暗2 h 后,表達量大幅度下調(diào),為參照的0.3%;在18~20 h時,表達量逐步升高至參照的0.14 倍;在20~22 h 時,表達量小幅度回調(diào);在22~24 h 時,ZmHY5基因表達量逐步上升達到最大值。ZmHY5L基因和ZmHY5基因一樣,在由黑暗轉(zhuǎn)到光照時,達到最大表達量,在0~6 h 逐漸下降,在6~8 h 有所回調(diào),8~18 h 表達量持續(xù)下降到最低水平,在18~24 h 表達量逐步上調(diào)到參照水平。表明在長日照條件下,ZmHY5基因?qū)庵芷诘捻憫?yīng)明顯強于ZmHY5L基因。
圖7 光周期處理下ZmHY5和ZmHY5L基因的表達量Fig.7 Relative expression levels of ZmHY5 and ZmHY5L genes under photoperiodic treatment
由圖7B 可知,在短日照條件下,ZmHY5和ZmHY5L基因的表達模式相似。ZmHY5基因在進入光照階段后,0~8 h 表達量持續(xù)下降;在進入黑暗時,8~18 h 表達量緩慢上漲;在18~20 h 時表達量下調(diào);在22 h 時,表達量達到最大值,為20 h 時表達量的12.23 倍。ZmHY5L基因在轉(zhuǎn)入光照2 h 時,表達量下調(diào)至參照的33%;在2~6 h 時表達量緩慢上升至參照的0.53 倍;在6~8 h,表達量快速下降至6 h時的16%;8~20 h,ZmHY5L基因的表達量基本處于平穩(wěn)狀態(tài);但在22 h 時的表達量是20 h 時的10.45倍,達到最大值。短日照條件下,ZmHY5和ZmHY5L基因均在黑暗即將轉(zhuǎn)光照時表達量有大幅度調(diào)整,但ZmHY5基因更加活躍,說明ZmHY5基因在短日照條件下發(fā)揮重要作用。
擬南芥HY5是bZIP類型的轉(zhuǎn)錄因子,是組成型核定位蛋白[34]。而玉米HY5 也定位于核內(nèi),包含bZIP保守結(jié)構(gòu)域,與擬南芥HY5的氨基酸序列具有相似性[31]。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,玉米與高粱、南荻、谷子等禾本科植物的親緣關(guān)系較近,說明HY5基因在進化上是保守的,其編碼蛋白質(zhì)序列和保守結(jié)構(gòu)域與擬南芥高度一致,意味著它們可能擁有類似的功能。研究表明,擬南芥hy5突變體在不同的光照條件下顯示出比野生型擬南芥更長的下胚軸,將ZmHY5基因轉(zhuǎn)入擬南芥hy5突變體中,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因株系在各種光質(zhì)下均與野生型幼苗無明顯差異,說明過表達ZmHY5基因可以恢復(fù)擬南芥hy5突變體的表型[31],推測兩者可能具有相似功能。據(jù)報道,藍光增強了高粱CRY1a和COP1的互作,抑制了COP1對HY5的降解,從而促使HY5蛋白穩(wěn)定和高粱的光形態(tài)建成[35]。
與擬南芥AtHY5基因和粳稻(Oryza sativa)日本晴OsbZIP18(Basic leucine zipper 18)基因相比,玉米ZmHY5基因組織特異性表達更明顯。粳稻日本晴OsbZIP18基因在不同組織中均有表達,除在開花期的葉片中表達量較高外,在其他器官中的表達量均較低,擬南芥AtHY5基因在幼苗期的子葉、下胚軸、根中表達量差異也不大[34,36]。此外,大豆中HY5同源基因有4 個,分別命名為STF1(Soybean TGACG-motif binding factor 1)—STF4。其中,STF3和STF4基因在葉中表達量明顯高于根,與玉米ZmHY5基因相似,并且STF3和STF4基因在葉中受光誘導(dǎo)表達后會轉(zhuǎn)移至根中調(diào)節(jié)根瘤菌的形成,進而發(fā)揮功能[37]。ZmHY5和ZmHY5L基因在葉中表達量最高,其次是葉枕,在根、幼穗、苞葉中表達量較低。除了根外,在玉米不同組織中,ZmHY5L基因表達量絕大部分都低于ZmHY5基因,推測ZmHY5基因發(fā)揮的作用更強。ZmHY5基因與STF3、STF4基因在葉中的表達量均明顯高于根,ZmHY5是否在葉中合成轉(zhuǎn)移至根中發(fā)揮功能有待探究。
前人研究結(jié)果表明,玉米ZmHY5基因在持續(xù)白光條件下表達量高于黑暗條件,且從黑暗條件轉(zhuǎn)至白光條件下6 h 時表達量顯著上升,ZmHY5基因的表達受到白光的誘導(dǎo)[31],與本研究結(jié)果相符。本研究也進一步細(xì)致研究了從黑暗轉(zhuǎn)到白光時,ZmHY5基因表達量首次達到峰值是在2 h 左右,隨后下降至相對平穩(wěn)狀態(tài),說明ZmHY5基因?qū)诎缔D(zhuǎn)到白光的反應(yīng)靈敏。另外,本研究深入探究了ZmHY5基因在不同光質(zhì)條件下的表達模式,無論在持續(xù)光條件下還是在轉(zhuǎn)換光條件下,ZmHY5基因在藍光下的表達量都明顯高于遠(yuǎn)紅光和紅光,推斷藍光對ZmHY5基因的誘導(dǎo)表達具有主要作用。ZmHY5和ZmHY5L基因在長短日照條件下的表達量有差異,ZmHY5L基因在長日照的黑暗過程中響應(yīng)能力更強,而ZmHY5基因在短日照的黑暗過程中響應(yīng)能力更強,ZmHY5和ZmHY5L基因在長日照和短日照條件下的響應(yīng)程度不同。這意味著ZmHY5和ZmHY5L基因可能存在功能差異,但它們對長日照和短日照均有響應(yīng),可能對玉米的開花期有所影響,還需要進一步探究。
在擬南芥中,HY5 與TZP(Tandem zinc-finger/plus 3)啟動子的G-box 連結(jié),TZP基因的表達在遠(yuǎn)紅光下被激發(fā),然后與HY5 競爭結(jié)合COP1,使HY5蛋白更穩(wěn)定,進而促進植物光形態(tài)建成[38]。藍光激活的CRY1 與AGB1(Arabidopsisgβ1)競爭HY5 的結(jié)合,從而導(dǎo)致HY5在促進光形態(tài)發(fā)生方面的生化活性增強[39]。在藍光條件下,CRY1 能通過與SWC6(Swi2/snf2-related 1 chromatin remodeling complex 6)和ARP6(Actin-related protein 6)的相互作用,促進H2A.Z 在HY5 靶基因(促進下胚軸伸長)上的染色質(zhì)上的沉積,抑制靶基因的表達,從而促進光形態(tài)建成過程[40]。本研究中ZmHY5和ZmHY5L基因均能響應(yīng)遠(yuǎn)紅光和藍光處理,推測ZmHY5可能參與玉米的光形態(tài)建成,但ZmHY5如何起作用,是否有其他相關(guān)因子參與到此過程中還有待研究。
在玉米育種過程中,遇到極端天氣時,玉米極容易倒伏折斷,一旦倒伏勢必會影響育種進程及產(chǎn)量。玉米倒伏受到多方面影響,與種植密度具有極大關(guān)系,玉米高密度種植時,株高增加,莖稈纖細(xì),根系不發(fā)達,進而易倒伏。擬南芥HY5降低質(zhì)膜中生長素轉(zhuǎn)運蛋白PIN3(Pin-formed 3)和LAX3(Like-auxin 3)的豐度,以抑制避蔭條件下根系的橫向生長[41]。HY5 在紅光和藍光條件下穩(wěn)定存在,并轉(zhuǎn)移至根部激活miR163 以促進初級根系生長[42-43]。如果玉米的根系長得完整且龐大,面對極端天氣時就不易倒伏,進而提高玉米產(chǎn)量。本試驗中ZmHY5和ZmHY5L基因可以對各種光處理有所響應(yīng),可能對玉米光形態(tài)建成有影響,從而對玉米的根系進行調(diào)控。因此,ZmHY5和ZmHY5L基因的功能研究可能對具有發(fā)達根系的玉米品種繁育具有重要作用。
玉米HY5與南荻、高粱、谷子、擬南芥HY5具有相似的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),均包含bZIP 結(jié)構(gòu)域。ZmHY5和ZmHY5L基因在根中的表達量顯著低于葉片,均能強烈響應(yīng)遠(yuǎn)紅光、紅光、藍光和白光處理,且ZmHY5基因的響應(yīng)水平高于ZmHY5L基因,在黑暗轉(zhuǎn)白光時的響應(yīng)更明顯。在長短日照處理中,ZmHY5L基因在長日照條件下的黑暗階段響應(yīng)能力更強,而ZmHY5基因在短日照條件下的黑暗階段響應(yīng)能力更強。暗示ZmHY5和ZmHY5L基因參與玉米光形態(tài)建成及花期調(diào)控,但存在功能冗余和差異。這些結(jié)果為ZmHY5和ZmHY5L基因在玉米品種改良中的應(yīng)用提供了依據(jù)。