劉景珍 李彥華 葛一蓉 薛紅娟 劉文春
急性髓系白血?。╝cute myeloid leukemia,AML),類似于大多數(shù)其他人類惡性腫瘤,是一種高度異質(zhì)性疾病[1]。約40%的年輕AML 患者和10%的老年AML患者可以通過目前的標準化療治愈[2]。盡管近年來AML 治療取得了一些進展,但由于耐藥性的快速發(fā)展和治療后的高復發(fā)率,AML 患者的長期生存仍很差[3]。因此,尋找針對AML 的特異性、新穎的治療靶點越來越迫切,這可能會改善AML 的臨床療效。一些報道認為長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是AML 進展中的新調(diào)節(jié)因子。lncRNA 由RNA 聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄,其5'端可被帽封,3'端可聚腺苷化[4]。lncRNA 的失調(diào)參與了癌癥的發(fā)生和進展[5-6]。lncRNA 通過多種機制調(diào)控癌細胞中與增殖、生存、遷移、轉(zhuǎn)移或多能性相關(guān)的下游基因的表達[7]。諸多臨床試驗[8-9]表明,lncRNA 作為新型腫瘤相關(guān)生物標志物在早期腫瘤篩查和預測腫瘤患者臨床結(jié)果方面具有重要的潛力。然而,lncRNA 在AML 中的表達和功能研究還很有限。LINC01234 是近年來新發(fā)現(xiàn)的與腫瘤進展相關(guān)的lncRNA,位于染色體12q24.13 上。部分研究表明,LINC01234 在乳腺癌[10]、肝癌[11]、結(jié)直腸癌[12]中上調(diào)表達,能夠促進疾病進展。上述研究表明,LINC01234 在人類疾病進展中作用重大。然而,LINC01234 在AML 中的表達及其與AML 細胞進展之間的相關(guān)性尚未明確。因此,本研究將揭示LINC0-1234 在AML 中的表達情況,并探討LINC01234 在AML 中的功能及潛在機制。
分析2019 年3 月至2021 年9 月在湖北省恩施州中心醫(yī)院確診的31 例AML 患者和在本院體檢的24 例健康志愿者的外周血標本。31 例AML 患者中男性20 例,女性11 例,平均年齡(49.34±12.29)個月。根據(jù)FAB 分型,31 例AML 患者中M1 型8 例,M2型11 例,M4 型8 例,M5 型4 例。24 例健康志愿者中男性14 例,女性10 例,平均年齡(36.59±5.42)個月。采集的外周血標本用標準Ficoll-Hypaque 密度離心法分離外周血單個核細胞(PBMCs)。所有受試者均已成年且均簽署知情同意書,相關(guān)研究經(jīng)本醫(yī)院人類倫理委員會批準,并根據(jù)《赫爾辛基宣言》進行。
HS-5(人骨髓基質(zhì)細胞)及AML 細胞株(MV-4-11、NB4、KG-1、THP-1、HL-60)購自浙江美森細胞科技有限公司。細胞在RPMI1640 培養(yǎng)基(10%胎牛血清)中,37℃和5%CO2培養(yǎng)。
1.2.1 試劑和儀器 shRNA 陰性對照(sh-control)、LINC01234 shRNA(sh-LINC01234)、LINC01234 過表達質(zhì)粒(LINC01234)和其對照組、胰島素樣生長因子2 mRNA 結(jié)合蛋白1(insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1,IGF2BP1)shRNA(sh-IGF2BP1)、IGF2BP1/c-Myc 過表達質(zhì)粒(pcDNA-IGF2BP1/pcDNA-c-Myc)和其對照(pcDNA-control)由上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司合成。兔抗IGF2BP1、兔抗c-Myc、兔抗GAPDH、山羊抗兔IgG(HRP)購自美國Abcam 公司。Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑購自中國賽默飛公司,TRIzol 試劑購自北京雷根生物公司,反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自大連寶生物公司,SYBR Green qPCR 試劑盒購自北京畢特博生物公司,CCK-8 試劑盒購自上海吉滿生物科技公司,EZ-Magna RIP 試劑盒購自上海玉博生物公司,RIPA 緩沖液購自北京百奧萊博公司,SuperSignal West Femto 試劑盒購自賽默飛世爾科技公司。ABI StepOnePlus 實時定量PCR 系統(tǒng)購自Applied Biosystems 公司,顯微鏡購自上海通灝光電科技有限公司。
1.2.2 細胞轉(zhuǎn)染和分組 為研究LINC01234 對AML細胞增殖、遷移、侵襲的影響,本研究使用Lipofectamine3000轉(zhuǎn)染試劑對HL-60 細胞進行轉(zhuǎn)染,并分為空白對照組(BC 組,正常培養(yǎng))、sh-control 組(轉(zhuǎn)染shRNA 陰性對照)、sh-LINC01234 組(轉(zhuǎn)染LINC-01234 shRNA);為探究LINC01234 調(diào)控AML 細胞增殖、遷移、侵襲的作用機制,本研究在sh-LINC-01234 組的基礎上,分別轉(zhuǎn)染c-Myc 過表達質(zhì)?;蜿幮詫φ眨⒂洖閟h-LINC01234+pcDNA-control 組、sh-LINC01234+pcDNA-c-Myc 組。
1.2.3 實時定量PCR(real-time quantitative PCR,qRTPCR)根據(jù)制造商的說明,用TRIzol 試劑從細胞或組織中提取總RNA。應用反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA。然后根據(jù)試劑盒協(xié)議使用SYBR Green qPCR 試劑盒對cDNA 進行qPCR 檢測?;陂撝笛h(huán)(Ct)定義lncRNA、基因的表達水平,并采用2-ΔΔCt法計算。以GAPDH 作為lncRNA、基因的參考。引物序列如下:LINC01234:F 5'-TCACCTCCTCGGTCTCAGTT-3',R 5'-GGGTGAGAAGAGACAAGCGT-3';IGF2BP1:F 5'-GGTTAGGCCTCTCCTCCTAATA-3',R 5'-CCTT CCCAGCACACTTGATAG-3';c-Myc:F 5'-AAGCTG AGGCACACAAAGA-3',R 5'-GCTTGGACAGGTTA GGAGTAAA-3';GLI1:F 5'-AGCTAGAGTCCAGAG GTTCAA-3',R 5'-TAGACAGAGGTTGGGAGGTAA G-3';Slug:F 5'-AACTACAGCGAACTGGACAC-3',R 5'-GAGGATCTCTGGTTGTGGTATG-3';HULC:F 5'-GGAACTCTGATCGTGGACATT-3',R 5'-ATTCCG GCCTTTACTTCAGAG-3';GAPDH:F 5'-GGTGTGA ACCATGAGAAGTATGA-3',R 5'-GAGTCCTTCCA CGATACCAAAG-3'。
1.2.4 細胞增殖檢測 采用CCK-8 試劑盒檢測細胞增殖情況。HL-60 細胞置于96 孔板中(每孔1 000 個細胞)。在指定時間點(培養(yǎng)24、48、72、96 h)加入CCK-8 試劑(15 μL/孔)。在5%CO2中37℃孵育2.5 h后,在酶標儀上450 nm 處測量吸光度(OD)。
1.2.5 Transwell 侵襲和遷移實驗 將250 μL 培養(yǎng)基中的經(jīng)過處理的HL-60 細胞置于預先涂上Matrigel 的上腔中(1×105個細胞/孔)。對于transwell 遷移檢測,上腔室不需要預先涂上Matrigel。下室添加含15%胎牛血清的培養(yǎng)基。培養(yǎng)24 h 后,移出培養(yǎng)基,用70%乙醇和0.1%結(jié)晶紫處理細胞。PBS 洗滌2次后,用顯微鏡拍攝侵襲或遷移細胞的圖像。
1.2.6 RNA 免疫沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)反應 根據(jù)制造商的說明,使用EZ-Magna RIP試劑盒與IGF2BP1 抗體或免疫球蛋白G(IgG)進行RIP,IgG 作為對照。
1.2.7 RNA pull-down 實驗 將LINC01234 或反義LINC01234(antisense LINC01234)cDNA 克隆到pBluescriptⅡ載體中。生物素標記RNA 在體外轉(zhuǎn)錄和純化。將細胞提取液與生物素化RNA 混合,再與預洗的鏈霉親和素-瓊脂糖小珠混合1 h。小珠短時間洗滌5 次,在十二烷基硫酸鈉緩沖液中煮沸,提取的蛋白通過Western blot 或質(zhì)譜分析進行檢測。antisense LINC01234 為陰性對照。
1.2.8 放線菌素D 處理檢測 c-Myc RNA 的穩(wěn)定性采用放線菌素D 檢測。將2 mg/mL 放線菌素D 添加到經(jīng)1.2.2 處理后的HL-60 細胞中,分別培養(yǎng)0、4、8、12、16 h。
1.2.9 Western blot 分析 細胞在RIPA 緩沖液中裂解獲得全蛋白。然后定量測定整個蛋白質(zhì),在十二烷基硫酸鈉緩沖液中煮沸。利用SDS-PAGE 凝膠分離蛋白,然后將分離的蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF 膜上。用一抗在4℃孵育膜過夜,用含Tween 20 的磷酸鹽緩沖鹽水沖洗膜后,用相應的二抗在室溫下孵育膜2 h。最后,采用SuperSignal West Femto 試劑盒將膜蛋白帶可視化。一抗、二抗分別為:兔抗IGF2BP1、兔抗c-Myc、兔抗GAPDH、山羊抗兔IgG(HRP)。GAPDH作為內(nèi)源性對照。
采用GraphPad Prism6.0 軟件進行統(tǒng)計學分析。數(shù)據(jù)以±s表示。統(tǒng)計方法主要包括雙尾t檢驗和方差分析(ANOVA)。Tukey 的事后檢驗被用于檢驗組間數(shù)據(jù)的差異。以P<0.05 為差異具有統(tǒng)計學意義。
如圖1A 顯示,與健康志愿者PBMC 樣本相比,AML 患者PBMC 樣本中LINC01234 水平明顯升高(P<0.05)。此外,圖1B 顯示,與HS-5 細胞相比,LINC-01234 在5 個AML 細胞中表達明顯上調(diào)(P<0.05)。選擇LINC01234 水平最高的HL-60 細胞進行后續(xù)實驗。
圖1 AML 標本及細胞系中LINC01234 表達
與BC 組和sh-control 組比較,sh-LINC01234 組LINC01234 的水平顯著降低,OD450(48、72、96 h)值顯著降低,侵襲和遷移數(shù)目明減少(P<0.05),見圖2。
圖2 沉默LINC01234 對AML 細胞的增殖和遷移的影響
Starbase 數(shù)據(jù)庫顯示IGF2BP1 可能與LINC01-234 相互作用。RNA pull-down 實驗證實了LINC012-34 和IGF2BP1 之間的相互作用(圖3A)。RIP 實驗結(jié)果顯示IGF2BP1 和LINC01234 之間存在顯著的相關(guān)性(圖3B)。然而,在HL-60 細胞中,sh-IGF2BP1組IGF2BP1 mRNA 和蛋白水平顯著降低(P<0.05),LINC01234 的水平基本不變(P>0.05),見圖3C。圖3D顯示,過表達或下調(diào)LINC01234 不影響IGF2BP1 蛋白的表達(P>0.05)。
圖3 LINC01234 與IGF2BP1 相互作用
qRT-PCR 結(jié)果顯示,sh-LINC01234 組HL-60 細胞中c-Myc mRNA 水平顯著降低(P<0.05),GLI1、Slug、HULC mRNA 的表達無顯著性差異(P>0.05),見圖4A。圖4B 顯示,放線菌素D 處理后sh-LINC 01234 組c-Myc mRNA 的半衰期顯著縮短(P<0.05)。使用IGF2BP1 抗體進行RIP 實驗,結(jié)果顯示,LINC01-234 組IGF2BP1 與c-Myc mRNA 的相互作用升高,sh-LINC01234 組IGF2BP1 與c-Myc mRNA 的相互作用降低(P<0.05),見圖4C。與sh-LINC01234 組和sh-LINC01234+pcDNA-control 組相比,sh-LINC012-34+pcDNA-IGF2BP1 組IGF2BP1、c-Myc 表達明顯升高,c-Myc mRNA 的穩(wěn)定性增強(P<0.05),見圖4D~F。
圖4 LINC01234 通過競爭性結(jié)合IGF2BP1 促進c-Myc mRNA 的穩(wěn)定性
與sh-LINC01234 組和sh-LINC01234+pcDNAcontrol 組比較,sh-LINC01234+pcDNA-c-Myc 組c-Myc 表達明顯升高,OD450(48、72、96 h)值顯著增高,侵襲和遷移數(shù)目明顯增多(P<0.05),見圖5。
圖5 LINC01234 通過調(diào)節(jié)c-Myc 的表達影響AML 增殖、侵襲和遷移
AML 是一種異質(zhì)性惡性腫瘤,干細胞研究和大量的基因組分析均取得了顯著進展,極大地促進AML 發(fā)病機制中潛在分子機制的研究[13-14]。然而,治療效果是有限的。因此,亟需發(fā)現(xiàn)新的抑制AML 細胞增殖轉(zhuǎn)移的靶點,以改善AML 患者的臨床預后。lncRNA 的異常表達已在多種類型的癌癥中被描述,其在AML 發(fā)病機制中的功能仍在不斷被闡明。本研究探索了LINC01234 在人類AML 細胞中的潛在作用,結(jié)果發(fā)現(xiàn)慢病毒介導的LINC01234 干擾可以有效抑制AML 細胞的增殖、侵襲和遷移,這依賴于競爭性結(jié)合IGF2BP1 降低c-Myc 的表達。因此,本研究在人類AML 發(fā)病機制中發(fā)現(xiàn)了一個LINC01234-IGF-2BP1-c-Myc 軸,其可能被用作AML 診斷和治療的生物標志物。
本研究發(fā)現(xiàn),LINC01234 在AML 患者和人AML細胞系中均有高表達,說明LINC01234 可能促進AML 發(fā)展。LINC01234 的表達也被一致地發(fā)現(xiàn)與乳腺癌的進展有關(guān)。在配對的臨床樣本中,乳腺癌組織中LINC01234 相對于相鄰正常組織表達上調(diào),其下調(diào)顯著抑制MDA-MB-231 和MDA-MB-468 細胞的增殖和遷移[15]。同樣,在本研究中,人類AML 細胞中的LINC01234 也具有促增殖功能,其沉默顯著抑制了HL-60 細胞的增殖和轉(zhuǎn)移能力。上述結(jié)果表明,LINC01234 在AML 致癌過程中起到啟動子的作用。此前,Liu 等[16]報道了LINC01234 在口腔鱗狀細胞癌中高表達。在其體外實驗中,LINC01234 被證明通過調(diào)節(jié)miR-433-3p/PAK4 顯著促進腫瘤細胞的增殖和轉(zhuǎn)移。其結(jié)果與本研究的發(fā)現(xiàn)相一致,提示LINC01-234 的功能在不同類型的腫瘤中是相似的。
IGF2BP1 與胚胎發(fā)生和癌變有關(guān)。IGF2BP1 作為一種轉(zhuǎn)錄后因子,調(diào)控癌細胞增殖、侵襲和耐藥所需的一些重要mRNA 靶標的表達,與各種類型的人類癌癥中較差的總生存率有關(guān)。IGF2BP1 是一種RNA結(jié)合蛋白,已報道與c-Myc、GLI1、Slug 和HULC RNA 相關(guān),并在癌細胞中獲得穩(wěn)定[17-20]。本研究通過Starbase 數(shù)據(jù)庫預測到LINC01234 可能與IGF2BP1存在互作。在這里,RNA pull-down 和RIP 分析證明了LINC01234 和IGF2BP1 之間的相互作用。然而,IGF2BP1 的表達不受LINC01234 的調(diào)控。近期,一些lncRNA 被報道與IGF2BP1 相關(guān)。LINC01093 特異性地直接結(jié)合IGF2BP1,干擾IGF2BP1 與GLI1 mRNA 的相互作用,誘導其在HCC 中降解[18]。在視網(wǎng)膜母細胞瘤中l(wèi)ncRNA THOR 通過增強IGF2BP1蛋白和c-Myc mRNA 的結(jié)合上調(diào)c-Myc 的表達[21]。因此,本研究檢測了LINC01234 是否影響IGF2BP1靶標的表達,發(fā)現(xiàn)僅有c-Myc 可以被LINC01234 正調(diào)控。c-Myc 的異常表達是大多數(shù)惡性腫瘤過度增殖的一個標志,也是哺乳動物細胞中引起程序性細胞死亡-凋亡的一種強有力的因子[22]。c-Myc 的表達在許多水平上受到調(diào)控,并在很大程度上受到轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制的控制。在轉(zhuǎn)錄后控制c-Myc 表達的因素中,癌胚RNA 結(jié)合蛋白IGF2BP1 保護CRD 序列不被切割,穩(wěn)定mRNA 并增加其表達[23-24]。此外,LINC-01234 促進了IGF2BP1 與c-Myc mRNA 的結(jié)合,促進了c-Myc mRNA 的穩(wěn)定性。本研究表明,LINC0-1234 與IGF2BP1 相關(guān),抑制了c-Myc mRNA 的衰減,從而促進了AML 的生長和轉(zhuǎn)移。與本研究一致的是,Chen 等[25]發(fā)現(xiàn)LINC01234 與c-Myc 表達顯著正相關(guān),在肺癌中LINC01234 通過與HNRNPA2B1 相互作用調(diào)控miR-106b-5p/CRY2 軸,進而增加c-Myc 的表達。
綜上所述,本研究首次發(fā)現(xiàn)LINC01234 在AML中高表達。LINC01234 通過與IGF2BP1 競爭性結(jié)合被發(fā)現(xiàn)是癌蛋白c-Myc 的促進因子,可能通過競爭性結(jié)合IGF2BP1 促進c-Myc mRNA 的穩(wěn)定性,提示LINC01234 在AML 治療方面可能是一種有效的治療方法。
本文無影響其科學性與可信度的利益沖突。