侯燕紅, 生小燕, 韓 博, 姜 華, 何承剛
(云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院, 云南 昆明 650201)
紫花苜蓿(MedicagosativaL.)是一種適口性好,蛋白質(zhì)含量高,營(yíng)養(yǎng)價(jià)值全面,利用年限長(zhǎng),分布極其廣泛的多年生優(yōu)質(zhì)豆科牧草。隨著全球氣候變暖并伴隨著降水量減少的形勢(shì)不斷加劇,高溫和干旱已經(jīng)成為制約紫花苜蓿生產(chǎn)的一個(gè)難題。在中國(guó)南方,紫花苜蓿生長(zhǎng)主要受高溫的限制,因此,突破高溫限制是實(shí)現(xiàn)其在該地區(qū)的開(kāi)發(fā)與利用的關(guān)鍵[1]。同時(shí),干旱也嚴(yán)重影響著苜蓿的產(chǎn)量和品質(zhì),研究表明干旱和高溫在自然環(huán)境中通常會(huì)伴隨出現(xiàn),兩者同時(shí)出現(xiàn)對(duì)植物生長(zhǎng)和產(chǎn)量的危害比單獨(dú)出現(xiàn)更大[2]。光合作用是植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中極其重要的生理過(guò)程[3],磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(Phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)是C4植物光合作用的重要關(guān)鍵酶之一,其功能是催化磷酸烯醇式丙酮酸(Phosphoenolpymvate,PEP)和碳酸氫根離子的反應(yīng),生成草酰乙酸(Oxaloacetate,OAA)和無(wú)機(jī)磷酸(Inorganic phosphate,Pi),這是C4植物和景天酸代謝植物同化與固定CO2的重要步驟,是植物光合作用必不可少的一步[4]。PEPC在高等植物、藻類(lèi)、細(xì)菌中廣泛存在[5],目前,PEPC基因相繼在擬南芥(Arabidopsisthaliana(L.) Heynh.)、大豆(Glycinemax(Linn.) Merr.)、水稻(OryzasativaL.)、玉米(ZeamaysL.)、甘蔗(Saccharumofficinarum)等植物中得到鑒定[6~9]。研究表明,PEPC參與了植物逆境脅迫的應(yīng)答[10],關(guān)于這方面的研究近年來(lái)也有很多。丁在松等[11]研究轉(zhuǎn)PEPC基因水稻在不同程度干旱脅迫下的光合特性,發(fā)現(xiàn)PEPC增強(qiáng)了干旱脅迫下水稻抵御強(qiáng)光脅迫的能力。Jeanneau等[12]研究發(fā)現(xiàn),玉米在適度干旱條件下,PEPC基因過(guò)表達(dá)能使其水分利用率和干物質(zhì)積累量增加。方立鋒等[13]研究轉(zhuǎn)PEPC基因水稻苗期抗旱性,發(fā)現(xiàn)其抗氧化能力和滲透調(diào)節(jié)能力均高于對(duì)照。趙晉峰等[14]從谷子基因中篩選出6個(gè)PEPC基因,得出SiPEPC基因廣泛參與了谷子苗期非生物逆境脅迫應(yīng)答。張慶琛等[15]研究了強(qiáng)光脅迫下玉米PEPC基因等對(duì)擬南芥光合特性的影響,發(fā)現(xiàn)強(qiáng)光處理下PEPC轉(zhuǎn)基因擬南芥的光合速率顯著高于正常處理,進(jìn)而獲得較高的生物量。另外也有研究表明,植物在面對(duì)干旱、冷害、強(qiáng)光、鹽和低磷等非生物逆境脅迫時(shí)[16-20],PEPC基因均能夠被強(qiáng)烈誘導(dǎo)并表達(dá),說(shuō)明植物在面對(duì)非生物逆境脅迫時(shí)PEPC在其中發(fā)揮著一定作用。
當(dāng)前,對(duì)于各種植物在逆境脅迫下的研究比較廣泛,有關(guān)于紫花苜蓿在干熱脅迫下Rubisco羧化酶和活化酶活性變化及其基因表達(dá)的研究[21],也有紫花苜蓿的耐鹽基因[22]、抗逆基因[23]等的研究,但是對(duì)于紫花苜蓿在干旱和高溫脅迫下PEPC基因的研究比較缺乏。因此,本研究以抗逆性均較強(qiáng)的‘阿爾岡金’紫花苜蓿和云南省德欽縣野生紫花苜蓿為材料,測(cè)定兩者在高溫脅迫和干旱脅迫下的PEPC酶活性,并擴(kuò)增了PEPC基因,對(duì)PEPC蛋白進(jìn)行了生物信息學(xué)分析和系統(tǒng)發(fā)育分析,為提高高溫和干旱條件下紫花苜蓿的生物產(chǎn)量提供理論依據(jù)。
供試的2個(gè)材料為采集于云南省迪慶州德欽縣奔子欄鄉(xiāng)干熱河谷區(qū)的野生紫花苜蓿和引自加拿大的‘阿爾岡金’紫花苜蓿,前者在云南干熱河谷地區(qū)干熱條件下能夠繁衍后代,能較好適應(yīng)類(lèi)似云南迪慶的生態(tài)條件,具有較強(qiáng)的抗旱性,后者抗逆性強(qiáng),適應(yīng)性廣。
試驗(yàn)采用盆栽方式,每盆種植20~30粒均勻飽滿的紫花苜蓿種子,放置于云南農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)科學(xué)實(shí)習(xí)基地溫室內(nèi),選取3~4片葉期的幼嫩葉片存放于-80℃冰箱中用于DNA的提取及PEPC基因的擴(kuò)增。每個(gè)品種隨機(jī)選取生長(zhǎng)150 d并且長(zhǎng)勢(shì)一致的6盆材料,每盆10株。其中3盆進(jìn)行干旱脅迫處理,將其置于室內(nèi)并在常溫(溫度23℃,濕度40%)下處理,開(kāi)始處理后不再澆水;另外3盆進(jìn)行干熱脅迫處理,將其放入人工氣候箱,空氣濕度設(shè)定為30%,白天溫度為32℃保持14 h,夜間溫度為28℃保持10 h。分別于脅迫處理前(對(duì)照)以及脅迫處理后第4 h,8 h,12 h,16 h,24 h,4 d,8 d,12 d以及復(fù)水(恢復(fù)為處理前的濕度和溫度,并澆水至花盆底部有水溢出為止)后2 d(在圖表中用r表示),取相同部位葉片經(jīng)液氮處理后置于-80℃冰箱中,用于PEPC酶活性的測(cè)定(試驗(yàn)做了3個(gè)技術(shù)重復(fù),3個(gè)生物學(xué)重復(fù))。
1.3.1PEPC酶活性測(cè)定 酶液提取和活性測(cè)定參照BERVEILLER等的方法[22]。(1)提取液制備:0.01%(v/v)Triton X-100;1 mmol·L-1EDTA;50 mmol·L-1Tris-HCl,pH 7.8;10 mmol·L-1MgCl2;10 mmol·L-1dtt;(2)酶液提?。涸陬A(yù)冷研缽中放入稱(chēng)好的0.25 g新鮮葉片后加入液氮迅速研磨,隨后加4 ml預(yù)冷提取液,在冰浴中研磨至勻漿,4℃、15 000 g離心15 min,取上清液保存于-20℃條件下備用;(3)酶活性測(cè)定:反應(yīng)體系為1 mL 100 mmol·L-1Tris-HCl緩沖液(pH7.4),0.1 mL酶提取液,1 mL 10 mmol·L-1MgCl2,1 mL 10 mmol·L-1NaHCO3,0.2 mL 40 mmol·L-1PEP,0.3 mL 1 mg·mol·mL-1NADH(pH 8.9),0.3 mL 12 U·mL-1蘋(píng)果酸脫氫酶。反應(yīng)液混勻,28℃水浴10 min,用200 μL PEPC提取液?jiǎn)?dòng)反應(yīng),測(cè)定波長(zhǎng)在340 nm處的吸光度。酶活性計(jì)算公式如下:
其中ΔA為反應(yīng)前后的差值,V為反應(yīng)體系總體積,d(cm)為比色光程,6.22為每微摩爾NADH在340 nm處的吸光度,2表示每固定1 mol CO2有2 mol NADH被氧化,Δt為測(cè)定時(shí)間,V酶為酶液體積。計(jì)算結(jié)果單位為μmol·g-1·min-1。
1.3.2DNA提取 取葉期的紫花苜蓿3~4幼嫩葉,采用上海生工生物工程股份有限公司的Ezup柱式植物基因組DNA抽提試劑盒提取紫花苜蓿的DNA。
1.3.3PCR擴(kuò)增 在National Center for Biotechnology Information(NCBI)上搜索已知紫花苜蓿的PEPC基因序列,利用網(wǎng)站(sg.idtdna.com)進(jìn)行引物設(shè)計(jì):F(GACCTACCCATCTTGCTATCTTG),R(CTCCAAAGCCCAACCATACT),引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。PCR反應(yīng)總體積為25 μL,包括上下游引物各1 μL,Taq PCR Mix預(yù)混液12.5 μL,模板DNA0.5 μL,ddH2O 10 μL。擴(kuò)增程序?yàn)?5℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,56℃復(fù)性30 s,72℃延伸90 s,33個(gè)循環(huán),72℃延伸7 min。
1.3.4產(chǎn)物回收及測(cè)序 將經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)合格后的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行回收純化并測(cè)序。
數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和折線圖采用Excel 2010軟件進(jìn)行。采用單因素方差分析法對(duì)同一材料不同條件下的差異顯著性(P<0.05)進(jìn)行分析,對(duì)不同材料同一處理?xiàng)l件之間顯著性差異(P<0.05和P<0.01)作獨(dú)立樣本T檢驗(yàn),單因素方差分析和獨(dú)立樣本T檢驗(yàn)均采用SPSS 23.0軟件進(jìn)行。采用DNAMAN 8.0軟件將本試驗(yàn)的紫花苜蓿PEPC基因核酸序列翻譯成蛋白質(zhì)并作多序列比對(duì),利用Protparam軟件分析并預(yù)測(cè)紫花苜蓿PEPC蛋白的理化性質(zhì)。在NCBI網(wǎng)站上將測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)后,用DNAMAN 8.0軟件對(duì)本研究的兩個(gè)材料以及NCBI網(wǎng)站上下載的鷹嘴豆(Cicerarietinum,XM_004488973.2)、紫花苜蓿(Medicagosativa,M83086.1)、蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula,XM_003596337.4)和菜豆(Phaseolusvulgaris,XM_007133140.1)6個(gè)PEPC蛋白序列間同源關(guān)系進(jìn)行比較,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
兩種紫花苜蓿PEPC酶活性變化隨脅迫時(shí)間的延長(zhǎng)都呈現(xiàn)出先上升后下降、再上升再下降、復(fù)水后上升的趨勢(shì)(圖1),在脅迫第12 h達(dá)到峰值,且顯著高于其他處理(P<0.05),此時(shí)野生紫花苜蓿的PEPC酶活性是脅迫前的14.3倍,‘阿爾岡金’紫花苜蓿是脅迫前的9.2倍;兩種紫花苜蓿PEPC酶活性在復(fù)水后均顯著高于脅迫結(jié)束時(shí)(P<0.05)。野生紫花苜蓿PEPC酶活性在脅迫第16 h、4 d和復(fù)水后極顯著高于相同條件下的‘阿爾岡金’紫花苜蓿(P<0.01),在脅迫第12 h和24 h顯著高于‘阿爾岡金’紫花苜蓿(P<0.05),其他條件下兩種紫花苜蓿PEPC酶活性之間均無(wú)顯著差異。
圖1 高溫脅迫下紫花苜蓿PEPC酶活性變化Fig.1 Changes of PEPC activity in Alfalfa under high temperature stress注:大寫(xiě)字母表示野生紫花苜蓿各項(xiàng)處理間的差異顯著性(P<0.05),小寫(xiě)字母表示‘阿爾岡金’紫花苜蓿各項(xiàng)處理間的差異顯著性(P<0.05);*和**分別表示在相同條件下不同材料之間在0.05和0.01水平存在顯著性差異,下同Note:Lowercase letters indicated the significant difference between the treatments of Medicago stativa ‘Algonquin’ and wild alfalfa (P<0.05),uppercase letters indicated the significant difference between the treatments of Medicago stativa ‘Algonquin’ alfalfa(P<0.05). * and ** indicate significant differences between tested materials under same treatment time at the 0.05 and 0.01 level,respectively,the same as below
野生紫花苜蓿PEPC酶活性變化隨脅迫時(shí)間的延長(zhǎng)呈現(xiàn)先上升、后下降、復(fù)水后上升的趨勢(shì),而‘阿爾岡金’紫花苜蓿呈現(xiàn)先上升后下降、再上升再下降、復(fù)水后上升的趨勢(shì)(圖2);兩種紫花苜蓿均在在脅迫第12 h達(dá)到峰值,且顯著高于其他處理(P<0.05),此時(shí)野生紫花苜蓿的PEPC酶活性是脅迫前的14.8倍,‘阿爾岡金’紫花苜蓿是脅迫前的12.7倍;兩種紫花苜蓿PEPC酶活性在復(fù)水后均顯著高于脅迫結(jié)束時(shí)(P<0.05)。野生紫花苜蓿PEPC酶活性在脅迫第16 h,8 d,12 d和復(fù)水后極顯著高于相同條件下的‘阿爾岡金’紫花苜蓿(P<0.01),在脅迫第8 h和12 h顯著高于‘阿爾岡金’紫花苜蓿(P<0.05),其他條件下兩種紫花苜蓿PEPC酶活性之間均無(wú)顯著差異。
圖2 干旱脅迫下紫花苜蓿PEPC酶活性變化Fig.2 Changes of PEPC activity in Alfalfa under drought stress
兩種紫花苜蓿PEPC基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)(圖3)均得到一條清晰明亮的條帶。野生紫花苜蓿和‘阿爾岡金’紫花苜蓿擴(kuò)增序列長(zhǎng)度分別為739 bp和750 bp,且兩份材料的序列均與Genbank中紫花苜蓿PEPC基因序列(M83086.1)相似率為100%,與蒺藜苜蓿PEPC基因序列(XM_003596337.4)相似率為99%。結(jié)果表明,獲得的兩份紫花苜蓿材料的目的片段均屬于PEPC基因家族。
表1可以看出,野生紫花苜蓿和‘阿爾岡金’紫花苜蓿的分子量分別為25.886和26.501 KDa,氨基酸總數(shù)分別為228和233 aa;理論等電點(diǎn)均大于7,為帶正電荷蛋白;蛋白質(zhì)不穩(wěn)定指數(shù)均大于4,均屬于不穩(wěn)定蛋白;親水性平均系數(shù)均為負(fù)數(shù),預(yù)測(cè)均為親水性蛋白。
圖3 兩種紫花苜蓿PEPC基因PCR電泳圖Fig.3 PCR electrophoresis of PEPC gene in two alfalfa species注:1,‘阿爾岡金’紫花苜蓿;2,野生紫花苜蓿Note:1, Medicqgo stativa‘ Algonquin’;2,Native Medicago stativa
表1 兩種紫花苜蓿PEPC蛋白理化性質(zhì)Tab 1 Physicochemical properties of PEPC proteins in two alfalfa species
紫花苜蓿PEPC蛋白同源性分析結(jié)果顯示(表2),野生紫花苜蓿和蒺藜苜蓿與紫花苜蓿之間,以及紫花苜蓿和蒺藜苜蓿之間同源性較高,均為1;‘阿爾岡金’紫花苜蓿與野生紫花苜蓿、紫花苜蓿和蒺藜苜蓿之間一致性均大于0.9;菜豆與其他5個(gè)近緣種間相似性較低,均小于0.5。
表2 紫花苜蓿6個(gè)近緣種間PEPC蛋白同源性分析Tab 2 Homology of PEPC proteins sequences among 6 related species of alfalfa
對(duì)野生紫花苜蓿、‘阿爾岡金’紫花苜蓿及4個(gè)PEPC基因近緣種間轉(zhuǎn)錄蛋白同源關(guān)系進(jìn)行比較,結(jié)果顯示(圖4):野生紫花苜蓿、紫花苜蓿和蒺藜苜蓿以100%的支持率聚為一組,這一組與‘阿爾岡金’紫花苜蓿聚為一支,支持率為96%;四種苜蓿與鷹嘴豆的同源關(guān)系為78%,而與菜豆同源關(guān)系最遠(yuǎn),其關(guān)系距離為47%。
圖4 紫花苜蓿6個(gè)近緣種的PEPC蛋白同源關(guān)系樹(shù)Fig.4 PEPC proteins sequence homology tree of 6 related species of Alfalfa
PEPC酶不同程度地增強(qiáng)了植物抵御和適應(yīng)外界脅迫的能力,幫助植物適應(yīng)生物脅迫和非生物脅迫,同時(shí),植物的PEPC酶活性在外界脅迫下可增強(qiáng)[25-27]。本研究中,兩種紫花苜蓿PEPC酶活性隨著脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),大致呈先增加后降低的趨勢(shì),當(dāng)植物感應(yīng)到脅迫時(shí),會(huì)啟動(dòng)脅迫應(yīng)激機(jī)制來(lái)抵御和適應(yīng)外來(lái)影響[28]。兩種脅迫條件下,兩種紫花苜蓿均在脅迫第12 h出現(xiàn)峰值,可能是此時(shí)達(dá)到了紫花苜蓿自我調(diào)節(jié)所能承受的極限,PEPC酶活性在此之后則表現(xiàn)出下降的趨勢(shì),當(dāng)受脅迫的紫花苜蓿未到死亡極限時(shí)給予復(fù)水,紫花苜蓿植株受到的脅迫減輕并脫離脅迫臨界點(diǎn)后,PEPC酶活性又開(kāi)始增強(qiáng)以便應(yīng)對(duì)脅迫。在相同處理?xiàng)l件下,‘阿爾岡金’紫花苜蓿的PEPC酶活性基本上都低于野生紫花苜蓿,可能因?yàn)橐吧匣ㄜ俎T揪蜕L(zhǎng)在干熱河谷極端惡劣的自然環(huán)境中[29],已經(jīng)適應(yīng)了干熱環(huán)境下形成的特殊自我保護(hù)機(jī)制。兩種脅迫條件下在復(fù)水前均可觀察到一個(gè)滯緩期,表明紫花苜蓿PEPC酶對(duì)植株復(fù)水的反應(yīng)是一個(gè)長(zhǎng)期反應(yīng),這可能與基因表達(dá)強(qiáng)度的減弱有關(guān)[30]。兩種紫花苜蓿PEPC酶活性在復(fù)水后可完全恢復(fù)到脅迫前的水平,甚至高于脅迫前的水平,這說(shuō)明植物PEPC酶對(duì)植物的作用是一個(gè)可逆過(guò)程,這與雷明月等[31]的研究結(jié)果一致。
本試驗(yàn)獲得的野生紫花苜蓿和‘阿爾岡金’紫花苜蓿的PEPC核酸序列長(zhǎng)度分別為739和750 bp,分別編碼228和233個(gè)氨基酸,在氨基酸序列比對(duì)中,兩種不同紫花苜蓿PEPC基因氨基酸序列極度保守,具有高度的一致性,這與趙晉鋒等[32]的研究結(jié)果一致。兩種紫花苜蓿PEPC蛋白的分子量、等電點(diǎn)、親水系數(shù)和蛋白質(zhì)不穩(wěn)定系數(shù)等理化性質(zhì)比較穩(wěn)定,與在水稻[33]、大豆[34]和油菜(BrassicanapusL.)[35]等植物上的研究結(jié)論相似。
兩個(gè)紫花苜蓿材料與4個(gè)近緣種間PEPC蛋白同源性分析中,野生紫花苜蓿與蒺藜苜蓿和紫花苜蓿之間,以及紫花苜蓿與蒺藜苜蓿之間同源性均為1,相似性較高,說(shuō)明其氨基酸結(jié)構(gòu)差異比較小;菜豆與其他5個(gè)近緣種間差異性較大,相似性均小于0.5,說(shuō)明他們之間親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。將兩個(gè)紫花苜蓿材料聯(lián)合4個(gè)近緣種的PEPC蛋白進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,野生紫花苜蓿、紫花苜蓿和蒺藜苜蓿以100%的支持率聚為一組,但不能單純從它們的序列相似性來(lái)推測(cè)其PEPC基因具有相似功能,還需要考慮其啟動(dòng)子順式作用元件和非編碼區(qū)的差異[36]。而‘阿爾岡金’紫花苜蓿可能適應(yīng)了相對(duì)獨(dú)立的環(huán)境條件,導(dǎo)致其PEPC蛋白發(fā)生改變,從而其蛋白活性及功能也隨之發(fā)生改變。四種苜蓿與鷹嘴豆和菜豆的同源關(guān)系均較遠(yuǎn),表明PEPC在進(jìn)化過(guò)程中既保留了較強(qiáng)的保守性,又在不同種屬間產(chǎn)生了差異[37]。
干旱脅迫與干熱脅迫都對(duì)紫花苜蓿光合酶PEPC活性產(chǎn)生了較大的影響,其中,兩種脅迫下野生紫花苜蓿的酶活性基本高于‘阿爾岡金’紫花苜蓿,兩種紫花苜蓿PEPC蛋白均為不穩(wěn)定蛋白和親水性蛋白,且氨基酸序列保守性較高。