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    不同預(yù)處理對(duì)小鼠糞樣菌群高通量測(cè)序分析結(jié)果的影響

    2023-02-12 10:51:52劉昕胡會(huì)玲張敏愛薛幗珍閆曉睿張希春劉計(jì)權(quán)
    生物技術(shù)進(jìn)展 2023年1期
    關(guān)鍵詞:糞樣高通量生理鹽水

    劉昕 , 胡會(huì)玲 , 張敏愛 , 薛幗珍 , 閆曉睿 , 張希春 , 劉計(jì)權(quán)

    1.山西中醫(yī)藥大學(xué)中藥與食品工程學(xué)院,山西 晉中 030600;

    2.太原海關(guān)技術(shù)中心,太原 030021

    腸道菌群是一個(gè)龐大的微生態(tài)系統(tǒng),其所含細(xì)菌種類繁多,可分為有益菌、有害菌和中性菌3大類[1]。腸道菌群的生態(tài)平衡對(duì)于維持人體代謝、發(fā)育、免疫、感染預(yù)防及治療等正常生理功能發(fā)揮著極其重要的作用,而這種正常的生態(tài)平衡一旦被打破,則會(huì)引起肥胖、糖尿病、肝病、免疫性疾病、精神疾病、慢性腎病等多種疾病的發(fā)生[2]。腸道菌群與人類的健康密切相關(guān),目前已成為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。新鮮糞樣經(jīng)腸道排出體外,因其具有取樣方便、無損傷性等特點(diǎn),常被作為腸道菌群研究的取樣來源[3]。

    高通量測(cè)序技術(shù)因其測(cè)序快速、數(shù)據(jù)量大、能夠較為全面地反應(yīng)微生物群落結(jié)構(gòu)等優(yōu)點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于腸道菌群的研究[4]。同時(shí),DNA樣品濃度、純度和污染也是影響高通量測(cè)序結(jié)果準(zhǔn)確度的重要因素。新鮮糞樣來源于宿主腸道,除了攜帶宿主的腸道微生物群,同時(shí)還包含有大量的食物殘?jiān)⒌鞍踪|(zhì)、糖類、脂肪、消化酶等多種雜質(zhì),這些雜質(zhì)可能會(huì)引起腸道菌群DNA發(fā)生降解、增加DNA被污染的風(fēng)險(xiǎn)、干擾PCR擴(kuò)增和檢測(cè)結(jié)果等問題,所以對(duì)糞樣進(jìn)行預(yù)處理操作,除去雜質(zhì),進(jìn)而提高腸道菌群DNA的濃度和純度,是保證高通量測(cè)序結(jié)果的有效手段[5]。已有研究報(bào)道可通過PBS緩沖液[6-7]、生理鹽水[8-9]、濾器過濾[10]、均質(zhì)化[11]等預(yù)處理方法達(dá)到除雜提純的目的,其中PBS緩沖液、生理鹽水預(yù)處理是常用方法,然而關(guān)于不同預(yù)處理對(duì)腸道菌群測(cè)定結(jié)果的影響少有報(bào)道。本文采用試劑盒提取DNA,通過高通量測(cè)序?qū)υ技S樣、PBS處理糞樣和生理鹽水處理糞樣進(jìn)行比較分析,以期為后續(xù)相關(guān)研究提供參考依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 SPF級(jí)8周齡昆明種小鼠10只,體質(zhì)量22~25 g,購(gòu)自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司。適應(yīng)性飼養(yǎng)1周,飼養(yǎng)期間自由采光,給予充足的食物和水。

    1.1.2試劑 胃蛋白酶購(gòu)自Sigma化工有限公司;PBS緩沖液和生理鹽水購(gòu)自武漢普諾賽生命科技有限公司;DNA提取試劑盒和QIAamp 96 PowerFecal QIAcube HT kit(5)購(gòu)自德國(guó)QIAGEN公司;Qubit DNA檢測(cè)試劑盒購(gòu)自Life Technologies;ExTaq高保真酶購(gòu)自日本Takara公司。

    1.1.3儀器 渦旋混合器購(gòu)自上海第一醫(yī)學(xué)儀器廠;臺(tái)式高速離心機(jī)購(gòu)自德國(guó)Eppendorf公司;凈化工作臺(tái)和立式壓力蒸汽滅菌鍋購(gòu)自上海博訊實(shí)業(yè)有限公司;厭氧培養(yǎng)箱購(gòu)自上海容威儀器設(shè)備有限公司;PCR儀購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司;電泳儀和凝膠成像儀購(gòu)自Tanon公司;-80 ℃超低溫冰箱購(gòu)自美國(guó)Thermo Fisher Revco公司;高通量核酸純化儀購(gòu)自QIAGEN公司;高通量測(cè)序儀購(gòu)自美國(guó)Illumina公司。

    1.2 方法

    1.2.1糞樣采集及預(yù)處理 將實(shí)驗(yàn)小鼠分別單獨(dú)放入滅菌的鼠籠中,用一次性無菌鑷子,收集每個(gè)小鼠新鮮糞樣2~3粒置于同一無菌離心管中,混勻。提取DNA之前,將糞樣分為3組,在厭氧培養(yǎng)箱內(nèi)迅速進(jìn)行如下處理。①原始糞樣組(Y):取新鮮糞樣1 g,裝入15 mL無菌離心管中,保存于-80 ℃冰箱。②生理鹽水處理組(S):參照Garcia等[8]方法,向裝有1 g新鮮糞樣的50 mL離心管中加入20 mL生理鹽水,用渦旋混勻儀搖動(dòng)3 min后,3 000 r·min-1離心3次,每次3 min,取上清液保存于-80 ℃冰箱。③PBS處理組(P):處理液為PBS緩沖液,其余操作同生理鹽水處理組。每組試驗(yàn)重復(fù)3次。

    1.2.2樣本DNA提取、PCR擴(kuò)增和16S rDNA測(cè)序 DNA提取、PCR擴(kuò)增和測(cè)序均由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司完成。根據(jù)提取試劑盒所述方法提取DNA,針對(duì)V3~V4區(qū)域設(shè)計(jì)帶Barcode的 特 異引物343F(5'-TACGGRAGGCAGCAG-3')和798R(5'-AGGGTATCTAATCCT-3')進(jìn)行PCR擴(kuò)增[12],通過Illumina MiSeq平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。

    1.2.3數(shù)據(jù)分析方法 使用Trimmomatic(version 0.35)[13]軟件、Flash(version 1.2.11)[14]軟件、QIIME中的split-libraries(version 1.8.0)[15]軟件、UCHIME(version 2.4.2)[16]軟件進(jìn)行微生物組學(xué)數(shù)據(jù)分析,使用QIIIME2軟件進(jìn)行多樣性分析,使用SPSS(version 26.0)進(jìn)行顯著性分析,使用Metabo Analyst進(jìn)行PCA分析,QIIIME2軟件在門、綱、科、屬水平下繪制柱狀圖。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)控

    2.1.1測(cè)序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì) 表1為3組9個(gè)樣本16S rDNA V3~V4區(qū)的測(cè)序結(jié)果。由表1可知,質(zhì)控之后的Clean tags數(shù)據(jù)量分布在69 909~77 752之間,Clean tags去除嵌合體后得到的Valid tags數(shù)據(jù)量分布在56 015~65 796之間,Valid tags平均長(zhǎng)度分布在412.34~421.21 bp,各樣本OTUs分布在351~670之間。

    表1 3組9個(gè)樣本的OTUs分析Table 1 OTUs analysis of 9 samples in 3 groups

    S組3個(gè)樣本有194 649條序列及1 987個(gè)OTUs;P組3個(gè)樣本有192 179條序列及1 092個(gè)OTUs;Y組3個(gè)樣本有186 241條序列及1 302個(gè)OTUs。

    2.1.2Specaccum物種累積曲線 圖1結(jié)果顯示,隨著樣本量由小變大,曲線逐漸趨于平緩;當(dāng)樣本量達(dá)到8時(shí),此時(shí)群落中的OTUs總數(shù)不再增加,表明測(cè)序深度已經(jīng)基本覆蓋到樣品中所有的物種,測(cè)序數(shù)據(jù)量合理,測(cè)序深度足夠大,可以反映絕大多數(shù)的微生物多樣性信息。

    圖1 物種累積曲線圖Fig. 1 Species accumulation plot

    2.1.3Rank abundance分析 曲線越寬表明物種的組成越豐富,曲線趨勢(shì)越平緩表明物種組成的均勻程度越高。圖2中Rank-abundance分析結(jié)果表明,S組曲線寬度最大,說明S組小鼠糞樣微生物豐度最高,而Y組和P組都有所降低;隨著OTU等級(jí)增加,S組、Y組和P組曲線最終均趨于平緩,表明3組糞樣菌群物種分布都較均勻,以S組物種分布的均勻度最高。

    圖2 等級(jí)分度曲線Fig. 2 Grade classification curve

    2.1.4韋恩圖 圖3中心數(shù)字代表所有樣本共有的OTUs,花瓣上的數(shù)字代表各個(gè)樣本總OTUs減去共有OTUs的數(shù)目。由圖3可知,9個(gè)樣本共有188個(gè)OTUs,S組3個(gè)特異性的OTUs數(shù)目均高于P組和Y組,Y組3個(gè)特異性的OTUs數(shù)目均高于P組,表明S組的微生物多樣性和豐富度最高,Y組次之,P組最低。

    圖3 Core-Pan圖Fig. 3 Core-Pan diagram

    2.2 不同預(yù)處理對(duì)糞樣菌群多樣性的影響

    2.2.1AIpha菌群多樣性指數(shù)分析 由表2可知,3組樣本的Goods coverage均達(dá)到了0. 99以上,且3組之間無顯著差異,表明本次測(cè)序的結(jié)果能真實(shí)反映樣本的微生物分布情況。S組的Chao l、Observed-species、Shannon、Simpson指數(shù)均顯著高于P組和Y組,Y組的Chao l、Observed-species、Shannon、Simpson多樣性指數(shù)均顯著高于P組,表明S組樣本微生物群落的豐度和多樣性最高,Y組次之,P組最低。

    表2 不同預(yù)處理組糞樣菌群的多樣性指數(shù)Table 2 Diversity index of faecal flora in different pretreatment groups

    2.2.2PCA分析 圖4結(jié)果表明,第一、第二主坐標(biāo)分別解釋了菌群結(jié)構(gòu)總變異的50.21%、12.27%;聚類現(xiàn)象表明,各組內(nèi)的菌群結(jié)構(gòu)相似,P組與Y組距離較近,說明P組與Y組菌群結(jié)構(gòu)相近;與P組相比,Y組距離S組更近,說明Y組與S組菌群結(jié)構(gòu)更相近。

    圖4 PCA(2D)分析Fig. 4 PCA(2D) analysis

    2.2.3樹狀圖聚類分析 采取隨機(jī)重復(fù)抽樣算法,對(duì)UPGMA的可靠性進(jìn)行分析,構(gòu)建了樣本聚類樹狀圖。由圖5可以看出,3組9個(gè)樣本共聚為2大類,S組3個(gè)樣本單獨(dú)為一類,Y組合P組的6個(gè)樣本聚為一類。S組與Y組的分支距離和可靠性比S組與P組分支距離近且可靠性高;Y組部分樣本與P組聚為另一類,但可靠性較低,P組與Y組部分樣本中的菌群相似,但相似程度較低。

    圖5 Jackknifed-UPGMA樣本相似性聚類圖Fig.5 Jackknifed-UPGMA sample similarity cluster graph

    2.3 不同預(yù)處理對(duì)糞樣菌群結(jié)構(gòu)的影響

    2.3.1在門分類水平上的差異分析 在門水平上,S組、P組和Y組分別檢出14、11、12個(gè)門,3組共有的門為11個(gè),圖6和表3列出了3組糞樣豐度排在前5的共有門。擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、和變形菌門(Proteobacteria)為3個(gè)優(yōu)勢(shì)菌門,放線菌門(Actinobacteria)和脫鐵桿菌門(Deferribacteres)含量較少。

    表3 在門水平上不同糞樣處理組的相對(duì)豐度(Xˉ±S)Table 3 Relative abundance of fecal samples in different treatment groups at phylum level(Xˉ±S)

    圖6 在門水平上不同糞樣處理組的群落組成分布Fig. 6 Community composition distribution in different fecal treatment groups at phylum level

    擬桿菌門(Bacteroidetes)和脫鐵桿菌門(Deferribacteres)的相對(duì)豐度在3組糞樣之間均無顯著差異(P>0.05);厚壁菌門(Firmicutes)的相對(duì)豐度在3組糞樣之間差異顯著(P<0.05),以S組最高,其次為Y組、P組;P組和Y組中變形菌門(Proteobacteria)的相對(duì)豐度高于S組(P<0.05),但P組、Y組之間無顯著差異(P>0.05);P組中放線菌門(Actinobacteria)的相對(duì)豐度顯著高于S組(P<0.05),S組與Y組之間無顯著差異(P>0.05)。

    2.3.2在綱分類水平上的差異分析 在綱水平上,S組、P組和Y組分別檢出24、21、21個(gè)綱,3組共有的綱為20個(gè),圖7和表4列出了3組糞樣豐度排在前5的共有綱,包括擬桿菌綱(Bacteroidia)、梭菌綱(Clostridia)、γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)、丹毒絲菌綱(Erysipelotrichia)、厚壁菌綱(Negativicutes)。

    圖7 在綱水平上不同糞樣處理組的群落組成分布Fig. 7 Community composition distribution in different fecal treatment groups at class level

    表4 在綱水平上不同糞樣處理組的相對(duì)豐度(±S)Table 4 Relative abundance of fecal samples in different treatment groups at class level(Xˉ±S)

    表4 在綱水平上不同糞樣處理組的相對(duì)豐度(±S)Table 4 Relative abundance of fecal samples in different treatment groups at class level(Xˉ±S)

    注:同一行不同組別標(biāo)的不同字母表示具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05)。

    ?

    擬桿菌綱(Bacteroidia)的相對(duì)豐度在3組之間無顯著差異(P>0.05);S組中梭菌綱(Clostridia)、γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)的相對(duì)豐度顯著高于P組和Y組(P<0.05),但P組和Y組之間無顯著差異(P>0.05);Y組中丹毒絲菌綱(Erysipelotrichia)的相對(duì)豐度顯著高于S組和P組(P<0.05),S組和P組之間無顯著差異(P>0.05);厚壁菌綱(Negativicutes)的相對(duì)豐度在3組之間差異顯著(P<0.05),以S組最高,其次為P組、Y組。

    2.3.3在科分類水平上的差異分析 在科水平上,S組、P組和Y組分別檢出62、55、59個(gè)科,3組共有26個(gè)科,圖8和表5列出了3組糞樣豐度排在前7的共有科,包括普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、腸桿菌科(Enterobacteriaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、伯克霍爾德科(Burkholderiaceae)、擬桿菌科(Bacteroidiaceae)、丹毒桿菌科(Erysipelotrichaece)。

    表5 在科水平上不同糞樣處理組的相對(duì)豐度(Xˉ±S)Table 5 Relative abundance of fecal samples in different treatment groups at family level(Xˉ±S)

    圖8 在科水平上不同糞樣處理組的群落組成分布Fig. 8 Community composition distribution in different fecal treatment groups at family level

    普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)的相對(duì)豐度在3組之間無顯著差異(P>0.05);瘤胃菌科(Ruminococcaceae)和擬桿菌科(Bacteroidiaceae)的相對(duì)豐度在3組之間差異顯著(P<0.05),以S組最高;伯克霍爾德科(Burkholderiaceae)和丹毒桿菌科(Erysipelotrichaece)的相對(duì)豐度在S組和Y之間組無顯著差異(P>0.05),但均顯著高于P組(P<0.05);腸桿菌科(Enterobacteriaceae)在P、Y兩組的相對(duì)豐度顯著高于S組(P<0.05);毛螺菌科(Lachnospiraceae)在S組的相對(duì)豐度顯著高于P、Y組(P<0.05)。

    2.3.4在屬分類水平上的差異分析 在屬水平上,S組、P組和Y組分別檢出147、126、137個(gè)屬,3組共有117個(gè)屬,圖9和表6列出了3組糞樣豐度排在前10的共有屬,包括普雷沃氏菌屬9(Prevotella_9)、克雷伯氏桿菌屬(Klebsiella)、大腸桿菌-志賀氏菌屬(Escherichia_Shigella)、羅氏菌屬(Roseburia)、糞桿菌屬(Faecalibacterium)、副薩特氏菌屬(Parasutterella)、擬桿菌屬(Bacteroides)、鏈狀桿菌屬(Catenibacterium)、毛螺旋菌科UCG-004菌屬(Lachnospiraceae_UCG-004)、乳梭菌屬(Lachnoclostridium)。

    圖9 在屬水平上不同糞樣處理組的群落組成分布Fig. 9 Community composition distribution in different fecal treatment groups at genus level

    表6 在屬水平上不同糞樣處理組的相對(duì)豐度(Xˉ±S)Table 6 Relative abundance of fecal samples in different treatment groups at genus level(Xˉ±S)

    雷沃氏菌屬9(Prevotella_9)的相對(duì)豐度在3組之間無顯著差異(P>0.05);P組和Y組的克雷伯氏桿菌屬(Klebsiella)、毛螺旋菌科UCG-004菌屬(Lachnospiraceae_UCG-004)、乳梭菌屬(Lachnoclostridium)的相對(duì)豐度無顯著差異(P>0.05),但均顯著高于S組(P<0.05);S組羅氏菌屬(Roseburia)、糞桿菌屬(Faecalibacterium)的相對(duì)豐度顯著高于P組和Y組(P<0.05),但P組和Y組之間差異不顯著(P>0.05);大腸桿菌-志賀氏菌(Escherichia_Shigella)的相對(duì)豐度在3組之間差異顯著(P<0.05),以P組最高,其次為Y組、S組。

    3 討論

    高通量測(cè)序技術(shù)因其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),目前已被廣泛應(yīng)用于腸道菌群多樣性、豐度及菌群組成的研究中。樊英等[17]利用高通量測(cè)序分析了大瀧六線魚表皮粘液及腸道內(nèi)容物微生物多樣性;劉銘等[18]應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)我國(guó)東海帶魚腸道菌群進(jìn)行了研究;申進(jìn)增[19]研究了當(dāng)歸揮發(fā)油對(duì)自發(fā)性高血壓大鼠腸道菌群的影響。腸道菌群的狀態(tài)可以通過糞樣菌群的變化反映出來[20],但糞樣并不能真實(shí)代表腸道菌群的組成,由于受限于目前沒有更好的采樣方式,所以在腸道菌群的研究中,一般以新鮮糞樣作為取樣來源。糞樣中除攜帶腸道細(xì)菌外,還含有大量的腐殖質(zhì)、腸道內(nèi)壁脫落細(xì)胞及碎片、各種有機(jī)物和無機(jī)物等[21],所以對(duì)糞樣進(jìn)行預(yù)處理具有必要性。董鵬飛等[9]研究發(fā)現(xiàn),用生理鹽水處理可以有效增加腸道菌群DNA的純度和濃度,提高腸道微生物DNA的提取質(zhì)量。張雪雁等[22]采用PBS緩沖液處理糞樣,可以在一定程度上去除糞樣中的雜質(zhì)和抑制物。曹冉冉等[23]發(fā)現(xiàn)生理鹽水和PBS緩沖液預(yù)處理是目前提取糞樣核酸常用的方法。

    本文采用Illumina Miseq高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)比分析原始糞樣、生理鹽水預(yù)處理糞樣和PBS緩沖液預(yù)處理糞樣中菌群的差異性,發(fā)現(xiàn)糞樣經(jīng)過生理鹽水處理后,不僅可以去除雜質(zhì),同時(shí)有利于保持糞樣微生物的多樣性和豐富度;PBS緩沖液雖然可以去除糞樣雜質(zhì),但在一定程度上降低了糞樣微生物的多樣性和豐度。高通量測(cè)序中,采用生理鹽水對(duì)糞樣進(jìn)行預(yù)處理,能夠在一定程度上提高糞樣中菌群檢測(cè)的準(zhǔn)確性。原始糞樣由于帶有大量雜質(zhì)可能會(huì)影響某些菌群的檢出,不同溶液預(yù)處理可能會(huì)造成某些菌群的損失,不同處理方式對(duì)不同菌群的影響也不完全一樣,其具體影響原因有待于進(jìn)一步研究。

    研究還發(fā)現(xiàn),擬桿菌門、厚壁菌門和變形菌門均為原始糞樣組、生理鹽水處理組和PBS緩沖液處理組排在前3位的優(yōu)勢(shì)菌門,這與文獻(xiàn)[24-25]報(bào)道的研究結(jié)果相一致,3組糞樣均能最大程度上保留優(yōu)勢(shì)菌門。厚壁菌門是腸道內(nèi)最為優(yōu)勢(shì)的一大類細(xì)菌,這一類細(xì)菌屬于革蘭陽性厭氧菌[19],很多厚壁菌可以產(chǎn)生芽孢,用以抵抗脫水和極端環(huán)境,動(dòng)物腸道中的厚壁菌屬于化能營(yíng)養(yǎng)型細(xì)菌,能幫助動(dòng)物從食物中獲取更多的能量[26]。放線菌是革蘭陽性厭氧菌,可增加腸道內(nèi)抗生素的產(chǎn)量,進(jìn)而破壞腸道菌群的穩(wěn)態(tài),加劇相關(guān)疾病的進(jìn)展[27],3組糞樣均檢出了放線菌門。

    瘤胃球菌科屬于厚壁菌門,是胃腸道中分解纖維素和發(fā)酵抗性淀粉的主要菌屬[28],瘤胃球菌具有碳水化合物降解活性,可通過分泌纖維素酶、半纖維素酶等降解纖維物質(zhì),并有助于細(xì)胞吸收糖分,為宿主提供所需營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)[29];擬桿菌能夠參與碳水化合物發(fā)酵、多糖代謝、膽汁酸和類膽固醇代謝、抑制機(jī)體炎性反應(yīng)、影響宿主免疫系統(tǒng)、維持腸道正常生理等諸多功能,對(duì)宿主健康具有重要影響[30];伯克霍爾德菌科涵蓋生態(tài)上極其多樣化的微生物,包括真正的環(huán)境腐生生物、植物病原體、條件致病菌,多數(shù)為人類和動(dòng)物的主要致病菌[31]。本次研究中,瘤胃球菌科、擬桿菌科和伯克霍爾德科作為排在前7的共有科在3組糞樣均被檢出。

    普雷沃氏菌屬能促進(jìn)腸道消化碳水化合物和膳食纖維,從而有利于維持腸道菌群穩(wěn)定,增強(qiáng)免疫功能[32];糞桿菌屬、毛螺旋菌科UCG-004菌屬是腸道中的有益菌屬,與短鏈脂肪酸產(chǎn)生相關(guān)[33];羅氏菌屬為腸道中產(chǎn)生丁酸的優(yōu)勢(shì)菌[34];擬桿菌屬菌群可在人體腸道內(nèi)產(chǎn)生乙酸、丙酸和丁酸等短鏈脂肪酸,而短鏈脂肪酸對(duì)維持機(jī)體功能具有重要作用;乳梭菌屬在腸道中多數(shù)為非致病菌,少數(shù)為致病菌;此外,克雷伯氏菌、大腸桿菌-志賀氏菌均來自腸桿菌科,屬于條件致病菌[35]。以上菌屬作為3組糞樣豐度排在前10的共有屬均被檢出。

    腸道菌群是一個(gè)極其復(fù)雜的微生態(tài)系統(tǒng),包括許多生物因子和非生物因子,不同的取樣方法、預(yù)處理方式、DNA提取方式、測(cè)序方式等均會(huì)對(duì)腸道菌群的研究結(jié)果產(chǎn)生影響,同一處理方式對(duì)不同腸道微生物的的影響也可能不同。此外,小鼠物種、個(gè)體、周齡等差異均會(huì)對(duì)腸道菌群研究結(jié)果產(chǎn)生影響,今后應(yīng)對(duì)影響腸道菌群結(jié)構(gòu)的可能因素進(jìn)行系統(tǒng)分析。

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