張彥冰,郭夢雅,劉曉丹
(揚(yáng)州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,江蘇 揚(yáng)州 225000)
烏鱧水泡病毒(Snakehead Vesiculovirus,SHVV)屬彈狀病毒科(Rhabdoviridae)成員,其基因組為單股不分節(jié)段的負(fù)鏈RNA[1],是引起烏鱧(Channa argus)病毒病的主要病原[2]。感染烏鱧水泡病毒的魚體多體表發(fā)黑,鰓無血色蒼白,不攝食,游泳無力偶爾會狂躁不安,容易在水流速度慢的地方聚集;解剖可觀察到病魚的肝脾腎腫大,有腹水[3]。烏鱧水泡病毒的基因組中有編碼核蛋白(Nucleoprotein,N)、磷酸化蛋白(Phosphoprotein,P)、基質(zhì)蛋白(Matrix protein,M)、糖蛋白(Glycoprotein,G)以及RNA 依賴的RNA 聚合酶蛋白(RNA-dependent RNA polymerase,L)五個結(jié)構(gòu)蛋白[3,4]。其中,核蛋白N 是含量最豐富、結(jié)構(gòu)最保守的病毒結(jié)構(gòu)蛋白,核蛋白與病毒基因組RNA 相結(jié)合,作為病毒轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的模板,對轉(zhuǎn)錄和復(fù)制過程起著重要的調(diào)節(jié)作用[5]。與此同時核蛋白能夠激活魚體內(nèi)的T 淋巴細(xì)胞,對病毒粒子產(chǎn)生免疫應(yīng)答,也可以激活T 輔助淋巴細(xì)胞,一定程度上加強(qiáng)B 淋巴細(xì)胞生成抗體的能力[6]。磷酸化蛋白P 是促使基因組從轉(zhuǎn)錄狀態(tài)轉(zhuǎn)換到復(fù)制狀態(tài)的關(guān)鍵因子,通過高度磷酸化改變自身結(jié)構(gòu),啟動核衣殼向病毒基因組RNA 結(jié)合,在RNA 與蛋白質(zhì)組成復(fù)合體的過程中發(fā)揮重要作用[7,8]。N 蛋白、P 蛋白與L 蛋白形成核糖核蛋白復(fù)合體指導(dǎo)病毒RNA 的轉(zhuǎn)錄與復(fù)制。
大腸桿菌(Escherichia coli)表達(dá)系統(tǒng)遺傳學(xué)背景清晰、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理研究成熟,操作過程簡便,能夠快速誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白,且表達(dá)產(chǎn)量高,最為成熟、應(yīng)用最普遍的原核表達(dá)系統(tǒng),有多種適用不同蛋白的表達(dá)載體和宿主菌[9,10]。大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)缺乏磷酸化、糖基化等翻譯后蛋白修飾系統(tǒng),適合翻譯后修飾作用不影響蛋白活性及特定結(jié)構(gòu)的外源蛋白表達(dá)[11]。
本研究通過克隆烏鱧水泡病毒SHVV 的N、P蛋白基因,構(gòu)建重組表達(dá)載體質(zhì)粒pGEX-5x-1-N和pGEX-5x-1-P,利用大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)對N、P蛋白進(jìn)行原核表達(dá),純化回收重組蛋白后免疫新西蘭大白兔和小鼠獲得N、P 蛋白的多克隆抗體,為該病毒免疫學(xué)檢測方法的建立及疫苗的研發(fā)提供基礎(chǔ)資料,并利用獲得的抗體檢測病毒蛋白在宿主細(xì)胞內(nèi)的分布。
大腸桿菌DH5α 與BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞購于寶生物工程(大連)有限公司;實(shí)驗(yàn)中表達(dá)載體pGEX-5x-1 及SSN-1 細(xì)胞由本實(shí)驗(yàn)室保存;SHVV由本實(shí)驗(yàn)室分離并保存。
MEM細(xì)胞基礎(chǔ)培養(yǎng)液、青霉素-鏈霉素溶液購自Hylcone 公司;胎牛血清(FBS)、胰酶購自Gibco 公司;限制性內(nèi)切酶Sal I、EcoR I、Not I 和RNA提取與反轉(zhuǎn)錄試劑盒、T4 DNA ligase、2×Taq PCR Mix 購自寶生物工程(大連)有限公司;包被液、洗滌液、稀釋液、底物液、終止液等購于武漢科前動物生物制品有限責(zé)任公司;質(zhì)粒抽提試劑盒、PCR 產(chǎn)物純化回收試劑盒等均購于北京康為世紀(jì)生物技術(shù)有限公司;SDS-PAGE 凝膠配置試劑盒與蛋白微量回收試劑盒購自于生工生物工程(上海)股份有限公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
以SHVV N、P 序列為模板分別設(shè)計引物。N 基因上游引物命名NF-Sal I,序列為GGGTCGACTCATGGAAAACCAAATCATCAAG;下游引物命名NB-Not I,序列為GATGCGGCCGCTCACAAAGCTTG GTGCTTCAG。P 基因上游引物命名PF-EcoR I,序列為AGCGAATTCATGGCAAAACCAGTTTTCCA;下游引物命名為PB-Not I,序列為ACTGCGGCCGCTTAGAACAGCACCATTTGCT。
用Trizol 法提取感染病毒細(xì)胞的總RNA,再根據(jù)反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書反轉(zhuǎn)錄成cDNA。以反轉(zhuǎn)錄的cDNA 為模板,用1.3 中所設(shè)計的特異性引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,共30 個循環(huán);延伸反應(yīng)72℃5 min,4℃保存。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳鑒定后,純化回收目的片段。
用對應(yīng)的限制性核酸內(nèi)切酶將PCR 產(chǎn)物以及pGEX-5x-1 表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切處理后,利用T4 DNA 連接酶將酶切后的目的片段與克隆載體連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞。將轉(zhuǎn)化后的感受態(tài)細(xì)胞涂布于含有氨芐青霉素的LB 固體培養(yǎng)基平板上,于37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)12 h,挑取單菌落重新接種在LB 培養(yǎng)基上過夜培養(yǎng),用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,并分別用Sal I/Not I 和EcoR I/Not I 對所提質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,將鑒定結(jié)果為陽性的克隆且測序正確的重組表達(dá)質(zhì)粒分別命名為pGEX-5x-1-N 和pGEX-5x-1-P。
將上述獲得的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞BL21(DE3)涂布LB 平板,挑取單克隆,37℃震蕩培養(yǎng)。在OD 值達(dá)到0.6 左右時加入IPTG,28℃誘導(dǎo)6 h。誘導(dǎo)結(jié)束后,取2 mL 誘導(dǎo)菌液及對照菌液4℃5 000 r/min 離心5 min,收集菌體。用100 μL PBS 重懸菌體,加入等量的SDS-PAGE 上樣緩沖液,沸水中處理10 min,取10 μL 樣品進(jìn)行SDS-PAGE 分析。
利用蛋白凝膠回收試劑盒回收經(jīng)SDS-PAGE分離的目的蛋白后,選取新西蘭大白兔,初次免疫時加等量完全弗氏佐劑乳化,后兩次加等量不完全弗氏佐劑,皮下多點(diǎn)注射500 μg 的pGEX-5x-1-N乳化后的蛋白,每隔兩周免疫一次,共進(jìn)行三次免疫;同樣,選取4~6 周齡小鼠,每次免疫100μg 的pGEX-5x-1-P 乳化后的蛋白,免疫三次;設(shè)置未免疫的兔子和小鼠作為對照。
免疫結(jié)束后采血,裝入離心管中,置于4℃過夜,取出析出的血清,分裝備用,在獲得抗血清之后用ELISA 測定血清效價。具體操作方法如下:用包被液(pH9.6,0.05 mol/L 碳酸鹽緩沖液)稀釋純化的SHVV 病毒懸液抗原后,按照0.625 μg/孔的濃度包被聚丙乙烯酶標(biāo)板,4℃過夜;棄去包被液,然后每孔加入200 μL 洗滌液(含0.05%Tween20 的0.01 mol/L、pH7.4 的PBS,PBST)洗滌4 次,每次5 min,在干毛巾上拍干;每孔加入100 μL 封閉液(含1%BSA 的PBS),37℃溫育1 h,拍干,洗板同前;加入100 μL 適當(dāng)稀釋的多克隆抗血清(按1∶200~1∶25 600 倍比稀釋),對照組加入正常兔子血清(按1∶200~1∶25 600 倍比稀釋作為陰性對照),37℃溫育30 min,洗滌同前;每孔加入100 μL 適當(dāng)稀釋倍數(shù)的辣根過氧化物酶標(biāo)記的羊抗小鼠IgG 抗體,37℃溫育30 min,同上洗滌;加底物液100 μL(底物液A 50 μL,底物液B 50 μL)顯色10 min,每孔加終止液50 μL,于酶標(biāo)儀630 nm 下測定光密度。再用0.1 MOI SHVV 感染SSN-1 細(xì)胞24 h 后收集細(xì)胞樣品,Western blot 分析多克隆抗體的特異性。
將SSN-1 細(xì)胞接種在24 孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,待細(xì)胞長滿單層后感染0.1 MOI(Multiplicity of infection,MOI)SHVV,同時設(shè)立未感染病毒的細(xì)胞作為對照組。接毒的細(xì)胞在28℃細(xì)胞培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h后,用預(yù)冷的丙酮-甲醇(1∶1)固定液固定10 min,PBS 清洗3 次后,1%BSA 封閉30 min,制備的N、P 蛋白的多克隆抗體(1∶5 000)為一抗,F(xiàn)ITC 標(biāo)記的商品化抗體(1∶200)為二抗,DAPI 細(xì)胞核染色3~5 min,最后在熒光顯微鏡下觀察并拍照。
以感染病毒的SSN-1 細(xì)胞cDNA 為模板,采取RT-PCR 方法通過特異性引物擴(kuò)增出SHVV 相應(yīng)的P、N 基因片段。瓊脂糖凝膠電泳檢測可見,對應(yīng)片段大小分別為864 bp 和1 290 bp 的片段(圖1),與預(yù)期結(jié)果一致。
圖1 SHVV P、N 基因的PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.1 The amplification products of P,N genes by PCR
將目的基因酶切后的片段純化回收后,與酶切后的pGEX-5x-1 載體連接,構(gòu)建融合GST 標(biāo)簽的原核表達(dá)重組質(zhì)粒。經(jīng)過測序和鑒定正確的重組質(zhì)粒分別命名為pGEX-5x-1-N,pGEX-5x-1-P 分別經(jīng)Sal I/Not I、EcoR I/Not I 雙酶切后,利用1%的瓊脂糖凝膠電泳對重組質(zhì)粒進(jìn)行鑒定(圖2)。
圖2 重組質(zhì)粒的酶切鑒定Fig.2 Identification of recombinant plasmid by restriction enzyme digestion
將重組質(zhì)粒pGEX-5x-1-N、pGEX-5x-1-P 分別轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)BL21(DE3)后,加入濃度1.0 mmol/L 的IPTG 誘導(dǎo)表達(dá)6 h,收集菌液及蛋白樣品。利用SDS-PAGE 進(jìn)行蛋白電泳檢測,經(jīng)過IPTG 誘導(dǎo)的和未經(jīng)過誘導(dǎo)的空白載體pGEX-5x-1作為對照(圖3),重組N 蛋白大小約為73 kD,重組P 蛋白大小約為57 kD,與預(yù)期相符。
圖3 重組質(zhì)粒誘導(dǎo)表達(dá)蛋白的SDS-PAGE 檢測Fig.3 Identification of recombinant plasmids prokaryotic expression by SDS-PAGE
通過蛋白凝膠回收試劑盒回收后,N 蛋白濃度為700 μg/mL,免疫所需總蛋白量為1 500 μg;P 蛋白濃度為300 μg/mL,免疫所需總蛋白量為300 μg。分別用N 蛋白作為抗原免疫兔子,P 蛋白作為抗原免疫小鼠,用ELISA 方法測得血清中特異性抗體的效價。當(dāng)樣品吸光值/陰性吸光值>2.1 時即認(rèn)為是陽性。不同稀釋倍數(shù)下實(shí)驗(yàn)組OD 值都在1 以上,且對照組OD 值很低,因此這兩個多克隆抗體的效價均不低于1∶25 600(圖4)。
圖4 多克隆抗體效價的測定Fig.4 The titer of the anti-N,anti-P polyclonal antibody detected by ELISA
用0.1 MOI SHVV 感染SSN-1 細(xì)胞24 h 后收集細(xì)胞樣品,對制備的多克隆抗體進(jìn)行Western blot分析。N 蛋白與P 蛋白的多克隆抗體能夠特異性地識別出SHVV N、P 蛋白的大小分別約為47 kD 和31 kD,且特異性良好,而對照組細(xì)胞沒有檢測到條帶(圖5)。
圖5 N、P 蛋白多克隆抗體的Western blotting 分析Fig.5 Western Blot Assay of PcAbs against SHVV N protein and P protein
將SSN-1 細(xì)胞接種在24 孔板中,長滿單層后感染0.1 MOI SHVV16 h 后,用制備的N、P 蛋白的多克隆抗體為一抗,F(xiàn)ITC 標(biāo)記的商品化抗體為二抗,進(jìn)行間接免疫熒光檢測。結(jié)果:SHVV 病毒感染的SSN-1 細(xì)胞出現(xiàn)了明顯的綠色熒光信號,而未感染組的SSN-1 細(xì)胞則沒有相應(yīng)的熒光信號,說明N、P 蛋白的多克隆抗體可以與SHVV 進(jìn)行特異性結(jié)合,且N、P 蛋白主要分布在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)(圖6)。
圖6 SHVV 的N 蛋白(1)和P 蛋白(2)在細(xì)胞內(nèi)分布Fig.6 Intracellular distribution of SHVV N protein(1)and P protein(2)
烏鱧水泡病毒SHVV 宿主廣泛,除了能感染鱧科魚類外還能感染鱸形目科的鱖(Siniperca chuatsi)等。魚類感染SHVV 后,體表發(fā)黑,鰓蒼白,胃腸道內(nèi)沒有食物,解剖觀察有腹水[3,12],且感染病毒的魚死亡率極高,目前為止缺乏對該病毒的診斷與有效防控方法。
彈狀病毒科的病毒基因組RNA 主要編碼N、P、M、G、L 5 種結(jié)構(gòu)蛋白。核蛋白N 是含量最豐富、結(jié)構(gòu)最保守的病毒結(jié)構(gòu)蛋白[5],磷酸化蛋白P 是促使基因組從轉(zhuǎn)錄狀態(tài)轉(zhuǎn)換到復(fù)制狀態(tài)的關(guān)鍵因子[13]。本實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增了N、P 蛋白的部分序列,將擴(kuò)增產(chǎn)物克隆至原核表達(dá)載體pGEX-5x-1 中。pGEX 系列的原核表達(dá)載體帶有GST 標(biāo)簽,而GST 標(biāo)簽?zāi)軌虼龠M(jìn)目的蛋白正確折疊,有效提高蛋白表達(dá)可溶性[14]。因此分別構(gòu)建融合GST 標(biāo)簽的重組質(zhì)粒pGEX-5x-1-N 以及pGEX-5x-1-P,并轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞BL21(DE3)。
大腸桿菌為原核生物,傳代時間短,營養(yǎng)要求簡單,遺傳背景清晰,能夠高效、迅速地表達(dá)外源蛋白等[15],但同時重組蛋白的原核表達(dá)常常形成包涵體,主要是在重組蛋白的表達(dá)過程中缺乏某些蛋白質(zhì)折疊的輔助因子,或環(huán)境不適無法形成正確的次級鍵等原因?qū)е?。相較于可溶性蛋白,包涵體表達(dá)有以下有利因素:首先,可溶性蛋白在細(xì)胞內(nèi)容易受到蛋白酶的攻擊,包涵體表達(dá)可避免蛋白酶對外源蛋白的降解;其次包涵體表達(dá)降低了胞內(nèi)外源蛋白的濃度有利于提高表達(dá)量。盡管包涵體的形成是目的蛋白表達(dá)量較高的表現(xiàn)[16],但大量包涵體的存在則對后續(xù)純化造成不便。有研究將切膠純化、過柱純化、包涵體復(fù)性純化等進(jìn)行對比[17-19],結(jié)果證明包涵體復(fù)性純化法適用于純化低表達(dá)量蛋白,而相比于過柱純化,切膠純化的包涵體蛋白具有良好的抗原結(jié)合性,能夠獲得條帶單一的目的蛋白,純化效果較好。本實(shí)驗(yàn)選擇直接切膠純化。后續(xù)Western blotting 及間接免疫熒光檢測分析結(jié)果表明,N 蛋白與P 蛋白的多克隆抗體可以與SHVV 特異性結(jié)合,特異性良好且N,P 蛋白主要分布在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)。
多克隆抗體成本低、周期短、制備過程簡單、可以識別更多的抗原、提高檢測的靈敏度[20]。目前,已有很多魚類病毒蛋白通過原核表達(dá)并成功構(gòu)建多克隆抗體[21-24],均為后續(xù)研究提供基礎(chǔ)資料。本研究制備了針對SHVV-N 及SHVV-P 的多克隆抗體,為建立該病毒免疫學(xué)檢測方法奠定了基礎(chǔ),也期待后續(xù)更深入的研究。