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    lncRNA NEAT1靶向miR-497-5p對(duì)胰腺癌細(xì)胞增殖、凋亡及上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化的影響

    2022-11-16 03:17:10于文昊王海久青海大學(xué)附屬醫(yī)院肝膽胰外科西寧810000
    中國(guó)免疫學(xué)雜志 2022年18期
    關(guān)鍵詞:檢測(cè)研究

    于文昊 王海久(青海大學(xué)附屬醫(yī)院肝膽胰外科,西寧 810000)

    胰腺癌是臨床常見消化系統(tǒng)惡性腫瘤,近30年來其發(fā)病率在全球范圍內(nèi)呈上升趨勢(shì),且病死率較高,其早期癥狀不明顯,缺乏特異性篩查指標(biāo),80%患者確診時(shí)多已是中晚期,僅5%左右患者進(jìn)行手術(shù)治療,但五年生存率不足5%[1-3]。因此,探尋胰腺癌新型生物治療靶標(biāo)已成為臨床研究熱點(diǎn)。長(zhǎng)鏈非 編 碼RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一種反義RNA分子,不具有蛋白編碼能力,能與靶基因非編碼區(qū)特異性結(jié)合,調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄和表達(dá)而發(fā)揮促癌或抑癌作用[4]。核富集轉(zhuǎn)錄體1(nuclear enriched abundant transcript 1,NEAT1)是lncRNAs家族成員之一,研究顯示,其對(duì)多種惡性腫瘤如甲狀腺癌、肝癌、舌鱗狀細(xì)胞癌等細(xì)胞生物學(xué)行為均具有調(diào)控作用[5-7]。miR-497-5p屬于miRNAs家族重要一員[8],姜達(dá)偉等[9]研究顯示,過表達(dá)miR-497-5p能夠誘導(dǎo)胰腺癌細(xì)胞周期阻滯進(jìn)而抑制細(xì)胞增殖。XIA等[10]研究顯示,NEAT1靶向下調(diào)miR-497-5p表達(dá)促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖并抑制凋亡。目前,有關(guān)NEAT1能否調(diào)控miR-497-5p影響胰腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的研究鮮有報(bào)道,因此本研究探討NEAT1與miR-497-5p對(duì)胰腺癌細(xì)胞增殖、凋亡等的影響,以期為臨床尋找胰腺癌新型生物治療靶點(diǎn)提供一定參考。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 細(xì)胞 人胰腺癌PANC-1細(xì)胞(bio-51676)購(gòu)自北京百歐博偉生物技術(shù)有限公司。

    1.1.2 試劑與儀器DMEM培養(yǎng)基(3-2001)、蛋白提取試劑盒(BC3711-50T)、LipofectamineTM3000轉(zhuǎn)染試劑盒(EF010-E)購(gòu)自美國(guó)艾美捷(武漢)科技有限公司;CCK-8試劑盒(CA1210-500T)、Annexin V-FITC/PI凋亡檢測(cè)試劑盒(WK304)、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(RP1105-100T)、AceQqPCR SYBR Green Mix(ALH185)、Trizol Reagent核酸分離試劑(YT526)、雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒(KFS303-HUV)購(gòu)自北京百奧萊博科技有限公司;靶向NEAT1的特異性siRNA(NEAT1-siRNA)及無關(guān)序列siRNA-NC由上海普邁生物科技有限公司設(shè)計(jì)合成;miR-497-5p-inhibitor及相應(yīng)陰性對(duì)照inhibitor-NC由百奧邁科生物技術(shù)有限公司合成;兔抗人細(xì)胞增殖相關(guān)核抗原(MKI67 Affinity Purified Polyclonal Ab,Ki-67)(100130-MM21)、B淋巴 細(xì) 胞 瘤 基 因-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)(FTB3598S)、Bcl-2相關(guān)X蛋白(Bcl-2 associated X protein,Bax)(ATA25287)、E-鈣黏附蛋白(E-cadherin)抗體(貨號(hào)ACRO)、間質(zhì)標(biāo)志物波形蛋白(Vimentin)(貨號(hào)K26866-PGZ)、N-鈣黏附蛋白(N-cadherin)抗體(貨號(hào)M00403-FCZ)、β-actin(ABP57456)多克隆抗體、山羊抗兔HRP(SE12-0.1)二抗均購(gòu)自武漢益普生物科技有限公司;二氧化碳細(xì)胞培養(yǎng)箱(型號(hào):BBD6220)購(gòu)自美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司;酶標(biāo)儀(型號(hào):ELx800)、熒光定量PCR儀(型號(hào):C1000)購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司;流式細(xì)胞儀(型號(hào):CytoFLEX)購(gòu)自美國(guó)Beckman公司。

    1.2 方法

    1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng) 取PANC-1細(xì)胞解凍,復(fù)蘇,置于含10%滅活胎牛血清(FBS)+DMEM培養(yǎng)基,37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每2~3 d換液,無菌操作,細(xì)胞已長(zhǎng)滿(達(dá)80%~90%)時(shí)進(jìn)行傳代培養(yǎng)。

    1.2.2 細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染及分組處理 取1.2.1對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的PANC-1細(xì)胞接種于24孔板(2.5×104個(gè)/孔),培養(yǎng)24 h后,更換無FBS的培養(yǎng)液,對(duì)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染并分組:①空白對(duì)照組(NG組):細(xì)胞不做特殊處理;②陰性轉(zhuǎn)染組(siRNA-NC組):采用LipofectamineTM3000將NEAT1-siRNA轉(zhuǎn)染至PANC-1細(xì)胞中;③沉默NEAT1組(NEAT1-siRNA組):采用LipofectamineTM3000將NEAT1-siRNA轉(zhuǎn)染至PANC-1細(xì)胞中;④共轉(zhuǎn)染組(NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor組):采用LipofectamineTM3000將NEAT1-siRNA和miR-497-5p-inhibitor序列共轉(zhuǎn)染。用含10%滅活FBS+DMEM培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng)細(xì)胞48 h。嚴(yán)格按照轉(zhuǎn)染試劑盒說明書操作,收集各組細(xì)胞用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

    1.2.3 實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)NEAT1、miR-497-5p水平TRIzol法提取1.2.2各組培養(yǎng)48 h的PANC-1細(xì)胞總RNA并測(cè)定濃度。以RNA為模板、PrimeScript RT reagent試劑盒說明書為操作標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA。體系20μl:ULtraSYBR mixture(10.0μl)、模板cDNA(2.0μl)、上下游引物(各2.0μl)、去離子純化水(4.0μl);93℃30 s、93℃5 s、65℃30 s,40個(gè)循環(huán)。引物序列詳見表1,由蘇州泓迅生物科技股份有限公司設(shè)計(jì)并合成。采用2-ΔΔCt方法計(jì)算NEAT1、miR-497-5p水平相對(duì)表達(dá)量。

    表1 引物序列Tab.1 Primer sequences

    1.2.4 CCK-8法檢測(cè)各組PANC-1細(xì)胞增殖能力取1.2.2各組培養(yǎng)48 h后的PANC-1細(xì)胞,消化,接種至24孔板(2.5×104個(gè)/孔),繼續(xù)培養(yǎng)48 h,嚴(yán)格按照CCK-8試劑盒說明書加入CCK-8試劑,繼續(xù)培養(yǎng)2 h,檢測(cè)490 nm處各孔細(xì)胞光密度(optical density,OD)值,計(jì)算細(xì)胞增殖抑制率(%)=(1-實(shí)驗(yàn)組OD值/對(duì)照組OD值)×100%。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

    1.2.5 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)各組PANC-1細(xì)胞凋亡率取1.2.2各組培養(yǎng)48 h后的PANC-1細(xì)胞接種于24孔板中(2.5×105個(gè)/孔),按照Annexin-V FITC/PI試劑盒說明書處理細(xì)胞;加5μl碘化丙啶(PI)+5μl Annexin V-FITC混勻,染色,稀釋,流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞凋亡率。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

    1.2.6 Western blot檢測(cè)增殖、凋亡及上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)標(biāo)志蛋白表達(dá)情況 以RIPA液裂解細(xì)胞,提取總蛋白并檢測(cè)濃度及純度,行10%SDS-PAGE電泳、轉(zhuǎn)膜,以5%脫脂牛奶封閉,加入一抗Ki-67、Bcl-2、Bax、E-cadherin、N-cadherin、Vimentin及內(nèi)參β-actin,稀釋比均為1∶500,4℃過夜,清洗,加入HRP標(biāo)記的山羊抗兔二抗(1∶1 000)孵育1 h。分析各蛋白相對(duì)表達(dá)量。

    1.2.7 雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn) 數(shù)據(jù)庫(Starbase)顯示NEAT1與miR-497-5p核苷酸存在結(jié)合位點(diǎn),根據(jù)miR-497-5p與NEAT1-3'UTR結(jié)合位點(diǎn)的預(yù)測(cè)結(jié)果,采用PCR技術(shù)擴(kuò)增NEAT1-3'UTR序列中包含與miR-497-5p存在結(jié)合位點(diǎn)的片段,并插入到熒光素酶pGL4載體中,構(gòu)建NEAT1野生型質(zhì)粒(NEAT1-WT),并利用基因突變技術(shù)將個(gè)別結(jié)合位點(diǎn)序列突變,構(gòu)建突變型質(zhì)粒(NEAT1-MT)。使用LipofectamineTM3000將NEAT1-WT、NEAT1-MT分別與miR-497-5p-inhibitor-NC、miR-497-5p-inhibitor共轉(zhuǎn)染于PANC-1細(xì)胞,分別為miR-497-5p-inhibitor-NC-NEAT1-WT組、miR-497-5p-inhibitor-NEAT1-WT組、miR-497-5p-inhibitor-NC-NEAT1-MT組、miR-497-5p-inhibitor-NC-NEAT1-MT組,轉(zhuǎn)染48 h后,用PBS洗滌細(xì)胞,加入RIPA裂解液(250μl)于室溫?fù)u床中搖晃15 min裂解細(xì)胞,收集裂解液,加入50μl熒光素酶檢測(cè)試劑Ⅱ,以自動(dòng)熒光素酶檢測(cè)儀測(cè)定熒光強(qiáng)度A,之后加入Stop&Glo,測(cè)定熒光強(qiáng)度B,以A/B表示熒光素酶相對(duì)活性。

    1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS22.0分析數(shù)據(jù),計(jì)量資料以±s表示,多組間比較采用單因素方差分析,進(jìn)一步兩兩比較采用SNK-q檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    2 結(jié)果

    2.1 各組PANC-1細(xì)胞NEAT1、miR-497-5p水平比較 與NG組、siRNA-NC組比較,NEAT1-siRNA組PANC-1細(xì)胞NEAT1水平顯著降低(P<0.05),miR-497-5p水平顯著升高(P<0.05);與NEAT1-siRNA組比較,NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor組PANC-1細(xì)胞NEAT1水平差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),miR-497-5p水平顯著降低(P<0.05,表2)。

    表2 各 組PANC-1細(xì) 胞NEAT1、miR-497-5p水 平 比較(±s,n=6)Tab.2 Comparison of NEAT1 and miR-497-5p levels in PANC-1 cells of each group(±s,n=6)

    表2 各 組PANC-1細(xì) 胞NEAT1、miR-497-5p水 平 比較(±s,n=6)Tab.2 Comparison of NEAT1 and miR-497-5p levels in PANC-1 cells of each group(±s,n=6)

    Note:Compared with NG group,1)P<0.05;compared with siRNA-NC group,2)P<0.05;compared with NEAT1-siRNA group,3)P<0.05.

    Groups NG siRNA-NC NEAT1-siRNA NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor F P NEAT1/β-actin 0.99±0.15 1.00±0.15 0.55±0.081)2)0.53±0.071)2)271.020 0.000 miR-497-5p/U6 1.01±0.16 0.98±0.15 1.55±0.231)2)1.20±0.181)2)3)130.270 0.000

    2.2 各組PANC-1細(xì)胞增殖情況比較 與NG組、siRNA-NC組比較,NEAT1-siRNA組PANC-1細(xì)胞增殖抑制率顯著升高(P<0.05);與NEAT1-siRNA組比較,NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor組PANC-1細(xì)胞增殖抑制率顯著降低(P<0.05,表3)。

    表3 各組PANC-1細(xì)胞增殖情況比較(±s,n=6)Tab.3 Comparison of PANC-1 cell proliferation in each group(±s,n=6)

    表3 各組PANC-1細(xì)胞增殖情況比較(±s,n=6)Tab.3 Comparison of PANC-1 cell proliferation in each group(±s,n=6)

    Note:Compared with NG group,1)P<0.05;compared with siRNA-NC group,2)P<0.05;compared with NEAT1-siRNA group,3)P<0.05.

    Groups NG siRNA-NC NEAT1-siRNA NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor F P Cell proliferation inhibition rate(%)0.00 0.08±0.01 22.87±3.431)2)15.12±2.271)2)3)939.753 0.000

    2.3 各組PANC-1細(xì)胞凋亡情況比較 與NG組、siRNA-NC組比較,NEAT1-siRNA組PANC-1細(xì)胞凋亡率顯著升高(P<0.05);與NEAT1-siRNA組比較,NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor組PANC-1細(xì) 胞凋亡率顯著降低(P<0.05,圖1、表4)。

    表4 各組PANC-1細(xì)胞凋亡情況比較(±s,n=6)Tab.4 Comparison of PANC-1 cell apoptosis in each group(±s,n=6)

    表4 各組PANC-1細(xì)胞凋亡情況比較(±s,n=6)Tab.4 Comparison of PANC-1 cell apoptosis in each group(±s,n=6)

    Note:Compared with NG group,1)P<0.05;compared with siRNA-NC group,2)P<0.05;compared with NEAT1-siRNA group,3)P<0.05.

    Groups NG siRNA-NC NEAT1-siRNA NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor FP Apoptosis rate(%)15.69±2.35 17.01±2.55 40.05±6.061)2)27.88±4.191)2)3)558.343 0.000

    圖1 各組PANC-1細(xì)胞凋亡情況比較Fig.1 Comparison of PANC-1 cell apoptosis in each group

    2.4 各組PANC-1細(xì)胞增殖、凋亡及EMT相關(guān)蛋白表達(dá)比較 與NG組、siRNA-NC組比較,NEAT1-siRNA組PANC-1細(xì)胞Ki-67、Bcl-2、N-cadherin、Vimentin蛋白表達(dá)顯著降低(P<0.05),Bax、E-cadherin蛋白表達(dá)顯著升高(P<0.05);與NEAT1-siRNA組比較,NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor組PANC-1細(xì)胞Ki-67、Bcl-2、N-cadherin、Vimentin蛋白表達(dá)顯著升高(P<0.05),Bax、E-cadherin蛋白表達(dá)顯著降低(P<0.05,圖2、表5)。

    表5 各組PANC-1細(xì)胞增殖、凋亡及EMT相關(guān)蛋白表達(dá)比較(±s,n=6)Tab.5 Comparison of proliferation,apoptosis and EMT related protein expressions of PANC-1 cells in each group(±s,n=6)

    表5 各組PANC-1細(xì)胞增殖、凋亡及EMT相關(guān)蛋白表達(dá)比較(±s,n=6)Tab.5 Comparison of proliferation,apoptosis and EMT related protein expressions of PANC-1 cells in each group(±s,n=6)

    Note:Compared with NG group,1)P<0.05;compared with siRNA-NC group,2)P<0.05;compared with NEAT1-siRNA group,3)P<0.05.

    Groups NG siRNA-NC NEAT1-siRNA NEAT1-siRNA+miR-497-5p-inhibitor FP Ki-67/β-actin 1.18±0.18 1.20±0.19 0.57±0.091)2)0.85±0.131)2)3)191.436 0.000 Bax/β-actin 0.33±0.04 0.35±0.05 0.97±0.161)2)0.67±0.111)2)3)699.870 0.000 Bcl-2/β-actin 0.95±0.14 0.96±0.15 0.30±0.051)2)0.71±0.111)2)3)305.653 0.000 E-cadherin/β-actin 0.55±0.08 0.58±0.09 1.17±0.251)2)0.87±0.131)2)3)273.400 0.000 N-cadherin/β-actin 1.21±0.18 1.19±0.19 0.52±0.081)2)0.79±0.121)2)3)240.613 0.000 Vimentin/β-actin 1.17±0.18 1.19±0.19 0.60±0.091)2)0.83±0.121)2)3)178.955 0.000

    圖2 各組PANC-1細(xì)胞增殖、凋亡及EMT相關(guān)蛋白表達(dá)比較Fig.2 Comparison of proliferation,apoptosis and EMT related protein expression of PANC-1 cells in each group

    2.5 雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)NEAT1對(duì)miR-497-5p的轉(zhuǎn)錄調(diào)控Starbase(http://starbase.sysu.edu.cn/degradomeRNA.php?source=mRNA)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,NEAT1與miR-497-5p基因序列存在結(jié)合位點(diǎn),見圖3。熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染NEAT1 WT的實(shí)驗(yàn)中,miR-497-5p-inhibitor-NEAT1-WT組熒光素酶活性(1.37±0.21)顯著高于miR-497-5p-inhibitor-NC-NEAT1-WT組(1.03±0.15),(P<0.05,圖4)。

    圖3 NEAT1與miR-497-5p基因靶向關(guān)系Fig.3 Targeting relationship between NEAT1 and miR-497-5p gene

    圖4 熒光素酶實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.4 Results of luciferase experiment

    3 討論

    胰腺癌是消化系統(tǒng)惡性腫瘤,具有發(fā)病隱匿、侵襲性強(qiáng)特點(diǎn),導(dǎo)致大多數(shù)患者確診時(shí)已是中晚期[11]。目前手術(shù)及化療手段是臨床治療胰腺癌的主要手段,但手術(shù)對(duì)于浸潤(rùn)程度深的患者有較大風(fēng)險(xiǎn),同時(shí)療效有一定局限性,而腫瘤細(xì)胞對(duì)化療藥物耐藥性又限制了化療藥物的廣泛應(yīng)用及療效。

    NEAT1是新近發(fā)現(xiàn)的一個(gè)lncRNA,能夠參與多種基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控,研究表明,其作為癌基因參與多種腫瘤發(fā)生發(fā)展[12]。郭春芳等[13]研究顯示,NEAT1在卵巢癌組織中異常高表達(dá)可能是卵巢癌潛 在 治 療 靶 點(diǎn)。WANG等[14]研 究 顯 示,過 表 達(dá)NEAT1顯著促進(jìn)子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖、侵襲等。細(xì)胞增殖及凋亡失衡是腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵,而EMT是指上皮細(xì)胞在正常生理及病理特征下向間質(zhì)細(xì)胞表型的轉(zhuǎn)變過程,是腫瘤細(xì)胞發(fā)生遷移和侵襲的關(guān)鍵步驟[15-16]。其中上皮細(xì)胞標(biāo)志蛋白E-cadherin及間質(zhì)細(xì)胞標(biāo)志蛋白N-cadherin、Vimentin是EMT標(biāo)志蛋白,E-cadherin表達(dá)下調(diào)及N-cadherin、Vimentin表達(dá)上調(diào),胞間黏附作用減弱,進(jìn)一步促使癌細(xì)胞向周邊正常組織發(fā)生侵襲、轉(zhuǎn)移[17-18]。本研究結(jié)果顯示,與NG組、siRNA-NC組比較,NEAT1-siRNA組PANC-1細(xì)胞增殖抑制率、凋亡率、Bax、Ecadherin蛋白表達(dá)顯著升高,NEAT1水平及Ki-67、Bcl-2、N-cadherin、Vimentin蛋白表達(dá)顯著降低。與既往腫瘤研究中表達(dá)模式一致,說明沉默NEAT1表達(dá)可能抑制胰腺癌細(xì)胞增殖、EMT過程并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。miR-497-5p是一種單鏈小分子RNA,位于腫瘤易突變區(qū)域人類染色體17q13.1,在多種腫瘤中異常低表達(dá)[19]。LIU等[20]研究顯示,miR-497可能通過抑制血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子-A表達(dá)抑制胰腺癌細(xì)胞增殖、血管生成和轉(zhuǎn)移能力。本研究結(jié)果顯示,與NG組、siRNA-NC組比較,NEAT1-siRNA組PANC-1細(xì)胞miR-497-5p水平顯著升高,當(dāng)在轉(zhuǎn)染NEAT1-siRNA基礎(chǔ)上抑制miR-497-5p表達(dá)后,沉默NEAT1表達(dá)抑制PANC-1細(xì)胞增殖并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡能力減弱,說明沉默NEAT1表達(dá)可能通過上調(diào)miR-497-5p表達(dá)發(fā)揮抑癌作用。研究發(fā)現(xiàn),NEAT1可對(duì)miR-497-5p發(fā)揮負(fù)調(diào)控作用促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖并抑制凋亡[10]。本研究經(jīng)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)網(wǎng)站得知NEAT1與miR-497-5p基因序列存在結(jié)合位點(diǎn),且經(jīng)雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)證實(shí),miR-497-5p-inhibitor-NEAT1-WT組熒光素酶活性顯著高于miR-497-5pinhibitor-NC-NEAT1-WT組。以上研究結(jié)果表明,沉默NEAT1表達(dá)可能靶向上調(diào)miR-497-5p表達(dá),抑制胰腺癌細(xì)胞增殖及EMT過程,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。

    綜上所述,沉默lncRNA NEAT1表達(dá)能抑制胰腺癌細(xì)胞增殖及EMT過程,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,可能是通過靶向上調(diào)miR-497-5p實(shí)現(xiàn)的。然而胰腺癌發(fā)生發(fā)展是多因素的復(fù)雜過程,關(guān)于其細(xì)胞增殖、凋亡等生物學(xué)惡性行為進(jìn)展中l(wèi)ncRNA NEAT1對(duì)下游靶基因或相關(guān)通路的調(diào)控作用仍需深入探索。

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