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    甜菜鹽脅迫分子機制研究進展

    2022-10-20 03:39:04李俊良羅成飛
    中國甜菜糖業(yè) 2022年3期
    關(guān)鍵詞:蛋白激酶甜菜組學(xué)

    李俊良,羅成飛

    (哈爾濱工業(yè)大學(xué),哈爾濱 150000)

    0 前言

    甜菜(Betavulgaris)是一種兩年生草本植物,分類上屬于石竹目藜科,二倍體染色體(2n=18),基因組大小估計有714-758 MB[1],全世界甜菜糖的產(chǎn)量約占糖總產(chǎn)量的35 %[2]。甜菜從野生甜菜Betavulgarisssp.maritima繼承了一定的耐鹽性[3]。許多栽培品種具有較高的耐受性,對鹽漬土也具有一定適應(yīng)能力,甚至低濃度的鹽分還能促進其生長,是一種適于在鹽漬土壤上耕種且極具價值的經(jīng)濟作物。近年來關(guān)于植物耐鹽機制的研究方向已經(jīng)逐漸從生理反應(yīng)深入到分子應(yīng)答研究上。近年來有少量文獻從轉(zhuǎn)錄水平[3-5]、蛋白質(zhì)水平[6-9]和代謝物水平[16]對甜菜適應(yīng)鹽脅迫的分子機制進行了初步研究。

    1 鹽份對植物生長發(fā)育的危害

    當(dāng)土壤中某種鹽類含量過高時,會形成以該鹽的離子為主要成分的土壤溶液,使得植物對離子吸收的可選性降低,迫使植物過量累積某些離子而破壞體內(nèi)離子平衡,從而產(chǎn)生離子毒害作用。NaCl是大部分鹽漬土中的常見鹽分,它通過Na+和Cl-的積累引起滲透脅迫和離子毒性。鉀是酶的活化劑,適當(dāng)?shù)腒+濃度是細胞內(nèi)多種酶類維持活性所必須的。過量積累的Na+會打破Na+/K+平衡,從而影響光合作用和蛋白質(zhì)合成等生物過程。同時過量的Na+和Cl-還會破壞膜組織并對細胞內(nèi)的各種代謝活動直接產(chǎn)生離子毒害作用。離子毒害對作物的傷害雖然緩慢,但通常持需時間較長,它會加速老葉的衰落甚至導(dǎo)致主干死亡[10]。

    在植株失水嚴重且離子失衡的情況下,細胞內(nèi)環(huán)境受到了破壞,這會進一步誘發(fā)活性氧(ROS)如單線態(tài)氧、超氧陰離子自由基、羥基自由基和過氧化氫等的產(chǎn)生,造成氧化脅迫[11]。過量的ROS一方面會造成膜質(zhì)的過氧化,破壞膜系統(tǒng)的完整性;另一方面可以直接氧化氨基酸和核酸,影響酶的活性、生物大分子如蛋白質(zhì)和核酸的結(jié)構(gòu)和功能,如DNA鏈斷裂和酶活降低等[12]。

    2 植物對鹽脅迫的應(yīng)答機制

    植物在對外界環(huán)境變化的長期適應(yīng)過程中進化出了一系列的鹽脅迫應(yīng)答調(diào)控機制。在遭受鹽脅迫后,植物自身會主動關(guān)閉氣孔降低蒸騰作用、削弱葉片的生長并抑制光合作用、合成/釋放滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)恢復(fù)滲透平衡、激活ROS清除系統(tǒng)緩解氧化物質(zhì)對細胞的毒害、合成伴侶蛋白保障生物大分子活性以及減少生物量[13],這些機制大大提高了植物對鹽脅迫的抵抗能力。

    2.1 滲透調(diào)節(jié)作用

    對于環(huán)境脅迫造成的滲透壓失衡,植物可以通過迅速合成并累積一些低分子量有機溶質(zhì)來降低體內(nèi)水勢,完成滲透調(diào)節(jié)過程。這類被稱為滲透保護劑(osmolytes)有機溶質(zhì),包括海藻糖、蘋果酸、甜菜堿、脯氨酸、多元醇(甘露醇和山梨醇)等。這些物質(zhì)不但有助于植物調(diào)節(jié)細胞內(nèi)的滲透壓,還可以穩(wěn)定蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)[14]。

    甘氨酸甜菜堿(Glycinebetaine)被譽為最佳滲透調(diào)節(jié)劑,它不僅參與細胞的滲透調(diào)節(jié),而且具有穩(wěn)定大分子的作用。高鹽環(huán)境下酶的活性會受到抑制,甜菜堿可以使許多重要的酶類如TCA循環(huán)的主要酶類、末端氧化酶類和光系統(tǒng)外周肽等在脅迫條件下保持活性,從而對生物體提供耐鹽保護[15-17]。甜菜堿的積累與植物脅迫下代謝方向的調(diào)整有關(guān),脅迫條件下可以合成甜菜堿的植物以膽堿(Choline)為底物經(jīng)兩步氧化反應(yīng)迅速合成。催化第一步反應(yīng)的酶是膽堿單加氧酶(Choline monooxygenase,CMO),合成中間產(chǎn)物甜菜堿醛,催化第二部反應(yīng)的酶是菜堿醛脫氫酶(Betaine-aldehyde dehydrogenase,BADH)。有研究指出,轉(zhuǎn)化BADH基因的煙草耐低溫能力顯著提高[18-19]。

    2.2 離子解毒作用

    植物在遭受鹽脅迫后需要重建體內(nèi)離子平衡以保障細胞可以進行正常的生命活動。植物鹽超敏感(Salt Overly Sensitive,SOS)途徑是目前已知的調(diào)控鹽脅迫下細胞離子穩(wěn)態(tài)的重要機制。該系統(tǒng)包含3個關(guān)鍵組件:SOS1屬于Na+/H+逆轉(zhuǎn)運蛋白(NHX),SOS2屬于SnRK3(sucrose non-fermenting-1-related protein kinase-3)蛋白激酶家族的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,SOS3屬于肉豆蔻酰化鈣結(jié)合蛋白(myristoylated calcium-binding protein)。鹽脅迫后細胞內(nèi)激增的Ca2+信號激活SOS途徑,SOS3首先識別這種Ca2+信號,SOS3與Ca2+結(jié)合后可以與SOS2發(fā)生相互作用,這種相互作用會將SOS2招募到等離子體膜上,進而激活膜上的SOS1(NHX),SOS1可以促進細胞將多余的Na+排出細胞質(zhì)[20](圖1)。植物吸收鹽分后積累到液泡中,控制胞質(zhì)鹽濃度在一定水平,維持胞質(zhì)內(nèi)較高的K+/Na+比的過程被稱為鹽的區(qū)隔化作用。高等植物Na+的外排和區(qū)隔化主要依賴于質(zhì)膜上的 NHX來完成。

    圖1 植物鹽超敏感途徑調(diào)控離子平衡示意圖

    2.3 ROS清除作用

    活性氧是有氧代謝不可避免的副產(chǎn)物,為避免ROS積累對細胞造成氧化傷害,植物進化出了一系列的ROS清除機制。超氧物歧化酶(SOD)、過氧化物酶(POD)、過氧化氧酶(CAT)等保護酶可以通過酶促反應(yīng)清除多余的ROS。對不同植物的研究表明,耐鹽植物體內(nèi)SOD、POD和CAT的活性更高,具有更強的ROS清除能力[21]。一些小分子抗氧化物質(zhì)如抗壞血酸(ASA)和谷胱甘肽(GSH)可以形成抗壞血酸-谷胱甘肽循環(huán)(ASA-GSH)還原細胞中的強氧化性物質(zhì)。Zhao等的研究顯示非共生血紅蛋白(NsHb)可以通過提高抗氧化酶系統(tǒng)的活性來減少氧化應(yīng)激造成的損傷[22]。

    2.4 脅迫信號傳遞

    植物激素是植物中最重要的第一信使。鹽脅迫可以誘發(fā)多種植物激素的合成。脫落酸(ABA)是一種可以調(diào)控鹽脅迫應(yīng)答的重要植物激素,它能激活一系列信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,調(diào)控多種脅迫應(yīng)答基因如蛋白激酶、轉(zhuǎn)錄因子、滲透調(diào)節(jié)蛋白、膜轉(zhuǎn)運蛋白、抗氧化酶類等的表達,進而調(diào)控鹽脅迫應(yīng)答過程。有報道指出,鹽脅迫下過量的生長素(IAA)會抑制主根的生長,高濃度的乙烯會抑制側(cè)根的萌發(fā),而迅速累積ABA則可以抑制植物側(cè)根的伸長[10]。NO也是植物細胞中重要的第一信使,研究指出內(nèi)外源NO均能緩解鹽脅迫對苗生長的抑制,適量的NO可以誘導(dǎo)植物細胞內(nèi)多種抗氧化酶的活性,從而提高植物的抗逆能力[23]。

    環(huán)境脅迫信號的感知和傳遞可以通過質(zhì)膜上存在的各種受體蛋白和跨膜蛋白激酶來完成。Ca2+是植物細胞中最重要的第二信使。目前植物細胞中發(fā)現(xiàn)的鈣信號系統(tǒng)有依賴Ca2+的蛋白激酶(CDPKs)、鈣調(diào)素(CaM)和鈣調(diào)磷酸酶B類似蛋白(CBLs)等多類鈣結(jié)合蛋白家族。此外,Ca2+可以誘導(dǎo)γ-氨基丁酸(GABA)的合成,有研究指出GABA也可以作為一種信號分子調(diào)控植物對鹽脅迫的應(yīng)答[24]。

    PA(Phosphatidic acid,PA)被稱為脂類第二信使,鹽脅迫下NO可以促進二酰甘油二酯激酶(DGK)催化1,2-二酰甘油(DAG)生成PA。蛋白質(zhì)的磷酸化/去磷酸化是細胞應(yīng)對外界環(huán)境變化并調(diào)節(jié)細胞功能的重要機制,該機制由蛋白激酶催化的蛋白磷酸化將環(huán)境信號進行逐級放大,借此調(diào)節(jié)細胞的生理應(yīng)答過程。PA可以激活絲裂原活化蛋白激酶(MAPK),將脅迫信號進行放大,激活下游應(yīng)答反應(yīng)。三磷酸肌醇(IP3)可以調(diào)控液泡內(nèi)Ca2+離子的釋放,同時條還可以被磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C(PI-PLC)水解生成DAG,也是植物細胞中重要的第二信使[25]。

    總的來看,各信號通路之間相互交叉和聯(lián)系,形成逆境脅迫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò),共同調(diào)節(jié)植物中逆境響應(yīng)的下游應(yīng)答基因(圖2)。

    圖2 植物調(diào)控鹽脅迫的信號分子示意圖紅色:第一信使,紫色:第二信使,黑色:其他信號分子,ABA:脫落酸,IAA:生長素,DAG:1,2-二酰甘油,IP3:三磷酸肌醇,PA:磷脂酸,cAMP:環(huán)磷酸腺苷,cGMP:環(huán)磷酸鳥苷,GABA:γ-氨基丁酸,MAPK:絲裂原活化蛋白激酶,CDPK:鈣依賴蛋白激酶,SOS3:肉豆蔻?;}結(jié)合蛋白,ROS:活性氧

    3 甜菜耐鹽機制研究現(xiàn)狀

    3.1 甜菜生理水平上對鹽脅迫的應(yīng)答研究

    早期對甜菜研究發(fā)現(xiàn),甜菜生理水平上獨特的耐鹽性主要源于以下3點:

    (Ⅰ)甜菜在遭受鹽脅迫后可以迅速合成甜菜堿。這是許多農(nóng)作物如水稻、土豆、番茄等所不具備的能力。甜菜堿不但可以調(diào)節(jié)滲透壓,還能保護生物大分子物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能;此外,胞質(zhì)內(nèi)的甜菜堿含量升高還可以促進Na+向液泡中流動。

    (Ⅱ)甜菜可以利用Na+部分取代K+的功能。Subbarao等的研究指出,紅甜菜中95%的K+被Na+被替代后可以正常生長且不影響產(chǎn)量[26]。目前的研究顯示,甜菜中除去葉綠素形成的過程必須要K+參與外,K+的非專性功能都可以被Na+替代,如滲透調(diào)節(jié)、輔助陰離子長距離運輸、控制氣孔開合、調(diào)節(jié)酶活性以及葉綠體增殖等[27-29]。

    (Ⅲ)甜菜可以通過區(qū)隔化作用將鹽分“鎖”在體內(nèi)。甜菜將從環(huán)境中吸收的鹽分運輸至地上部分,研究顯示葉柄和老葉中鹽分含量較高,而光合強度較高的葉片中鹽分含量較低。此外,甜菜體內(nèi)的K+、Na+分布也有利于保證功能葉片中K+的功能。

    3.2 甜菜分子水平上對鹽脅迫的應(yīng)答研究

    甜菜雖然對鹽脅迫表現(xiàn)出較強的耐受性,然而不同品種(基因型)之間的耐鹽能力存在顯著差異。甜菜對鹽脅迫的分子應(yīng)答過程十分復(fù)雜,既涉及到植物激素、糖類、脂類和氨基酸等有機化合物參與的多種信號轉(zhuǎn)導(dǎo),也包含了基因指導(dǎo)的多種功能蛋白和功能化合物的生物合成。

    Lv等使用轉(zhuǎn)錄組測序?qū)μ鸩薓14單體附加系在鹽脅迫下的差異基因進行鑒定,結(jié)果顯示大部分差異表達基因的GO注釋集中在氧化還原平衡,信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和蛋白質(zhì)磷酸化上;同時參與ROS清除系統(tǒng)的基因如APX,SOD,硫氧還蛋白(TRX),谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST)等在鹽脅迫下呈現(xiàn)顯著差異[4]。Skorupa等使用轉(zhuǎn)錄組測序研究了海甜菜對鹽脅迫的應(yīng)答,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與滲透調(diào)節(jié)劑、分子伴侶和氧化還原蛋白合成有關(guān)的基因在鹽脅迫下顯著差異表達,這些基因可能在甜菜鹽脅迫應(yīng)答過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用[5]。

    Wang等使用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)方法比較了鹽敏感和耐鹽甜菜品種在鹽脅迫下蛋白質(zhì)組學(xué)上的差異,結(jié)果顯示涉及蛋白質(zhì)修飾,TCA循環(huán),細胞壁合成和ROS清除的幾種蛋白質(zhì)在敏感和耐性品種之間存在顯著差異,表明這些途徑可能與甜菜的耐鹽性高度相關(guān)[29]。Li等iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)研究了 M14微粒體膜蛋白,結(jié)果顯示質(zhì)膜ATPase 11和液泡ATPase H亞基響應(yīng)鹽脅迫而增加,這些蛋白質(zhì)參與產(chǎn)生質(zhì)子梯度,分別用于離子穿過質(zhì)膜和液泡膜的轉(zhuǎn)運[7]。Yu等使用無標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析了短期鹽脅迫下M14的磷酸化蛋白質(zhì)組變化,發(fā)現(xiàn)促分裂原活化蛋白激酶(MAPK),14-3-3s受體激酶和鈣依賴性蛋白激酶(CDPK)在鹽脅迫下表現(xiàn)出顯著改變[8]。

    4 各組學(xué)研究對揭示植物鹽脅迫應(yīng)答分子機制的作用

    4.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)

    4.1.1 表達譜測序

    基于RNA-seq的表達譜測序技術(shù)通過構(gòu)建處于特定狀態(tài)下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,通過大規(guī)模的測序工作,最終完成對樣本中基因表達種類和豐度的定性和定量分析。表達譜測序技術(shù)是一種高性價比的轉(zhuǎn)錄鑒定和表達定量方法,適用于大規(guī)模研究轉(zhuǎn)錄水平基因的表達變化。

    加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)是一種網(wǎng)絡(luò)分析方法,可以根據(jù)樣本中共表達基因之間的高度相關(guān)性將基因分組到特定的模塊中,然后使用模塊內(nèi)連接性,基因重要性等來識別調(diào)控目標(biāo)途徑的Hub基因。WGCNA相比于差異表達基因包含更多的信息,通過考慮各轉(zhuǎn)錄本之間的關(guān)系可以更加完整地解析表達譜數(shù)據(jù)。然而WGCNA分析依賴于充足的樣本量,因此大規(guī)模的表達譜測序搭配WGCNA分析成為解析植物鹽脅迫應(yīng)答中復(fù)雜性狀的有效手段。例如Zhu等采用WGCNA方法篩選了水稻(OryzasativaL.)的候選耐鹽基因[30]。Zhou等利用WGCNA方法對煙草(NicotianaTabacum)響應(yīng)低溫脅迫的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行分析[31]。

    4.1.2 小RNA測序和降解組測序

    miRNA(microRNA)是一類內(nèi)生小分子非編碼RNA,長度在18~25個核苷酸之間,它們通過抑制翻譯過程或直接斷裂靶標(biāo)mRNA從而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達[32]。研究表明,miRNA參與調(diào)控多種生理和生化過程,如幼苗的生長[33]、花的發(fā)育[34]以及對環(huán)境脅迫的反應(yīng)[35]。此外,一項新的研究發(fā)現(xiàn),植物可以輸出miRNAs來抑制真菌病原體中的毒力基因表達[36]。識別miRNA及其靶基因?qū)﹃U明其調(diào)控機制至關(guān)重要。

    Small RNA測序是研究生物樣品中小RNA的最主要方法之一,該技術(shù)首先分離樣品中18-30nt的RNA片段;再利用高通量測序技術(shù)獲取小RNA的序列和表達量信息。在植物中,大多數(shù)miRNA擁有與其靶基因完美互補或接近完美互補的序列,因此可以使用生物信息學(xué)工具來預(yù)測其靶基因[37]。此外,一種使用高通量測序技術(shù)的5′-快速擴增cDNA末端(RACE)的改良版本稱為Degradome測序,已越來越多地用于預(yù)測miRNAs的靶點[38-39]。許多先前被證實和預(yù)測的miRNA靶點已經(jīng)被這種方法所證實,它提供了一種分析miRNA對靶標(biāo)RNA編輯模式的綜合手段。Degradome測序與小RNA測序相結(jié)合,大大提高了在植物中識別miRNAs及其靶點的速度[48]。目前關(guān)于甜菜中miRNA的分布及功能研究還相對較少,在miRBase數(shù)據(jù)庫中尚未收錄有關(guān)于甜菜的miRNA信息注釋。

    4.1.3 全轉(zhuǎn)錄組測序

    除編碼RNA外,非編碼RNA的調(diào)控作用對于植物適應(yīng)環(huán)境脅迫也是必不可少的。全轉(zhuǎn)錄組測序可以同時分析同一樣本中的多種RNA(mRNA、lncRNA和circRNA等),它在揭示細胞生理活動規(guī)律和生物代謝機理的研究中發(fā)揮越來越重要的作用。

    長非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一種長度> 200 nt的非編碼RNA[40],它可以從表觀遺傳水平、轉(zhuǎn)錄調(diào)控及轉(zhuǎn)錄后加工等多種層面實現(xiàn)對基因表達的調(diào)控[41]。lncRNAs通常具有和mRNA類似的結(jié)構(gòu),經(jīng)剪接后5′端通常有一個7mC帽子,3′端即可以帶polyA也可以不帶polyA尾。lncRNA的分布與表達通常具有組織特異性和時空特異性,并且lncRNA在不同物種間的保守性較差。最近的研究顯示,lncRNA參與植物對非生物脅迫的應(yīng)答,例如在毛果楊(PopulusTrichocarpa)中發(fā)現(xiàn)504條響應(yīng)干旱脅迫的lncRNA[42],在陸地棉(GossypiumhirsutumL.)中發(fā)現(xiàn)了44個響應(yīng)鹽脅迫的lncRNA[43]。對蘋果(Malusdomestica)lncRNA的研究顯示,MSTRG.85814.11促進SAUR32的表達,從而激活與缺鐵反應(yīng)相關(guān)的質(zhì)子排出[44]。

    環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是具有共價閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA[45]。大多數(shù)circRNA在不同物種間具有保守性和穩(wěn)定性,而且circRNA的表達同樣具備時空特異性。研究發(fā)現(xiàn)circRNAs在植物中具有強大的調(diào)控作用[46]。對小麥(TriticumAestivumL.)的研究發(fā)現(xiàn)了62條響應(yīng)脫水脅迫的circRNA[47]。對番茄(solanumlycopersicumL.)的研究鑒定了163條響應(yīng)低溫脅迫的circRNA[48]。

    基于對大量非編碼RNA功能的研究,哈佛大學(xué)的研究人員提出了一種競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)調(diào)控假說,即mRNA、lncRNA、circRNA及假基因轉(zhuǎn)錄物通過miRNA應(yīng)答元件(MicroRNA Response Element,MRE)競爭結(jié)合相同的miRNA來影響靶基因的穩(wěn)定性或翻譯活性,實現(xiàn)轉(zhuǎn)錄后水平的基因表達調(diào)節(jié)[49]。全轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析方法的進步將ceRNA的研究擴展到了其他領(lǐng)域。例如,它參與了楊樹[50]對低氮的適應(yīng)、香橙[51]對銅毒性的反應(yīng),以及黃瓜[52]對熱脅迫的反應(yīng)。這些結(jié)果大大提高了我們對植物非生物脅迫反應(yīng)機制的認識。

    4.2 蛋白質(zhì)組學(xué)

    蛋白質(zhì)組學(xué)是以蛋白質(zhì)為對象,研究機體內(nèi)蛋白質(zhì)組成及含量變化規(guī)律的科學(xué)。由于蛋白質(zhì)是生理功能的執(zhí)行者,對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究將有助于直接從生理水平上闡明植物對環(huán)境脅迫的應(yīng)答機制。相對和絕對定量標(biāo)記(Isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)是當(dāng)前最可靠的蛋白質(zhì)組定量標(biāo)記技術(shù)之一[53],廣泛應(yīng)用于非生物脅迫下植物蛋白質(zhì)組變化的研究。Li等使用iTRAQ研究了甜菜單體附加系M14鹽脅迫下膜蛋白的變化[2]。Yu等人研究了短期鹽脅迫(30分鐘和1小時)誘導(dǎo)的M14葉片中蛋白質(zhì)組/磷酸化蛋白質(zhì)組的變化[3]。然而植物蛋白質(zhì)組對鹽脅迫的反應(yīng)取決于鹽脅迫的強度、持續(xù)時間和取樣部位,同時近年來的研究指出鹽處理可以分為漸進的(鹽脅迫處理)或立即的(鹽休克處理)[54],這些差異會引起植物不同的應(yīng)答反應(yīng),并可能影響對最終實驗結(jié)果的解釋[8]。目前關(guān)于甜菜蛋白質(zhì)組學(xué)的研究存在處理時間較短或處理低濃度較低等局限,因此,采用漸進式給鹽方式,研究高濃度長時間處理對甜菜幼苗蛋白質(zhì)組的變化有助于豐富甜菜蛋白水平鹽脅迫應(yīng)答的結(jié)果,為最終揭示甜菜鹽脅迫應(yīng)答分子機制提供基礎(chǔ)。

    圖3 ceRNA機制示意圖(a)ceRNA競爭miRNA機制示意圖,MRE:miRNA應(yīng)答元件;(b)ceRNA表達水平關(guān)系示意圖

    4.3 代謝組學(xué)

    代謝物既可以作為信號分子(如植物激素等)參與調(diào)控植物的信號轉(zhuǎn)導(dǎo),也可以直接作為效應(yīng)物(如作為滲透調(diào)節(jié)劑的甜菜堿和自由基清除劑的生育酚等)參與植物的生物和非生物脅迫應(yīng)答。與基因和蛋白質(zhì)相比,代謝產(chǎn)物更接近于表型,可以更加準確地反映各種調(diào)控的綜合結(jié)果。近年來隨著新技術(shù)的不斷涌現(xiàn),各組學(xué)的研究迅速向高通量化和定量化發(fā)展。由于轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的研究目標(biāo)共同處于一張代謝網(wǎng)絡(luò)中,使得這些組學(xué)之間存在一定的關(guān)聯(lián)性,基于此的多組學(xué)聯(lián)合分析已成為探索生命化學(xué)物質(zhì)基礎(chǔ)和深入解析其分子機制的新方向。

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