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    泛Kennard-Stone算法的數(shù)據(jù)集代表性度量與分塊采樣策略

    2022-10-14 09:40:56武晴瀅祝震予吳劍鳴徐昕
    關(guān)鍵詞:子集復(fù)雜度網(wǎng)格

    武晴瀅,祝震予,吳劍鳴,徐昕

    (復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系,上海 200438)

    在大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的機(jī)器學(xué)習(xí)建模中,針對擬解決的問題,搜集或主動(dòng)采集足量(或盡可能足量)的數(shù)據(jù)樣本,以組成建模所需的數(shù)據(jù)集,是進(jìn)行機(jī)器學(xué)習(xí)不可或缺的重要環(huán)節(jié)[1].Kennard-Stone(KS)算法(原文稱之為Computer-aided design of experiments,CADEX)于1969年由Kennard和Stone[2]提出,被證明是優(yōu)秀的數(shù)據(jù)集分割方法[3,4],迄今仍在廣泛應(yīng)用[5~8].為了滿足不同應(yīng)用需求,在傳統(tǒng)KS算法基礎(chǔ)上改進(jìn)的新算法不斷涌現(xiàn),如用馬氏距離代替歐氏距離的MDKS(Kennard-Stone algorithm based on Mahalanobis distance)[9],將因變量Y計(jì)入歐氏距離的SPXY(Sample set Partitioning based on jointX-Ydistances)[10]和考慮自變量和因變量權(quán)重的SSWD(Subset Selection based on Weightedxandyjoint Distances)[11],進(jìn) 一 步 將 核 函 數(shù) 距 離 代 替 歐 氏 距 離 的KSPXY(Kernel distance-based Sample set Partitioning based on jointX-Ydistances)[12]、考慮因變量預(yù)測誤差分布的SPXYE(Sample set Partitioning based on jointX-Y-Edistances)[13]、考慮特征向量間余弦距離的HSPXY(Sample subset Partition method based on joint Hybrid correlation and diversityX-Ydistances)[14],以及針對時(shí)間數(shù)據(jù)流的KSB(Kennard-Stone Balance Algorithm)[15].在上述方法中,除KSB外,其它方法可以看作為在傳統(tǒng)KS算法的特征空間“距離”本身挖掘算法在不同應(yīng)用方面的潛力.如,在歐氏距離、馬氏距離和余弦距離之外,還可以引入切比雪夫距離、閔可夫斯基距離及半正矢距離等[15],以期從原有數(shù)據(jù)集中獲得盡可能高代表性的子集,以適用不同的應(yīng)用需求.但這些方法采出的樣本集是否具有足夠的代表性,由于缺乏可實(shí)際量化的標(biāo)準(zhǔn),只能依靠最終的建模效果進(jìn)行事后評價(jià).本文從建模所需數(shù)據(jù)集的完備性入手,嘗試探討采樣集的代表性,提出可定量化采樣數(shù)據(jù)集代表性的一種通用性度量.此外,由于KS算法及其變種(泛KS算法)的計(jì)算復(fù)雜度為O(K3),限制了它們在大型數(shù)據(jù)集上采樣的效率.為此,提升算法效率有利于提高其可用性,同時(shí)采用分塊采樣策略,可以顯而易見地提升采樣效率.

    1 基本概念與條件設(shè)定

    1.1 數(shù)據(jù)集的完備性

    當(dāng)所組建的數(shù)據(jù)集對于擬采用的機(jī)器學(xué)習(xí)模型是“足量”的,意味著它們能夠以足夠的密度分布于模型的所有特征空間,可以完整地反映模型所需的各種數(shù)據(jù)特征.假設(shè)問題可由J個(gè)線性無關(guān)的特征來表示,即這些特征構(gòu)成J維的希爾伯特空間.若完整描述某個(gè)特征維度所需的最少數(shù)據(jù)量為N(jj=1~J),將該維度劃分出Nj個(gè)空間區(qū)域,每個(gè)區(qū)域保有一個(gè)數(shù)據(jù)樣本,相鄰空間區(qū)域的樣本盡量遠(yuǎn)離,這一數(shù)據(jù)集可稱為完備集.此時(shí),整個(gè)數(shù)據(jù)集所需的數(shù)據(jù)量至少為,同時(shí)要求每個(gè)樣本必須分屬不同的希爾伯特空間網(wǎng)格.

    當(dāng)每個(gè)特征維度僅有0和1兩種可能(即二分法),則這個(gè)模型為最簡單的模型,其完備集的樣本量為2J.倘若每個(gè)特征維度都是線性的,不考慮數(shù)據(jù)本身誤差的情況,其完備集的樣本量最小為2J或3J(Nj=3是為了避免同一維度中兩點(diǎn)過于接近導(dǎo)致數(shù)值上擬合斜率誤差過大).當(dāng)數(shù)據(jù)本身可能有一定誤差(但誤差較小的情況),且每個(gè)特征維度為線性或近似線性的,則每個(gè)特征維度通常至少需要5個(gè)點(diǎn),則完備集的數(shù)量至少要5J.當(dāng)問題比較復(fù)雜,其特征維度不能以線性描述,尤其是無法預(yù)知其具體的非線性函數(shù)時(shí)(這也是采用非線性神經(jīng)元的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型經(jīng)常遇到的情況),要完整表示這個(gè)維度的趨勢,所需的樣本點(diǎn)數(shù)量則難以估計(jì),急劇降低了獲取完備集的可能性.針對此情況,為了獲取盡可能完備的數(shù)據(jù)集,首先要確定每一個(gè)維度的上下界(適用范圍),然后進(jìn)行必要的網(wǎng)格劃分.原理上,網(wǎng)格的密度需與擬研究問題的模型梯度的變化量成正比.由于事實(shí)上大多情況下梯度變化量是預(yù)先不可知的,因此只能在建模初期,在可承受的范圍盡量提高網(wǎng)格密度.在初步建模擬合后,根據(jù)擬合模型中各區(qū)域的梯度變化量以及擬合誤差調(diào)整網(wǎng)格密度,實(shí)施補(bǔ)采樣,進(jìn)行再擬合,依此迭代至收斂.最終收斂得到的希爾伯特空間網(wǎng)格,暫且稱之為精細(xì)網(wǎng)格,也即只要每個(gè)精細(xì)網(wǎng)格中保有一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),所組成的數(shù)據(jù)集為該模型所需的完備集.

    1.2 數(shù)據(jù)集的可代表性

    當(dāng)一個(gè)數(shù)據(jù)集覆蓋了所有的精細(xì)網(wǎng)格,即其理論上擬解決問題的完備集是該數(shù)據(jù)集的子集,則可稱此數(shù)據(jù)集是“足量”的.由前述可知,對于高特征維度的復(fù)雜模型,“足量”數(shù)據(jù)的獲取是極其艱難的任務(wù).在很多情況下,由于沒有條件實(shí)施系統(tǒng)網(wǎng)格化數(shù)據(jù)采集(如,難以確定精細(xì)網(wǎng)格,或精細(xì)網(wǎng)格數(shù)量非常龐大,或難以按擬定的特征獲取數(shù)據(jù)),只能根據(jù)實(shí)際可獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行建模.當(dāng)一個(gè)數(shù)據(jù)集對于擬解決問題時(shí)“足量”,意味著該數(shù)據(jù)集包含一個(gè)完備集,同時(shí)還可能存在數(shù)據(jù)冗余,即某些精細(xì)網(wǎng)格區(qū)域存在不止一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),甚至存在兩兩相同(或極其相似/近)的數(shù)據(jù)點(diǎn).如果存在大量冗余數(shù)據(jù),不僅增加了模型擬合的代價(jià),冗余度不均也會給擬合模型帶來偏差.由于擬合過程中,一般的損失函數(shù)進(jìn)行誤差統(tǒng)計(jì)時(shí),對每個(gè)樣本是同等對待的,冗余度越大的網(wǎng)格空間對最終模型的貢獻(xiàn)也就越大.最終擬合模型對冗余度大的網(wǎng)格空間內(nèi)的數(shù)據(jù)點(diǎn)的擬合精度要高于數(shù)據(jù)稀疏的區(qū)域.非系統(tǒng)性網(wǎng)格化數(shù)據(jù)采集獲得的數(shù)據(jù)集,非“足量”卻又包含大量冗余甚至重復(fù)數(shù)據(jù)是很普遍的現(xiàn)象.

    在此種普遍情況下,從已有數(shù)據(jù)集G抽提出盡可能完備的子集G(rGr?G),即Gr占據(jù)G所分布的所有精細(xì)空間網(wǎng)格,使得Gr可以完全代表G,有利于以最小的代價(jià)建立合理的模型.假設(shè)一個(gè)數(shù)據(jù)集有K個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),第k點(diǎn)(1≤k≤K)包含了J個(gè)線性無關(guān)的特征xkj(1≤j≤J)組成的向量Xk,和對應(yīng)的預(yù)期結(jié)果Yk.每個(gè)特征分別有相應(yīng)的上界(Uj)和下界(Dj),即xkj∈[Dj,Uj]或xkj∈(Dj,Uj).當(dāng)精細(xì)網(wǎng)格的分布是均勻的(或每個(gè)特征維度均為近線性,或已變換成近線性的),相鄰網(wǎng)格之間的距離ε是恒定的.當(dāng)ε已知,可以應(yīng)用泊松盤采樣方法[16,17],從G抽提出G(r也可應(yīng)用KS采樣算法,并設(shè)定采樣距離r小于ε時(shí)終止采樣).事實(shí)上,擬解決問題在被理解透徹之前,精細(xì)空間網(wǎng)格的劃分不可知,因此ε也不可知.當(dāng)無法確定合適的ε時(shí),也就無法應(yīng)用泊松盤采樣方法獲取.當(dāng)ε越大時(shí),即空間網(wǎng)格越大,對整個(gè)特征空間的描述就越粗線條,反之越精細(xì).因此,可以以特征空間中距離r最遠(yuǎn)的兩個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)開始,不斷逐級縮小采樣距離r,同時(shí)確保所有已采樣本間的距離均不小于r,來實(shí)施采樣獲得Gr.KS算法等效地實(shí)現(xiàn)了這個(gè)過程.需要注意的是,經(jīng)典的KS算法不是以r的大小為終止采樣的判據(jù),而往往是以設(shè)定的擬采樣數(shù)目來終止采樣.當(dāng)不選擇r為0的情況,KS算法就排除了G中所有相同的數(shù)據(jù)點(diǎn).當(dāng)兩個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)距離小于ε時(shí),這兩個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)被認(rèn)為是相似或互為冗余的,設(shè)定r=ε時(shí)終止KS采樣,則可以篩除G中所有r<ε的冗余數(shù)據(jù).因此,選擇所有兩兩之間的距離r≥ε的數(shù)據(jù)組成的Gr可以完全代表G.

    2 算法與改進(jìn)

    2.1 經(jīng)典KS算法

    經(jīng)典KS算法提供了從一個(gè)含等構(gòu)數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集G中選取預(yù)定數(shù)目樣本的方法.這個(gè)數(shù)據(jù)集要求所包含的每個(gè)數(shù)據(jù)為包含n個(gè)特征的一維向量.為了確保篩選的樣本子集分布均勻,對于包含K個(gè)樣本的數(shù)據(jù)集G,Kennard和Stone[2]設(shè)計(jì)了以下多步操作:

    (1)首先計(jì)算兩兩樣本之間的歐氏距離dp,q,構(gòu)造所有數(shù)據(jù)樣本間的距離矩陣.

    式中:Xp和Xq分別為樣本p和q的特征.這部分的計(jì)算復(fù)雜度為O(K2n).

    為了保證計(jì)算獲得的歐氏距離在數(shù)值上的合理性,一般在進(jìn)行本步驟前,需將整個(gè)數(shù)據(jù)集的每個(gè)特征分別進(jìn)行歸一化,以確保計(jì)算歐氏距離過程中每種特征的貢獻(xiàn)一致.對于不同的KS變種,如SSWD[11],可以根據(jù)各特征的重要性程度統(tǒng)一調(diào)整不同特征的權(quán)重大小.

    (2)選出其中距離最大的兩個(gè)樣本(k=2).

    (3)對于每個(gè)剩余樣本[共(K-k)個(gè)],確定其與已選k個(gè)樣本之間的最短距離.

    然后,選擇這些最短距離中相對最長的距離rk+1=max{di,min,…,dK-k,min}所對應(yīng)的樣本,移入已采集的樣本池.

    (4)重復(fù)步驟(3),直至所采出的樣本個(gè)數(shù)達(dá)到事先確定的數(shù)目為止.

    步驟(2)~(4)的計(jì)算復(fù)雜度為O(K3).KS采樣的結(jié)果與數(shù)據(jù)集的樣本順序無關(guān).

    除了KS算法及其各種改進(jìn)版本外,還有許多方法用以從樣本庫中選擇具有代表性的子集,如隨機(jī)抽樣(RS).基于能量距離最小的支持點(diǎn)(Support Point)的SPlit[18]、PVLOO(Posterior Variance of Leave-One-Out cross-validation)[19]、Kohonen自 組 織 映 射[20]、D-optimum[21]、OptiSim(Optimizable K-Dissimilarity Selection)[22]、IOS(Isolation forest Outlier detection and Subset selection)[23]和GDBSCAN(Generalized Density Based Spatial Clustering of Applications with Noise)[24]等.RS憑借著其簡單易用性,無人為偏差,被廣泛應(yīng)用于樣本分割.當(dāng)數(shù)據(jù)集G的均勻性和冗余度很高時(shí),通過RS采集出的GRS具備包含Gr的可能性.在數(shù)據(jù)分布均勻的情況下,冗余度越高,可能性越大.然而GRS不能保證對G的代表性,尤其存在數(shù)據(jù)密度分布不均衡(如部分重要網(wǎng)格區(qū)域數(shù)據(jù)點(diǎn)稀疏)的情況.當(dāng)選出的數(shù)據(jù)集不包含部分邊界上的樣本,很可能導(dǎo)致非線性模型在邊界區(qū)域產(chǎn)生巨大的偏差,使得適用范圍受到壓縮且未能提前預(yù)知.泛KS算法是除RS以外最為常用的一類采樣算法,它們在機(jī)制上首先保證了數(shù)據(jù)集特征定義域邊界上的樣本被優(yōu)先采集,已采集樣本相互間盡可能遠(yuǎn)離,從而達(dá)到均勻篩選樣本的目的,在諸多應(yīng)用中被證明在樣本分割方面具有優(yōu)勢[3,4,7].

    2.2 采樣集代表性度量

    由經(jīng)典KS采樣算法可知,首先選擇的2個(gè)距離最大的樣本間的距離r2=rmax.第k個(gè)樣本被選中時(shí),其與已選擇的數(shù)據(jù)集中所有k-1個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的最小距離為rk.按此定義,不存在r1.當(dāng)rk=0,則余下的K-k個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)均為重復(fù)的數(shù)據(jù).因此,對于一個(gè)給定的數(shù)據(jù)集G,令為一個(gè)常數(shù).

    當(dāng)上述精細(xì)網(wǎng)格不可知,且數(shù)據(jù)集G中不存在絕對等價(jià)的數(shù)據(jù)樣本(即rK>0)時(shí),經(jīng)KS算法采出的k個(gè)樣本組成的數(shù)據(jù)集Gk對于G的代表性的判定,TK提供了一個(gè)度量,令Pk=TkTK×100%,則Pk可以作為一種可定量化的度量來表示Gk對于G的代表程度.由上述可知,當(dāng)rk=0時(shí),Tk=TK,即Gk為G完備的子集,可以完整地代表G,此時(shí)Pk=100%.當(dāng)Tk<TK,即rk>0時(shí),Pk<100%.若rk>ε,此時(shí),Gk不是G完備的子集,只能部分代表G,其代表性可用Pk來近似表示.對于給定的數(shù)據(jù)集G,當(dāng)P=0和P=100%時(shí)是精確的.從中選取Gk子集,其Pk值的大小可以反映數(shù)據(jù)集代表程度的高低.盡管P不滿足加和性,但對于一個(gè)給定的數(shù)據(jù)集,P的相對大小具有可比性.從定義而言,由于上述提到的“距離”并不限于歐氏距離,因此,P值不僅可以用于傳統(tǒng)的KS算法,也同樣適用于各種不同距離的泛KS算法.

    為了測試P值大小的實(shí)際效果,選取簡正振動(dòng)采樣的5400個(gè)甲烷分子結(jié)構(gòu)[25]中的所有21600個(gè)碳?xì)滏I組成的數(shù)據(jù)集為例.為了方便,每個(gè)碳?xì)滏I僅用2個(gè)特征來描述,第1個(gè)特征f1為每個(gè)碳?xì)滏I鍵長的倒數(shù),以原子單位表示,即a-10;第2個(gè)特征f2為該鍵的鍵環(huán)境,為考慮其它化學(xué)鍵對該鍵的影響,以其中,i=1,2,3分別為其它3個(gè)碳?xì)滏I,θi為該鍵分別與它們的夾角)表示.進(jìn)行KS采樣前,分別將兩個(gè)特征歸一化至0~1區(qū)間,數(shù)據(jù)分布如圖1(A)所示.

    在這個(gè)數(shù)據(jù)集所有21600個(gè)碳?xì)滏I中,僅有2個(gè)樣本間歐氏距離為0(小于10-6),冗余度極低,同時(shí),也表明不存在兩個(gè)完全等價(jià)的甲烷分子結(jié)構(gòu).當(dāng)設(shè)ε=10-6,如要求Pk=100%,則采樣數(shù)至少為21599.按照KS算法,從頭開始選擇距離最大的點(diǎn),直到最后將所有的點(diǎn)選出,即k=K.將rk對k作圖得到圖2.

    Fig.1 Feature distribution(2D)maps of the methane-based C—H bond dataset

    當(dāng)P=10%時(shí),KS選出61個(gè)點(diǎn).如表S1(見本文支持信息)中最右列的散點(diǎn)圖顯示,這部分點(diǎn)均勻分布在圖的各個(gè)區(qū)域,鄰近的兩點(diǎn)間距也較均勻,同時(shí)保留了圖1(A)中散點(diǎn)的大致邊界,此時(shí),rk=0.09462.而根據(jù)RS采樣,同樣采出61個(gè)點(diǎn),鄰近的兩點(diǎn)間距大小不均,無法看出整體邊界.當(dāng)P=20%時(shí),KS選出285個(gè)點(diǎn),鄰近的兩點(diǎn)間距仍較均勻,且r明顯更小(rk=0.03858).而RS采出的285個(gè)點(diǎn)組成的圖與原圖[圖1(A)]對比,可以看出,它著重采出原圖密度較大的區(qū)域.隨著采樣點(diǎn)逐步增加,P值相應(yīng)升高,上述趨勢表現(xiàn)一致.KS采樣過程的采樣距離從大到小選取樣本,事實(shí)上,將優(yōu)先選中處于最遠(yuǎn)離中心的邊界樣本,在采樣樣本數(shù)較小的情況下,已能還原數(shù)據(jù)集的輪廓與范圍,并表現(xiàn)出均勻的數(shù)據(jù)分布.在采樣距離逐步縮小的過程,在維持均勻的數(shù)據(jù)分布的同時(shí),逐步加大樣本分布的密度.而RS采樣隨著采樣的樣本量增加,逐步反映著原數(shù)據(jù)集的密度分布,無法確保顧及數(shù)據(jù)集的邊界,以及樣本相對稀疏的區(qū)域.當(dāng)P=50%時(shí),KS選出2431個(gè)點(diǎn)所組成的圖[圖1(C)]很好地還原了數(shù)據(jù)集的完整邊界與內(nèi)部細(xì)節(jié),此時(shí)rk=0.01041,實(shí)際采樣比例僅為11.25%,顯示出非常高的采樣效果,相比RS以同樣采樣數(shù)采出的圖[圖1(B)],其具有更高的還原度與可識別度.從P=60%起至P=90%,rk分別為0.00754,0.00545,0.00387和0.00249.因此,對于具體采樣問題,也可以根據(jù)rk的大小來判斷采樣是否充分.由數(shù)據(jù)集的精細(xì)網(wǎng)格尺寸ε可知,當(dāng)rk≤ε,可以認(rèn)定采樣集的代表性為100%,則特別地,當(dāng)數(shù)據(jù)集存在冗余數(shù)據(jù),則冗余部分的樣本在P=100%之前,不會被選取,因此,可以根據(jù)P值或rk的數(shù)值來剔除冗余度.從這個(gè)意義上,P值或rk都可用來確定所需采樣數(shù)k.

    2.3 KS采樣算法效率的提高

    盡管,與RS相比,KS采樣算法可以以較小比例的采樣數(shù)獲取較高代表性的采樣集Gk.但是,KS采樣算法的計(jì)算復(fù)雜度不是線性的.它的第一個(gè)主要步驟(1),需要計(jì)算所有樣本的兩兩間距離(不限于歐氏距離、馬氏距離和其它距離),計(jì)算復(fù)雜度為O(K2n).對于一個(gè)給定的等構(gòu)的數(shù)據(jù)集,特征數(shù)量n是固定的,n融入前置因子,計(jì)算復(fù)雜度為O′(K2).當(dāng)數(shù)據(jù)集樣本量K很大時(shí),尤其是大數(shù)據(jù)時(shí)代的數(shù)據(jù)集往往很大,導(dǎo)致此步驟的計(jì)算量特別龐大.該步驟中的距離計(jì)算相互沒有關(guān)聯(lián),容易分布式并行實(shí)現(xiàn).而接下來的篩選過程[第二步驟:(2)~(4)],需要根據(jù)rk從大到小依次采樣,而且rk的數(shù)值需要等第k-1個(gè)樣本確定后才能確定,因此不能對樣本量K實(shí)施并行算法,只能在每個(gè)具體樣本的篩選過程中進(jìn)行局部算法并行化,降低了算法的并行效率.此外,數(shù)據(jù)集樣本量的大小在加劇算法計(jì)算量的同時(shí)也加大了對內(nèi)存的需求.當(dāng)內(nèi)存不足以存放所有樣本的兩兩距離矩陣時(shí),算法的效率還將受磁盤讀寫速度的瓶頸影響而急劇降低,乃至失去可用價(jià)值.

    注意到篩選過程中存在重復(fù)比較大小的過程.對于某個(gè)已選樣本i,與(K-k)個(gè)剩余樣本間的最短距離di,min在上一個(gè)采樣(第k個(gè))循環(huán)中已經(jīng)比較過{di,1,…,di,k}中的大小.因此,在內(nèi)存許可的情況下,對該距離向量進(jìn)行動(dòng)態(tài)維護(hù),實(shí)際只需對上一循環(huán)的di,min與di,(k+1)進(jìn)行比較,往往可以在每個(gè)循環(huán)中減少O(K)量級的求最小值的計(jì)算量,使計(jì)算復(fù)雜度由O(K3)降至O(K2).最近,在空間填充設(shè)計(jì)(Space-filling design)領(lǐng)域的算法中,也報(bào)道了運(yùn)用動(dòng)態(tài)規(guī)劃避免重復(fù)比較大小的類似做法[26].結(jié)果使KS采樣算法的前后兩個(gè)步驟的計(jì)算復(fù)雜度均為O′(K2).

    此外,對于超大樣本量數(shù)據(jù)集,O′(K2)仍為難以承受的情況,可以采取分別處理的折中做法,即,將整個(gè)數(shù)據(jù)集G切分成較小的S個(gè)子集Gs(s=1,2,…,S),每個(gè)子集分別實(shí)施KS采樣,再將采樣后的數(shù)據(jù)集匯總.這不僅降低了計(jì)算兩兩距離的復(fù)雜度O′(K2)中的K,同時(shí),也減少了后續(xù)的從最短距離中取最大值的比較過程[2.1節(jié)步驟(3)和(4)]中的K.由于實(shí)際每個(gè)子集的樣本量最大值受到計(jì)算資源的限制,以及計(jì)算效率的考慮,要求K/S有限.因此,隨著K增大,子集數(shù)量S必然相應(yīng)增大以確保K/S有限,最終總的實(shí)際計(jì)算復(fù)雜度為

    接下來,需要考慮這種分塊采樣策略能否保證最終采樣集的代表性.由于G切分成若干個(gè)子集Gs,不同子集間的樣本,其特征空間大概率存在交錯(cuò).可以預(yù)見在此情況下,從一個(gè)子集Gs中采出的,與相鄰特征空間的另一個(gè)子集Gs′中采出的Gsk′,存在樣本間特征距離小于各子集采樣時(shí)的最小rk.基于此,可按數(shù)據(jù)特征空間劃分子集,或簡單地將數(shù)據(jù)集G按照某一主要特征維度排序后再切分,以避免子集間的特征空間交錯(cuò).但仍存在相鄰子集的特征空間相互接壤,由于子集采樣過程中,特征空間邊界的數(shù)據(jù)點(diǎn)往往被優(yōu)先采集,使得處于特征空間相鄰的子集中采樣點(diǎn)存在彼此距離較近的情況.在實(shí)際應(yīng)用過程中,即使存在少量rk較小的數(shù)據(jù),僅略微提高了數(shù)據(jù)冗余度,對模型建立的影響較小,甚至可以忽略.從更嚴(yán)格的要求上,如果在合并后的Gk集基礎(chǔ)上再做一輪KS采樣,足以排除合并導(dǎo)致的部分?jǐn)?shù)據(jù)間存在rk較小的情況,但仍需面對合并后的Gk集進(jìn)行再采樣的計(jì)算消耗.另外,要對大型數(shù)據(jù)集按特征空間實(shí)施系統(tǒng)性切分,所需要的排序過程也是非常耗時(shí)的.因此隨機(jī)劃分,或直接按已有的順序切分成多個(gè)子集,再分別進(jìn)行KS采樣,較為現(xiàn)實(shí).

    3 實(shí)驗(yàn)部分

    為了驗(yàn)證以這種方式進(jìn)行分塊KS采樣的有效性,基于文獻(xiàn)[10,12,14]中常用的柴油近紅外光譜數(shù)據(jù)集[27],采用偏最小二乘(Partial least-squares,PLS)回歸方法[28]構(gòu)建通過近紅外光譜預(yù)測柴油質(zhì)量特性的模型,用于檢驗(yàn)對比.在該數(shù)據(jù)集中,近紅外光譜采集范圍為750~1550 nm,狹縫寬度為2 nm,則每個(gè)數(shù)據(jù)樣本包含401個(gè)光譜特征.選擇每種柴油的50%餾出溫度(bp50)、15℃時(shí)的密度(d4052)和總芳烴含量質(zhì)量百分比(Total)3個(gè)質(zhì)量特性作為測試對象.在篩除所有空缺或不完整的數(shù)據(jù)點(diǎn)后,數(shù)據(jù)集的基礎(chǔ)統(tǒng)計(jì)信息列于表1.

    Table 1 Dataset statistics of three diesel fuel propertiesa

    針對這個(gè)PLS回歸實(shí)驗(yàn),應(yīng)用KS算法的目的是將數(shù)據(jù)集劃分為校準(zhǔn)集和預(yù)測集兩個(gè)子集.通過調(diào)整校準(zhǔn)集占總數(shù)據(jù)集的比例,來檢驗(yàn)不同代表性的數(shù)據(jù)集的建模能力.其中校準(zhǔn)集用于估計(jì)其潛在變量的最佳數(shù)量,來確定偏最小二乘模型的復(fù)雜度,并建立校準(zhǔn)模型.預(yù)測集用于評估所構(gòu)建校準(zhǔn)模型的預(yù)測能力,采用擬合優(yōu)度(R2)來評估模型的預(yù)測效果.

    為了對比不同數(shù)據(jù)集分塊方案的效果,以總數(shù)據(jù)集直接KS采樣的建模結(jié)果為基準(zhǔn),采取按原始數(shù)據(jù)順序劃分子集和隨機(jī)順序劃分子集兩種模式,為了避免隨機(jī)算法的偶然性,平行做A,B,C 3次隨機(jī)分集.基于樣本總數(shù)量為385~392之間,每個(gè)分塊子集最多60個(gè)樣本.

    從表2可知,由于PKS為按KS算法全采樣后,特征距離rk從大到小排列所加和獲得的Tk值與總TK值的比,因此,PKS必定大于等于其它方式所選集的P值.此外,由于Sequential是按原特征既定順序排列的,避免了子集間數(shù)據(jù)點(diǎn)的特征空間交錯(cuò),因此,所得P值要大于等于隨機(jī)排序后再分塊(Random-A/B/C)的情況.從最終的各模型擬合優(yōu)度R2可見,大小趨勢也與P值基本正相關(guān),進(jìn)一步反映了P值設(shè)計(jì)的合理性.分塊采樣后,各擬合模型的擬合優(yōu)度R2sequential和R2ramdom-A/B/C,與整體KS篩選得到的樣本構(gòu)造出的PLS回歸模型擬合優(yōu)度R2差值大致保持在0.01以內(nèi).結(jié)果表明,分塊篩選的方式可以在提高篩選效率的同時(shí),合理地采出具有合理代表性的樣本集.從具象化的結(jié)果,以及PLS回歸測試的結(jié)果,均能反映出P值的定量化效果.但它也存在不足,即,P值盡管在0和100%是精確的,中間數(shù)值僅對單個(gè)數(shù)據(jù)集的KS采樣結(jié)果有相對意義,而不具備數(shù)學(xué)意義上的加和性.關(guān)于數(shù)據(jù)集“代表性”度量的提法,基于分類目的的算法關(guān)注其數(shù)據(jù)點(diǎn)在聚類區(qū)間的分布量[29],而本文更關(guān)注回歸算法所需的數(shù)據(jù)集的完備性.

    Table 2 Performance tests of different slicing KS sampling strategies

    此外,由于KS類算法的計(jì)算復(fù)雜度為O(K3),與其樣本總數(shù)K緊密相關(guān),進(jìn)行超大數(shù)據(jù)樣本量的篩選時(shí),其算法效率限制了其應(yīng)用.針對此問題,對KS采樣的篩選過程施行動(dòng)態(tài)規(guī)劃,可將原本的計(jì)算復(fù)雜度從O(K3)降至O′(K2);提出分塊采樣的解決方案,進(jìn)一步將計(jì)算復(fù)雜度從O′(K2)降至O′′(K),并通過PLS回歸測試,達(dá)到了預(yù)期效果,在提高篩選效率的同時(shí),合理采出具有合理代表性的樣本集.

    4 結(jié) 論

    在大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的機(jī)器學(xué)習(xí)建模過程中,由于特征空間維度J往往不是一個(gè)很小的數(shù),實(shí)際數(shù)據(jù)集要覆蓋所有特征空間精細(xì)網(wǎng)格幾乎是不可能完成的任務(wù).從實(shí)際盡可能匯集到的數(shù)據(jù)集中篩選出能夠代表該數(shù)據(jù)集的訓(xùn)練集(或校準(zhǔn)集),是機(jī)器學(xué)習(xí)建模成功的關(guān)鍵基礎(chǔ).傳統(tǒng)的KS采樣算法,及用各種定義的“距離”替代原有的歐氏距離的改進(jìn)版本,為不同應(yīng)用領(lǐng)域的樣本篩選提供了強(qiáng)有力的算法基礎(chǔ).這些方法原理上均可以篩除數(shù)據(jù)集中的重復(fù)樣本,當(dāng)可以定義精細(xì)網(wǎng)格間距ε時(shí),設(shè)定最小采樣距離rk≥ε可以篩除冗余樣本,以提高建模效率,并降低數(shù)據(jù)密度分布不均帶來的偏差.由于數(shù)據(jù)集代表性迄今仍未有一個(gè)定量化的度量,無法在建模前判斷采樣是否充分,本文提出了以實(shí)際采出的訓(xùn)練集(或校準(zhǔn)集)中每個(gè)樣本的采樣距離的和(或積分值)Tk與所有樣本的TK的比值P,來定量化表示泛KS算法抽提出的訓(xùn)練集所能代表總數(shù)據(jù)集的程度.針對KS復(fù)雜度問題,對KS采樣的篩選過程施行動(dòng)態(tài)規(guī)劃,并提出分塊采樣的解決方案,將計(jì)算復(fù)雜度從O(K3)降至O′′(K),在提高篩選效率的同時(shí),采出具有合理代表性的樣本集.同時(shí),事先對數(shù)據(jù)集中至少一個(gè)特征維度進(jìn)行排序再分集,可有效避免各子集的特征空間交錯(cuò)導(dǎo)致采樣效果(匯總后的訓(xùn)練集的均衡度)降低.特別當(dāng)數(shù)據(jù)集中樣本分布極度不均衡的情況下,如大部分特征空間區(qū)域樣本稀疏,而極小部分特征空間存在大量冗余樣本時(shí),預(yù)先按關(guān)鍵特征維度排序后再分集采樣,有助于保障分塊采樣策略的效果.如有必要,在計(jì)算資源許可的情況下(匯總的采樣集樣本數(shù)K不太大),對匯總的采樣集再實(shí)行一次KS采樣,可以獲得嚴(yán)格的采樣集.

    支持信息見http://www.cjcu.jlu.edu.cn/CN/10.7503/cjcu20220397.

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