美國《Emerging Infectious Diseases》2022年第6期有關人獸共患病論文摘譯

P1101 美國俄勒岡州某社區(qū)，病例檢測前通過廢水監(jiān)測檢測SARS-CoV-2 B.1.351(β)變體//Melissa Sutton, Tyler S. Radniecki, Devrim Kaya,等

基因組監(jiān)測已成為SARS-CoV-2大流行期間的關鍵監(jiān)測方法。廢水監(jiān)測有可能識別和跟蹤社區(qū)中的SARSCoV-2變體，包括新出現(xiàn)的變體。我們利用多位點序列分型來識別廢水中SARS-CoV-2變體的新方法，在個別臨床標本發(fā)現(xiàn)該變體之前12 d觀察到在美國俄勒岡州林恩縣的廢水中出現(xiàn)B.1.351(β)變體。研究期間，我們鑒定了42個B.1.351臨床標本，分為3個系統(tǒng)發(fā)育分支。林恩縣19個臨床標本中的18個和所有廢水B.1.351標本均聚集在第1類。研究結果進一步提供了廢水監(jiān)測報告當?shù)豐ARS-CoV-2序列信息可靠性的證據(jù)。

P1110 2017-2020年美國加利福尼亞州圣地亞哥耐抗生素志賀菌//Thaidra Gaufn, Jill Blumenthal, Claudia Ramirez-Sanchez,等

每年，志賀氏菌引起全球約1.88億腹瀉病例，其中50萬例發(fā)生在美國，抗菌藥物耐藥率逐年上升。為了確定美國加利福尼亞州圣地亞哥的抗菌藥物耐藥性及風險因素，我們回顧性分析了2017—2020年間由福氏志賀菌和宋內(nèi)氏志賀菌引起的腹瀉病例。128例病例中，福氏志賀菌比福氏志賀菌略為常見；大多數(shù)病例發(fā)生在同性戀或雙性戀男性、艾滋病毒攜帶者、無住所或使用甲基苯丙胺者。阿奇霉素、氟喹諾酮、氨芐西林和甲氧芐啶/磺胺甲惡唑(TMP/SMX)的耐藥率與疾病預防控制中心報告的最新國家數(shù)據(jù)一致；55%的分離株對阿奇霉素耐藥，23%對氟喹諾酮耐藥，70%對氨芐西林耐藥，83%對二氯甲烷/三氯甲烷耐藥。我們發(fā)現(xiàn)TMP/SMX的比值略高于國家公布數(shù)據(jù)。

P1117 2009-2018年美國國家監(jiān)測報告的食源性疾病疫情//Alice E. White, Alexandra R. Tillman, Craig Hedberg,等

國家監(jiān)測系統(tǒng)報告的食源性疫情僅為美國所有疫情的一部分；并非所有疫情都有檢測、調(diào)查和報告。我們描述了2009-2018年報告的疫情的形成因素和疫情特征。根據(jù)每1 000萬人口報告的疫情數(shù)量，我們將各州(加上DC)分為高(最高1/5)、中(中間3/5)或低(最低1/5)報告者。分析表明，各州報告的食源性疫情數(shù)量和類型存在很大差異。高報告州的疫情是低報告州的4倍。低報告者比高報告者更有可能報告更嚴重的疫情，較少涉及到環(huán)境或食物載體；報告的食物載體類型存在統(tǒng)計學差異。人均收入與報告的多少密切相關。公共衛(wèi)生規(guī)劃的投入對疫情報告有著重要的影響。

P1128 2015-2019年加拿大成年人感染醫(yī)療相關和社區(qū)相關艱難梭菌的特征//Tim Du, Kelly B. Choi, Anada Silva，等

我們調(diào)查了2015—2019年間加拿大醫(yī)院感染監(jiān)測的成年患者，分析醫(yī)療保健相關(HA)和社區(qū)相關(CA)艱難梭菌感染(CDI)的流行病學和分子特征。共分析18 455例CDI病例，13 735例(74.4%)HA和4 720例(25.6%)CA。2015—2019年期間，HA的CDI率下降了23.8%，而CA下降了18.8%。與CA-CDI相比，HA-CDI與30 d全因死亡率增加顯著相關(P<0.01)。分析的2 506個分離株中，最常見的核糖型(RTs)為RT027、RT106、RT014和RT020。無論采集類型如何，與非RT027相比， RT027與CDI歸因死亡密切相關。除莫西沙星外，所有受試藥物的總耐藥率一致。成人HA和CA的CDI發(fā)病率下降，與RT027和RT106的患病率變化一致。預防和控制感染及持續(xù)的國家監(jiān)測是CDI流行病學、調(diào)查和控制的有力保障。

P1137 美國新墨西哥州2只灰狐中攜帶的蝙蝠相關變異狂犬病病毒//Rene E. Condori, Adam Aragon, Mike Breckenridge，等

西半球，蝙蝠相關狂犬病病毒(RABV)在多個哺乳動物宿主中建立了傳播路徑，形成了遺傳上不同的譜系。美國新墨西哥州，臭鼬、蝙蝠和灰狐是狂犬病宿主，因與人類接觸而造成公共健康風險。2015—2019年，新墨西哥州林肯縣的2只灰狐(Urocyon cinereoargenteus)中檢測到兩種以前未識別的RABV。核蛋白基因的系統(tǒng)發(fā)育分析表明，分離株是一種新的RABV變體。這可能表明了從未知蝙蝠宿主到灰狐的重復溢出。新墨西哥州狂犬病病例的分子流行病學分析表明，其他跨物種傳播事件是已知對新墨西哥州有致病菌作用的病毒變異的結果。盡管美國有健全的狂犬病公共衛(wèi)生監(jiān)測系統(tǒng)，但隨著檢測和監(jiān)測技術的進步，仍會發(fā)現(xiàn)以前未識別的人獸共患病病原體。

P1146 急性登革熱感染對男性精子和體液病毒清除的影響//Joffrey Mons, Dominique Mahé-Poiron, Jean-Michel Mansuy，等

我們收集了Réunion島的10名感染者在癥狀出現(xiàn)后7、15、30、60和90 d的樣本，研究了登革熱病毒(DENV)對精液的影響。我們評估了精液和生殖激素的特征，并從精液中分離出活動精子。研究采用逆轉錄PCR檢測精液中的DENV，并通過病毒分離在Vero E6細胞培養(yǎng)中尋找DENV RNA。4名感染者的DENV RNA陽性精液樣本>1份；2名志愿者在第15 d和第30 d的精液中有DENV RNA陽性。沒有活動精子呈DENV陽性。暴露于陽性精液后，少數(shù)Vero E6細胞對DENV抗原呈陽性染色，表明復制病毒水平較低。我們發(fā)現(xiàn)DENV在精液中的持續(xù)時間比在血液中的持續(xù)時間短。這些結果提示了登革熱病毒在急性登革熱疾病后短期內(nèi)，可能通過性傳播導致精子可逆性改變(圖1)。

P1154 貓和狗中SARS-CoV-2感染和疾病的危險因素//Dorothee Bienzle, Joyce Rousseau, David Marom,等

我們通過定量PCR檢測了加拿大安大略省家庭寵物的拭子樣本中的SARS-CoV-2，并調(diào)查了寵物主人與感染和血清陽性相關的風險因素。我們測試了家養(yǎng)寵物以及庇護所和低成本閹割診所動物的血清樣本中的棘突蛋白IgG和IgM。在家養(yǎng)寵物中，2%(1/49)的狗拭子樣本和7.7%(5/65)的貓拭子樣本為PCR陽性，但41%的狗血清樣本和52%的貓血清樣本為SARS-CoV-2 IgG或IgM陽性。寵物樣本中SARS-CoV-2血清陽性的可能性較高的是貓，而不是睡在主人床上的狗，以及感染新疾病的狗和貓。絕育診所樣本的血清陽性率為16%(35/221)；在避難所樣本中，9.3%(7/75)。檢測結果表明，COVID-19感染者家庭中的寵物血清轉化和患病的可能性很高。

P1198 西非布基納法索2017年登革熱病毒暴發(fā)的回顧性基因特征分析//Andrew G. Letizia, Catherine B. Pratt, Michael R. Wiley,等

為了進一步了解非洲登革熱病毒(DENV)的當代基因組成，本研究通過對西非布基納法索2017年登革熱疫情樣本的下一代測序，分離出29個登革熱基因組(5個血清型1，16個血清型2[DENV-2]和8個血清型3)。系統(tǒng)發(fā)育分析證明了登革病毒-2在布基納法索的流行性特征。研究發(fā)現(xiàn)，不一致的診斷結果可能與這些基因組和三重PCR之間的遺傳差異有關。正向和反向1引物在映射到DENV-2基因組時存在單個錯配，這可能解釋了分子測試的不敏感性。雖然與這些基因組相比，登瓦夏和四聯(lián)疫苗株以及B細胞表位之間具有相當大的同質性，但應注意到了獨特的差異。因此，需要對非洲的登革熱病毒進行持續(xù)監(jiān)測，理清新型循環(huán)病毒種群進化動態(tài)，為制定有效的診斷、治療和預防對策提供依據(jù)。

(福建省疾病預防控制中心 王曉歡 譯)