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    米黑根毛霉甘露聚糖酶的定向進化、高效表達與應(yīng)用

    2022-08-17 11:12:28李延嘯馬俊文閆巧娟江正強
    關(guān)鍵詞:寡糖魔芋聚糖

    李延嘯, 馬俊文, 閆巧娟, 武 建, 張 偉, 江正強

    (1. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 工學(xué)院/中國輕工業(yè)食品生物工程重點實驗室, 北京 100083;2. 北京瓜爾潤科技股份有限公司,北京 100101;3. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 食品科學(xué)與營養(yǎng)工程學(xué)院,北京 100083;4. 南京財經(jīng)大學(xué) 食品科學(xué)與工程學(xué)院/江蘇省現(xiàn)代糧食流通與安全協(xié)同創(chuàng)新中心,江蘇 南京 210023)

    魔芋粉是一種來源于魔芋(Amorophophallus konjac)塊莖的天然植物膠,具有多種功能活性,如控制餐后血糖、增強飽腹感、潤腸通便等,被國際上譽為“十大健康食品”之一[1]。 魔芋粉具有良好的持水力、增稠性和穩(wěn)定性,廣泛用于多種食品中,以改善食品品質(zhì)。 魔芋粉的主要成分是葡甘露聚糖,是一種由葡萄糖和甘露糖 (物質(zhì)的量比為1.0∶1.6)通過β-1,4-糖苷鍵連接而成的線性多糖,可作為生產(chǎn)甘露寡糖的重要原料[2]。 魔芋粉在低濃度下即可形成高黏度凝膠狀溶液,阻礙了水解時體系內(nèi)分子移動和傳質(zhì)傳熱,嚴重降低了魔芋甘露寡糖的生產(chǎn)效率[3]。 因此,需要開發(fā)一種能夠高效水解高濃度魔芋粉的生產(chǎn)方法,以提高魔芋甘露寡糖的生產(chǎn)效率。

    與化學(xué)和物理降解法相比,酶法水解魔芋粉生產(chǎn)甘露寡糖具有條件溫和、過程可控、綠色環(huán)保等多種優(yōu)勢, 是最具應(yīng)用潛力的甘露寡糖生產(chǎn)方法。酶法生產(chǎn)過程中,最重要的酶是甘露聚糖酶(mannanase,EC 3.2.1.78), 能夠隨機水解甘露聚糖主鏈中的β-1,4-糖苷鍵,產(chǎn)生低聚合度的甘露寡糖[4]。 目前,已有一些甘露聚糖酶用于水解魔芋粉生產(chǎn)甘露寡糖,但這些甘露聚糖酶水解時所用底物濃度通常較低。例如白曲霉(Aspergillus kawachii)來源的甘露聚糖酶水解10 mg/mL 魔芋粉, 可以產(chǎn)生聚合度2~4的甘露寡糖,產(chǎn)物重均分子量約為2 000[5];枯草芽孢桿菌 (Bacillus subtilis) 來源的甘露聚糖酶水解50 mg/mL 魔芋粉,可以產(chǎn)生聚合度大于2 的一系列甘露寡糖[6]。 因此,發(fā)掘一種能夠高效水解魔芋粉的甘露聚糖酶,對魔芋甘露寡糖的工業(yè)化生產(chǎn)至關(guān)重要。

    定向進化、理性設(shè)計等分子改造手段是提高甘露聚糖酶酶學(xué)性質(zhì)和催化效率的有效手段。 白曲霉甘露聚糖酶通過理性設(shè)計實現(xiàn)了分子改造,所得突變體D273-V308 的最適溫度提高了5 ℃,75 ℃下的半衰期增加了73.9%[7]。 通過理性設(shè)計對黑曲霉(A. niger)甘露聚糖酶進行了分子改造,使其水解特性發(fā)生明顯改變,產(chǎn)物中高聚合度的寡糖組分含量明顯增多[8]。 通過定向進化對米黑根毛霉(Rhizomucor miehei)甘露聚糖酶進行了分子改造,所得突變體與野生型甘露聚糖酶相比, 最適pH 降低2.5,最適溫度提高10 ℃, 在酸性高溫下的催化效率提高3 倍以上[9]。 此外,高產(chǎn)的甘露聚糖酶是工業(yè)化生產(chǎn)甘露寡糖的前提與基礎(chǔ)。 目前,已有一些甘露聚糖酶在畢赤酵母(Pichia pastoris) 中實現(xiàn)了高效表達,如來源于樟絨枝霉和枯草芽孢桿菌的McMan5B和Bman26-MEIR[10-11]。 由于水解特性和催化效率不足,這些甘露聚糖酶不適合用于水解魔芋粉生產(chǎn)甘露寡糖。 因此,對現(xiàn)有甘露聚糖酶進行分子改造,實現(xiàn)甘露聚糖酶的高效表達,提高其對魔芋粉的水解效率,對魔芋甘露寡糖的工業(yè)化生產(chǎn)具有重要意義。

    米黑根毛霉是一種重要的絲狀真菌,能夠產(chǎn)生多種脂肪酶、蛋白酶和半纖維素酶[12-14]。 作者所在團隊前期研究中,從米黑根毛霉中發(fā)掘了一個糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)5 家族的甘露聚糖酶,該酶具有優(yōu)良的酶學(xué)特性和水解特性,水解魔芋粉主要產(chǎn)生聚合度2~5 的甘露寡糖,在魔芋甘露寡糖生產(chǎn)中具有良好的應(yīng)用潛力[15]。 作者通過定向進化技術(shù)對該酶進行分子改造,以期提高該酶對魔芋粉的水解效率, 并將該酶在畢赤酵母中高效表達,為魔芋甘露寡糖的高效生產(chǎn)提供依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 菌種與質(zhì)粒

    1.2 試劑與儀器

    甘露寡糖(甘露二糖、甘露三塘、甘露四糖、甘露五糖、甘露六糖)、DP10 葡聚糖:愛爾蘭Megazyme公司產(chǎn)品;槐豆膠(LBG):美國Sigma-Aldrich 公司產(chǎn)品;魔芋粉(葡甘露聚糖質(zhì)量分數(shù)≥80%,甘露糖與葡萄糖物質(zhì)的量比為1.62∶1.00): 湖北強森魔芋科技有限公司產(chǎn)品;其他試劑均為市售國產(chǎn)分析純。

    1260 Infinity II system 高效液相色譜儀、G7162A 型示差折光檢測器: 美國Agilent 公司產(chǎn)品;Shodex Sugar KS-802 色譜柱:日本Shodex 公司產(chǎn)品;?KTA 蛋白純化系統(tǒng): 美國GE Healthcare 公司產(chǎn)品;100 L 發(fā)酵罐:上海國強生化工程裝備有限公司產(chǎn)品。

    1.3 甘露聚糖酶(RmMan5A)突變體文庫構(gòu)建

    易 錯 PCR 利 用 引 物RmMan5AF(CGCGGATCCGCTTCTTCGTTTGTCCAGACAAG)和RmMan5AR (CCGCTCGAGCTACTTCTTGGCCATGG CATCAGC), 以質(zhì)粒pET-28a-RmMan5A為模板進行擴增。 產(chǎn)物經(jīng)1 g/dL 瓊脂糖凝膠回收后,用DNaseI 進行隨機片段化處理, 隨后用過酚/氯仿/異戊醇(體積比為25∶24∶1)和氯仿/異戊醇(體積比為24∶1)兩步抽提純化,得到隨機片段化后的DNA 片段。 以上述DNA 片段為模板,進行無引物重疊延伸PCR,得到重疊延伸PCR 產(chǎn)物。 再以上述重疊延伸PCR 產(chǎn)物為模板, 使用引物RmMan5AF 和RmMan5AR 進行PCR 擴增。 PCR 擴增產(chǎn)物經(jīng)限制性內(nèi)切酶BamH I 和XhoI 雙酶切,與載體pET-28a連接后電轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),即得到甘露聚糖酶(RmMan5A)突變體文庫。

    1.4 甘露聚糖酶(RmMan5A)突變體文庫高通量篩選

    甘露聚糖酶(RmMan5A)突變體文庫的高通量篩選分為初篩和復(fù)篩。 首先,使用LBG-剛果紅平板法對突變體文庫進行初篩,篩選具有甘露聚糖酶活性的陽性克隆。 再利用LB 搖瓶培養(yǎng)基對陽性克隆進行復(fù)篩:將初篩獲得的陽性克隆接種于10 mL LB培養(yǎng)基中, 在37 ℃、200 r/min 下培養(yǎng)至發(fā)酵液在600 nm 處的吸光度(OD600)達0.6~0.8,加入終濃度為1 mmol/L 的IPTG, 在30 ℃、200 r/min 下繼續(xù)培養(yǎng)4 h 誘導(dǎo)菌株產(chǎn)酶,離心(10 000g、5 min)收集菌體,經(jīng)超聲破壁獲得陽性克隆的粗酶液,測定粗酶液在pH 7.0、55 ℃下對魔芋粉的比酶活力, 并以比酶活力有所提高的突變體為正向突變體。

    1.5 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)在大腸桿菌中表達與純化

    重組大腸桿菌接種于10 mL 含有50 μg/mL 卡那霉素的LB 培養(yǎng)基中, 在37 ℃、200 r/min 下培養(yǎng)過夜制備種子液。種子液以體積分數(shù)1%接種量接種于200 mL 相同的LB 培養(yǎng)基中,在相同條件下培養(yǎng)至發(fā)酵液OD600達0.6~0.8 后, 加入終濃度為1 mmol/L 的IPTG,在30 ℃、200 r/min 下誘導(dǎo)過夜。離心(10 000g、5 min) 收集菌體, 并用緩沖液A(20 mmol/L 磷 酸 緩 沖 液、pH 8.0,300 mmol/L NaCl,20 mmol/L 咪唑)懸浮菌體,超聲破壁,離心(10 000g、10 min)收集上清液(即粗酶液)。

    利用Ni-NTA 親和層析柱對甘露聚糖酶進行純化。用緩沖液A 平衡親和層析柱,粗酶液以0.5 mL/min的流量上樣,分別用緩沖液A 和B(20 mmol/L 磷酸緩沖液、pH 8.0,300 mmol/L NaCl,50 mmol/L 咪唑)洗脫5 個柱體積,再用緩沖液C(20 mmol/L 磷酸緩沖 液、pH 8.0,300 mmol/L NaCl,200 mmol/L 咪 唑)洗脫目的蛋白。 洗脫過程在?KTA 蛋白純化系統(tǒng)上進行,流動相流量為1.0 mL/min。收集有酶活的組分后,在50 mmol/L 檸檬酸-磷酸緩沖液(pH 7.0)中低溫透析過夜,用十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)分析蛋白質(zhì)純度。

    肇慶市政府指定疏浚物處理項目由肇慶市國資委管理,肇慶市國資委委托城投公司組織公開招投標(biāo)。最終,方少瑜名下的廣州市安邦裝飾工程有限公司以約6500萬元中標(biāo)。

    1.6 甘露聚糖酶酶活力和蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度測定

    甘露聚糖酶酶活力的測定采用3,5-二硝基水楊 酸 法 (DNS 法)[16], 以0.5 g/dL 槐 豆 膠 溶 液(50 mmol/L 檸檬酸-磷酸緩沖液、pH 7.0)作為底物,900 μL 底物與100 μL 用50 mmol/L 檸檬酸-磷酸緩沖液(pH 7.0)適當(dāng)稀釋后的酶液混合在55 ℃下反應(yīng)10 min。加入1 mL DNS 試劑,沸水浴15 min 后加入1 mL 40 g/dL 酒石酸鉀鈉,冷卻至室溫后在540 nm下測定吸光度。 以甘露糖為標(biāo)準計算反應(yīng)生成還原糖的含量。 在上述反應(yīng)條件下,每分鐘釋放1 μmol還原糖所需要的酶量為一個酶活力單位(U)。

    酶液中蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度的測定采用Lowry 等的方法,以牛血清白蛋白(BSA)為標(biāo)準蛋白質(zhì)[17]。

    1.7 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)的酶學(xué)性質(zhì)

    1)最適pH 和pH 穩(wěn)定性的測定 在不同pH 下按照標(biāo)準方法測定突變體酶活力, 以最大值為100%,計算各pH 下的相對酶活力。所用緩沖液(50 mmol/L)包括檸檬酸-磷酸緩沖液(pH 3.0~7.0)、醋酸緩沖液(pH 4.0~6.0)、磷酸緩沖液(pH 6.0~8.0)、Tirs-HCl 緩沖液 (pH 7.0~9.0)、CHES 緩沖液(pH 8.0~10.0) 和甘氨酸-氫氧化鈉緩沖液 (pH 9.5~11.0)。用上述緩沖液適當(dāng)稀釋酶液后,置于50 ℃下處理30 min, 按照標(biāo)準方法測定不同pH 下的殘余酶活力,以未經(jīng)處理的酶液為對照。

    2)最適溫度和溫度穩(wěn)定性的測定 在30~90 ℃下按照標(biāo)準方法測定突變體酶活力, 以最大值為100%,計算不同溫度下的相對酶活力。用50 mmol/L檸檬酸-磷酸緩沖液(pH 7.0)將酶液適當(dāng)稀釋后在不同溫度下保溫30 min,按照標(biāo)準方法測定不同溫度下的殘余酶活力,以未經(jīng)處理的酶液為對照。

    3)底物特異性的測定 以0.5 g/dL 槐豆膠、魔芋粉、瓜爾膠為底物,按照標(biāo)準方法測定甘露聚糖酶酶活力。 槐豆膠為底物時測定的酶活力為100%,分別計算甘露聚糖酶對不同底物的相對酶活力。

    4)動力學(xué)參數(shù)的測定 以不同質(zhì)量濃度槐豆膠(1.0~6.0 mg/mL)、魔芋粉(9.0~35.0 mg/mL)和瓜爾膠(3.0~14.0 mg/mL)為底物,與適當(dāng)稀釋后的酶液混合均勻后,在最適條件下反應(yīng)5 min,按照標(biāo)準方法測定酶活力。利用Grafit 軟件計算米氏常數(shù)Km和最大反應(yīng)速率Vmax。

    1.8 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)在畢赤酵母中表達和高密度發(fā)酵

    PCR 擴增甘露聚糖酶突變體基因(RmMan5AM2)時,以RmMan5AM2F(CCATGTACG TAGCTTCTTCGTTTGTCCAGACAAG) 和RmMan5AM2R(CCGCCTAGGCTACTTCTTGGCCAT GGCATC)為引物,以質(zhì)粒pET-28a-RmMan5AM2為模板。 擴增產(chǎn)物用1 g/dL 瓊脂糖凝膠回收純化后,利用限制性內(nèi)切酶SnaB I 和AvrII 雙酶切, 與載體pPIC9k 連接后獲得質(zhì)粒pPIK9k-RmMan5AM2。將上述質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶SalI 線性化后電轉(zhuǎn)化畢赤酵母GS115,獲得重組菌株。

    在不同質(zhì)量濃度遺傳霉素G418(1.0~4.0 mg/mL)下,對重組菌株進行高拷貝篩選,選取搖瓶發(fā)酵酶活力最高的重組菌株在100 L 發(fā)酵罐中進行高密度發(fā)酵,整個過程包括種子液培養(yǎng)、分批發(fā)酵培養(yǎng)、甘油流加培養(yǎng)、100%甲醇誘導(dǎo)培養(yǎng)。 將酶活力最高的重組菌株接種于200 mL BMGY 培養(yǎng)基中, 在30℃、200 r/min 下培養(yǎng)過夜, 接種于3 L BMGY 培養(yǎng)基中,在相同條件下培養(yǎng)至OD600達10.0,得到種子液。種子液接種于裝有30 L BSM 培養(yǎng)基的100 L發(fā)酵罐內(nèi), 在30 ℃、pH 4.0、600 r/min 下發(fā)酵至罐內(nèi)甘油耗盡后,開始流加50%(體積分數(shù))甘油4~5 h;待發(fā)酵液OD600達180 后,停止流加甘油饑餓30 min;隨后流加100%甲醇誘導(dǎo)培養(yǎng)基,在30 ℃、pH 6.0、800 r/min 下繼續(xù)發(fā)酵168 h; 于不同時間點取樣,分析發(fā)酵液中甘露聚糖酶酶活力、蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度和菌體質(zhì)量濃度(單位體積發(fā)酵液酵母的濕質(zhì)量)的變化。

    1.9 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)水解魔芋粉

    甘露聚糖酶突變體以300 U/mL 加入500 mL檸檬酸-磷酸緩沖液(50 mmol/L、pH 7.0)中,在攪拌下加入150 g 魔芋粉, 置于50 ℃、200 r/min 下水解8 h,再沸水浴滅酶20 min,離心(10 000g、10 min)后取上清液凍干后即為魔芋甘露寡糖。

    魔芋甘露寡糖(10 mg/mL)過膜(0.22 μm)后,用高效液相色譜- 示差折光檢測器(high performance liquid chromatography - differential refractive index detector,HPLC-RID)進行分析,色譜柱為Shodex Sugar KS-802(7.8 mm× 300 mm),柱溫為65 ℃,流動相為純水,流量為0.6 mL/min,以甘露糖、甘露二糖、甘露三糖、甘露四糖、甘露五糖、甘露六糖和葡聚糖(PD10)為標(biāo)準品。

    2 結(jié)果與討論

    2.1 甘露聚糖酶(RmMan5A)突變體文庫的高通量篩選

    甘露聚糖酶突變體文庫含有12 000 多個克隆,隨機挑選10 個克隆進行測序分析, 結(jié)果表明該突變體文庫中的基因突變率為0.72%, 這一突變率略高于定向進化的推薦突變率 (2~5 bp/kp)[18]。 利用LBG-剛果紅初篩培養(yǎng)基對突變體文庫進行初篩,30%以上的克隆能夠形成清晰的透明圈, 即可以產(chǎn)生有活性的甘露聚糖酶。其中,894 個克隆形成了能夠準確測量直徑的透明圈(≥3 mm)。 隨后,對上述894 個克隆進行復(fù)篩, 測定其最適催化條件和對魔芋粉的比酶活力,最終篩選到一株在pH 7.0 下對魔芋粉催化效率明顯提高的正向突變, 命名為RmMan5AM2。

    基因測序分析結(jié)果表明該突變體基因(RmMan5AM2)中有7 個堿基發(fā)生突變,其中3 個為同義突變(Asn128 中aat-aac、Ala280 中g(shù)ct-gcc、Lys306 中aag-aaa),4 個為錯義突變,導(dǎo)致該突變體中4 個氨基酸殘基在野生型甘露聚糖酶上發(fā)生改變, 分別是Leu122His (ctt-cat)、Lys162Arg (aagagg)、Glu194Asp(gaa-gac)和Asp305Gly(gac-ggc)。該突變體的氨基酸序列與其他GH5 家族甘露聚糖酶的多重序列比對表明:Leu122 和Glu194 均為嚴格保守氨基酸,Lys162 為部分保守氨基酸,Asp305為非保守氨基酸(見圖1)。

    圖1 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)與其他GH5 家族甘露聚糖酶氨基酸序列多重比對分析Fig. 1 Amino acid sequence similarity of RmMan5AM2 with other GH family 5 mannanases

    2.2 突變體(RmMan5AM2)的表達與純化

    甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 在大腸桿菌BL21(DE3)中可溶表達。 該突變體經(jīng)Ni-NTA 親和層析柱進一步純化得到電泳級純酶, 純化倍數(shù)為7.5 倍,回收率為60.8%。 經(jīng)SDS-PAGE 分析,該突變體的相對分子質(zhì)量為44 000(見圖2),與野生型甘露聚糖酶(RmMan5A)的相對分子質(zhì)量一致[15]。

    圖2 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)的純化圖Fig. 2 SDS-PAGE analysis of purified RmMan5AM2

    2.3 突變體(RmMan5AM2)的酶學(xué)性質(zhì)

    甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 的酶學(xué)性質(zhì)如圖3 所示。該突變體的最適pH 為7.0,在pH 5.0~8.5 表現(xiàn)出50%以上的酶活力。 該突變體具有優(yōu)良的pH 穩(wěn)定性, 在pH 4.0~10.0 下處理30 min 仍能保留80%以上的酶活力。 該酶的最適溫度為65 ℃,在70、75 ℃下分別具有90%和50%左右的酶活力。該突變體具有良好的溫度穩(wěn)定性, 在60 ℃以下處理30 min 仍能保留90%以上的酶活力。

    圖3 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)的最適pH、pH 穩(wěn)定性、最適溫度和溫度穩(wěn)定性Fig. 3 Optimal pH,pH stability,optimal temperature,and thermostability of RmMan5AM2

    與野生型甘露聚糖酶RmMan5A 相比, 該突變體的最適pH 和pH 穩(wěn)定性沒有發(fā)生明顯改變[15]。該突變體在中性條件下具有最高的酶活力,這與大多數(shù)真菌來源的甘露聚糖酶明顯不同,如嗜熱毀絲菌(Myceliophthora thermophila)和米曲霉(A. oryzae)來源的甘露聚糖酶[19-20]。 該突變體在pH 5.0~8.5 仍具有50%以上的酶活力, 且在pH 4.0~10.0 具有良好的穩(wěn)定性, 表明其能夠在寬泛的pH 范圍內(nèi)表現(xiàn)出較高催化活性。 此外,與野生型甘露聚糖酶相比,該突變體的最適溫度提高了10 ℃, 熱穩(wěn)定性溫度提高5 ℃[15]。該突變體最適溫度明顯提高,高于許多天然甘露聚糖酶的最適溫度, 如嗜熱裂孢菌(Thermobifida fusca) 和芽孢桿菌 (Bacillussp.)來源的甘露聚糖酶[21-22]。 較高的反應(yīng)溫度有利于提高水解時的底物濃度和催化反應(yīng)效率,并減少反應(yīng)過程中微生物污染的風(fēng)險[23]。

    2.4 突變體(RmMan5AM2)的底物特異性和動力學(xué)參數(shù)

    甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 保留了野生型甘露聚糖酶高比酶活力的特點,對槐豆膠具有最高比酶活力,為10 371.4 U/mg,其次分別為魔芋粉(6 430.3 U/mg)和瓜爾膠(2 604.0 U/mg)。 該突變體對魔芋粉和瓜爾膠的比酶活力有明顯提高,分別為野生型甘露聚糖酶的20.9%和74.5%[15]。 定向進化后,突變體對槐豆膠的比酶活力顯著高于大部分甘露聚糖酶,如來源于短小芽孢桿菌(B. pumilus,3 462.0 U/mg)和 白 曲 霉(763.6 U/mg)的 甘 露 聚糖 酶[5,24]。

    甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 的動力學(xué)參數(shù)如表1 所示。 可以看出,該突變體對魔芋粉的最大反應(yīng)速率(Vmax)最高,為36 696.0 μmol/(min·mg);對槐豆膠的親和能力(Km)最高,為3.1 mg/mL。 與野生型甘露聚糖酶相比,突變體對不同底物的最大反應(yīng)速率沒有明顯改變,但對槐豆膠、魔芋粉和瓜爾膠的Km值分別提高了18.4%、16.7%和12.8%[15],表明定向進化后突變體對甘露聚糖底物的親和力有明顯提升。 此外,在最適條件下,該突變體對槐豆膠、魔芋粉和瓜爾膠的催化效率(kcat/Km)分別較野生型甘露聚糖酶提高了37.4%、28.9%和34.4%。 高比酶活力和高催化效率能夠有效降低甘露聚糖酶使用成本,提高魔芋甘露寡糖生產(chǎn)效率,對甘露聚糖酶的商業(yè)化應(yīng)用和魔芋甘露寡糖的工業(yè)化生產(chǎn)至關(guān)重要。

    2.5 突變體(RmMan5AM2)的結(jié)構(gòu)分析

    野生型甘露聚糖酶RmMan5A 的分子結(jié)構(gòu)呈經(jīng)典的(β/α)8-TIM 桶結(jié)構(gòu)。 根據(jù)其分子結(jié)構(gòu)可知,突變Leu122His 位于分子內(nèi)部, 突變Lys162Arg、Glu194Asp 和Asp305Gly 位于分子表面 (見圖4)。突變體中,疏水的Leu122 突變?yōu)橛H水的His122,有利于穩(wěn)定該酶的α2 螺旋,從而提高該酶的穩(wěn)定性。突變Lys162Arg 和Asp305Gly 距離該酶催化中心較遠,其中酸性的Asp305 突變?yōu)橹行缘腉ly305,可能在一定程度上改變了酶分子局部與溶劑的相互作用,從而有利于酶分子穩(wěn)定。 突變Glu194Asp 位于催化位點中心, 長側(cè)鏈的Glu194 突變?yōu)槎虃?cè)鏈的Asp194,使突變體催化凹槽變得開闊,便于底物與產(chǎn)物的進入和離去。 同時,與Glu194 相同,突變后的Asp194 也是帶有羧基的酸性氨基酸, 該突變并不改變催化凹槽內(nèi)的電荷分布及其與周圍分子的相互作用。 這可能是該突變體比酶活力顯著提高的原因之一。

    圖4 甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)的分子結(jié)構(gòu)Fig. 4 Overall structure of RmMan5AM2

    2.6 高密度發(fā)酵產(chǎn)甘露聚糖酶

    甘露聚糖酶突變體基因RmMan5AM2在畢赤酵母GS115 中成功表達,經(jīng)高拷貝轉(zhuǎn)化子篩選,從含有1.0 mg/mL 遺傳霉素G418 的篩選培養(yǎng)基中得到一株高產(chǎn)重組菌株, 搖瓶發(fā)酵的酶活力達862.8 U/mL。該重組菌株在100 L 發(fā)酵罐中進行高密度發(fā)酵,隨著發(fā)酵進行發(fā)酵液中甘露聚糖酶酶活力、蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度和菌體質(zhì)量濃度都逐漸增加。 發(fā)酵至156 h,甘露聚糖酶酶活力達到最高值, 為176 000 U/mL,此時蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度和菌體質(zhì)量濃度分別為22.6 mg/mL 和421 g/L(見圖5)。

    圖5 畢赤酵母高密度發(fā)酵產(chǎn)甘露聚糖酶突變體(RmMan5AM2)歷程Fig. 5 Time course of RmMan5AM2 expression in Pichia pastoris

    甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 在畢赤酵母中表達表現(xiàn)出很高的酶活力,大大高于野生型甘露聚糖酶RmMan5A 在畢赤酵母中的酶活力(85 200 U/mL)[25]。迄今,已有多種甘露聚糖酶在畢赤酵母中實現(xiàn)了高效表達,如枯草芽孢桿菌(105 836 U/mL)和樟絨枝霉(42 200 U/mL)來源的甘露聚糖酶[10-11]。 該突變體發(fā)酵液胞外酶活力顯著高于其他已報道甘露聚糖酶,是目前甘露聚糖酶的最高表達水平。 同時,該突變體發(fā)酵液中的蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度也顯著高于畢赤酵母表達的大多數(shù)甘露聚糖酶(2~10 mg/mL)[26-27]。

    2.7 突變體(RmMan5AM2)制備魔芋甘露寡糖

    甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 在最適條件下(加酶量300 U/mL、底物質(zhì)量濃度300 g/L)水解魔芋粉8 h,魔芋粉的水解率達90.2%,魔芋甘露寡糖的得率達88.5%。 HPLC 分析結(jié)果表明(見圖6):產(chǎn)物主要為聚合度2~6 的甘露寡糖,這些組分的峰面積超過總峰面積的85%; 聚合度2~10 的甘露寡糖組分峰面積超過總峰面積的95%。 該突變體水解魔芋粉制備的魔芋甘露寡糖符合我國 “新食品原料”目錄(2013 年第10 號公告)中甘露寡糖組分的有關(guān)規(guī)定。

    圖6 魔芋甘露寡糖的組成分析Fig.6 HPLC analysis of the composition of konjac mannooligosaccharides

    通常,底物質(zhì)量濃度是影響多糖水解效率的重要因素[28]。 水解時提高魔芋粉質(zhì)量濃度在一定程度上可以提高產(chǎn)物得率,但魔芋粉質(zhì)量濃度高會顯著增加反應(yīng)體系黏度,阻礙體系中甘露聚糖酶分子移動及其與底物結(jié)合,反而降低魔芋粉水解率。 因此,水解魔芋粉制備魔芋甘露寡糖時,所用底物質(zhì)量濃度一般在5~20 g/L[29-30]。 硫色曲霉(A. sulphureus)甘露聚糖酶水解10 g/L 魔芋粉時, 水解率達74%;但當(dāng)魔芋粉質(zhì)量濃度增加到100 g/L 時, 水解率顯著降低至53%[31]。 甘露聚糖酶突變體RmMan5AM2 制備魔芋甘露寡糖時,所用魔芋粉質(zhì)量濃度及其水解率分別達300 g/L 和90.2%, 均顯著高于大多數(shù)已報道的甘露聚糖酶。 此外,利用該突變體制備的魔芋甘露寡糖主要為聚合度2~6 的寡糖組分,這與枯草芽孢桿菌和產(chǎn)黃青霉來源的甘露聚糖酶明顯不同, 其水解魔芋粉主要產(chǎn)生聚合度7~12 的甘露寡糖[11,26]。 本研究中制備的魔芋甘露寡糖主要在人體近端結(jié)腸中發(fā)揮作用,能夠有效預(yù)防小鼠的便秘情況,改善小鼠的胰島素水平和瘦素抵抗[32-33]。

    3 結(jié) 語

    利用定向進化技術(shù)對米黑根毛霉來源的甘露聚糖酶(RmMan5A)進行了分子改造,獲得了一個正向突變體(RmMan5AM2)。 該突變體對甘露聚糖的比酶活力和催化效率顯著提高,同時保留了野生型甘露聚糖酶優(yōu)良的酶學(xué)性質(zhì)。 利用畢赤酵母實現(xiàn)了該突變體的高效生產(chǎn), 發(fā)酵液胞外酶活力最高達176 000 U/mL,是目前甘露聚糖酶的最高產(chǎn)酶水平。該突變體能夠水解高質(zhì)量濃度魔芋粉制備低聚合度的魔芋甘露寡糖,在甘露寡糖生產(chǎn)應(yīng)用具有很好的應(yīng)用潛力。 本研究為甘露聚糖酶的分子改造、高效表達及其在生產(chǎn)甘露寡糖中的應(yīng)用提供了理論基礎(chǔ)和實踐依據(jù)。

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