羅瑩,黃智,李亞蘭,廖明
(廣西醫(yī)科大學(xué),廣西 南寧 530021)
廣西地處亞熱帶,氣候與自然環(huán)境都非常適合蛇類生存,毒蛇的種類繁多。近年來,隨著城市綠化生態(tài)的還原以及人工養(yǎng)蛇業(yè)和食蛇餐飲業(yè)的發(fā)展,廣西的蛇傷病例居高不下,每年約有3~4萬人被蛇咬傷[1]。僅據(jù)本校附屬醫(yī)院急診科統(tǒng)計2006-2015年十年的數(shù)據(jù)顯示,平均每年收治的蛇傷患者近100例[2]??梢姡瑥V西長期以來是蛇傷的重點區(qū)域,蛇傷的臨床診斷和治療已成為廣西醫(yī)療衛(wèi)生行業(yè)的突出問題。
眼鏡蛇咬傷是我國南方最常見的蛇傷之一,位居毒蛇咬傷發(fā)病率的第二位[3],而在廣西則位于毒蛇咬傷的首位[4]。眼鏡蛇的蛇毒為混合毒且組成成分十分復(fù)雜,造成眼鏡蛇咬傷后的病理生理具有多樣性,臨床特征往往體現(xiàn)為傷口腫脹、潰爛壞死,呼吸困難、心力衰竭等等,嚴(yán)重者出現(xiàn)休克甚至死亡。目前,由于缺乏對廣西眼鏡蛇蛇毒所有成分的了解,給治療帶來了不少的困難,因此有必要詳細(xì)對廣西眼鏡蛇蛇毒的蛋白質(zhì)組進(jìn)行研究,旨在為廣西眼鏡蛇的蛇傷診治提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
CCK-8試劑盒購于中國MCE。甲酸、乙腈購 于 德 國Merck公 司;DTT、IAA buffer、Trypsin buffer、 NH4HCO3均購于美國Sigma公司。廣西眼鏡蛇蛇毒凍干粉從廣西醫(yī)科大學(xué)蛇毒研究所獲得。AB Triple TOF 5600/6600質(zhì) 譜 儀(美 國AB SCIEX公司);1290 Infinity LC超高壓液相色譜儀(安捷倫科技有限公司)。
取蛇毒凍干粉適量,溶解于高純水,CCK-8試劑盒測蛇毒蛋白質(zhì)的含量。12% SDS-PAGE對蛇毒蛋白質(zhì)的質(zhì)量進(jìn)行分析。
取蛇毒凍干粉適量,溶解于高純水。然后取30μl溶解好的蛇毒溶液,加DTT達(dá)濃度為100mM,100℃5min,室溫下冷卻。接著加入200μLUA緩沖液混勻,經(jīng)30kD超膜過濾,15min離心(14000g),棄濾液(重復(fù)以上步驟1次)。加入100μLIAA緩沖液,1min振蕩(600rpm),室溫下 反 應(yīng)30min(避 光),14000g離 心15min。加入100μLUAbuffer離心14000g15min,重復(fù)2次。加 入100μL25mMNH4HCO3溶 液,14000g離 心15min,重復(fù)該步驟兩次。加入40μLTrypsin緩沖液,振蕩1min(600rpm),37℃放置16-18h,14000g離心15min,收集濾液。肽段用C18Cartridge脫鹽,然后凍干,接著40μL0.1%CH2O2復(fù)溶,OD280進(jìn)行定量。
取1 μl酶解后產(chǎn)物進(jìn)行LC-MS/MS分析(納升級系統(tǒng)Easy nLC,)每個樣品進(jìn)樣一次。采分離過程:A 液:0.1%甲酸,B 液:0.1%甲酸乙腈 (乙腈為84%)。95% A 液平衡色譜柱。樣品上樣到色譜柱Thermo scientific EASY column分離,流速:300 nL/min。相關(guān)設(shè)置: 2小時梯度: 0 min- 110 min, B液從0%-55%;110 min- 115 min, B液從55%-100%;115 min- 120 min, B液維持在100%。質(zhì)譜儀質(zhì)譜分析條件:正離子; 300-1800 m/z母離子掃描;一級質(zhì)譜70,000 at m/z 200 分辨率;每次全掃描后采集20個碎片圖譜進(jìn)行二級質(zhì)譜分析(分辨率:17,500 at m/z 200)。
原始文件(raw file)采用分析軟件PD-Mascot查庫進(jìn)行數(shù)據(jù)庫檢索。蛋白數(shù)據(jù)庫為uniprot_Naja_981_20201030.fasta。(http://www.uniprot.org)。其中搜庫參數(shù)設(shè)定: Enzyme為Trypsin;Missed cleavage sites 設(shè)為2;固定修飾為Carbamidomethyl (C);動態(tài)修飾設(shè)定Oxidation (M);過濾參數(shù)為FDR≤0.01。
考染結(jié)果見圖1,蛇毒樣品條帶分離清晰,質(zhì)量滿足質(zhì)譜鑒定的實驗要求。
圖1 廣西眼鏡蛇蛇毒SDS-PAGE電泳考染分析圖
質(zhì)譜共鑒定到了59個蛋白,包括19大類的蛋白質(zhì):酸性磷脂酶A2,蛇毒神經(jīng)生長因子,細(xì)胞毒素,神經(jīng)毒素,金屬蛋白酶,蛇毒磷酸二酯酶,磷脂酶A2受體抑制蛋白,富含半胱氨酸蛇毒蛋白,蛇毒5核苷酸酶,氨基酸氧化酶,Thaicobrin蛋白,磷脂酶A2,Nakoroxin蛋白,蛇毒抗菌肽,補體因子,絲氨酸蛋白酶抑制子,SH3結(jié)構(gòu)域結(jié)合蛋白4,E3泛素蛋白連接酶,Envoplakin蛋白等。詳細(xì)見表1。質(zhì)譜分析的蛇毒蛋白質(zhì)Basepeak圖譜見圖2。
圖2 蛋白質(zhì)Basepeak圖譜
表1 LC-MS/MS鑒定廣西眼鏡蛇蛇毒蛋白列表
續(xù)表1
廣西屬于全國毒蛇咬傷高發(fā)區(qū),每年的致死率和傷殘率居高不下,成為突出的公共衛(wèi)生問題。相關(guān)資料顯示,廣西常見毒蛇咬傷中,六成以上是眼鏡蛇傷。蛇毒的生理和病理活性主要與其含有的蛋白質(zhì)或肽段有關(guān),因蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在復(fù)雜體系中檢測低豐度蛋白質(zhì)的方面具備優(yōu)勢[5-7],可以通過蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)全面分析蛇毒的蛋白組成。最近幾年相繼有學(xué)者對中國境內(nèi)的蝮蛇、蛇島蝮、莽山洛鐵頭蛇等蛇毒[8-10]蛇毒蛋白組學(xué)研究。在中華眼鏡蛇蛇毒中蛋白質(zhì)組的研究中,Shan(2017)等人采用質(zhì)譜技術(shù)鑒定到5類蛋白質(zhì)家族共32個蛋白質(zhì)[11],張經(jīng)碩(2019)等人從篩選到11類蛋白質(zhì)家族共17個蛋白質(zhì)[12]。目前,由于缺乏對廣西眼鏡蛇蛇毒具體蛋白質(zhì)成分的了解,本研究采用液質(zhì)聯(lián)用的串聯(lián)質(zhì)譜LC-MS/MS對廣西眼鏡蛇蛇毒的蛋白質(zhì)組進(jìn)行研究,質(zhì)譜共鑒定出19類的蛋白質(zhì)家族,共59個蛋白;分析發(fā)現(xiàn)細(xì)胞毒素類家族蛋白占了13個,為最多;接著是神經(jīng)毒素家族類為10個和酸性磷酸酶家族類為6個。本實驗獲得的廣西眼鏡蛇蛇毒蛋白質(zhì)的組成,將為蛇毒蛋白純度的檢測、表征和應(yīng)用提供了可靠依據(jù),可為蛇毒蛋白組分的純化、藥效、結(jié)構(gòu)與功能等研究提供重要的信息,也同時為廣西眼鏡蛇的蛇傷診治提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。