馬鑫宇,官月嬋,吳爽靖,謝明學(xué),畢研偉,寸韡
1.昆明醫(yī)科大學(xué),云南 昆明 650500;2.中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所,云南 昆明 650000
嚙齒類肝炎病毒(Rodent Hepacivirus,RHV)是一種通過血液傳染大鼠的肝炎病毒[1],與人類丙型肝炎病毒(hepaci C virus,HCV)具有同源性[2-3]。RHV屬于單鏈RNA 病毒,基因組全長9 600 bp,包括5′UTR、1 個不間斷的開放閱讀框(open reading frame,ORF)和 3′UTR,ORF 至少編碼 10 種蛋白質(zhì),包括結(jié)構(gòu)蛋白(core、E1、E2)和非結(jié)構(gòu)蛋白(P7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A、NS5B)。RHV rn1 亞型(RHV-rn1)的 5′和3′端UTR 中包含多個蛋白裂解位點和二級結(jié)構(gòu),其中5′非編碼區(qū)含有2 個miR-122 結(jié)合位點。
RHV-rn1 可造成慢性高滴度病毒血癥,引起慢性感染及漸進性肝損傷,宿主具有干擾素通路持續(xù)激活癥狀,這些臨床癥狀與人類HCV 感染較相似,同時,HCV 的抗病毒藥物可抑制RHV 感染,表明RHV-rn1感染的大鼠模型具有作為研究人類HCV 替代模型的潛力[4-6]。因此,建立RHV-rn1 感染的大鼠模型有助于HCV 的相關(guān)研究,但目前尚無可行的細(xì)胞培養(yǎng)體系,無法通過細(xì)胞培養(yǎng)獲得病毒顆粒[7-8]。前期研究發(fā)現(xiàn),體外轉(zhuǎn)錄獲得的病毒全長基因組RNA 經(jīng)注射進入宿主體內(nèi)可能誘發(fā)病毒感染,如大麥條紋花葉病毒(barley stripe mosaic virus,BSMV)[9]、口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,F(xiàn)MDV)[10]、兔出血熱病毒(rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)[11]和HCV[12]等。本研究采用反向遺傳學(xué)方法獲得RHV-rn1,直接注射至大鼠體內(nèi),建立RHV-rn1 感染的大鼠模型,以期為人類HCV 的相關(guān)研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 質(zhì)粒 質(zhì)粒pcw1057[根據(jù)NCBI 登錄的RHV-rn1 基因組(KX905133.1)合成病毒 cDNA 序列,全長9 656 bp,連接至含有T7 啟動子的載體上]由上海捷瑞生物工程有限公司提供。
1.2 主要試劑 限制性內(nèi)切酶EcoRⅤ購自美國NEB公司;體外轉(zhuǎn)錄T7 RiboMAXTMExpress Large Scale RNA Production System 試劑盒購自美國Promega 公司;RNA純化回收試劑盒RNeasy Mini Kit 購自德國Qiagen公司;Trizol 試劑購自天根生化科技(北京)有限公司;DL10000 DNA marker 購自上海捷瑞生物工程有限公司;One Step PrimeScriptTMRT-PCR Kit(Perfect Real Time)購自寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司。
1.3 實驗動物 SPF 級 Wistar 大鼠,雌性,3 ~ 6月齡,體重約180 g,購自中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所,動物合格證號為:XDWSYB20210228。實驗對大鼠的所有處理均以科研為目的進行養(yǎng)殖和使用,且按照本研究所動物倫理相關(guān)規(guī)定進行(文件號為:DWLL202007001)。
1.4 體外轉(zhuǎn)錄RNA 及純化 將質(zhì)粒pcw1057 經(jīng)限制性內(nèi)切酶EcoRⅤ酶切,用酚氯仿抽提線性化DNA,體外轉(zhuǎn)錄T7 RiboMAXTMExpress Large Scale RNA Production System 試劑盒進行體外轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)RNeasy Mini Kit 試劑盒純化,獲得RHV-rn1 基因全長RNA,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分析。
1.5 動物分組及給藥 分別經(jīng)大鼠肝內(nèi)直接注射和尾靜脈注射途徑給予純化的RHV-rn1 基因全長RNA,5 μg /(100 μL·只),每組 2 只;同時設(shè)對照組(PBS,100 μL / 只),1 只。
1.6 大鼠血清中RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)的檢測 采用RT-qPCR 法。用One Step PrimeScriptTMRT-PCR Kit(Perfect Real Time)試劑盒測定RHV-rn1 基因全長RNA 濃度,根據(jù)濃度計算基因組拷貝數(shù),即為RT-qPCR法的標(biāo)準(zhǔn)品。以RHV-rn1 基因組序列5′-TACATGGCTAAGCAATACGG-3′為正鏈引物,5′-AAGCGCAGCACCAATTCC-3′為負(fù)鏈引物,5′-CTCACGTACATGACGTACGGCATG-3′為特異性 taqman FAM 探針,引物和探針由上海捷瑞生物工程有限公司合成。注射后2 d 起每日經(jīng)各組大鼠尾靜脈采血,至7 d,隨后每7 d 采血,肝內(nèi)注射組和對照組采血至49 d,尾靜脈注射組采血至28 d,分離血清,Trizol 試劑提取RNA,以其為模板進行RT-qPCR 擴增。RT-qPCR 擴增條件為:42 ℃5 min,95 ℃ 10 s,95 ℃ 15 s,共 45 個循環(huán);53 ℃45 s,60 ℃ 45 s。利用RT-qPCR 法標(biāo)準(zhǔn)品建立標(biāo)準(zhǔn)曲線,計算大鼠血清中RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)。
1.7 子代RHV-rn1 感染能力的檢測 將純化的RHV-rn1 基因全長 RNA 經(jīng)肝內(nèi)注射大鼠,5 μg /(100 μL·只),注射后 49 d 經(jīng)尾靜脈采血,分離血清(P0 代 RHV-rn1);另取 4 只大鼠(編號 1 ~ 4),經(jīng)尾靜脈注射 P0 代 RHV-rn1,100 μL /只,同時設(shè) PBS 對照組,注射后 3、14、56、106、134 d 經(jīng)尾靜脈采血,分離血清,采用 RT-qPCR 法(同 1.6 項)檢測 RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)。
1.8 RHV-rn1 對大鼠器官親嗜性的檢測 將P0 代RHV-rn1 經(jīng)尾靜脈注射大鼠,100 μL / 只,注射后第7 天經(jīng)腹主動脈采血,分離血清,即P1 代RHV-rn1,相同方法獲得 P2 和 P3 代 RHV-rn1,RT-qPCR 法(同1.6 項)檢測RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)。取RHV-rn1在體內(nèi)傳至P3 代時的3 只大鼠,無菌取大鼠的肌肉、腦、甲狀腺、肺、小腸、腎臟、性器官、心臟、脾臟、肝臟組織,剪成小塊,研磨,制備為細(xì)胞懸液,用Trizol 提取 RNA,RT-qPCR 法(同 1.6 項)檢測 RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)。
1.9 RHV-rn1 感染能力的檢測 分別用劑量為101、102、103、104、105copies / μL 的 P3 代 RHV-rn1 經(jīng)尾靜脈注射大鼠,100 μL / 只,于注射后 0、3、6、12 d,經(jīng)尾靜脈采血,分離血清,采用RT-qPCR 法(同1.6項)檢測RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)。
2.1 RHV-rn1 基因全長RNA 的鑒定 純化的RHV-rn1 基因全長RNA 經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分析,于約10 000 bp 處可見目的基因條帶,大小與預(yù)期相符,見圖1。
圖1 RHV-rn1 基因全長RNA 電泳圖Fig.1 Electrophoretic profile of full-length RNA of RHV-rn1 gene
2.2 大鼠血清中的RHV-rn1 基因組拷貝數(shù) 肝內(nèi)注射組2 只大鼠于注射后2 d 出現(xiàn)高滴度病毒血癥,血液中RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)達 105copies / μL,注射后 3 d拷貝數(shù)大幅下降,注射后 4 d 上升,達 105copies/μL,隨后呈緩慢上升趨勢;至注射后14 d 開始穩(wěn)定,維持約在 106copies / μL,可持續(xù)至注射后 49 d。尾靜脈注射組2 只大鼠直至28 d 時未檢測到病毒血癥。見圖2。
圖2 RT-qPCR 法檢測各組大鼠血清中RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)Fig.2 Determination of RHV-rn1 genome copy number in sera of rats by RT-qPCR
2.3 子代 RHV-rn1 的感染能力 P0 代RHV-rn1注射3 d 后,大鼠血清中RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)為105copies / μL;隨后血清中的拷貝數(shù)逐漸上升,至14 d 時,維持約在 106copies / μL。見表 1。表明 P0代大鼠血液中含有感染性RHV-rn1 顆粒,且可形成慢性感染。
表1 感染子代 RHV-rn1 大鼠血清中的 RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)(copies / μL)Tab.1 Genome copy numbers of RHV-rnl in sera of rats infected with offspring HRV(copies / μL)
2.4 RHV-rn1 對大鼠器官的親嗜性 P1、P2、P3 代RHV-rn1 的拷貝數(shù)分別為 1.12 × 107、7.5 × 106、1.65 × 107copies / μL。RHV-rn1 在體內(nèi)傳至 P3 代時,大鼠的肌肉、腦、甲狀腺、肺、小腸、腎臟、性器官、心臟、脾臟、肝臟組織中,肝臟中的RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)達107copies / mg,高于其他組織器官1 000 倍以上,見圖3。表明RHV-rn1 是一種嗜肝性病毒。
圖3 大鼠不同器官/ 組織中RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)Fig.3 Genome copy numbers of RHV-rnl in various organs /tissues of rats
2.5 RHV-rn1 的感染能力 RHV-rn1 半數(shù)感染的基因組拷貝數(shù)為102.5copies,見圖4,表明RHV-rn1具有較強的感染能力。
圖4 RHV-rn1 半數(shù)感染劑量試驗Fig.4 Test for median infectious dose of RHV-rn1 of P3
本研究采用經(jīng)反向遺傳學(xué)方法合成RHV-rn1基因組cDNA,體外轉(zhuǎn)錄獲得的病毒基因組RNA[13-14],通過肝臟注射至大鼠體內(nèi),在體內(nèi)擴增病毒,建立該動物模型,于不同時間點采血,分離血清,RT-qPCR 法檢測RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)。檢測結(jié)果顯示,接種RHV-rn1 后,大鼠可形成高滴度病毒血癥,且可形成慢性感染,表明RHV-rn1 基因組含有完整的5′和3′UTR 結(jié)構(gòu),具有使大鼠形成病毒血癥的能力。
人類乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)和 HCV均是慢性肝炎病毒,有研究表明,通過尾靜脈直接注射HBV 基因組可在小鼠體內(nèi)形成高滴度病毒血癥[14],HCV 則通過肝內(nèi)直接注射病毒基因組感染黑猩猩形成病毒血癥[15]。RHV-rn1 也為慢性肝炎病毒,因此本實驗采用尾靜脈和肝內(nèi)注射兩種方式給予RHV-rn1 RNA,RT-qPCR 檢測結(jié)果顯示,肝內(nèi)注射組大鼠血清中的RHV-rn1 基因組拷貝數(shù)遠(yuǎn)高于尾靜脈注射組及對照組,尾靜脈注射組與對照組差異較小,表明RHV-rn1 基因組RNA 經(jīng)肝內(nèi)注射具有較強的感染能力,可能是由于肝臟細(xì)胞具有較強的吸收外來物質(zhì)的能力,病毒RNA 更易進入肝細(xì)胞,有利于病毒基因組復(fù)制。
模擬RHV 血液傳播的過程,本實驗用P0 代大鼠血清成功感染健康大鼠,表明子代RHV 具有較強的感染能力,可形成慢性感染,且對肝臟有較強的親嗜性。通過個體傳代,獲得了P1、P2、P3 代病毒,拷貝數(shù)分別為 1.12 × 107、7.5 × 106、1.65 × 107copies / μL。RHV-rn1 感染能力試驗計算得出,RHV-rn1病毒半數(shù)感染的基因組拷貝數(shù)為102.5copies,表明RHV-rn1具有極強的感染能力,僅需感染大鼠的1 μL 血液就能感染其他健康大鼠,是一種傳染性較強的病毒。本研究建立了RHV-rn1 感染的大鼠模型,為慢性肝炎致病機理和免疫反應(yīng)的相關(guān)研究奠定了基礎(chǔ)。