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    乳酸菌代謝低聚果糖/菊粉途徑及機(jī)理的研究進(jìn)展

    2022-05-30 02:51:06賴鯨慧祝元婷陳貴希李建龍劉書(shū)亮
    食品科學(xué) 2022年9期
    關(guān)鍵詞:合生元菊粉基因簇

    賴鯨慧,祝元婷,陳 媛,唐 林,陳貴希,李建龍,劉書(shū)亮,3,*

    (1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院,四川 雅安 625014;2.四川師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,四川 成都 610066;3.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)食品加工與安全研究所,四川 雅安 625014)

    低聚果糖(fructooligosaccharides,F(xiàn)OS)是由β-D(2→1)果糖基連接、末端有(或沒(méi)有)一個(gè)葡萄糖分子的碳水化合物,聚合度(degree of polymerization,DP)為2~10,分子式為GFn或FFn(G表示葡萄糖,F(xiàn)表示果糖基,n表示果糖基數(shù))[1]。菊粉也稱菊糖,是由D-呋喃果糖分子以β(2→1)鍵連接而成的線性直鏈多糖,末端常帶一個(gè)葡萄糖殘基,常表示為GFn,DP一般在2~60。根據(jù)平均DP不同可分為3種:短鏈菊粉(DP≤10)、天然菊粉(2≤DP≤60)和長(zhǎng)鏈菊粉(DP≥23)[2]。FOS和菊粉是研究最為廣泛的益生元,大量體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)表明其可以選擇性調(diào)節(jié)腸道微生物,有助于宿主健康。

    合生元又稱合生素,指益生元與益生菌結(jié)合使用的生物制劑(微生態(tài)制劑),具有益生功能及治療多種疾病的作用[3]。合生元可分為互補(bǔ)性合生元和協(xié)同性合生元。互補(bǔ)性合生元要求益生元和益生菌能產(chǎn)生益生效應(yīng),產(chǎn)生的影響是其中每個(gè)組分有益影響之和。協(xié)同性合生元各成分除應(yīng)具有益生效應(yīng)外,益生菌還應(yīng)具有代謝益生元的能力。這是協(xié)同性合生元最大的優(yōu)點(diǎn),即益生元可為益生菌提供營(yíng)養(yǎng),賦予它與其他腸道微生物競(jìng)爭(zhēng)的優(yōu)勢(shì),使得其在腸道定植和長(zhǎng)期發(fā)揮益生作用成為可能。

    乳酸菌屬于益生菌,是人體腸道菌群重要組成部分,具有多種益生功能,如代謝產(chǎn)生的短鏈脂肪酸、細(xì)菌素、過(guò)氧化氫可抑制或殺死腸道內(nèi)的有害菌,維持腸道微生態(tài)平衡[4]。乳酸菌細(xì)胞內(nèi)碳水化合物活性酶存在特異性[5],對(duì)益生元的利用也具有特異性,因此,了解不同乳酸菌對(duì)FOS和菊粉的代謝情況可為合生元(特別是協(xié)同性合生元)的研究提供菌種資源,明確乳酸菌代謝FOS和菊粉的機(jī)制有利于合生元研究。本文對(duì)乳酸菌對(duì)FOS和菊粉的代謝能力差異、代謝途徑以及主要的代謝調(diào)控機(jī)制進(jìn)行綜述,總結(jié)近年來(lái)FOS/菊粉合生元的應(yīng)用,以期為益生元與益生菌進(jìn)一步聯(lián)用提供參考依據(jù),同時(shí)展望了未來(lái)的研究方向。

    1 乳酸菌對(duì)低聚果糖和菊粉代謝能力的差異

    FOS和菊粉被廣泛用于評(píng)價(jià)乳酸菌的益生功能。常以FOS或菊粉代替MRS培養(yǎng)基中的葡萄糖,觀察乳酸菌能否生長(zhǎng)或能否達(dá)到在MRS培養(yǎng)基生長(zhǎng)時(shí)的生物量。表1總結(jié)了近年來(lái)部分能利用FOS/菊粉的乳酸菌。能代謝FOS和菊粉的乳酸菌種類多樣,以乳桿菌屬和雙歧桿菌屬為主,乳桿菌對(duì)菊粉的利用較雙歧桿菌更常見(jiàn)。此外,乳酸菌與FOS和菊粉存在著特異性代謝關(guān)系,有的乳酸菌對(duì)FOS和菊粉均能代謝,如Lactobacillus paracaseiI321、L. caseiL1等,而B(niǎo)ifidobacterium longumB2a、B. bifidumB6A僅能代謝FOS[6]。

    表1 近年報(bào)道的能代謝FOS/菊粉的乳酸菌Table 1 Overview of lactic acid bacteria capable of metabolizing FOS/inulin

    乳酸菌在代謝FOS和菊粉時(shí),對(duì)DP有不同偏好性。當(dāng)FOS(DP為4)和長(zhǎng)鏈菊粉(DP>23)共同作為碳源時(shí),L. paracaseisubsp.paracasei8700:2優(yōu)先代謝FOS,且不受FOS的DP影響[20]。類似地,B. longumBB536會(huì)先代謝scFOS)[21]。然而L. delbrueckiiTU-1、L. delbrueckiiJCM 1002T會(huì)優(yōu)先利用DP較高的FOS[22]。于雙歧桿菌而言,目前普遍認(rèn)為其優(yōu)先代謝低DP的FOS[21]。綜上所述,不同種類乳酸菌對(duì)不同DP的FOS的利用存在先后差異,因此代謝方式可能不同。

    2 乳酸菌代謝低聚果糖和菊粉的途徑

    通過(guò)薄層色譜法和高效液相色譜法檢測(cè)發(fā)現(xiàn)L. paracasei1195在用FOS替換葡萄糖的改良MRS培養(yǎng)基中生長(zhǎng)時(shí),培養(yǎng)液中果糖、蔗糖含量會(huì)短暫增加,細(xì)胞提取物沒(méi)有FOS水解酶活性[10,23]。在L. plantarumP14和P76的無(wú)細(xì)胞上清液和細(xì)胞壁提取物中檢測(cè)到了水解酶活性,在細(xì)胞質(zhì)部分未檢測(cè)到[24]。相反,L. plantarumWCFS1培養(yǎng)液中未發(fā)現(xiàn)單糖和二糖的積累[25],為此研究者們提出兩種乳酸菌代謝FOS的途徑。

    2.1 水解轉(zhuǎn)運(yùn)途徑

    水解轉(zhuǎn)運(yùn)途徑即先水解后轉(zhuǎn)運(yùn)的途徑,對(duì)L. paracaseiDSM 20020[22]、L. paracaseiDSM 23505[26]、L. caseiIAM 1045[27]和L. plantarumP14、P76[24]等而言,F(xiàn)OS先在胞外被水解酶水解,然后一個(gè)或多個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白將水解產(chǎn)物(果糖、蔗糖和葡萄糖)轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入胞內(nèi)。以L. plantarumP14[24]為例分析其代謝過(guò)程:GFn和FFn型FOS或菊粉在胞外β-果糖苷酶作用下水解為果糖和scFOS,分別通過(guò)果糖和蔗糖磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(phosphotransferase system,PTS)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)進(jìn)入細(xì)胞。即一方面scFOS在蔗糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)作用下穿過(guò)細(xì)胞膜并被磷酸化,再在蔗糖-6-磷酸水解酶(也稱作β-果糖苷酶)作用下水解成6-磷酸葡萄糖和果糖,6-磷酸葡萄糖再在磷酸己糖異構(gòu)酶的作用下轉(zhuǎn)化為6-磷酸果糖,果糖在果糖激酶作用下生成6-磷酸果糖,隨后進(jìn)入糖酵解途徑(圖1)。另一方面,胞外果糖通過(guò)果糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)后被磷酸化,在磷酸果糖激酶作用下生成1,6-二磷酸果糖繼續(xù)進(jìn)行糖酵解。

    2.2 轉(zhuǎn)運(yùn)水解途徑

    轉(zhuǎn)運(yùn)水解途徑即先轉(zhuǎn)運(yùn)再水解的途徑,如L. acidophilusNCFM[28]、L. delbrueckii[22]、L. plantarumST-III[29]以及L. plantarumWCFS[25]等是先通過(guò)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)將FOS轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)胞內(nèi),再在胞內(nèi)水解酶作用下水解成單糖后被利用。雙歧桿菌多以此方式代謝FOS,如B. breveUCC2003[30]、B. adolescentisG1[31]、B. lactisDSM 1014[32]。以L. plantarumWCFS1[25]為例分析其代謝過(guò)程:乳酸菌通過(guò)蔗糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)攝取胞外蔗糖或scFOS并將其磷酸化,接著胞內(nèi)果糖苷酶作用于葡萄糖和果糖之間糖苷鍵生成果糖和葡萄糖-6-磷酸;果糖在果糖激酶作用下磷酸化成果糖-6-磷酸,最后進(jìn)入糖酵解途徑(圖1)。有研究表明,轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白能力會(huì)隨FOS的DP增加而顯著減弱,因此,高DP的FOS、菊粉是通過(guò)先水解再轉(zhuǎn)運(yùn)的方式被代謝[25,29]。但Tsujikawa等[22]發(fā)現(xiàn)L. delbrueckiiTU-1的轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)可直接將高DP菊粉型果聚糖轉(zhuǎn)運(yùn)到胞內(nèi)。因此,推測(cè)L. delbrueckiiTU-1代謝菊粉的途徑是先轉(zhuǎn)運(yùn)再水解。

    圖1 乳酸菌代謝FOS的途徑[25]Fig. 1 FOS catabolic pathways of lactic acid bacteria[25]

    3 乳酸菌代謝低聚果糖和菊粉的分子機(jī)制

    由上述乳酸菌代謝FOS途徑可知,水解酶和轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)在代謝過(guò)程中至關(guān)重要。許多研究表明水解酶和轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)的編碼基因一般位于同一個(gè)編碼FOS代謝的基因簇中,還包括相應(yīng)調(diào)控因子基因。表2歸納了預(yù)測(cè)到的在一些菌株中與FOS或菊粉代謝相關(guān)的基因簇。粉乳酸菌在代謝FOS或菊時(shí),可能會(huì)有多個(gè)相關(guān)基因簇參與。Saulnier等[25]比較L. plantarumWCFS1在MRS培養(yǎng)基和改良MRS培養(yǎng)基(葡萄糖替換為FOS)中基因表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)位于同一基因簇中分別編碼果糖激酶(sacK1)、蔗糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(pts1BCA)、β-果糖苷酶(SacA)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白(SacR)和α-葡萄糖苷酶(Agl)基因的表達(dá)明顯增強(qiáng)。Goh等[23]運(yùn)用微陣列分析發(fā)現(xiàn)一個(gè)由編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白(fosR)、果糖/甘露糖特異PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(fosABCD)、假定蛋白(fosX)和β-果糖苷酶(fosE)基因組成的fosRABCDXE操縱子參與了L. paracasei1195對(duì)FOS的代謝。Buntin[24]和Chen Chen[29]等發(fā)現(xiàn)L. plantarumST-III對(duì)FOS的代謝以及L. plantarumP14和L. plantarumP76對(duì)菊粉的代謝都有2 個(gè)相關(guān)基因簇參與。

    表2 乳酸菌對(duì)FOS和菊粉代謝相關(guān)的酶及基因簇Table 2 Gene clusters and enzymes involved in metabolism of FOS and inulin in lactic acid bacteria

    3.1 基因簇編碼蛋白

    3.1.1 水解酶

    與FOS和菊粉代謝相關(guān)水解酶有多種,均屬于GH32家族,如β-果糖苷酶(EC 3.2.1.26)[33-34]、菊粉酶(EC 3.2.1.7)[35-36]、果聚糖酶(EC 3.2.1.65)[35]和果聚糖β-果糖苷酶(EC 3.2.1.80)[26,37]等。許多研究者從分子水平證實(shí)了果糖苷酶對(duì)FOS的水解作用。如Chen Chen等[29,38]通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)了參與L. plantarumST-III代謝FOS的果糖苷酶(編碼基因?yàn)閟acA),并用基因敲除實(shí)驗(yàn)證明果糖苷酶獨(dú)立負(fù)責(zé)FOS水解,sacA基因在大腸桿菌和L. rhamnosusGG的成功表達(dá)也進(jìn)一步證實(shí)了果糖苷酶對(duì)FOS的水解作用。由于代謝途徑存在胞內(nèi)水解和胞外水解,水解酶也有胞內(nèi)外之分,F(xiàn)OS胞外酶最典型特征是N端包含信號(hào)肽,C端有細(xì)胞壁的錨定位點(diǎn)LPQAG[23-24,39]。

    通過(guò)分析酶水解產(chǎn)物和動(dòng)力學(xué)常數(shù)發(fā)現(xiàn),不同酶作用的糖苷鍵種類以及酶切位點(diǎn)有所不同,而且同一種酶在不同菌株中對(duì)底物的活性都存在差異。如菊粉酶是內(nèi)切菊粉β(2-1)糖苷鍵,形成DP 3~6的FOS,果聚糖β-果糖苷酶卻作用于非還原末端的糖苷鍵,釋放果糖[40]。Ryan等[30]發(fā)現(xiàn)B. breveUCC 2003的果糖苷酶能夠催化裂解蔗糖或低DP的FOS中葡萄糖與相鄰果糖分子間的β(2-1)糖苷鍵,并且水解蔗糖時(shí)活力最高,然而B(niǎo). lactisDSM 10140T果糖苷酶是裂解末端果糖之間的β(2-1)糖苷鍵,作用于FOS時(shí)活力高于蔗糖[30,32]。因此水解酶酶切位點(diǎn)的不同將會(huì)影響水解產(chǎn)物種類及比例,這可能會(huì)影響乳酸菌代謝FOS過(guò)程中參與的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白種類。

    研究表明果糖苷酶的底物特異性取決于其晶體結(jié)構(gòu)。果糖苷酶三維結(jié)構(gòu)具有典型的GH32家族蛋白結(jié)構(gòu)特征:N端為含有催化位點(diǎn)的β-螺旋槳結(jié)構(gòu)域(包括5 個(gè)β-折疊保守區(qū)域),C端為與底物結(jié)合有關(guān)的β-三明治結(jié)構(gòu)域,酶活性中心位于β-螺旋槳結(jié)構(gòu)的中心區(qū)域,Asp-63位點(diǎn)充當(dāng)親核試劑,Glu-234位點(diǎn)作為廣義酸堿(圖2)[41-42]。據(jù)報(bào)道,通常果糖苷酶催化水解底物的機(jī)理是:Glu為底物氧原子提供質(zhì)子,Asp作為親核體攻擊底物果糖殘基的異頭C-2碳原子,形成了果糖殘基-共價(jià)酶復(fù)合物,同時(shí)底物其余殘基被釋放,然后Glu從水分子中奪走一個(gè)質(zhì)子(作為廣義堿)使得羥基取代酶-果糖殘基復(fù)合物的果糖殘基,從而釋放果糖使酶活性中心恢復(fù)[43]。此外,Mendoza-Llerenas等[44]認(rèn)為β-螺旋槳結(jié)構(gòu)域中擁有開(kāi)放式漏斗狀通道的果糖苷酶比僅有一個(gè)空洞的果糖苷酶具有更廣泛的底物選擇性。

    圖2 β-果糖苷酶的三維結(jié)構(gòu)[41]Fig. 2 Three-dimensional structure of β-fructofuranosidase[41]

    3.1.2 轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)

    乳酸菌糖轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)主要有4種:PTS、腺苷三磷酸結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABC)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)、透性酶、同向轉(zhuǎn)運(yùn)體[45]。就目前研究結(jié)果而言,蔗糖PTS和果糖/甘露糖PTS是參與乳酸菌代謝FOS和菊粉最常見(jiàn)的轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng),如L. plantarumWCFS1[25]、L. paracasei1195[23]、L. plantarumP14和L. plantarumP76[24]等;也有少數(shù)乳酸菌是通過(guò)ABC轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)和透性酶轉(zhuǎn)運(yùn)FOS或其水解產(chǎn)物,如L. acidophilusNCFM[28]、B. breveUCC2003[30]等。PTS由磷酸烯醇式丙酮酸(phosphoenolpyruvate,PEP)依賴性蛋白激酶I(PEP-dependent protein kinase enzyme I,EI)、組氨酸磷酸載體蛋白(histidine-phosphoryl protein,HPr)以及糖特異性酶II復(fù)合物(enzyme II,EII)組成,其中前兩者是無(wú)底物識(shí)別特異性的可溶性胞內(nèi)蛋白,EII可特異性識(shí)別和轉(zhuǎn)運(yùn)底物分子,并且包含4 個(gè)結(jié)構(gòu)域(EIIA、EIIB、EIIC和EIID),但有的不含EIID[46]。PTS是一種需能量的可逆濃度運(yùn)輸系統(tǒng),碳源分子經(jīng)過(guò)該系統(tǒng)轉(zhuǎn)運(yùn)后會(huì)發(fā)生構(gòu)象變化(被磷酸化)。一般PTS轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程為:HPr在EI的作用下接受來(lái)自磷酸烯醇式丙酮酸的磷酸基團(tuán)被磷酸化,接著依次將磷酸基團(tuán)傳遞給EIIA、EIIB,然后胞外碳源分子經(jīng)EIIC、EIID轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)胞內(nèi)后接受磷酸基團(tuán)成為磷酸化的碳源分子而被代謝[47],其中EIIB的磷酸化和EIIC(EIID)的轉(zhuǎn)運(yùn)是緊密相連的[48]。

    乳酸菌在代謝FOS時(shí)參與的轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)可能不止1 個(gè),如Chen Chen等[29]通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析和基因敲除實(shí)驗(yàn)證明SacPTS1和SacPTS2編碼的蔗糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)均參與L. plantarumST-III對(duì)FOS的轉(zhuǎn)運(yùn)。Buntin等[24]發(fā)現(xiàn)L. plantarumP14、P76對(duì)菊粉的代謝有蔗糖PTS和果糖/甘露糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)的共同參與。此外,從表2中可以看出,只要是先水解再轉(zhuǎn)運(yùn)的菌株,其代謝過(guò)程中參與的轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)均有果糖/甘露糖PTS,從現(xiàn)有收集到的文獻(xiàn)推測(cè),若乳酸菌在胞外水解FOS或菊粉,那么水解產(chǎn)物的轉(zhuǎn)運(yùn)由果糖/甘露糖PTS轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)負(fù)責(zé),如果是在胞內(nèi)代謝FOS,那么參與的轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)可能為蔗糖PTS或ABC轉(zhuǎn)運(yùn)或透性酶。

    3.1.3 調(diào)控因子

    目前已命名編碼參與FOS代謝調(diào)控因子的基因有MsmR、fosR、sacR、LacIfos。B. breveUCC2003中LacIfos產(chǎn)物的N端與GalR-LacI家族中和DNA結(jié)合的區(qū)域具有明顯相似性,即螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu),C端則是與糖結(jié)合區(qū)域[30]。此外,通過(guò)NCBI網(wǎng)站查詢到L. acidophilusNCFM、L. plantarumWCFS1、L. plantarumST-III調(diào)控因子是阻遏蛋白,分別為MsmR、SacR、SacR1;相反L. paracasei1195的調(diào)控因子FosR是轉(zhuǎn)錄激活蛋白。與FOS代謝相關(guān)的基因簇均受FOS或菊粉誘導(dǎo),因此,探討乳酸菌代謝FOS/菊粉的機(jī)制離不開(kāi)對(duì)其代謝調(diào)控方式的總結(jié)。

    3.2 乳酸菌對(duì)FOS和菊粉的代謝調(diào)控

    3.2.1 局部調(diào)控

    局部調(diào)控即局部轉(zhuǎn)錄因子在有或無(wú)誘導(dǎo)物存在時(shí),與操縱基因作用調(diào)控結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。Chen Chen等[49]在排除葡萄糖引起的全局調(diào)控情況下,通過(guò)基因敲除實(shí)驗(yàn)證明編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的sacR1和sacR2對(duì)L. plantarumST-III代謝FOS具有局部調(diào)控作用。Francke等[50]在植物乳桿菌WCFS1中發(fā)現(xiàn)了參與蔗糖或FOS代謝的局部轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子Lp_0188(sacR)。因此,鑒于L. plantarumST-III和L. plantarumWCFS1在誘導(dǎo)物(FOS)存在時(shí),基因簇被誘導(dǎo)表達(dá),且基因簇中調(diào)控因子產(chǎn)物為阻遏蛋白,推測(cè)其局部調(diào)控方式屬于可誘導(dǎo)的負(fù)調(diào)控。即當(dāng)FOS(誘導(dǎo)物)不存在時(shí),阻遏蛋白與操縱基因結(jié)合,阻止結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄;當(dāng)FOS(誘導(dǎo)物)存在時(shí),F(xiàn)OS與阻遏蛋白結(jié)合并從操縱基因上脫離,RNA聚合酶啟動(dòng)結(jié)構(gòu)基因的正常轉(zhuǎn)錄。而對(duì)L. paracasei1195而言,誘導(dǎo)物(FOS)存在時(shí),基因簇同樣被誘導(dǎo)表達(dá),但其基因簇中編碼調(diào)控因子fosR的產(chǎn)物是激活蛋白,推測(cè)其局部調(diào)控方式屬可誘導(dǎo)的正調(diào)控。即當(dāng)FOS(誘導(dǎo)物)不存在時(shí),激活蛋白以失活狀態(tài)存在,無(wú)法與操縱基因結(jié)合,因此結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄;當(dāng)FOS(誘導(dǎo)物)存在時(shí),激活蛋白被FOS激活,與操縱基因結(jié)合開(kāi)啟結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。此外Chen Chen等[49]通過(guò)電泳凝膠遷移實(shí)驗(yàn)和染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)證明了L. plantarumST-III的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子SacR1和SacR2能與啟動(dòng)子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(transcription factor binding site,TFBS)以高親和力進(jìn)行特異性結(jié)合。

    3.2.2 全局調(diào)控

    除局部調(diào)控外,乳酸菌對(duì)糖的代謝調(diào)控往往還有全局調(diào)控。全局調(diào)控是由易被宿主利用的糖(如葡萄糖)所誘導(dǎo)的代謝調(diào)控蛋白A(catabolite control protein A,CcpA)與代謝反應(yīng)元件(catabolite response element,cre)結(jié)合完成的。CcpA對(duì)碳代謝物的調(diào)控可分為碳代謝阻遏(carbon catabolite repression,CCR)效應(yīng)和碳代謝物激活(carbon catabolite activation,CCA)效應(yīng)[51]。cre是CcpA介導(dǎo)CCR效應(yīng)的重要順勢(shì)調(diào)控元件[52]。革蘭氏陽(yáng)性菌中與CcpA結(jié)合的cre位點(diǎn)位置有所不同,有的位于啟動(dòng)子區(qū)域,也有位于啟動(dòng)子下游。有學(xué)者對(duì)L. plantarumST-III FOS代謝相關(guān)基因簇中潛在cre位點(diǎn)進(jìn)行點(diǎn)突變并結(jié)合電泳凝膠遷移實(shí)驗(yàn)證明CcpA與其4 個(gè)啟動(dòng)子區(qū)域的6 個(gè)cre位點(diǎn)特異性結(jié)合[53-54]。這種直接與cre位點(diǎn)結(jié)合的方式為CcpA的直接調(diào)控,除此之外,CcpA還可通過(guò)間接調(diào)控來(lái)調(diào)控其他基因表達(dá),即CcpA引起局部調(diào)控因子變化,從而使得受控于局部調(diào)控因子且啟動(dòng)子區(qū)域不含cre位點(diǎn)的基因也因此而發(fā)生變化。如盧艷青[55]通過(guò)分析CcpA基因敲除前后利用FOS和葡萄糖的差異轉(zhuǎn)錄組發(fā)現(xiàn),有些已確定發(fā)生了顯著變化的基因,其啟動(dòng)子區(qū)域卻不含cre位點(diǎn),推測(cè)這些基因可能受到CcpA間接調(diào)控。

    在革蘭氏陽(yáng)性菌中CcpA主要起負(fù)調(diào)控作用,即主要為CCR效應(yīng),也稱葡萄糖效應(yīng)。比如L. paracasei1195在含低濃度葡萄糖的FOS環(huán)境生長(zhǎng)時(shí)呈現(xiàn)典型二次生長(zhǎng)現(xiàn)象,即葡萄糖先被利用,待葡萄糖利用完,F(xiàn)OS代謝相關(guān)基因才開(kāi)始表達(dá)[23]。調(diào)控原理即:當(dāng)葡萄糖等速效碳源存在時(shí),胞內(nèi)高水平ATP/Pi(ATP與無(wú)機(jī)磷酸比例)與葡萄糖代謝產(chǎn)物激活Hpr激酶/磷酸酯酶活性,將HPr的Ser46位點(diǎn)磷酸化,形成HPr-Ser46-P,然后HPr-Ser46-P與CcpA結(jié)合形成復(fù)合物,與非速效碳源(FOS)代謝基因簇啟動(dòng)子區(qū)域cre位點(diǎn)結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄;當(dāng)葡萄糖不存在時(shí),His15被HPr磷酸化,HPr-Ser46-P將失去磷酸化反應(yīng),F(xiàn)OS被正常利用,抑制效果消失[23,56](圖3)。

    圖3 CcpA介導(dǎo)的CCR效應(yīng)Fig. 3 Mechanism of CcpA-mediated CCR effect in lactic acid bacteria

    因此,乳酸菌對(duì)FOS(或菊粉,下同)的代謝調(diào)控(全局+局部)大致可分為4種情況(以阻遏蛋白為例):僅葡萄糖存在、僅FOS存在、葡萄糖和FOS均不存在、葡萄糖和FOS都存在(圖4)。只有葡萄糖時(shí),局部調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物(阻遏蛋白)與操縱基因結(jié)合,HPr-Ser46-P和CcpA結(jié)合形成復(fù)合物并與啟動(dòng)子區(qū)域cre位點(diǎn)結(jié)合,阻止FOS代謝相關(guān)結(jié)構(gòu)基因的表達(dá);只有FOS時(shí),結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄沒(méi)有CcpA復(fù)合物(即沒(méi)有CcpA復(fù)合物與啟動(dòng)子區(qū)域的cre位點(diǎn)結(jié)合)抑制,阻遏蛋白與FOS(誘導(dǎo)劑)結(jié)合,從操縱基因上脫離,解除對(duì)FOS代謝相關(guān)基因的抑制;葡萄糖和FOS都不存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄同樣沒(méi)有CcpA復(fù)合物的抑制,阻遏蛋白與操縱基因結(jié)合抑制FOS代謝相關(guān)簇表達(dá);葡萄糖和FOS都存在時(shí),阻遏蛋白與FOS(誘導(dǎo)劑)結(jié)合,脫離結(jié)構(gòu)基因,解除其對(duì)FOS相關(guān)基因簇啟動(dòng)子區(qū)域的抑制,但是這時(shí)全局調(diào)節(jié)因子CcpA與啟動(dòng)子區(qū)域cre位點(diǎn)結(jié)合,阻礙了RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合,從而抑制FOS代謝相關(guān)基因的表達(dá),即出現(xiàn)了CCR效應(yīng)。乳酸菌對(duì)碳源的代謝調(diào)控非常復(fù)雜,有些基因只受局部調(diào)控因子作用,有的會(huì)受到全局調(diào)控和局部調(diào)控的雙重作用,同時(shí)有的局部調(diào)控因子還受到全局調(diào)控的作用,因此這背后復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)還亟待解析。

    圖4 乳酸菌對(duì)FOS(或菊粉)的代謝調(diào)控Fig. 4 Metabolic regulation of FOS (or inulin) by lactic acid bacteria

    總的來(lái)說(shuō),乳酸菌對(duì)FOS/菊粉的代謝機(jī)制為:在誘導(dǎo)物存在或者不存在的情況下,乳酸菌基因組中與碳代謝相關(guān)的調(diào)控蛋白啟動(dòng)或抑制FOS/菊粉代謝相關(guān)基因簇的表達(dá),即影響編碼水解酶和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的表達(dá),進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對(duì)FOS或菊粉的代謝或不代謝。

    4 低聚果糖或菊粉類合生元的應(yīng)用

    乳酸菌代謝菊粉或FOS的能力對(duì)于合生元(特別是協(xié)同性合生元)發(fā)揮生理作用起著重要作用。本文對(duì)近年來(lái)(2018ü2021年)關(guān)于菊粉/FOS合生元的報(bào)道進(jìn)行了總結(jié)(表3)。研究表明菊粉/FOS合生元在對(duì)抗2型糖尿病的并發(fā)癥、調(diào)節(jié)免疫以及改善腸道健康方面具有積極的影響。Kanjan等[9]對(duì)協(xié)同性合生元進(jìn)行了體外研究,發(fā)現(xiàn)將L. paracaseiI321(能降解菊粉)和菊粉同時(shí)應(yīng)用到糞便菌群時(shí),菊粉使得L. paracaseiI321在糞便菌群的競(jìng)爭(zhēng)環(huán)境中存活并占優(yōu)勢(shì),同時(shí)其代謝過(guò)程分泌的胞外酶將菊粉水解為scFOS和果糖,刺激糞便中不能代謝菊粉但能代謝FOS的菌(乳桿菌和雙歧桿菌)的生長(zhǎng),使這些菌協(xié)同抑制沙門氏菌的生長(zhǎng)。

    表3 近年關(guān)于FOS/菊粉合生元的應(yīng)用研究Table 3 Recent applications of synbiotics containing FOS/inulin

    5 結(jié) 語(yǔ)

    本文綜述了乳酸菌對(duì)FOS和菊粉的代謝能力差異,乳酸菌代謝FOS和菊粉的途徑、代謝機(jī)制以及FOS/菊粉類合生元的應(yīng)用等。目前乳酸菌代謝FOS和菊粉的兩種途徑已較為明了,即先轉(zhuǎn)運(yùn)再水解和先水解再轉(zhuǎn)運(yùn),但是更為深入、清楚的代謝機(jī)制,尤其是調(diào)控機(jī)制還亟待解析。新技術(shù)手段的發(fā)展,特別是基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的發(fā)展,將為代謝機(jī)制的解析提供更好的手段。此外,雖然益生菌/益生元單獨(dú)使用均有益生效應(yīng),但是從實(shí)際應(yīng)用以及長(zhǎng)遠(yuǎn)發(fā)展來(lái)看,合理利用代謝機(jī)制促進(jìn)FOS或菊粉更有效地被乳酸菌利用、賦予乳酸菌與其他微生物競(jìng)爭(zhēng)的優(yōu)勢(shì)、開(kāi)發(fā)科學(xué)健康的合生元(尤其是協(xié)同性合生元)產(chǎn)品將有望成為未來(lái)的熱門課題。

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