吳非,劉飛*,張?zhí)O,李棟,孫亮亮,徐進
(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 園藝學(xué)院,山西 太谷 030801;2.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 資源與環(huán)境學(xué)院,北京 100091)
托魯巴姆(Solanum torvumSw.)是茄子(So?lanum melongenaL.)的近緣野生種,是一種優(yōu)良的茄子砧木和重要的鎘(Cd)低累積作物之一[1]。有研究表明,茄子嫁接到托魯巴姆砧木上后,其果實中Cd 含量下降了63%~74%[2]。Cd 由根系向莖葉的長距離運輸,即Cd 木質(zhì)部裝載量,是托魯巴姆地上部Cd 低累積的關(guān)鍵因素[3]。另外,熒光探針檢測表明,在茄子根中Cd 主要分布在中柱,而在托魯巴姆根中Cd 主要分布于皮層[4]。鎘通過鐵(Fe)、鈣(Ca)和鋅(Zn)轉(zhuǎn)運/通道蛋白進入植物細胞[5],高濃度Cd 處理后的托魯巴姆轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果表明,ZIP 家族轉(zhuǎn)運蛋白(Zinc and iron regulated transporter proteins)基因的差異表達在托魯巴姆Cd 的低累積發(fā)生過程中可能發(fā)揮了重要作用[6],但具體機制還有待進一步的研究。
ZIP 金屬轉(zhuǎn)運蛋白包括Zinc regulated transporter proteins(ZRT)和Iron regulated transporter proteins(IRT)[7],ZIP 家族轉(zhuǎn)運蛋白在植物中廣泛存在,對Zn2+、Fe2+、Cu2+及Cd2+等多種二價金屬離子的吸收、分配及運輸起重要作用[8-10]。ZIP 蛋白家族成員發(fā)揮功能往往具有不同的轉(zhuǎn)運對象及專一性,其表達水平也受到環(huán)境金屬離子濃度的調(diào)控[11]。擬南芥AtIRT1是在根表層細胞中高度表達的Fe轉(zhuǎn)運蛋白[12];AtZIP1?5、AtZIP9?12和AtIRT3在擬南芥根和莖中受缺Zn 誘導(dǎo)表達[13],并且AtZIP2和AtZIP5也在缺銅(Cu)誘導(dǎo)下于根部表 達[14]。水 稻OsIRT1和OsIRT2主要在根部表達,對Fe2+進 行的吸收和運輸[15];缺Zn 脅迫 下,OsZIP2僅在根部表達,OsZIP7僅在地上部表達,而OsZIP1、OsZIP3?5和OsZIP8在根和地上部中均表達[16-19]。研究ZIPs 轉(zhuǎn)運蛋白在不同植物中的表達模式,揭示不同金屬離子脅迫下ZIPs基因在各組織部位中的表達規(guī)律,可為提高作物養(yǎng)分吸收效率提供新的研究方向[20-21]。本研究利用qRTPCR 方法,分析了托魯巴姆StZIP5/11基因和茄子SmZIP5/11基因在Zn 和Cd 毒害下的表達模式,測定擬南芥突變體(zip5和zip11)以及轉(zhuǎn)托魯巴姆StZIP5和StZIP11基因擬南芥分別在Zn、Cd 毒害下主根生長量,為初步探明StZIP5和StZIP11基因功能提供理論依據(jù)。
托魯巴姆和茄子種子先用無菌水浸泡30 min,無菌環(huán)境下置于50% 消毒水中浸泡消毒8 min,再用無菌水沖洗5~8 遍。將種子均勻的播種在1/2MS 培養(yǎng)基表面。4 ℃中春化3 d 后,放至人工氣候室中進行萌發(fā)培養(yǎng)。培養(yǎng)條件為22 ℃、5000 lx、16 h/8 h 光暗。待子葉完全展開后,選取長勢均勻一致的托魯巴姆和茄子幼苗,轉(zhuǎn)移到1/2 Hoagland 營養(yǎng)液中進行培養(yǎng),培養(yǎng)條件不變。每3 d 更換1次營養(yǎng)液。對生長4 周的托魯巴姆和茄子幼苗,在營養(yǎng)液中分別進行添加200 μmol·L-1Zn或10 μmol·L-1Cd,每處理設(shè)3 組重復(fù)。以正常1/2 Hoagland 營養(yǎng)液培養(yǎng)條件下生長的幼苗為對照,分別取處理后第1、3 天的葉、莖和根為樣品。樣品收集后立即液氮冷凍并放于-80 ℃保存。
擬南芥突變體zip5(SALK_009007C)和zip11(SALK_009007C)購自TAIR(https://www.arabidopsis.org/)。將托魯巴姆StZIP5和StZIP11基因的CDS 序列分別與含有CaMV 35S 啟動子的pCAMBIA1300 載體連接,構(gòu)建StZIP5和StZIP11基因過表達載體,轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌菌株。利用擬南芥花 序 浸 染 法[22],將構(gòu)建好的StZIP5和StZIP11基因過表達載體轉(zhuǎn)化到擬南芥中,并獲得轉(zhuǎn)StZIP5和StZIP11基因的擬南芥StZIP5OX、StZIP11OX、StZIP5OX/zip5、StZIP11OX/zip11、StZIP5OX/zip11和StZIP11OX/zip5后代。將獲得的種子在1/2MS(hyg+)固體培養(yǎng)基上進行篩選;利用qRT-PCR 對轉(zhuǎn)基因T3代后代進行基因表達鑒定,選擇陽性株系進行后續(xù)試驗(表1)。
表1 鑒定轉(zhuǎn)基因擬南芥引物Table 1 Primers for identification of transgenic A.thaliana
分析所用的托魯巴姆StZIP5和StZIP11的CDS 序列由作者在前期采用RACE 方法克隆得到;茄子、擬南芥的相關(guān)序列信息分別獲取于茄子EGDB(http://eggplant. kazusa. or. jp/)數(shù) 據(jù) 庫[23]和擬南芥TAIR 數(shù)據(jù)庫。采用Clustal Omega 進行多序列比較分析,并使用Jalview 進行作圖;分子進化樹利用MEGA-X 進行構(gòu)建,自展值為1000,并使用FigTree 進行作圖。
對收取的托魯巴姆和茄子樣品進行總RNA提取,使用Nanodrop 進行RNA 樣品純度檢測以及濃度定量,以保證使用的RNA 樣品合格和后續(xù)實驗的進行。使用Roche LightCycler 480 熒光定量PCR 儀進行qRT-PCR。以Actin8基因作為內(nèi)參,每個基因3次重復(fù),使用2-ΔΔCt方法進行基因表達分析[24],顯著性差異t檢驗P<0.05,引物序列見表2。
表2 引物序列Table 2 Primers of qRT-PCR
使用Epson Perfection V500 Photo 掃描儀對處理4 d 的擬南芥幼苗主根進行掃描,并采用Image-J 對主根生長量進行測量。利用SPSS 軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,顯著性差異t 檢驗P<0.05。
對茄子SmZIPs 以及托魯巴姆StZIP5 和StZIP11 的蛋白序列進行了多序列同源性比較分析(圖1)。分析表明托魯巴姆StZIP5 和StZIP11與茄子ZIP 家族成員之間的氨基酸序列具有較高的同源性,預(yù)示了托魯巴姆StZIP5 和StZIP11 與茄子ZIP 家族成員之間具有類似的結(jié)構(gòu)以及發(fā)揮相似或相同的功能。進一步分析發(fā)現(xiàn),StZIP5 和SmZIP5 之間的序列一致性為97.97%,StZIP11 和SmZIP11 之間的序列相似度為96.19%(表3)。
表3 StZIP5/11 和SmZIP5/11 序列的相似性百分比單位矩陣Table 3 Percent identity Matrix of sequences in StZIP5/11 and SmZIP5/11
圖1 SmZIPs 的序列同源性分析Fig.1 Sequence identity analysis of SmZIPs
ZIP 蛋白家族之間的進化關(guān)系顯示,不同物種之間的同名ZIP 成員具有很高的親緣關(guān)系(圖2),參與分析的ZIP 成員在進化上被分為了4個進化分支,ZIP2 和ZIP11 形成的進化分支長度最長,ZIP6 形成的進化分支個體成員最少。并且,StZIP5 和SmZIP5 之間的差異度為0.00,StZIP11和SmZIP11 之間的差異度為0.01,表明StZIP5 和SmZIP5 以及StZIP11 和SmZIP11 之間的僅具有極小的序列差異。
圖2 擬南芥、茄子的ZIP 家族成員和托魯巴姆StZIP5 和StZIP11的分子進化樹Fig.2 Phylogenetic relationship of S.torvum StZIP5 and StZIP11 with other ZIP family members in A.thaliana and S.melon?gena
對Zn 毒害下托魯巴姆和茄子幼苗ZIP5和ZIP11基因在根、莖、葉中1、3 d 時表達水平進行了分析(圖3)。StZIP5基因的表達水平均顯著低于對照組;SmZIP5基因的表達水平在1 d 時的根、莖中同樣顯著低于對照,但在葉中1 d 時顯著高于對照;在3 d 時,根中顯著高于對照,莖中與對照組無顯著差異,而葉中顯著低于對照。StZIP11基因在根中1 d 的表達水平顯著高于對照,3 d 時的表達水平較對照組無顯著差異,SmZIP11基因在根中1 d的表達水平較對照組無顯著差異,3 d 時的表達水平顯著高于對照;StZIP11基因在莖中的表達水平較對照組均無顯著差異,SmZIP11基因顯著高于對照;StZIP11基因在葉中1 d 的表達水平顯著高于對照,3 d 時的表達水平較對照組無顯著差異,SmZIP11基因在1 d 和3 d 時均顯著高于對照。
圖3 鋅毒害下托魯巴姆和茄子ZIP5 和ZIP11 的基因表達Fig.3 Gene expression of ZIP5 and ZIP11 in S.melongena and S.torvum under high Zn stress
對Cd 毒害下托魯巴姆和茄子ZIP5和ZIP11基因的表達量進行了分析(圖4)。托魯巴姆和茄子幼苗Cd 毒害處理1、3 d 時,StZIP5基因在根中的表達水平較對照組無顯著差異,而SmZIP5基因的表達水平在3 d 時顯著高于對照;StZIP5基因的表達水平在莖中3 d 時顯著低于對照,而SmZIP5基因的表達水平在1、3 d 時較對照組無顯著差異;StZIP5和SmZIP5基因在葉中1 d 的表達水平均顯著高于對照,但StZIP5基因3 d 時于對照組無顯著差異,SmZIP5基因3 d 時顯著低于對照。StZIP11和SmZIP11基因在根、莖、葉中1、3 d 時的表達水平均顯著高于對照組。
圖4 鎘毒害下托魯巴姆和茄子ZIP5 和ZIP11 的基因表達Fig.4 Gene expression of ZIP5 and ZIP11 in S.melongena and S.torvum under high Cd stress
野生型擬南芥Col-0、擬南芥突變體zip5和zip11、轉(zhuǎn)基因擬南芥StZIP5OX、StZIP11OX、StZIP5OX/zip5、StZIP11OX/zip11、StZIP5OX/zip11和StZIP11OX/zip5的主根生長量在45 μmol·L-1Cd 處理下均顯著降低(圖5)。但zip5和zip11的相對主根長量顯著高于Col-0;StZIP5OX、StZIP11OX的相對主根長量顯著低于Col-0。StZIP5OX/zip5、StZIP11OX/zip5的相對主根長量顯著低于zip5;StZIP5OX/zip11、StZIP11OX/zip11的相對主根長量顯著低于zip11。
圖5 Cd 毒害下擬南芥的主根生長量和相對主根生長量Fig.5 Principal root growth and relative principal root growth of A.thaliana under high Cd stress
400 μmol·L-1Zn 處理下,擬南芥的主根生長量和相對主根生長量結(jié)果如圖6所示。Col-0、zip5、zip11、StZIP5OX、StZIP11OX、StZIP5OX/zip5、StZIP11OX/zip11、StZIP5OX/zip11和StZIP11OX/zip5的主根生長量在400 μmol·L-1Zn 處理下同樣被顯著抑制。并且,zip5、zip11的相對主根長量顯著高于Col-0;StZIP5OX、StZIP11OX的相對主根長量顯著低于Col-0;StZIP5OX/zip5、StZIP11OX/zip5的相對主根長量顯著低于zip5;StZIP5OX/zip11、StZIP11OX/zip11的 相 對 主 根長量顯著低于zip11。
圖6 Zn 毒害下擬南芥的主根生長量和相對主根生長量Fig.6 Principal root growth and relative principal root growth of A.thaliana under high Zn stress
本研究中,茄子SmZIPs以及托魯巴姆StZIP5和StZIP11的蛋白序列同源性比較分析結(jié)果表明,茄子ZIP家族蛋白成員之間在功能結(jié)構(gòu)區(qū)的氨基酸序列相對保守,與蒲琦[11]、傅明輝等[25]論述的對植物ZIP基因家族結(jié)構(gòu)的觀點結(jié)果一致。StZIP5和SmZIP5 之間的序列一致性為97.97%,StZIP11和SmZIP11 之間的序列一致性為96.19%。分子進化樹顯示,托魯巴姆StZIP5、StZIP11 和茄子SmZIPs 與擬南芥同名ZIP 家族成員具有較高的親緣關(guān)系。并且StZIP5 和SmZIP5 之間的差異度為0.00,StZIP11 和SmZIP11 之間的差異度為0.01,這些結(jié)果說明StZIP5 和SmZIP5 以及StZIP11 和SmZIP11 之間的僅具有極小的序列差異。
在200 μmol·L-1Zn 處理下,除StZIP11基因在葉中1 d 時的表達水平顯著升高(3 d 時較對照組無顯著差異)外,其余時間點StZIP5和StZIP11基因的表達水平較對照組顯著降低或無顯著差異。推測在Zn 毒害下,托魯巴姆通過降低StZIP5和StZIP11基因的表達量來減少StZIP5 和StZIP11轉(zhuǎn)運蛋白的含量,從而降低對Zn 的吸收以維持植物 體Zn的平衡。Lee 等[26]在Zn毒害下通過水稻OsZIP5基因表達結(jié)果也驗證了這一結(jié)論。茄子在200 μmol·L-1Zn 處 理3 d 時,SmZIP5和SmZIP11基因在根中顯著高表達,暗示茄子在Zn 毒害過程中吸收了較多的Zn。而在葉中,SmZIP5和SmZIP11基因在應(yīng)對Zn 毒害時表達水平先升高后降低,推測在茄子葉中先通過增加轉(zhuǎn)運分配,后通過降低表達量的方式以減少過量Zn 對葉的毒害作用。與Katarzyna 等[27]認(rèn)為煙草NtZIP11基因在維持整個煙草鋅的供應(yīng)相符。
Cd 對植物的毒害作用主要是由于Cd 與Fe、Zn之間的競爭吸收,Cd通過Fe或Zn轉(zhuǎn)運蛋白通道進入植物細胞,從而導(dǎo)致植物缺Fe或缺Zn[5]。10 μmol·L-1Cd 處理下,托魯巴姆StZIP5和StZIP11基因和茄子SmZIP5和SmZIP11基因在根、莖和葉中的qRT-PCR 結(jié)果表明,ZIP5和ZIP11基因參與了托魯巴姆和茄子對Cd 的吸收和轉(zhuǎn)運過程。 托魯巴姆StZIP11基因和茄子SmZIP11基因在1、3 d 時較對照組均顯著高表達,但根中StZIP5基因在1、3 d 時較對照組均無顯著,而茄子SmZIP5基因在3 d 時的根中顯著高表達。這表明,相對托魯巴姆,茄子在Cd 毒害過程中吸收了更多的Cd。在莖中StZIP5基因和SmZIP5基因的表達水平均較低,但托魯巴姆StZIP5在3 d 時較對照組顯著低表達。在葉中1 d 時StZIP5基因和SmZIP5基因的表達水平較對照組顯著高表達。以上結(jié)果表明,茄子可能通過根部吸收大量Cd,并且通過莖向地上部運輸,使Cd 在葉中富集。Mori等[3]通過對托魯巴姆和茄子根部、地上部以及木質(zhì)部汁液中Cd 的濃度測定結(jié)果也驗證了這一結(jié)論。與茄子不同,托魯巴姆莖和葉中StZIP5基因表達水平較對照組無顯著差異或顯著低表達;與Mori等[3]認(rèn)為莖的截留作用是導(dǎo)致了托魯巴姆地上部Cd 低累積相符。然而托魯巴姆莖部對Cd 的具體截留機制還有待進一步揭示。
Cd 和Zn 毒害均能顯著抑制植物根系生長[28-29]。在45 μmol·L-1Cd 和400 μmol·L-1Zn 處 理下,野生型擬南芥Col-0、擬南芥突變體zip5和zip11、轉(zhuǎn)托魯巴姆StZIP5和StZIP11基因擬南芥StZIP5OX、StZIP11OX、StZIP5OX/zip5、StZIP11 OX/zip11、StZIP5OX/zip11和StZIP11OX/zip5的主根生長均受到不同程度的抑制,與Castiglione等[28]得出的Zn 毒害能顯著抑制植物根系生長一致。擬南芥AtZIP5或AtZIP11基因的功能喪失突變體(zip5和zip11)主根生長表現(xiàn)出了對Zn 和Cd脅迫顯著的耐受性;托魯巴姆StZIP5或StZIP11基因在擬南芥野生型Col-0 中的過量表達顯著加重了Zn 和Cd 毒害下對擬南芥主根生長的抑制;托魯巴姆StZIP5或StZIP11基因在擬南芥突變體zip5或zip11中的過量表達也顯著加重Zn 和Cd 毒害對擬南芥主根生長的抑制。這些結(jié)果表明,托魯巴姆StZIP5或StZIP11基因在擬南芥中的過量表達增強了Zn 和Cd 毒害對擬南芥主根生長的抑制作用。
托魯巴姆作為一種優(yōu)良的茄子砧木和重要的Cd 低累積作物之一,其Cd 低累積機理的研究對茄子、番茄等低Cd 蔬菜品種的改良具有極其重要的意義。本研究結(jié)果表明StZIP5或StZIP11參與了托魯巴姆低Cd 累積過程,有助于未來進一步的研究探明StZIP5或StZIP11在托魯巴姆中調(diào)節(jié)Cd 累積與耐受的分子機理。