美國(guó)《Emerging Infectious Diseases》2022年第1期有關(guān)人獸共患病論文摘譯

P1 印度浦那冠狀病毒病患者中暴發(fā)毛霉菌病//Samir Joshi,Rahul Telang,Muralidhar Tambe,等

本文回顧了冠狀病毒病(COVID-19)大流行時(shí)期毛霉菌病的流行病學(xué)和臨床病程。在印度浦那第2波COVID-19流行期間，對(duì)178例COVID-19治療后經(jīng)臨床、內(nèi)窺鏡診斷或組織病理學(xué)確診的鼻-眶-腦毛霉菌病患者，進(jìn)行回顧性圖表分析。從診斷為COVID-19到出現(xiàn)毛霉菌病癥狀的中位時(shí)間為28 d。73%的患者為中度或重度COVID-19，74.2%的患者既往或新近診斷患有糖尿病；52.8%的患者接受了類固醇治療；75%的患者鼻上方或鼻內(nèi)可見焦痂，但多數(shù)患者入院時(shí)的臨床體征和實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)并無(wú)特殊；大約90%的病例有骨穿透，30%的病例有翼腭窩軟組織腫脹，7%的病例有海綿狀竇血栓形成，60%的病例有多灶核霉病；在178例研究病例中，151人(85%)接受了外科清創(chuàng)術(shù)，26人(15%)死亡，死亡病例中16人(62%)患有多灶毛霉病。病例數(shù)情況詳見圖1。

A為2016年1月1日至 2021年6月14日；B為2020年9月1日至2021年6月14日。圖1 印度浦那Sassoon綜合醫(yī)院在COVID-19大流行之前和期間評(píng)估和治療的鼻-眶-腦毛霉菌病病例數(shù)

P35 美國(guó)多州暴發(fā)與大規(guī)模公眾集會(huì)相關(guān)的新型冠狀病毒感染，包括疫苗突破性感染//Radhika Gharpure,Samira Sami,Johanna Vostok,等

2021年7月，在美國(guó)馬薩諸塞州普羅文斯敦舉行大規(guī)模公眾集會(huì)后，發(fā)生了新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)B.1.617.2型變異株感染，包括疫苗突破性感染，促使開展一項(xiàng)多州調(diào)查。公共衛(wèi)生部門通過新冠監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)、病例調(diào)查和接觸者追蹤來(lái)確定原發(fā)和續(xù)發(fā)病例。原發(fā)病例被定義為在7月3日至17日在普羅溫斯敦旅行或居住后的14 d內(nèi)檢出SARS-CoV-2。續(xù)發(fā)病例被定義為7月3日至8月10日期間，在與原發(fā)病例密切接觸后的14 d內(nèi)檢出SARS-CoV-2，但無(wú)普羅溫斯敦旅居史。本文確定了1 098例原發(fā)病例和30例續(xù)發(fā)病例，其中26例原發(fā)病例發(fā)生在完全和未完全接種疫苗的人群中。大規(guī)模集會(huì)可對(duì)SARS-CoV-2傳播產(chǎn)生廣泛影響，尤其是在高流行期，完全接種疫苗的人也應(yīng)采取戴口罩等防護(hù)措施，以預(yù)防SARS-CoV-2感染與傳播。

P51 2018-2019年美國(guó)到墨西哥的醫(yī)療旅游與廣泛耐藥的耐碳青霉烯類銅綠假單胞菌//Ian Kracalik,D.Cal Ham,Gillian McAllister,等

耐碳青霉烯類銅綠假單胞菌(CRPA)可產(chǎn)生維羅納整合子編碼的金屬-β-內(nèi)酰胺酶(VIM)，是一種高抗菌耐藥病原體，在美國(guó)并不常見。本文調(diào)查了在墨西哥蒂華納接受減肥手術(shù)的美國(guó)醫(yī)療游客中VIMCRPA的來(lái)源。病例為2018年1月至2019年12月期間，分離出VIM-CRPA或CRPA且在標(biāo)本采集前45 d內(nèi)赴墨西哥接受了選擇性侵入性醫(yī)療手術(shù)的對(duì)象。對(duì)分離株進(jìn)行全基因組測(cè)序。在18個(gè)州發(fā)現(xiàn)了38名病例患者；31例由外科醫(yī)生進(jìn)行手術(shù)，且大多數(shù)(27/31)來(lái)自A機(jī)構(gòu)。美國(guó)患者和醫(yī)療服務(wù)提供者應(yīng)認(rèn)識(shí)到，存在醫(yī)療旅游后被美國(guó)不常見的高耐藥性病原體定植和感染的風(fēng)險(xiǎn)。

P62 香港COVID-19的非藥物干預(yù)對(duì)兒童其他呼吸道病毒感染住院治療的影響//Ian Kracalik,D.Cal Ham,Gillian McAllister,等

為確定COVID-19的非藥物干預(yù)(NPIs)對(duì)兒童感染新冠病毒以外的呼吸道病毒的住院治療的影響，本文分析了2017-2021年的醫(yī)院數(shù)據(jù)。與2017-2019年相比，2020年實(shí)施了NPIs，同年與呼吸道病毒相關(guān)的年齡別住院率大幅下降。此外，在實(shí)施NPIs期間，各年齡段兒童感染甲型和乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒、人類偏肺病毒和鼻病毒/腸病毒的住院率也有所下降。年齡和季節(jié)調(diào)整后的回歸模型表明，其他原因所致急性發(fā)熱性疾病/呼吸道癥狀的住院率降低了76%，而感染上述病毒的住院率降低了85%～99%。香港施行NPIs與兒童呼吸道病毒住院率降低相關(guān),而施行NPIs 和學(xué)校復(fù)課與感染鼻病毒/腸道病毒的住院率小幅增加相關(guān)。

P85 新冠病毒再次感染和復(fù)發(fā)的系統(tǒng)基因組學(xué)和臨床分析//Cristina Rodríguez-Grande,Luis Alcalá,Agustín Estévez,等

由于缺乏包含基因組學(xué)支持的人群水平研究，很難評(píng)估新冠病毒再次感染的負(fù)擔(dān)。在病毒基因分析和宿主基因分析的支持下，在西班牙馬德里對(duì)新冠病毒再次感染進(jìn)行了系統(tǒng)研究，以消除實(shí)驗(yàn)室錯(cuò)誤，并區(qū)分涉及同一毒株的再次感染和復(fù)發(fā)。在2020年3月至2021年3月確診的41 195例病例中，93例(0.23%)有2次逆轉(zhuǎn)錄PCR檢測(cè)陽(yáng)性(間隔55～346 d)。在剔除標(biāo)本未保存、序列質(zhì)量不佳或?qū)儆诓煌±那闆r后，得到22例有效數(shù)據(jù)。4例(0.01%)為同一毒株的復(fù)發(fā);患者年齡為39～93歲，其中3例免疫抑制。18例為再次感染(0.04%);患者年齡為19～84歲，多數(shù)無(wú)相關(guān)臨床病史。第1次發(fā)作病情加重的有8例。

P111 肺炎支原體全球基因組多樣性與重組//Yu-Chia Hsieh,Shiao-Wen Li,Yi-Yin Chen,等

肺炎支原體對(duì)環(huán)境或生態(tài)壓力的適應(yīng)引起的基因組變化，知之甚少。本研究收集了2017-2020年臺(tái)灣地區(qū)確診肺炎兒童的肺炎支原體，使用全基因組測(cè)序?qū)⑦@些分離株與全球范圍內(nèi)當(dāng)前和歷史臨床菌株庫(kù)進(jìn)行比較，描述種群結(jié)構(gòu)特征。對(duì)284株菌株進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析，結(jié)果顯示，所有測(cè)序菌株由5個(gè)進(jìn)化枝組成:T1-1(序列型1)、T1-2(序列型以ST3為主)、T1-3(序列型ST17)、T2-1(序列型以ST2為主)、T2-2(序列型以ST14為主)。本研究鑒定出一個(gè)可能包含6個(gè)基因的重組區(qū)(MPN366-371)。每個(gè)進(jìn)化枝都檢測(cè)到涉及23S rRNA突變的大環(huán)內(nèi)酯類耐藥性。大環(huán)內(nèi)酯抗性的克隆擴(kuò)增主要發(fā)生在1亞型株中，其中進(jìn)化枝T1-2表現(xiàn)出最高的重組率和基因組多樣性。重組區(qū)域的功能表征闡明了這些重組事件在肺炎支原體進(jìn)化中的生物學(xué)作用。

P139 2017-2019年意大利病豬豬鏈球菌新序列類型及耐藥菌株研究//Lucilla Cucco,Marta Paniccià,Francesca Romana Massacci,等

豬鏈球菌是一種與豬和人類嚴(yán)重疾病相關(guān)的病原體。人類感染源于豬，為人獸共患病。為評(píng)估循環(huán)毒株，本研究對(duì)2017-2019年意大利病豬身上分離到的78株豬鏈球菌的血清型、序列類型和抗菌藥物敏感性進(jìn)行分析。近60%的感染是由血清型1/2和血清型9引起的。血清型2和血清型1/2的分離株除1株外均聚集在一個(gè)聚類中，而血清型9株則沿系統(tǒng)進(jìn)化樹分布。除序列類型(ST)1外，血清型2還包括ST17,該序列類型曾在1998年和2005年在中國(guó)引起嚴(yán)重的人感染。大部分的血清型9分離株，歸類為ST123，對(duì)青霉素耐藥。這種克隆株的出現(xiàn)影響了豬鏈球菌感染治療的成功率。從豬身上分離豬鏈球菌株并加以鑒定，將有助于早期發(fā)現(xiàn)新出現(xiàn)的克隆株。

P166 與死亡相關(guān)的肺炎鏈球菌血清型，南非，2012-2018年//Annelies Müller,Jackie Kleynhans,Linda de Gouveia,等

肺炎鏈球菌莢膜多糖與疾病嚴(yán)重程度有關(guān)。本文采用向后剔除多變量logistic回歸，評(píng)估了2012-2018年(疫苗時(shí)代)南非侵襲性肺炎球菌病(IPD)和腦膜炎血清型與病死率(CFR)的關(guān)系。IPD最常見的血清型為8型和19A型。在<15歲的患者中，控制混雜因素后，與8型相比，與IPD中CFR升高相關(guān)的血清型為11A、13、19F、15A和6A。這些血清型均與腦膜炎患者病死率增加無(wú)關(guān)。在>15歲的IPD患者中，15B/C型與CFR增高相關(guān)。在所有年齡的腦膜炎患者中，血清1型與CFR病死率增加相關(guān)。應(yīng)監(jiān)測(cè)PCV13血清型1、3、6A、19A和19F，且應(yīng)考慮將血清型8、12F、15A和15B/C納入疫苗，以減少肺炎鏈球菌導(dǎo)致的死亡。