首次構(gòu)建出泛癌真菌微生物組圖譜

據(jù)Narunsky-Haziza L 2022年9月29日[Cell，2022，185（20）：3789-3806.e17.]報道，美國加州大學(xué)圣地亞哥分校和以色列魏茨曼科學(xué)研究所等研究機構(gòu)的研究人員通過調(diào)查35種癌癥及其相關(guān)真菌，構(gòu)建出首個泛癌真菌微生物組圖譜。

癌細胞和微生物有著長期而持久的聯(lián)系。這兩者在人體的生態(tài)系統(tǒng)中共同進化，經(jīng)常依賴相同的資源。對這些資源的競爭往往影響到癌細胞、微生物和人類宿主的復(fù)制和生存。

癌癥與個別微生物之間的聯(lián)系長期以來一直被逐一研究，但最近的焦點主要集中在整個人類微生物組上，特別是在腸道中，因為腸道中的細菌、病毒和真菌比人體其他地方更多、更多樣化。然而與癌癥有關(guān)的真菌的作用和影響在很大程度上仍未得到研究和了解。真菌是比病毒和細菌更復(fù)雜的有機體。它們是真核生物——含有細胞核的有機體。相比于細菌或病毒，它們的細胞與動物細胞要相似得多。

大多數(shù)人類癌癥中存在真菌，這是令人吃驚的。因為人們不知道真菌如何能進入整個身體的腫瘤。但它也是令人期待的，因為它符合整個身體（包括腸道、口腔和皮膚）的健康微生物組的模式，在那里，細菌和真菌作為復(fù)雜群落的一部分相互作用。

在人體上發(fā)現(xiàn)的真菌主要有兩種類型：環(huán)境真菌，如酵母菌和霉菌，通常對大多數(shù)健康人不構(gòu)成危害；共生真菌，它們生活在人體表面上或體內(nèi)，可能無害，提供諸如改善腸道健康之類的益處，或者導(dǎo)致疾病，比如酵母菌感染或肝病。真菌還在塑造宿主免疫力方面發(fā)揮著作用，這在免疫功能低下的人（包括癌癥患者）中顯得尤為突出。

該研究選擇4個獨立隊列的35種癌癥的17 401例患者組織、血液和血漿樣本，對表征癌癥真菌微生物組與癌癥有關(guān)的真菌進行分析。將真菌群落與相匹配的細菌組（微生物組的細菌部分）和免疫組（構(gòu)成免疫系統(tǒng)的基因和蛋白）進行比較分析顯示，它們之間的關(guān)聯(lián)性往往是“寬容的”，而不是競爭的。如發(fā)現(xiàn)一種真菌物種在50歲以上患者的乳腺癌腫瘤中富集，而另一種真菌物種在肺癌樣本中明顯大量存在。特定的真菌與年齡、腫瘤亞型、吸煙狀態(tài)、對免疫療法的反應(yīng)和生存措施之間存在著明顯的關(guān)聯(lián)性。這些真菌是簡單的相關(guān)還是有因果關(guān)系，有待確定。

這些發(fā)現(xiàn)驗證了這樣一個觀點，即從整體上來看微生物組是癌癥生物學(xué)的一個關(guān)鍵部分，并且可能帶來重大的轉(zhuǎn)化機會，不僅在癌癥檢測方面，而且在與藥物開發(fā)、癌癥演變、最小殘留疾病、復(fù)發(fā)和輔助診斷有關(guān)的其他生物技術(shù)應(yīng)用方面。