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    紫蘇硬脂酰-ACP 脫氫酶基因家族鑒定及表達(dá)分析

    2022-03-09 03:37:06董書(shū)言周雅莉楊宏斌王計(jì)平
    西北植物學(xué)報(bào) 2022年1期

    邢 志,董書(shū)言,王 超,周雅莉,楊宏斌,王計(jì)平

    (山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 分子農(nóng)業(yè)與生物能源研究所,山西太谷 030801)

    紫蘇(Perillafrutescens)古名荏,又名赤蘇、桂荏、香蘇,系唇形科紫蘇屬一年生草本植物,在亞洲國(guó)家種植廣泛[1]。紫蘇具有豐富的種質(zhì)資源,在中國(guó)已有2000多年的栽培歷史,適宜在光照充足、土壤疏松、肥力足及排水好的環(huán)境條件下種植[2]。紫蘇具有特異芳香,主要用于油用、藥用、食用及香料方面,是衛(wèi)計(jì)委首批公布的60種藥食同源植物之一,可以開(kāi)發(fā)出多種保健食品[3]。紫蘇種子中含油量高達(dá)45%~55%,其不飽和脂肪酸含量豐富,占總脂肪酸含量的 90%以上,其中油酸含量約占12.01%,亞油酸含量約為15.43%,α-亞麻酸含量高達(dá)62.73%,是目前發(fā)現(xiàn)的亞麻酸含量較高的油料作物之一[4-5]。α-亞麻酸能夠提高人體免疫力、降低膽固醇、延緩機(jī)體衰老、預(yù)防阿爾茨海默病等,常用于保健和治療疾病[6]。因此,紫蘇油極具開(kāi)發(fā)價(jià)值,是良好的植物保健資源,其在醫(yī)藥及食品等領(lǐng)域都具有重要的的開(kāi)發(fā)利用價(jià)值和良好的市場(chǎng)前景[7]。

    植物油脂主要通過(guò)脂肪酸(FA)的生物合成和 TAG 的合成積累來(lái)形成,脂肪酸的從頭合成途徑主要發(fā)生在質(zhì)體中,該過(guò)程以乙酰輔酶 A 作為底物,在?;d體蛋白(ACP)的參與下進(jìn)行催化合成[8]。在脂肪酸合酶復(fù)合物(FAS)的催化下,丙二酰輔酶 A 與 ACP 結(jié)合,?;溍總€(gè)循環(huán)經(jīng)歷 2 個(gè)碳原子形式的連續(xù)縮合反應(yīng),產(chǎn)生16∶0-ACP和18∶0-ACP[9]。硬脂酰-ACP脫氫酶(stearoyl-ACP desaturase,SAD)以硬酰基-ACP(C18∶0-ACP)為底物,催化18∶0-ACP 在第9-10碳原子間脫氫形成一個(gè)雙鍵產(chǎn)生18∶1-ACP,得到的18∶1-ACP可以進(jìn)入原核甘油脂途徑,或被水解成游離脂肪酸,進(jìn)而在酰基-CoA 合成酶的作用下活化成脂酰-CoA,并從質(zhì)體轉(zhuǎn)運(yùn)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或胞質(zhì)中[10-11]。植物脂酰-ACP 脫飽和酶定位于植物質(zhì)體中,是植物中唯一可知的可溶性脫飽和酶家族,包括Δ9硬脂酰 ACP 脫飽和酶、Δ6 軟脂酰 ACP 脫飽和酶和Δ4 軟脂酰ACP 脫飽和酶等,其中SAD催化硬脂酰基-ACP在Δ9 位置去飽和形成油酰ACP,使硬脂酸脫飽和后形成油酸(18∶1),其存在于質(zhì)體基質(zhì)中,調(diào)控紫蘇不飽和脂肪酸成分的比例,是不飽和脂肪酸合成代謝的關(guān)鍵酶[12],對(duì)調(diào)節(jié)油料作物種子中脂肪酸組成具有重要意義。目前,已經(jīng)從蓖麻[13]、油菜[14]和棉花[15-16]等植物中克隆獲得SAD基因,并驗(yàn)證了其功能和表達(dá)特性。Liu 等[16]利用 RNA 干涉對(duì)棉花SAD基因進(jìn)行沉默,結(jié)果發(fā)現(xiàn)棉花中的硬脂酸含量從20%上升到40%,而棉籽油中的3種主要脂肪酸(棕櫚酸、油酸和亞油酸)含量減少。在煙草中過(guò)表達(dá)SAD基因,硬脂酸(18∶0)被催化為油酸(18∶1),使得多不飽和脂肪酸含量增加,轉(zhuǎn)基因煙草及其種子的抗寒性顯著提高[17]。前人研究表明,SAD家族基因在不同組織器官中具有不同的表達(dá)模式[15,18-19]。Kachroo等[18]研究表明擬南芥AtSADs呈現(xiàn)組織特異性表達(dá),且在發(fā)育種子中的表達(dá)量比其他組織都高。Shang等[15]對(duì)棉花中SAD基因家族進(jìn)行鑒定,研究發(fā)現(xiàn)棉花GhSAD2 和GhSAD4 在開(kāi)花后20~35 d的發(fā)育種子中表達(dá)量較高,在其他組織中表達(dá)較低。已有報(bào)道顯示,SAD基因家族已在棉花[15]、擬南芥[18]、可可[19]等作物中被鑒定,而關(guān)于紫蘇PfSAD的研究鮮見(jiàn)報(bào)道。因此,為解析紫蘇硬脂酰-ACP 脫氫酶基因家族(PfSAD)在脂肪酸合成過(guò)程中發(fā)揮的作用,本研究對(duì)紫蘇SAD家族成員的基因結(jié)構(gòu)及酶蛋白理化性質(zhì)等序列特征進(jìn)行分析,并采用實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)對(duì)紫蘇PfSAD家族基因的表達(dá)特性進(jìn)行研究,為進(jìn)一步探究PfSAD家族基因的功能以及紫蘇油脂合成機(jī)制、提高紫蘇油品質(zhì)與產(chǎn)量提供理論依據(jù)。

    1 材料和方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    供試植物材料為‘晉紫蘇1號(hào)’品種,種植于山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)作站試驗(yàn)基地,以點(diǎn)播方式進(jìn)行種植,每小區(qū)分6行,每行6株,株距50 cm,行距50 cm,小區(qū)間距50 cm,播種1個(gè)月后進(jìn)行間苗。在苗期、花期及種子發(fā)育不同時(shí)期分別取樣,取6周齡左右的幼苗根、莖、葉、盛花期的花,以及開(kāi)花后10、20、30、40 d的種子,所有樣品液氮速凍后儲(chǔ)存于-80 ℃冰箱備用。

    1.2 試驗(yàn)方法

    1.2.1 紫蘇PfSADs基因的鑒定在課題組前期自測(cè)序獲得的紫蘇轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出功能注釋為SAD的基因序列及氨基酸序列,根據(jù)不同物種間同源基因核苷酸序列相對(duì)保守的特點(diǎn),將紫蘇SAD的基因序列與擬南芥和蓖麻等植物中的SAD序列進(jìn)行比對(duì)分析,獲得紫蘇PfSADs基因的CDS序列。

    1.2.2 紫蘇PfSADs基因編碼蛋白的理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)分析利用生物信息學(xué)軟件對(duì)紫蘇PfSAD家族基因進(jìn)行分析,通過(guò)在線(xiàn)工具NCBI-ORF Finder分析紫蘇PfSAD家族基因的開(kāi)放閱讀框(ORF);通過(guò)在線(xiàn)軟件ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)對(duì)PfSADs蛋白的分子量、等電點(diǎn)等基本理化性質(zhì)進(jìn)行分析;利用TMHMM(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)預(yù)測(cè)PfSADs蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)域;使用Plant-Multi和TargetP在線(xiàn)網(wǎng)站對(duì)PfSADs編碼的蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)分析;運(yùn)用NCBI-CDD分析紫蘇PfSADs蛋白序列的功能結(jié)構(gòu)域;采用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_ automat.pl?page=npsa_sopma.html)軟件預(yù)測(cè)PfSADs蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu);運(yùn)用SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/interactiv)對(duì)PfSADs蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行同源建模和預(yù)測(cè)分析;采用多序列比對(duì)工具ClustalW對(duì)紫蘇PfSAD家族基因的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì);運(yùn)用MEGA7軟件鄰接法(neighbor-joining,NJ)對(duì)紫蘇及其近緣種的SAD蛋白進(jìn)行比對(duì)分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

    1.2.3 RNA提取及cDNA的合成用艾德萊公司的 EASYspin植物 RNA 快速提取試劑盒提取紫蘇根、莖、葉、花和不同發(fā)育時(shí)期種子的RNA,并檢測(cè)各個(gè)組織RNA 濃度與質(zhì)量;使用ABM公司的5×All-In-One MasterMix反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.4 紫蘇PfSAD家族基因組織特異性表達(dá)分析利用Primer 6.0設(shè)計(jì)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)特異性引物(表1),擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為150~220 bp,退火溫度為53~61 ℃之間,其中以紫蘇Actin為內(nèi)參基因[20]。實(shí)時(shí)熒光定量PCR使用GenStar公司的2×RealStar Green Power Mixture試劑盒,反應(yīng)體系為:cDNA模板0.5 μL,正向引物0.2 μL,反向引物0.2 μL,ddH2O 4.1 μL,2×RealStar Green Power Mixture 5 μL,總計(jì)10 μL;反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃ 10 min,95 ℃ 15 s,Tm 1 min,共40個(gè)循環(huán);65 ℃ 5 s,95 ℃ 15 s。應(yīng)用CFX96TM OpticsModule實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Bio-Rad)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,每個(gè)樣品進(jìn)行3次重復(fù),利用2-ΔΔCt法[21]計(jì)算紫蘇PfSADs基因的相對(duì)表達(dá)量。

    表1 PfSADs基因qRT-RCR引物

    2 結(jié)果與分析

    2.1 紫蘇PfSADs基因家族的鑒定及基因結(jié)構(gòu)和蛋白理化性質(zhì)分析

    從紫蘇轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選得到SADs基因,利用擬南芥AtSADs基因序列為模板進(jìn)行比對(duì)分析,通過(guò)NCBI-CDD將獲得的紫蘇SAD序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,鑒定獲得6個(gè)具有?;?ACP 脫氫酶保守結(jié)構(gòu)域的PfSAD家族成員,且均屬于含有Fe-O-Fe中心的Ferritin-like鐵蛋白超家族。

    通過(guò)在線(xiàn)軟件ProtParam對(duì)紫蘇6個(gè)SAD家族基因編碼蛋白的基本理化性質(zhì)進(jìn)行分析,結(jié)果如表2所示:紫蘇PfSAD家族基因編碼蛋白長(zhǎng)度范圍為367~396 aa,其蛋白相對(duì)分子質(zhì)量最低的為89 848.27 Da(PfSAD6),最高的為97 876.78 Da(PfSAD1),理論等電點(diǎn)在5.02~5.07之間,均小于7.0,因此預(yù)測(cè)PfSADs家族可能為一類(lèi)酸性蛋白,且均為不穩(wěn)定疏水性蛋白,6個(gè)PfSADs蛋白的理化性質(zhì)均與其他植物SAD的理化性質(zhì)相近。使用SOPMA網(wǎng)站對(duì)PfSADs蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),由表3可知,PfSADs的二級(jí)結(jié)構(gòu)由4種元件構(gòu)成,其中α-螺旋所占比例較高為53.08%~57.88%,無(wú)規(guī)則卷曲所占比例為29.43%~34.10%,β-轉(zhuǎn)角和延伸鏈則鑲嵌于整個(gè)蛋白中,所占比例均小于10%。通過(guò)TMHMM、Plant-Multi和TargetP分別預(yù)測(cè)PfSADs蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域、亞細(xì)胞定位及N-末端轉(zhuǎn)運(yùn)肽(TP),結(jié)果顯示,PfSADs蛋白均不存在跨膜結(jié)構(gòu)域;其中PfSAD1、PfSAD2、PfSAD3、PfSAD4、PfSAD5和PfSAD6分別含有24、33、19、19、35 和33個(gè)氨基酸的葉綠體轉(zhuǎn)運(yùn)肽,cTP值分別為0.665 3、0.909 9、0.0082、0.784 6、0.879 5和0.970 6,表明這6種蛋白定位在葉綠體,在葉綠體中發(fā)揮作用。

    表2 紫蘇SAD家族蛋白的基本理化性質(zhì)

    表3 紫蘇SAD家族蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)跨膜區(qū)及亞細(xì)胞定位分析

    利用 SWISS-Model 軟件預(yù)測(cè)分析紫蘇PfSADs蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)并進(jìn)行同源建模(圖1)。對(duì)紫蘇PfSADs蛋白進(jìn)行同源建模時(shí)使用的模板為蓖麻1afr.1.A蛋白[13],預(yù)測(cè)結(jié)果顯示PfSADs蛋白均與蓖麻1afr.1.A蛋白序列相似度較高,相似性范圍為51%~59%,序列覆蓋度在87%~92%之間;X射線(xiàn)衍射發(fā)現(xiàn)紫蘇PfSADs蛋白編碼多肽的保守性基本一致,其蛋白活性形式為二聚體,多個(gè)二聚體共同形成催化Fe2+的活性位點(diǎn);PfSADs蛋白包含4個(gè)鐵輔基[FE(II)ION]配體,其蛋白單體主要由α-螺旋、β-折疊和其他無(wú)規(guī)則卷曲組成,含有一個(gè)由4個(gè)α-螺旋束包圍的二鐵離子,每個(gè)蛋白單體還含有2個(gè)與其相互作用的金屬配合物,由α-螺旋束組成的氨基酸側(cè)鏈或基團(tuán)為Fe2+的配基,兩個(gè)單體的二鐵離子位于蛋白二聚體底物結(jié)合凹槽的內(nèi)部,共同構(gòu)成了催化SAD的活性中心,該中心催化?;?ACP上第九個(gè)和第十個(gè)碳原子脫氫形成不飽和鍵,表明其在蛋白脫氫過(guò)程中發(fā)揮作用。

    2.2 紫蘇SAD蛋白同源序列比對(duì)

    通過(guò)ClustalW軟件對(duì)紫蘇PfSADs蛋白家族進(jìn)行多序列比對(duì)分析,將其氨基酸序列與蓖麻(Ricinuscommunis)RcSAD1、擬南芥(Arabidopsisthaliana)AtSSI2、甘藍(lán)油菜(Brassicanapus)BnSAD1和可可(Theobromacacao)TcSAD1的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)。紫蘇SAD蛋白同源序列比對(duì)結(jié)果如圖2所示,紫蘇PfSADs氨基酸序列與蓖麻 RcSAD1、擬南芥 AtSSI2、甘藍(lán)油菜BnSAD1和可可TcSAD1 氨基酸序列的相似性較高,均大于50%,其保守結(jié)構(gòu)域與RcSAD1、AtSSI2的保守結(jié)構(gòu)域相類(lèi)似,都分布在11個(gè)α-螺旋和2個(gè)β-轉(zhuǎn)角之內(nèi)。前人報(bào)道顯示,植物SAD脫氫酶催化中心的8個(gè)關(guān)鍵氨基酸影響著不同脂肪酰-ACP的選擇特異性。例如,擬南芥 AtSSI2的關(guān)鍵氨基酸殘基(M152、L153、T155、L156、P217、T219、G226和F227)和蓖麻 RcSAD1(M114、L115、T117、L118、P179、T181、G188和F189)均能使其進(jìn)行特異性選擇并催化 18∶0-ACP 生成 18∶1-ACP[22]。紫蘇PfSADs多序列比對(duì)結(jié)果表明,PfSAD1-PfSAD5具有與 RcSAD1和AtSSI2完全相同的關(guān)鍵氨基酸,PfSAD6含有5個(gè)變異氨基酸,分別為M134G、T137S、P199V、T201W和G208A,預(yù)測(cè)其催化脫氫作用可能對(duì)底物的選擇有所差異。EENRHG 和 DEKRHE為典型SAD特征的保守組氨酸富集區(qū),PfSADs家族的6個(gè)蛋白均存在這兩個(gè)保守區(qū)域,其天冬氨酸(D)和組氨酸(H)為PfSADs蛋白單體的二鐵離子提供了必需的結(jié)合位點(diǎn),為脫氫酶的催化中心Fe2+提供了催化活性。

    2.3 紫蘇SAD蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析

    利用MEGA 7.0軟件構(gòu)建紫蘇PfSADs蛋白與其他植物SADs蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果如圖3所示,通過(guò)系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),6個(gè)紫蘇SAD家族蛋白與其他7種植物蛋白被聚為三大類(lèi):PfSAD1與向日葵HaSAD、蓖麻RcSAD1、可可TcSAD1、白頭翁LcSAD3等親緣關(guān)系較近,被聚為一類(lèi),而PfSAD2和PfSAD3與擬南芥AtSAD3、擬南芥AtSAD4、芝麻SiSAD和白頭翁LcSAD2相似性較高,聚在第二類(lèi),PfSAD4、PfSAD5和PfSAD6與擬南芥AtSAD6聚在一類(lèi),具有較近的親緣關(guān)系。

    2.4 紫蘇PfSADs基因的表達(dá)特性分析

    以Actin作為內(nèi)參基因,運(yùn)用熒光定量PCR技術(shù)分析紫蘇PfSADs基因在‘晉紫蘇1號(hào)’不同組織及不同發(fā)育時(shí)期種子(開(kāi)花后10、20、30及40 d)的表達(dá)情況。結(jié)果(圖4)顯示,紫蘇PfSAD家族基因表達(dá)情況具有多樣性。紫蘇PfSAD1、PfSAD2、PfSAD3在各個(gè)組織及不同發(fā)育時(shí)期種子中均有表達(dá),其中PfSAD1在根中表達(dá)量最弱,在葉中表達(dá)量最高,PfSAD3在所有組織器官中均有高表達(dá);PfSAD4在葉和開(kāi)花后10 和40 d基本不表達(dá),在花及開(kāi)花后20 d時(shí)表達(dá)較弱,在根、莖、開(kāi)花后10和30 d時(shí)表達(dá)量較高;PfSAD5和PfSAD6分別在開(kāi)花后30 d種子和花中表達(dá)較高,其他時(shí)期及組織基本不表達(dá)。在不同發(fā)育時(shí)期種子中,PfSAD1和PfSAD3的表達(dá)隨著種子發(fā)育先升高后降低,PfSAD2、PfSAD4呈現(xiàn)先下降后升高再下降的趨勢(shì),且PfSAD2在植株開(kāi)花后10、30和40 d的表達(dá)量相較于其他組織具有明顯的表達(dá)優(yōu)勢(shì);PfSAD1-PfSAD5均在開(kāi)花后30 d時(shí)表達(dá)量達(dá)到峰值,其中PfSAD2較其他基因具有明顯的表達(dá)優(yōu)勢(shì)。研究結(jié)果表明6個(gè)基因均具有轉(zhuǎn)錄活性,PfSAD1在葉中表達(dá)量最高,PfSAD2-PfSAD5在種子發(fā)育成熟期時(shí)表達(dá)量達(dá)到高峰,PfSAD6在花中表達(dá)量最高,推測(cè)紫蘇PfSADs基因在不同組織器官中發(fā)揮不同的功能。

    3 討 論

    紫蘇是一種多用途經(jīng)濟(jì)作物,既可食用,又可作為醫(yī)用藥品,其中紫蘇籽油富含不飽和脂肪酸,在保健和醫(yī)療等方面都具有重要作用[3]。硬脂酰-ACP脫氫酶作為高等植物中唯一的脂溶性脫氫酶,在不飽和脂肪酸合成過(guò)程中起重要調(diào)控作用[10,12]。因此,探究紫蘇硬脂酰-ACP 脫氫酶的催化活性及其分子合成機(jī)制,對(duì)紫蘇SAD的功能鑒定及通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)培育高油酸紫蘇具有重要指導(dǎo)意義。

    本研究通過(guò)篩選紫蘇轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),鑒定并獲得6個(gè)紫蘇SAD基因,其編碼蛋白長(zhǎng)度、相對(duì)分子質(zhì)量、理論等電點(diǎn)等基本理化性質(zhì)有所差異,如PfSAD6 編碼蛋白長(zhǎng)度為367 aa,相對(duì)分子量為89 848.27 Da,二級(jí)結(jié)構(gòu)的α-螺旋含量最高,分布較為均勻;而 PfSAD3編碼蛋白序列較長(zhǎng)(390 aa),相對(duì)分子質(zhì)量也較大(96 289.25 Da),二級(jí)結(jié)構(gòu)的α-螺旋含量相對(duì)最少,在序列中間分布密集;PfSADs蛋白質(zhì)序列不包含跨膜區(qū)域,預(yù)測(cè)其定位于葉綠體上,這與其他物種中硬脂酰-ACP脫氫酶在細(xì)胞質(zhì)體內(nèi)進(jìn)行催化反應(yīng)的研究結(jié)果相一致[23-24];對(duì)PfSADs蛋白信號(hào)肽預(yù)測(cè)分析結(jié)果表明,均無(wú)信號(hào)肽,這與預(yù)測(cè)的PfSADs是非跨膜蛋白的結(jié)論相一致;三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)PfSADs具有Acyl_ACP_Desat的保守結(jié)構(gòu)域,蛋白活性形式均為同型二聚體,每個(gè)蛋白單體包含一個(gè)由2個(gè)鐵原子組成的二鐵中心,二鐵中心鑲嵌在α-螺旋束中,這表明6個(gè)PfSADs均具有催化硬脂酰-ACP脫氫酶的活性中心,屬于類(lèi)鐵氧化還原蛋白超家族。

    已有研究證明,植物SAD酶蛋白的8個(gè)關(guān)鍵氨基酸種類(lèi)影響著SAD 對(duì)不同酰基-ACP的選擇特異性,當(dāng)這些關(guān)鍵氨基酸發(fā)生突變時(shí),該脫氫酶對(duì)底物選擇活性會(huì)發(fā)生改變。蓖麻 RcSAD1的關(guān)鍵氨基酸殘基(M114、L115、T117、L118、P179、T181、G188 和 F189)能催化 18∶0-ACP 生成 18∶1-ACP[22],當(dāng)蓖麻 RcSAD1的 T117、L118、F189和T206突變?yōu)槠渌被?,則 RcSAD1 酶所催化的底物對(duì) 16∶0-ACP 的選擇活性遠(yuǎn)高18∶0-ACP[23,25]。本試驗(yàn)多重序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)紫蘇PfSADs與擬南芥、蓖麻、可可和甘藍(lán)型油菜的關(guān)系較近,都含有硬?;?ACP脫氫酶的關(guān)鍵氨基酸和保守基序,說(shuō)明SAD的關(guān)鍵氨基酸和典型結(jié)構(gòu)域在進(jìn)化上是高度保守的,且其關(guān)鍵氨基酸和保守基序在鐵氧化還原反應(yīng)中發(fā)揮重要作用,是SAD進(jìn)行底物特異性選擇的重要識(shí)別區(qū)域。對(duì)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析表明,紫蘇6個(gè)SAD家族基因分別被聚到三類(lèi),其中PfSAD1屬于第一類(lèi),第二類(lèi)包含PfSAD2和PfSAD3,PfSAD4、PfSAD5和PfSAD6與擬南芥SAD6聚為第三類(lèi),表明SAD的特定結(jié)構(gòu)域在生物進(jìn)化中具有高度保守性。

    在擬南芥中,發(fā)現(xiàn)缺失SAD基因擬南芥突變體葉片中硬脂酸含量較高,且AtSSI2基因活性較高,在油酸(18∶1)合成中發(fā)揮重要作用[17,26];牡丹PoSAD基因在花瓣及60 d種子中表達(dá)量最高,在根和10 d種子中的表達(dá)量最低[27]。Zhang等研究發(fā)現(xiàn)可可TcSAD1、TcSAD2和TcSAD7在各組織中均有表達(dá),TcSAD3和TcSAD4在花中表達(dá)較高,TcSAD5在根中表達(dá)較高[19]。本研究發(fā)現(xiàn),PfSADs基因在紫蘇各組織器官中的表達(dá)有所差異。其中:PfSAD1在各組織中表達(dá)廣泛,但在葉中表達(dá)量最高,表明其主要在葉中行使功能;PfSAD2、PfSAD4在各組織中均有表達(dá),特別是在發(fā)育種子中具有極高的表達(dá)量,且PfSAD2在開(kāi)花后30 d達(dá)到最高,PfSAD4在開(kāi)花后10 和30 d時(shí)較其他組織中具有更高的表達(dá)量,說(shuō)明PfSAD2和PfSAD4主要在種子中行使功能;PfSAD3在各組織中表達(dá)量均較高,尤其在種子發(fā)育時(shí)期的表達(dá)量顯著高于在其他組織中的表達(dá),推測(cè)其在各組織中均發(fā)揮作用,在發(fā)育種子中較顯著;PfSAD5僅在開(kāi)花后30 d表達(dá)較強(qiáng),在其他組織中表達(dá)均較弱。PfSAD2-PfSAD5等4個(gè)基因均在發(fā)育種子中表達(dá)量較高,并且都在開(kāi)花后30 d達(dá)到最高值,說(shuō)明這4個(gè)基因在種子中發(fā)揮著重要作用并主要催化成熟期種子的表達(dá),在脂肪酸合成過(guò)程中催化飽和脂肪酸脫氫反應(yīng)。PfSAD6僅在花中表達(dá),在其他組織中不表達(dá),且在同源序列比對(duì)中PfSAD6的關(guān)鍵氨基酸含有5個(gè)變異氨基酸,這可能與該基因在底物特異選擇上及其在紫蘇組織發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮的功能存在一定的聯(lián)系,這與Zhang等[19]研究發(fā)現(xiàn)可可TcSAD3和TcSAD4在花中表達(dá)較高的功能較為相似。

    油酸為不飽和脂肪酸的重要組成部分,其含量是植物營(yíng)養(yǎng)價(jià)值及理化性質(zhì)穩(wěn)定的重要影響因子,近年來(lái),在油菜[14]、花生[28]等油料作物中已經(jīng)對(duì)SAD的功能進(jìn)行了鑒定,并通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)進(jìn)行品種改良,實(shí)現(xiàn)了高油酸化。本研究獲得了紫蘇硬脂酰-ACP脫氫酶基因PfSADs,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析和表達(dá)特性的研究,為進(jìn)一步提高紫蘇油酸含量提供了理論依據(jù)。

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