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    特應(yīng)性皮炎全基因組關(guān)聯(lián)研究進(jìn)展①

    2022-02-26 11:49:14沈松英王成銳黃培元曠雅舒
    中國(guó)免疫學(xué)雜志 2022年24期
    關(guān)鍵詞:區(qū)域研究

    沈松英 王成銳 黃培元 曠雅舒 邱 琇

    (廣州醫(yī)科大學(xué)附屬?gòu)V州市婦女兒童醫(yī)療中心出生隊(duì)列研究室,廣州 510623)

    特應(yīng)性皮炎(atopic dermatitis,AD),又稱(chēng)特應(yīng)性濕疹,是一種常見(jiàn)的慢性反復(fù)性炎癥皮膚疾病,以反復(fù)局部皮膚瘙癢和發(fā)紅為特征。65%的AD患者在出生后第1年出現(xiàn),稱(chēng)為嬰兒濕疹(嬰兒AD);2歲以前發(fā)生的AD為早發(fā)型。AD是“過(guò)敏進(jìn)程”的第一站,嬰兒AD可顯著增加過(guò)敏性鼻炎、哮喘的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[1]。過(guò)去30年中,工業(yè)化國(guó)家兒童AD患病率從15%上升至30%,成人AD患病率也從2%上升至10%,引起關(guān)注[2]。

    AD的病因尚不清楚,目前普遍認(rèn)為是遺傳因素和環(huán)境暴露綜合作用所致。早期AD的遺傳學(xué)研究主要采用家系關(guān)聯(lián)研究、雙胞胎研究和候選基因關(guān)聯(lián)研究等方法,這些研究結(jié)果提示,AD是高度遺傳的疾?。?]。隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用,過(guò)去10年AD的全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)逐漸增加。

    自2009年報(bào)道第一個(gè)AD的GWAS以來(lái),共發(fā)表了11個(gè)AD的GWAS(附表1,www.immune99.com)[4-14]。這些GWAS共報(bào)道了36個(gè)染色體區(qū)域上76個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(single nucleotide polymorphism,SNP)在全基因組水平上與AD相關(guān)。這些SNPs相關(guān)的基因主要與表皮皮膚屏障功能和免疫功能相關(guān)。有研究估計(jì),目前GWAS發(fā)現(xiàn)的遺傳變異解釋了AD約27%的遺傳度,約73%的遺傳性還未被解釋?zhuān)?2-13]。本文系統(tǒng)地總結(jié)了2009年以來(lái)AD的GWAS發(fā)現(xiàn)。

    1 與表皮皮膚屏障功能相關(guān)的基因和SNPs

    1.1 絲聚蛋白(filaggrin,F(xiàn)LG)基因及其相關(guān)SNPs目前有6個(gè)GWAS發(fā)現(xiàn)了1q21.3染色體區(qū)域上的10個(gè)SNPs在全基因組水平上與AD相關(guān),其中8個(gè)位于 FLG 基因,即 rs3126085、R501X、2282del4、rs11205006、rs6661961、rs61813875、rs12081541、rs12144049(附 表2,www.immune99.com),其 中rs3126085 位點(diǎn)在中國(guó)人群中發(fā)現(xiàn)[6,9-11,13-15]。連鎖不平衡分析顯示該位點(diǎn)與既往其他研究發(fā)現(xiàn)的中國(guó)人群主要的FLG突變位點(diǎn)c.3321delA16高度相關(guān)。其余位點(diǎn)主要在歐洲人群中發(fā)現(xiàn),以R501X和2282del4的無(wú)效突變最為常見(jiàn)[16]。FLG基因位點(diǎn)突變與AD發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的OR值為1.61(95%CI:1.48~1.75),其中與兒童早發(fā)持續(xù)性AD亞組相關(guān)性最強(qiáng)(OR:4.31,95%CI:3.29~5.63)[10,17]。FLG是目前較為公認(rèn)的與AD相關(guān)的基因[16]。在皮層分化過(guò)程中,F(xiàn)LG在顆粒層被釋放至細(xì)胞間隙,其逐漸降解形成的各種氨基酸及降解產(chǎn)物是天然保濕因子中的重要組成部分,對(duì)維持正常皮膚屏障功能具有重要作用[18]。近期有針對(duì)AD小鼠模型進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,并在AD患者中進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在沒(méi)有炎癥的情況下,F(xiàn)LG無(wú)效突變足以誘導(dǎo)AD小鼠和患者皮膚中蛋白酶激肽釋放酶-7(kallikrein-7,KLK7)表達(dá)上調(diào)和免疫調(diào)節(jié)因子親環(huán)素A(cyclophilin A,PPIA)表達(dá)下調(diào)[19]。這些蛋白是AD特有的分子,在蛋白溶解和炎癥中起重要作用。小鼠模型中,人類(lèi)KLK7過(guò)表達(dá)會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重瘙癢、表皮厚度增加和皮膚炎癥[20];PPIA是廣泛表達(dá)的親免疫蛋白家族成員,在蛋白折疊、運(yùn)輸和免疫調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用[21]。FLG的無(wú)效突變也與皮膚角質(zhì)形成IL-1細(xì)胞因子表達(dá)上調(diào)有關(guān),IL-1因子水平升高與天然保濕因子成分減少相關(guān)[22];也有研究顯示FLG無(wú)效突變的人表皮CD83(+)朗格漢斯細(xì)胞數(shù)量增加,絲聚蛋白降解產(chǎn)物尿氨酸可減少樹(shù)突狀細(xì)胞成熟,并增加其誘導(dǎo)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的作用,提示絲聚蛋白缺乏與免疫失調(diào)有關(guān)[23]。FLG的功能和表達(dá)可受IL-4和IL-13細(xì)胞因子影響,提示皮膚屏障和免疫功能可能協(xié)同作用,增加機(jī)體對(duì)濕疹的易感性[8,24]。以上結(jié)果表明FLG無(wú)效突變?cè)贏D的發(fā)病中發(fā)揮重要作用。

    1.2 OVOL1基因及其相關(guān)SNPs 11q13.1染色體區(qū)域與AD相關(guān)的SNPs有rs479844和rs10791824[7,11,14](附表2,www.immune99.com)。rs479844主要在歐洲人群中發(fā)現(xiàn),位于OVOL1上游<3 kb處[7,14]。2014年王理[25]驗(yàn)證該位點(diǎn)也與中國(guó)漢族人群AD相關(guān)。rs10791824位于OVOL1基因的內(nèi)含子區(qū)域,已在多個(gè)種族人群中進(jìn)行驗(yàn)證[11]。OVOL1屬于高度保守的基因,編碼含C2H2鋅指結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子OVO樣蛋白。OVOL1蛋白在多種上皮組織中表達(dá),參與調(diào)節(jié)上皮組織和生殖細(xì)胞的發(fā)育和分化,可抑制角質(zhì)形成細(xì)胞中與細(xì)胞增殖密切相關(guān)的c-Myc表達(dá),是WG/Wnt和TGF-β/BMP7-Smad4信號(hào)通路的下游靶點(diǎn)[26-29]。這些途徑除了在胎兒皮膚及皮膚附屬物的器官形成中發(fā)揮作用外,也參與出生后表皮增殖和分化的調(diào)節(jié)[30-31]。有研究顯示外周組織中的IL-13水平升高可通過(guò)下調(diào)OVOL1-FLG軸引起屏障功能障礙[32]。

    1.3 EMSY基因及其相關(guān)SNPs 11q13.5染色體區(qū)域與AD相關(guān)的SNPs由最早期的濕疹GWAS發(fā)現(xiàn),隨后在幾個(gè)歐洲大型GWAS中得到驗(yàn)證,包括rs7927894、rs2155219、rs2212434 和 rs7130588[4,9,11,14](附表2,www.immune99.com)。但程芳[33]并未在中國(guó)人群中發(fā)現(xiàn)rs7927894與AD發(fā)病相關(guān)。這些SNPs位于EMSY和LRRC32兩個(gè)基因之間。EMSY基因在包括皮膚、小腦等多個(gè)人體組織中表達(dá),是一種轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,也可在炎癥中發(fā)揮作用。蛋白激酶AKT1可通過(guò)EMSY的磷酸化調(diào)節(jié)干擾素反應(yīng)[34]。有關(guān)EMSY基因在AD發(fā)病中的機(jī)制研究較少。近期有研究顯示培養(yǎng)組織中采用siRNA技術(shù)敲除EMSY可導(dǎo)致FLG和FLG2蛋白以及長(zhǎng)鏈神經(jīng)酰胺等表達(dá)增加,從而增強(qiáng)皮膚屏障功能[35]。相反,EMSY在角質(zhì)形成細(xì)胞中過(guò)度表達(dá)可導(dǎo)致FLG等屏障形成標(biāo)志物的顯著減少,AD患者的皮膚活檢標(biāo)本顯示細(xì)胞核內(nèi)EMSY染色增強(qiáng),提示該基因在皮膚屏障形成中具有重要作用。這在一定程度上解釋了之前發(fā)現(xiàn)的rs7927894和FLG的遺傳風(fēng)險(xiǎn)變異存在倍增效應(yīng)的結(jié)果,提示二者的聯(lián)合效應(yīng)可能導(dǎo)致更高的AD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)[36]。

    1.4 CCDC80基因及其相關(guān)SNPs 3q13.2染色體區(qū)域上的rs12634229發(fā)現(xiàn)于日本人群(附表2,www.immune99.com),該位點(diǎn)可能與中國(guó)人群的AD發(fā)病不相關(guān)[8,33]。相關(guān)的基因是該 SNP 附近的 CCDC80基因。CCDC80基因編碼蛋白可充分抑制T細(xì)胞因子介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄活性,在克隆擴(kuò)增過(guò)程中下調(diào)Wnt/β-catenin靶基因,隨后誘導(dǎo)C/EBPα和過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator-activated receptor γ,PPARγ)[37]。C/EBPα 在基底角質(zhì)形成細(xì)胞中表達(dá),且當(dāng)角質(zhì)形成細(xì)胞退出基底層并進(jìn)行終末分化時(shí)表達(dá)上調(diào)[38]。IL-12和IL-23分別是Th1和Th17細(xì)胞產(chǎn)生和效應(yīng)功能的關(guān)鍵因子,在AD慢性期反應(yīng)中起重要作用[39-40]。C/EBPα可直接與IL-12和IL-23的亞基P40啟動(dòng)子相互作用并抑制P40在炎癥巨噬細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄[41]。PPARγ在免疫細(xì)胞中起負(fù)調(diào)節(jié)作用,其激動(dòng)劑可明顯抑制胸腺基質(zhì)淋巴生成素在皮膚中的表達(dá),以及在AD小鼠模型中抑制樹(shù)突狀細(xì)胞的成熟和遷移[42]。因此推測(cè)CCDC80基因編碼蛋白可能通過(guò)C/EBPα和PPARγ表達(dá)改變?cè)贏D發(fā)病中發(fā)揮作用。關(guān)于CCDC80基因在AD發(fā)病機(jī)制中作用的直接證據(jù)有待進(jìn)一步研究。

    2 人體免疫功能相關(guān)的基因和SNPs

    2.1 IL6R基因及其相關(guān)SNPs PATERNOSTER等[11]發(fā)現(xiàn)IL6R基因上的rs12730935位點(diǎn)在全基因組水平上與AD相關(guān)(附表2,www.immune99.com)。IL6R基因雖與FLG基因同在一個(gè)染色體區(qū)域,但其功能獨(dú)立于FLG基因。該基因已被證實(shí)決定了經(jīng)典的膜結(jié)合和可溶性IL6R信號(hào)傳導(dǎo)途徑之間的平衡。與野生型358Asp(rs2228145[A])純合子相比,突變型358Ala(rs2228145[C])純合子攜帶者的血清可溶性IL6R水平呈2倍增加,且AD患者的可溶性IL6R水平高于對(duì)照組[43]。ROSA等[44]和MCGOWAN等[45]均通過(guò)孟德?tīng)栯S機(jī)化研究驗(yàn)證了基因預(yù)測(cè)的血漿可溶性IL6R水平升高與AD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加的因果關(guān)系[45];MCGOWAN等[45]還發(fā)現(xiàn)可溶性IL6R特異性調(diào)節(jié) T細(xì)胞在AD發(fā)病中發(fā)揮重要作用。在動(dòng)物模型中已發(fā)現(xiàn)IL-6可降低Th2細(xì)胞因子并改善哮喘癥狀[46];抗IL-6的藥物使用也被發(fā)現(xiàn)與濕疹發(fā)生相關(guān)[47]。血漿可溶性IL6R水平升高也可能通過(guò)負(fù)向調(diào)節(jié)IL-6信號(hào)在AD的發(fā)病中起作用[44]。

    2.2 CD207基因及其相關(guān)SNPs 2015年P(guān)ATERNOSTER等[11]通過(guò)多種族人群meta分析新發(fā)現(xiàn)位于2p13.3區(qū)域的rs112111458位點(diǎn)與AD在全基因水平相關(guān)。該SNP在CD207基因上游37 kb。2018年蔡新穎[48]也在中國(guó)人群中證實(shí)該位點(diǎn)與AD相關(guān)。CD207編碼一種只在樹(shù)突狀細(xì)胞亞群朗格漢斯細(xì)胞中表達(dá)的細(xì)胞內(nèi)模式識(shí)別受體。表皮朗格漢斯細(xì)胞在AD患者受損皮膚中可穿透皮膚緊密連接識(shí)別抗原,在誘導(dǎo)耐受和適應(yīng)性免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用[49-51]。

    2.3 IL-1家族成員基因及其相關(guān)SNPs 2q12.1區(qū)域的rs13015714和rs6419573也被發(fā)現(xiàn)與AD相關(guān)(附表2,www.immune99.com)[8,11]。相關(guān)基因是編碼IL-1家族成員IL1RL1、IL18R1和IL18RAP的基因。IL-1家族成員IL1RL1、IL18R1和IL18RAP基因編碼的蛋白在皮膚中表達(dá)豐富。IL1RL1是IL-33受體的組成部分,在Th2和肥大細(xì)胞中表達(dá)。據(jù)報(bào)道,IL-33在AD受損組織中分泌,促進(jìn)Th2型免疫反應(yīng)和AD發(fā)?。?2]。IL-33轉(zhuǎn)基因小鼠在角質(zhì)形成細(xì)胞中特異性表達(dá)IL-33,可自發(fā)產(chǎn)生AD樣濕疹,提示IL-33足以促進(jìn)AD的發(fā)展[53]。IL-33刺激各種細(xì)胞,包括Ⅱ型天然淋巴樣細(xì)胞(ILC2s),ILC2s通過(guò)產(chǎn)生大量IL-5和IL-13而引發(fā)過(guò)敏性炎癥[54]。IL-33還可通過(guò)誘導(dǎo)IL-31促進(jìn)瘙癢和抓撓行為;抓撓皮膚反過(guò)來(lái)會(huì)促進(jìn)角質(zhì)形成細(xì)胞釋放IL-33[55];IL-33也可能直接作用于周?chē)窠?jīng)引起瘙癢[56]。因此,阻斷IL-33信號(hào)可能是減輕IL-33信號(hào)相關(guān)皮膚瘙癢和炎癥的治療靶點(diǎn)。與IL-33的研究相比,IL18R1和IL18RAP與AD發(fā)病的研究較少。有研究發(fā)現(xiàn)IL18RAP在AD或銀屑病皮膚活檢中新鮮分離的角質(zhì)形成細(xì)胞中顯著高表達(dá);IL-18可上調(diào)角質(zhì)形成細(xì)胞主要組織相容性復(fù)合體(MHC)Ⅱ類(lèi)分子表達(dá)和趨化因子CXCL10水平[57]。

    2.4 GLB1和CCR4基因及其相關(guān)SNPs 染色體3p22.3區(qū)域上的rs7613051位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)于日本人群(附表2,www.immune99.com)[8]。該位點(diǎn)位于編碼半乳糖苷酶β1的GLB1基因內(nèi)含子區(qū)域。GLB1基因與AD的關(guān)系有待進(jìn)一步研究,值得注意的是附近的CCR4基因編碼Th2趨化因子CCL17的受體CCR4蛋白,CCR4蛋白在炎癥過(guò)程中介導(dǎo)皮膚特異性的T細(xì)胞聚集[58]。在AD小鼠模型中,CCR4缺陷的Th2不能遷移至炎癥部位,對(duì)引發(fā)皮膚炎癥具有重要作用[59]。

    2.5 Th2細(xì)胞信號(hào)通路基因及其相關(guān)SNPs 多個(gè)GWAS確定了AD在5q31區(qū)域中參與Th2細(xì)胞信號(hào)通路的基因遺傳風(fēng)險(xiǎn)位點(diǎn)(rs2897442、rs2897443、rs6871536、rs2158177、rs1295686、rs20541、rs12188917、rs17690965、rs848),相關(guān)基因主要包括IL-4、IL-13、IL4Rα 基因(附表2,www.immune99.com)[7,9-11,14,60]。Th2細(xì)胞信號(hào)通路的IL-4、IL-13、IL4Rα基因也在AD的發(fā)病中發(fā)揮重要作用。IL-4促進(jìn)Th2在過(guò)敏性炎癥中的作用并降低上皮細(xì)胞的表皮分化復(fù)合物(EDC)基因表達(dá)[61]。IL-13主要促進(jìn)外周組織炎癥的發(fā)生,在濕疹型皮損中表達(dá)上調(diào)[12]。以IL-13為靶點(diǎn)的生物制品,如抗IL4Rα抗體dupilumab和抗IL-13抗體tralokinumab,成功地改善了AD病變,進(jìn)一步突出了IL-13在AD發(fā)病機(jī)制中的重要性[32]。

    2.6 MHC基因及其相關(guān)SNPs HIROTA等[8]在日本人群首先發(fā)現(xiàn)6p21.33和6p21.32染色體區(qū)域MHC基因的相關(guān)SNPs與AD關(guān)聯(lián),隨后WEIDINGER等[9]、BAURECHT 等[10]和 PATERNOSTER 等[11]在歐洲人群也發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證了以上位點(diǎn)(附表2,www.immune99.com)。WEIDINGER等[9]發(fā)現(xiàn)MHC基因相關(guān)SNPs與AD的相關(guān)性來(lái)自?xún)蓚€(gè)經(jīng)典的HLA等位基因HLA-DRB*07:01和HLA-B*18:44:02的獨(dú)立效應(yīng)。盡管有以上發(fā)現(xiàn),這些基因在AD中發(fā)揮作用的機(jī)制還有待進(jìn)一步探討。

    2.7 CARD11基因及其相關(guān)SNPs 7p22.2染色體區(qū)域的rs4722404位點(diǎn)在日本人群被發(fā)現(xiàn)與AD相關(guān)(附表2,www.immune99.com),但未在中國(guó)人群得到 驗(yàn) 證[8,33]。 該 位 點(diǎn) 位 于 CARD11 基 因 附 近 。CARD11基因編碼蛋白通過(guò)T細(xì)胞受體和B細(xì)胞受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)激活淋巴細(xì)胞,在T細(xì)胞分化中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,在調(diào)節(jié)JUNB和GATA3轉(zhuǎn)錄因子及隨后產(chǎn)生的Th2特異性細(xì)胞因子中也起關(guān)鍵作用[62]。有研究顯示CARD11突變小鼠逐漸發(fā)展為AD,其血清IgE含量也逐漸升高[63]。

    2.8 DOK2和CD200R1基因及其相關(guān)SNPs 最近一項(xiàng)GWAS新發(fā)現(xiàn)染色體8p21.3區(qū)域的rs34215892和3q13.2區(qū)域的rs9865242與AD有關(guān)(附表2,www.immune99.com),分別位于DOK2和CD200R1基因[12]。DOK2是細(xì)胞質(zhì)信號(hào)分子,主要在造血/免疫細(xì)胞中表達(dá)。DOK1-2是Toll樣受體4下游ERK信號(hào)必不可少的負(fù)調(diào)控因子[64]。缺乏DOK1-3的小鼠在免疫細(xì)胞發(fā)育和免疫應(yīng)答中表現(xiàn)出明顯缺陷[65]。此外,DOK1-2在NK細(xì)胞的成熟中發(fā)揮作用[66]。CD200R1是一種蛋白質(zhì)編碼基因,與之相關(guān)的疾病包括人皰疹病毒和伴有硬化性白質(zhì)腦病的多囊性脂膜性骨增生,參與相關(guān)途徑包括Ⅰ類(lèi)MHC介導(dǎo)的抗原加工和呈遞及先天免疫系統(tǒng)。基于多組學(xué)的網(wǎng)絡(luò)和RNA-Sequencing分析表明,DOK2是一個(gè)與CD200R1、IL6R和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)相互作用的中心樞紐,有望成為一個(gè)新的治療靶點(diǎn)[12]。由于DOK2為新發(fā)現(xiàn)的位點(diǎn),有關(guān)DOK2在AD發(fā)病中的作用機(jī)制仍有待進(jìn)一步深入研究。

    2.9 STAT3基因及其相關(guān)SNPs 位于染色體17q21.2區(qū)域的rs12951971位點(diǎn)也在PATERNOSTER等[11]的研究中發(fā)現(xiàn)與AD相關(guān)(附表2,www.immune99.com)。該SNP位于STAT3基因內(nèi)含子區(qū)域。STAT3蛋白可在各種細(xì)胞因子和生長(zhǎng)因子刺激下通過(guò)磷酸化激活,介導(dǎo)多種基因表達(dá),在細(xì)胞生長(zhǎng)和凋亡等細(xì)胞過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。有研究顯示,該基因的突變與嬰兒期發(fā)病的自身免疫性疾病和高IgE綜合征有關(guān),與兒童早發(fā)型持續(xù)濕疹的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度僅次于FLG基因[17,67]。

    2.10 TNFRSF6B和ZGPAT基因及其相關(guān)SNPs染色體20q13.33區(qū)域的相關(guān)SNPs在中國(guó)人群和歐洲人群中均發(fā)現(xiàn)與AD相關(guān)(附表2,www.immune99.com)[6,10-11]。這些 SNPs包括 rs909341、rs6010620 和rs4809219,其中rs909341位于TNFRSF6B基因,rs6010620在ZGPAT基因附近,rs6010620、rs4809219位于RTEL1基因內(nèi)含子區(qū)域內(nèi)。TNFRSF6B為T(mén)NF受體超家族成員6B,在適應(yīng)性免疫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用,具體作用于T細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞和巨噬細(xì)胞反應(yīng)[68-70]。AD患者與健康對(duì)照和非特應(yīng)性炎癥性疾病患者相比,血清TNFRSF6B的 mRNA 表達(dá)增加[71]。ZGPAT編碼一種鋅指CCCH結(jié)構(gòu)域蛋白參與表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)通路[72]。有研究顯示,在小鼠模型中阻斷EGFR信號(hào)通路可誘導(dǎo)角質(zhì)形成細(xì)胞趨化因子表達(dá)失調(diào),導(dǎo)致皮膚炎癥增強(qiáng)[73]。表明TNFRSF6B和ZGPAT是AD可能的候選基因,但仍需進(jìn)一步的功能驗(yàn)證闡明其在AD發(fā)病中的作用。RTEL1基因編碼一種DNA解旋酶,其在端粒的穩(wěn)定性、保護(hù)和伸長(zhǎng)中起作用,但在AD中所發(fā)揮的作用機(jī)制有待進(jìn)一步探討。

    2.11 其他與免疫相關(guān)的基因 其他識(shí)別的與AD相關(guān)的SNPs和基因在既往研究中或多或少與免疫功能相關(guān)(附表2,www.immune99.com),如編碼細(xì)胞因子的IL-2/IL-21、IL-7/CAPSL和IL15RA/IL2RA,以及 ZNF365、NLRP10 和 PPP2R3C[8,11,13]。

    3 與濕疹/AD相關(guān)的其他基因和SNPs

    近年的GWAS發(fā)現(xiàn)了3p21.1、5q22.1、6p21.33和6p21.32染色體區(qū)域上的其他相關(guān)SNPs(附表2,www.immune99.com)[6,9,11]。涉及的相關(guān)基因主要 有 SFMBT1/RFT1、TMEM232/SLC25A46、BAT1、TNXB、PUS10和ATF6B。這些基因主要編碼一些跨膜蛋白或連接蛋白,其具體作用有待進(jìn)一步研究。另外還有一些基因的功能未確定。

    值得注意的是,20q13.2上的rs16999165也與AD相關(guān)(附表2,www.immune99.com),相關(guān)基因?yàn)镃YP24A1/PFDN4基因。CYP24A1基因是維生素D通路基因,編碼一種線粒體細(xì)胞色素P450超家族酶,該酶通過(guò)側(cè)鏈羥基化啟動(dòng)降解1,5-二羥基維生素D3,即維生素D3的活性形式。而維生素D是先天和適應(yīng)性免疫系統(tǒng)功能的調(diào)節(jié)因子。有報(bào)道提示維生素D缺乏與AD發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)和嚴(yán)重程度相關(guān)[74-75]。但本課題組前期的系統(tǒng)綜述發(fā)現(xiàn)血液中維生素D缺乏并不增加哮喘的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[76]。

    4 總結(jié)

    隨著基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,2009年以來(lái)研究者開(kāi)始采用GWAS進(jìn)行AD的遺傳學(xué)研究。目前共發(fā)現(xiàn)36個(gè)染色體區(qū)域上76個(gè)SNPs與AD在全基因組水平上相關(guān)。與這些SNPs相關(guān)的基因主要與表皮皮膚屏障功能和免疫系統(tǒng)功能相關(guān)。

    在目前的大多GWAS中,病例與對(duì)照的年齡并不一致,如病例是兒童,而對(duì)照是成人。有研究顯示,與過(guò)敏性疾病風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)的遺傳位點(diǎn)與更早發(fā)病相關(guān),提示AD患者和對(duì)照組的年齡存在差異可能會(huì)導(dǎo)致結(jié)果偏倚[77]。后續(xù)研究應(yīng)進(jìn)一步關(guān)注早發(fā)型AD的遺傳學(xué)特征,這對(duì)于AD的個(gè)性化干預(yù)前移具有指導(dǎo)意義。另外,濕疹的遺傳易感基因具有種族特異性。目前的研究主要在歐洲人群中開(kāi)展,亞洲人群較少,未來(lái)研究需要更多的亞洲人群參與。隨著深度測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,全基因組測(cè)序能夠提供更多的遺傳信號(hào),且可進(jìn)行基因功能研究[78]。AD“丟失的遺傳性”可能需要采用全基因組測(cè)序來(lái)進(jìn)一步補(bǔ)充[79]。

    綜上所述,近年來(lái)GWAS研究表明皮膚屏障功能障礙、先天免疫反應(yīng)減弱、IL-1信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和Th2免疫信號(hào)增強(qiáng)等在AD的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用。這些基因并非獨(dú)立存在,而是相互作用。這些發(fā)現(xiàn)為AD的精準(zhǔn)分型和治療帶來(lái)新的視角。未來(lái)研究需進(jìn)一步進(jìn)行全基因組測(cè)序識(shí)別“丟失的遺傳性”,并對(duì)識(shí)別的基因功能進(jìn)行驗(yàn)證。

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