蘇 丞,孫雙喜,孟苗苗,徐祿玉,萬 燦,黃 燕
腦積水是世界范圍內(nèi)最常見的神經(jīng)外科疾病,腦積水是由于腦脊液的產(chǎn)生和吸收失衡或其通路受阻所致,導(dǎo)致腦脊液充滿的腦室擴(kuò)張和顱內(nèi)壓升高。腦積水通常需手術(shù)治療,但術(shù)后并發(fā)癥較多,復(fù)發(fā)率較高。目前,內(nèi)科藥物治療、中西醫(yī)治療尚無特效藥物,多采用對癥干預(yù),其中,甘露醇是最常見的脫水藥,但長時(shí)間使用副作用大。研究表明,炎癥反應(yīng)與腦積水的發(fā)病機(jī)制有關(guān)[1]。
五苓散是治療水液代謝異常的基本方,出自《傷寒雜病論》,由茯苓、澤瀉、豬苓、白術(shù)、桂枝組成,有健脾利水、溫陽化氣的功效,小便不利、水腫、口渴、體液停留、嘔吐、腹瀉、頭暈、頭重等主證表現(xiàn)與神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)疾病腦積水有相同之處。多項(xiàng)研究表明,五苓散對于腦積水及正常顱壓腦積水有較好的療效,同時(shí)可減少并發(fā)癥[2-7]。中藥復(fù)方具有多成分、多靶點(diǎn)、多通路的特點(diǎn),且具有整體性和系統(tǒng)性,在干預(yù)具有多細(xì)胞、多因子共同參與調(diào)控的復(fù)雜病理生理過程中具有獨(dú)特的優(yōu)勢[8]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)利用計(jì)算機(jī)技術(shù),系統(tǒng)全面地觀察藥物和疾病之間潛在的關(guān)系并進(jìn)行可視化分析,有助于揭示中藥復(fù)方的科學(xué)內(nèi)涵、發(fā)現(xiàn)藥物靶標(biāo)、傳承和發(fā)展中醫(yī)藥理論[9]。本研究運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,系統(tǒng)地闡述五苓散治療腦積水的作用機(jī)制,以期為臨床及基礎(chǔ)研究提供新思路[10-11]。
1.1 成分靶點(diǎn)信息查詢 在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)數(shù)據(jù)庫(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php)中檢索五苓散中5種中藥豬苓、澤瀉、桂枝、茯苓和白術(shù)的成分,成分的篩選條件設(shè)置為口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18。將所獲得的成分通過TCMSP數(shù)據(jù)庫和Swisstargets數(shù)據(jù)庫(http://www.swisstargetprediction.ch/)獲得成分靶點(diǎn)。
1.2 疾病靶點(diǎn)查找 以“Hydrocephalus”為關(guān)鍵詞,在基因名片數(shù)據(jù)庫(GeneCards,https://www.genecards.org/)和 美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)進(jìn)行人類基因檢索。
1.3 關(guān)鍵靶點(diǎn)篩選及蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 采用R3.6.3軟件將五苓散化學(xué)成分作用靶點(diǎn)和腦積水相關(guān)的疾病靶點(diǎn)進(jìn)行映射構(gòu)建韋恩圖。存在交集的共同靶點(diǎn)可能是五苓散中活性成分治療腦積水的關(guān)鍵靶點(diǎn)。將藥物疾病共有靶點(diǎn)輸入STING數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/cgi/input.pl)進(jìn)行PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建,將生物種類設(shè)定為“homo sapiens”,最小互相作用閾值設(shè)定為“highest confidence”(>0.9),其余設(shè)置均為默認(rèn)設(shè)置,獲得 PPI 網(wǎng)絡(luò)。
1.4 靶點(diǎn)通路注釋分析 對篩選出的共同靶基因進(jìn)行基因本體(GO)功能注釋和京都基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,對所預(yù)測的化學(xué)成分靶點(diǎn)進(jìn)行富集分析,采用R 3.6.3 軟件進(jìn)行可視化處理,分析五苓散治療腦積水可能的生物過程和信號(hào)通路。
1.5 化學(xué)成分-交集基因-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 根據(jù)上述化學(xué)成分的靶點(diǎn)預(yù)測結(jié)果,采用Cytoscape 3.8.0軟件構(gòu)建藥物組-化學(xué)成分-交集靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)模型。在網(wǎng)絡(luò)中,用不同的形狀表示化學(xué)成分、交集基因、映射通路等信息,連接線表示兩節(jié)點(diǎn)間存在關(guān)聯(lián)或映射關(guān)系。
2.1 五苓散成分靶點(diǎn)信息 共篩選出五苓散中5味中藥50種類藥成分,其中,豬苓11個(gè),白術(shù)7個(gè),茯苓15個(gè),桂枝7個(gè),澤瀉10個(gè)。收集類藥成分的靶點(diǎn)信息,其中,豬苓181個(gè),白術(shù)124個(gè),茯苓186個(gè),桂枝226個(gè),澤瀉183個(gè),去重后共獲得五苓散類藥成分的作用靶點(diǎn)335個(gè)。
2.2 腦積水疾病靶點(diǎn)的篩選及共同靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 在GeneCards數(shù)據(jù)庫檢索到3 519個(gè)相關(guān)基因,OMIM-NCBI基因數(shù)據(jù)庫獲得70個(gè)相關(guān)基因,將這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫的基因合并去重之后,獲得3 520個(gè)腦積水相關(guān)基因。采用R軟件制作3 520個(gè)疾病靶點(diǎn)與335個(gè)類藥成分作用靶點(diǎn)的韋恩圖,獲得疾病-類藥活性成分共同靶點(diǎn)105個(gè)(見圖1)。在STRING數(shù)據(jù)平臺(tái)輸入105個(gè)疾病與藥物共同靶點(diǎn),分析后獲得PPI作用網(wǎng)絡(luò),共獲得105個(gè)相互作用節(jié)點(diǎn)和1 147條相互作用關(guān)系(見圖2)。
圖1 疾病與藥物靶點(diǎn)韋恩圖
圖2 共同靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)圖
2.3 關(guān)鍵靶點(diǎn)GO生物功能注釋 應(yīng)用R軟件中clusterProfiler包對五苓散成分-疾病的105個(gè)共同作用靶蛋白進(jìn)行GO生物功能注釋,保留P≤0.01的結(jié)果,進(jìn)行可視化分析,獲得GO分析柱狀圖(見圖3)。結(jié)果可見,共同作用靶點(diǎn)主要富集在類固醇代謝過程(steroid metabolic process)、小分子代謝過程的調(diào)節(jié)(regulation of small molecule metabolic process)、對氧化應(yīng)激的反應(yīng)(response to oxidative stress)、細(xì)胞對化學(xué)應(yīng)激的反應(yīng)(cellular response to chemical stress)、生殖結(jié)構(gòu)發(fā)育(reproductive structure development)等。
圖3 共同靶點(diǎn)GO分析柱狀圖
2.4 KEGG通路富集分析 應(yīng)用R軟件中clusterProfiler包對五苓散成分-疾病的105個(gè)共同作用靶蛋白進(jìn)行KEGG通路富集分析,保留P≤0.01的結(jié)果,進(jìn)行可視化分析,獲得KEGG通路富集氣泡圖(見圖4)。可見,共同靶點(diǎn)主要富集于癌癥中的蛋白聚糖(proteoglycans in cancer)、MAPK信號(hào)通路(MAPK signaling pathway)、乙型肝炎(hepatitis B)、結(jié)核(tuberculosis)、卡波西氏肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染(kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)。
圖4 KEGG通路富集氣泡圖
2.5 構(gòu)建成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò) 應(yīng)用Cytoscape 3.2.1軟件,構(gòu)建出五苓散中藥-成分-靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋱D(見圖5)。使用network analyzer功能進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)特征分析,以度值(Degree)為評判標(biāo)準(zhǔn)可獲得較為重要的成分、靶點(diǎn)、通路。詳見表1。
圖5 中藥-成分-共同靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)圖
表1 關(guān)鍵成分信息表
腦積水是一種常見的神經(jīng)系統(tǒng)疾病,但其發(fā)生原因復(fù)雜。研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)腦組織損傷時(shí),炎性細(xì)胞的炎性反應(yīng)誘發(fā)室管膜瘢痕、腦室內(nèi)阻塞,這些物質(zhì)通過多種機(jī)制引起更多的細(xì)胞損傷和調(diào)亡,而許多抗炎藥物的相關(guān)研究也表明其對改善腦積水的有效性[12-14]。目前認(rèn)為,腦積水的形成多為室管膜纖毛的功能障礙、水通道蛋白介導(dǎo)的高效跨膜和跨細(xì)胞水轉(zhuǎn)運(yùn)腦脊液的循環(huán)障礙,還有出血后血紅蛋白降解物質(zhì)堵塞腦脊液通路這3個(gè)主要原因[15-18]。
五苓散可以治療的疾病的臨床表現(xiàn)主要是水液代謝障礙,表現(xiàn)為頭痛發(fā)熱、口渴、水入即吐、吐涎沫而頭目眩暈、短氣而咳、小便不利、水氣上逆等;腦積水的典型癥狀為頭痛、嘔吐、視力模糊、視神經(jīng)乳頭水腫、偶伴復(fù)視、眩暈及癲癇發(fā)作、血壓升高、呼吸紊亂、腦型鈉潴留及腦性耗鹽綜合征等,兩者在臨床表現(xiàn)上有很大的相同性。研究表明,桂枝具有抗病毒、抗菌、降糖、解熱、抗炎、抗敏、抗凝血、抗腫瘤、鎮(zhèn)靜、抗焦慮、擴(kuò)血管、神經(jīng)保護(hù)等作用[19-21]。白術(shù)的作用集中在胃腸道系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)及泌尿系統(tǒng),具有抗腫瘤、修復(fù)胃黏膜、抗炎鎮(zhèn)痛、調(diào)整水液代謝、保肝、改善記憶力、調(diào)節(jié)脂代謝、降血糖、抗血小板、抑菌、免疫調(diào)節(jié)等多種藥理作用[22-24]。而茯苓具有抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)、抗炎、抗氧化、抗衰老等作用[25-27]。澤瀉具有利尿、抗結(jié)石及腎臟保護(hù)、降血脂及保肝、降血糖、抗癌、抗氧化損傷、抗炎、抗補(bǔ)體等多種藥理活性[28-29]。豬苓的藥理作用包括利尿、抗腫瘤、抗炎、抗氧化、免疫調(diào)節(jié)、保肝、抑菌、促進(jìn)頭發(fā)生長等[30-32]。
本研究中,通過中藥-成分-靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治龊螅仙剂?taxifolin)、兒茶素[(+)-catechin]、表兒茶素(ent-Epicatechin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)為篩選后的主要活性成分,這些成分均來自桂枝。相關(guān)研究表明,桂枝提取物通過下調(diào)Toll樣受體4/髓樣細(xì)胞分化因子88(TLR4/MyD88)信號(hào)通路有效抑制小鼠小膠質(zhì)細(xì)胞(BV2)中脂多糖(LPS)誘導(dǎo)的神經(jīng)炎癥[33-34]。紫杉林具有抗氧化和抗炎作用[35]。兒茶素治療對創(chuàng)傷性腦損傷大鼠有神經(jīng)保護(hù)作用,這些作用可能是通過干預(yù)血腦屏障破壞和過度炎癥反應(yīng)的自我維持過程來實(shí)現(xiàn)的[36]。表兒茶素顯著刺激脾細(xì)胞增殖,可顯著增強(qiáng)自然殺傷(NK)細(xì)胞的細(xì)胞毒作用和巨噬細(xì)胞的吞噬功能,具有免疫調(diào)節(jié)活性[37]。β-谷甾醇通過抑制p38絲裂原活化蛋白激酶(p38)、細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶(ERK)、核轉(zhuǎn)錄因子-κB(NF-κB)通路的激活而影響小膠質(zhì)細(xì)胞的活性從而減輕炎癥反應(yīng)[38]。此外,β-谷甾醇具有抑制血小板Aβ生成的潛在作用,可以改善粉樣前體蛋白/早老素1(APP/PS1)小鼠的記憶和學(xué)習(xí)障礙[39]。故五苓散可能通過上述核心成分的抗炎、抗氧化、免疫調(diào)節(jié)來治療腦積水。
在中藥-成分-靶點(diǎn)-信號(hào)通路的后續(xù)分析中,篩選出來的靶點(diǎn)有蛋白激酶 B信號(hào)1(AKT1)、白細(xì)胞介素6(IL6)、胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、絲裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、重組人血管內(nèi)皮生長因子(VEGFA)。絲氨酸-蘇氨酸蛋白激酶信號(hào)通路在T細(xì)胞的發(fā)育和存活過程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,與中樞神經(jīng)系統(tǒng)的自身反應(yīng)性免疫細(xì)胞有關(guān)[40]。AKT1對血管內(nèi)皮細(xì)胞功能和壁細(xì)胞覆蓋的調(diào)節(jié)在血管生成過程中對血管成熟有重要作用[41],AKT1可調(diào)節(jié)血管張力和缺血誘導(dǎo)的動(dòng)脈形成[42]。
通過KEGG通路分析可知,五苓散主要通過蛋白聚糖通路來治療腦積水。蛋白多糖是細(xì)胞外基質(zhì)的主要成分,是一組高度異質(zhì)的蛋白質(zhì),其特征是糖胺多糖類型的特定線性碳水化合物鏈的共價(jià)連接,在細(xì)胞表面,這些分子調(diào)節(jié)細(xì)胞因子、趨化因子、生長因子、黏附分子的表達(dá)和活性,并作為信號(hào)輔助受體發(fā)揮作用[43]。蛋白多糖在神經(jīng)組織發(fā)育中的作用因其高度調(diào)控的時(shí)空表達(dá)模式而受到越來越多的關(guān)注,其可促進(jìn)/抑制軸突生長,參與各種前體細(xì)胞類型的指定和成熟,調(diào)節(jié)細(xì)胞的遷移、軸突尋路、突觸發(fā)生和可塑性等行為[44-45]。絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路是細(xì)胞外信號(hào)向細(xì)胞內(nèi)反應(yīng)轉(zhuǎn)換的重要橋梁[46]。抑制p38MAPK信號(hào)通路可有效改善缺血缺氧性腦損傷新生大鼠的學(xué)習(xí)記憶能力和運(yùn)動(dòng)功能,減少海馬區(qū)神經(jīng)元凋亡,從而促進(jìn)神經(jīng)元的恢復(fù)[47]。此外,MAPK信號(hào)通路對血腦屏障的破壞有預(yù)防作用[48]。同時(shí)MAPK是缺血性和出血性腦血管疾病的重要調(diào)節(jié)因子[49]。
綜上所述,本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法與技術(shù),挖掘到五苓散中50種類藥性成分及335個(gè)潛在靶點(diǎn),腦積水疾病相關(guān)靶點(diǎn)3 520個(gè),其中五苓散-腦積水共同靶點(diǎn)105個(gè),通過對這些靶點(diǎn)進(jìn)行GO生物過程及KEGG信號(hào)通路的富集分析,初步預(yù)測出五苓散可能是通過調(diào)節(jié)AKT1、IL6、CASP3、MAPK3、VEGFA等靶點(diǎn),調(diào)控癌癥中的蛋白聚糖、MAPK信號(hào)通路、乙型肝炎、結(jié)核、卡波西氏肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染的信號(hào)通路對腦積水進(jìn)行有效治療。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是通過計(jì)算機(jī)輔助技術(shù)研究數(shù)據(jù)庫相關(guān)聯(lián)系得來,得出的結(jié)果可作為后續(xù)研究的線索,為后續(xù)的臨床及實(shí)驗(yàn)研究提供思路。