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      蒙古沙冬青外向鉀離子通道AmGORK啟動子克隆及表達分析

      2021-11-19 03:07:18李俊林張煥朝聶文婧張海洋王向譽郭洪恩韓蕾
      生物技術(shù)通報 2021年10期
      關(guān)鍵詞:冬青離子通道擬南芥

      李俊林 張煥朝 聶文婧 張海洋 王向譽 郭洪恩 韓蕾

      (1. 山東省蠶業(yè)研究所,煙臺 264002;2. 南京林業(yè)大學(xué),南京 210037;3. 魯東大學(xué),煙臺 264025)

      植物啟動子在基因的表達調(diào)控中起關(guān)鍵作用,基因表達的時空特異性、組織特異性和條件特異性主要取決于基因的啟動子。植物基因啟動子是重要的順式作用元件,能夠在轉(zhuǎn)錄水平上參與并調(diào)控下游相應(yīng)基因表達,使植物能夠抵御外界各種環(huán)境脅迫[1-2]。因此,研究植物啟動子有助于了解基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控表達模式及其調(diào)控機制,并應(yīng)用于基因工程中提高或改進外源目的基因的表達。

      干旱條件下,植物體內(nèi)ABA水平升高,保衛(wèi)細(xì)胞中的離子從細(xì)胞質(zhì)膜運出,從而驅(qū)使氣孔關(guān)閉,減少蒸騰失水[3-4]。保衛(wèi)細(xì)胞外向整流鉀離子通道(guard cell outward rectifying K+channe,GORK)是擬南芥保衛(wèi)細(xì)胞唯一一個介導(dǎo)鉀離子外流的鉀離子通道,在氣孔關(guān)閉過程起重要作用[5-7]。擬南芥GORK在保衛(wèi)細(xì)胞、根及維管組織中表達,在轉(zhuǎn)錄水平上受干旱、鹽和冷脅迫誘導(dǎo)[8]。在保衛(wèi)細(xì)胞中,GORK的表達與分布對ABA不敏感,但其分布受細(xì)胞外鉀濃度影響[7-8]。但是,ABA對保衛(wèi)細(xì)胞外向整流鉀通道轉(zhuǎn)運鉀離子有直接調(diào)控作用[9]。GORK也可通過蛋白磷酸酶(PP2C-type protein phosphatase,PP2CA)介導(dǎo)的信號途徑增強擬南芥對ABA的敏感性,并對高鹽和滲透脅迫的相關(guān)機制起到了負(fù)調(diào)節(jié)作用[10]。GORK通道可以作為細(xì)胞代謝的“主開關(guān)”,調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)K+穩(wěn)態(tài)以適應(yīng)環(huán)境條件的變化,從而最大限度地發(fā)揮植物的適應(yīng)潛力[11]。迄今為止,除了擬南芥GORK,Li等[12]曾報道蒙古沙冬青中一個與擬南芥GORK同源的外鉀離子通道AmGORK,該通道與擬南芥GORK電生理功能特征相似,但其體內(nèi)生理功能還未有報道。

      蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)為豆科,沙冬青屬,是我國西北荒漠區(qū)特有的常綠旱生闊葉灌木,起源與第三紀(jì),瀕危物種,國家三級保護植物[13-14]。常年生長在年降水量不足100 mm,年蒸發(fā)量大于3 000 mm的極端干旱環(huán)境中,是研究植物抗旱機制的很好材料[15]。

      本研究從蒙古沙冬青中克隆了外向鉀離子通道AmGORK的啟動子序列,利用PlantCARE預(yù)測AmGORK啟動子順式作用元件。將AmGORKpro定向替換植物表達載體Cambia1301的CaMV35S啟動子,構(gòu)建重組載體Cambia1301-AmGORKpro-GUS,通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)轉(zhuǎn)入野生型擬南芥。組織化學(xué)染色和定量分析揭示該啟動子對干旱脅迫的響應(yīng)特性,為深入研究該基因在水分及養(yǎng)分利用、光合作用、抗旱等過程的功能奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      蒙古沙冬青(A. mongolicus)由甘肅民勤沙生植物園提供。擬南芥(Arabidopsis thaliana)哥倫比亞(Columbia)野生型和根癌農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)GV3101為海水農(nóng)業(yè)實驗室保存。大腸桿菌(Escherichia coli)Trans1-T1、Taq酶、限制性內(nèi)切酶、T4DNA連接酶購自北京全式金生物技術(shù)有限公司。

      1.2 方法

      1.2.1 基因組DNA提取 利用CTAB法提取蒙古沙冬青幼嫩葉片基因組DNA,微量紫外分光光度計檢測DNA質(zhì)量和濃度,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2.2 AmGORK基因5′側(cè)翼片段克隆 鑒于AmGORK啟動子序列未知,參考Liu等[16]的方法進行交錯式熱不對稱PCR法(thermal asymmetric interlaced PCR),以沙冬青基因組DNA為模板,根據(jù)前期已經(jīng)克隆得到的AmGORK序列,分別在其DNA序列ATG下游45、114和248 bp處設(shè)計3條反向引物GP1-3、GP1-2和GP1-1。為了增加PCR反應(yīng)特異性,在GP1-2引物前添加一段隨機引物序列。合成4條隨機引物L(fēng)AD1-1、LAD1-2、LAD1-3和LAD1-4以及1條引物AC1,具體序列見表1。

      AmGORK的5′側(cè)翼片段的擴增由3輪PCR完成,第一輪PCR反應(yīng)以沙冬青基因組DNA為模板,上游引物分別是4條隨機引物,下游引物是GP1-1;首輪PCR產(chǎn)物稀釋40倍后作為第二輪PCR反應(yīng)模板,上游引物為AC1,下游引物為GP1-2;第二輪PCR產(chǎn)物稀釋10倍后作為第三輪PCR反應(yīng)模板,上游引物為AC1,下游引物為GP1-3。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物,將PCR條帶切膠回收,與pMD19-T載體連接,送華大基因測序。根據(jù)測序結(jié)果設(shè)計引物(GP2-1、GP2-2和GP2-3),用同樣方法進行PCR擴增,直到獲得需要大小的目的片段。

      1.2.3 AmGORK啟動子的克隆及鑒定 根據(jù)上述測序得到的DNA拼接序列設(shè)計上游引物AmGORK-pro-F和下游引物AmGORK-pro-R(表1),并分別在引物5′端引入KpnⅠ和NcoⅠ酶切位點。

      表1 試驗所用引物序列Table 1 Primer sequences used in the experiment

      以沙冬青基因組DNA為模板,用上述引物進行PCR擴增,PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖電泳檢測。按照回收試劑盒說明書回收目的片段。獲得的目的片段和pEasy-blunt zero載體(TransGen Biotech)連接,并轉(zhuǎn)化Trans1-T1,涂在含氨芐的平板上,挑取菌斑做菌落PCR鑒定,初步確認(rèn)為陽性克隆后,送華大公司測序。測序結(jié)果正確,含有AmGORK啟動子重組質(zhì)粒,保存待用。

      1.2.4 AmGORK啟動子序列的特征分析 通過在線軟件PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)進行順式作用元件預(yù)測分析[17]。

      1.2.5 AmGORK啟動子植物表達載體的構(gòu)建 用KpnⅠ和NcoⅠ分別對上述測序正確的含有AmGORK啟動子重組質(zhì)粒和植物表達載體pCambia1301-GUS進行酶切、片段回收、純化、連接及陽性克隆鑒定(圖 1)。

      圖1 表達載體構(gòu)建示意圖Fig.1 Construction map of expression vector

      1.2.6 AmGORK啟動子轉(zhuǎn)化擬南芥 根據(jù)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的花序侵染法,將Cambia1301-AmGORKPro-GUS轉(zhuǎn)化擬南芥。將收獲的T0代種子播種于含有50 mg/L潮霉素的1/2 MS培養(yǎng)基中,選取能夠長出綠色真葉,根系較長的抗性苗移栽到基質(zhì)中。

      1.2.7 GUS組織化學(xué)染色 參考Han等[18]的方法,選取T3代純合轉(zhuǎn)基因擬南芥的不同組織置于GUS染色液中,37℃黑暗培養(yǎng)過夜,用梯度濃度酒精完全脫色,顯微鏡下觀察拍照。

      2 結(jié)果

      2.1 AmGORK啟動子的克隆

      AmGORK的5′側(cè)翼片段的擴增由3輪PCR完成(圖2-A),獲得約1 200 bp的序列。然后根據(jù)測得序列重新設(shè)計3條引物GP2-1、GP2-2和GP2-3(表1),繼續(xù)向5′側(cè)翼延伸(圖2-B)獲得500 bp左右的序列。將2次測得的序列拼接,刪除中間重復(fù)片段,得到長度為1 723 bp的序列,命名為AmGORKpro。

      圖2 AmGORK啟動子序列的擴增Fig. 2 Amplification of AmGORK promoter sequence

      根據(jù)上述拼接序列設(shè)計上游引物AmGORK-pro-F和下游引物AmGORK-pro-R,分別在引物5′端引入KpnⅠ和NcoⅠ酶切位點。以沙冬青基因組DNA為模板,進行PCR擴增(圖2-C),得到2條約1 700 bp的特異條帶。將上述片段與pEasy-blunt zero載體(TransGen Biotech)連接,轉(zhuǎn)化Trans1-T1,進行菌落PCR鑒定,初步確認(rèn)為陽性克隆后測序。將測序結(jié)果正確含有AmGORKpro的重組質(zhì)粒保存待用。

      2.2 AmGORK啟動子序列功能預(yù)測分析

      利用在線數(shù)據(jù)庫PlantCARE對AmGORK啟動子序列的結(jié)構(gòu)特征及重要的順式作用元件進行分析。結(jié)果(表2)顯示,AmGORK啟動子序列包含典型的TATA-box及CAAT-box。此外,還包含ABA響應(yīng)元件ABRE、赤霉素響應(yīng)元件GARE、干旱誘導(dǎo)元件MBS、低溫響應(yīng)元件LTR等各1個,及多個光響應(yīng)元件。表明AmGORK可能受到干旱、低溫等非生物脅迫或光信號的調(diào)控。

      表2 AmGORK啟動子序列預(yù)測分析Table 2 Prediction analysis of AmGORK promoter sequence

      2.3 轉(zhuǎn)基因擬南芥植株的鑒定

      根據(jù)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的花序侵染法,將Cambia1301-AmGORKPro-GUS轉(zhuǎn)化擬南芥。將收獲的T0代種子播種于含有潮霉素的1/2 MS培養(yǎng)基中,提取能夠長出綠色真葉,根系較長的抗性苗基因組DNA,進行PCR檢測(圖3),抗性植株的PCR產(chǎn)物與目的條帶大小一致。初步證明目的基因已成功轉(zhuǎn)入擬南芥中。按照上述方法獲得T3代純合轉(zhuǎn)基因株系。

      圖3 轉(zhuǎn)AmGORK擬南芥PCR鑒定結(jié)果Fig. 3 PCR validation of AmGORK transgenic A. thaliana

      2.4 AmGORK啟動子的組織表達特異性

      構(gòu)建了Cambia1301-AmGORKpro-GUS植物表達載體,通過農(nóng)桿菌介導(dǎo),將該表達載體轉(zhuǎn)入擬南芥中,觀測轉(zhuǎn)基因陽性植株GUS的表達情況(圖4),轉(zhuǎn)基因擬南芥的葉片葉柄、葉脈、保衛(wèi)細(xì)胞和莖均有明顯的藍色GUS染色信號,表明AmGORK的表達在整個發(fā)育階段具有連續(xù)性。除了葉片,在主根中柱和花萼也有GUS的表達,表明AmGORK的表達具有組織特異性,并且主要在輸導(dǎo)組織中表達。

      圖4 轉(zhuǎn)基因擬南芥中AmGORK啟動子活性分析Fig.4 Activity analysis of AmGORK promoter in transgenic A. thaliana

      2.5 逆境脅迫對轉(zhuǎn)基因幼苗AmGORK啟動子活性的影響

      為了研究非生物脅迫對擬南芥中AmGORK啟動子活性的影響,對轉(zhuǎn)AmGORK啟動子的擬南芥進行PEG或ABA處理。定量表達分析顯示,PEG處理24 h后,轉(zhuǎn)基因植株葉片的GUS表達為對照的3.2倍,ABA處理24 h后,轉(zhuǎn)基因植株葉片的GUS表達為對照的4.1倍(圖5)。以上結(jié)果表明,AmGORK啟動子活性受PEG或ABA誘導(dǎo)。

      圖5 不同處理下轉(zhuǎn)基因擬南芥葉片中GUS的表達分析Fig. 5 Expression analysis of GUS gene in the transgenic A. thaliana leaves under different treatments

      3 討論

      啟動子位于基因上游,被RNA聚合酶特異性識別并結(jié)合的一段DNA序列,在轉(zhuǎn)錄水平,對基因的表達起調(diào)控作用。啟動子核心區(qū)域一般包括TATA-box和CAAT-box等模塊,這也是啟動子的特征序列[19-20]。本研究通過生物信息學(xué)對克隆的AmGORKpro序列進行分析,發(fā)現(xiàn)該序列含有多個TATA-box和CAAT-box,說明該序列具有典型的啟動子特征。除了這些核心特征序列外,啟動子中還有很多特異的順式作用元件和非生物脅迫響應(yīng)元件[21-22]。研究結(jié)果顯示,AmGORK啟動子序列內(nèi)包含干旱響應(yīng)相關(guān)元件、激素響應(yīng)元件和光響應(yīng)元件等。啟動子區(qū)域的干旱誘導(dǎo)響應(yīng)元件、ABA響應(yīng)元件和水楊酸響應(yīng)元件與基因參與的逆境響應(yīng)和對應(yīng)激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān),而ABA和水楊酸介導(dǎo)植物對外界環(huán)境的響應(yīng)[23-25]。

      擬南芥中2個外向型鉀離子通道分別為中柱鉀離子外向整流通道(stelar K+outward rectifier channel,SKOR)和GORK,SKOR主要在根中柱鞘和中柱薄壁細(xì)胞中表達[26]。GORK主要在保衛(wèi)細(xì)胞中表達,進一步研究發(fā)現(xiàn)其在根、葉、花和花粉中都有表達[6,8]。本研究結(jié)果顯示,AmGORK組織定位模式與擬南芥GORK基本一致,都在根中柱、葉脈、葉柄等輸導(dǎo)組織中表達。輸導(dǎo)組織是植物體中擔(dān)負(fù)物質(zhì)長途運輸?shù)闹饕M織,根從土壤中吸收的水分和無機鹽分,由輸導(dǎo)組織運送到地上各個部位。植物組織間的物質(zhì)重新分配和轉(zhuǎn)移,也要通過輸導(dǎo)組織來進行。AmGORK在輸導(dǎo)組織中表達,推測其可能參與植物水分或養(yǎng)分運輸與再分配過程。此外,AmGORK啟動子還存在數(shù)個“TAAAG”元件,這些元件能夠驅(qū)動馬鈴薯鉀通道KST1在保衛(wèi)細(xì)胞中特異性表達[27],同時,AmGORK在保衛(wèi)細(xì)胞中有強烈的GUS信號,表明AmGORK可能參與保衛(wèi)細(xì)胞運動過程。植物遭遇干旱脅迫時,體內(nèi)ABA含量提高,ABA通過激活保衛(wèi)細(xì)胞內(nèi)Ca2+、K+及陰離子通道,使保衛(wèi)細(xì)胞內(nèi)離子外流,減少保衛(wèi)細(xì)胞滲透壓,導(dǎo)致氣孔關(guān)閉,從而適應(yīng)水分虧缺[28-29]。蒙古沙冬青幼苗受到PEG模擬水分脅迫及ABA處理2 d后,都能引起AmGORK表達上調(diào)[12],有報道顯示,擬南芥外向整流鉀離子通道AtGORK受到干旱脅迫時,表達量也上調(diào)[8],表明AmGORK可能參與干旱脅迫引起氣孔關(guān)閉過程。

      4 結(jié)論

      本研究克隆并鑒定一個沙冬青外向鉀離子通道AmGORK的啟動子,該啟動子可以驅(qū)動外源基因在植物葉片葉脈、葉柄、氣孔、根系中柱和花萼中表達,且主要集中于葉脈、葉柄和根系的輸導(dǎo)組織。AmGORK啟動子活性受PEG和ABA誘導(dǎo)。

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