馬學(xué)玲,蔡海瑜,車艷紅,劉星爍
(鄭州市婦幼保健院a.婦科,b.婦科腫瘤病區(qū),鄭州 450052)
宮頸癌是常見的婦科惡性腫瘤,以宮頸鱗癌較為多發(fā),近來發(fā)病呈年輕化趨勢,危害嚴(yán)重[1]。早期確診患者的5年生存率可達(dá)90%,但晚期多發(fā)生浸潤、轉(zhuǎn)移,患者預(yù)后差,Ⅳ期患者的5年生存率不足20%[2]。宮頸癌發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,探究與發(fā)病機(jī)制相關(guān)的分子標(biāo)志物對宮頸癌的病情監(jiān)測具有重要意義。FXYD3蛋白(domain-containing ion transport regulator3 precursor)是FXYD蛋白質(zhì)家族成員,以脯氨酸-苯丙氨酸-X-酪氨酸-天冬氨酸(PFXYD)而得名,又稱為乳腺腫瘤標(biāo)志物(MAT-8),其可通過調(diào)節(jié)Na+-K+泵,參與細(xì)胞內(nèi)環(huán)境代謝及穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)。研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)XYD3在乳腺癌[3]、前列腺癌[4]等多種癌癥中的表達(dá)上調(diào),并與腫瘤惡性程度呈正相關(guān)。然而,關(guān)于FXYD3在宮頸鱗癌中表達(dá)情況的報道少見。雖然不同腫瘤的異質(zhì)性極大的影響了相關(guān)腫瘤分子標(biāo)志物的表達(dá)、患者治療、預(yù)后及復(fù)發(fā)等,但不同腫瘤之間亦存在相似性,研究腫瘤異質(zhì)性及相似性可加深對腫瘤發(fā)生、發(fā)展機(jī)制的認(rèn)知[5]。因此,本研究選取FXYD3基因為研究對象,通過生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫及免疫組化染色法分析FXYD3在正常宮頸組織及宮頸鱗癌組織中的表達(dá)情況,并初步探討其與宮頸鱗癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系。
1.1研究對象 收集2015年9月至2018年1月于鄭州市婦幼保健院婦科收治的65例宮頸鱗癌患者癌組織標(biāo)本,年齡(46.92±10.35)歲,腫瘤臨床(FIGO)分期:Ⅰ期15例,Ⅱ期32例,Ⅲ期13例,Ⅳ期5例;病理分級:Ⅰ級12例,Ⅱ級39例,Ⅲ級14例;淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移者26例,未轉(zhuǎn)移者39例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)符合國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(FIGO)宮頸鱗癌診斷標(biāo)準(zhǔn)[6];(2)均行手術(shù)切除,術(shù)前均未進(jìn)行放化療等抗腫瘤治療,術(shù)后均經(jīng)組織病理學(xué)證實為宮頸鱗癌;(3)臨床資料完整。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)合并其他惡性腫瘤者;(2)合并基礎(chǔ)性疾病或慢性感染性疾病者。另取同期50例本院保存的因子宮肌瘤行子宮全切術(shù)的正常宮頸組織標(biāo)本作為對照組,年齡(46.41±11.08)歲,均經(jīng)超聲和病理檢查確診為子宮肌瘤[7]。本研究通過鄭州市婦幼保健院醫(yī)學(xué)倫理委員會審核批準(zhǔn)[倫理批文:2015-(倫)009)]?;颊叱鲈汉笸ㄟ^門診復(fù)查、電話等方式對患者進(jìn)行隨訪,記錄患者生存時間(overall survival,OS)。本次隨訪截止日期為2020年12月。
1.2儀器與試劑 NanoDrop 2000c 超微量紫外分光光度計、905-ULT超低溫冰箱(美國Thermo Fisher公司),CFX96實時熒光定量PCR儀(美國Bio-Rad公司)。RNA提取試劑盒(北京天根公司),反轉(zhuǎn)錄試劑盒、qRT-PCR試劑盒(日本TaKaRa公司),兔抗人FXYD3多克隆抗體、生物素標(biāo)記的羊抗兔IgG二抗(英國Abcam公司),DAB顯色試劑盒(北京中杉金橋公司)。
1.3方法
1.3.1數(shù)據(jù)庫挖掘分析 使用TCGA門戶網(wǎng)站的UALCAN數(shù)據(jù)庫(http://ualcan.path.uab.edu/analysis.html)深入分析31種癌癥類型的RNA測序數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù)。從TCGA數(shù)據(jù)庫(https://www.cancer.gov)下載宮頸鱗癌對應(yīng)的mRNA表達(dá)RNASeq數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù)。GEPIA數(shù)據(jù)庫(http://gepia.cancer-pku.cn/)分析來自TCGA和GTEX數(shù)據(jù)庫中樣本的RNA測序表達(dá)數(shù)據(jù)。下載GTEX數(shù)據(jù)庫(https://commonfund.nih.gov/gtex)中正常宮頸組織的RNA Seq數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù),基于以上2種數(shù)據(jù)庫,篩選存在FXYD3mRNA表達(dá)的宮頸鱗癌組織和正常宮頸組織樣本,分析FXYD3在宮頸鱗癌(CESC)組織及正常宮頸組織中的表達(dá)差異。
1.3.2RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng) 按照RNA提取試劑盒說明書對宮頸鱗癌組織及正常宮頸組織標(biāo)本(各60 mg)中的總RNA進(jìn)行提取。NanoDrop 2000c 分光光度計檢測RNA濃度,取吸光度(A260 nm/A280 nm)值在1.8~2.0間的樣本,置于-80 ℃保存。按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,置于-20 ℃保存。
1.3.3引物設(shè)計及實時熒光定量PCR(qRT-PCR) 參照GenBank中各基因的序列號(FXYD3序列號為NC_000019.10、GAPDH序列號為NC_000012.12),引物設(shè)計參照文獻(xiàn)[8],并由上海生工公司合成。FXYD3上游引物序列:5′-CCTGTCCTGGACGCCAAT-3′,下游引物序列:5′-GAGGCTGTGCCAGTCATAGTAGAA-3′,退火溫度61 ℃,產(chǎn)物片段大小243 bp;GAPDH上游引物序列:5′-TGCACCACCAACTGCTTAGC-3′,下游引物序列:5′-GGCATGGACTGTGGTCATGAG-3′。qRT-PCR反應(yīng)體系共25 μL,包括SYBR Premix Ex Taq Ⅱ 10 μL,cDNA(50 ng/μL)2 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1 μL,滅菌水8.5 μL。反應(yīng)條件:預(yù)變性95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s,共35個循環(huán);72 ℃時采集熒光信號。以GAPDH為內(nèi)參基因,2-ΔΔCt法計算FXYD3mRNA的相對表達(dá)量,計算公式:ΔΔCt=[(樣本Ct目的基因-樣本Ct內(nèi)參基因)-(對照Ct目的基因-對照Ct內(nèi)參基因)]。
1.3.4免疫組化染色法檢測FXYD3蛋白表達(dá) 石蠟組織切片標(biāo)本常規(guī)脫蠟至水,修復(fù)抗原,加入6%的正常山羊血清室溫封閉30 min,加入50 μL兔抗人FXYD3多克隆抗體(1∶100稀釋)4 ℃過夜,PBS洗滌3次,加入生物素標(biāo)記的羊抗兔IgG二抗(1∶1 000稀釋),37 ℃溫育1 h,PBS洗滌3次,DAB染色5 min,蘇木素復(fù)染,鹽酸酒精短暫分化后,脫水、透明、封片。用PBS代替一抗作為陰性對照。結(jié)果判定:由2名資深病理醫(yī)師采用雙盲法分別對染色結(jié)果進(jìn)行半定量評分。細(xì)胞質(zhì)或核內(nèi)呈黃色或棕色顆粒為陽性染色,采用免疫反應(yīng)積分(IRS)法進(jìn)行評分:染色強(qiáng)度(SI)積分,無著色0分,淡黃色1分,棕黃色2分,棕褐色3分;陽性染色細(xì)胞百分比(PP)積分,陰性記0分,PP 1%~10%記1分,PP 11%~50%記2分,PP 51%~75%記3分,PP 76%~100%記4分。IRS = SI積分×PP積分,IRS≥3為陽性,IRS<3為陰性。
1.3.5FXYD3共表達(dá)基因分析 基于cBioPortal數(shù)據(jù)庫(https://www.cbioportal.org/),選取相關(guān)系數(shù)r>0.3且P<0.05的基因。進(jìn)一步將其導(dǎo)入Enrichr網(wǎng)站(http://amp.pharm.mssm.edu/Enrichr)進(jìn)行共表達(dá)基因的富集分析,選擇顯著相關(guān)通路,采用ImageGP(http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/)在線軟件進(jìn)行信號通路富集分析,以氣泡圖形式呈現(xiàn)富集結(jié)果。
1.3.6FXYD3蛋白互作分析 STRING數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/)是一種用于識別已知蛋白質(zhì)和預(yù)測蛋白質(zhì)之間相互作用的軟件系統(tǒng)?;赟TRING數(shù)據(jù)庫對FXYD3蛋白進(jìn)行蛋白質(zhì)互作分析,繪制蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)圖。
2.1FXYD3在宮頸鱗癌組織及正常宮頸組織中的表達(dá)差異 UALCAN數(shù)據(jù)庫中共分析了3例正常宮頸組織及305例宮頸鱗癌組織中FXYD3的表達(dá),結(jié)果顯示宮頸鱗癌組織中FXYD3的表達(dá)水平[8.921(8.287,9.400)]顯著高于正常宮頸組織[0.995(0.346,5.837)],差異有統(tǒng)計學(xué)意義(Z=-0.205,P<0.05)。進(jìn)一步比較GEPIA數(shù)據(jù)庫中13例正常宮頸組織[3.269(2.720,7.820)]及306例宮頸鱗癌組織[10.244(9.569,10.749)]FXYD3的表達(dá)量,結(jié)果顯示宮頸鱗癌組織中FXYD3的表達(dá)水平亦顯著高于正常宮頸組織(Z=-6.107,P<0.05)。
2.2FXYD3mRNA在宮頸鱗癌組織及正常宮頸組織中的表達(dá) qRT-PCR結(jié)果顯示,F(xiàn)XYD3mRNA在50例正常宮頸組織中的表達(dá)量為1.00±0.00,在65例宮頸鱗癌組織中的表達(dá)量為1.68±0.32,F(xiàn)XYD3mRNA在宮頸鱗癌組織中的表達(dá)量顯著高于正常宮頸組織(t=15.011,P<0.05)。
2.3FXYD3蛋白在宮頸鱗癌組織及正常宮頸組織中的表達(dá) 免疫組化染色結(jié)果顯示,F(xiàn)XYD3蛋白主要定位于細(xì)胞質(zhì)或(和)細(xì)胞膜上。宮頸鱗癌組織中FXYD3陽性表達(dá)率為63.08%(41/65),顯著高于正常宮頸組織的28.00%(14/50),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=13.935,P<0.05)。
2.4FXYD3表達(dá)與宮頸鱗癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系 基于UALCAN數(shù)據(jù)庫分析FXYD3與宮頸鱗癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系,結(jié)果顯示FXYD3在不同組織類型中的表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,圖1E),在不同年齡、體重、種族、癌癥分期、腫瘤分級、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移類型中的表達(dá)差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05,圖1A~F)。本研究基于選取病例中FXYD3的表達(dá)情況,分析其與宮頸癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系,結(jié)果顯示FXYD3蛋白的表達(dá)與年齡、病理分級均無關(guān)(P>0.05),而與組織類型、臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P<0.05)。見表1。
注:A,不同年齡;B,不同體重;C,不同種族;D,不同癌癥分期;E,不同組織類型;F,不同腫瘤分級;G,不同淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。
表1 FXYD3表達(dá)與宮頸鱗癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系[n(%)]
2.5FXYD3蛋白表達(dá)與宮頸鱗癌患者預(yù)后的關(guān)系 FXYD3蛋白陽性表達(dá)患者的平均生存時間(OS)顯著低于陰性表達(dá)患者(38.12個月 vs 53.56個月,χ2=5.485,P=0.019)。
2.6FXYD3蛋白互作共表達(dá)分析 通過STRING網(wǎng)站在線繪制FXYD3蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖,根據(jù)相關(guān)性評分分析結(jié)果顯示,相關(guān)性較強(qiáng)的前5個蛋白質(zhì)分別為ATP1B1、ATP1B2、ATP1B3、ATP1A1、ATP1A2(圖2)。
圖2 FXYD3蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖
2.7FXYD3共表達(dá)基因通路富集分析 通過cBioPortal數(shù)據(jù)庫,預(yù)測分析出417個與FXYD3共表達(dá)基因,表2為與FXYD3基因相關(guān)性較強(qiáng)的前5個基因。將共表達(dá)基因輸入Enrichr網(wǎng)站進(jìn)行通路富集分析,選擇有顯著差異的前20條,采用ImageGP在線網(wǎng)站繪制氣泡圖(圖3),結(jié)果顯示,F(xiàn)XYD3共表達(dá)基因富集到的主要通路包括T細(xì)胞受體、B細(xì)胞受體、白細(xì)胞介素-17、趨化因子信號通路,氧化應(yīng)激信號通路,非小細(xì)胞肺癌、膀胱癌等癌癥信號通路,蛋白質(zhì)水解、核黃素代謝、核酸合成代謝等信號通路。
表2 FXYD3基因共表達(dá)分析基因
注:氣泡大小代表基因數(shù)量,氣泡顏色由紅色至藍(lán)色表示顯著性差異的P值逐漸減小。
FXYD3定位于人類染色體19q13.11-q13.12,是最早在家鼠的乳腺癌組織中發(fā)現(xiàn)的一種分子量(Mr)為8 000的單跨膜蛋白質(zhì),其可通過調(diào)節(jié)Na+-K+-ATP酶改變其對Na+、K+的親和力,進(jìn)而確保機(jī)體正常組織功能的運轉(zhuǎn)[9]。本研究首先采用數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計分析FXYD3基因在正常宮頸組織及宮頸鱗癌組織中的差異表達(dá)情況,UALCAN數(shù)據(jù)庫、GEPIA數(shù)據(jù)庫中的統(tǒng)計結(jié)果均顯示,宮頸鱗癌組織中FXYD3基因的表達(dá)水平顯著高于正常宮頸組織,提示FXYD3基因可能起促癌基因作用。為進(jìn)一步驗證數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計結(jié)果,本研究采用qRT-PCR和免疫組化染色法檢測65例宮頸鱗癌組織標(biāo)本及50例正常宮頸組織標(biāo)本中FXYD3mRNA及FXYD3蛋白的表達(dá)水平,結(jié)果顯示FXYD3mRNA在宮頸鱗癌組織中的相對表達(dá)量及FXYD3蛋白陽性表達(dá)率均顯著高于正常宮頸組織,與UALCAN、GEPIA數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計結(jié)果一致,提示FXYD3表達(dá)可能與宮頸鱗癌發(fā)生有關(guān)。
研究報道,F(xiàn)XYD3在子宮內(nèi)膜癌中表達(dá)上調(diào)是子宮內(nèi)膜癌進(jìn)展的早期事件,與年齡、血壓、血糖和血脂水平、癌癥家族史、絕經(jīng)年齡、FIGO分期、組織病理學(xué)類型、組織學(xué)分級、肌層侵犯、宮頸受累度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和生長方式無關(guān),僅與生育頻率呈負(fù)相關(guān)[10]。本研究基于UALCAN數(shù)據(jù)庫分析FXYD3與宮頸鱗癌患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系,結(jié)果顯示FXYD3在不同腫瘤組織類型中的表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義,在不同年齡、體重、種族、癌癥分期、腫瘤分級、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移類型中的表達(dá)差異均無統(tǒng)計學(xué)意義,與Li等[10]研究結(jié)果具有相似性,但在腫瘤組織類型方面有所不同,需繼續(xù)深入探討。另有研究報道[11],F(xiàn)XYD3在宮頸癌組織及細(xì)胞系中的表達(dá)上調(diào),且與LINC01503通過競爭性結(jié)合miR-342-3p正向調(diào)控FXYD3的表達(dá)機(jī)制有關(guān),抑制FXYD3表達(dá)可抑制宮頸癌Hela、CaSki細(xì)胞增殖、侵襲及遷移。本研究通過收集臨床資料分析發(fā)現(xiàn),F(xiàn)XYD3陽性表達(dá)與年齡、腫瘤分級無關(guān),而與組織類型、臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),與Peng等[11]研究結(jié)果類似,提示FXYD3陽性表達(dá)可能與宮頸鱗癌發(fā)生及病情程度有關(guān)。筆者進(jìn)一步行生存分析結(jié)果表明,F(xiàn)XYD3陽性表達(dá)患者具有更短的生存時間,提示FXYD3陽性表達(dá)可能是宮頸鱗癌預(yù)后的潛在預(yù)測生物學(xué)標(biāo)志物。
腫瘤的發(fā)生、發(fā)展是一個多基因、多因素參與的復(fù)雜過程,其中包括抑癌基因失活、促癌基因激活、微環(huán)境的改變等多因素相互作用。已有研究顯示,F(xiàn)XYD3不僅在正常人體組織中廣泛表達(dá),而且在多種腫瘤組織中表達(dá)上調(diào),近年來FXYD3作為一種潛在的新型癌癥生物學(xué)標(biāo)志物備受關(guān)注[12-13]。本研究采用cBioPortal數(shù)據(jù)庫共預(yù)測到與FXYD3共表達(dá)的基因417個。通路富集分析顯示,F(xiàn)XYD3共表達(dá)基因主要參與的通路包括癌癥相關(guān)通路(非小細(xì)胞肺癌、膀胱癌及其他癌癥),免疫、炎癥調(diào)節(jié)相關(guān)通路(T細(xì)胞、B細(xì)胞、白細(xì)胞介素-17)及各種營養(yǎng)代謝通路(蛋白質(zhì)水解、核黃素代謝、核酸合成代謝等),機(jī)體免疫狀態(tài)、營養(yǎng)水平均可影響疾病易感性[14],提示FXYD3可能與癌癥進(jìn)展密切相關(guān),但關(guān)于其在宮頸鱗癌中的表達(dá)及作用機(jī)制研究尚處于初級階段,還需深入探究。
綜上所述,F(xiàn)XYD3在宮頸鱗癌組織中的表達(dá)水平顯著升高,且與宮頸鱗癌組織類型、臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及預(yù)后有關(guān),可能成為監(jiān)測宮頸鱗癌進(jìn)展的有價值基因。然而,本研究僅分析了FXYD3在宮頸鱗癌組織中的表達(dá)及其與患者臨床病理參數(shù)和預(yù)后的關(guān)系,納入的宮頸鱗癌組織及正常組織樣本量較少,結(jié)果可能存在一定的局限性,是本研究不足之處。下一步我們將通過擴(kuò)大樣本量,探討FXYD3在宮頸鱗癌中的臨床意義,并根據(jù)FXYD3共表達(dá)基因相關(guān)通路進(jìn)行相關(guān)的基礎(chǔ)實驗,探討FXYD3在宮頸鱗癌發(fā)生、發(fā)展中的可能通路機(jī)制。