曾超,吳迪,丘文,周宏偉,沈薇
(1. 南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院新生兒科,廣州 510515; 2. 南方醫(yī)科大學珠江醫(yī)院檢驗醫(yī)學部,廣州 510282)
喂養(yǎng)不耐受(feeding intolerance,F(xiàn)I),指新生兒腸內(nèi)喂養(yǎng)后出現(xiàn)嘔吐、腹脹、胃潴留、血便等臨床表現(xiàn),在早產(chǎn)兒中具有較高的發(fā)病率(25%~53%)[1-3]。該疾病與特定新生兒胃腸道不成熟或腸道功能障礙密切相關(guān)[4],常是壞死性小腸結(jié)腸炎或敗血癥等嚴重疾病的早期臨床表現(xiàn)[4-5]。對于胎齡<34周的非晚期早產(chǎn)兒,輸血是生命早期較為常見的醫(yī)療干預(yù)措施[5]。有研究報道,輸血可能是FI的獨立危險因素[6],尤其是進行紅細胞輸注可引發(fā)缺氧腸組織再灌注損傷[7],進而增加壞死性小腸結(jié)腸炎風險[8-10]。近年來,腸道菌群紊亂在壞死性小腸結(jié)腸炎中的角色日益受到關(guān)注[11],而輸血可否通過改變腸道菌群影響FI,進而對壞死性小腸結(jié)腸炎發(fā)揮作用未見報道。本研究回顧性分析輸血對FI事件的潛在影響,初步探索輸血治療的早產(chǎn)兒出現(xiàn)腸道FI表型與腸道菌群內(nèi)環(huán)境間潛在關(guān)聯(lián)。
1.1研究對象 以2021年3月至2021年6月南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院新生兒科重癥監(jiān)護室(NICU)住院收治的早產(chǎn)兒為研究對象。納入標準:(1)胎齡<34周或出生體重<2 000 g;(2)出生后即轉(zhuǎn)入新生兒科病房,存活>7 d;(3)獲家屬知情同意。排除標準:(1)合并有多發(fā)畸形、遺傳代謝性疾病,伴有血流動力學改變的動脈導(dǎo)管未閉或其他紫紺型心臟病;(2)存在需要外科干預(yù)的疾??;(3)存在先天性免疫缺陷性疾病,或母親合并免疫性疾??;(4)生后1周內(nèi)進行過輸血治療或輸注過血液制品;(5)出院或因其他疾病轉(zhuǎn)院時尚未達足量喂養(yǎng)等出院標準者。根據(jù)生后第1周后是否輸注紅細胞,分為輸血組和對照組。本研究通過南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院倫理委員會審查并獲批準(NFEC-2021-054)。
1.2資料收集 采用回顧性分析。觀察至生后4周或出院時間。依據(jù)患兒病情,遵循科室臨床診療規(guī)范,統(tǒng)一確定紅細胞輸血量、輸血標準及輸血持續(xù)時間。早產(chǎn)兒均為配方奶喂養(yǎng),喂養(yǎng)間隔時間3 h。輸血前1~2 h及輸血期間奶量減半,輸血結(jié)束后喂養(yǎng)量恢復(fù)干預(yù)前體積。調(diào)查輸血組在輸血起始干預(yù)后2周內(nèi)以及對照組在對應(yīng)周齡段是否發(fā)生FI及其臨床特征(包括腹脹、嘔吐、暫停喂養(yǎng)等癥狀次數(shù))。并采集兩組達全胃腸內(nèi)喂養(yǎng)時間、住院時長等資料。FI診斷標準依據(jù)中國醫(yī)師協(xié)會新生兒科醫(yī)師分會循證專業(yè)委員會指定的《早產(chǎn)兒喂養(yǎng)不耐受臨床診療指南(2020)》,具體為:胃殘余量超過前一次喂養(yǎng)量的50%,伴有嘔吐和/或腹脹;或喂養(yǎng)計劃失敗,包括減少、延遲或中斷腸內(nèi)喂養(yǎng)[12]。
收集患兒性別、出生體重、胎齡,出生時是否有窒息缺氧,生后第1周是否合并急性呼吸窘迫綜合征和感染性疾病等一般資料。其中感染性疾病特指細菌感染,包括:羊膜腔內(nèi)感染、早發(fā)型新生兒敗血癥(包含臨床敗血癥)、化膿性腦膜炎、肺炎等,與新生兒窒息及新生兒呼吸窘迫綜合征均參照人民衛(wèi)生出版社第5版《實用新生兒學》診斷標準[13]。
1.3標本采集 采集輸血組輸血后的第1周、第2周2次糞便樣本,如期間多次輸血則以第1次輸血為準。該時間節(jié)點對應(yīng)于對照組生后第3周至第4周出生周齡,采集對照樣本。所有樣本采集時均使用一次性糞便采樣管,收集尿布上非表層糞便0.5 g,置入無菌凍存管,迅速保存于-80 ℃待測。
1.4主要儀器與試劑 Nano Drop 2000超微量分光光度計(美國Thermo Scientific公司),VII7000實時熒光定量PCR儀(美國ABI公司),Illumina iSeq 100(美國Illumina公司);QIAamp Mini Kit(德國Qiagen公司), PCR檢測試劑盒(美國Invitrogen公司),蛋白酶K(美國Sigma公司),Phix溶液(美國Illumina公司),分析純異丙醇、無水乙醇和氯仿(廣東光華化學廠)。
1.5方法
1.5.1DNA提取 -80 ℃保存的糞便樣本,置于4 ℃融解后,采用細菌基因組DNA提取試劑盒QIAamp Mini Kit,參照試劑盒說明書,提取糞便菌群總DNA。用Nano Drop 2000超微量分光光度計檢測DNA濃度及純度,DNA產(chǎn)物保存于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>
1.5.2PCR擴增 以16S rRNA V4區(qū)作為擴增靶標,選用V4可變區(qū)的上游引物 514F:5′-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3′、下游引物805R:5′-CCGGACTACNVGGTWTCTAAT-3′,對糞便總DNA進行PCR擴增。上述引物插入序列不同的條碼序列以區(qū)分樣本。擴增體系20 μL,包括:2×SYBR qPCR Master Mix 10 μL,ROX Reference Dye2 0.4 μL,514F 0.4 μL,805R 0.4 μL,DNA 2 μL,ddH2O 6.8 μL。PCR循環(huán)條件為:94 ℃ 2 min;90 ℃ 30 s,57 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30個循環(huán);72 ℃ 5 min;5 ℃ 15 s,60 ℃ 60 s,95 ℃ 15 s。
1.5.316S rRNA測序 根據(jù)樣本定量PCR擴增曲線中的最高值G,計算各個樣本所需混樣量,同一批次PCR樣本均勻混樣后純化,以Phix溶液將混樣稀釋成50 pmol/L濃度的DNA溶液,取20 μL用于上機測序。開啟Illumina iSeq 100平臺,點擊GenerateFASTQ2.0.0.9模式進行建庫,選擇Nextera XT工具,設(shè)計雙末端堿基測序長度為161,命名測序項目,然后點擊Sequence按平臺默認程序測序。測序結(jié)束后查看測序數(shù)據(jù)質(zhì)量,確認Phix數(shù)據(jù)占有量接近30%,去掉重復(fù)克隆簇后的測序量/總測序量(ClusterPF%)大于75%。
1.5.4生物信息學分析 使用DADA2(版本1.6.0)對每個糞便樣本的16S rRNA測序讀數(shù)進行去噪以生成擴增子序列變體(amplicon sequence variants,ASV)。通過PyNAST算法比對代表性序列并通過FastTree構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹?;贕reengene(版本13.8)數(shù)據(jù)庫,使用RDP分類器的默認參數(shù)對ASV進行物種注釋。來自試劑對照的ASV被排除在下游分析之外。所有后續(xù)的生物統(tǒng)計分析均使用QIIME(版本1.9.1)軟件或R語言(版本4.0.5)進行。根據(jù)ASV的注釋結(jié)果,分別在各個分類水平統(tǒng)計各樣本的物種相對豐度,繪制菌群堆疊圖、柱狀圖展示菌群構(gòu)成;同時分析ASV的分類比對結(jié)果,比較在輸血組和對照組中觀察到的ASV,以Y表示輸血組,N表示對照組,對兩組的菌群數(shù)據(jù)分別進行α多樣性分析及β多樣性相異矩陣分析。通過主成分分析(principal component analysis,PCA)圖對兩組數(shù)據(jù)的相似性進行可視化,用于顯示基于β多樣性相異矩陣和排列多元方差分析(PERMANOVA)的樣本之間的差異,進行999次置換來估計分組β多樣性的統(tǒng)計顯著性。
2.1入組患兒基礎(chǔ)資料 本研究共納入早產(chǎn)兒33例,其中生后第1周后進行過紅細胞輸注早產(chǎn)兒共14例,為輸血組;同期無輸血史早產(chǎn)兒19例,為對照組。兩組早產(chǎn)兒的性別、胎齡、出生體重以及基礎(chǔ)疾病等一般資料差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),組間具有可比性。見表1。
表1 兩組患兒一般臨床資料比較
2.2FI事件比較 輸血組中12例發(fā)生FI事件(85.7%),相關(guān)FI癥狀數(shù)為(7.7±5.4)次/人;對照組出現(xiàn)7例FI(36.8%),其相關(guān)癥狀數(shù)為(6.7±5.9)次/人。兩組早產(chǎn)兒FI事件發(fā)生率差異有統(tǒng)計學意義(P=0.005),但兩組FI患兒間癥狀頻次差異無統(tǒng)計學意義(P=0.712)。見表2。兩組達到全胃腸內(nèi)喂養(yǎng)所需的時間、住院時長及住院花費間差異均無統(tǒng)計學意義。本研究兩組患兒觀察至4周齡,均未發(fā)生壞死性小腸結(jié)腸炎。
表2 兩組發(fā)生喂養(yǎng)不耐受(FI)事件的比較
2.3腸道菌群比較 研究共獲得來源于33例早產(chǎn)兒的糞便樣本55份。測序并經(jīng)質(zhì)控后,共獲得610 515條序列,有效序列為10 758(7 416,13 060)條/樣本。經(jīng)DADA2去噪后得到1 476個ASV,歸一化到3 180條序列后,保留55個樣本和1 379個ASV進行下游分析。根據(jù)細菌門水平(Phylum)分類展示,該階段早產(chǎn)兒輸血組與對照組總體構(gòu)成相似(圖1),其腸道菌群以厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)為主,并存在一定比例的放線菌門(Actinobacteria)及擬桿菌門(Bacteroidetes)細菌。在非輸血組,還觀察到少數(shù)個體腸道以浮霉菌門(Verrucomicrobia)為優(yōu)勢豐度菌。
注:Y,輸血組;N,對照組。
依據(jù)ASV水平的菌群多樣性分析,四類α多樣性指數(shù),無論是Chao1(反應(yīng)物種總數(shù))、observed otu(物種豐富度指數(shù))、PD_whole_tree(系統(tǒng)發(fā)育多樣性指數(shù))、Shannon(香農(nóng)指數(shù),同時反映物種豐富度及均勻度),兩組間差異均無統(tǒng)計學意義,見圖2A-D。在β多樣性分析中,依據(jù)Bray-Curtis距離(基于ASV的計數(shù)統(tǒng)計比較兩個群落微生物的組成差異)的PCA,輸血干預(yù)組與對照組呈區(qū)分趨勢,但P值為0.089,見圖2E。
注:Y,輸血組;N,對照組;A,Chao1;B,observed_otus;C,PD_whole_tree;D,Shannon;E,PCA。
在屬水平,發(fā)現(xiàn)兩組間的特定菌豐度差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見圖3。輸血組葡萄球菌屬(Staphylococcus)、寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas)顯著高于對照組;而腸球菌屬(Enterococcus)、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)及阿克曼氏菌(Akkermansia)則顯著下降。
本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),經(jīng)歷輸血事件早產(chǎn)兒治療結(jié)束后2周內(nèi),F(xiàn)I發(fā)生率顯著高于對照組。盡管樣本量較小,但本研究中對照組FI發(fā)生率與文獻報道一致[1-3],提示本研究結(jié)果相對可靠。既往研究主要關(guān)注輸血干預(yù)與新生兒壞死性小腸結(jié)腸炎發(fā)生率間關(guān)聯(lián),但二者間是否存在顯著關(guān)聯(lián),系統(tǒng)評價結(jié)果并不一致[6-7,10,14]。從FI發(fā)展為新生兒壞死性小腸結(jié)腸炎,存在復(fù)雜的外界環(huán)境(包括喂養(yǎng)、機械通氣、藥物等)及個體病理進程(缺氧、感染等)多因素影響[15]。本研究結(jié)果提示,以FI為首要終點事件,將更有利于揭示輸血事件與不良腸道事件間的潛在關(guān)聯(lián),從而為未來的臨床干預(yù)提供新線索。
盡管兩組間FI發(fā)生率存在顯著差異,但兩組間發(fā)生FI事件患兒的臨床表現(xiàn)并無差別,且兩組最終達到全胃腸內(nèi)喂養(yǎng)時間及住院時長差異均無統(tǒng)計學意義。該結(jié)果提示輸血事件并未導(dǎo)致更嚴重的FI,且對于病情的恢復(fù)及整體治療影響較小。其中一項潛在的原因是,本研究單位輸血治療時常規(guī)采取奶量減半喂養(yǎng)保護策略,可能減小了輸血對腸道的干擾。另外,本研究中部分早產(chǎn)兒由于住院時間不足4周而只留取到1份樣本,可能使結(jié)果產(chǎn)生一定的偏倚;同時,發(fā)生FI患兒均未發(fā)生壞死性小腸結(jié)腸炎,存在一定的幸存者偏倚。
注:Y,輸血組;N,對照組;Abundance,豐度。
本研究發(fā)現(xiàn),輸血組葡萄球菌屬、寡養(yǎng)單胞菌屬相對豐度增加,雙歧桿菌屬及腸球菌屬相對豐度減少。雙歧桿菌是健康嬰兒腸道主要優(yōu)勢菌,對腸道和宿主的發(fā)育具有重要作用[11];健康早產(chǎn)兒腸球菌的相對豐度顯著高于FI早產(chǎn)兒[16];葡萄球菌、寡養(yǎng)單胞菌與壞死性小腸結(jié)腸炎、敗血癥發(fā)病高度相關(guān)[17]。絕大多數(shù)早產(chǎn)兒均接受多種抗菌藥物治療,對腸道菌群整體產(chǎn)生顯著影響。因此,輸血組與對照組間α及β多樣性差異均不顯著。但兩組間差異菌與既往報道的FI及壞死性小腸結(jié)腸炎存在關(guān)聯(lián),提示腸道菌群在上述疾病中可能具有潛在的因果作用,其具體機制值得深入探討。
本研究不足之處在于樣本量偏小,未能對是否紅細胞輸注、輸血量、輸血次數(shù)等進行進一步的亞組分析,無法為腸損傷機制研究提供線索。從菌群角度,進一步擴大樣本量,將有助于探明輸血是否可以改變腸道菌群β多樣性,并為探明特定腸道菌作為FI乃至壞死性小腸結(jié)腸炎風險預(yù)測新型標志物提供可能。