多技術(shù)聯(lián)合檢測產(chǎn)前9p三體胎兒1例

邱顯榮 申 瑤

1.珠海市醫(yī)學(xué)遺傳研究所 珠海市婦幼保健院檢驗(yàn)科，廣東珠海 519001；2.廣東省中醫(yī)院 珠海醫(yī)院檢驗(yàn)科，廣東珠海 519001

9p三體綜合征（duplicationg 9p syndrome）由Rethor等[1]于1970年首次報(bào)道。1975年Centerwall等[2]確定了9p三體綜合征的畸變類型，通常是親代9號(hào)染色體與其他染色體的平衡易位所致子代染色體的部分三體表現(xiàn)，也有罕見的配子發(fā)生期不明原因的新發(fā)突變所致[3]。9p三體綜合征是活產(chǎn)嬰兒中僅次于21、18、13三體的較為常見的染色體異常，一種可能的解釋是這些染色體和9p一樣，基因相對(duì)貧乏[4-5]。迄今為止，已經(jīng)報(bào)道的9p三體綜合征200余例[6]。染色體微陣列分析技術(shù)作為一種新型的分子遺傳學(xué)分析方法，能夠檢出包括三體、衍生染色體、微缺失、微重復(fù)、標(biāo)記染色體等異常的染色體。本研究中，應(yīng)用細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)聯(lián)合CMA技術(shù)對(duì)1例無創(chuàng)提示9號(hào)染色體異常且超聲心臟發(fā)育異常的胎兒進(jìn)行遺傳學(xué)分析，明確患兒異常染色體的來源及遺傳學(xué)病因，為臨床診療提供了依據(jù)?，F(xiàn)報(bào)道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料

孕婦夫婦年齡分別為37歲和32歲，非近親。既往體健，否認(rèn)家族遺傳病史。孕婦懷孕兩次，曾剖宮產(chǎn)一女嬰，健康。孕12+4周時(shí)NIPT報(bào)告21、18、13三體低風(fēng)險(xiǎn)，但提示9號(hào)染色體異常。孕23+4周B超示胎兒宮內(nèi)發(fā)育遲緩、室間隔缺損、單臍動(dòng)脈，不排除多囊腎、羊水少。孕婦在知情同意下行羊水穿刺術(shù)，抽取羊水同時(shí)做G顯帶核型分析和基因芯片檢查。在得知核型分析和芯片結(jié)果后，孕婦和家屬選擇終止妊娠，引產(chǎn)一女嬰。對(duì)孕婦及其丈夫抽外周血行G顯帶核型分析。

1.2 方法

1.2.1 NIPT評(píng)估胎兒常見染色體非整倍體患病風(fēng)險(xiǎn) 用EDTA抗凝的專用K管抽取孕婦外周血5 ml，2～8℃低溫條件下離心分離血漿，-70℃以下超低溫保存。采用深圳華大基因公司生產(chǎn)的“磁珠法DNA提取試劑盒”抽提含有胎兒游離DNA的孕婦血漿DNA，使用胎兒染色體非整倍體（T21、T18、T13）檢測試劑盒（華大基因）對(duì)母血游離DNA進(jìn)行特定序列接頭連接、擴(kuò)增及上機(jī)測序，然后通過與陽性判斷值比較進(jìn)行胎兒21、18、13號(hào)染色體非整倍體情況的判斷。應(yīng)用BGISEQ-500基因測序儀（華大基因）進(jìn)行測序，測序方法為聯(lián)合探針錨定聚合測序法，測序深度為0.1×。

1.2.2 G顯帶核型分析 對(duì)胎兒取20 ml羊水做常規(guī)G顯帶核型分析。取孕夫婦外周血各2 ml均肝素鈉抗凝處理，接種于廣州和能生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)的無血清外周血培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng)。69～72 h收獲，常規(guī)操作制備染色體，G 顯帶處理。非嵌合體計(jì)數(shù)20個(gè)核型，嵌合體計(jì)數(shù)100個(gè)核型。染色體核型參照人類細(xì)胞遺傳學(xué)國際命名體制（ISCN 2016）描述。

1.2.3 染色體微陣列分析（chromosomal microarray analysis，CMA） 抽取羊水10 ml，采用QIAamp DNA Mini試劑盒（德國QIAGEN公司）提取和純化全基因組DNA，應(yīng)用Affymetrix 750K試劑盒（美國ThermoFisher 公司）對(duì)DNA進(jìn)行酶切、連接、PCR擴(kuò)增、純化、片段化、標(biāo)記、雜交等處理，最后應(yīng)用配套的ChAS軟件分析染色體的拷貝數(shù)變異（copy number variation，CNV）。CNV的分析標(biāo)準(zhǔn)是以50個(gè)標(biāo)記、100 kb為cut-off值進(jìn)行分析；雜合性缺失（loss of heterozygosity，LOH）或純合狀態(tài)（regions of homozygosity，ROH）以5 Mb的分辨率進(jìn)行分析，包含明確印記致病基因的ROH區(qū)域報(bào)告標(biāo)準(zhǔn)染色體片段≥5 Mb，不包含明確印記致病基因的ROH區(qū)域報(bào)告片段為染色體片段≥10 Mb。

2 結(jié)果

2.1 NIPT檢測結(jié)果

胎兒顯示21、18、13三體篩查低風(fēng)險(xiǎn)，但9號(hào)染色體異常，見圖1。

圖1 胎兒羊水NIPT結(jié)果示意圖：胎兒9號(hào)染色體拷貝數(shù)增加

2.2 核型分析結(jié)果

胎兒核型為：47，Xn，+9[82]/47，Xn，+del（9）（q13qter）[14]/46，Xn[4]，胎兒父母的核型結(jié)果未見異常，見圖2。

圖2 核型分析結(jié)果：47，Xn，+9[82]/47，Xn，+del（9）（q13qter）[14]/46，Xn[4]

2.3 CMA檢測結(jié)果

對(duì)胎兒行羊水CMA分析，胎兒在chr9p24.3q34.3位置檢出一段約137.5Mb的3拷貝重復(fù)，檢測結(jié)果為arr[GRCH37]9p24.3q34.3（208454-141018648）x3，共 涉 及DOCK8、KANAK1、DMRT1等570個(gè)OMIM基因，見圖3、表1。

表1 CMA檢測結(jié)果

圖3 胎兒CMA分析結(jié)果：羊水WGV示意圖，箭頭所示為重復(fù)區(qū)域

3 討論

9p三體綜合征是一種臨床上很好描述的常染色體綜合征，具有隨年齡增長而變得更明顯的顱面畸形的特征[7]。該綜合征患者通常表現(xiàn)為生長發(fā)育遲緩、智力嚴(yán)重缺陷、具有眼間距寬、眼裂和嘴角下斜、杯狀耳等頭面部異常[8]、先天性心臟病、中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常、腎臟異常、骨骼畸形、泌尿生殖器異常等[9-10]。

9號(hào)染色體p22p24區(qū)是9p三體綜合征的關(guān)鍵區(qū)域。謝娟等[11]認(rèn)為9p22.1p22.3區(qū)段拷貝數(shù)的重復(fù)會(huì)引起典型顱面部異常。而9p22p24區(qū)段的DOCK8、KANK1、DMRT1、VLOLR基因明確與多種疾病及智力低下有關(guān)。DOCK8基因?yàn)橹圃霥OCK8家族的蛋白質(zhì)提供了指令，DOCK8蛋白在免疫系統(tǒng)的細(xì)胞中含量最多。這種蛋白在多種類型的免疫系統(tǒng)細(xì)胞，如T細(xì)胞、B細(xì)胞的生存和功能中起著至關(guān)重要作用。DOCK8基因的突變會(huì)導(dǎo)致DOCK8免疫缺陷綜合征。它是一種免疫系統(tǒng)疾病，可導(dǎo)致反復(fù)嚴(yán)重的皮膚和呼吸道感染[12-13]。KANK1的拷貝數(shù)變異與中樞神經(jīng)系統(tǒng)缺陷有關(guān)。Boxill等[14]認(rèn)為9p區(qū)域包含一個(gè)或多個(gè)涉及脈絡(luò)叢生長調(diào)控的基因，與9p三體相比，9p四體患者似乎更容易發(fā)生脈絡(luò)叢增生（choroid plexus hyperplasia，CPH）。二者最常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常是胼胝體異常和腦積水。DMRT1基因?qū)儆谝粋€(gè)鋅指樣的DNA結(jié)合序列（DM域），DM域是脊椎動(dòng)物性別決定途徑中一個(gè)古老而保守的組成部分。當(dāng)該基因CNV異常時(shí)，就會(huì)出現(xiàn)睪丸發(fā)育缺陷和XY女性化。Verheij等[15]認(rèn)為9p染色體上某些基因的超表達(dá)可能導(dǎo)致睪丸功能低下和泌尿生殖系統(tǒng)異常。丁宇等[16]認(rèn)為9p21.2p21.3區(qū)段重復(fù)與語言發(fā)育遲滯有關(guān)，而位于該區(qū)段的VLDLR基因拷貝數(shù)的改變可調(diào)節(jié)突觸的可塑性并對(duì)海馬的特殊學(xué)習(xí)和記憶功能發(fā)揮重要作用。從而影響智力和骨骼的發(fā)育。本研究中胎兒的雙親染色體正常，其核型中的9p多體屬于新發(fā)突變。因其覆蓋了9p三體綜合征的關(guān)鍵區(qū)域，故會(huì)呈現(xiàn)出與之相關(guān)的典型癥狀，是其發(fā)病的真正原因。

綜上，準(zhǔn)確和快速的產(chǎn)前基因檢測可以讓父母在知情的情況下做出決定。對(duì)正在進(jìn)行介入性產(chǎn)前診斷和基因檢測的父母進(jìn)行遺傳咨詢時(shí)，除了常見的染色體畸變外，還應(yīng)包括罕見的，但在臨床上同樣重要的相關(guān)基因組。染色體微陣列分析技術(shù)在臨床中的應(yīng)用將會(huì)明顯提高不明來源復(fù)雜染色體畸變的診斷效率，為病因的解釋、個(gè)體化的診療和遺傳咨詢提供科學(xué)合理的遺傳學(xué)依據(jù)。