胡雪影,張玲,李垚,陳櫻瑋,趙娟娟
宿州市疾病預防控制中心,安徽 宿州 234000
新型冠狀病毒肺炎(以下簡稱新冠肺炎)是由新型冠狀病毒感染引起的急性呼吸道傳染病,臨床主要表現(xiàn)為發(fā)熱、干咳、乏力等癥狀,后期可加速進展為急性呼吸窘迫綜合征、膿毒癥休克、出凝血功能障礙等多器官衰竭[1]。新型冠狀病毒屬于β冠狀病毒,主要經(jīng)呼吸道飛沫傳播和接觸傳播,在一定條件下也存在經(jīng)氣溶膠傳播的可能,另外也有報道認為該病毒存在糞-口傳播的可能[2-3]。目前,實時熒光RT-PCR檢測病毒核酸仍是臨床確診的金標準[4]。2020年1月24日,宿州市報告了該市首例新冠肺炎病例,為了解新冠肺炎不同防控階段核酸檢測結果的差異,本文對宿州市新冠肺炎流行情況及其核酸檢測情況進行分析,報道如下。
1.1樣本來源 2020年1月22日—2月29日,采集有湖北省旅居史人員、宿州市新冠肺炎各定點醫(yī)療機構發(fā)熱門診留觀患者以及新冠肺炎確診病例和疑似病例密切接觸者的咽拭子和痰液。各類樣本由縣(區(qū))疾病預防控制中心按照實驗室生物安全相關要求運送至宿州市疾病預防控制中心實驗室進行檢測。
1.2資料來源 病例個案信息來自中國疾病預防控制信息系統(tǒng),新冠病毒核酸檢測數(shù)據(jù)來自宿州市疾病預防控制中心實驗室。
1.3防控階段 根據(jù)病例的流行病學特征以及采取的防控措施,宿州市新冠肺炎疫情大致分為四個階段:第一階段是2020年1月22日—28日,以輸入性病例及其家庭內密切接觸者感染為主,該階段檢測對象主要是有癥狀的湖北省旅居史人群及密切接觸者;第二階段是2020年1月29日—2月7日,轄區(qū)出現(xiàn)病例所在家庭內、外的密切接觸者聚集性感染,該階段檢測對象主要包括有湖北省旅居史人員、密切接觸者和部分發(fā)熱門診留觀人員等重點人群;第三階段是2020年2月8日—16日,病例主要是有湖北省旅居史人員及其密切接觸者,此階段主要采取擴大人群檢測策略;第四階段是2020年2月17日—29日,除1例湖北省武漢市輸入性病例外,無新增本地確診病例,此階段繼續(xù)采取擴大人群篩查策略。
1.4檢測方法 采用實時熒光RT-PCR技術檢測樣本中的新冠病毒核酸。按照新型冠狀病毒感染的肺炎實驗室檢測技術指南(第二版)[5]推薦,選用針對新型冠狀病毒的開放讀碼框、核殼蛋白基因區(qū)域的引物和探針。嚴格按照核酸檢測試劑盒的說明書進行操作和結果判讀。
1.5主要試劑與儀器 采用上海伯杰BG-Flex-48核酸提取儀和臺灣圓點全自動核酸提取儀進行核酸提取。采用ABI公司7500 PCR儀及賽默飛Q7 PCR儀進行產(chǎn)物擴增分析。新冠病毒核酸檢測試劑盒購自上海捷諾及伯杰生物醫(yī)療科技有限公司,所有檢測試劑均在有效期內使用。
1.6統(tǒng)計分析 使用Excel 2010錄入數(shù)據(jù)并進行統(tǒng)計分析,描述不同防控階段、不同檢測人群、不同類型樣本的實驗室檢測結果。
2.1一般情況 2020年1月22日—2月29日,共檢測704人,檢出新冠病毒核酸陽性者46例,陽性檢出率為6.53%(46/704);累計采集1 182份樣本,新冠病毒核酸檢測陽性樣本59份,樣本陽性檢出率4.99%(59/1 182),其中咽拭子樣本檢測陽性率為4.46%(45/1 010),痰液樣本檢測陽性率為8.14%(14/172)。46例新冠病毒核酸陽性者(以下統(tǒng)稱為感染者)中,確診病例41例,無癥狀感染者5例;湖北輸入性感染者27例,本地感染者19例;男性25例,女性21例,男女性別比為1.19∶1;平均年齡(37.52±15.22)歲,其中最大67歲,最小9歲。
2.2新冠病毒核酸檢測陽性病例數(shù)時間分布 宿州市從2020年1月24日首次檢出新冠病毒核酸陽性樣本開始,1月26日、1月31日及2月10日出現(xiàn)病例高峰,之后除了2月24日一例輸入性病例檢測陽性之外,未再檢出陽性樣本。見圖1。
2.3不同防控階段新冠病毒核酸檢測情況 宿州市自開展新冠病毒核酸檢測以來,新冠病毒核酸檢測陽性率最高的階段是在第一階段(14.81%,12/81),其次是第二階段(6.17%,24/389)和第三階段(5.71%,22/385),最低的是第四階段(0.31%,1/327)。見表1。
表1 宿州市不同防控階段新冠病毒核酸檢測情況
2.4不同重點人群新冠病毒核酸檢測情況 有湖北省旅居史人員共檢測306份樣本,核酸檢測陽性率為10.13%;密切接觸者共檢測727份樣本,核酸檢測陽性率為3.85%;本地發(fā)熱門診留觀患者的149份樣本中均未檢出新冠病毒核酸陽性。見表2。
表2 宿州市不同防控階段重點人群新冠病毒核酸檢測情況
2.5感染者檢出次數(shù)及樣本類型 46例感染者中,82.61%(38/46)的感染者在首次采樣檢測中檢出新冠病毒核酸陽性,10.87%(5/46)的感染者在第二次采樣檢測中檢出陽性,有6.52%(3/46)的感染者經(jīng)過3~4次采樣檢出陽性;37例感染者咽拭子樣本核酸檢測陽性,9例感染者痰液樣本核酸檢測陽性。
從宿州市疫情不同防控階段檢測結果來看,新冠病毒核酸檢測陽性率最高的是第一階段,樣本陽性檢出率達14.81%,該階段有癥狀的有湖北省旅居史人員和密切接觸者樣本陽性檢出率分別達到16.32%和16.00%,原因一方面是春節(jié)前湖北返宿、來宿人員增加并陸續(xù)發(fā)病,另一方面是密切接觸者居家隔離、自我管控不到位,導致部分密切接觸者在居家隔離的過程中出現(xiàn)再傳播,因此該階段感染的密切接觸者主要是家庭內成員。其次是第二階段,核酸陽性率達6.17%,檢測對象主要包括有湖北省旅居史人員、密切接觸者和部分發(fā)熱門診留觀人員等重點人群,樣本陽性檢出率較第一階段有所下降。該階段對重點人群落實集中隔離措施,盡管出現(xiàn)了本地家庭內、外傳播的病例,但最大程度降低了再傳播的風險。疫情防控第三階段核酸陽性率達5.71%,此階段主要采取擴大檢測范圍的策略,把所有可能有感染風險的人群均納入檢測范圍,切實做到“早發(fā)現(xiàn)、早報告、早隔離、早診斷、早治療”;尤其把“湖北武漢等疫情較重地區(qū)來宿正在居家觀察但未滿8天的人員”和“2月3日以來發(fā)熱就診病人凡有湖北武漢等重點地區(qū)旅居史的人員”納入擴大檢測范圍后,有湖北省旅居史人群的樣本陽性檢出率(14.52%)較第二階段(7.74%)有所上升,有助于及時發(fā)現(xiàn)風險,避免疫情擴散。疫情第四階段基于前期對各類重點人群的擴大檢測、限制人員流動、關停部分公共場所、加強個人防護等措施的落實,除2月24日有1例武漢返宿的輸入性病例外,未再檢出陽性,提示宿州市在疫情不同發(fā)展階段,及時調整核酸檢測策略并制定針對性防控措施是科學有效的。
從不同人群樣本的新冠病毒核酸檢測情況來看,有湖北省旅居史人員樣本陽性檢出率最高,其次是密切接觸者,而本地發(fā)熱門診留觀患者的樣本中未檢出新冠病毒核酸,提示宿州市新冠患者主要以有湖北尤其武漢旅居史的人員及其密切接觸者為主。另外,有6.52%(3/46)的感染者經(jīng)過3~4次采樣才檢出陽性,這些感染者臨床癥狀不典型,但均有確切的湖北武漢旅居史等流行病學史,針對這類人群,宿州市在國家方案要求至少間隔24 h再次進行1次檢測的基礎上,增加采樣檢測次數(shù),提高檢出率。國內也曾報道經(jīng)7次核酸檢測才檢出陽性的病例[6],原因可能主要與感染者機體內的病毒載量相關,潛伏期病毒載量低,檢測假陰性高,多數(shù)病例需要多次檢測才能檢出陽性[7-8];也可能與標本采集、核酸提取過程、試劑盒保存和運輸?shù)拳h(huán)節(jié)有關[9],實驗室診斷只能作為新冠病毒檢測的重要手段之一,不能孤立地據(jù)此進行感染的排查[10]。因此,對于有流行病學史的人員,即便臨床癥狀不典型,也不能放松警惕,可增加采樣次數(shù)或增加檢測樣本類型。
宿州市在新冠肺炎疫情不同防控階段采取了不同的核酸檢測策略,新冠病毒核酸陽性檢出率也明顯不同。在疫情發(fā)展的初始階段檢測的主要是有癥狀的重點人群,隨著對新冠病毒和新冠肺炎疾病認識的不斷深入,擴大檢測范圍覆蓋到各類有感染風險的人群。雖然新冠病毒核酸陽性檢出率呈逐步下降趨勢,但宿州市把有潛在傳播風險的人群均納入管控范圍中,實施集中隔離醫(yī)學觀察,最大限度降低疾病傳播的風險,有效控制了疫情。