黃金鳳,李 波,白 瑩,馮禮燊,李文笙,孫彩云
(中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/有害生物控制與資源利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/廣東省水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物良種繁育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/廣東省重要經(jīng)濟(jì)魚類健康養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心,廣東 廣州 510006)
【研究意義】幾丁質(zhì)是由β-1,4 糖苷鍵連接N-乙酰氨基葡萄糖的一種線性多糖,是自然界中唯一存在的陽離子型可食用纖維。幾丁質(zhì)貯量十分豐富,僅海洋生物每年所合成的幾丁質(zhì)已超過10 億t,是自然界中貯量?jī)H次于纖維素的第二大天然多糖[1]。幾丁質(zhì)多存在于真菌細(xì)胞壁、昆蟲消化道和多數(shù)節(jié)肢動(dòng)物的外骨骼中,因此研究關(guān)于降解幾丁質(zhì)的酶具有重要意義。幾丁質(zhì)酶(EC 3.2.1.14)是一種糖苷水解酶,催化N-乙酰氨基葡萄糖從幾丁質(zhì)上脫去,從而降解幾丁質(zhì)。幾丁質(zhì)酶根據(jù)其催化結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列相似性主要分為糖基水解酶(GH)家族18、19、23 和48,該酶在自然界分布廣泛,在細(xì)菌到高等植物和動(dòng)物等生物體中均有分布,植物的幾丁質(zhì)酶屬于GH19,魚類的幾丁質(zhì)酶均為GH18,GH23 和GH48 分別在細(xì)菌和真菌中分布[2-4]。幾丁質(zhì)酶具有多種生理作用,如促進(jìn)甲殼類和昆蟲類蛻皮,降解魚類胃腸道里的蝦蟹殼幫助消化,在植物里則參與抵抗含有幾丁質(zhì)的致病菌[4],在魚皮膚粘液中抵抗寄生蟲等[5]。
【前人研究進(jìn)展】魚類中的幾丁質(zhì)酶最早在海鯛的胃腸道中被發(fā)現(xiàn)[6]。隨著基因組測(cè)序的快速發(fā)展,已研究獲得斑馬魚、日本比目魚等多種魚類的幾丁質(zhì)酶序列[7]。肉食性海水魚類的天然食譜中含有豐富的幾丁質(zhì),如含有高結(jié)晶度α-幾丁質(zhì)的蝦蟹和浮游動(dòng)物,含有低結(jié)晶度β-幾丁質(zhì)的烏賊等[4,8]。研究表明,魚類消化道組織具有幾丁質(zhì)降解活性,其中胃中的幾丁質(zhì)酶活性最高,降解幾丁質(zhì)寡糖的活性比其他組織高,如白姑魚、日本鯖、斑鱾、琉球棘角魚和梭魚等。而降解單糖的β-N-乙酰氨基葡萄糖酶的活性在各組織中廣泛分布,而非局限于消化道。不同的幾丁質(zhì)降解酶的分布很可能取決于該魚類品種的飲食習(xí)慣和棲息地位置[4,9]。已有研究表明,從魚胃分離獲得的幾丁質(zhì)酶約38~62 ku,與植物幾丁質(zhì)酶大?。?4.5~29 ku)有明顯差異。在實(shí)驗(yàn)室條件下,魚胃的丁質(zhì)酶降解幾丁質(zhì)低聚糖的最適pH 值為2.0~5.0,降解幾丁質(zhì)多聚糖的最適pH 值為1.5~5.5。這表明魚類胃中的幾丁質(zhì)酶適應(yīng)胃組織的酸性環(huán)境來降解幾丁質(zhì)底物[4]。
【本研究切入點(diǎn)】迄今為止,有關(guān)羅非魚幾丁質(zhì)酶的研究報(bào)道僅有1 篇,它揭示了羅非魚血清、胃和腸中存在幾丁質(zhì)酶降解活性,能夠降解4-甲基傘形酮-β-D-N,N-二乙酰殼三糖〔4MU-(GlcNAc)2〕或4-甲基傘形酮-β-D-N,N,N-三乙酰殼三糖〔4MU-(GlcNAc)3〕,其中血清中的幾丁質(zhì)酶具有最高的比活性[10]。但目前仍未見關(guān)于羅非魚幾丁質(zhì)酶序列及其功能的報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究克隆了吉富羅非魚3 種預(yù)測(cè)的酸性幾丁質(zhì)酶,并對(duì)克隆結(jié)果進(jìn)行了進(jìn)化樹分析,同時(shí)檢測(cè)幾丁質(zhì)酶在羅非魚中的組織分布,以期獲得相關(guān)功能信息。提取羅非魚胃組織蛋白并純化其中的幾丁質(zhì)酶,測(cè)定酶活,比較羅非魚和其他魚類幾丁質(zhì)酶的活性,為羅非魚幾丁質(zhì)酶的深入研究奠定基礎(chǔ)。
本研究所用的吉富羅非魚(70~100 g)約為30 尾,均為雄性,購(gòu)自廣東省國(guó)家羅非魚良種場(chǎng)。試驗(yàn)前,供試羅非魚在12 h ∶12 h 黑暗光照循環(huán)條件下,室溫循環(huán)淡水中馴化1 周,每天9:30 和16:30進(jìn)行飽食投喂。采樣前24 h內(nèi)對(duì)羅非魚停食,在第2 天早上進(jìn)行取樣。
主要試劑:總RNA 提取試劑Trizol Reagent、反轉(zhuǎn)錄試劑盒M-MLV First Strand cDNA Synthesis Kit 購(gòu)自英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司;聚合酶Blend taq plus 和連接試劑Ligation High,購(gòu)自東洋紡(上海)生物科技有限公司;DNase Ⅰ 購(gòu)自美國(guó)紐英倫生物技術(shù)公司;E.Z.N.A? Gel Extraction Kit、E.Z.N.A? Plasmid Extraction Kit,購(gòu)自O(shè)mega Bio-Tek 公司;SYBR? Green Real-time PCR Master Mix 試劑盒、100 bp DNA Ladder,購(gòu)自廣州東盛生物科技有限公司;DEPC、X-gal 和IPTG 購(gòu)自生工生物工程(上海)公司。引物由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成。所用大腸桿菌DH5α 和pUCM-T載體購(gòu)自英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司,感受態(tài)細(xì)菌則由本實(shí)驗(yàn)室制備。其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
主要儀器:凝膠成像分析系統(tǒng)和CFX Connect熒光定量PCR 儀購(gòu)于伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品有限公司,VeritiTM PCR 儀、高速冷凍離心機(jī)5810R 和移液槍購(gòu)于德國(guó)艾本德股份有限公司,核酸蛋白測(cè)定儀NanoDrop2000 購(gòu)于美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)公司,三洋制冰機(jī)購(gòu)于日本SANYO 公司,微波爐購(gòu)于廣東美的集團(tuán)有限公司。
1.2.1 羅非魚tChit1a、tChi3和tChit基因cDNA 的克隆 根據(jù)NCBI 的尼羅羅非魚基因組中3 種預(yù)測(cè)的酸性幾丁質(zhì)酶序列tChit1a(XM_039611991.1)、tChi3(XM_005464320.4)和tChit(XM_003459030.3),采用Primer 5 軟件設(shè)計(jì)特異性引物(表1)。
用丁香酚將羅非魚麻醉,斷頭處死,取出胃、腸用DEPC 水清洗,按照說明書用Trizol Reagent 進(jìn)行總RNA 提取,用DNase Ⅰ去除基因組DNA,用反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄合成第一鏈cDNA,并以此為模板按照聚合酶Blend tap plus所要求的反應(yīng)條件進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,所用引物分別 為tChi1a-ORF-F/R、tChi3-ORF-F/R 和tChit-ORF-F/R(表1)。PCR 反應(yīng)程序均為:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s、56 ℃ 30 s、72 ℃ 45 s,40 個(gè)循環(huán);72 ℃ 7 min;4 ℃ 保存。對(duì)PCR 產(chǎn)物進(jìn)行膠回收,加入pUCM-T 載體和Ligation High 室溫孵育連接,然后通過熱激法轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α 中,陽性克隆經(jīng)菌落PCR 鑒定后,送至生工生物工程(上海)公司進(jìn)行測(cè)序。
表 1 羅非魚3 種幾丁質(zhì)酶tChit1a、tChi3 和tChit 的ORFs 克隆引物及組織分布研究引物Table 1 Primers used in cloning of ORFs and tissue distribution study of three chitinases tChit1a,tChi3 and tChit in tilapia
1.2.2 羅非魚tChit1a、tChi3和tChit基因序列的生物信息學(xué)分析 利用SignalP 5.0 尋找?guī)锥≠|(zhì)酶tChit1a、tChi3和tChit基因的信號(hào)肽(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)[11];利用ClustalW2軟件進(jìn)行氨基酸序列同源性分析(http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/)[12]。通過NCBI 在線網(wǎng)站進(jìn)行氨基酸序列相似度分析(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)[13];采 用MEGA6.0 軟 件Neighbor-Joining 法進(jìn)行進(jìn)化樹分析[14]。
1.2.3 羅非魚tChit1a、tChi3和tChit基因的mRNA 組織分布 用丁香酚麻醉羅非魚,斷頭處死,迅速取出端腦、中腦、小腦、延髓、脊髓、下丘、垂體、鰓、心臟、腎、脾、脂肪、肝、胃、前腸、中腸、后腸、白肌、紅肌和性腺等組織,放入RNase-free 的1.5 mL 離心管中,立即放入液氮,之后置于-80 ℃冰箱中貯藏。按照1.2.1 克隆步驟進(jìn)行總RNA 提取和反轉(zhuǎn)錄,以獲得的第一鏈cDNA 為模板,按照SYBR? Green 說明書進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR,所用引物為tChit1a-qt-F/R、tChi3-qt-F/R 和tChit-qt-F/R(表1)。PCR 反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃ 5 min;95 ℃ 15 s、56 ℃ 15 s、72 ℃ 30 s,40 個(gè)循環(huán);每個(gè)循環(huán)結(jié)束后在82 ℃收集熒光15 s;95 ℃ 10 s,然后以0.5 ℃/2 s 的遞增速度,65~95 ℃下進(jìn)行溫度梯度退火及收集熒光值。所測(cè)的值以18S rRNA 為內(nèi)參進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,2-ΔΔCt法分析數(shù)據(jù)。
1.2.4 羅非魚胃幾丁質(zhì)酶的純化 用丁香酚麻醉羅非魚,斷頭處死,取出其胃組織進(jìn)行清洗,剪下內(nèi)壁粘膜層置于PBS 緩沖液中破碎(70 Hz/ 120 s),隨后12 000 g 離心20 min 后收集上清用于純化。用幾丁質(zhì)樹脂制備重力柱,根據(jù)說明書清洗柱子,隨后將樣品過幾丁質(zhì)柱2 次,緩沖液清洗雜蛋白,然后加入洗脫液,關(guān)閉出樣口,4 ℃過夜。第2 天依次收集濾液,并進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定和Western blot 檢測(cè)。
1.2.5 SDS-PAGE及Western blot驗(yàn)證 制備12% SDS 聚丙烯酰胺凝膠,上樣后80 V 電泳30 min,120 V 電泳60 min。電泳結(jié)束,其中一塊PAGE膠用于G250 染色,另一塊PAGE 膠則按照正極-海綿-濾紙-NC 膜-PAGE 膠-濾紙-海綿-負(fù)極的順序夾緊,放在電泳槽中,裝置在冰浴中恒流200 mA 電泳60 min;電轉(zhuǎn)完的NC 膜用TBST緩沖液漂洗后浸入5%脫脂奶粉中封閉30 min;用1 ∶4 000 的斜帶石斑魚1 型幾丁質(zhì)酶抗體稀釋液孵育過夜,最后放入Goat anti-rabbit IgG按1∶5 000 稀釋液中孵育1 h,最后滴加ECL 熒光混合液到膜上,在化學(xué)發(fā)光儀中顯色并拍照記錄。
1.2.6 酶活測(cè)定 采用4-甲基傘形酮(4-MU)熒光底物測(cè)定酶活。酶活定義為:在37 ℃下,每分鐘釋放1 μmol 4-MU 所需要的酶量,用U 表示。比活力用每克蛋白所含的酶活力單位(U/mg)數(shù)表示。1 μg 待測(cè)樣品、不同pH 的PBS 緩沖液和底物0.5 mmol/L 的4-甲基傘形酮-β-D-N,N-二乙酰殼三糖〔4MU-(GlcNAc)2〕或4-甲基傘形酮-β-D-N,N,N-三乙酰殼三糖〔4MU-(GlcNAc)3〕,在37 ℃下孵育70 min,然后用 0.5 mol/L Na2CO3緩沖液終止反應(yīng)。用pH 7.4 的PBS 緩沖液配制梯度濃度0、0.1、0.2、0.4、0.6、0.8、1 nmol 的4-MU 標(biāo)準(zhǔn)樣品,而待測(cè)樣品是1 μg 純化產(chǎn)物與2.5 nmol 的4MU-(GlcNAc)2/3,標(biāo)準(zhǔn)樣品和待測(cè)樣品的反應(yīng)終體積均為100 μL,均在37 ℃、500 r/min 反應(yīng)70 min,最后在每孔加入 100 μL 的 0.5 mol/L 的Na2CO3溶液終止反應(yīng),用酶標(biāo)儀在激發(fā)波長(zhǎng)370 nm、發(fā)射波長(zhǎng)448 nm 下的熒光強(qiáng)度測(cè)定。
從吉富羅非魚胃中克隆得到tChit1a的ORF序列,全長(zhǎng)1 362 bp,編碼453 個(gè)氨基酸(AA);Expasy 在線軟件預(yù)測(cè)蛋白大小為50.03 ku,等電點(diǎn)為6.14;SignalP 在線軟件預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,前19 AA 為信號(hào)肽,緊接著為糖苷酶18 家族催化域343 AA,然后為43 AA 的連接區(qū)域,最后為48 AA 的幾丁質(zhì)結(jié)合域(圖1)。
從吉富羅非魚前腸和中腸中克隆得到tChi3的ORF 序 列,全 長(zhǎng)1 362 bp,編 碼453 AA;Expasy 在線軟件預(yù)測(cè)蛋白大小為50.03 ku,等電點(diǎn)為5.39;SignalP 在線軟件預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,前19 AA 為信號(hào)肽,緊接著為糖苷酶18 家族催化域343 AA,然后是43 AA 的連接區(qū)域,最后為48 AA 的幾丁質(zhì)結(jié)合域(圖1)。
圖1 羅非魚3 種幾丁質(zhì)酶氨基酸序列比較Fig.1 Comparison of amino acid sequences of three chitinases of tilapia
從吉富羅非魚中腸中克隆得到tChit的ORF序列,大小為1 422 bp,編碼473AA;Expasy 在線軟件預(yù)測(cè)蛋白大小為52.44 ku,等電點(diǎn)為5.68;SignalP 在線軟件預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,前20 AA 為信號(hào)肽,緊接著為糖苷酶18 家族催化域343 AA,然后為49 AA 的連接區(qū)域,最后為61 AA 的幾丁質(zhì)結(jié)合域(圖1)。
比對(duì)吉富羅非魚3 種幾丁質(zhì)酶序列,結(jié)果顯示tChit1a 與tChi3 的氨基酸序列相似度為83.66%,而tChit 與tChit1a、tChi3 的相似度則較低,分別為49.89%和50.11%。從結(jié)構(gòu)(圖1)來看,3 種幾丁質(zhì)酶結(jié)構(gòu)相似,在序列N 端具有信號(hào)肽和第18 家族糖苷催化域,C 端具有幾丁質(zhì)結(jié)合域,中間由連接域連接。其中,tChit1a 和tChi3 結(jié)構(gòu)相似,幾丁質(zhì)酶催化活性位點(diǎn)序列一致,而tChit的連接域長(zhǎng)于tChit1a 和tChi3 的連接域,有較多連續(xù)的蘇氨酸(Thr),且在催化活性位點(diǎn)有2 個(gè)氨基酸不一樣。
本研究供試羅非魚與其他物種的幾丁質(zhì)酶進(jìn)化樹分析結(jié)果(圖2)顯示,羅非魚3 種幾丁質(zhì)酶既不屬于哺乳動(dòng)物的酸性幾丁質(zhì)酶和幾丁三糖苷酶,也不屬于魚類酸性幾丁質(zhì)酶1 和2,可歸類為魚類三型幾丁質(zhì)酶,即非酸性幾丁質(zhì)酶。
圖2 羅非魚與其他物種的幾丁質(zhì)酶進(jìn)化樹分析Fig.2 Phylogenetic tree analysis of chitinases among tilapia and other species
3 種幾丁質(zhì)酶在羅非魚不同組織中的表達(dá)結(jié)果顯示,tChit1a 在中腸的表達(dá)量最高,其次是前腸(圖3A);而tChi3 在前腸的表達(dá)量最高,其次是中腸(圖3B);tChit 主要在中腸后部表達(dá)(圖3C)??梢姡_非魚3 種幾丁質(zhì)酶均主要在腸道中表達(dá),在其他組織中表達(dá)量非常低。
圖3 幾丁質(zhì)酶tChit1a、tChi3 和tChit mRNA 在羅非魚不同組織中的分布Fig.3 Distribution of tChit1a,tChi3 and tChit in different tissues of tilapia
利用幾丁質(zhì)樹脂純化羅非魚胃幾丁質(zhì)酶,SDS-PAGE 膠在40 ku 附近有兩條明顯條帶,50 ku 附近沒有明顯條帶(圖4A)。本研究所克隆獲得的3 種幾丁質(zhì)酶tChit1a、tChi3 和tChit 預(yù)測(cè)的成熟肽大小分別為48.01、48.11、50.425 ku,但Western blot 驗(yàn)證未在預(yù)測(cè)大小附近發(fā)現(xiàn)明顯條帶(圖4B)。用實(shí)驗(yàn)室前期制備的斜帶石斑魚1型幾丁質(zhì)酶多克隆抗體檢測(cè),同樣沒有檢測(cè)到同源性高的條帶。
圖4 羅非魚胃幾丁質(zhì)酶的純化結(jié)果Fig.4 Purification of chitinases extracted from the stomach of tilapia
用4-MU法檢測(cè)純化產(chǎn)物的幾丁質(zhì)酶活性,結(jié)果如圖5所示,純化產(chǎn)物的幾丁質(zhì)降解酶活性為弱酸性,在pH 4~7之間活性較高,最適pH值為5.0。1 μg純化產(chǎn)物與2.5 nmol的4MU-(GlcNAc)2/3反應(yīng)70 min,在最適pH值下,降解4MU-(GlcNAc)2的酶活為1.73 U/g,降解4MU-(GlcNAc)3的酶活為4.89 U/g。
本研究從吉富羅非魚中克隆獲得3 種幾丁質(zhì) 酶tChit1a、tChi3和tChit的ORF,這3 種 幾丁質(zhì)酶主要分布于中腸和前腸。tChit1a、tChi3和tChit 結(jié)構(gòu)相似,均屬于18 家族幾丁質(zhì)酶,預(yù)測(cè)的成熟肽大小分別為48.01、48.11、50.425 ku。其中tChit1a 和tChi3 的全長(zhǎng)氨基酸序列相似性較高,達(dá)83.66%,催化活性位點(diǎn)序列一致,而tChit 在該位點(diǎn)與它們則有兩個(gè)氨基酸差異,表明tChit1a 和tChi3 親緣關(guān)系更近。進(jìn)化樹分析表明,3 種幾丁質(zhì)酶不屬于魚類酸性幾丁質(zhì)酶-1(AFCase-1)和魚類酸性幾丁質(zhì)酶-2(AFCase-2),而與魚類幾丁質(zhì)酶-3(FCase-3)親緣關(guān)系更近。其中tChit 與金槍魚幾丁質(zhì)酶3、比目魚幾丁質(zhì)酶3 和虹鱒幾丁質(zhì)酶聚成一起,而tChit1a 和tChi3 則聚成另一分支,說明它們親緣關(guān)系較近。為更有效降解食物中的幾丁質(zhì),硬骨魚魚類胃中表達(dá)兩種不同的幾丁質(zhì)酶,即AFCase-1 和AFCase-2,它們具有不同A:12% SDS-PAGE;B:Western blot,一抗:斜帶石斑魚1 型幾丁質(zhì)酶多克隆抗體(1 ∶4 000)M:Marker;1:純化樣品;箭頭指示克隆獲得的幾丁質(zhì)酶預(yù)測(cè)大小位置
A:12% SDS-PAGE;B:Western blot by using polyclonal anti-Chitinase 1 ofEpinephelus lanceolatus(1 ∶4 000)M:Marker;1:Purified product;Arrowhead showed the predicted protein of tChit1a,tChi3 and tChit的降解模式,AFCase-1 優(yōu)先水解GlcNAc 鏈的非還原端的第二糖苷鍵,而AFCase-2 優(yōu)先水解第三糖苷鍵[15]。但關(guān)于FCase-3 的研究較少。在褐菖鲉肝臟和腎臟表達(dá)的一種幾丁質(zhì)酶屬于FCase-3[16]。有關(guān)FCase-3 的降解特性還沒有報(bào)道。此外,羅非魚3 種幾丁質(zhì)酶的等電點(diǎn)均在5~6.5 間,略小于7.0,說明這3 種酶均偏中性,推測(cè)它們發(fā)揮催化作用的環(huán)境pH 也偏中性,具體功能需要進(jìn)一步探索。此外,為繼續(xù)探索羅非魚酸性幾丁質(zhì)酶,本研究分析了來源于NCBI 的尼羅羅非魚基因組注釋的另外12 種羅非魚幾丁質(zhì)酶,包 括XM_003440467.5、XM_003459039.4、X M_0 1 3 2 6 6 3 5 4.2、X M_0 1 9 3 4 9 7 5 6.2、X M_0 2 5 9 0 1 8 9 2.1、X M_0 2 5 9 0 1 8 9 1.1、X M_0 2 5 9 0 1 8 9 0.1、X M_0 1 9 3 4 9 7 5 0.2、X M_0 1 9 3 4 9 7 4 9.2、X M_0 0 5 4 4 8 5 6 1.3、XM_019355318.2 和XM_003459030.3,進(jìn)化分析結(jié)果顯示,它們不屬于AFCase-1 和AFCase-2,均歸類為FCase-3。
研究表明,tChit、tChit1a 和tChi3 主要在羅非魚前腸和中腸表達(dá),在胃中的表達(dá)量相對(duì)較低。其他物種研究表明,大菱鲆的3 種幾丁質(zhì)酶在腸道高表達(dá),其次是腦、皮膚和脾臟[17];而日本沙丁魚幾丁質(zhì)酶的高表達(dá)組織是性腺[15];褐菖鲉幾丁質(zhì)酶主要在肝和腎臟中表達(dá)[16]。不同的幾丁質(zhì)酶同工酶可能發(fā)揮不同的作用,包括免疫、消化和蛻皮等[4,18]。本研究中,tChit、tChit1a 和tChi3 幾丁質(zhì)酶均在腸道高表達(dá),因此,推測(cè)這3種幾丁質(zhì)酶可能主要將上游進(jìn)行了部分分解的幾丁質(zhì)寡糖再進(jìn)一步水解,從而幫助機(jī)體消化吸收幾丁質(zhì)。
為了解羅非魚是否存在高活性的酸性幾丁質(zhì)酶,本研究通過純化胃蛋白以期獲得酸性幾丁質(zhì)酶。已有多種具有活性的幾丁質(zhì)酶在魚類胃中分離出來,且有多種同工酶,例如,在白姑魚的胃組織中純化獲得兩種大小分別為42、56 ku 的幾丁質(zhì)酶[19-20];在褐菖鲉胃中發(fā)現(xiàn)3 種大小分別為46、52、56 ku 的幾丁質(zhì)酶[21];在日本沙丁魚胃中純化得到大小為45、56 ku 的幾丁質(zhì)酶[15]。在六線魚胃組織中純化出47、51、62 ku 等3 種幾丁質(zhì)酶[22]。這些純化獲得的幾丁質(zhì)酶具有較高的酶活性,能夠降解pNP-(GlcNAc)n,推測(cè)幾丁質(zhì)酶活性與這些魚類棲息地和食物來源有關(guān),它們均以海洋富含幾丁質(zhì)的貝類、甲殼類或浮游生物為食,胃組織中高活性的幾丁質(zhì)酶有助于它們消化食物中的幾丁質(zhì)。幾丁質(zhì)酶存在于許多魚類的胃中,但并不局限于胃組織,在其他組織中同樣發(fā)現(xiàn)幾丁質(zhì)酶的表達(dá)和酶活性,例如在褐菖鲉腎臟中發(fā)現(xiàn)幾丁質(zhì)酶mRNA 的表達(dá)[16],在白姑魚腎臟檢測(cè)到幾丁質(zhì)酶活性[23],在日本鯖魚幽門盲囊中檢測(cè)到幾丁質(zhì)酶mRNA[23]。但還未有研究展示胃以外組織的純化幾丁質(zhì)酶結(jié)果。
在前期研究中,我們成功純化獲得鞍帶石斑魚和赤點(diǎn)石斑魚胃組織中的幾丁質(zhì)酶,并通過了斜帶石斑魚1 型幾丁質(zhì)酶多克隆抗體的Western blot 驗(yàn)證。本研究中,我們首先從吉富羅非魚的胃組織中提取總蛋白,通過幾丁質(zhì)樹脂親和層析法分離純化幾丁質(zhì)酶,SDS-PAGE 結(jié)果顯示,我們只獲得約40 ku 的兩條條帶,且未能用多克隆抗體檢測(cè)到這兩條條帶。我們使用了較DNS法[24]更為靈敏的4-MU 法分析純化產(chǎn)物酶活性,結(jié)果顯示,在最適pH 5 的條件下,純化產(chǎn)物降解4MU-(GlcNAc)2的酶活為1.73 U/g,降 解4MU-(GlcNAc)3的酶活為4.89 U/g。以4-硝基 苯基-β-D-乙酰氨基葡萄糖〔pNP-(GlcNAc)n〕為底物,從六線魚胃組織純化獲得3 種幾丁質(zhì)酶的最佳酶活分別為3.04、1.25、2.37 U/mg[22],從白姑魚胃中純化獲得的兩種幾丁質(zhì)酶降解pNP-(GlcNAc)3分別為0.109、2.07 U/mg[15]。本研究的羅非魚純化產(chǎn)物明顯低于這兩種魚的胃幾丁質(zhì)酶。而檢測(cè)真鯛、海鱸魚、六線魚、太平洋鱈魚和黃尾鰤等胃組織粗酶液的幾丁質(zhì)酶活性在0.24~1.59 U/g 之間[9],與本研究獲得的純化產(chǎn)物幾丁質(zhì)酶活性接近。推測(cè)羅非魚胃中的幾丁質(zhì)酶蛋白表達(dá)量較低,通過幾丁質(zhì)樹脂親和層析法并不能很好地純化幾丁質(zhì)酶,后續(xù)可能需要用多種純化方法相結(jié)合,如在現(xiàn)基礎(chǔ)上再結(jié)合陰/陽離子交換層析方法等,以進(jìn)一步分離天然的幾丁質(zhì)酶,探究它們對(duì)不同形式完整幾丁質(zhì)底物的降解特性及反應(yīng)機(jī)制。幾丁質(zhì)在海洋貯藏量非常豐富[25],其中包括大量蝦蟹殼。在處理蝦蟹殼廢料方面,除了魚類幾丁質(zhì)酶潛在的降解蝦蟹殼幾丁質(zhì)的作用外,細(xì)菌幾丁質(zhì)降解酶也是重要的潛在候選者。對(duì)蝦醬中篩選分離出來的細(xì)菌進(jìn)行全基因組測(cè)序,灰色鏈霉菌CS1801 包含103 個(gè)糖苷水解酶家族基因,體現(xiàn)了幾丁質(zhì)的降解潛力[26]。在海鮮工業(yè)廢物(蝦殼傾倒區(qū))分離出的地衣芽孢桿菌(SSCL-10)的最高比活度為3.4 U/mL。對(duì)菌株進(jìn)行化學(xué)誘變并通過紫外線照射來篩選潛在的幾丁質(zhì)分解菌群,誘變模型已成功使突變型產(chǎn)生的幾丁質(zhì)酶產(chǎn)量提高了5~6 倍[27]。
本研究發(fā)現(xiàn),不同于以貝類、甲殼類或者浮游生物為食的魚類,羅非魚3 種幾丁質(zhì)酶tChit1a、tChi3和tChit主要在前腸或中腸中高表達(dá),而在胃中的表達(dá)量很低。推測(cè)主要原因?yàn)榱_非魚是棲息在水體中下層的魚類,是以植物性餌料為主的雜食性魚類,其食物中的蝦蟹殼所占比例較小,這種食性影響到羅非魚幾丁質(zhì)酶的表達(dá)。因此,這3 種在羅非魚腸道不同位置表達(dá)的幾丁質(zhì)酶可能不同程度地參與羅非魚的消化吸收,但降解幾丁質(zhì)可能不是其主要功能。