張榮琴,萬效琰,張晉豪,代真林,鄭建立,崔興國,趙項(xiàng)武,魏蘭芳,姬廣海
(1云南農(nóng)業(yè)大學(xué)/農(nóng)業(yè)生物多樣性與病蟲害控制教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,昆明 650201;2云南省紅河熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,云南河口 661300;3曲靖佳沃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)有限公司,云南曲靖 655000)
藍(lán)莓(Vaccinium spp.)又稱越桔,屬杜鵑花科越桔屬灌木,分布在熱帶、亞熱帶、溫帶等地區(qū)。藍(lán)莓果實(shí)風(fēng)味獨(dú)特,營養(yǎng)豐富,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和廣闊的栽培前景[1]。近年來,藍(lán)莓在云南省的種植面積逐年增加,各種藍(lán)莓病害也頻繁發(fā)生[2],其中藍(lán)莓根癌病是一種為害藍(lán)莓根部的重要病害,使藍(lán)莓產(chǎn)量急劇下降,經(jīng)濟(jì)損失嚴(yán)重。根癌病是一種普遍發(fā)生的細(xì)菌性病害,由具有致瘤性的根瘤菌科菌株引起,包括土壤桿菌屬、異根瘤菌屬和根瘤菌屬的多個(gè)種,可侵染多種果樹和一些多年生觀賞植物[3],危害根頸、主根、側(cè)根[4],為果園及苗圃帶來重大經(jīng)濟(jì)損失。2010年,阿根廷首次發(fā)現(xiàn)和報(bào)道了由根癌農(nóng)桿菌引起的藍(lán)莓根癌病[5],同年國內(nèi)研究人員在遼寧、吉林、山東及黑龍江省發(fā)現(xiàn)了藍(lán)莓根癌病[6],目前未見云南省藍(lán)莓根癌病的研究報(bào)道。為闡明云南省發(fā)生的藍(lán)莓根癌病病原菌種類,筆者采用多點(diǎn)采樣,進(jìn)行病原菌分離培養(yǎng)、致病性測定和病原菌的系統(tǒng)鑒定,以期為藍(lán)莓根癌病的研究和防治提供參考。
藍(lán)莓根癌病樣品分別采集自云南省藍(lán)莓主栽區(qū)曲靖市麒麟?yún)^(qū)、馬龍區(qū),玉溪市澄江縣,昆明市石林縣藍(lán)莓基地發(fā)病地塊。采集具有根癌病病癥的根部腫瘤組織,保存于紙質(zhì)采樣袋中。
參照文獻(xiàn)[7-8]中根癌菌的分離方法。選取根部腫瘤組織白色幼嫩部分,清洗干凈后用75%乙醇表面消毒60 s,再用無菌水漂洗3次,用無菌研缽將組織研碎,轉(zhuǎn)移至無菌三角瓶中,加入45 mL無菌水,28℃160 r/min振蕩30 min,將上清液梯度稀釋(10-1~10-5),各取100 μL在YEM和MW培養(yǎng)基按低濃度至高濃度進(jìn)行涂布分離,28℃培養(yǎng)48 h。參考文獻(xiàn)[9]中根癌土壤桿菌代表菌株的菌落特征和生物學(xué)特性測定方法,篩選具有根癌土壤桿菌特征的單菌落,純化培養(yǎng)2代后保存?zhèn)溆茫ū?)。
表1 藍(lán)莓根部腫瘤中分離獲得的菌株
1.3.1 向日葵、番茄接種試驗(yàn) 選取向日葵和番茄為指示植物[10]。將分離得到的20株純培養(yǎng)菌株(表1)分別接種到50 mL KB液體培養(yǎng)基中,28℃過夜培養(yǎng),制備濃度為1×109CFU/mL的菌懸液。采用針刺法接種健康向日葵和番茄植株的莖基部并用脫脂棉保濕,對照用無菌水接種處理,每個(gè)處理5個(gè)重復(fù)。每天觀察植株發(fā)病情況,2周后開始觀察并記錄腫瘤的生長情況。根據(jù)柯赫氏法則對發(fā)病部位進(jìn)行再分離,根據(jù)菌株的形態(tài)特征判斷分離得到的病菌是否與原接種菌株相同。
1.3.2 藍(lán)莓回接試驗(yàn) 選取致病性較強(qiáng)的菌株回接藍(lán)莓。菌懸液制備方法同1.3.1,灌根生長健壯的藍(lán)莓植株,對照用無菌水灌根處理,每個(gè)處理5個(gè)重復(fù)。每天觀察植株發(fā)病情況,30天后開始觀察記錄腫瘤的生長情況。
1.4.1 病原菌DNA的提取 將供試菌株L-11、2JK11(芽孢桿菌)、1-BT-186(假單胞菌)、1-BT-22(冬青節(jié)桿菌)、2-BT-19(黃桿菌)、RG-4(根瘤菌)接種至NA培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)24 h,用接種環(huán)挑取少量菌體接種于LB液體培養(yǎng)基,28℃160 r/min過夜培養(yǎng)后收集菌體。按照細(xì)菌DNA提取試劑盒(天根DP302-02)說明書提取細(xì)菌基因組DNA。
1.4.2 16S rDNA序列分析及其同源性比較 根據(jù)已發(fā)表的細(xì)菌16S rDNA通用引物[11]27F和1492R對供試菌株進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物序列為27F(5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG- 3’)/1492R(5’ -GGTTACCTTGTTACGACTT-3’)。 參 照 Taq PCR Master Mix(catTSE030,擎科)配制25 μL PCR反應(yīng)體系,PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min;擴(kuò)增產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測。擴(kuò)增產(chǎn)物送上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測序。將得到的16S rDNA序列與BLAST中的分析結(jié)果進(jìn)行比較,使用MEGA6.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。
1.4.3 特異性引物設(shè)計(jì)及檢測 將根癌土壤桿菌的ipt基因在BLAST中進(jìn)行同源性比對并將靶片段序列通過BLASTn進(jìn)行同源性比對,設(shè)計(jì)出特異性較強(qiáng)的藍(lán)莓根癌病菌特異性引物[12-14],由昆明擎科生物技術(shù)公司合成。引物序列為AtP3F(5’-GCAACGAGTTAGCAGAC GAG-3’)/AtP3R(5’-CCCATCGATCCCTTCCAGTA-3’),預(yù)期片段為155bp。
利用AtP3F/AtP3R對菌株L-11和5株非靶標(biāo)菌株2JK11、1-BT-186、1-BT-22、2-BT-19、RG-4進(jìn)行PCR擴(kuò)增。參照Taq PCR Master Mix(catTSE030,擎科)配制25 μL PCR反應(yīng)體系,PCR擴(kuò)增程序同1.4.2,擴(kuò)增產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測。
采用美國BIOLOG公司的MicrostationTMV 4.01系統(tǒng)、革蘭氏陰性菌微板(GN)和數(shù)據(jù)庫,Biolog-GN板反應(yīng)底物如表2,試驗(yàn)程序按公司的操作指南進(jìn)行。將供試菌株L-11在YEM培養(yǎng)基上轉(zhuǎn)接2次,劃線接種到Bug瓊脂培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)24 h,用無菌棉簽輕輕擦拭培養(yǎng)基上的菌落,移入無菌稀釋緩沖液中,混勻得到菌懸液,測定其濁度為98%。用移液器將菌懸液加入GN微孔板,每孔150 μL,共96孔,對照孔加150 μL無菌水,置于28℃培養(yǎng),4、24、48 h后讀數(shù)記錄結(jié)果。
表2 Biolog GN微孔板上96種碳氮源底物
1.6.1 供試藍(lán)莓 試驗(yàn)藍(lán)莓園位于曲靖市麒麟?yún)^(qū)越州鎮(zhèn)大梨樹村,試驗(yàn)于2018年12月開始、2019年5月結(jié)束。
1.6.2 供試藥劑 化學(xué)藥劑包括50%氯溴異氰尿酸粉劑(南京南農(nóng)農(nóng)藥科技發(fā)展有限公司),1.5%噻霉酮水乳劑(陜西西大華特科技實(shí)業(yè)有限公司),1%申嗪霉素懸浮劑(上海農(nóng)樂生物制品有限公司),葉斑寧-60億芽孢/mL解淀粉芽孢桿菌Lx-11水劑(江蘇蘇科農(nóng)化有限公司)。生防菌劑為WR13-6、C3、13-6、枯草芽孢桿菌,均由本實(shí)驗(yàn)室提供。
1.6.3 試驗(yàn)方法
(1)藥劑施用方法。選擇基地中發(fā)病嚴(yán)重的藍(lán)莓植株進(jìn)行藥劑試驗(yàn),共9個(gè)處理(8個(gè)藥劑處理,1個(gè)空白處理),每個(gè)處理30株藍(lán)莓,供試藥劑稀釋至相應(yīng)濃度(表3),每隔10天灌根1次,每株每次灌1000 mL,共灌根5次。
表3 藥劑施用濃度
(2)試驗(yàn)結(jié)果調(diào)查及統(tǒng)計(jì)方法。
①坐果率調(diào)查。花期結(jié)束后每隔15天調(diào)查1次坐果情況,直至果實(shí)子房膨大成形不再出現(xiàn)生理落果為止。
②田間藥劑防效評估。最后一次灌根10天后進(jìn)行病情調(diào)查。每個(gè)小區(qū)隨機(jī)選取5株藍(lán)莓進(jìn)行調(diào)查,3次生物學(xué)重復(fù),依據(jù)根瘤情況進(jìn)行分級(表4),按照式(2)~(4)計(jì)算各處理的發(fā)病率、病情指數(shù)以及防效。
表4 根癌病分級標(biāo)準(zhǔn)
式中,A為試驗(yàn)區(qū)處理后的病情指數(shù),B為試驗(yàn)區(qū)處理前的病情指數(shù),C為對照區(qū)處理后的病情指數(shù),D為對照區(qū)處理前的病情指數(shù)。
藍(lán)莓根部腫瘤早期呈圓形、黃白色,后期瘤體慢慢變大,并由黃褐色變?yōu)榘岛稚?。根部腫瘤傾向于木質(zhì)化,表皮粗糙,近圓形或不規(guī)則,直徑可達(dá)2~3 cm,嚴(yán)重可達(dá)10~15 cm。田間調(diào)查發(fā)現(xiàn),根癌發(fā)病早期在苗木根部形成較小的白色或者肉色粗糙瘤狀物(圖1D)。感染根癌病后,植物根部吸收水分及營養(yǎng)物質(zhì)受阻,根系發(fā)育不良;發(fā)病后期,植株生長緩慢,葉片變黃、干枯甚至整株死亡[12]。
圖1 田間藍(lán)莓發(fā)病癥狀
2.2.1 向日葵、番茄接種試驗(yàn) 20株供試菌株接種向日葵幼苗2周后,接種P2-2、L-3、L-11、L-5的向日葵在莖基部開始出現(xiàn)不規(guī)則的瘤狀突起,接種其他菌株的向日葵和對照無瘤狀突起(圖2A);接種30天后,瘤狀突起逐漸增大形成明顯腫瘤,接種L-11的植株瘤狀突起最大,其余16株菌株和對照仍無瘤狀突起。L-11接種番茄幼苗14天后,接種部位出現(xiàn)瘤狀突起(圖2B)。從接種發(fā)病部位重新分離病原菌獲得純培養(yǎng)物,通過菌株形態(tài)學(xué)特征判斷分離得到的病菌與原接種菌株相同。
圖2 L-11致病性檢測
2.2.2 藍(lán)莓植株回接試驗(yàn) L-11灌根藍(lán)莓60天后,在接種植株根部形成不規(guī)則的結(jié)節(jié)狀突起,對照植株的接種部位無瘤狀突起。90天后瘤狀突起逐漸增大,形成明顯的冠癭瘤(圖3B),對照植株無腫瘤形成(圖3A)。
圖3 L-11接種藍(lán)莓幼苗的癥狀
2.3.1 Biolog生理生化鑒定 將L-11菌懸液接種到Biolog革蘭氏陰性菌微孔板(GN)中,4、24、48 h后分別測定其對碳、氮源的利用情況并與數(shù)據(jù)庫中的標(biāo)準(zhǔn)菌株進(jìn)行比較。L-11與數(shù)據(jù)庫中的放射根瘤菌/土壤桿菌屬(Rhizobium radiobacter/Agrobacetrum sp.)相似程度較高(表5),碳源、氮源利用情況完全相同,均不能利用亞甲基丁二酸(E2)、α-氧代戊酸(E5)、D-絲氨酸(G8)。
表5 L-11菌株在Biolog GN微板中的代謝活性195 mm×132 mm(96×96 dpi)
2.3.2 分子生物學(xué)鑒定
(1)16S rDNA分子鑒定。以L-11基因組DNA為模板,用16S rDNA通用引物27F/1492R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物約1500 bp。L-11 16S rDNA測序序列(登錄號MK910214.1)進(jìn)行BLAST比對,與根癌土壤桿菌Agrobacterium tumefaciens Ell-7序列(登錄號FJ613554.1)相似度達(dá)到97.65%;將L-11的16S rDNA序列與其他農(nóng)桿菌屬的序列進(jìn)行比較并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖4),表明L-11與標(biāo)準(zhǔn)菌株Ell-7親緣關(guān)系最近。因此,云南省藍(lán)莓根癌病的病原菌鑒定為根癌土壤桿菌(Agrobacterium tumefaciens)。
圖4 基于16S rDNA序列的藍(lán)莓根癌病原菌相關(guān)種系統(tǒng)發(fā)育樹
(2)特異性引物擴(kuò)增結(jié)果(圖5)。利用根癌土壤桿菌特異性引物AtP3F/AtP3R,對L-11、2JK11、1-BT-186、1-BT-22、2-BT-19、RG-4基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。L-11擴(kuò)增出155 bp的特異性片段,其他菌株均未擴(kuò)增出條帶,可將L-11鑒定為根癌土壤桿菌。
圖5 特異性引物AtP3F/AtP3R擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳圖譜
藥劑篩選結(jié)果(表6)表明,1.5%噻霉酮水乳劑防治效果最好(52%),1%申嗪霉素懸浮劑、C3生防菌劑、50%氯溴異氰尿酸粉劑防治效果次之,分別為48%、45%、43%。
表6 藍(lán)莓根癌病田間藥劑試驗(yàn)防治結(jié)果
本研究對云南省藍(lán)莓主產(chǎn)區(qū)采集的藍(lán)莓根癌病樣品進(jìn)行病原菌的分離培養(yǎng),通過致病性測定和多種分類鑒定方法,證實(shí)云南發(fā)生的藍(lán)莓根癌病是由根癌土壤桿菌所致,并篩選出對藍(lán)莓根癌病有較好防治效果的藥劑1.5%噻霉酮水乳劑,為進(jìn)一步開展有關(guān)該病發(fā)病規(guī)律及防治技術(shù)的系統(tǒng)研究提供科學(xué)依據(jù)。
根癌病菌可侵染93科331屬643種植物,包括多種果樹、林木、花卉甚至瓜類,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失[15]。根癌病病原菌較多,包括土壤桿菌屬、異根瘤菌屬和根瘤菌屬的多個(gè)種[2]。土壤桿菌屬和根瘤菌屬的關(guān)系一直存在爭議。有學(xué)者提出按照16S rDNA序列分析可將土壤桿菌屬(Agrobacterium)和異根瘤菌屬(Allorhizobium)歸為根瘤菌屬(Rhizobium)[16],但也有學(xué)者發(fā)現(xiàn)根瘤菌屬(Rhizobium)中個(gè)別種與土壤桿菌屬的關(guān)系不是很密切,不能籠統(tǒng)地說土壤桿菌和根瘤菌的關(guān)系較近,而應(yīng)該深入研究土壤桿菌與根瘤菌的種間關(guān)系[17]。土壤桿菌屬與根瘤菌屬的鑒別標(biāo)準(zhǔn)之一是病菌引起致病癥狀還是引起根瘤[18]。本研究分離得到的菌株P(guān)2-2、L-3、L-11、L-5都會引起藍(lán)莓根部腫瘤,說明這4株菌歸類至土壤桿菌屬。
根癌病菌通過傷口侵染植物,T-DNA在寄主植物中表達(dá),編碼生長素和細(xì)胞分裂素的生物合成,使植物細(xì)胞增殖失控,導(dǎo)致腫瘤的形成[19]?;瘜W(xué)農(nóng)藥防治效果并不顯著,持效性差[20],1.5%噻霉酮水乳劑防治效果較好但相對防效也僅為52%。目前生物防治研究發(fā)展較快,R.rhizogenes K84(商品名根癌寧)可有效防治桃根癌病[21]。K84是Kerr于1972年發(fā)現(xiàn)的一株無致瘤性的發(fā)根根瘤菌[22],主要作用方式是接合質(zhì)粒pAgK84編碼產(chǎn)生土壤桿菌素84進(jìn)而殺滅細(xì)菌[23]。另外放射土壤桿菌M I-15也能有效抑制葡萄根癌菌的生長和致瘤[24]。還有無致病性的葡萄土壤桿菌E26菌株對葡萄根癌病具有良好防效[25]。目前生產(chǎn)上可在施用藥劑的同時(shí),采用植物檢疫,苗木、砧木消毒,及時(shí)清除田間病株,選育抗病品種,改進(jìn)嫁接方式等手段進(jìn)行綜合治理,控制藍(lán)莓根癌病的發(fā)生,以實(shí)現(xiàn)藍(lán)莓產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。