李志剛,顧 陽,陳寶峰,王寶石,張中華,常景玲,*
(1.現(xiàn)代生物育種河南省協(xié)同創(chuàng)新中心,河南新鄉(xiāng)453003;2.河南科技學(xué)院生命科技學(xué)院,河南新鄉(xiāng)453003)
環(huán)磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)是生物體內(nèi)廣泛存在的一種生理活性物質(zhì),對(duì)細(xì)胞的各種代謝活動(dòng)以及核酸和蛋白質(zhì)等物質(zhì)的合成具有重要的調(diào)節(jié)作用[1]。該物質(zhì)在體內(nèi)可以促進(jìn)心肌細(xì)胞存活,增強(qiáng)心肌細(xì)胞抗損傷、抗缺血和抗缺氧能力,臨床上主要用于心功能不全、心絞痛和心肌梗死等疾病的治療,另外,其作為飼料添加劑廣泛應(yīng)用于畜禽產(chǎn)品的生產(chǎn)中,具有十分重要的應(yīng)用價(jià)值[2-3]。
微生物合成cAMP代謝過程涉及糖酵解途徑、磷酸戊糖途徑、嘌呤核苷酸合成途徑、腺苷酸合成途徑和三羧酸循環(huán),代謝流分配情況是影響cAMP合成的重要因素[4]。Chen等[5]利用不同的抑制劑調(diào)節(jié)糖酵解途徑代謝強(qiáng)度,結(jié)果表明氟化鈉顯著提高了cAMP的產(chǎn)量和得率。Niu等[6]利用13C示蹤實(shí)驗(yàn)對(duì)添加氟化鈉條件下的碳流分配情況進(jìn)行研究,結(jié)果表明糖酵解途徑代謝強(qiáng)度明顯下降,同時(shí)磷酸戊糖途徑的代謝強(qiáng)度顯著上升。此外,Niu等[7]利用比較轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法對(duì)高溶氧條件下cAMP產(chǎn)量顯著提高的原因進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)糖酵解途徑中酶的轉(zhuǎn)錄水平明顯下降,而三羧酸循環(huán)和嘌呤核苷酸合成途徑中酶的轉(zhuǎn)錄水平和表達(dá)量明顯上升。因此,合理調(diào)節(jié)碳流在糖酵解和磷酸戊糖途徑間的分配,能夠有效促進(jìn)cAMP的積累。
6-磷酸葡萄糖脫氫酶是改變碳流分配的關(guān)鍵酶,活性受NADPH的反饋抑制,消除過量的NADPH有利于碳流更多的分配到磷酸戊糖途徑[8]。硝酸鹽是一種氧化性強(qiáng)的氮源,在硝酸鹽還原酶和亞硝酸鹽還原酶順序催化作用下轉(zhuǎn)化為銨態(tài)氮,同時(shí)該還原反應(yīng)需要NADPH作為輔酶才能進(jìn)行[9-10]。微生物利用硝酸鹽的過程會(huì)消耗大量NADPH,還原性輔酶NADPH水平下降會(huì)提高6-磷酸葡萄糖脫氫酶的活性,還會(huì)影響其他代謝途徑中酶的活性,進(jìn)而改變代謝流分配情況[11-13]。
本文針對(duì)cAMP從頭合成途徑的代謝特點(diǎn),通過適量添加硝酸鈉的方式促進(jìn)產(chǎn)物合成,并從cAMP發(fā)酵動(dòng)力學(xué)、還原性輔酶水平、關(guān)鍵酶活性、胞內(nèi)氨基酸水平以及能量代謝水平等方面進(jìn)行研究,闡明硝酸鹽促進(jìn)cAMP發(fā)酵合成的生理機(jī)制,為硝酸鹽在核苷酸類產(chǎn)品發(fā)酵生產(chǎn)中應(yīng)用提供理論參考。
節(jié)桿菌(Arthrobacter sp.)A.sp01 本實(shí)驗(yàn)室篩選并保藏于中國典型培養(yǎng)物保存中心(保藏號(hào)為CCTCC No.M2013431);cAMP、ATP、AMP、NADH、NAD+分析純,阿拉丁生化科技股份有限公司;苯酚、次氯酸鈉、水楊酸、對(duì)氨基苯磺酸、α-萘胺 分析純,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;6-磷酸葡萄糖脫氫酶試劑盒、NADPH與NADP+濃度測定試劑盒 北京索萊寶科技有限公司;AccQ-Tag氨基酸分析試劑包、氨基酸柱 沃特世科技(上海)有限公司(Waters);其他試劑 均為市售國產(chǎn)或進(jìn)口分析級(jí)純。
LDZX-50KBS高壓滅菌鍋 上海申安醫(yī)療器械廠;SW-CJ-2FD雙人垂直凈化工作臺(tái) 蘇凈集團(tuán)安泰公司制造;ZWF-2112搖床 上海智城分析儀器制造有限公司;UV-2800紫外分光光度計(jì) 上海舜宇恒平科學(xué)儀器有限公司;BIOTECH-7BG機(jī)械攪拌式發(fā)酵罐 上海保興生物設(shè)備有限公司;Aglient 1260 Infinity液相色譜儀 美國安捷倫科技有限公司;VC150超聲波破碎儀 美國Sonics&Materials公司;pH和DO電極 瑞士METTLER TOLEDO公司。
1.2.1 培養(yǎng)基配制 斜面培養(yǎng)基、種子培養(yǎng)基和發(fā)酵培養(yǎng)基的組成及配制參見文獻(xiàn)[14]。
1.2.2 培養(yǎng)方法
1.2.2.1 發(fā)酵罐培養(yǎng) 7 L機(jī)械攪拌式發(fā)酵罐配備pH和DO電極各一支,裝載發(fā)酵培養(yǎng)基5 L(初始葡萄糖濃度為80 g/L)。121℃、高壓蒸汽滅菌20 min,接種量10%,發(fā)酵溫度30℃,初始pH調(diào)節(jié)至7.4待下降至6.8時(shí)保持不變,攪拌轉(zhuǎn)速初始400 r/min視溶氧變化情況逐漸增加至500 r/min,通風(fēng)量從起始的0.1 vvm提升至0.6 vvm。
1.2.2.2 硝酸鹽添加方法 發(fā)酵罐發(fā)酵實(shí)驗(yàn):發(fā)酵過程進(jìn)行至24 h一次性添加3 g/L-broth的硝酸鈉。搖瓶發(fā)酵實(shí)驗(yàn):設(shè)置1、2、3、4和5 g/L-broth等5個(gè)不同添加量和0、16、24和36 h等4個(gè)不同添加時(shí)間,共計(jì)20個(gè)不同組合,每個(gè)組合作3個(gè)平行試驗(yàn)。
1.2.3 指標(biāo)測定
1.2.3.1 菌體濃度(OD600)和菌體干重(DCW)測定 菌體濃度采用光密度法測定,發(fā)酵液稀釋適當(dāng)倍數(shù),在600 nm波長下測吸光度,所測數(shù)值乘以稀釋倍數(shù)即為OD600;菌體干重通過關(guān)系式DCW(g/L)=0.46×OD600計(jì)算得出[15]。
全省濕地總面積2606萬畝,有效維護(hù)生態(tài)平衡、保護(hù)生物多樣性。圖為“國際重要濕地”黃河三角洲國家級(jí)自然保護(hù)區(qū)。
1.2.3.2 葡萄糖濃度測定 采用DNS法進(jìn)行測定[15]。
1.2.3.3 cAMP與次黃嘌呤測定 使用高效液相色譜進(jìn)行測定[5],取適量發(fā)酵液于離心管中,9000 r/min,離心10 min。上清液經(jīng)過0.45μm孔徑的水相膜過濾后待測。色譜條件:色譜柱為Lichrospher C18柱(4.6 mm×300 mm,5μm),進(jìn)樣量5μL,有機(jī)相為甲醇,水相為磷酸三乙胺緩沖液(0.6%的磷酸溶液,用三乙胺調(diào)p H為6.6),水相與有機(jī)相體積比為70∶30,流速0.8 mL/min,柱溫30℃,波長254 nm。
1.2.3.4 pH和CO2含量測定 p H由發(fā)酵罐配備的電極在線測定,尾氣中CO2含量由尾氣分析儀在線測定。
表1 硝酸鈉不同添加時(shí)間和添加量對(duì)cAMP發(fā)酵產(chǎn)物濃度的影響(g/L)Table 1 The effects of sodium nitrate on cAMP fermentation production with different addition time and amounts(g/L)
1.2.3.6 細(xì)胞內(nèi)ATP、AMP、NADH和NAD+濃度測定取5 mL發(fā)酵液,在4℃、9000 r/min條件下離心10 min。所得菌體于液氮中處理2 min,使細(xì)胞代謝瞬間停止。用PBS緩沖液洗滌細(xì)胞兩次,重新懸浮在5 mL的PBS緩沖液中,冰浴條件下超聲波破碎10 min,超聲3 s,停5 s。在4℃,12000 r/min條件下離心15 min,上清液用0.22μm孔徑的濾膜過濾后待測。ATP、AMP采用高效液相色譜法進(jìn)行測定,具體方法參見文獻(xiàn)[15];NADPH與NADP+濃度采用試劑盒進(jìn)行測定,操作方法和步驟按照說明書進(jìn)行。
1.2.3.7 關(guān)鍵酶活性測定 6-磷酸葡萄糖脫氫酶活性采用試劑盒進(jìn)行測定,操作方法和步驟按照說明書進(jìn)行;異檸檬酸脫氫酶、丙酮酸脫氫酶和琥珀腺苷酸合成酶活性測定方法參見文獻(xiàn)[18],比酶活以U/mg蛋白表示。
1.2.3.8 蛋白濃度測定 采用考馬斯亮藍(lán)染色法測定[18]。
1.2.3.9 胞內(nèi)氨基酸濃度測定 在不同發(fā)酵時(shí)期,分別取50 mL發(fā)酵液,12000×g離心10 min,使用超純水洗滌2次。細(xì)胞重懸于1 mL 10%(w/v)的三氯乙酸中,37℃放置10 min,煮沸15 min。12000×g離心10 min除去細(xì)胞碎片,上清經(jīng)0.22μm濾膜過濾后[19-20],采用Waters公司開發(fā)的AccQ-Tag法進(jìn)行測定,操作方法和步驟按照說明書進(jìn)行。
在250 mL錐形瓶中進(jìn)行了添加硝酸鈉的cAMP發(fā)酵實(shí)驗(yàn),以產(chǎn)物濃度為指標(biāo)確定最佳添加時(shí)間和添加量。如表1所示,硝酸鈉添加量和添加時(shí)間對(duì)cAMP產(chǎn)量均有較為明顯的影響,24 h添加3 g/Lbroth硝酸鈉時(shí)cAMP濃度達(dá)到最高的3.58 g/L,比對(duì)照提高了36.6%,與其他組合條件相比具有顯著差異。因此,將24 h添加3 g/L-broth硝酸鈉確定為最佳操作條件,在7 L發(fā)酵罐上進(jìn)行發(fā)酵實(shí)驗(yàn)。
在7 L機(jī)械攪拌式發(fā)酵罐上進(jìn)行了添加硝酸鈉的發(fā)酵實(shí)驗(yàn),添加時(shí)間為24 h,添加量為3 g/Lbroth,其它操作條件與對(duì)照批次一致。如圖1所示,添加硝酸鈉發(fā)酵批次的cAMP終產(chǎn)量達(dá)到5.02 g/L,比對(duì)照批次提高了22.7%,而葡萄糖消耗量有一定幅度的下降,cAMP對(duì)葡萄糖的得率達(dá)到了0.097 g/g,比對(duì)照提高了29.8%。在發(fā)酵中后期(36~60 h),對(duì)照批次的產(chǎn)物合成速率明顯變慢,產(chǎn)物增加量很少,而添加硝酸鹽批次的產(chǎn)物合成仍較為活躍,合成量比對(duì)照批次高出約1.0 g/L,有效促進(jìn)了產(chǎn)物的合成與積累。這可能是由以下3個(gè)原因?qū)е碌?a.硝酸鈉作為一種氧化性氮源,利用過程消耗大量還原力(NADPH或NADH),一定程度上影響了菌體的生長和葡萄糖的利用;b.還原力的消耗緩解了NADPH對(duì)6-磷酸葡萄糖脫氫酶的反饋抑制,使碳流更多的分配到產(chǎn)物合成途徑;c.還原力的消耗致使副產(chǎn)物(乙酸和乳酸)合成大幅下降,從而提高了產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化率。由圖1C可知,兩批次中pH均呈現(xiàn)先降后升的趨勢,在36 h后添加硝酸鹽批次的pH回升速度明顯快于對(duì)照批次,有機(jī)酸合成量減少和堿性物質(zhì)生成導(dǎo)致p H的迅速回升。添加硝酸鹽批次尾氣中CO2比例明顯高于對(duì)照批次(圖1D),表明菌體的代謝活性得到增強(qiáng)。
另外,兩批次中次黃嘌呤濃度在40 h后均降到0.2 g/L以下,且基本沒有變化,cAMP是通過從頭合成途徑進(jìn)行合成的。cAMP的從頭合成途徑涉及到糖酵解與磷酸戊糖途徑間的碳流分配、能量供應(yīng)以及氨基酸供應(yīng)等問題,因此,可以從硝酸鹽利用、代謝途徑關(guān)鍵酶活性水平、輔因子和ATP變化規(guī)律、氨基酸代謝等方面闡明硝酸鹽促進(jìn)cAMP合成的生理機(jī)制。
圖1 添加硝酸鈉對(duì)cAMP發(fā)酵性能的影響Fig.1 The effect of sodium nitrate on cAMP fermentation performance
硝酸鹽還原酶和亞硝酸鹽還原酶必須要有還原型輔酶(NADH或NADPH)提供還原力才能完成催化反應(yīng),因此,對(duì)反映細(xì)胞內(nèi)氧化還原狀態(tài)的NADH/NAD+和NADPH/NADP+進(jìn)行測定。如圖3所示,添加硝酸鹽批次細(xì)胞內(nèi)NADH/NAD+明顯高于對(duì)照批次的,而NADPH/NADP+卻明顯低于對(duì)照批次的,表明上述兩種還原酶主要以NADPH作為輔酶來還提供原力,而NADH/NAD+的提高表明細(xì)胞能量代謝得到強(qiáng)化。這也解釋了添加硝酸鹽批次呼吸代謝旺盛而菌體濃度較低的現(xiàn)象,NADPH/NADP+的大幅降低,使細(xì)胞組分的合成受到影響,進(jìn)而影響菌體生長。
微生物合成cAMP過程涉及到糖酵解、磷酸戊糖途徑、嘌呤核苷酸合成途徑以及三羧酸循環(huán)等。代謝流在不同途徑間的分配對(duì)產(chǎn)物合成具有顯著影響,而代謝網(wǎng)絡(luò)中關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)處酶活性變化反映了代謝途徑的強(qiáng)弱和碳流分配情況。
圖2 添加硝酸鈉時(shí)cAMP發(fā)酵液中銨態(tài)氮和硝態(tài)氮的變化情況Fig.2 Time courses ofand concentrations in fermentation with sodium nitrate added
如圖4所示,添加硝酸鹽批次的丙酮酸脫氫酶活性比對(duì)照批次有一定程度下降,糖酵解途徑的代謝強(qiáng)度弱化;而異檸檬酸脫氫酶、6-磷酸葡萄糖脫氫酶和琥珀腺苷酸合成酶的活性均一定程度上高于對(duì)照批次,表明代謝流更多的分配到磷酸戊糖途徑為產(chǎn)物合成提供碳骨架,同時(shí)三羧酸循環(huán)的代謝強(qiáng)度也得到強(qiáng)化。同時(shí)細(xì)胞內(nèi)高NADPH/NADP+水平會(huì)抑制6-磷酸葡萄糖脫氫酶的活性,本文中硝酸鈉利用過程以NADPH為輔酶,使胞內(nèi)NADPH/NADP+水平顯著下降,解除或緩解了對(duì)6-磷酸葡萄糖脫氫酶的抑制作用,提高了該酶的活性,進(jìn)而將更多的碳流分配到磷酸戊糖途徑為產(chǎn)物合成提供碳骨架,促進(jìn)了產(chǎn)物的合成。
圖3 硝酸鈉對(duì)胞內(nèi)氧化還原水平的影響Fig.3 The effects of sodium nitrate on NADPH/NADP+and NADH/NAD+
圖4 硝酸鹽對(duì)cAMP發(fā)酵代謝過程中關(guān)鍵酶活性的影響Fig.4 The effects of sodium nitrate on the activities of sAMPase,PGH,ICDH and G6PD
對(duì)添加硝酸鈉發(fā)酵批次的細(xì)胞內(nèi)氨基酸含量進(jìn)行測定,結(jié)果表明,添加硝酸鹽批次中有12種氨基酸的含量高于對(duì)照批次,其中6種氨基酸含量得到明顯提高,分別是天冬氨酸、甘氨酸、谷氨酸、精氨酸、賴氨酸和異亮氨酸(圖5)。天冬氨酸、甘氨酸、谷氨酸是微生物通過從頭合成途徑進(jìn)行cAMP合成的前體氨基酸,能夠部分或整體的整合到嘌呤環(huán)上,是產(chǎn)物合成的材料來源;同時(shí)天冬氨酸、谷氨酸、異亮氨酸、賴氨酸和精氨酸均是以三羧酸循環(huán)的代謝物為碳骨架進(jìn)行合成的。硝酸鹽的利用不僅為氨基酸合成提供了氮素,還通過強(qiáng)化三羧酸循環(huán)提供了碳骨架,促進(jìn)了氨基酸代謝,進(jìn)而促進(jìn)產(chǎn)物合成。
圖5 硝酸鹽對(duì)細(xì)胞內(nèi)氨基酸合成的影響Fig.5 The effects of sodium nitrate on the amounts of intracellular amino acids
cAMP是由ATP在腺苷酸環(huán)化酶的催化下合成的,高ATP水平有利于產(chǎn)物的合成;而ATP/AMP則一定程度上體現(xiàn)了細(xì)胞內(nèi)磷酸化水平和ATP合成水平。如圖6所示,添加硝酸鹽發(fā)酵批次的細(xì)胞內(nèi)ATP含量和ATP/AMP均明顯高于對(duì)照批次,結(jié)合NADH/NAD+的提高,表明硝酸鹽能夠強(qiáng)化能量代謝,有利于胞內(nèi)ATP的合成。
圖6 硝酸鹽對(duì)胞內(nèi)ATP含量和ATP/AMP比的影響Fig.6 The effects of sodium nitrate on intracellular ATP concentration and ATP/AMP
發(fā)酵24 h添加3 g/L-broth硝酸鈉時(shí),cAMP發(fā)酵性能得到明顯提升。硝酸鹽利用過程消耗了大量NADPH,緩解了對(duì)6-磷酸葡萄糖脫氫酶的抑制作用,同時(shí)糖酵解途徑受到抑制而磷酸戊糖途徑和三羧酸循環(huán)中關(guān)鍵酶活性明顯提高,更多碳流分配到產(chǎn)物合成途徑。此外,胞內(nèi)前體氨基酸水平、NADH/NAD+和ATP/AMP均得到明顯提高,為cAMP的發(fā)酵合成與積累提供了物質(zhì)和能量基礎(chǔ)。硝酸鹽利用過程消耗了大量的還原力,改變了代謝流分配情況,提高了胞內(nèi)氨基酸水平和ATP合成,為cAMP發(fā)酵合成提供了物質(zhì)和能量基礎(chǔ)。硝酸鹽作用機(jī)制的闡明,為提高核苷酸類發(fā)酵產(chǎn)品的生產(chǎn)水平提供了參考。