李志路,李洪海,杜瑩婧,李賽嘉,許冰心,易國輝,張云霞
1.海南醫(yī)學院第一臨床學院(???570105);2.海南醫(yī)學院 科學實驗中心(海口 570105);3.海南省創(chuàng)傷與災難救援研究重點實驗室(???570105)
動脈粥樣硬化性腦梗死(atherosclerotic cerebral infarction,ASCI)是指動脈粥樣硬化和血栓形成導致腦供血不足,局部腦組織壞死和神經(jīng)功能不可逆性損傷的疾病,具有發(fā)病率高、致殘率高等特點[1]。ASCI發(fā)病機制復雜,危險因素包括炎性反應、慢性感染性疾病、高血糖、高血壓、吸煙、飲酒、暴飲暴食、偏頭痛等,但共同特點是動脈粥樣硬化斑塊脫落導致血管堵塞[2-6]。動脈粥樣硬化(arteriosclerosis,AS)是一種涉及全身大、中動脈病變,誘導產(chǎn)生各種缺血性心腦血管疾病,其病灶及斑塊形成與血液中低密度脂蛋白(low-disentylipo-protein,LDL)的代謝及氧化密切相關(guān)[7]。對氧磷酶1基因(paraoxonase 1,PON1)是一種由肝臟分泌的與高密度脂蛋白(high-densitylipo-protein,HDL)緊密結(jié)合鈣離子依賴型磷脂酶,具有抑制LDL氧化作用,可間接減緩巨噬細胞源性泡沫細胞的形成而發(fā)揮抗AS作用[8-9]。PON1基因的遺傳變異可影響其蛋白的結(jié)構(gòu)和數(shù)量,進而影響其功能的正常發(fā)揮。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)作為第三代遺傳標記廣泛存在于各類物種的基因組中,成為個體化差異和疾病發(fā)生發(fā)展的遺傳基礎(chǔ)。
據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫查詢發(fā)現(xiàn),PON1基因中存在1 169個SNP位點,部分SNPS與不同地區(qū)心腦血管疾病的相關(guān)性研究已被報道,rs662位點多態(tài)性與江西人群[10]、 -909C/G基因多態(tài)性與包頭漢族人群[11]、-162A/G 基因多態(tài)性與上海漢族人群[12]等關(guān)聯(lián)性研究表明,PON1的遺傳變異與心腦血管疾病具有相關(guān)性。海南本地人群長期處于孤島,在地理位置上具有相對隔離性,因而是研究遺傳變異與疾病性狀相關(guān)性的良好的遺傳資料。目前,對海南漢族中PON1基因與ASCI的相關(guān)性研究甚少[13]。因此,本研究擬以海南ASCI和正常人群為研究對象,探究PON1基因rs2074354、 rs3917538 和rs854565與ASCI的相關(guān)性,以期為易感人群提供預警指標,為臨床診斷和治療提供理論參考。
選取2019年3—12月在海南醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院收治的142例單純性漢族ASCI患者作為試驗組,選擇同期在本院體格檢查科檢查的196例漢族健康人群作為對照組。納入標準:采樣者均自愿加入本研究,并簽署知情同意書。試驗組嚴格按照《中國急性缺血性腦卒中診治指南2018》[14]的標準納入;試驗組納入的樣本除患ASCI外無其余疾病史;對照組無任何疾病史。本研究通過本院醫(yī)學倫理委員會批準。排除標準:所有受試者排除癌癥史、心血管疾病、自身免疫性疾病或已知感染性疾病史。試驗組男84例,女58例,年齡38~94歲。對照組男127例,女69例,年齡49~91歲。兩組性別及年齡比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),具有可比性。
1.2.1 樣本采集方法 所有樣本采集乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraaceticacid,EDTA)抗凝外周血2 mL,試劑盒法提取外周血全基因組DNA,質(zhì)量鑒定。
1.2.2 基因 SNP 位點分型方法 上述樣本為原材料,以上游引物P1(ACGTTGAGTGCTGTAG AAGACCTTCTAGGAGC)和下游引物P2(ACGT TGAGTGCAGCTCAGAGAACAAAGAGG)擴增出包含 rs2074354 位點的 91 bp DNA片段,以上游引物P3(ACGTTGAGTGCTGTGTGTGTCTGTG TGTAA)和下游引物P4(ACGTTGAGTGTGTA GGCCCAAGTATGTAGG)擴增出包含 rs3917538 位點的 120 bp DNA片段,以上游引物P4(ACGTT GAGTAGTGCAGCATCAGTAGCTTCG)和下游引物P5(ACGTTGAGTGGTCTAGGTAAAGAG CAAAGG)擴增出包含 rs854565 位點的110 bp DNA片段。多重PCR擴增條件: 95 ℃預變性3 min、[94 ℃(15 s)、55 ℃(15 s)、72 ℃(30 s)]進行35個循環(huán)、72 ℃延伸3 min。純化產(chǎn)物利用3730XL基因測序儀進行序列測定及數(shù)據(jù)讀取。
數(shù)據(jù)經(jīng)Excel 2016錄入整理,使用人工計算和SNPstats軟件進行Hardy-weinberg平衡定律、兩組間基因型分布頻率、等位基因分布頻率、單倍型分析;等位基因用SPSS 25.0軟件進行分析,定性資料以例數(shù)(%)表示,組間比較采用2檢驗。檢驗水準α除特別說明外均設(shè)定為0.05。
Hardy-Weinberg遺傳平衡驗證結(jié)果顯示,PON1基因的3個SNP位點在兩組漢族人群出現(xiàn)概率差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),符合Hardy-Weinberg遺傳平衡,具有代表性 (表1~2)。
表1 對照組Hardy-Weinberg遺傳平衡驗證
表2 試驗組Hardy-Weinberg遺傳平衡驗證
3個多態(tài)性位點rs854565、rs3917538、rs2074354均可檢測出3種基因型。這3種基因型在兩組中的發(fā)生率比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);且3個位點的等位基因A和G在兩組間比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)(表3~4)。
表3 rs2074354、rs3917538、rs854565的基因分型結(jié)果[n(%)]
表4 rs2074354、rs3917538、rs854565等位基因分型結(jié)果[n(%)]
rs2074354-rs3917538-rs854565單倍型G-G-A、G-G-G、G-A-G均與漢族ASCI的發(fā)生無相關(guān)性(P>0.05)(表5)。
表5 試驗組PON1基因3個SNP位點單倍型分析
血漿LDL參與細胞內(nèi)的氧化代謝,在人體中通過觸發(fā)信號傳導影響AS過程,包括內(nèi)皮細胞和血管壁巨噬細胞在內(nèi)的多種靶細胞的反應,其信號傳導能力與LDL及其受體的含量相關(guān)聯(lián)[15-16]。PON1基因的編碼區(qū)定位于人類染色體Ⅶ號臂21.3~22.1上,是一種存在于哺乳動物HDL中Ca2+依賴血清酯酶,其通過保護LDL不被氧化,從而提高HDL在膽固醇逆轉(zhuǎn)運中抗AS作用,降低LDL形成巨噬細胞源性泡沫細胞促AS作用[17]。已有研究[18]報道,亞洲人ASCI的發(fā)病原因以顱內(nèi)AS多見,而歐美人則大多為顱外AS,且ASCI由AS引起為主的觀點已成共識。此外,從基因遺傳變異的角度挖掘其發(fā)病機制,可以幫助更多的研究者在基因組水平上揭示疾病的發(fā)病機制及尋找新的靶向治療位點。關(guān)于基因與ASCI的關(guān)聯(lián)性研究主要集中在PON1、CD147、MMP-12、LRP6等基因上,且在不同人群中發(fā)現(xiàn)其與ASCI存在不同程度的關(guān)聯(lián)性[19-20],但關(guān)于PON1基因多態(tài)性與ASCI的關(guān)聯(lián)性研究甚少,基于此本實驗遴選PON1基因3個SNP與海南ASCI關(guān)聯(lián)性進行了探究。
本試驗的3個SNP位點rs2074354、rs3917538、rs854565均位于Ⅶ號染色體上,具體位置分別為第95311275 bp、第95308581 bp、第95319032 bp。rs2074354屬于PON1基因內(nèi)含子突變,分析等位基因聚合分析計劃的數(shù)據(jù),結(jié)果顯示等位基因A的全球發(fā)生頻率為10.9%, 歐洲人群A的分布頻率為9.5%,亞洲人群中A的分布頻率達到46.1%,而在東亞人群中為48.5%。本研究結(jié)果顯示,漢族人群中等位基因A的分布頻率為45.9%,遠遠高于全球分布頻率,與亞洲人群及東亞人群中A的分布頻率相接近。
多態(tài)性位點rs3917538也屬于PON1基因內(nèi)含子突變,分析等位基因聚合分析計劃的數(shù)據(jù),結(jié)果顯示,等位基因A的全球發(fā)生頻率為24.6%, 歐洲人群接近全球水平(22.8%),亞洲人群中A的分布頻率達到57.0%,而在東亞人群中為59.2%,本次研究結(jié)果顯示,漢族人群中等位基因A的分布頻率為53.32%,遠高于全球分布頻率,與亞洲人群及東亞人群中A的分布頻率相接近。關(guān)于位點rs2074354和rs3917538,在Sikora等[21]關(guān)于多酚攝入與心血管疾病標志物上的PON1基因變異之間的相互作用的研究中有所提及,該項研究表明,在意大利人群中PON1作為對心血管健康的易感基因在攝入不同量高抗氧化劑的情況下,rs2074354和rs3917538對心血管疾病具有一定的保護作用。
多態(tài)性位點rs854565同屬于PON1基因內(nèi)含子突變,分析等位基因聚合分析計劃的數(shù)據(jù),結(jié)果顯示,等位基因A的全球發(fā)生頻率為69.3%, 歐洲人群接近全球水平(69.2%),亞洲人群中A的分布頻率達到70%,而在東亞人群中為50%,本研究結(jié)果顯示,漢族人群中等位基因A的分布頻率為30.87%,遠低于與亞洲人群及東亞人群中A的分布頻率,這個研究結(jié)果可能是因為跨地域人群的差異導致,也正體現(xiàn)了海南漢族人群在rs854565的多態(tài)性的進化上相對獨立;也可能是樣本量太小導致,可以擴大樣本量進行驗證。相關(guān)學者[22-23]通過對rs854565等位點研究發(fā)現(xiàn),血清對氧磷酶活性與PON基因簇中的變異和阿爾茨海默氏病及散發(fā)性ALS的發(fā)病率均有所關(guān)聯(lián)。Kim等[24]相關(guān)研究表明,在西雅圖人群中PON基因簇中rs2074354和rs3917538在內(nèi)的PON基因雖可預測PON1活性,但不能預測血管疾病。
綜上所述,本研究結(jié)果顯示,rs2074354、rs3917538、rs8545653這3個位點與海南ASCI的關(guān)聯(lián)性較弱。研究人群的選擇和樣本量的大小可能會影響本研究結(jié)果,對于這些問題,將在今后的研究中使用更大的樣本量對多項研究結(jié)果進行匯總分析。因此,在后續(xù)的研究中可以考慮納入更多的樣本及更多的多態(tài)性位點進行檢測,以期尋找ASCI的易感位點,為ASCI的診斷、防治提供參考依據(jù)。