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    腦血管病生物樣本庫(kù)建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)研究

    2021-05-29 03:25:10林金嬉梁憲紅李上智劉麗孟霞王伊龍王擁軍
    中國(guó)卒中雜志 2021年5期
    關(guān)鍵詞:腦血管病樣本生物

    林金嬉,梁憲紅,李上智,劉麗,孟霞,王伊龍,王擁軍,4

    腦血管病因高發(fā)病率、高致殘率、高復(fù)發(fā)率、高死亡率已成為世界范圍內(nèi)第二大死亡原因[1]。作為一種可防可治的疾病,現(xiàn)有循證醫(yī)學(xué)證實(shí)有效的藥物幾乎均被國(guó)外企業(yè)壟斷。我國(guó)是一個(gè)疾病資源大國(guó),有充足的病例資源,但腦血管病領(lǐng)域的藥物研發(fā)卻很薄弱,亟待提高。

    生物樣本庫(kù)又稱生物銀行,是指在符合醫(yī)學(xué)倫理原則及患者知情同意的基礎(chǔ)上,標(biāo)準(zhǔn)化收集、處理、儲(chǔ)存、應(yīng)用健康和疾病生物體的樣本以及與這些生物樣本相關(guān)的臨床、治療、隨訪等資料的質(zhì)量控制、信息管理與應(yīng)用系統(tǒng)。生物樣本庫(kù)融合了生物樣本衍生的各類分子數(shù)據(jù)及相關(guān)臨床表型、輔助檢查及治療轉(zhuǎn)歸的綜合信息,對(duì)于開展人類疾病預(yù)測(cè)、診斷、治療及新藥研發(fā)等領(lǐng)域的研究具有重要意義[2]。近年來(lái),隨著分子遺傳學(xué)等現(xiàn)代生物技術(shù)的快速發(fā)展,國(guó)內(nèi)外對(duì)于人類遺傳資源的保護(hù)與開發(fā)呈快速增長(zhǎng)趨勢(shì),各國(guó)都投入了大量資金建立大型生物樣本庫(kù),如英國(guó)生物樣本數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了英國(guó)約50萬(wàn)例志愿者的疾病和生活方式信息及基因型數(shù)據(jù),中國(guó)嘉道理生物樣本庫(kù)于2004-2008年在10個(gè)地理區(qū)域收集了約50萬(wàn)人次的健康數(shù)據(jù)及血液樣本。我國(guó)早在1994年就啟動(dòng)了中華民族永生細(xì)胞庫(kù)的建設(shè),而后北京重大疾病臨床數(shù)據(jù)與樣本資源庫(kù)、泰州(復(fù)旦)健康科學(xué)研究院、上海芯超生物銀行等專項(xiàng)生物標(biāo)本資源庫(kù)也相繼建立。

    盡管生物樣本庫(kù)的建設(shè)蓬勃發(fā)展,然而操作規(guī)范不統(tǒng)一、質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)不同、數(shù)據(jù)格式不一致等問(wèn)題,成為許多生物樣本庫(kù)資源開發(fā)利用的瓶頸。本項(xiàng)目通過(guò)首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院生物樣本庫(kù)建設(shè)模式,探討如何建立高質(zhì)量的生物樣本庫(kù),以規(guī)范化采集、保存、使用生物樣本信息和數(shù)據(jù),從而促進(jìn)科研效率的提高。本研究生物樣本庫(kù)建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)作為國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)專項(xiàng)——腦血管疾病專病隊(duì)列研究的組成部分,立足于腦血管病精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究的需要,為腦血管病精準(zhǔn)預(yù)防和診治研究提供可開放、共享的生物樣本資源采集、存儲(chǔ)及管理的標(biāo)準(zhǔn)化方案和平臺(tái)支撐。

    1 對(duì)象與方法

    1.1 確定腦血管病生物樣本庫(kù)采集信息流程及內(nèi)容 通過(guò)文獻(xiàn)復(fù)習(xí)及專家咨詢法等定性研究方法確認(rèn)腦血管病臨床研究病例信息及生物樣本采集流程及內(nèi)容。

    1.1.1 文獻(xiàn)復(fù)習(xí) 通過(guò)文獻(xiàn)復(fù)習(xí)學(xué)習(xí)我國(guó)相關(guān)法律法規(guī)[3-5],查詢國(guó)際、國(guó)內(nèi)生物樣本庫(kù)建設(shè)現(xiàn)狀及相關(guān)規(guī)范[6-9],了解國(guó)內(nèi)外關(guān)于腦血管病臨床研究采集信息及生物樣本的內(nèi)容[10-12],確定腦血管病生物樣本庫(kù)指標(biāo)體系。經(jīng)過(guò)文獻(xiàn)研究后確定的初步生物樣本庫(kù)指標(biāo)體系包括:①硬件指標(biāo):建設(shè)生物樣本庫(kù)硬件設(shè)施要求,如環(huán)境條件、動(dòng)力供給、設(shè)備設(shè)施、信息平臺(tái)建設(shè)等;②臨床信息指標(biāo):腦血管病臨床研究應(yīng)采集的流行病學(xué)信息、通用數(shù)據(jù)元、專病數(shù)據(jù)元等;③樣本采集信息指標(biāo):符合腦血管病臨床研究需求的生物樣本種類、數(shù)量、處理方法等。

    1.1.2 專家咨詢 遴選國(guó)內(nèi)腦血管病診斷與治療方面的神經(jīng)科學(xué)、流行病學(xué)、社會(huì)學(xué)、康復(fù)醫(yī)學(xué)、檢驗(yàn)學(xué)等學(xué)科的專家,篩選適合中國(guó)國(guó)情的腦血管病臨床研究生物樣本庫(kù)采集內(nèi)容,制定規(guī)范化的樣本采集處理種類、流程、方法及配套信息。

    1.2 參考國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)文件建設(shè) 通過(guò)整理吸納世界衛(wèi)生組織、國(guó)際生物與環(huán)境樣本庫(kù)協(xié)會(huì)關(guān)于生物樣本庫(kù)的最佳實(shí)踐指南意見,根據(jù)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織(International Organization for Standardization,ISO)的ISO9001的標(biāo)準(zhǔn)化思路,建立質(zhì)量手冊(cè)、程序、標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序、表格與記錄等,構(gòu)建生物樣本庫(kù)建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)框架,重點(diǎn)從場(chǎng)地設(shè)施、設(shè)備、操作規(guī)程、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、信息化等多個(gè)維度,對(duì)樣本庫(kù)的建設(shè)提出技術(shù)要求[13-16]。

    質(zhì)量手冊(cè):制定生物樣本庫(kù)的質(zhì)量方針和質(zhì)量目標(biāo),并對(duì)質(zhì)量管理體系提出具體要求,適用于生物樣本庫(kù)的全面質(zhì)量管理工作。

    程序文件:程序文件作為質(zhì)量手冊(cè)的支持性文件,是生物樣本庫(kù)質(zhì)量管理體系文件的重要組成部分,是質(zhì)量手冊(cè)中涉及要素的具體描述,也是生物樣本庫(kù)質(zhì)量的基本準(zhǔn)則。

    標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序:根據(jù)質(zhì)量手冊(cè)要求制定的標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序,是經(jīng)過(guò)不斷實(shí)踐總結(jié)出來(lái)的在當(dāng)前條件下可以實(shí)現(xiàn)的最優(yōu)化操作程序設(shè)計(jì),是質(zhì)量手冊(cè)的重要支持性文件。標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序闡述生物樣本庫(kù)工作過(guò)程中的規(guī)范性操作要求,是指導(dǎo)相關(guān)工作人員進(jìn)行工作實(shí)施的必要文件,對(duì)生物樣本庫(kù)質(zhì)量管理和工作開展具有重要的指導(dǎo)作用。

    表格與記錄:記錄各項(xiàng)工作執(zhí)行及落實(shí)過(guò)程,以便及時(shí)發(fā)現(xiàn)不符合項(xiàng)并進(jìn)行糾正和預(yù)防。

    1.3 實(shí)驗(yàn)研究 結(jié)合腦血管病特征搭建專病生物樣本庫(kù)資源體系,包括腦血管生物樣本庫(kù)的運(yùn)行管理體系、腦血管病生物樣本庫(kù)硬件設(shè)施及信息平臺(tái)、腦血管生物樣本庫(kù)的標(biāo)準(zhǔn)操作流程及按照標(biāo)準(zhǔn)操作流程開展研究課題的生物樣本采集、質(zhì)量控制、保藏及應(yīng)用。

    1.4 資源共享 建立腦血管病生物樣本庫(kù)共享機(jī)制,由使用者提出需求,經(jīng)專家委員會(huì)論證科學(xué)性及可行性,統(tǒng)一規(guī)劃使用方案。樣本檢測(cè)數(shù)據(jù)歸檔大數(shù)據(jù)部,依據(jù)國(guó)家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心資源共享管理辦法進(jìn)行開放共享。

    2 結(jié)果

    作為腦血管病臨床研究的重要支撐平臺(tái),天壇腦血管病生物樣本庫(kù)在符合國(guó)家相關(guān)法律法規(guī)前提下,已完成建設(shè)規(guī)范、建設(shè)配置及資源利用等運(yùn)行管理制度、質(zhì)量管理體系、硬件投入及軟件開發(fā)等工作。

    2.1 腦血管病生物樣本庫(kù)建設(shè)規(guī)范

    2.1.1 獲得生物樣本庫(kù)建設(shè)資質(zhì) 根據(jù)《中華人民共和國(guó)人類遺傳資源管理?xiàng)l例》規(guī)定,為了有效保護(hù)和合理利用我國(guó)人類遺傳資源,維護(hù)公眾健康、國(guó)家安全和社會(huì)公共利益,采集、保藏、利用、對(duì)外提供我國(guó)人類遺傳資源,應(yīng)當(dāng)遵守本條例[2]。天壇腦血管病生物樣本庫(kù)于2016年7月獲得中國(guó)人類遺傳資源管理辦公室審批(國(guó)科遺辦審字[2016]90號(hào))。

    2.1.2 形成腦血管病樣本庫(kù)運(yùn)行管理體系 天壇腦血管病生物樣本庫(kù)運(yùn)行實(shí)行法人負(fù)責(zé)制下的團(tuán)隊(duì)協(xié)作運(yùn)行機(jī)制。在天壇醫(yī)院學(xué)術(shù)委員會(huì)及倫理委員會(huì)的監(jiān)督指導(dǎo)下,由項(xiàng)目執(zhí)行團(tuán)隊(duì)協(xié)調(diào)各職能部門(主要包括臨床研究部門及生物樣本庫(kù))合作的運(yùn)行管理模式,以保障項(xiàng)目順利進(jìn)展。其中臨床研究部門負(fù)責(zé)臨床研究方案的制定、項(xiàng)目實(shí)施、臨床資料采集、質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)管理;樣本庫(kù)協(xié)同臨床研究部門完成研究項(xiàng)目具體執(zhí)行。樣本庫(kù)專屬工作人員共7名,明確職責(zé)、專人專崗,分別承擔(dān)運(yùn)行管理、技術(shù)主管、數(shù)據(jù)主管、質(zhì)控主管及技術(shù)員等工作。明確樣本庫(kù)各環(huán)節(jié)工作崗位及職責(zé),并對(duì)相關(guān)工作人員進(jìn)行定期的技術(shù)及管理章程培訓(xùn)(圖1)。

    圖1 北京天壇腦血管病生物樣本庫(kù)運(yùn)行管理體系

    2.1.3 建立腦血管病生物樣本庫(kù)質(zhì)量管理體系參照ISO9001標(biāo)準(zhǔn)建立腦血管病生物樣本庫(kù)質(zhì)量管理體系,包括樣本庫(kù)質(zhì)量手冊(cè)、程序文件、標(biāo)準(zhǔn)操作流程(圖2),以及各種表格記錄。質(zhì)量管理體系涵蓋生物樣本采集、處理、存儲(chǔ)、廢棄、轉(zhuǎn)運(yùn)全周期標(biāo)準(zhǔn)操作流程,已形成70余份標(biāo)準(zhǔn)文件(表1)。通過(guò)試運(yùn)行及修改調(diào)整,天壇腦血管病生物樣本庫(kù)已于2019年通過(guò)ISO9001認(rèn)證。

    2.2 腦血管病生物樣本庫(kù)建設(shè)配置 天壇腦血管病生物樣本庫(kù)已完成環(huán)境及軟、硬件配置投入,包括生物樣本庫(kù)處理、保存等基礎(chǔ)設(shè)備、設(shè)施,生物樣本出入庫(kù)管理系統(tǒng),存儲(chǔ)設(shè)備溫度遠(yuǎn)程監(jiān)控系統(tǒng)等。

    2.2.1 硬件投入 硬件設(shè)施包括工作環(huán)境及硬件設(shè)備。工作環(huán)境:自2009年10月啟動(dòng),逐步增加硬件設(shè)備投入,以滿足支撐課題生物樣本處理及保藏等需求。目前一期占地面積200 m2,二期擴(kuò)建占地面積500 m2,最大容量可放置140臺(tái)超低溫冰箱保存設(shè)備,預(yù)計(jì)2021年6月投入使用。硬件設(shè)備:一期已投入樣本處理設(shè)備、樣本質(zhì)控設(shè)備、樣本保藏設(shè)備、全血自動(dòng)分裝儀、自動(dòng)核酸提取儀等(表2)。所有低溫保存設(shè)備實(shí)現(xiàn)云平臺(tái)實(shí)時(shí)監(jiān)控其溫度變化,以保障樣本保存條件穩(wěn)定。

    2.2.2 軟件開發(fā) 通過(guò)一系列的平臺(tái)建設(shè)工作,開發(fā)了腦血管病生物樣本管理軟件,通過(guò)樣本登記、空間定位、入庫(kù)、出庫(kù)、轉(zhuǎn)移、預(yù)警、查詢、統(tǒng)計(jì)等功能,對(duì)每一份樣本的儲(chǔ)存情況、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等進(jìn)行嚴(yán)格的數(shù)據(jù)化管理,保障信息資源的完整性、真實(shí)性、可靠性及可溯源性(圖3)。對(duì)標(biāo)本采集前后進(jìn)行詳細(xì)信息的登記,包括樣本提供者自然信息、標(biāo)本處理信息、標(biāo)本使用信息等;信息采用統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)格式、可長(zhǎng)期保存并多層面使用,并及時(shí)更新、檢查、保護(hù)。樣本數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化、完整、高質(zhì)量,并可通過(guò)唯一標(biāo)識(shí)碼實(shí)現(xiàn)與臨床數(shù)據(jù)信息、隨訪信息及統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)處理軟件穩(wěn)定轉(zhuǎn)換。

    圖2 北京天壇腦血管病生物樣本庫(kù)標(biāo)本處理標(biāo)準(zhǔn)操作流程

    2.2.3 信息整合 生物樣本相關(guān)采集、處理、保藏及檢測(cè)數(shù)據(jù)均反饋至國(guó)家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心大數(shù)據(jù)中心,結(jié)合腦血管病臨床研究信息采集平臺(tái)所收集的項(xiàng)目臨床數(shù)據(jù),形成腦血管病臨床研究全面信息整合資源,用于開展腦血管病臨床及多組學(xué)研究。

    表1 北京天壇腦血管病生物樣本庫(kù)質(zhì)量管理體系標(biāo)準(zhǔn)化文件

    2.3 腦血管病生物樣本庫(kù)在庫(kù)資源及產(chǎn)出 自2009年10月腦血管病生物樣本庫(kù)建成,截至目前已支撐腦血管病臨床研究22項(xiàng),收集腦血管病病例生物樣本10.5萬(wàn)人次,涵蓋多樣化的生物樣本,如血清、血漿、白細(xì)胞、DNA等,合計(jì)104萬(wàn)余份。經(jīng)過(guò)前期積累,自2012年起使用在庫(kù)樣本開展的腦血管病研究成果,先后于JAMA、Neurology、Stroke等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表15篇SCI文章,成為一個(gè)集臨床數(shù)據(jù)與生物樣本于一體的科研資源平臺(tái)(圖4)[17-31]。

    3 討論

    腦血管病作為一種異質(zhì)性很強(qiáng)的臨床綜合征,不同地域、不同民族之間存在較大差異,因此,有必要開發(fā)適合研究我國(guó)腦血管病人群遺傳與代謝特點(diǎn)、以病因?qū)W分型為基礎(chǔ)的創(chuàng)新藥物臨床信息與標(biāo)本資源庫(kù)平臺(tái),這必將縮短樣本收集時(shí)間,降低科研成本,為開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究、藥物開發(fā)與評(píng)價(jià)研究提供資源平臺(tái)。

    表2 北京天壇腦血管病生物樣本庫(kù)主要設(shè)備清單

    圖3 北京天壇腦血管病生物樣本庫(kù)信息管理平臺(tái)

    圖4 北京天壇醫(yī)院腦血管病樣本庫(kù)在庫(kù)資源概要

    許多國(guó)家都在卒中登記的基礎(chǔ)上,進(jìn)行了生物樣本庫(kù)的建立。如美國(guó)心臟病協(xié)會(huì)的“卒中——跟著指南走”項(xiàng)目,加拿大疾病預(yù)防與控制中心的國(guó)家急性卒中登記研究以及美國(guó)國(guó)立神經(jīng)疾病與卒中研究院的急性卒中專項(xiàng)轉(zhuǎn)化型研究項(xiàng)目,均已經(jīng)或正在建立各自的臨床數(shù)據(jù)庫(kù)以及影像中央數(shù)據(jù)庫(kù)。國(guó)內(nèi)北京大學(xué)基于TOAST分型在房山社區(qū)建立了卒中登記。由于國(guó)家登記為多中心登記,因此,如何將臨床信息、樣本信息以及影像信息通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化的規(guī)則進(jìn)行收集與保存成為各國(guó)資源樣本庫(kù)所面臨的挑戰(zhàn)。

    目前,國(guó)內(nèi)外腦血管病生物樣本庫(kù)主要存在以下不足:①人群異質(zhì)性:如缺血性卒中為一種受多因素影響的綜合征,對(duì)其進(jìn)行正確的分型是指導(dǎo)規(guī)范化治療的基礎(chǔ),既往許多研究因未考慮不同缺血性卒中發(fā)病機(jī)制的異質(zhì)性特征,導(dǎo)致研究結(jié)果的不穩(wěn)定。②缺乏臨床和科研信息統(tǒng)一的數(shù)據(jù)收集系統(tǒng):既往生物樣本庫(kù)多是為科研而專門制作的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng),這種做法的弊端,一是收集的信息不夠全面,收集的多是特定研究指定的信息,忽略了大量的臨床信息,使得數(shù)據(jù)庫(kù)更進(jìn)一步的科研價(jià)值降低;另外一個(gè)弊端是方法學(xué)不當(dāng),僅僅為了科研而收集數(shù)據(jù),必須投入專門的人力物力,使得收集數(shù)據(jù)的難度增加,成本加大,數(shù)據(jù)難以自然增長(zhǎng)。③缺乏將臨床信息、樣本信息與影像信息整合的統(tǒng)一數(shù)據(jù)庫(kù):目前許多生物樣本庫(kù)未能將臨床、樣本與影像信息有機(jī)整合,因此缺乏進(jìn)一步高水平研究的資料,如無(wú)法將各種臨床表型和相應(yīng)的標(biāo)本資料獲得的基因型進(jìn)行有效的關(guān)聯(lián)研究。

    本研究中,天壇腦血管病生物樣本庫(kù)作為北京天壇醫(yī)院腦血管病臨床研究平臺(tái)的支撐部門之一,與臨床研究數(shù)據(jù)平臺(tái)緊密結(jié)合,一方面利用臨床病例系統(tǒng)整合收集科研數(shù)據(jù)的方法,不僅可以使科研數(shù)據(jù)收集更容易在臨床病例的常規(guī)收錄工作中實(shí)現(xiàn),更重要的是為科研病歷提供了詳細(xì)的臨床診斷、治療、隨訪過(guò)程等資料,使數(shù)據(jù)庫(kù)價(jià)值大大增加;同時(shí)基于規(guī)范的臨床數(shù)據(jù)及生物樣本采集管理機(jī)制、嚴(yán)格的質(zhì)量控制體系及標(biāo)準(zhǔn)的超低溫保存條件,建立涵蓋生物樣本采集、處理、存儲(chǔ)、廢棄、轉(zhuǎn)運(yùn)全周期標(biāo)準(zhǔn)操作流程,提升了腦血管病多中心研究中各分中心生物樣本資源采集處理水平,收集了以多中心研究項(xiàng)目為主的生物樣本資源,推動(dòng)了腦血管病多組學(xué)研究的發(fā)展,并促進(jìn)了科研產(chǎn)出效率。目前,利用在庫(kù)生物樣本資源,已發(fā)表15篇SCI文章,對(duì)腦血管病個(gè)體化治療方案的制定及復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估等做出重要貢獻(xiàn)[17-31]。

    ISO9001認(rèn)證并非生物樣本庫(kù)專用質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)體系,隨著生物樣本庫(kù)建設(shè)的蓬勃發(fā)展,國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織于2018年8月正式發(fā)布了第一項(xiàng)生物樣本庫(kù)認(rèn)可體系——生物樣本庫(kù)通用要求(ISO20387)。該體系規(guī)定了生物樣本庫(kù)能力、公正性、持續(xù)運(yùn)行(含質(zhì)量控制)的通用要求,為生物樣本庫(kù)的建設(shè)提供了更適合的參考標(biāo)準(zhǔn)和技術(shù)規(guī)范。我國(guó)也自2019年8月30日起實(shí)施《生物樣本庫(kù)質(zhì)量和能力通用要求》(GB/T37864-2019,等同ISO20387),目前正在逐步落實(shí)過(guò)程中。隨著天壇腦血管病生物樣本庫(kù)于2020年升級(jí)為院級(jí)生物樣本庫(kù),未來(lái)將涉及多病種、多種類生物樣本的處理及保藏工作,下一步將參照GB/T37864-2019標(biāo)準(zhǔn),進(jìn)一步完善質(zhì)量管理體系運(yùn)行,保障樣本質(zhì)量、促進(jìn)資源開發(fā)。

    【點(diǎn)睛】規(guī)范化的腦血管病生物樣本庫(kù)能打造集臨床數(shù)據(jù)與生物樣本于一體的資源管理平臺(tái),基于規(guī)范的臨床數(shù)據(jù)及生物樣本采集管理機(jī)制、嚴(yán)格的質(zhì)量控制體系及標(biāo)準(zhǔn)的超低溫保存條件,充分利用腦血管病臨床資源,實(shí)現(xiàn)資源的有效整合、管理和共享。

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