浙江中醫(yī)藥大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 杭州 310053
膠質(zhì)瘤是最常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(central nervous system,CNS)原發(fā)性惡性腫瘤之一,約占所有顱內(nèi)腫瘤的40%[1]。目前臨床上普遍采用腫瘤切除和輔助放化療的治療方案。替莫唑胺(Temozolomide,TMZ)是公認的治療膠質(zhì)瘤的一線化療藥物,但有相當一部分患者會對TMZ表現(xiàn)出不同程度的原發(fā)性和獲得性耐藥,最終導(dǎo)致化療失敗[2]。
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是長度大于200nt的非編碼RNA,又稱長非編碼RNA。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA在癌癥的多種生物學(xué)行為中扮演重要角色,能夠影響癌癥的發(fā)展和走向[3-4]。近年來研究證實,部分lncRNA與膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān),可發(fā)揮抑癌基因的作用[5];還有一些lncRNA的表達與膠質(zhì)瘤的化療耐藥及預(yù)后密切相關(guān)[6-7]。相關(guān)研究已證實,lncRNA FoxD2-AS1基因參與膠質(zhì)瘤的發(fā)生和發(fā)展,以O(shè)6-甲基鳥嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(methylation ofO6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)依賴的方式促進膠質(zhì)瘤TMZ耐藥,可作為膠質(zhì)瘤的預(yù)后因子[8]。
近年來,中藥因其不良反應(yīng)小、療效明確的優(yōu)點備受關(guān)注。莪術(shù)醇(curcumol)是中藥莪術(shù)揮發(fā)油中提取的有效單體成分,具有抗菌、抗炎、抗腫瘤、抗病毒等功效[9-10]。研究證實,莪術(shù)醇能夠顯著抑制膠質(zhì)瘤細胞生長并促進凋亡[11]。
基于此,本研究在體外培養(yǎng)膠質(zhì)瘤耐藥細胞A172/TMZ和U251/TMZ,探究lncRNA FoxD2-AS1在膠質(zhì)瘤細胞TMZ耐藥過程中的作用,并檢測不同濃度莪術(shù)醇對耐藥細胞內(nèi)FoxD2-AS1含量的影響,探究莪術(shù)醇與膠質(zhì)瘤TMZ耐藥以及FoxD2-AS1表達的相關(guān)性。
1.1 材料
1.1.1 細胞株和短片斷干擾RNA(small interfering RNA,siRNA) 人腦膠質(zhì)瘤細胞系U251、A172均購于美國模式培養(yǎng)物集存庫(American Type Culture Collection,ATCC)。si-FOXD2-AS1由百奧生物技術(shù)有限公司合成,siRNA序列:上游5′-GCGAAGAGUACGUUGCUAUTT-3′,下 游5′-AUAGCAACG UACUCUUCGCTT-3′。
1.1.2 主要試劑 替莫唑胺、莪術(shù)醇均購于安諾倫生物科技有限公司(貨號:HY-17364/CS-0943、HYN0104);Lipofectamine 2000購于美國Invitrogen公司(批號:2067406);噻唑藍(3-[4,5-dimethylthiazol-2-yl]-2,5-diphenyltetrazolium bromide,MTT) 粉購于Sigma公司(批號:11465007001);達爾伯克改良伊格爾高糖培養(yǎng)基(Dulbecco's modified eagle medium-high glucose,DMEM-HG)購于天津市灝洋生物制品科技有限公司(批號:TBD10569);新生小牛血清購于浙江天杭生物科技股份有限公司(批號:20170106);青-鏈霉素溶液購于吉諾生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司(批號:1812110207);4%多聚甲醛購于廣州賽國生物科技有限公司(批號:1807213);TRIzol試劑購于美國Thermo Fisher公司(批號:135404);異丙醇購于上海麥克林生化科技有限公司(批號:M54318067);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購于TaKaRa公司(批號:A4301-1);RNaseA、UltraSYBR Mixture均購于北京康為世紀生物科技有限公司(批號:50423、30237);細胞凋亡與壞死檢測試劑盒購于上海碧云天生物技術(shù)有限公司(批號:C1056);二甲基亞砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)購于湖北盛齊安生物科技股份有限公司(批號:1129E036)。
1.1.3 主要儀器 TE2000熒光倒置顯微鏡為Nikon公司產(chǎn)品;5541R高速冷凍離心機購于德國Eppendorf公司;SW-CJ-2FD雙人單面垂直凈化工作臺購于蘇凈集團蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司;二氧化碳培養(yǎng)箱、流式細胞儀、熒光定量PCR儀、金屬浴均購于美國Thermo Fisher公司。
1.2 方法
1.2.1 數(shù)據(jù)庫和生物信息學(xué)分析 對來自癌癥和腫瘤基因組圖譜(cancer genome atlas,TCGA)和中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的膠質(zhì)瘤基因表達數(shù)據(jù)進行生物信息學(xué)分析,比較FoxD2-AS1在正常膠質(zhì)細胞與膠質(zhì)瘤組織中的表達量。采用Kaplan-Meier法計算生存率,以logrank檢驗生存率差異。
1.2.2 耐藥細胞系的建立 經(jīng)脈沖加藥建立A171/TMZ、U251/TMZ耐藥細胞系,構(gòu)建方式采用經(jīng)典的間歇誘導(dǎo)法[12],以MTT法分別檢測U251/TMZ、A172/TMZ及其母本細胞對TMZ的耐藥程度,計算TMZ對各細胞系的半數(shù)抑制濃度(half inhibitory concentration,IC50)。
1.2.3 脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染 分別用無血清無雙抗培養(yǎng)基稀釋脂質(zhì)體和siRNA,輕輕混勻并室溫孵育20min后,將混合物加入耐藥細胞的培養(yǎng)孔中,于培養(yǎng)箱中培養(yǎng)4~6h后,將培養(yǎng)基換為正常DMEM培養(yǎng)基,將該組別設(shè)置為siRNA干擾組。另設(shè)置轉(zhuǎn)染陰性對照siRNA的陰性對照組作為對照。
1.2.4 實時熒光定量聚合酶鏈式反應(yīng)(Real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)檢測轉(zhuǎn)染效率 實驗分為陰性對照組(轉(zhuǎn)染陰性對照siRNA)、siRNA干擾組(轉(zhuǎn)染FoxD2-AS1基因siRNA)。使用TRIzol提取RNA,檢測RNA純度后,進行逆轉(zhuǎn)錄,得到cDNA產(chǎn)物。根據(jù)試劑盒說明書進行RT-qPCR反應(yīng),以β-actin為內(nèi)參,測定lncRNA FoxD2-AS1在膠質(zhì)瘤耐藥細胞中的表達水平。反應(yīng)體系如下:cDNA 1μL,2×UltraSYBR Mixture 12.5μL,正反向引物各1μL,ddH2O 9.5μL,總計50μL。反應(yīng)條件如下:95°C預(yù)變 性 10min;95°C 15s,60°C 1min,35個循環(huán);95°C 15s,60°C 1min,95°C 15s,60°C 15s。采用2-△△Ct法計算FoxD2-AS1表達水平。
1.2.5 流式細胞儀檢測細胞凋亡 收集siRNA干擾組和陰性對照組細胞,以5×104個細胞/孔的數(shù)量接種于24孔板,分別以0、20、40mg·mL-1的TMZ處理48h。胰酶消化后收集細胞,分別加入碘化丙啶(propidium iodide,PI)/Annexin Ⅴ,室溫避光染色15min,流式細胞儀檢測細胞凋亡。
1.2.6 流式細胞儀檢測細胞周期 收集處于對數(shù)生長期的耐藥細胞,加入預(yù)冷的70%乙醇,4°C固定過夜,棄去上清液,以磷酸緩沖鹽溶液(phosphate buffer saline,PBS)洗滌2次,離心5min,棄去上清液。每管細胞樣品分別加入染色緩沖液500μL、1mg·mL-1的RNaseA溶液7.5μL和PI染液3μL后,避光37°C金屬浴30min,上機檢測A172/TMZ和U251/TMZ耐藥細胞的細胞周期分布。
1.2.7 藥物相互作用分析 取對數(shù)生長期的兩種耐藥細胞,調(diào)整細胞密度為5×104個/mL,吸取100μL細胞至96孔板中,培養(yǎng)6h后,計算TMZ和莪術(shù)醇的IC50值,得出TMZ的IC50是69μg·mL-1,莪術(shù)醇的IC50是89μg·mL-1,TMZ和莪術(shù)醇的濃度設(shè)置均為其IC50的0、1/8、1/4、1/2、1。固定TMZ的濃度為0、8.625、17.25、34.5、69μg·mL-1,分別與不同濃度的莪術(shù)醇組合處理耐藥細胞,每組分別進行3次實驗并取平均值,確定量效曲線。采用相互作用指數(shù)(combination index,CI)來判斷兩藥聯(lián)用效果,CI=莪術(shù)醇在混合藥物中的IC50/莪術(shù)醇單獨IC50+TMZ在混合藥物中的IC50/TMZ單獨IC50。若CI>1則說明兩藥拮抗,若CI=1說明兩藥相加,若CI<1則說明兩藥有協(xié)同作用。
1.2.8 Hoechst染色觀察不同濃度莪術(shù)醇和TMZ對兩種耐藥細胞形態(tài)的影響 研究共分6組:A組(空白對照組)為不加藥的耐藥細胞;B組為10μg·mL-1莪術(shù)醇組;C組為40μg·mL-1莪術(shù)醇組;D組為40μg·mL-1TMZ組;E組為10μg·mL-1莪術(shù)醇和40μg·mL-1TMZ組;F組為40μg·mL-1莪術(shù)醇和40μg·mL-1TMZ組。吸盡培養(yǎng)基,加0.5mL固定液固定20min。PBS洗滌2~3次,加入染色液300μL/孔,染色15min,PBS洗滌2~3次,最后在紫外線(ultraviolet,UV)下鏡檢觀察。
1.2.9 RT-qPCR測定莪術(shù)醇對耐藥細胞的FoxD2-AS1含量的影響 研究分為6組:不加莪術(shù)醇的兩種膠質(zhì)瘤耐藥細胞作為對照組;不同濃度莪術(shù)醇(20、40μg·mL-1)分別處理的U251/TMZ和A172/TMZ耐藥細胞,處理24、48、72h后,收集細胞,進行總RNA提取和cDNA合成,根據(jù)RT-qPCR試劑盒說明書進行PCR反應(yīng),以β-actin為內(nèi)參,以PCR儀進行定量分析,方法同1.2.4。采用2-△△Ct法計算FoxD2-AS1表達水平。將PCR結(jié)果中2-ΔΔCt值>2的組別設(shè)為FoxD2-AS1高表達組,而2-ΔΔCt值≤2為非FoxD2-AS1高表達組。
1.3 統(tǒng)計學(xué)分析 采用SPSS 22.0統(tǒng)計軟件和Graph-Pad Prism 8.0繪圖軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,計量資料以±s表示,兩組間比較采用t檢驗,多組間比較采用單因素方差分析。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 FoxD2-AS1基因表達與患者預(yù)后的關(guān)系 通過GraphPad Prism軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn),與正常膠質(zhì)細胞比較,F(xiàn)oxD2-AS1在低級別膠質(zhì)瘤組織中高表達(P<0.01),在多形惡性神經(jīng)膠質(zhì)瘤組織中極高表達(P<0.001);與低級別膠質(zhì)瘤比較,F(xiàn)oxD2-AS1在多形惡性神經(jīng)膠質(zhì)瘤組織中高表達(P<0.01)。CGGA庫數(shù)據(jù)分析顯示,多形惡性神經(jīng)膠質(zhì)瘤FoxD2-AS1表達量顯著高于低級別膠質(zhì)瘤(P<0.001)和血管中心型膠質(zhì)瘤(P<0.01)。見圖1A和B。
CGGA數(shù)據(jù)進一步分析顯示,F(xiàn)oxD2-AS1表達量高的患者總生存率低,F(xiàn)oxD2-AS1表達量低的患者生存率較高。見圖1C。RT-qPCR結(jié)果表明,膠質(zhì)瘤細胞中FoxD2-AS1的表達量均高于正常膠質(zhì)細胞(P<0.05,P<0.01),且耐藥細胞中FoxD2-AS1的表達量顯著高于母本細胞(P<0.05,P<0.01)。見圖1D。以上結(jié)果提示,F(xiàn)oxD2-AS1的表達與膠質(zhì)瘤發(fā)病及患者預(yù)后密切相關(guān)。
圖1 FoxD2-AS1與膠質(zhì)瘤的關(guān)系Fig.1 Relationship between FoxD2-AS1 and glioma
2.2 FoxD2-AS1的表達對膠質(zhì)瘤細胞TMZ耐藥的影響 與同種細胞的陰性對照組比較,20、40μg·mL-1的TMZ誘導(dǎo)后,siRNA干擾組細胞的凋亡率顯著提高(P<0.05,P<0.01)。見表1。暗示FoxD2-AS1的表達與膠質(zhì)瘤細胞TMZ耐藥相關(guān)。
表1 FoxD2-AS1表達對A172/TMZ和U251/TMZ耐藥細胞凋亡的影響(±s,%)Tab.1 Expression of FoxD2-AS1 on apoptosis of A172/TMZ and U251/TMZ cells(±s,%)
表1 FoxD2-AS1表達對A172/TMZ和U251/TMZ耐藥細胞凋亡的影響(±s,%)Tab.1 Expression of FoxD2-AS1 on apoptosis of A172/TMZ and U251/TMZ cells(±s,%)
注:與A172/TMZ細胞陰性對照組比較,*P<0.05,**P<0.01;與U251/TMZ細胞陰性對照組比較,△P<0.05Note:Compared with negative control group of A172/TMZ cells,*P<0.05,**P<0.01;compared with negative control group of U251/TMZ cells,△P<0.05
A172/TMZ細胞TMZ 濃度(μg·mL-1)U251/TMZ細胞陰性對照組 siRNA干擾組 陰性對照組 siRNA干擾組0 5.71±0.98 5.58±0.92 5.03±0.97 4.01±1.09△20 7.30±0.48 18.00±2.36* 9.75±1.40 12.71±1.07△40 12.77±1.54 25.20±1.47** 17.54±1.54 20.42±1.01△
A172/TMZ和U251/TMZ細胞siRNA干擾組處于G0/G1期的細胞比例均低于相應(yīng)的陰性對照組,而處于S期和G2/M期的細胞比例明顯高于陰性對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,P<0.01)。見圖2。
圖2 A172/TMZ、U251/TMZ陰性對照組和siRNA干擾組細胞周期比較Fig.2 Comparison of cell cycle of A172/TMZ and U251/TMZ cell in negative control group and siRNA interference group
2.3 莪術(shù)醇逆轉(zhuǎn)膠質(zhì)瘤TMZ化療耐藥 聯(lián)合實驗結(jié)果表明,莪術(shù)醇在0~90μg·mL-1、TMZ在0~69μg·mL-1的劑量范圍內(nèi),TMZ與莪術(shù)醇合用能顯著抑制膠質(zhì)瘤細胞增殖,并呈現(xiàn)一定的劑量依賴關(guān)系,兩種細胞均有類似現(xiàn)象可初步確定莪術(shù)醇和TMZ具有協(xié)同作用,提示莪術(shù)醇對TMZ耐藥的逆轉(zhuǎn)作用。見圖3。
圖3 莪術(shù)醇和TMZ聯(lián)用的效價圖Fig.3 The titer chart of curcumol in conjunction with TMZ
空白對照組細胞經(jīng)Hoechst染色發(fā)出均勻的淡藍色熒光,細胞核無明顯的凋亡形態(tài)學(xué)變化;用莪術(shù)醇處理細胞,可見細胞密度減少,核染色質(zhì)濃縮聚集、核破碎、核邊集,隨著莪術(shù)醇濃度增加而更加明顯。同時發(fā)現(xiàn)40μg·mL-1莪術(shù)醇+40μg·mL-1TMZ組效果最明顯,可見細胞核發(fā)出較強的藍色熒光,內(nèi)部呈亮白色,表現(xiàn)出細胞凋亡核固縮的典型變化。見圖4。
圖4 不同濃度藥物及聯(lián)合作用下對A172/TMZ細胞凋亡的影響(Hoechst染色,200×)Fig.4 Effects of different concentrations of drugs and combined uses on A172/TMZ cell apoptosis(Hoechst staining,200×)
2.4 莪術(shù)醇對FoxD2-AS1表達的影響 RT-qPCR結(jié)果顯示,在同一時間段里隨著莪術(shù)醇濃度的升高,F(xiàn)oxD2-AS1的相對表達量下降,下降程度呈明顯劑量依賴性(P<0.05,P<0.01);在同一濃度莪術(shù)醇作用下,與培養(yǎng)24h比較,培養(yǎng)48h和72h的細胞FoxD2-AS1的相對表達量下降程度更明顯(P<0.05,P<0.01)。見圖5。結(jié)果表明莪術(shù)醇能夠抑制膠質(zhì)瘤A172/TMZ和U251/TMZ耐藥細胞中FoxD2-AS1的表達,呈現(xiàn)明顯的濃度依賴性,并與作用時間呈正相關(guān)性。
圖5 莪術(shù)醇處理后耐藥細胞內(nèi)FoxD2-AS1含量的變化Fig.5 Changes of FoxD2-AS1 content in resistant cells treated with curcumol
膠質(zhì)瘤是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的原發(fā)性惡性腫瘤,其發(fā)病率、致死率均位于顱內(nèi)腫瘤榜首,患者預(yù)后極差[13]。在膠質(zhì)瘤的臨床治療過程中,TMZ是公認的一線藥物,然而TMZ耐藥極大限制了其治療膠質(zhì)瘤的療效。如何降低耐藥成為臨床治療亟待解決的問題。本研究通過生物信息學(xué)技術(shù)手段,發(fā)現(xiàn)FoxD2-AS1在多形惡性神經(jīng)膠質(zhì)瘤中表達量較高,且高表達FoxD2-AS1的患者總生存率較低,暗示FoxD2-AS1參與不良預(yù)后。通過建立TMZ耐藥細胞系,本研究發(fā)現(xiàn)FoxD2-AS1在TMZ耐藥細胞中高表達,提示FoxD2-AS1的表達可能與膠質(zhì)瘤TMZ耐藥相關(guān)。
中藥是我國傳統(tǒng)文化的瑰寶,尋找新型、高效、低毒的中藥將成為提高腫瘤治療療效的突破口。中醫(yī)理論認為莪術(shù)味辛、苦,性溫,具有行氣破血、消積止痛的功效,而莪術(shù)醇作為莪術(shù)揮發(fā)油中提取的成分,具有抗病毒、抗菌、抗炎、抗腫瘤等生物活性,且能夠?qū)δz質(zhì)瘤細胞增殖起到抑制作用[14-15]。
而隨著高通量技術(shù)的不斷發(fā)展,越來越多的研究證實lncRNA可以在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后、表觀遺傳等方面發(fā)揮重要的生物學(xué)功能,如Gu等[16]報道沉默lncRNA FoxD2-AS1可以通過microRNA-98-5p/胞質(zhì)聚腺苷化元件結(jié)合蛋白4(cytoplasmic polyadenylation element bindingprotein 4,CPEB4)軸促進膠質(zhì)瘤耐藥細胞的凋亡。然而FoxD2-AS1與膠質(zhì)瘤耐藥及莪術(shù)醇之間的關(guān)系目前尚不明確。本實驗結(jié)果表明,干擾FoxD2-AS1后,耐藥細胞凋亡率增高,細胞周期主要停滯在S期和G2/M期,暗示FoxD2-AS1基因可能通過調(diào)控膠質(zhì)瘤細胞的周期和凋亡過程而參與膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展以及TMZ耐藥。大量研究表明,膠質(zhì)瘤TMZ耐藥是多分子參與的復(fù)雜過程[17],目前研究較多的是DNA損傷修復(fù)、多藥耐藥、凋亡通路異常、膠質(zhì)瘤干細胞學(xué)說等[18]。而本研究的結(jié)果提示lncRNA也可能參與了TMZ的耐藥過程。
莪術(shù)醇是莪術(shù)油的抗腫瘤活性成分,在不同腫瘤中均已證實,莪術(shù)醇能夠抑制腫瘤細胞的增殖,還能夠通過激活抑癌基因或抑制原癌基因,抑制腫瘤的發(fā)生發(fā)展,如通過第10號染色體缺失磷酸酶及張力蛋白同源基因/磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(gene of phosphatase and tension homology deleted on chromsometen/phosphatidylinositol3 kinase/protein kinase B,PTEN/PI3K/Akt)途徑降低腫瘤細胞中miR-21的含量,從而起到抑癌作用[19]。莪術(shù)醇還能夠阻滯細胞周期,抑制腫瘤細胞增殖,如研究證實莪術(shù)醇可以通過活性氧和蛋白激酶B/糖原合成酶激酶3β/細胞周期蛋白D1(protein kinase B/glycogen synthase kinase 3β/cyclin D1,Akt/GSK3β/cyclin D1)途徑誘導(dǎo)結(jié)腸癌細胞的細胞周期停滯[20]。本研究發(fā)現(xiàn),莪術(shù)醇處理耐藥細胞后,耐藥細胞內(nèi)FoxD2-AS1的含量明顯下降,且具有濃度和時間依賴性,提示莪術(shù)醇可能通過抑制FoxD2-AS1的表達,從而提高膠質(zhì)瘤耐藥細胞對TMZ的敏感度。實驗證明,莪術(shù)醇能夠抑制不同腫瘤細胞中磷酸化Akt和磷酸化PI3K蛋白的表達[21],由此筆者推測莪術(shù)醇也可能通過Akt/PI3K通路誘導(dǎo)膠質(zhì)瘤細胞凋亡。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)FoxD2-AS1與膠質(zhì)瘤細胞TMZ化療耐藥有關(guān),干擾FoxD2-AS1后可以誘導(dǎo)耐藥細胞周期阻滯,促進細胞凋亡;莪術(shù)醇可通過下調(diào)耐藥細胞中FoxD2-AS1的含量來提高耐藥細胞對TMZ的敏感度。這一發(fā)現(xiàn)為膠質(zhì)瘤TMZ耐藥的臨床治療提供了新思路。