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      生物電鏡觀測(cè)網(wǎng)上預(yù)約追蹤系統(tǒng)的開發(fā)

      2014-02-03 03:14:16王奕文
      實(shí)驗(yàn)室研究與探索 2014年1期
      關(guān)鍵詞:電鏡知識(shí)庫(kù)管理員

      王奕文, 劉 歡, 倪 兵

      (華東師范大學(xué) a.電鏡中心; b.信息化辦公室,上海 200062)

      0 引 言

      華東師范大學(xué)電鏡中心是屬于華東師范大學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)觀察與分析綜合實(shí)驗(yàn)室的服務(wù)測(cè)試平臺(tái),目前中心實(shí)行全委托式服務(wù),這種測(cè)試服務(wù)模式的優(yōu)點(diǎn)就是管理體系簡(jiǎn)單、用戶勞動(dòng)強(qiáng)度低、設(shè)備故障風(fēng)險(xiǎn)小。但是在具體的測(cè)試服務(wù)過(guò)程中其缺點(diǎn)也很明顯,以生物樣品的測(cè)試為例:① 儀器分類多,用戶群體不一,實(shí)驗(yàn)室工作人員勞動(dòng)強(qiáng)度大:電鏡中心目前擁有透射電鏡2臺(tái)、掃描電鏡2臺(tái)及激光共聚焦顯微鏡1臺(tái),共有3位工作人員負(fù)責(zé)。不同儀器的測(cè)試內(nèi)容不同,其操作方式不同,對(duì)于樣品制備的要求也不相同;同時(shí)電鏡中心面向校內(nèi)外提供測(cè)試服務(wù),用戶范圍廣,委托測(cè)試樣品的種類特點(diǎn)各不相同,從而使得實(shí)驗(yàn)室工作人員在最終獲得觀察結(jié)果之前,首先要對(duì)用戶的樣品進(jìn)行甄別判斷,在樣品處理過(guò)程中分別對(duì)待,如固定時(shí)間的長(zhǎng)短、是否需要離心等,增大了工作人員的勞動(dòng)強(qiáng)度。② 時(shí)間周期長(zhǎng),實(shí)驗(yàn)室工作成本較高:用于電鏡觀察的生物樣品,制備過(guò)程繁瑣復(fù)雜,從最初取材部位的選擇,經(jīng)固定漂洗,梯度脫水,到用于透射電鏡觀察的滲透包埋、超薄切片、電子染色,或者用于掃描電鏡觀察的零界點(diǎn)干燥、離子濺射噴鍍,均需要較長(zhǎng)的時(shí)間,而且生物電鏡使用試劑價(jià)格昂貴,消耗量大,所需載網(wǎng)和載物臺(tái)成本均很高[1]。③ 服務(wù)質(zhì)量過(guò)分依賴于工作人員的經(jīng)驗(yàn),用戶的研究效率低:測(cè)試服務(wù)通常由工作人員負(fù)責(zé)電鏡的操作,用戶在有限時(shí)間內(nèi)選取有限數(shù)量的照片,該過(guò)程中拍照位點(diǎn)的選擇主要依賴于工作人員的以往經(jīng)驗(yàn),而用戶則往往缺少相關(guān)知識(shí),要在取回結(jié)果后才能進(jìn)行系統(tǒng)分析,因此一些樣品間的特殊差異和變化可能會(huì)被忽略而造成研究不夠深入,效率低。

      目前電鏡中心采用的預(yù)約方式主要為上門登記和電話預(yù)約,而由于生物樣品處理周期長(zhǎng)、用戶實(shí)驗(yàn)安排不當(dāng)?shù)仍?,很多預(yù)約安排不能嚴(yán)格按照規(guī)定時(shí)間段完成觀察,從而存在預(yù)約混亂的問題;其次用戶在送樣初期,不能充分了解電鏡樣品前處理所需試劑和方法,需要工作人員口頭教授,容易產(chǎn)生溝通不暢,理解錯(cuò)誤的情況,即存在信息傳達(dá)的問題,導(dǎo)致用戶不能正確掌握前處理技術(shù),易造成樣品的損失和電鏡觀察的拖延;另外在工作量審查中,由于用戶對(duì)于樣品處理要求不同,如僅做半薄切片或僅做離子濺射噴鍍,使得工作量記錄瑣碎,不易統(tǒng)計(jì)。

      在信息化發(fā)展日益迅速的今天,華東師范大學(xué)電鏡中心通過(guò)建設(shè)網(wǎng)上預(yù)約追蹤系統(tǒng)和知識(shí)管理庫(kù)系統(tǒng),使電子顯微鏡的管理和測(cè)試工作更為規(guī)范、有序和高效[2-3]。通過(guò)網(wǎng)上預(yù)約追蹤系統(tǒng)和知識(shí)管理庫(kù)系統(tǒng),以期使用戶對(duì)于儀器使用情況、樣品處理方法和結(jié)果分析研究一目了然,高效有序地在這一平臺(tái)上與工作人員和老師同學(xué)互動(dòng),最終實(shí)現(xiàn)儀器的最大化利用,為校內(nèi)外師生提供更為優(yōu)質(zhì)的服務(wù)[4-6]。

      1 系統(tǒng)設(shè)計(jì)

      1.1 預(yù)約追蹤系統(tǒng)的設(shè)計(jì)

      業(yè)務(wù)流程的梳理是本系統(tǒng)設(shè)計(jì)開發(fā)中的重點(diǎn)。清晰合理的流程設(shè)計(jì)能提高預(yù)約追蹤系統(tǒng)的運(yùn)行效率,降低管理人員的工作壓力。根據(jù)電鏡觀測(cè)的線下步驟,梳理并確定了網(wǎng)上預(yù)約追蹤系統(tǒng)的業(yè)務(wù)流程,如圖1所示。

      首先,新用戶登錄本系統(tǒng)時(shí),自行注冊(cè)網(wǎng)站帳戶,該賬戶將作為用戶日后在網(wǎng)站中查詢和管理自己預(yù)約信息的身份依據(jù)。用戶賬戶分為校內(nèi)和校外兩種,以便于在費(fèi)用計(jì)算、工作量考核等情況下能夠?qū)⒉煌瑏?lái)源的數(shù)據(jù)加以區(qū)分。

      圖1 預(yù)約系統(tǒng)業(yè)務(wù)流程

      其次,登錄用戶可以查看電鏡觀測(cè)服務(wù)項(xiàng)目及其狀態(tài)。當(dāng)儀器出現(xiàn)故障無(wú)法正常提供觀測(cè)服務(wù)時(shí),用戶將無(wú)法提交預(yù)約申請(qǐng),但能夠查看儀器故障原因和預(yù)計(jì)恢復(fù)服務(wù)時(shí)間。對(duì)于正常運(yùn)行的服務(wù)項(xiàng)目,用戶能夠以預(yù)約的方式進(jìn)行申請(qǐng)。

      電鏡中心管理人員對(duì)來(lái)自用戶的預(yù)約請(qǐng)求進(jìn)行審核。對(duì)于初次預(yù)約的用戶,由于其身份真實(shí)性不可知,需要由管理人員根據(jù)用戶資料與其聯(lián)系,以確定其身份。管理員根據(jù)用戶預(yù)約申請(qǐng)的樣品名稱、樣品性質(zhì)安排觀測(cè)服務(wù)的時(shí)間表,確定送樣日期。

      用戶按照約定日期送樣以后,根據(jù)服務(wù)日程表,電鏡中心將進(jìn)行樣品的預(yù)處理等工作。在此階段,管理人員將在預(yù)約系統(tǒng)后臺(tái)不斷更新各樣品的處理情況,見圖2。用戶可以登錄自己帳號(hào),動(dòng)態(tài)查詢自己的觀測(cè)服務(wù)信息。除每批樣品的信息外,系統(tǒng)還提供了單個(gè)樣品的信息查詢,用戶可以通過(guò)輸入每個(gè)樣品的編號(hào),精確查詢某個(gè)樣品的處理情況。當(dāng)樣品預(yù)處理結(jié)束后,將進(jìn)入電鏡觀察階段。用戶可以根據(jù)系統(tǒng)提示的預(yù)約日期前往電鏡中心進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)觀察。同時(shí),管理人員也可以通過(guò)將觀察的電子圖片結(jié)果傳送到后臺(tái),用戶不必前往現(xiàn)場(chǎng),即使在遠(yuǎn)程也能夠直接下載獲取觀測(cè)結(jié)果。最后,系統(tǒng)將對(duì)觀測(cè)服務(wù)費(fèi)用進(jìn)行結(jié)算和處理[7]。

      圖2 不同處理階段樣品信息

      1.2 知識(shí)庫(kù)系統(tǒng)設(shè)計(jì)

      由于生物電鏡樣品復(fù)雜且信息量大,在積累豐富經(jīng)驗(yàn)的基礎(chǔ)上進(jìn)行觀測(cè)才能獲得較好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,而預(yù)約用戶往往需要根據(jù)這些經(jīng)驗(yàn)準(zhǔn)備實(shí)驗(yàn)樣品并在現(xiàn)場(chǎng)自主觀察,因此相關(guān)知識(shí)總結(jié)對(duì)于用戶提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的質(zhì)量是非常重要的,有必要建立相應(yīng)的知識(shí)庫(kù)系統(tǒng)作為預(yù)約系統(tǒng)的輔助功能。

      用戶可以在知識(shí)庫(kù)中上傳每次觀測(cè)結(jié)果的收獲和體驗(yàn),甚至是圖片和視頻資料,成為知識(shí)庫(kù)的內(nèi)容貢獻(xiàn)者。同時(shí),也可以搜索和查看知識(shí)庫(kù)中的內(nèi)容,收藏自己感興趣的知識(shí)。整個(gè)知識(shí)庫(kù)類似于小型的維基系統(tǒng)。其中,標(biāo)簽是用戶對(duì)知識(shí)進(jìn)行標(biāo)記的重要功能,有助于用戶快速查找到相關(guān)知識(shí),或是對(duì)知識(shí)進(jìn)行分類管理。標(biāo)簽的熱門程度也能夠體現(xiàn)用戶的關(guān)注焦點(diǎn)。

      1.3 用戶權(quán)限設(shè)計(jì)

      本預(yù)約系統(tǒng)中主要有兩種權(quán)限,分別為管理員和用戶[8]。管理員分為系統(tǒng)管理員和技術(shù)人員兩類,如圖3所示。系統(tǒng)管理員主要對(duì)系統(tǒng)的儀器狀況、服務(wù)內(nèi)容、費(fèi)用情況、用戶列表等信息進(jìn)行維護(hù),并審核來(lái)自用戶的預(yù)約請(qǐng)求。技術(shù)人員在每個(gè)樣品進(jìn)行每一階段的處理后,及時(shí)更新該樣品的狀態(tài);并在電鏡觀察后將圖像結(jié)果進(jìn)行上傳。此外,系統(tǒng)管理員和技術(shù)人員還共同維護(hù)和管理相應(yīng)的知識(shí)庫(kù)系統(tǒng)。

      圖3 預(yù)約系統(tǒng)管理權(quán)限

      用戶主要包括校內(nèi)和校外兩種,以便于測(cè)試費(fèi)用的分別處理。用戶的權(quán)限包括提交預(yù)約申請(qǐng),動(dòng)態(tài)查詢服務(wù)信息,使用知識(shí)庫(kù)系統(tǒng)等。

      1.4 移動(dòng)設(shè)備優(yōu)化

      在移動(dòng)設(shè)備發(fā)展迅速的今天,為了實(shí)現(xiàn)電鏡預(yù)約服務(wù)的隨時(shí)、隨地,需要使預(yù)約系統(tǒng)能夠跨平臺(tái)工作,其中關(guān)鍵之處在于系統(tǒng)對(duì)移動(dòng)設(shè)備的優(yōu)化[9]。一方面,系統(tǒng)需要對(duì)移動(dòng)頁(yè)面進(jìn)行簡(jiǎn)化,精簡(jiǎn)頁(yè)面內(nèi)容,減少載入時(shí)間,同時(shí)使用響應(yīng)化設(shè)計(jì),確保系統(tǒng)在不同分辨率設(shè)備中的正確顯示;另一方面,在移動(dòng)頁(yè)面中避免使用諸如Flash之類的控件,盡量使用HTML5和JavaScript進(jìn)行替代,同時(shí)檢測(cè)JavaScript在不同移動(dòng)設(shè)備下的兼容性。

      2 預(yù)約系統(tǒng)的開發(fā)與實(shí)施

      2.1 系統(tǒng)服務(wù)器與數(shù)據(jù)庫(kù)

      由于電鏡預(yù)約系統(tǒng)對(duì)象人群僅為高校和研究機(jī)構(gòu)的相關(guān)專業(yè)人員,其使用人數(shù)較少,導(dǎo)致一方面系統(tǒng)訪問量不會(huì)太高,另一方面系統(tǒng)的并發(fā)訪問數(shù)并不高。這些都表明后臺(tái)的壓力不大,因此在選擇相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)和服務(wù)器時(shí),可以選擇成本較低的方案。

      在開發(fā)中選擇了SQL Server 2000作為預(yù)約系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)[10],服務(wù)器選擇使用IIS 6.0,并使用ASP作為開發(fā)腳本[11]。其中,系統(tǒng)中主要的數(shù)據(jù)如表1所示。

      表1 系統(tǒng)主要數(shù)據(jù)表

      2.2 用戶操作后臺(tái)開發(fā)[12]

      用戶操作后臺(tái)的功能主要包括用戶的注冊(cè)、登錄、開放服務(wù)查詢、服務(wù)預(yù)約和電鏡預(yù)約記錄查看。當(dāng)用戶注冊(cè)時(shí),系統(tǒng)將用戶數(shù)據(jù)寫入t_User表,并在登錄時(shí)查詢?cè)摫硪耘袛嗟卿洺晒εc否。用戶在查詢開放服務(wù)時(shí),返回t_Service表中的服務(wù)列表。用戶可以查看各項(xiàng)服務(wù)的內(nèi)容詳情,并對(duì)狀態(tài)信息為“正?!钡姆?wù)進(jìn)行預(yù)約。預(yù)約表單中填寫的信息被提交至t_Appointment表。在整個(gè)觀測(cè)過(guò)程中,管理員將依據(jù)觀測(cè)進(jìn)度修改t_Appointment表中的各條記錄狀態(tài),用戶可以始終通過(guò)登錄查看每項(xiàng)預(yù)約的進(jìn)度變化。

      用戶可以在每次登錄后對(duì)個(gè)人信息進(jìn)行維護(hù),預(yù)約時(shí)系統(tǒng)將自動(dòng)從t_User表中讀取這些信息內(nèi)容,并預(yù)置在預(yù)約表單中,從而避免用戶每次都需要填寫大量個(gè)人信息的復(fù)雜操作。

      2.3 管理后臺(tái)開發(fā)

      管理后臺(tái)的功能主要包括管理員的登錄、開放服務(wù)的增刪和修改、預(yù)約記錄的維護(hù)、用戶的管理等。由于管理者主要為本校教職工,為了確保后臺(tái)數(shù)據(jù)的安全性,管理員用戶名為其學(xué)校公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的工號(hào),密碼為公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的對(duì)應(yīng)密碼。登錄時(shí),首先將用戶名和密碼提交至學(xué)校的統(tǒng)一身份驗(yàn)證進(jìn)行判定,如判定通過(guò),再將用戶名與t_Admin表中的工號(hào)進(jìn)行匹配,若數(shù)據(jù)庫(kù)中存在該工號(hào)的賬戶,則說(shuō)明該用戶有效并能夠進(jìn)入管理后臺(tái)。使用統(tǒng)一身份驗(yàn)證與本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證相結(jié)合的方式,使管理員不必額外記憶一套管理密碼,同時(shí)大大提高了系統(tǒng)的安全級(jí)別。

      管理人員對(duì)開放服務(wù)的維護(hù)通過(guò)t_Service表完成,除服務(wù)的增加與刪除外,由于儀器故障等原因所導(dǎo)致的服務(wù)開放狀態(tài)變化也體現(xiàn)在該表中,管理員根據(jù)當(dāng)前服務(wù)是否可用來(lái)動(dòng)態(tài)修改t_Service表中的數(shù)據(jù),不可用的服務(wù)將無(wú)法被預(yù)約。此外,每一種服務(wù)被自動(dòng)分配一個(gè)id號(hào),以便與預(yù)約數(shù)據(jù)中的服務(wù)類型相匹配。

      在預(yù)約記錄的維護(hù)界面,t_Appointment表將返回目前的所有預(yù)約信息,其中包括了每條預(yù)約記錄的申請(qǐng)人信息、樣品信息等,并通過(guò)服務(wù)的id匹配顯示對(duì)應(yīng)的預(yù)約服務(wù)類型。管理人員根據(jù)預(yù)約信息安排工作時(shí)間表,并在觀測(cè)的各個(gè)階段動(dòng)態(tài)通過(guò)管理后臺(tái)定期更新各條記錄的狀態(tài)。由于系統(tǒng)在預(yù)約記錄中,給每份觀測(cè)樣品分配了一個(gè)唯一的序列號(hào),管理人員可以方便地維護(hù)單個(gè)樣品的狀態(tài)信息。同時(shí),預(yù)約者也隨時(shí)可以在前臺(tái)輸入該序列號(hào),查看t_Appointment表中每個(gè)樣品的處理情況。

      最后,管理員還需要查看和管理所有的用戶信息,通過(guò)t_User表可以方便地進(jìn)行用戶信息的操作處理。此外,系統(tǒng)還預(yù)置了激活功能,當(dāng)管理員開啟用戶激活時(shí),初次注冊(cè)的用戶信息在t_User表中的相應(yīng)記錄為未激活狀態(tài),需要管理員通過(guò)電話、Email聯(lián)系進(jìn)行實(shí)名確認(rèn)后,再由管理員對(duì)用戶帳號(hào)進(jìn)行激活,以避免虛假的預(yù)約信息。

      2.4 知識(shí)庫(kù)開發(fā)

      在現(xiàn)有的用戶數(shù)據(jù)庫(kù)基礎(chǔ)上,使用輕量級(jí)的開源系統(tǒng)AspWiki作為知識(shí)庫(kù)的維基系統(tǒng)[13]。AspWiki提供了文件在線編輯、文件自主分類、文件共享、文檔共同修改、歷次修改記錄回溯等維基功能,可以通過(guò)用戶登錄、記錄寫入、搜索等接口來(lái)實(shí)現(xiàn)與現(xiàn)有系統(tǒng)間的無(wú)縫結(jié)合。預(yù)約觀測(cè)的最終實(shí)驗(yàn)結(jié)果或用戶心得體會(huì)能夠直接推送到維基系統(tǒng)中,形成知識(shí)的積累。

      2.5 前臺(tái)頁(yè)面開發(fā)

      除上述的后臺(tái)功能外,電鏡預(yù)約系統(tǒng)還需要制作前臺(tái)頁(yè)面來(lái)顯示電鏡中心的各種信息,如電鏡中心介紹、各種服務(wù)的資費(fèi)說(shuō)明、規(guī)章制度、圖像和視頻資料下載等。前臺(tái)頁(yè)面使用HTML5、CSS3和JavaScript相結(jié)合進(jìn)行開發(fā)[14]。此外,通過(guò)響應(yīng)設(shè)計(jì),使前臺(tái)頁(yè)面針對(duì)移動(dòng)設(shè)備進(jìn)行優(yōu)化,使用戶即使在手機(jī)屏幕上也能很好操作和使用本系統(tǒng)。

      2.6 系統(tǒng)安全

      在黑客攻擊和木馬傳播屢屢發(fā)生的互聯(lián)網(wǎng)環(huán)境下,信息安全防護(hù)對(duì)于電鏡預(yù)約系統(tǒng)的穩(wěn)定運(yùn)行至關(guān)重要。除前述的統(tǒng)一身份驗(yàn)證提高管理員登錄安全級(jí)別外,系統(tǒng)還需要程序和服務(wù)器端的相應(yīng)安全措施,保障web服務(wù)運(yùn)行。在本程序中,主要使用SQL防注入方法提高防護(hù)級(jí)別,對(duì)含有文件上傳的腳本代碼進(jìn)行漏洞排查,阻斷外來(lái)木馬上傳的通道[15]。在服務(wù)器端,設(shè)置強(qiáng)健的服務(wù)器帳號(hào)密碼,嚴(yán)格控制文件夾的寫入權(quán)限,安裝服務(wù)器防火墻,并做好數(shù)據(jù)的定期備份工作。

      3 結(jié) 語(yǔ)

      華東師范大學(xué)電鏡預(yù)約追蹤系統(tǒng)的建立受到了學(xué)校的大力支持,并獲得“實(shí)驗(yàn)教學(xué)設(shè)備研制項(xiàng)目”的資助,通過(guò)本校電鏡中心和信息化辦公室的共同研究,以期建立穩(wěn)定的信息化平臺(tái),進(jìn)而推廣至全校各個(gè)實(shí)驗(yàn)教學(xué)相關(guān)中心。自該系統(tǒng)創(chuàng)建以來(lái),已穩(wěn)定運(yùn)行超過(guò)一年。經(jīng)過(guò)實(shí)際使用,方便了校內(nèi)外用戶的預(yù)約,簡(jiǎn)化了工作流程,大大提高了管理工作效率,對(duì)科研和教學(xué)起到了有益的幫助。

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