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    藻類捕光天線系統(tǒng):結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一

    2021-03-15 09:00:44甄張赫李文軍林瀚智秦松
    海洋學(xué)報(bào) 2021年2期
    關(guān)鍵詞:復(fù)合體藻類解析

    甄張赫,李文軍,林瀚智,秦松*

    (1.中國科學(xué)院煙臺海岸帶研究所,山東 煙臺 264003;2.中國科學(xué)院大學(xué) 資源與環(huán)境學(xué)院,北京 100049;3.中國科學(xué)院海洋大科學(xué)研究中心,山東 青島 266071;4.廣東省科學(xué)院 廣東省生態(tài)環(huán)境技術(shù)研究所 華南土壤污染控制與修復(fù)國家地方聯(lián)合工程研究中心/廣東省農(nóng)業(yè)環(huán)境綜合治理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510650)

    1 引言

    藻類是光合自養(yǎng)的水生孢子植物,是地球上最原始的進(jìn)行放氧光合作用的植物,可分為原核藻類及真核藻類。原核藻類的成員主要為藍(lán)藻,它通過內(nèi)共生進(jìn)化出各種真核藻類。最初,藍(lán)藻的初級內(nèi)共生演化出3 個(gè)分支:灰胞藻、紅藻及綠藻[1]。隨后,紅藻及綠藻通過一系列次內(nèi)共生產(chǎn)生了其他的真核藻類[2]。按照傳統(tǒng)方法,真核藻類通常被分為10 個(gè)門:綠藻門、輪藻門、裸藻門、紅藻門、隱藻門、甲藻門、金藻門、黃藻門、硅藻門及褐藻門[3]。

    藻類可在各類地球環(huán)境中(湖泊、海洋、溫泉、高山、極地等)生存,特別是水下弱光環(huán)境造就了藻類獨(dú)特而高效的捕光能力[4]。為了適應(yīng)各種光環(huán)境,藻類進(jìn)化出了各種捕光天線(色素?蛋白復(fù)合體),包括定位于類囊體膜外的水溶性復(fù)合體,以及在類囊體膜內(nèi)的疏水性復(fù)合體。這些復(fù)合體可通過調(diào)整其結(jié)合色素的數(shù)量、種類及位點(diǎn),吸收環(huán)境中特定波段的光[5]。例如水溶性捕光天線復(fù)合體藻膽體(Phycobilisome,PBS),可通過共價(jià)結(jié)合的各類藻膽素,如藻藍(lán)膽素(Phycocyanobilin,PCB)、藻紅膽素(Phycoerythrobilin,PEB)、藻尿膽素(Phycourobilin,PUB)和藻紫膽素(Phycoviolobilin,PVB)等吸收460~670 nm 的可見光[6];膜蛋白捕光天線復(fù)合體(Light-harvesting Complex,LHC)可通過非共價(jià)結(jié)合的各類色素如葉綠素(Chlorophyll,Chl),及各種類胡蘿卜素(Carotenoids)如巖藻黃素(Fucoxanthin,F(xiàn)x)、甲藻黃素(Diadinoxanthin,Dd)和硅藻黃素(Diatoxanthin,Dt)等吸收350~750 nm的光[7-8],這些吸收的光能被捕光天線復(fù)合體以大于90%的效率傳遞至光合反應(yīng)中心。在此過程中,類胡蘿卜素可以通過淬滅激發(fā)態(tài)葉綠素的方式進(jìn)行光保護(hù)。這些捕光和傳能的過程之所以如此的高效,與藻類捕光天線獨(dú)特的蛋白結(jié)構(gòu)密不可分[9-13]。

    藻類擁有的獨(dú)特的捕光天線結(jié)構(gòu)是其行使捕光和傳能過程的基礎(chǔ)(表1)[14-16],研究藻類捕光天線的精細(xì)結(jié)構(gòu)具有非常重要的意義。其精細(xì)結(jié)構(gòu)的揭示,可以幫助人們了解天線的捕光和傳能機(jī)制,并為光電仿生器件提供重要的結(jié)構(gòu)和功能基礎(chǔ)[17],這對開發(fā)太陽能電池甚至人工光合作用的合成都至關(guān)重要。

    但需要注意的是,藻類捕光天線結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展非常依賴于相關(guān)的檢測及解析技術(shù)。這些技術(shù)被用來分析藻類捕光天線的成分和結(jié)構(gòu),是影響結(jié)構(gòu)分辨率的重要因素,因此相關(guān)的研究方法學(xué)和技術(shù)手段的進(jìn)步至關(guān)重要。本文將以研究方法學(xué)和技術(shù)手段的進(jìn)步為線索,回顧過去70 年藻類捕光天線結(jié)構(gòu)生物學(xué)的研究歷程,闡明結(jié)構(gòu)生物學(xué)揭示的藻類捕光復(fù)合體結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一性及其科學(xué)意義,并展望有關(guān)領(lǐng)域未來發(fā)展趨勢。

    2 藻類捕光天線結(jié)構(gòu)解析

    2.1 生化提取和成分分析階段

    生化提取是解析藻類捕光天線結(jié)構(gòu)的第一步,也是后續(xù)成分分析的重要基礎(chǔ)。自20 世紀(jì)50 年代起,人們開始通過簡單易行的生理生化技術(shù),廣泛研究藻類捕光天線的組成及結(jié)構(gòu)[18-20]。例如,Gantt 和Lipschultz[21]開發(fā)了從單細(xì)胞紅藻紫球藻中分離完整PBS 的方法,大大推動(dòng)了當(dāng)時(shí)甚至后續(xù)的PBS 結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)展。后續(xù)提取完整PBS 的方法均由此衍生而來,至今仍延用了其中的經(jīng)典條件及步驟,例如細(xì)胞破碎緩沖液磷酸根濃度為0.6~1.0 mol/L、pH 約為7,提取溫度在18°C 左右,純化方法選擇蔗糖梯度離心法等[22-25]。

    隨后Gingrich 等[26-28]通過改進(jìn)該方法,分離純化了藍(lán)藻的PBS,例如聚球藻SynechococcusPCC 6301、SynechococcusPCC 7002 等,并通過蛋白電泳、吸收光譜及熒光發(fā)射光譜,對PBS 的蛋白成分及色素成分進(jìn)行了鑒定(表1)?;谶@些研究成果,Glazer[29]構(gòu)建了聚球藻Synechococcus6 701 藻膽體結(jié)構(gòu)的初始模型。在完整的藻膽體結(jié)構(gòu)被結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究技術(shù)解析之前,該初始模型的建立對于分析藻膽體能量傳遞途徑具有重要的指導(dǎo)意義。

    2.2 利用X-ray 解析晶體局部精細(xì)結(jié)構(gòu)

    X-ray 晶體學(xué)是解析藻類捕光天線復(fù)合體精細(xì)結(jié)構(gòu)的第一選擇[30](表1)。蛋白本身的特性往往決定了其結(jié)晶的難易程度,因此水溶性捕光天線和膜蛋白捕光天線的晶體結(jié)構(gòu)解析進(jìn)展并不對等。大量易結(jié)晶的水溶性捕光天線蛋白以及組成PBS 的各類藻膽蛋白率先獲得了原子分辨率的結(jié)構(gòu),例如多甲藻素葉綠素蛋白(Peridinin-chlorophyll-protein,PCP)(2 ?)[31]、藻紅蛋白(phycoerythrin,PE)(1.85 ?)[32]、藻藍(lán)蛋白(phycocyanin,PC)(1.35 ?)[33]和隱藻PE545(0.97 ?、1.63 ?)[34-35]等(表2)。

    由于膜蛋白純化及結(jié)晶均較為困難,因此獲得LHC 家族成員的晶體結(jié)構(gòu)往往需要漫長的摸索過程。幸運(yùn)的是,目前已經(jīng)獲得了多種LHCII、FCP(Fx and Chla/cbinding protein)的高分辨晶體結(jié)構(gòu)(表2),這些結(jié)構(gòu)清晰地展示了色基類型及結(jié)合位點(diǎn)[36-38]。大量晶體結(jié)構(gòu)的成功解析,為后續(xù)冷凍電鏡三維重構(gòu)計(jì)算奠定了重要的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。

    然而,由于LHC 家族成員的結(jié)構(gòu)多樣性,膜蛋白又較難結(jié)晶,因此大多數(shù)藻類的膜蛋白捕光天線的精細(xì)結(jié)構(gòu)尚未通過X-ray 晶體學(xué)方法獲得(表2)。此外,超分子捕光復(fù)合體的結(jié)構(gòu)也很難通過X-ray 晶體學(xué)方法獲得。一方面是由于超分子復(fù)合體的體積太大,增加了結(jié)晶難度,例如PSI(photosystem I)-LHCI,PSII-LHCII 等大體積復(fù)合物至今未見晶體結(jié)構(gòu),而其包含的體積小的PSI、PSII 以及部分LHC卻早已通過結(jié)晶法獲得精細(xì)結(jié)構(gòu)[37,39-40];另一方面是受限于復(fù)合體的體外理化性質(zhì),例如PBS 不僅體積大,而且在體外易解聚,很難通過結(jié)晶獲得完整的精細(xì)結(jié)構(gòu)。由于X-ray 晶體學(xué)技術(shù)幾乎沒有機(jī)會完成部分藻類捕光天線的結(jié)構(gòu)解析,因此開發(fā)更多的結(jié)構(gòu)解析技術(shù)變得非常必要。

    2.3 利用電鏡技術(shù)解析捕光天線復(fù)合體結(jié)構(gòu)(以冷凍電鏡為技術(shù)分水嶺)

    表2 藻類捕光天線復(fù)合體晶體結(jié)構(gòu)解析進(jìn)展Table 2 Progress in crystal structure analysis of algal light-harvesting antenna complexes

    表3 電鏡技術(shù)解析藻類捕光復(fù)合體結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)展Table 3 Advance in electron microscope analysis of algal light-harvesting complexes

    電鏡技術(shù)一直是生物分子結(jié)構(gòu)生物學(xué)結(jié)構(gòu)解析,特別是超大分子解析的重要手段,只不過早期的解析清晰度遠(yuǎn)遠(yuǎn)不如X-ray 晶體解析技術(shù),制約了技術(shù)的應(yīng)用范圍。早在20 世紀(jì)80 年代起,人們便開始利用各種電鏡技術(shù)對捕光天線的結(jié)構(gòu)進(jìn)行觀察(表1,表3),例如通過透射電子顯微鏡(Transmission Electron Microscope,TEM)[21,68]、掃描隧道顯微鏡(Scanning Tunneling Microscope,STM)[69]以及原子力顯微鏡(Atomic Force Microscope,AFM)[70]觀察到了各種不同類型的二維或三維PBS 結(jié)構(gòu)。部分膜蛋白捕光天線的結(jié)構(gòu)也可通過電鏡觀察到,如體積較小的XLH(來源于黃藻)[71]以及大體積的LHC 和光系統(tǒng)I 的超分子復(fù)合物(如隱藻的PSI-LHCI[72]、綠藻的PSI-LHCI-LHCII[44]等),結(jié)合已公布的晶體結(jié)構(gòu),可對這些負(fù)染圖像進(jìn)行三維重構(gòu)計(jì)算,獲得粗略結(jié)構(gòu)模型。然而,由于這幾種電鏡技術(shù)本身的限制及獲得的圖像分辨率的限制,這些粗略結(jié)構(gòu)相比于精細(xì)結(jié)構(gòu)僅能提供復(fù)合體組成成分,丟失了大量的亞基及色基結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié),例如PBS與PSII-LHCII(圖1A,圖1C)的粗略結(jié)構(gòu),無法提供確切的亞基類型及空間位置,也無法觀察到結(jié)合的色基,而精細(xì)結(jié)構(gòu)(圖1B,圖1D)卻可以提供這些細(xì)節(jié)。因此,直到冷凍電鏡技術(shù)發(fā)展成熟之前,人們都很難通過電鏡獲得捕光天線復(fù)合體完整的精細(xì)結(jié)構(gòu)。

    圖1 捕光復(fù)合體粗略結(jié)構(gòu)及精細(xì)結(jié)構(gòu)對比Fig.1 Comparison of contour and fine structures of algal light-harvesting complexes

    冷凍電鏡技術(shù)的應(yīng)用不僅使結(jié)構(gòu)生物學(xué)跨入了新時(shí)代,也使藻類捕光天線的結(jié)構(gòu)解析得以關(guān)鍵性突破,這得益于冷凍電鏡技術(shù)相比較X-ray 結(jié)晶法對樣品質(zhì)量的依賴度更低[73]。僅2019 年,便有7 個(gè)超分子復(fù)合體的精細(xì)結(jié)構(gòu)通過冷凍電鏡技術(shù)獲得[42,45,74-78],包括提高了分辨率的PBS 結(jié)構(gòu)(紅藻Porphyridium purpureum,2.82 ?)[42]、綠藻的PSI-LHCI 以及多種類型的PSII-LHCII 等。這些結(jié)構(gòu)清晰的揭示了復(fù)合體組件之間的連接與排布方式。目前,冷凍電鏡技術(shù)在藻類捕光天線復(fù)合體結(jié)構(gòu)解析領(lǐng)域的應(yīng)用還有很大的發(fā)展空間。例如,利用冷凍電鏡技術(shù)解析的藻類捕光天線復(fù)合體結(jié)構(gòu)分辨率均未突破2.5 ?(表3)。因此,未來還需要對樣品純化以及冷凍電鏡解析技術(shù)繼續(xù)優(yōu)化提升,以提高結(jié)構(gòu)分辨率。

    3 藻類捕光天線蛋白結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一

    結(jié)構(gòu)生物學(xué)的進(jìn)步,為深刻理解藻類捕光天線復(fù)合體的功能提供了大量結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié),例如精細(xì)結(jié)構(gòu)展示的大量的精準(zhǔn)的發(fā)色團(tuán)位置,提示了捕光天線系統(tǒng)內(nèi)部高效的能量傳遞發(fā)生的可能機(jī)制。目前,將結(jié)構(gòu)生物學(xué)與捕光天線功能整合為一體的研究方法學(xué)如下(圖2)。

    (1)通過比對分析捕光蛋白的同源基因,結(jié)合其三維結(jié)構(gòu),揭示捕光蛋白結(jié)構(gòu)與功能的進(jìn)化關(guān)系。例如,在2006 年,Zhao 和Qin[90]對藻膽蛋白同源基因進(jìn)行了進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)某些藻膽蛋白中的部分氨基酸位點(diǎn)表現(xiàn)出較高的非同義替換率(圖2A),這些位點(diǎn)大多分布在發(fā)色團(tuán)結(jié)合結(jié)構(gòu)域和螺旋發(fā)夾結(jié)構(gòu)域(X 和Y)內(nèi)或其附近(圖2B),并顯示出共同進(jìn)化的特征。將這些位點(diǎn)精確地定位在藻膽蛋白的三級結(jié)構(gòu)上,發(fā)現(xiàn)脫輔基蛋白的發(fā)色團(tuán)結(jié)合結(jié)構(gòu)域?yàn)榘l(fā)色團(tuán)創(chuàng)造了特定的微環(huán)境,以確保高效的能量轉(zhuǎn)移效率[90]。這個(gè)研究從計(jì)算生物學(xué)的角度,證實(shí)了發(fā)色團(tuán)與藻膽蛋白之間存在特定的空間環(huán)境以有效的進(jìn)行共振能量轉(zhuǎn)移。

    (2)根據(jù)藻類捕光天線蛋白精細(xì)結(jié)構(gòu)提供的發(fā)色團(tuán)網(wǎng)絡(luò),預(yù)測能量傳遞的大概路徑,并為利用超快時(shí)間分辨光譜研究能量傳遞提供結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。例如,通過硅藻(Phaeodactylum tricornutum)FCP 的結(jié)構(gòu)解析發(fā)現(xiàn),F(xiàn)CP 主要以二聚體的形式存在,且該結(jié)構(gòu)揭示的FCP 不僅結(jié)合了含氧光合作用生物中常見的Chla,而且結(jié)合了Chlc和Fx,使它們能夠捕捉藍(lán)綠光以適應(yīng)水中的光環(huán)境(圖3)[36]。隨后通過PSII-FCPII 的結(jié)構(gòu)解析,進(jìn)一步揭示了硅藻(Chaetoceros gracilis)FCPII與PSII 的連接方式及可能的能量傳遞模式。但是由于超分子復(fù)合體的結(jié)構(gòu)過于復(fù)雜,具體的能量傳遞路徑目前還不清晰[89]。由于復(fù)合體體積太大,色素分子較多而導(dǎo)致目前無法僅通過高分辨的復(fù)合體結(jié)構(gòu)就準(zhǔn)確預(yù)測能量傳遞路徑的例子還有很多,例如,2020年解析的來自紫球藻(P.purpureum)的PBS 的結(jié)構(gòu),包含了1 598 個(gè)色素分子,且2.82 ?的分辨率足以使人們看清每個(gè)色基的結(jié)合位點(diǎn)[42]。然而,由于色素?cái)?shù)量龐大,能量傳遞路徑復(fù)雜,其中可能涉及到多個(gè)激子能量傳遞,甚至相干共振能量轉(zhuǎn)移。因此,準(zhǔn)確的能量傳遞途徑還需要配合各種精確的光譜技術(shù)手段進(jìn)行分析。

    圖2 計(jì)算生物學(xué)分析藍(lán)藻藻膽蛋白同源序列及結(jié)構(gòu)[90]Fig.2 Computational biology analysis of cyanobacterial phycobiliprotein homologous sequence and structure [90]

    (3)光譜學(xué)是分析捕光蛋白能量傳遞的最佳手段,常用的有吸收光譜、熒光發(fā)射光譜、圓二色譜[91]以及超快光譜[92]。目前,超快時(shí)間分辨光譜被認(rèn)為是分析捕光蛋白能量傳遞機(jī)制的最佳光譜學(xué)手段,超快時(shí)間分辨光譜可對飛秒(fs)內(nèi)的能量傳遞過程進(jìn)行監(jiān)測[93-94]。例如,二維超快時(shí)間分辨光譜顯示,隱藻捕光蛋白PC645的兩組色素分子之間存在振動(dòng)相干節(jié)拍以及部分離域振動(dòng),這使得能量轉(zhuǎn)移速率增強(qiáng)[95-96]。

    除了高效能量傳遞,藻類捕光天線系統(tǒng)的精細(xì)結(jié)構(gòu),為理解其光適應(yīng)機(jī)制提供了更多的科學(xué)依據(jù),例如,藻類捕光天線可通過結(jié)構(gòu)的變化響應(yīng)來啟動(dòng)各種光保護(hù)機(jī)制(如非光化學(xué)淬滅(NPQ)、狀態(tài)轉(zhuǎn)換等[97-98]),以保護(hù)光合反應(yīng)中心免受光損傷。例如,發(fā)色團(tuán)網(wǎng)絡(luò)揭示的各類LHC 的類胡蘿卜素位置,可輔助理解LHC 的NPQ 機(jī)制。近來,有研究利用時(shí)間分辨紅外光譜對LHCII 的能量淬滅動(dòng)力學(xué)及構(gòu)象變化進(jìn)行了分析[99],該研究揭示了高等植物L(fēng)HCII 三聚體對多余激發(fā)能的耗散可響應(yīng)溫度和酸度的變化,這可通過類胡蘿卜素與葉綠素612 之間的動(dòng)態(tài)構(gòu)象變化來調(diào)控。需要說明的是,由于植物L(fēng)HCII 的結(jié)構(gòu)與綠藻LHCII 的結(jié)構(gòu)一樣,因此,對高等植物L(fēng)HCII 的研究結(jié)果均可用來分析綠藻LHCII。此外,對高等植物PSI-LHCI-LHCII 的精細(xì)結(jié)構(gòu)解析,也可幫助人們深入理解綠藻捕光天線的狀態(tài)轉(zhuǎn)換機(jī)制。通過對比綠藻中發(fā)現(xiàn)的各種類型的PSII(photosystem II)-LHCII(C2S2-typePSII-LHCII、C2S2M2-typePSII-LHCII及C2S2M2N2-typePSII-LHCII 等)復(fù)合體結(jié)構(gòu)差異,有助于深入理解LHCII 對不同光條件下的響應(yīng)機(jī)制[45,74,77,86]。

    圖3 FCP 單體結(jié)構(gòu)及其色素組成[36]Fig.3 Monomer structure and pigment composition of FCP [36]

    藻類捕光天線的結(jié)構(gòu)盡管可根據(jù)生活的光環(huán)境進(jìn)行變化,但是決定其結(jié)構(gòu)類型的根本因素在于進(jìn)化所決定的基因。因此,盡管有一些藻類生活在相似的環(huán)境中,但是其捕光天線結(jié)構(gòu)卻有差別,例如都生活在海表面的單細(xì)胞藍(lán)藻和紅藻,其具備的捕光天線結(jié)構(gòu)并不相同。紅藻的藻膽體較藍(lán)藻藻膽體體積更大,且紅藻還具有膜蛋白LHC[23,42,74]。因此,藻類捕光天線的結(jié)構(gòu)與功能的統(tǒng)一是建立在進(jìn)化的基礎(chǔ)上的,解析不同藻類的捕光天線結(jié)構(gòu)有助于理解藻類進(jìn)化。

    4 展望

    冷凍電鏡技術(shù)與超快時(shí)間分辨光譜技術(shù)的結(jié)合,初步實(shí)現(xiàn)了對藻類捕光天線系統(tǒng)結(jié)構(gòu)與能量傳遞功能的統(tǒng)一認(rèn)識,為深刻理解水生植物藻類為何具有高效的弱光捕獲能力,極高的傳能效率以及靈活的光適應(yīng)能力等,奠定了堅(jiān)實(shí)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。然而,清晰繪制一幅特殊水環(huán)境如何塑造了特殊的捕光結(jié)構(gòu),又如何獲得高效而精準(zhǔn)的捕光功能的系統(tǒng)畫卷,仍舊任重道遠(yuǎn)。

    捕光天線結(jié)構(gòu)中復(fù)雜的發(fā)色團(tuán)網(wǎng)絡(luò)結(jié)合各類光譜技術(shù)可揭示其高效的傳能過程,其中可用于解釋兩個(gè)相干量子系統(tǒng)引起的周期性振動(dòng)過程的CRET 機(jī)制引起了廣泛的關(guān)注和爭議。CRET 過程可使能量在幾百飛秒內(nèi)分布在整個(gè)系統(tǒng)(大于分子的直徑)內(nèi)[100],因此部分觀點(diǎn)認(rèn)為相干共振能量轉(zhuǎn)移是藻類捕光天線高效捕光的真正原因。然而,也有部分觀點(diǎn)認(rèn)為該過程的相互作用時(shí)間太短暫,在光合作用能量轉(zhuǎn)移中沒有任何功能意義[101]。而且,通用的物理計(jì)算模型無法可靠的解釋捕光天線內(nèi)復(fù)雜的能量傳遞過程,例如關(guān)于隱藻PC645 中量子節(jié)拍的解釋仍然備受爭議,因?yàn)樵诱駝?dòng)也可呈現(xiàn)出相似的觀測結(jié)果,而這種觀測結(jié)果很難區(qū)分是由哪種機(jī)制導(dǎo)致的[96]。因此,需要開發(fā)更合理的計(jì)算模型(如非微擾計(jì)算模型)[102],才能清楚地闡釋相干能量傳遞機(jī)制是否是藻類捕光天線高效捕光的“殺手锏”。另外,需要注意的是,現(xiàn)今發(fā)現(xiàn)的捕光天線內(nèi)的量子節(jié)拍大多數(shù)測量于77 K,而考慮到藻類生存的溫度及溫度升高對量子退相干過程的加劇作用,在常溫下測量量子相干的意義重大。

    關(guān)于PBS 光保護(hù)機(jī)制的研究還需要依賴相關(guān)復(fù)合物的結(jié)構(gòu)解析。一方面,PBS 可通過橙色類胡蘿卜素蛋白(water-soluble orange carotenoid protein,OCP)依賴型NPQ 過程將多余的激發(fā)能進(jìn)行熱耗散(圖4a)。但關(guān)于OCP 的結(jié)合位點(diǎn)仍存在爭議,雖然普遍認(rèn)為活性O(shè)CP 可以結(jié)合PBS 的核心結(jié)構(gòu)[103],但至今沒有相關(guān)的結(jié)構(gòu)被解析,無法直觀的驗(yàn)證該觀點(diǎn)。另一方面,PBS 可通過狀態(tài)轉(zhuǎn)換機(jī)制進(jìn)行光保護(hù),其機(jī)制不同于膜蛋白LHC(圖4)。為了避免PSII 能量過強(qiáng)導(dǎo)致光損傷,通常PBS 可通過移動(dòng)傳能機(jī)制(圖4b,狀態(tài)一)和溢出機(jī)制(圖4b,狀態(tài)二)兩種途徑實(shí)現(xiàn)多余能量在光系統(tǒng)之間的重新分配[104]。遺憾的是,至今,兩種機(jī)制的結(jié)構(gòu)僅局限于結(jié)構(gòu)模型,直觀的結(jié)構(gòu)解析將寄希望于未來原位結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)步及動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)研究方法的開發(fā)。

    圖4 藻膽體光保護(hù)結(jié)構(gòu)模型Fig.4 Photoprotective structural model of phycobilisomes

    目前,仍有許多藻類捕光天線的精細(xì)結(jié)構(gòu)未被解析,其中不乏有一些藻類擁有特殊結(jié)構(gòu)的捕光天線。例如,極端環(huán)境中的藻類為了在多變的光環(huán)境或不尋常的溫度條件下,依然能維持捕光天線的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性和捕光效率,進(jìn)化出了獨(dú)特的捕光天線結(jié)構(gòu)。已發(fā)現(xiàn)嗜熱藍(lán)藻的捕光天線核結(jié)構(gòu)中,含有結(jié)構(gòu)特殊的PC(PC612),可使藻膽體在高溫條件結(jié)構(gòu)依然穩(wěn)定[105];南極紅藻可通過轉(zhuǎn)換不同的藻膽體類型來適應(yīng)長期的光照環(huán)境和長期的黑暗環(huán)境[106]。但這些沒有細(xì)節(jié)的粗略結(jié)構(gòu)只是提供了理解適應(yīng)機(jī)制的可能方向,并不能輔助人們理解其特殊的捕光及傳能機(jī)制。例如,嗜熱藍(lán)藻中特殊結(jié)構(gòu)的PC 在藻膽體傳能過程中的具體作用還不清楚;驅(qū)動(dòng)南極紅藻兩種藻膽體轉(zhuǎn)換的具體機(jī)制以及兩種藻膽體與光系統(tǒng)的聯(lián)系仍未見報(bào)道。這些科學(xué)問題都需要通過解析精細(xì)結(jié)構(gòu),甚至是動(dòng)態(tài)光環(huán)境下的精細(xì)結(jié)構(gòu)來解釋。

    現(xiàn)階段,藻類捕光天線系統(tǒng)結(jié)構(gòu)生物學(xué)的研究已為深入揭示藻類光合作用高效能量傳遞機(jī)制奠定了堅(jiān)實(shí)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),驗(yàn)證了結(jié)構(gòu)生物學(xué)揭示的藻類捕光復(fù)合體結(jié)構(gòu)與其功能的統(tǒng)一性。此外,通過特殊的捕光天線結(jié)構(gòu)及其動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)變化,進(jìn)一步研究捕光天線對光環(huán)境的適應(yīng)性,成為了未來的研究重點(diǎn),這將為藻類捕光天線蛋白在光電器件領(lǐng)域的應(yīng)用提供科學(xué)依據(jù)。

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