基于SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫(kù)

徐超華，劉新龍，毛鈞，劉洪博，林秀琴，陸鑫*，蘇火生*

基于SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫(kù)

徐超華1,2，劉新龍1,2，毛鈞1,2，劉洪博1,2，林秀琴1,2，陸鑫1,2*，蘇火生1,2*

(1.云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所，云南 開(kāi)遠(yuǎn) 661699；2.云南省甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，云南 開(kāi)遠(yuǎn) 661699)

以92份割手密初級(jí)核心種質(zhì)為研究對(duì)象，利用SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)，依據(jù)Jaccard、SM和Nei & Li 3種遺傳相似性系數(shù)逐步進(jìn)行UPGMA聚類(lèi)、多次抽樣構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫(kù)。結(jié)果顯示：92份樣本在15個(gè)SSR 位點(diǎn)上呈現(xiàn)出豐富的多態(tài)性，共獲得331個(gè)多態(tài)性條帶，平均多態(tài)性條帶比例達(dá)100%；利用3種遺傳相似性系數(shù)和隨機(jī)取樣共獲得5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)；Shannon-Wiener多樣性指數(shù)、總條帶數(shù)和多態(tài)性條帶數(shù)3個(gè)指標(biāo)在核心種質(zhì)庫(kù)代表性檢驗(yàn)中呈現(xiàn)出較高的檢測(cè)效率，其他6個(gè)指標(biāo)檢測(cè)效率相對(duì)較低；5個(gè)核心庫(kù)中依據(jù)SM遺傳相似性系數(shù)逐步構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)質(zhì)量最優(yōu)，該庫(kù)由80份樣本組成，Nei’s多樣性指數(shù)和Shannon-Wiener多樣性指數(shù)分別為0.984 1和4.259 8，在<0.05概率條件下與原庫(kù)(分別為0.985 6和4.358 3)無(wú)顯著差異，而且與原庫(kù)的農(nóng)藝性狀均值差異百分率為0(<20.00%)，極差符合率為99.16%(>80.00%)。研究認(rèn)為，依據(jù)SM相似性系數(shù)，通過(guò)UPGMA聚類(lèi)構(gòu)建的80份割手密核心種質(zhì)較好地代表了基礎(chǔ)原始種質(zhì)的分子水平和表型遺傳多樣性，可為后續(xù)割手密種質(zhì)資源的精準(zhǔn)鑒定、優(yōu)異抗性基因發(fā)掘和種質(zhì)資源雜交利用提供依據(jù)。

割手密；聚類(lèi)；多樣性指數(shù)；分子標(biāo)記；核心種質(zhì)

割手密(L.)即甘蔗細(xì)莖野生種，具有分蘗力強(qiáng)、抗性強(qiáng)等特點(diǎn)，分布于N18°15? ~33°20?、E97°~122°，涵蓋中國(guó)廣東、廣西、云南、福建、海南和臺(tái)灣等17個(gè)省份[1]。目前，現(xiàn)代甘蔗品種血緣主要來(lái)自熱帶種、割手密、印度種的種間雜交后代，尤其是印度割手密、爪哇割手密和崖城割手密的成功應(yīng)用推動(dòng)了世界甘蔗產(chǎn)業(yè)的發(fā)展[2-3]。中國(guó)是“甘蔗屬?gòu)?fù)合群”中大部分資源的起源地和多樣性中心，分布有大量甘蔗野生種質(zhì)資源。自1995年建圃以來(lái)，國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源圃收集、保存了6個(gè)屬15個(gè)種共3 000余份的甘蔗種質(zhì)資源，位居世界第二。豐富的種質(zhì)資源同時(shí)給資源保育工作者帶來(lái)了巨大的工作量與挑戰(zhàn)，如何從龐大的種質(zhì)資源中迅速發(fā)掘優(yōu)異資源，將中國(guó)的資源優(yōu)勢(shì)迅速轉(zhuǎn)化為產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢(shì)，對(duì)提高甘蔗良種選育效率具有重要意義。

自FRANKEL[4]首次提出核心種質(zhì)的概念以來(lái)，國(guó)內(nèi)外學(xué)者先后構(gòu)建了水稻[5-6]、玉米[7]、小麥[8]、大豆[9]核心種質(zhì)庫(kù)，在甘蔗屬及其近緣屬核心庫(kù)構(gòu)建上也做了大量的前期研究。劉新龍等[10]以國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源圃保育的1 202份甘蔗雜交種為材料，依托表型性狀，采用10%總體取樣量、總體聚類(lèi)分組和對(duì)數(shù)比例聚類(lèi)，構(gòu)建了161份初級(jí)核心種質(zhì)。在此基礎(chǔ)上，進(jìn)一步使用SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)，依據(jù)Jaccard、SM和Dice 3種相似性系數(shù)，采用UPGMA逐步聚類(lèi)法構(gòu)建了107份甘蔗雜交品種核心種質(zhì)。BALAKRISHNAN等[11]以印度坎納諾爾甘蔗育種研究中心保育的713份熱帶種質(zhì)為材料，基于27個(gè)質(zhì)量性狀和10個(gè)數(shù)量性狀，構(gòu)建了185份熱帶種(L.)核心種質(zhì)庫(kù)。在割手密種質(zhì)構(gòu)建方面，TAI等[12]以美國(guó)農(nóng)業(yè)部佛州運(yùn)河點(diǎn)甘蔗研究所保育的342份甘蔗細(xì)莖野生種質(zhì)為材料，基于數(shù)量性狀和環(huán)境因子的11種取樣方法，構(gòu)建了包含75份種質(zhì)的甘蔗細(xì)莖野生種核心種質(zhì)庫(kù)。齊永文等[13]以海南甘蔗育種場(chǎng)保育的540份甘蔗細(xì)莖野生種質(zhì)為材料，利用分子標(biāo)記數(shù)據(jù)和表型性狀，構(gòu)建了包含60份種質(zhì)的甘蔗細(xì)莖野生種核心庫(kù)。

齊永文等[13]應(yīng)用分子標(biāo)記數(shù)據(jù)構(gòu)建了甘蔗細(xì)莖野生種核心種質(zhì)庫(kù)，但分子標(biāo)記數(shù)據(jù)主要用于探討不同取樣比例的確定和核心種質(zhì)庫(kù)質(zhì)量的檢測(cè)，未用于樣本間聚類(lèi)、等位變異數(shù)量等分析，未充分發(fā)揮分子標(biāo)記數(shù)據(jù)的優(yōu)勢(shì)。近年來(lái)，國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源圃收集并保存了約600份割手密種質(zhì)資源，極大地豐富了國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源。前期，蘇火生等[14]以國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源圃保育的596份割手密種質(zhì)為試驗(yàn)材料，依據(jù)27個(gè)表型性狀，采用15%總體取樣量，以莖徑分組，按多樣性比例構(gòu)建了92份初級(jí)核心種質(zhì)庫(kù)。在此基礎(chǔ)上，課題組進(jìn)一步使用SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)，通過(guò)比較2種取樣策略和3種遺傳距離(Nei & Li、Jaccard、SM)相似系數(shù)，進(jìn)一步縮減92份割手密初級(jí)核心庫(kù)，結(jié)合農(nóng)藝性狀數(shù)據(jù)評(píng)價(jià)不同核心種質(zhì)庫(kù)的質(zhì)量，以篩選出最優(yōu)核心種質(zhì)庫(kù)，旨在為后續(xù)割手密種質(zhì)資源的精準(zhǔn)鑒定、優(yōu)異抗性基因的發(fā)掘和種質(zhì)資源的雜交利用提供依據(jù)。

1　材料與方法

1.1　材料

以前期蘇火生等[14]構(gòu)建的92份割手密初級(jí)核心種質(zhì)為研究對(duì)象。92份割手密無(wú)性系均保育在云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源圃。

1.2　方法

1.2.1葉片基因組總DNA提取與PCR擴(kuò)增

采用CTAB法[15]進(jìn)行甘蔗幼葉基因組DNA的提取和純化。依據(jù)前人[16-18]的研究方法，篩選出15對(duì)多態(tài)性較高的SSR引物，用于核心種質(zhì)的遺傳多樣性研究。參照劉新龍等[10]的方法設(shè)計(jì)SSR反應(yīng)體系和PCR擴(kuò)增條件。參照劉新龍等[19]的銀染方法快速銀染。

1.2.2分子標(biāo)記數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

在相同遷移位置上，利用人工讀帶的方式，統(tǒng)計(jì)擴(kuò)增條帶，無(wú)擴(kuò)增條帶記為“0”，有擴(kuò)增條帶記為“1”。利用NTSYSpc2.1，計(jì)算參試材料3種不同相似系數(shù)(Jaccard、SM和Nei & Li)。采用位點(diǎn)的基因型頻率計(jì)算Nei’s遺傳多樣性(He)[20]和Shannon-Weier多樣性指數(shù)()[21]。

式中，p為SSR標(biāo)記第個(gè)基因位點(diǎn)的基因型頻率。

1.2.3取樣策略

根據(jù)相似性系數(shù)，應(yīng)用NTSYSpc2.1軟件對(duì)所有參試材料進(jìn)行UPGMA系統(tǒng)聚類(lèi)，參照HU等[22]、WANG等[23]提出的多次聚類(lèi)最小距離取樣方法構(gòu)建核心種質(zhì)。根據(jù)每次聚類(lèi)結(jié)果，找出最相似的2個(gè)樣本，剔除1份，剩余材料組成1個(gè)核心庫(kù)，計(jì)算每次形成的核心庫(kù)(新庫(kù))的Nei’s遺傳多樣性、Shannon-Weiner多樣性指數(shù)，應(yīng)用檢驗(yàn)評(píng)價(jià)新庫(kù)與原庫(kù)之間的遺傳多樣性是否存在顯著差異。當(dāng)存在顯著差異時(shí)，終止多次聚類(lèi)取樣，上一個(gè)新庫(kù)為該相似性系數(shù)條件下取得的最佳核心種質(zhì)庫(kù)。為了確保所構(gòu)建的核心種質(zhì)具有最大的適用性，2個(gè)樣本的選擇依據(jù)以下4種原則：1)若樣本來(lái)源地點(diǎn)特殊且保存數(shù)量很少，可以直接保留；2)若2個(gè)樣本都具有抗性且抗性不同，保留抗性更優(yōu)異的樣本；3)若2個(gè)樣本都具有抗性且抗性相同，保留具備較多等位基因數(shù)的樣本；4)若2個(gè)樣本遺傳背景不清，保留具備較多等位基因數(shù)的樣本。

為了比較3種核心種質(zhì)庫(kù)的質(zhì)量，以相同樣本數(shù)量的2個(gè)隨機(jī)核心庫(kù)為對(duì)照，應(yīng)用4個(gè)分子標(biāo)記指標(biāo)(Nei’s遺傳多樣性、Shannon-Weiner多樣性指數(shù)、總條帶數(shù)和多態(tài)性條帶數(shù))和4個(gè)數(shù)量性狀指標(biāo)(極差符合率、變異系數(shù)符合率、均值差異百分率和方差差異百分率)綜合評(píng)價(jià)核心庫(kù)構(gòu)建質(zhì)量的好壞。其中，4個(gè)數(shù)量性狀指標(biāo)計(jì)算公式同文獻(xiàn)[22]。在均值差異百分率小于20%，同時(shí)極差符合率大于80%的情況下，可以認(rèn)為該核心庫(kù)較好地代表了原始種質(zhì)群體的遺傳多樣性水平[22]。

2　結(jié)果與分析

2.1　初級(jí)核心種質(zhì)的遺傳多樣性

依據(jù)前人研究報(bào)道和云南省甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究結(jié)果[16-18]，篩選出15對(duì)多態(tài)性較高的SSR引物，用于核心種質(zhì)的遺傳多樣性研究。標(biāo)記數(shù)據(jù)分析(表1)顯示，15對(duì)SSR引物共獲得331個(gè)擴(kuò)增條帶，平均每對(duì)SSR引物獲得22.1個(gè)擴(kuò)增條帶，多態(tài)性條帶比例為100%。其中，SMC278CS引物獲得36個(gè)多態(tài)性擴(kuò)增條帶，SMC1047HA獲得32個(gè)多態(tài)性擴(kuò)增條帶。15對(duì)SSR引物平均Nei’s遺傳多樣性指數(shù)為0.985 6，平均Shannon-Weiner多樣性指數(shù)為4.358 3。說(shuō)明割手密初級(jí)核心種質(zhì)庫(kù)在15個(gè)SSR位點(diǎn)上遺傳多樣性十分豐富。

表1　15對(duì)SSR引物在92份割手密初級(jí)核心種質(zhì)間的多態(tài)性分析結(jié)果

表1(續(xù))

2.2　核心種質(zhì)的取樣策略

依據(jù)Jaccard、Nei & Li和SM 3種遺傳相似性系數(shù)，采用UPGMA系統(tǒng)聚類(lèi)法構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫(kù)，隨著剔除材料的逐漸增多，多次聚類(lèi)取樣建立的核心種質(zhì)遺傳多樣性呈下降趨勢(shì)。當(dāng)樣本剔除到第13個(gè)材料時(shí)，剩余的79份材料所組成的核心種質(zhì)Nei’s遺傳多樣性指數(shù)與原庫(kù)檢驗(yàn)沒(méi)有顯著差異，但Shannon-Wiener多樣性指數(shù)與原庫(kù)呈顯著差異；當(dāng)剔除12份材料時(shí)，剩余80份材料形成的核心種質(zhì)庫(kù)與原庫(kù)之間的Nei’s遺傳多樣性和Shannon-Wiener多樣性指數(shù)均不存在顯著差異，Jaccard、Nei & Li和SM 3種遺傳相似性系數(shù)逐步聚類(lèi)的結(jié)果基本一致。據(jù)此，可以認(rèn)為剩余的80份材料構(gòu)成的核心種質(zhì)庫(kù)為該相似性系數(shù)下最優(yōu)核心庫(kù)，分別編號(hào)為J-80、NL-80和SM-80。

2.3　核心種質(zhì)的代表性檢測(cè)

為比較依托3種遺傳相似性系數(shù)構(gòu)建的割手密核心種質(zhì)庫(kù)的質(zhì)量，隨機(jī)取樣，構(gòu)建編號(hào)為RS-80-1和RS-80-2的2個(gè)隨機(jī)核心種質(zhì)庫(kù)。根據(jù)5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)與原庫(kù)的檢驗(yàn)結(jié)果(表2)，5個(gè)核心庫(kù)均與原庫(kù)的Nei’s遺傳多樣性沒(méi)有顯著差異；隨機(jī)核心種質(zhì)庫(kù)RS-80-1和RS-80-2的Shannon-Wiener多樣性指數(shù)與原庫(kù)在<0.05的概率水平下呈顯著差異，核心種質(zhì)庫(kù)SM-80、J-80、NL-80與原庫(kù)均無(wú)顯著差異，說(shuō)明隨機(jī)核心種質(zhì)庫(kù)RS-80-1和RS-80-2不能完全代表原庫(kù)的遺傳多樣性水平。

表2　核心種質(zhì)庫(kù)與原庫(kù)多樣性指數(shù)差值的t檢驗(yàn)結(jié)果

“SM-66”示SM核心庫(kù)與原庫(kù)差異顯著時(shí)樣本的數(shù)量為66?！?”示在0.05水平差異顯著。

從5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)保留的總條帶數(shù)、多態(tài)性條帶數(shù)(表3)來(lái)看，核心庫(kù)SM-80保留了原庫(kù)的全部條帶數(shù)和多態(tài)性條帶數(shù)，核心庫(kù)J-80和NL-80丟失總條帶和多態(tài)性條帶各1個(gè)。根據(jù)不同核心庫(kù)27個(gè)數(shù)量性狀差異情況來(lái)看，5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)的均值差異百分率都為0，極差符合率為97.04%～100.00%，變異系數(shù)符合率為97.97%～103.45%，說(shuō)明5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)與原庫(kù)數(shù)量性狀均沒(méi)有太大的差異，即新構(gòu)建的5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)較好地代表了原庫(kù)的表型遺傳多樣性水平。

表3　不同核心種質(zhì)庫(kù)在總條帶、多態(tài)性條帶和農(nóng)藝性狀相關(guān)檢測(cè)指標(biāo)上的評(píng)價(jià)結(jié)果

Shannon-Wiener多樣性指數(shù)、總條帶數(shù)和多態(tài)性條帶數(shù)3個(gè)指標(biāo)能夠有效地評(píng)價(jià)5個(gè)核心種質(zhì)庫(kù)的質(zhì)量好壞。筆者最終從分子遺傳多樣性、保留的總條帶數(shù)、保留的多態(tài)性條帶數(shù)和表型性狀差異情況，確定核心種質(zhì)庫(kù)SM-80作為最佳核心庫(kù)。該庫(kù)由80份材料組成(表4)，占初級(jí)核心種質(zhì)庫(kù)的86.96%，占原始種質(zhì)(596)的13.42%。SM-80核心種質(zhì)Nei’s多樣性指數(shù)和Shannon-Wiener多樣性指數(shù)分別為0.984 1和4.259 8，在<0.05概率條件下與原庫(kù)(分別為0.985 6和4.358 3)無(wú)顯著差異，而且與原庫(kù)的農(nóng)藝性狀均值差異百分率為0(<20.00%)，極差符合率為99.16%(>80.00%)。以上數(shù)據(jù)綜合表明，核心庫(kù)SM-80較好地代表了原始種質(zhì)群體的農(nóng)藝性狀水平。

表4　入選核心種質(zhì)庫(kù)的80種材料

3　結(jié)論與討論

齊永文等[13]研究了SSR引物數(shù)量和種質(zhì)鑒別能力間的關(guān)系，結(jié)果表明，當(dāng)使用5對(duì)引物時(shí)，鑒別出的種質(zhì)數(shù)量可達(dá)到所有種質(zhì)的90%；當(dāng)使用9對(duì)引物時(shí)，可鑒別出所有種質(zhì)，說(shuō)明9對(duì)引物已經(jīng)能夠鑒別所有種質(zhì)。本研究中，15對(duì)SSR引物產(chǎn)生331個(gè)多態(tài)性條帶，平均每對(duì)引物產(chǎn)生22.1個(gè)條帶；而齊永文等[13]應(yīng)用20對(duì)SSR引物產(chǎn)生454個(gè)多態(tài)性條帶，平均每對(duì)引物產(chǎn)生22.7個(gè)條帶。2個(gè)研究中，平均每對(duì)引物產(chǎn)生的條帶數(shù)相差不大，間接證明15對(duì)SSR引物多態(tài)性豐富。總的多態(tài)性條帶數(shù)(331)僅為齊永文等[13]的72.9%，說(shuō)明在核心庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中，SSR引物數(shù)量越多，更能夠準(zhǔn)確反映群體的遺傳多樣性，建議在以后的核心庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中要保證足夠的SSR引物數(shù)量。

董玉琛等[24]認(rèn)為核心庫(kù)構(gòu)建可以分2步：首先依托表型數(shù)據(jù)(數(shù)量性狀和質(zhì)量性狀)構(gòu)建初級(jí)核心種質(zhì)庫(kù)；在此基礎(chǔ)上，利用分子標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行DNA水平的遺傳冗余壓縮，從而篩選到既在分子層面又在表型層面具有代表性的核心種質(zhì)庫(kù)，此方法在甘蔗[10]、大豆[25]、柿子[26]等植物上得到了應(yīng)用。本研究以國(guó)家甘蔗種質(zhì)資源圃保育的596份割手密為原始種質(zhì)群體，基于表型和SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)，構(gòu)建了割手密初級(jí)核心種質(zhì)92份(占總資源的15.4%)和核心種質(zhì)80份(占總資源的13.4%)，并應(yīng)用4個(gè)分子標(biāo)記指標(biāo)和4個(gè)數(shù)量性狀指標(biāo)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果表明，依托SM遺傳相似系數(shù)構(gòu)建的核心庫(kù)質(zhì)量最優(yōu)，在<0.05概率條件下，SM-80的多樣性指數(shù)與原庫(kù)的無(wú)顯著差異，與原庫(kù)的農(nóng)藝性狀均值差異百分率為0(<20.00%)，極差符合率為99.16%(>80.00%)，說(shuō)明SM-80對(duì)原庫(kù)表型性狀和分子遺傳多樣性都具有較好的代表性。該庫(kù)由80 份割手密無(wú)性系組成，占原初級(jí)核心種質(zhì)庫(kù)的86.9%，占原始種質(zhì)群體(=596)的13.4%。2個(gè)隨機(jī)核心種質(zhì)庫(kù)，雖然在表型水平對(duì)原庫(kù)具有較好的代表性，但在分子水平上，Shannon-Wiener多樣性指數(shù)與原庫(kù)存在顯著差異，而依據(jù)SM遺傳相似性系數(shù)構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)在表型和分子水平的遺傳多樣性都具有較好的代表性。可見(jiàn)，依據(jù)相似性系數(shù)構(gòu)建的核心種質(zhì)庫(kù)質(zhì)量要優(yōu)于同等數(shù)量的隨機(jī)核心種質(zhì)庫(kù)。

綜上所述，本研究構(gòu)建的割手密核心種質(zhì)數(shù)量少且較好地代表了596份原始種質(zhì)群體的遺傳多樣性水平，有利于針對(duì)性地開(kāi)展鑒定評(píng)價(jià)，大幅縮短工作時(shí)間和節(jié)省工作量，為后續(xù)割手密種質(zhì)資源的精準(zhǔn)鑒定、優(yōu)異抗性基因發(fā)掘和種質(zhì)資源雜交利用提供依據(jù)。

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Construction of a core-collection ofbased on SSR molecular markers

XU Chaohua1,2, LIU Xinlong1,2, MAO Jun1,2, LIU Hongbo1,2, LIN Xiuqin1,2, LU Xin1,2*, SU Huosheng1,2*

(1.Sugarcane Research Institute, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Kaiyuan, Yunnan 661699, China; 2.Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Kaiyuan, Yunnan 661699, China)

A stepwise UPGMA cluster sampling approach with three different genetic similarity coefficients(Jaccard, SM, and Nei & Li) was applied to a SSR molecular data of 92-genotype primary core collection. Results showed that 92 genotypes possessed abundant genetic diversity at 15 SSR loci, which produced 331 polymorphic bands in amplification, constituting a mean of 100% of total bands. The genetic similarity coefficients were constructed with three approaches and two random samplings, which produced five putative core collections. To evaluate the quality of putative core collections, three indices, Shannon-Wiener diversity index, polymorphic band number and percentage of polymorphic bands, using core collections had the highest identification efficiency, while others were less efficient. The putative core collection constructed using SM genetic similarity coefficient had higher quality than others. The putative core collection consisted of 80genotypes shaving a 0.984 1 Nei’s diversity index and 4.259 8 Shannon-Wiener diversity index, and did not differ significantly(<0.05) in molecular diversity from the primary core. Further, MD was 0%(<20.00%) and CR 99.16%(>80.00%).The putative core collection of 80genotypes based on SM genetic similarity coefficient did not differ significantly from the genetic diversity of the primary core regarding to the agronomic traits or molecular markers. The putative core will facilitate the evaluation and utilization of the germplasm in developing elite sugarcane hybrids, and mining elite genes.

; clustering; diversity index; molecular marker; core collection

S566.102.4

A

1007-1032(2020)06-0657-07

徐超華，劉新龍，毛鈞，劉洪博，林秀琴，陸鑫，蘇火生．基于SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)構(gòu)建割手密核心種質(zhì)庫(kù)[J]．湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)，2020，46(6)：657-663．

XU C H, LIU X L, MAO J, LIU H B, LIN X Q, LU X, SU H S. Construction of a core-collection ofbased on SSR molecular markers[J]. Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences), 2020, 46(6): 657-663.

http://xb.hunau.edu.cn

2019-11-28

2019-12-19

云南省農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)研究聯(lián)合專項(xiàng)(2018FG001-017)；國(guó)家農(nóng)作物種質(zhì)資源共享服務(wù)平臺(tái)項(xiàng)目(NICGR-2019-44)；農(nóng)業(yè)農(nóng)村部政府購(gòu)買(mǎi)服務(wù)項(xiàng)目(19190167)

徐超華(1986—)，男，湖北洪湖人，碩士，助理研究員，主要從事甘蔗種質(zhì)資源的研究與利用，xuchaohua_0435@sina.com；*通信作者，陸鑫，碩士，副研究員，主要從事甘蔗種質(zhì)資源的研究與利用，xinlu_ky@126.com；*通信作者，蘇火生，碩士，副研究員，主要從事甘蔗種質(zhì)資源的研究與利用，shs304@163.com

10.13331/j.cnki.jhau.2020.06.004

責(zé)任編輯：毛友純

英文編輯：柳正