方若思 周澄笑 金誠豫 張一維 黃溫迪 黃 俊 呂常江 肖功年 龔金炎 陳啟和
(1 浙江科技學(xué)院 杭州310023 2 浙江省農(nóng)產(chǎn)品化學(xué)與生物加工技術(shù)重點實驗室 杭州310023 3 浙江大學(xué) 杭州310058)
鳥氨酸氨甲酰轉(zhuǎn)移酶(OTCase/OTC,EC 2.1.3.3) 是瓜氨酸合成代謝中的一個關(guān)鍵酶,廣泛存在于動、植物與微生物中,分布于生物生長發(fā)育的各個階段。在原核生物和真菌中,OTCase 是一種雙功能酶,不僅可催化瓜氨酸的合成,也催化瓜氨酸的降解[1-2];在植物中,它是尿素循環(huán)第1 步反應(yīng)的催化酶,催化鳥氨酸和氨甲酰磷酸反應(yīng)合成瓜氨酸和磷酸鹽[3];在動物中,OTCase 主要參與尿素循環(huán),是尿素循環(huán)的關(guān)鍵酶之一;在人體內(nèi),OTCase是肝臟尿素循環(huán)的必需酶,OTCase 的缺失常導(dǎo)致嗜睡、嘔吐、精神發(fā)育遲緩等癥狀,同時OTCase的缺失與否也可作為肝細(xì)胞癌的早期診斷指標(biāo)之一[4-5]。
鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶參與乳酸菌精氨酸代謝途徑的關(guān)鍵一步,即將瓜氨酸分解成為鳥氨酸和氨甲酰磷酸。瓜氨酸是一種非蛋白質(zhì)氨基酸,因最先從西瓜中獲取而得名[6]。研究表明,瓜氨酸對于男性性功能障礙、高血壓和冠心病具有一定療效,并可作為人體NO 產(chǎn)生的評價因子,且在腦血流的調(diào)節(jié),提高身體免疫力和美容護(hù)膚中具有重要的作用[7-10]。
除上述優(yōu)點外,瓜氨酸也是發(fā)酵食品中氨基甲酸乙酯的重要前體物[11-12]。氨基甲酸乙酯(簡稱EC,又稱脲烷),是一種在試驗動物甚至人體內(nèi)造成多位點致癌的物質(zhì),2007年國際癌癥研究機(jī)構(gòu)認(rèn)定EC 為2A 類致癌物質(zhì),與丙烯酰胺同等危險。EC 存在于多種發(fā)酵食品,尤其是發(fā)酵的酒精飲料中,如葡萄酒、黃酒、日本清酒等[13-14]。
酒類中的瓜氨酸主要來自精氨酸降解。在乳酸菌中,精氨酸的降解通過精氨酸脫亞胺酶途徑(arginine deiminase pathway,ADI pathway)完成。在這一途徑中,包含3 個關(guān)鍵酶:精氨酸脫亞胺酶(ADI,arginine deiminase,EC 3.5.3.6)、鳥氨酸氨甲酰轉(zhuǎn)移酶 (OTC,ornithine transcarbamylse,EC 2.1.3.3) 和氨基甲酸激酶(CK,carbamatekinase,EC 2.7.2.2)[15],它們分別由arcA、arcB 和arcC 基因編碼[16],如圖1所示。
圖1 乳酸菌中精氨酸的代謝途徑Fig.1 Arginine metabolic pathway in LAB
目前,對精氨酸脫亞胺酶的研究較為透徹,而對鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶的研究仍為空白。尋找更加安全有效的OTCase 具有重要的研究價值。
乳桿菌是一類革蘭氏陽性兼性厭氧菌,在含碳水化合物的動物及植物發(fā)酵產(chǎn)品以及溫血類動物的消化系統(tǒng)中十分常見,作為一般認(rèn)為安全(Generally recognized as safe,GRAS)的食品級微生物,在食品、工業(yè)、農(nóng)牧業(yè)及醫(yī)藥等領(lǐng)域中亦擁有重要的應(yīng)用價值。挖掘益生性乳酸菌源的各種酶類是目前人們的關(guān)注點之一。短乳桿菌(Lactobacillus brevis) 是乳桿菌屬中一種非常重要的菌種,根據(jù)NCBI 數(shù)據(jù)庫顯示短乳桿菌中無疑存在著具有生物活性的OTCase。獲取并研究短乳桿菌的OTCase 酶學(xué)性質(zhì),將為探索其應(yīng)用價值奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株和質(zhì)粒 短乳桿菌(Lactobacillus brevis),由浙江大學(xué)食品微生物重點實驗室保存;大腸桿菌BL21(DE3),購自全試金公司;質(zhì)粒pET-28a,由浙江科學(xué)院保存。
1.1.2 主要試劑 細(xì)菌基因組提取試劑盒、PCR產(chǎn)物回收試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒DNA 提取試劑盒、L-精氨酸、DL-鳥氨酸、茚三酮、異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)、硫酸卡那霉素(Kan)、Ni-NTA 瓊脂糖樹脂,購自生工生物工程(上海)股份有限公司;T4 DNA 連接酶、限制性內(nèi)切酶BamHI、SalI,購自TaKaRa 公司,
1.1.3 培養(yǎng)基
1)LB 培養(yǎng)基 酵母提取物5 g/L,胰蛋白胨10 g/L,NaCl 10 g/L,pH 7.0,用于大腸桿菌的培養(yǎng)。
2)MRS 培養(yǎng)基 蛋白胨10 g/L,牛肉浸粉5 g/L,酵母浸粉4 g/L,葡萄糖20 g/L,吐溫80 1 g/L,磷酸氫二鉀2 g/L,乙酸鈉5 g/L,檸檬酸三胺2 g/L,硫酸鎂0.2 g/L,硫酸錳0.05 g/L,pH 6.2,用于短乳桿菌的培養(yǎng)。
短乳桿菌鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶的正向引物序列:5’-cgcggatccATGACTAAGGATTTTCGGGAA AATGTA-3’(下劃線為BamHI 識別序列);反向引物 序 列:5’-acgcgtcgacTTAAGCTCGTGGAATGAA TAAGTTACCT-3’(下劃線為SalI 識別序列)。以短乳桿菌的基因組DNA 為模板,進(jìn)行鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶的基因擴(kuò)增,反應(yīng)程序:98 °C 變性5 min,以98°C 20 s,55°C 15 s,72°C 20 s 反應(yīng)35個循環(huán)后,72 °C 延伸7 min,最后冷卻至4 °C。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳驗證后采用PCR產(chǎn)物純化試劑盒純化。
采用限制性內(nèi)切酶BamHI 和SalI 分別對鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶基因片段和載體pET-28a 進(jìn)行雙酶切。酶切產(chǎn)物經(jīng)膠回收試劑盒回收,連接并轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,涂布在含卡那霉素的LB 培養(yǎng)平板上,經(jīng)菌落PCR 驗證后,篩選得到陽性克隆,提取陽性克隆子DNA 后測序驗證。
挑取陽性單菌落接種于5 mL LB 培養(yǎng)基中,于37°C、200 r/min 振蕩培養(yǎng)過夜。按體積分?jǐn)?shù)1%接種量轉(zhuǎn)接于200 mL LB 培養(yǎng)基中,繼續(xù)于37°C、200 r/min 振蕩培養(yǎng),至OD600nm值在0.6~0.8時,加入異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG),25°C、180 r/min 誘導(dǎo)培養(yǎng)過夜。
離心、收集菌體后,加入30 mL 緩沖液 (50 mmol/L NaH2PO4,300 mmol/L NaCl,20 mmol/L 咪唑pH 8.0) 重懸菌體,隨后冰水浴超聲破碎細(xì)胞,4°C、9 000/min 離心30 min,獲得上清液。
Ni-NTA 瓊脂糖樹脂是螯合金屬Ni2+而形成的一種親和層析介質(zhì)。該純化介質(zhì)對帶有His-Tag的蛋白有專一的吸附能力,能使His-Tag 蛋白結(jié)合在Ni-NTA 親和層析介質(zhì)上,而沒有結(jié)合的雜蛋白被洗滌掉。結(jié)合在介質(zhì)上的蛋白經(jīng)一定濃度的咪唑洗脫下來,得到高純度的目的蛋白。參照Ni-NTA 瓊脂糖樹脂的使用說明,采用親和層析純化重組蛋白,隨后用SDS-PAGE 檢測蛋白純度及分子質(zhì)量。
取125 μL 酶液與125 μL 10 mmol/L MnCl2在55 ℃下培養(yǎng)20 min,激活酶,加入250 μL 0.1 mol/L 精氨酸底物(pH 9.5),于37 ℃水解55 min。取樣100 μL,加入300 μL 冰醋酸終止酶反應(yīng),最后加入100 μL 70 mmol/L 茚三酮進(jìn)行比色測定,檢測有無鳥氨酸形成。煮沸30 min 后測OD515nm值。根據(jù)鳥氨酸濃度標(biāo)準(zhǔn)曲線擬合方程計算酶液中鳥氨酸含量,蛋白含量采用Brandford 法測定。OTC 酶活定義為每分鐘水解1 mg 蛋白質(zhì)產(chǎn)生1 μmol 鳥氨酸所需的酶量(OTC)為1 個酶活單位。
1.6.1 重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶最適溫度的測定 將酶液轉(zhuǎn)移至離心管中,加入底物,分別置于25,35,45,55,65,75 ℃條件下反應(yīng),測定酶活。
1.6.2 重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶熱穩(wěn)定性的測定 將酶液分別置于4,37,60 ℃中保溫放置0,20,40 min,1,2,3 h 后進(jìn)行反應(yīng),測定其活性。
1.6.3 重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶最適pH 的測定 配制pH 5.5~11.5 的精氨酸底物,加入酶液,反應(yīng)后測定酶活。
1.6.4 NaCl 和乙醇對酶活穩(wěn)定性的影響 將純化得到的酶液在不同NaCl 質(zhì)量分?jǐn)?shù) (0%,2.5%,5%,10%,15%,18%,20%)的緩沖液中保溫1 h,測定酶活,確定NaCl 對酶活穩(wěn)定性的影響。將純化的酶液在不同乙醇體積分?jǐn)?shù)(0%,2.5%,5%,10%,15%,18%,20%)的緩沖液中保溫1 h,測定酶活,確定乙醇對酶活穩(wěn)定性的影響。
1.6.5 重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶的動力學(xué)參數(shù)的測定 酶的米氏常數(shù)Km值,即酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度的二分之一時的底物濃度,是酶的非常重要的動力學(xué)常數(shù),表示酶與反應(yīng)底物的結(jié)合能力。Km越小,結(jié)合能力越強(qiáng),反之亦然。在pH 9.5,37 ℃條件下,以精氨酸為底物,分別測定重組ADI 在底物濃度為0.01~1 mol/L 時的反應(yīng)速度,然后將試驗數(shù)據(jù)按Lineweaver-Burk 雙倒數(shù)法作圖,求出酶的Km和Vmax。
將構(gòu)建并鑒定的重組質(zhì)粒交由上海生工生物技術(shù)有限公司測序,結(jié)果該序列與短乳桿菌具有100%的相似性,表明重組鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶構(gòu)建成功。
見圖2。
2.3.1 重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶的最適反應(yīng)溫度 溫度對酶活性的影響表現(xiàn)在兩個方面:一是溫度升高,提高了分子運動速率,從而增加了底物分子與酶蛋白的結(jié)合幾率;二是溫度影響酶蛋白分子的結(jié)構(gòu),當(dāng)溫度過高時易使蛋白變性失活,降低酶分子的催化效率。綜上,溫度對酶活性的影響是兩個因素綜合作用的結(jié)果。其它反應(yīng)條件相同,在25~75 ℃范圍,間隔10 ℃測定不同溫度下的酶活性,結(jié)果見圖3。
結(jié)果表明,重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶的酶活隨溫度的升高而升高,在溫度高于45 ℃后酶活的提高幅度較大,55 ℃時酶活達(dá)到最高值,隨后急速下降。綜上,此OTC 酶的最適反應(yīng)溫度為55℃。
圖2 重組OTCase 純化SDS-PAGE 電泳圖Fig.2 SDS-PAGE analysis for the purified recombinant OTCase
圖3 溫度對重組OTCase 活性的影響Fig.3 Effects of temperature on activity of the recombinant OTCase
圖4 不同溫度下鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶的穩(wěn)定性Fig.4 Stability of the recombinant OTCase at different temperature
重組鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶在4 ℃放置3 h后活性差異不大,在37 ℃下放置3 h 仍保持50%以上的生物活性,然而,其在65 ℃下的半衰期僅為10 min,放置40 min 后已檢測不到活性。
pH 值對酶活性的影響主要是酸性或堿性環(huán)境改變酶的空間結(jié)構(gòu)。在其它反應(yīng)條件相同的前提下,在pH 5.5~11.5 范圍測定酶活性,結(jié)果見圖5。
如圖5所示,鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶活性隨pH值的變化而變化。當(dāng)pH 5.5~6.5 時,隨著pH 值的升高,酶活性升高,在pH 6.5 時酶活性達(dá)到最高值。當(dāng)pH 高于6.5 后,酶活下降,在pH 11.0時,酶活力僅為最高值的1/6,表明此酶為酸性偏中性酶。
發(fā)酵食品和飲料酒中普遍存在 NaCl 和乙醇,例如醬油中NaCl 質(zhì)量分?jǐn)?shù)為18%左右,黃酒、葡萄酒中乙醇體積分?jǐn)?shù)為8%~15%??疾霴TC酶對鹽和乙醇的耐受性,有利于為其在發(fā)酵食品中的應(yīng)用提供參考。
圖5 pH 值對重組OTCase 活性的影響Fig.5 Effects of pH on activity of the recombinant OTCase
如圖6可知,OTC 酶的活性隨著乙醇、NaCl濃度的變化而變化。乙醇體積分?jǐn)?shù)為5%時酶活性達(dá)到最高值,隨著乙醇濃度的增加,酶活性也開始降低,但不明顯,這表明該OTC 酶在含酒精的發(fā)酵食品或飲料中具有一定的應(yīng)用潛力。而在NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為2.5%~5%時,酶活性隨NaCl 濃度的增加而增加,在鹽NaCl 5%時酶活性最高。隨后在NaCl 質(zhì)量分?jǐn)?shù)為5%~20%時,酶活性隨NaCl 濃度的增加而降低,NaCl 20%左右時酶活性最低。試驗結(jié)果表明,即使在高鹽濃度的反應(yīng)體系中,OTC 酶活性受到的影響也不大,表明該酶在高濃度鹽的溶液中具有一定的應(yīng)用潛力。
圖6 鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶對乙醇和氯化鈉的耐受性Fig.6 Effects of ethanol and NaCl on OTCase activity
以精氨酸為底物,利用Lineweaver-Burk 雙倒數(shù)法測定重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶的米氏常數(shù)。重組酶的Km為1.58 mmol,Vmax為5.88 mmol/min。
以短乳桿菌的基因序列為模板,通過分子克隆手段獲得鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶基因,以大腸桿菌為宿主進(jìn)行重組表達(dá),經(jīng)Ni-NTA 親和層析柱純化獲得重組蛋白,研究其酶學(xué)性質(zhì)。重組鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶最適溫度為55°C,4 ℃下熱穩(wěn)定性優(yōu)異,37 ℃下放置3 h 仍保持50%以上的生物活性。然而,在65 ℃放置40 min 后已檢測不到酶活性。該酶的最適pH 值為6.5,在pH 值為堿性時,酶活力下降明顯;5% NaCl 和5%乙醇時具有最高酶活性,而整體差異不明顯,說明重組鳥氨酸氨甲酰基轉(zhuǎn)移酶具有良好的耐鹽和酒精耐受力。動力學(xué)參數(shù)Km和Vmax分別為1.58 mmol 和 5.88 mmol/min。由此可見,來源于短乳桿菌的鳥氨酸氨甲?;D(zhuǎn)移酶具有良好的溫度穩(wěn)定性及耐鹽、耐酒精能力,在酒類發(fā)酵中應(yīng)用前景看好。