摘 要:冷凍電鏡技術(shù)近年來獲得了迅猛的發(fā)展,取得了許多具有重大意義的成果。冷凍電鏡將生物分子進行冷凍便可進行高分辨率成像,還具有分辨率高、更接近天然狀態(tài)、適用研究對象廣泛等優(yōu)勢。同時,系統(tǒng)地綜述了冷凍電鏡技術(shù)在科學研究中的應(yīng)用,并展望冷凍電鏡技術(shù)未來的發(fā)展。
關(guān)鍵詞:冷凍電鏡;結(jié)構(gòu)生物學
中圖分類號:TG115.21+5.3;Q518.3 ?文獻標志碼:A
Abstract Cryo-electron microscopy technology has made rapid development in recent years,and many groundbreaking results has achieved. Cryo-electron microscopy can freeze biomolecules for high-resolution imaging. It also has the advantages of high resolution,closer to the natural state,and a wide range of research objects. At the same time,the application of cryo-electron microscopy technology in scientific research is systematically reviewed and the future development is prospected.
Key words Cryo-electron microscopy;structural biology
冷凍電鏡(cryo-electron microscopy,cryo-EM)技術(shù),是在低溫下使用透射電子顯微鏡觀察樣品的顯微技術(shù),即把樣品冷凍并保持低溫放進顯微鏡里面,用高度相干的電子作為光源從上面照射,透過樣品和附近的冰層,受到散射,再利用探測器和透鏡系統(tǒng)把散射信號成像記錄下來,最后進行信號處理,得到樣品的結(jié)構(gòu)[1]。冷凍電鏡技術(shù)作為一種重要的結(jié)構(gòu)生物學研究方法,它與X射線晶體學、核磁共振一起構(gòu)成了結(jié)構(gòu)生物學研究的基礎(chǔ)。[1]
1 冷凍電鏡技術(shù)的基本原理
1.1 電鏡三維重構(gòu)理論
D.DeRosier和A.Klug提出三維重構(gòu)理論是借助一系列沿不同方向投影的電子顯微像來重構(gòu)被測物體的立體構(gòu)型,利用計算機數(shù)字圖像處理技術(shù)進行電子顯微像三維重構(gòu)測定生物大分子結(jié)構(gòu)的概念和方法[2]。
透射電子顯微鏡成像過程中,電子束穿透樣品,將樣品的三維電勢密度分布函數(shù)沿著電子束的傳播方向投影至與傳播方向垂直的二維平面上。運用中心截面定理,從而可以通過三維物體不同角度的二維投影在計算機內(nèi)進行三維重構(gòu)來解析獲得物體的三維結(jié)構(gòu)。
1.2 三維冷凍電鏡技術(shù)
樣品經(jīng)過在液氮中的冷凍固定,使得生物大分子中的H2O分子以玻璃態(tài)的形式存在,保持低溫,將樣品放入顯微鏡,高度相干的電子作為光源從上面照射下來,透過樣品和附近的冰層,受到散射,利用探測器和透鏡系統(tǒng)把散射的信號成像記錄下來,再進行信號處理,最后利用三維重構(gòu)的技術(shù)得到樣品的三維結(jié)構(gòu)。
2 冷凍電鏡技術(shù)的獨特優(yōu)勢
2.1 分辨率高
光學顯微鏡的分辨率為0.2μm,透射電子顯微鏡的分辨率為0.2nm,透射電子顯微鏡在光學顯微鏡的基礎(chǔ)上放大了1000倍。
2.2 更接近天然狀態(tài)
電子斷層成像技術(shù)則可用來研究一定厚度的亞細胞器在天然狀態(tài)下的內(nèi)部結(jié)構(gòu),不需要蛋白質(zhì)結(jié)晶[3]。
2.3 適用研究對象廣泛
冷凍電鏡單粒子法既可以對具有對稱結(jié)構(gòu)的大分子進行研究,也適合于研究結(jié)構(gòu)不規(guī)則的大分子復合物,對于分子量的上限沒有限制,理論上>100kD的分子在成像技術(shù)能夠保證的情況下可以形成足夠的對比以進行圖像校正。
3 冷凍電鏡技術(shù)在結(jié)構(gòu)生物學中的應(yīng)用
冷凍電鏡技術(shù)主要應(yīng)用在單個蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)的分析方面。此外,冷凍電子顯微鏡技術(shù)還將廣泛應(yīng)用于細胞組織的超微結(jié)構(gòu)解析,對解開生命活動的規(guī)律和機制等奧秘會產(chǎn)生更大影響。清華大學生命科學學院王宏偉團隊創(chuàng)造了利用冷凍電鏡單顆粒分析技術(shù)解析至近原子分辨率的分子量最小的生物大分子的記錄[4]。施一公研究組解析了γ-secretase蛋白質(zhì)和RyR-1蛋白質(zhì)[5]。楊茂君研究組解析了Mammalian respirasome蛋白質(zhì)[6]。隨著越來越多蛋白質(zhì)神秘面紗的揭開,我們可以更好地解釋各種各樣的生命活動發(fā)生的原因和機理。利用冷凍電鏡技術(shù)觀察到的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),我們可以定向改造或構(gòu)建新的蛋白質(zhì)用于科研或醫(yī)療領(lǐng)域。
4 總結(jié)與展望
冷凍電鏡技術(shù)具有分辨率高、更接近天然狀態(tài)、適用研究對象廣泛等特點,越來越多的科學家開始把冷凍電鏡技術(shù)作為研究的一個新方向。冷凍電鏡技術(shù)與X射線技術(shù)和核磁共振技術(shù)互相補充,讓絕大多數(shù)的蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)都可以被解析。眾多領(lǐng)域的研究者們將在未來冷凍電鏡新的技術(shù)方法的開發(fā)中發(fā)揮重要的作用,成為該技術(shù)的進一步完善與成熟的重要力量。冷凍電鏡領(lǐng)域研究者們則需要以主動開放的態(tài)度吸引其他領(lǐng)域研究者的合作,并積極迎接來自更多領(lǐng)域研究者的挑戰(zhàn),保持并發(fā)展自己的技術(shù)特長,站在技術(shù)發(fā)展的制高點上選準研究方向,始終在冷凍電鏡的技術(shù)前沿上開疆拓土。
參考文獻
[1] 王宏偉. 冷凍電子顯微學在結(jié)構(gòu)生物學研究中的現(xiàn)狀與展望 [J]. 中國科學:生命科學,2014,44(10):1020-1028.
[2] 程凌鵬. 生物大分子高分辨率冷凍電鏡三維重構(gòu)技術(shù) [J]. 實驗技術(shù)與管理,2018,35(06):17-22+26.
[3] MAOFU L,ERHU C,DAVID J,et al. Structure of the TRPV1 channel determined by electron cryo-microscopy [J]. Nature:International weekly journal of science,2013,504(7478):107-112.
[4] 馨婭. 利用冷凍電鏡方法成功解析最小分子量的蛋白質(zhì) [J]. 科學,2019,71(04):62.
[5] BAI S S,ZHUO L,SUN Y,et al. Physalin B reduce secretion of Aβ by inhibiting phosphorylation of STAT3 via down-regulated expression of β-secretase and γ-secretase [J]. 中國藥理學與毒理學雜志,2019,33(06):426-427.
[6] GU J,WU M,GUO R Y,et al. The architecture of the mammalian respirasome [J]. Nature,2016,537(7622).
作者簡介:陳薇,女,1999年出生,本科,生物技術(shù)。