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    牦牛和犏牛MEISETZ基因克隆及生物信息學(xué)分析

    2020-08-04 09:12:22柴志欣武志娟王吉坤鐘金城
    關(guān)鍵詞:牦牛結(jié)構(gòu)域染色體

    向 婭,柴志欣,武志娟,王吉坤,鐘金城

    (1.青藏高原生態(tài)畜牧業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心,成都 610041;2.青藏高原動(dòng)物遺傳資源保護(hù)與利用四川省教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,成都 610041)

    牦牛(Bos grunniens)是分布于青藏高原高寒草地的主要畜種資源,為當(dāng)?shù)剞r(nóng)牧民提供賴(lài)以生存的生產(chǎn)生活資料,為重要經(jīng)濟(jì)畜種[1]。牦牛生產(chǎn)性能低于其他牛種。近年來(lái),為提高牦牛生產(chǎn)性能,利用牦牛與普通牛種間雜交改良,以提高雜種F1代犏牛產(chǎn)肉和產(chǎn)奶量,犏牛對(duì)海拔3 000 m以上高寒草地氣候環(huán)境有良好適應(yīng)性,表現(xiàn)雜交優(yōu)勢(shì)[2-3]。因種間遺傳隔離的影響,母犏牛生殖能力正常,公犏牛因生精機(jī)能紊亂而不育,限制犏牛雜種優(yōu)勢(shì)和牦牛遺傳資源利用。研究顯示,犏牛雄性不育主要特征為精子發(fā)生受阻,即雄性犏牛性腺發(fā)育不良或減數(shù)分裂及精子發(fā)生存在障礙[4],而減數(shù)分裂中多樣性異常主要由兩牛種遺傳基礎(chǔ)或遺傳結(jié)構(gòu)差異造成。

    PRDM9是已鑒定的有助于分離兩個(gè)脊椎動(dòng)物物種繁殖障礙的基因[5],該基因編碼的蛋白質(zhì)是具有組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶活性的鋅指蛋白,可在減數(shù)分裂前期催化組蛋白-H3-賴(lài)氨酸4-三甲基轉(zhuǎn)移酶(H3K4me3)。該蛋白質(zhì)包含多個(gè)結(jié)構(gòu)域,如SET(PR/SET)域的子類(lèi)、一個(gè)串聯(lián)C2H2鋅指等。鋅指(Zinc finger,ZF)基因家族編碼具有鋅指模序的轉(zhuǎn)錄因子,可有效調(diào)控與生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)。研究表明,MEISETZ(Meiosis-induced factor containing a PR/SET domain and zinc-finger motif)為調(diào)控早期減數(shù)分裂基因表達(dá)候選基因,可編碼減數(shù)分裂特有H3K4me3,為小鼠同源染色體之間減數(shù)分裂重組所必需,在小鼠生殖細(xì)胞譜系減數(shù)分裂前期正常進(jìn)程中發(fā)揮重要作用[6]。研究發(fā)現(xiàn),具有突變型MEISETZ基因的雄性小鼠睪丸較小,睪丸中無(wú)圓形精子、細(xì)長(zhǎng)精子或精子[7]。MEISETZ編碼的氨基酸序列,在N端部分具有PR結(jié)構(gòu)域,C端部分具有C2H2型鋅指基序[7],其氨基酸序列與人類(lèi)PRDM9有較高同源性(72%),尤其是在PR結(jié)構(gòu)域(93%)。組蛋白調(diào)控基因表達(dá)和染色體結(jié)構(gòu)后天修飾說(shuō)明MEISETZ是一種減數(shù)分裂誘導(dǎo)的組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶,在減數(shù)分裂早期特異性表達(dá),且僅在精子細(xì)胞進(jìn)入雌性胚胎生殖腺的減數(shù)分裂早期和新生兒睪丸組織中檢測(cè)到MEISETZ基因轉(zhuǎn)錄物產(chǎn)物[6]。對(duì)大鼠MEISETZ減數(shù)分裂細(xì)胞分析顯示,因嚴(yán)重?fù)p害斷裂DNA雙鏈修復(fù)途徑、同源染色體配對(duì)及性小體形成,阻礙減數(shù)分裂進(jìn)程,導(dǎo)致兩性不育[6]。

    犏牛作為牦牛和普通牛雜交后代,其雄性不育原因可能與MEISETZ基因序列差異具有一定相關(guān)性,目前尚未見(jiàn)牦牛、犏牛MEISETZ基因相關(guān)報(bào)道。因此選取MEISETZ作為目的基因,利用RT-PCR技術(shù)對(duì)牦牛、犏牛MEISETZ編碼區(qū)克隆,預(yù)測(cè)分析核酸序列和蛋白結(jié)構(gòu),旨在從分子水平探索MEISETZ基因相關(guān)特性,為開(kāi)展犏牛雄性不育相關(guān)研究提供理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)動(dòng)物

    樣品采集于青海省大通種牛場(chǎng),選取雄性犏牛(1歲1頭,2歲3頭,3歲2頭)共6頭,在四川省九龍縣選取成年公牦牛3頭(7歲),去勢(shì)手術(shù)后迅速采集睪丸組織,DEPC水沖洗后,于液氮中保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2 試驗(yàn)試劑

    GoldViewTM核酸染料;TRIzol購(gòu)自Invitrogen公司;RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScriptTMRT Reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time))、pGEM-T Vector cloning kit、DH5α感受態(tài)細(xì)胞均購(gòu)自TaKaRa公司;質(zhì)粒提取試劑盒、DNA純化回收試劑盒購(gòu)自AxyGENE公司;2×TaqPCR Master Mix、DNA Marker 2000購(gòu)自Tiangen公司。

    1.3 總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄

    TRIzol法提取牦牛、犏牛睪丸組織總RNA,采用NanoDrop 2000分光光度計(jì)測(cè)定其濃度及OD260nm/OD280nm值,A260/A280在1.8~2.0時(shí)方可采用;配制1.5%瓊脂糖凝膠,加入適量GoldViewTM核酸染料,120 V,15 min后,凝膠成像系統(tǒng)檢測(cè)RNA樣品質(zhì)量。以提取總RNA樣品為模板,按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)合成cDNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.4 引物設(shè)計(jì)與合成

    根據(jù)GenBank上已發(fā)表MEISETZ基因(Gen-Bank accession NO.:XM_589388)核苷酸序列,利用Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增引物:5'AACCGCTCAGCCCTCACTCT 3'(正向),5'TCCTTGACCTCACGACCCTC 3'(反向)。引物由成都擎科梓熙生物技術(shù)有限公司合成。

    1.5 MEISETZ基因克隆測(cè)序

    PCR反應(yīng)體系(25 μL):上下游引物各1 μL,cDNA 模板 1 μL,2×TaqPCR Master Mix 12.5 μL,ddH2O 9.5 μL。反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性 5 min;94℃變性30 s;58℃退火30 s;72℃延伸35 s,33個(gè)循環(huán);72℃再延伸7 min;4℃保存。凝膠電泳檢測(cè)并純化回收PCR產(chǎn)物,4℃存放。

    按照pGEM-T載體試劑盒說(shuō)明書(shū)連接,轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,復(fù)蘇后,均勻涂布在含Amp+LB固體培養(yǎng)基表面,37℃倒置培養(yǎng)10~12 h;挑取白色單克隆菌落,篩選陽(yáng)性菌液,送成都擎科梓熙生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

    1.6 提取質(zhì)粒與酶切鑒定

    根據(jù)質(zhì)粒提取試劑盒說(shuō)明書(shū)提取質(zhì)粒,將提取質(zhì)粒加入配制的PCR反應(yīng)液中,作PCR鑒定,反應(yīng)體系和程序分別與RT-PCR中反應(yīng)體系、程序相同。PCR產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

    將已提取的質(zhì)粒DNA用限制性?xún)?nèi)切酶EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切,酶切體系為:去離子水7 μL,質(zhì)粒DNA 5 μL,HindⅢ 1 μL,EcoRⅠ1 μL,1×M Buffer 4 μL,37℃水浴1 h。酶切產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

    1.7 生物信息學(xué)分析

    分析牦牛、犏牛MEISETZ基因CDS區(qū)序列,預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)及功能(見(jiàn)表1)。

    表1 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具Table 1 Protein sequence data analysis tools

    2 結(jié)果與分析

    2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果

    采用分光光度法測(cè)定本試驗(yàn)中獲得的RNA樣品,OD260/OD280≈2.0;經(jīng)1.5%瓊脂糖電泳檢測(cè)發(fā)現(xiàn),存在5 S、18 S和28 S條帶且條帶清晰(見(jiàn)圖1A),說(shuō)明RNA質(zhì)量較高,滿(mǎn)足后續(xù)試驗(yàn)要求。

    為得到MEISETZ基因CDS區(qū),以牦牛、犏牛睪丸組織cDNA為模板PCR擴(kuò)增,經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),獲得與預(yù)期片段長(zhǎng)度一致單一清晰條帶,長(zhǎng)度均為688 bp(見(jiàn)圖1B)。參照DNA純化回收試劑盒說(shuō)明書(shū)回收PCR產(chǎn)物,送成都擎科梓熙生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

    2.2 重組子鑒定

    挑取白色單一菌落,置于含Amp+LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng)4~6 h,提取質(zhì)粒后PCR擴(kuò)增,經(jīng)1.0%瓊脂糖電泳檢測(cè)。結(jié)果顯示,所提取質(zhì)粒成功擴(kuò)增目的條帶(見(jiàn)圖2A)。初步證明目的基因片段已重組到pGEM-T載體上。

    將提取的重組質(zhì)粒pGEM-T Vector-MEISETZ用限制性?xún)?nèi)切酶EcoRⅠ、HindⅢ酶切消化,消化產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖2B所示,得到2 692 bp載體序列和目的片段,說(shuō)明目的片段正向插入pGEM-T載體,成功構(gòu)建重組質(zhì)粒。

    2.3 序列比對(duì)

    經(jīng)克隆測(cè)序獲得牦牛(GenBank accession No.:EF432551)、犏牛(GenBank accession NO.:EF432552)MEISETZ基因CDS區(qū)序列長(zhǎng)度均為668 bp,編碼222個(gè)氨基酸殘基。將牦牛、犏牛與GenBank中人(GenBank accession No.:DQ388610)、小鼠 (Gen-Bank accession No.:BC023014)相應(yīng)基因核苷酸序列比對(duì)(見(jiàn)圖3),結(jié)果表明,牦牛與犏牛序列相比,共有4處發(fā)生堿基變異,分別位于第270、431、611、648位點(diǎn),一致性為99.4%;牦牛與人序列相比,共有121處發(fā)生堿基變異,一致性為81.9%;牦牛與小鼠序列相比,共有161處發(fā)生堿基變異,一致性為74.8%。

    2.4 系統(tǒng)進(jìn)化分析

    利用Mega 7.0軟件分析牦牛、犏牛、水牛、人類(lèi)、小鼠MEISETZ基因氨基酸序列(見(jiàn)圖4)。結(jié)果表明,犏牛與牦牛聚為一類(lèi),親緣關(guān)系最近,其次是人類(lèi)和小鼠,與水牛親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。

    2.5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)

    2.5.1 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析

    使用軟件ExPASy-ProtParam預(yù)測(cè)牦牛、犏牛MEISETZ蛋白理化性質(zhì)。牦牛和犏牛MEISETZ基因分子質(zhì)量分別為25.081和25.098 ku;蛋白等電點(diǎn)均為5.66,為偏酸性蛋白;帶負(fù)電荷氨基酸殘基(Asp+Glu)均為30個(gè),正電荷氨基酸殘基(Arg+Lys)均為24個(gè),其中絲氨酸(Ser)數(shù)量最多,均為23個(gè),占比10.4%,甲硫氨酸(Met)含量最少,均為1個(gè),且除丙氨酸(Ala)、甘氨酸(Gly)、谷氨酰胺(Gln)、脯氨酸(Pro)含量有差別外,其余氨基酸含量均相同;不穩(wěn)定指數(shù)分別為48.21、47.68,高于閾值40,表明牦牛和犏牛MEISETZ蛋白結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定;脂肪系數(shù)分別為65.9、65.45,說(shuō)明牦牛、犏牛該蛋白流動(dòng)性好;總平均親水系數(shù)(GRAVY)為-0.829、-0.848,結(jié)合ExPASy-ProtScale預(yù)測(cè)結(jié)果,牦牛、犏牛MEISETZ蛋白中大多數(shù)氨基酸為親水性,屬于親水性蛋白。

    2.5.2 二級(jí)結(jié)構(gòu)及三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

    利用在線(xiàn)軟件ExPASy-SOPMA預(yù)測(cè)牦牛、犏牛MEISETZ蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)(見(jiàn)圖5)。

    牦牛、犏牛該蛋白均含有α-螺旋(Hh)、無(wú)規(guī)則卷曲(Cc)、β-轉(zhuǎn)角(Tt)和延伸鏈(Ee),其中牦牛、犏牛無(wú)規(guī)則卷曲含量均最高,共135、124處,分別占二級(jí)結(jié)構(gòu)的60.81%、55.86%,β-轉(zhuǎn)角含量均最低,僅4.5%。

    采用ExPASy-SWISSMODEL在線(xiàn)軟件,選取與氨基酸序列相似性最高序列,基于PDB數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)其三級(jí)結(jié)構(gòu)模型(見(jiàn)圖6)。

    結(jié)果顯示,牦牛、犏牛MEISETZ蛋白均與4c1q.1模型相似性高達(dá)84.96%,三級(jí)結(jié)構(gòu)均以無(wú)規(guī)則卷曲為主,與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相符。

    2.5.3 保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)

    利用NCBI-CD Search預(yù)測(cè)牦牛、犏牛MEISETZ蛋白氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域(見(jiàn)圖7)。結(jié)果顯示,牦牛、犏牛MEISETZ蛋白均含有SET超家族結(jié)構(gòu)域,Trithorax(SET)結(jié)構(gòu)域超家族對(duì)應(yīng)于含有SET結(jié)構(gòu)域的賴(lài)氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶,對(duì)真核生物中基因激活和沉默的表觀遺傳調(diào)控至關(guān)重要。已證明SET域介導(dǎo)與雙特異性磷酸酶(dsPTPases)相似的蛋白質(zhì)家族相互作用。該蛋白與PR域鋅指蛋白7(PRDM7)和9(PRDM9)發(fā)現(xiàn)的PR-SET域高度重合。

    2.5.4 跨膜結(jié)構(gòu)及信號(hào)肽預(yù)測(cè)

    ExPASy-TMHMM預(yù)測(cè)表明牦牛、犏牛該蛋白氨基酸均位于細(xì)胞膜表面,無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域。使用ExPASy-TMPred在線(xiàn)軟件分析發(fā)現(xiàn),牦牛和犏牛MEISETZ蛋白包含2個(gè)較高可能的跨膜螺旋,無(wú)跨膜蛋白。牦牛、犏牛MEISETZ蛋白信號(hào)肽位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,MEISETZ蛋白無(wú)信號(hào)肽,均為非分泌型蛋白。

    2.5.5 磷酸化位點(diǎn)及糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

    在線(xiàn)軟件NetPhos預(yù)測(cè)顯示,牦牛、犏牛MEISETZ蛋白均包含31個(gè)潛在磷酸化位點(diǎn),其中Ser磷酸化位點(diǎn)均為20個(gè),4個(gè)Thr磷酸化位點(diǎn)(第6、46、61、180位),7個(gè)Tyr磷酸化位(第56、67、69、83、126、189、206位)。

    分別利用在線(xiàn)軟件ExPASy中NetOGlyc 4.0和NetNGlyc 1.0預(yù)測(cè)O、N糖基化位點(diǎn)。分析結(jié)果表明,牦牛MEISETZ蛋白含有14個(gè)O-糖基化位點(diǎn),犏牛MEISETZ蛋白存在12個(gè)O-糖基化位點(diǎn);牦牛、犏牛均在第1位檢測(cè)到1個(gè)潛在N-糖基化位點(diǎn),由于無(wú)信號(hào)肽的蛋白質(zhì)不可能暴露于N-糖基化機(jī)制,即使該蛋白包含潛在的糖基化位點(diǎn),也不可能在體內(nèi)被糖基化。

    2.5.6 亞細(xì)胞定位

    利用PSORTⅡPrediction在線(xiàn)軟件預(yù)測(cè)牦牛、犏牛MEISETZ蛋白功能,結(jié)果顯示,MEISETZ蛋白主要定位于細(xì)胞核(73.9%)中,在細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞外(包括細(xì)胞壁)中均占8.7%,4.3%分布于線(xiàn)粒體和過(guò)氧化物酶。

    2.5.7 蛋白互作分析

    STRING分析發(fā)現(xiàn),PRDM9與SPO11蛋白相關(guān)性高達(dá)0.976,與組蛋白家族中核小體組蛋白H2A、H2B相關(guān)性均高于0.9(見(jiàn)圖8)。SPO11是減數(shù)分裂重組所需的拓?fù)洚悩?gòu)酶6復(fù)合物成分,與TOP6BL共同介導(dǎo)DNA裂解,形成雙鏈斷裂(DSB),啟動(dòng)減數(shù)分裂重組;該復(fù)合物通過(guò)切割和連接循環(huán)促進(jìn)負(fù)、正超螺旋DNA松弛以及DNA脫級(jí)。

    3 討論

    犏牛雄性不育主要是由精子發(fā)生過(guò)程中減數(shù)分裂缺陷導(dǎo)致,導(dǎo)致減數(shù)分裂缺陷的機(jī)制仍未知。多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),MEISETZ可調(diào)控生殖細(xì)胞特異性基因表達(dá),影響細(xì)胞減數(shù)分裂[8-9]。犏牛由牦牛與黃牛雜交而來(lái),公牛表現(xiàn)為不育,F(xiàn)1代犏牛在屠宰率、胴體體重、肉、乳生產(chǎn)能力等方面均優(yōu)于牦牛[10],但犏牛不育問(wèn)題迄今尚未解決。本研究對(duì)牦牛、犏牛MEISETZ基因開(kāi)展克隆和生物信息學(xué)分析,初步探索MEISETZ與犏牛減數(shù)分裂阻滯引起的無(wú)精癥之間的可能聯(lián)系。

    3.1 MEISETZ基因核苷酸、氨基酸序列分析

    本研究使用DNAMAN軟件比對(duì)牦牛、犏牛MEISETZ基因核苷酸序列,結(jié)果表明,牦牛與犏牛相比,第270(C-T)和648(T-C)位點(diǎn)發(fā)生堿基轉(zhuǎn)換,431(C-G)和611(C-A)位點(diǎn)處發(fā)生堿基顛換,同源性為99.4%。Miyamoto等研究發(fā)現(xiàn),因減數(shù)分裂阻滯而導(dǎo)致無(wú)精子癥的日本男性患者精子發(fā)生受阻可能與外顯子6的614位核苷酸的等位基因C和外顯子9的1086位核苷酸的等位基因T有關(guān)[11]。因此,犏牛雄性不育可能與611、648位點(diǎn)突變有關(guān),但其具體調(diào)控機(jī)制還需進(jìn)一步驗(yàn)證。牦牛MEISETZ蛋白222個(gè)氨基酸序列與犏牛相比,僅2個(gè)位點(diǎn)發(fā)生變異,144位(A-G)由丙氨酸變?yōu)楦拾彼帷?04位(P-Q)由脯氨酸變?yōu)楣劝滨0?,氨基酸序列同源性?9.1%。王薇薇研究發(fā)現(xiàn),日糧中添加甘氨酸(Gly)提高新生和斷奶仔豬生長(zhǎng)性能[12];谷氨酰胺(Gln)具有增加力量、提高耐力作用。犏牛體型增大、役力更強(qiáng)、產(chǎn)奶、產(chǎn)肉性能的提高可能與第144、204位氨基酸突變存在關(guān)聯(lián)。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示,犏牛先與牦牛聚為一類(lèi),親緣關(guān)系最密切,表明牦牛與犏牛序列高度保守。牦牛與普通牛分屬于不同牛種,在基因DNA序列保持不變基礎(chǔ)上,基因功能在遺傳信息從DNA傳遞給RNA和蛋白質(zhì)的過(guò)程中可能發(fā)生變化,導(dǎo)致犏牛雄性不育。

    3.2 MEISETZ蛋白的性質(zhì)和功能分析

    本研究通過(guò)牦牛、犏牛MEISETZ蛋白理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),絲氨酸(10.4%)、脯氨酸(8.1%、7.7%)、谷氨酸(7.7%)、亮氨酸(9.0%)含量較高。絲氨酸在脂肪和脂肪酸新陳代謝及肌肉生長(zhǎng)中發(fā)揮重要作用[13],研究發(fā)現(xiàn)在小鼠陰莖海綿體[14]、食管下括約肌[15]均發(fā)現(xiàn)D-Ser發(fā)揮重要功能。亮氨酸可作為營(yíng)養(yǎng)增補(bǔ)劑、調(diào)味增香劑,谷氨酸增強(qiáng)食品風(fēng)味,且對(duì)動(dòng)物性食品有保鮮作用,故而牦牛、犏牛肉質(zhì)細(xì)嫩,味道鮮美。精氨酸(6.8%)具有促進(jìn)精子生成和提高精子活力功能[16],且在一定程度上改善家畜胴體組成及肉質(zhì)性狀指標(biāo)。本研究顯示,牦牛、犏牛MEISETZ蛋白理化性質(zhì)相似,推測(cè)犏牛雄性不育可能與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)無(wú)關(guān)。

    亞細(xì)胞定位表明牦牛、犏牛該蛋白主要定位于細(xì)胞核中,該蛋白對(duì)于核定位至關(guān)重要。保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)顯示,牦牛、犏牛MEISETZ蛋白均含有SET超家族結(jié)構(gòu)域,Trithorax(SET)結(jié)構(gòu)域超家族對(duì)應(yīng)于含有SET結(jié)構(gòu)域的賴(lài)氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶,對(duì)于真核生物中基因激活和沉默的表觀遺傳調(diào)控至關(guān)重要。研究發(fā)現(xiàn),MEISETZ具有催化三甲基活性,但對(duì)組蛋白-H3-賴(lài)氨酸4的單甲基和雙甲基無(wú)催化作用,且轉(zhuǎn)錄活性依賴(lài)其甲基化活性[6];在缺乏MEISETZ基因睪丸中,組蛋白-H3-賴(lài)氨酸4的三甲基減少,減數(shù)分裂基因轉(zhuǎn)錄被改變[7]。利用GAL4系統(tǒng)作反式激活分析表明,MEISETZ也可依賴(lài)其HMTase活性方式激活轉(zhuǎn)錄[6];MEISETZ可與轉(zhuǎn)錄活性相關(guān)蛋白質(zhì)(與RNAPolII相關(guān)的SET1)形成復(fù)合物[17-18]。該蛋白與PR域鋅指蛋白9(PRDM9)發(fā)現(xiàn)的PR-SET域高度重合。通過(guò)蛋白互作分析發(fā)現(xiàn),PRDM9蛋白與 HIST1H2BA、HIST2H2BE、HIST2H2AC等核小體組蛋白相關(guān)性均較高。HIST1H2BA(0.924)是一種H2B類(lèi)型的變異組蛋白,此蛋白在雄性生殖細(xì)胞中直接指導(dǎo)解離核小體轉(zhuǎn)化為魚(yú)精蛋白,完全取代經(jīng)典組蛋白H2B之前的核小體向魚(yú)精蛋白過(guò)渡,且可能充當(dāng)核小體解離因子,促進(jìn)組蛋白大規(guī)模交換。HIST2H2BE、HIST2H2AC、HIST1H2BN、HIST1H2BB和H2BFS均是核小體核心成分,在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)、DNA復(fù)制和染色體穩(wěn)定中發(fā)揮主要作用。

    3.3 犏牛雄性不育機(jī)理

    睪丸、腦RNA結(jié)合蛋白(Testis brain RNA-binding protein,TB-RBP)在睪丸和腦組織中可與靶基因mRNA特異性結(jié)合,主要參與減數(shù)分裂后部分靶基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),調(diào)控精子變態(tài)成形相關(guān)基因,是精子發(fā)生過(guò)程轉(zhuǎn)錄因子之一。柴志欣等通過(guò)牦牛、犏牛TB-RBP基因克隆及組織表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),TB-RBP蛋白屬于Translin結(jié)合蛋白家族,對(duì)精子發(fā)生等生物過(guò)程具有重要調(diào)控作用;TBRBP基因在牦牛中表達(dá)水平顯著高于犏牛(0.01<P<0.05)[19],TB-RBP基因是精子正常發(fā)育的關(guān)鍵基因,在犏牛睪丸組織中表達(dá)量較低,表明犏牛雄性不育與精子發(fā)生異常有關(guān)。

    多項(xiàng)研究表明哺乳動(dòng)物Y染色體部分快速退化可能是缺乏基因間重組,雄性基因變異和積累增加,使X染色體或常染色體與Y染色體形成遺傳互作[20-22]。TSPY相關(guān)序列和其他Y染色體高度重復(fù)序列、快速協(xié)同進(jìn)化和減數(shù)分裂期的基因重排的缺乏證實(shí)MSY進(jìn)化(易位,擴(kuò)增,刪除和基因轉(zhuǎn)變)具有水平效應(yīng)。

    TSPY抗原決定簇主要定位于精原細(xì)胞亞型的細(xì)胞質(zhì)和成人睪丸曲細(xì)精管基膜[23],且TSPY的精原細(xì)胞與鄰近低表達(dá)細(xì)胞成對(duì)存在。因精子發(fā)生受雄激素影響[24-25],若TSPY在介導(dǎo)精原干細(xì)胞進(jìn)入減數(shù)分裂期時(shí)具有重要作用,則其表達(dá)很可能受雄激素和雄激素受體調(diào)控;且由于一個(gè)或幾個(gè)其轉(zhuǎn)錄單元調(diào)控元件突變,或睪丸中激素環(huán)境變化產(chǎn)生機(jī)體中不適應(yīng)信號(hào),使TSPY不表達(dá)。張利亞等推測(cè)牦牛和犏牛TSPY蛋白參與雄性減數(shù)分裂過(guò)程中精原細(xì)胞、初級(jí)精母細(xì)胞調(diào)控[26]。官久強(qiáng)等通過(guò)黃牛、犏牛和牦牛睪丸組織TSPY基因熒光定量分析表明,TSPY基因拷貝數(shù)與犏牛雄性不育可能存在一定聯(lián)系[27]。

    推測(cè)雄性犏牛不育可能與以下兩方面遺傳機(jī)制有關(guān):大多數(shù)雄性犏牛減數(shù)分裂過(guò)程處于異常狀態(tài),為兩個(gè)牛種染色體基因性質(zhì)或位置差異所致[4]。但兩個(gè)親本牛種的染色體自發(fā)畸變頻率較高,如果具有不同遺傳背景的染色體畸變攜帶者雜交,產(chǎn)生的雜種個(gè)體在減數(shù)分裂時(shí)可能造成染色體無(wú)法配對(duì)聯(lián)會(huì),染色體之間發(fā)生同源片段或異源片段聯(lián)會(huì)等復(fù)雜情況,使減數(shù)分裂過(guò)程錯(cuò)亂。

    核質(zhì)互作關(guān)系也是導(dǎo)致雄性不育的可能因素。犏牛體細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)為母源,細(xì)胞核中一套染色體源于母體,另一套染色體源于父體。對(duì)于雄性犏牛,來(lái)自父本的Y染色體和一套常染色體,由于物種差異與母本的X染色體和另一套常染色體之間不協(xié)調(diào),且與來(lái)自母體的細(xì)胞質(zhì)不親和,影響雄性生殖功能有關(guān)基因表達(dá),出現(xiàn)生殖障礙問(wèn)題。

    4 結(jié)論

    本研究克隆牦牛、犏牛MEISETZ基因CDS區(qū)序列,比對(duì)其核苷酸、氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)2個(gè)位點(diǎn)氨基酸突變,推測(cè)其可能與犏牛雄性不育有關(guān),可為牦牛、犏牛MEISETZ基因結(jié)構(gòu)與功能研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),為進(jìn)一步研究犏牛雄性不育提供理論依據(jù)。

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