邢佳鑫 陳玲 柯學(xué) 鐘巧芳 張敦宇 付堅 陳越 肖素勤 王玲仙 王波 殷富有 陳麗娟 程在全*
(1 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院,昆明650201;2 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所/云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室,昆明650205;*通訊作者:650205czquan-99@163.com)
水稻白葉枯?。╞acterial blight)是世界范圍內(nèi)最嚴(yán)重的水稻細(xì)菌性病害,也是我國水稻三大病害之一。實踐證明,水稻白葉枯病沒有特效的化學(xué)防治試劑,而種植抗病品種是最為經(jīng)濟、安全和有效的防治措施。為了在水稻白葉枯病害常發(fā)區(qū)獲得理想的水稻產(chǎn)量,需要不斷培育攜有不同抗白葉枯病基因的品種,尤其是對廣譜抗病基因的發(fā)掘與利用,以抵御白葉枯病菌的變異[1]。
野生稻是現(xiàn)代栽培稻的始祖,由于長期處于野生狀態(tài),經(jīng)受了各種災(zāi)害和不良環(huán)境的自然選擇,蘊含了大量的優(yōu)良基因,是天然的基因?qū)殠靃2]。全世界稻屬中有22 個野生種,從中發(fā)掘可利用的抗病新基因并進(jìn)行育種利用,是近年來研究的熱點。迄今從野生稻中克隆的抗白葉枯病基因有 3 個,即 Xa21[3]、Xa23[4]和 Xa27(t)[5]。 另 外 ,Xa29(t)[6]、Xa30(t)[7]、Xa32(t)[8]、xa32(t)[9]和Xa35(t)[10]等5 個抗白葉枯病基因分別來自藥用野生稻、普通野生稻、澳洲野生稻、疣粒野生稻和小粒野生稻。這5 個抗白葉枯病基因已被定位在不同的染色體上,但目前尚未被克隆。可見,野生稻中的抗白葉枯病基因的發(fā)掘應(yīng)用還處于初級階段,從中開發(fā)利用廣譜高抗白葉枯病基因的前景廣闊,對改良栽培稻抗性、擴寬其遺傳基礎(chǔ)具有重大意義。
疣粒野生稻是中國現(xiàn)有三種野生稻資源之一,主要分布在云南和海南,擁有許多優(yōu)良性狀,具有很高的利用價值。過去一些研究表明,疣粒野生稻對白葉枯病抗性良好,發(fā)現(xiàn)其抗性從高抗到接近免疫[11-12]。然而,程在全等[13]利用 C1、X1、BD8438 和 CN9404 共 4 個菌株鑒定云南疣粒野生稻對白葉枯病的抗性時發(fā)現(xiàn),部分植株感供試菌株??梢姡颇橡嗔R吧緦Π兹~枯病菌的抗性并不一致。為了解云南疣粒野生稻對不同白葉枯病小種的抗性,尤其是對近年在云南部分稻區(qū)流行的白葉枯病菌的抗性,本研究利用本實驗室從2013 年至2017 年間收集的云南不同地區(qū)水稻白葉枯病菌株,以及國內(nèi)外部分標(biāo)準(zhǔn)強致病菌系,對云南疣粒野生稻12 個居群共36 份材料進(jìn)行了抗性鑒定,以為開發(fā)和利用云南疣粒野生稻抗白葉枯病基因提供科學(xué)依據(jù)。
供試的疣粒野生稻材料取自云南省不同地區(qū)的12 個居群,每個居群分別隨機采樣3 株,共36 份,其詳細(xì)來源見表1。金剛30 為感病對照材料。所有研究材料均種植于本實驗室溫室中。
供試水稻白葉枯病菌株:本研究中用到的菌株包括本實驗室從2013 年至2017 年間收集的18 個在云南省部分稻作區(qū)流行的白葉枯病菌,以及6 個國內(nèi)外部分標(biāo)準(zhǔn)強致病菌系,共24 個,詳細(xì)信息見表2。
表2 不同白葉枯病菌詳細(xì)信息
表3 接種水稻白葉枯病發(fā)病程度分級標(biāo)準(zhǔn)
對選取的疣粒野生稻材料進(jìn)行割茬處理,分栽到直徑為20 cm、高為15 cm 的花盆中,每份材料分栽24盆,進(jìn)行編號,澆透水,放置在溫室陰涼處,每隔1 周澆1 次水,待植株長至孕穗期時進(jìn)行接種鑒定。同時播種金剛30 種子于24 個直徑為21 cm、高為21 cm 的花盆中,進(jìn)行編號,放置在溫室中進(jìn)行正常水肥培養(yǎng)至孕穗期。將各材料相同編號的花盆放在一起,利于接種同一菌株。
本研究采用剪葉接種的方法進(jìn)行鑒定。接種前將在-20℃保存的菌種于NA 培養(yǎng)基上復(fù)壯,28℃~30℃培養(yǎng)48 h 后,用無菌水洗脫菌株,懸浮均勻,將菌懸液濃度調(diào)節(jié)為 3×108cfu/mL(OD600=0.5),用于接種試驗。手術(shù)剪滅菌后,蘸取制備好的病菌懸浮液,將供試材料葉片葉尖剪去1~3 cm,每株植株接種3 片以上葉片,以感病水稻金剛30 作為對照,并做好標(biāo)記。接種21 d 左右當(dāng)參試材料的病情發(fā)展趨于穩(wěn)定時,量取病斑長度,鑒定供試植株的抗病性,同時進(jìn)行拍照。
整理測量得到的數(shù)據(jù),抗性分級參考表3。根據(jù)對照材料金剛30 的發(fā)病等級,分析水稻白葉枯病菌的致病力,并按照抗性分級標(biāo)準(zhǔn)對供試植株進(jìn)行抗感分級,并利用Microsoft Excel 2010 進(jìn)行常規(guī)的數(shù)據(jù)統(tǒng)計,采用SPSS 19.0 進(jìn)行系統(tǒng)聚類分析疣粒野生稻的抗菌譜,以及計算眾數(shù)值、最小值、最大值、求和值、均值和均值標(biāo)準(zhǔn)差,進(jìn)行疣粒野生稻對白葉枯病抗性的量化分析,其中眾數(shù)值是指一組數(shù)據(jù)中,出現(xiàn)次數(shù)最多的標(biāo)志值,即為最普遍、最常見的標(biāo)志值,可了解疣粒野生稻哪種抗病類型最普遍;最小值是指樣本中取值最小的數(shù)據(jù)、最大值是指樣本中取值最大的數(shù)據(jù),根據(jù)最小值和最大值,可了解疣粒野生稻抗病類型的范圍;求和值是指一組數(shù)據(jù)所有取值的總和,均值表示某變量所有取值的集中趨勢或平均水平,根據(jù)求和值和均值,有利于挑選出抗性最優(yōu)的參試材料;均值標(biāo)準(zhǔn)差(Standard Error of Mean, SE.mean)是描述這些樣本均值與總體均值之間平均差異的統(tǒng)計量,可分析樣本間抗性差異程度。
表4 感病對照材料金剛30 接菌情況
圖1 36 份疣粒野生稻對白葉枯病菌抗性結(jié)果聚類分析
根據(jù)感病對照材料金剛30 的病斑長度,對其進(jìn)行抗感等級劃分,由等級劃分判斷接種菌株致病力。接種后14~21 d,金剛30 的發(fā)病病情趨于穩(wěn)定。接種后21 d調(diào)查發(fā)現(xiàn),金剛30 接種24 個白葉枯病菌的植株病斑長度都超過了20 cm(表4),葉片枯黃,而未接種病菌的植株葉片沒有發(fā)生任何變化,說明用于接種的白葉枯病病菌致病力沒有喪失,可用于接種參試材料。
疣粒野生稻接種后第21 d,出現(xiàn)了3 類癥狀5 種病斑。第一類癥狀為急性癥狀,像開水燙傷一樣,病斑有1 種,呈灰綠色。第二類癥狀為典型癥狀,病斑有4種:第1 種呈黃白色,第2 種呈淡黃白色,這兩種病斑部分病菌都向下蔓延,病斑往往較長;第3 種呈黃色,少數(shù)病菌向下蔓延,病斑稍短;第4 種呈褐色,病菌不蔓延,病斑長度一般為0.00~0.30 cm。第三類無病癥,癥狀與接種清水一樣,只有一個割傷的傷口痕跡。參試的材料中大部分材料表現(xiàn)第二類第4 種病斑。量取病斑長度進(jìn)行統(tǒng)計分析,根據(jù)抗性反應(yīng)的鑒定標(biāo)準(zhǔn),將36 份云南疣粒野生稻對供試菌株的抗性反應(yīng)進(jìn)行分級,結(jié)果顯示,絕大部分野生稻對參試的24 個菌株的抗性表型基本都處于高抗到免疫程度,抗性表現(xiàn)良好(表5)。
通過系統(tǒng)聚類法分析36 份疣粒野生稻的抗譜,可分為抗譜寬和抗譜窄兩大類,除居群5 中的3 份材料抗譜較窄之外,其余為抗譜寬類型,即相對于OM5-1、OM5-2 和OM5-3,其余33 份參試疣粒野生稻抗譜都較寬(圖 1)。
根據(jù)量取的每份疣粒野生稻的病斑長度,統(tǒng)計參試材料分別對24 個菌株抗性反應(yīng)的病斑長度的眾數(shù)值、極小值、極大值、求和值、均值及均值標(biāo)準(zhǔn)差,統(tǒng)計結(jié)果見表6。從表6 可見,眾數(shù)值最大為1.00 cm(高抗),最小為 0.00 cm(免疫),除 OM4-3、OM6-1 和OM6-2 這3 份材料眾數(shù)值稍大外,大部分的參試植株眾數(shù)值都為0.00 cm,說明對24 個菌株的抗性表現(xiàn)免疫的材料最為普遍。從最小值和最大值可知,參試材料的抗病范圍有4 種,第1 種是最小值到最大值在0.00~1.40 cm 之間(I~HR),第 2 種在 0.00~3.00 cm 之間(I~R),第 3 種在 0.00~6.00 cm 之間(I~MR),第 4 種在0.00~9.00 cm 之間(I~MS),其中第 1 種類型最多(占比44.44%),第4 種類型最少(占比僅2.78%)。從均值可看出,OM5-1 抗性最差,其平均病斑最長;18 份參試材料的均值小于等于0.20 cm(I),抗性較好,進(jìn)一步從求和值可看出,這18 份材料中OM2-1、OM8-2 和OM7-3的抗性表現(xiàn)特別突出,它們對24 個菌株抗性反應(yīng)的病斑長度相加起來的總和小于等于1.50 cm,而OM2-1的求和值最小,僅為0.68 cm,說明OM2-1 的抗性最優(yōu)。從標(biāo)準(zhǔn)差可看出,OM2-1 的標(biāo)準(zhǔn)差亦最小,說明OM2-1 對24 個菌株的抗性反應(yīng)差異最小,結(jié)合表5 可知,該份材料除對XOO5 菌株表現(xiàn)為高抗之外,對其余菌株的抗性反應(yīng)都為免疫,表明OM2-1 的抗譜最為廣泛;反之,OM5-1 的標(biāo)準(zhǔn)差最大,說明 OM5-1 對 24 個菌株的抗性反應(yīng)差異最大,抗譜最窄。
表5 疣粒野生稻對白葉枯病菌的抗感反應(yīng)
綜合以上結(jié)果說明,參試的疣粒野生稻對白葉枯病菌的整體抗性水平較好,44.44%野生稻對參試菌株表型處于高抗到免疫水平,并且抗病類型為免疫的表型最為普遍;OM5-1、OM5-2 和 OM5-3 這 3 份材料抗譜較窄,尤其是OM5-1,其余33 份參試材料抗譜都較寬,特別是OM2-1。
表6 參試材料對24 個菌株抗性反應(yīng)的量化指標(biāo)
統(tǒng)計疣粒野生稻對單一菌株不同抗性反應(yīng)類型的份數(shù),建立柱狀圖(圖2)。從圖2 可知,無論對哪個單一菌株的抗性,I 型和HR 型材料所占比例均較大,除對XOO3 菌株HR 型材料比I 型材料多外,參試材料對其余單一菌株的抗性反應(yīng)以I 型材料最多,具體表現(xiàn)如下:I 型材料中,免疫XOO3 菌株的材料最少,免疫XOO23 菌株的材料最多;HR 型材料中,高抗XOO23菌株的材料最少,高抗XOO3 菌株的材料最多;R 型材料中,抗XOO3 菌株材料最多,有4 個單一菌株(XOO9、XOO14、XOO23 和 XOO24)對參試材料沒有 R類型的抗性反應(yīng),即對于這4 個單一菌株的抗性反應(yīng)而言,R 型材料最少,為0 份;MR 型材料中,中抗XOO2 菌株稍多外,有一半以上的菌株對參試材料沒有MR 類型的抗性反應(yīng);MS 型材料中,只有1 份參試材料對XOO8 菌株出現(xiàn)MS 類型的抗性反應(yīng)。以上結(jié)果表明,參試的云南疣粒野生稻,除有1 份中感XOO8菌株外,其余參試材料對各單一菌株抗性良好,大多數(shù)達(dá)到了高抗到免疫的程度。
圖2 疣粒野生稻對單一菌株抗性反應(yīng)
圖3 不同居群的疣粒野生稻對白葉枯病菌抗性結(jié)果聚類分析
根據(jù)每個居群中3 份植株的病斑求取平均值,依據(jù)抗性反應(yīng)的鑒定標(biāo)準(zhǔn),統(tǒng)計12 個居群對參試菌株的抗性反應(yīng),結(jié)果見表7。12 個居群對大多數(shù)菌株抗性都達(dá)到了高抗到免疫程度,根據(jù)其抗病特性,進(jìn)一步進(jìn)行系統(tǒng)聚類,如圖 3 所示,可分為 A、B、C 和 D 四大類,其中 OM5 為 A 類,OM6 為 B 類,OM4、OM10、OM11 和OM12 為 C 類,OM1、OM2、OM3、OM7、OM8 和 OM9 為D 類。結(jié)合表7 可知,A 類的抗譜最窄,此類型對參試的白葉枯病菌的抗性表現(xiàn)為中抗到免疫,B 類較A 類抗譜稍寬,對參試白葉枯病菌的抗性表現(xiàn)為抗到免疫,C 類較A 和B 類抗譜更寬,對參試白葉枯病菌的抗性表現(xiàn)為高抗到免疫,D 類抗性程度雖與C 類一致,但對更多的參試菌株具有免疫能力,此類抗譜較C 類更寬,然而在D 類中,OM7 免疫的菌株更多,即OM7 的抗譜最廣。
以上結(jié)果顯示,除OM5 中抗部分參試菌株外,其余居群都是抗參試菌株。從表7 可見,OM5 對XOO2、XOO5、XOO8 和 XOO16 菌株中抗,病斑都在 3.1 cm 以上,其中對XOO8 菌株抗性反應(yīng)的病斑最長,達(dá)4.28 cm,即XOO8 對OM5 具有一定的致病力。
野生稻植株往往是遺傳雜合體,個體之間也存在遺傳背景差異。本研究以標(biāo)準(zhǔn)差的大小作為考核指標(biāo),評估接種同一菌株同一居群的3 份野生稻抗病能力的差異,標(biāo)準(zhǔn)差大,說明3 株間的病斑長度差異大,則抗病能力差異大,反之亦然。從表7 可看出,除OM3 外,其余疣粒野生稻居群對菌株抗性反應(yīng)的病斑長度標(biāo)準(zhǔn)差都有超過 1.0 的,其中,OM1、OM2、OM7、OM8、OM9、OM11 對1 個菌株的抗性反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)差超過1.0;OM4 和OM6 對 2 個菌株的標(biāo)準(zhǔn)差超過 1.0;OM5、OM10 和OM12 分別對10 個、7 個和6 個參試菌株的標(biāo)準(zhǔn)差超過1.0。由此說明,OM3 純合度高,植株之間抗病差異小,而其余11 個居群具有一定的雜合度,尤其OM5、OM10 和OM12,它們個體之間抗病能力差異較大,這3個居群雜合度相對較高。
綜上所述,云南12 個居群的疣粒野生稻對大多數(shù)白葉枯病菌抗性表現(xiàn)較好,除OM5 和OM6 之外,其余居群對參試的24 個菌株抗性都達(dá)到了高抗到免疫程度,特別是耿馬孟定(OM7)野生稻的抗性較其他居群好,景洪景訥(OM5)對在云南會澤流行的菌株(XOO8)抗性不強。同時,本研究也表明了大部分云南疣粒野生稻居群雜合度高,同一居群不同植株對白葉枯病的抗性差異大。
根據(jù)分析結(jié)果可知,無論以植株為單位還是以居群為單位,大部分疣粒野生稻對白葉枯病高抗甚至免疫,說明云南大部分疣粒野生稻攜有豐富的優(yōu)良白葉枯病抗性基因。特別是OM2-1 在抗性和抗譜方面都較其它供試材料好,該材料可能含有1 個甚至多個高抗白葉枯病基因。這些豐富的基因資源對遺傳研究和品種改良具有重要的價值。本研究還發(fā)現(xiàn),少部分疣粒野生稻中感個別菌株,這與程在全等[13]的研究結(jié)果一致,但據(jù)其報道的感病疣粒野生稻病斑長度最長為3.2
cm,若按本文的評價標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)為中抗,本文鑒定的最長平均病斑為6.85 cm,即到目前為止,未見相關(guān)文獻(xiàn)報道疣粒野生稻病斑特別長的,為此,筆者繼續(xù)同等條件種植培養(yǎng)管理,進(jìn)行接種,發(fā)現(xiàn)該份疣粒野生稻的病斑長度變化不大,推測溫室種植可能使疣粒野生稻自身的抗病能力下降,后續(xù)還需將該材料種植于室外,經(jīng)過多年種植之后再進(jìn)行接種鑒定,了解其是否感病。
表7 云南疣粒野生稻不同居群對24 個菌株的抗感反應(yīng)
由于寄主與病原菌之間存在互作關(guān)系,互作關(guān)系為親和關(guān)系時,植物寄主表現(xiàn)感病,互作關(guān)系為非親和關(guān)系時,植物寄主表現(xiàn)抗病[14]。所以,評價寄主抗性時,應(yīng)采用不同的生理小種進(jìn)行鑒定,以便最大限度鑒定出抗相應(yīng)小種的抗源,同時能較清楚抗源的抗譜,為充分發(fā)掘抗病基因奠定基礎(chǔ)。野生稻含有優(yōu)良的抗性基因,為了篩選出廣譜抗性基因,本研究選用不同的生理小種評價疣粒野生稻的抗性,從中篩選出多份廣譜高抗白葉枯病抗源。寄主與病原菌之間還存在協(xié)同進(jìn)化的關(guān)系,當(dāng)一個新的抗病品種大量推廣后,病菌方面就有相應(yīng)的新小種產(chǎn)生和流行,并導(dǎo)致抗病品種的抗性“喪失”,因而監(jiān)測抗病品種的抗性也必須堅持不懈地進(jìn)行[15]。疣粒野生稻對過去的菌株處于高抗到免疫的程度,了解疣粒野生稻是否對最近幾年流行的小種具有抗性尤其重要。從本研究結(jié)果可見,值得慶幸的是,云南疣粒野生稻對目前在云南流行的小種基本都還處于非親和關(guān)系。
目前,疣粒野生稻的抗性評價標(biāo)準(zhǔn)存在爭議。章琦等[12]認(rèn)為,病斑占葉面積百分率較能反應(yīng)試材的實際抗性水平,然而疣粒野生稻同一株葉片長短差異較大,短的才5 cm 左右,長的有20 cm 左右,若病斑都是2 cm,對于短的葉片來說就是高感,對于長的葉片就是中抗,那很難判定其抗感性。程在全等[13]以病斑長度為3 cm 作為抗感界限評價疣粒野生稻抗性,而其文中的病斑最長才3.2 cm,就被認(rèn)為感病。所以,筆者認(rèn)為,疣粒野生稻抗性評價標(biāo)準(zhǔn)還是應(yīng)以國際分級標(biāo)準(zhǔn)更為合理,即病斑長度小于0.2 cm 為免疫,0.2~1.5 cm 為高抗,1.6~3.0 cm 為抗,3.1~6.0 cm 為中抗,6.1~9.0 cm 為中感,9.1~20.0 cm 為感,大于 20.0 cm 為高感,同時應(yīng)在對照品種的病情發(fā)展趨于穩(wěn)定時進(jìn)行調(diào)查。然后,根據(jù)相應(yīng)結(jié)果優(yōu)先選取高抗的材料用于遺傳研究和品種改良,從而最大限度避免以上存在的問題。
本研究發(fā)現(xiàn),云南疣粒野生稻對白葉枯病的抗性與地理位置無關(guān),同一居群的材料有高抗甚至免疫的材料,也存在抗性稍差的材料。其余野生稻,如普通野生稻也存在類似情況[12,16],可能因為大多數(shù)的野生稻柱頭大而外露,異交結(jié)實率較高,造成同一地點采集的材料并不是1 個抗性純合體[12]。這提示我們,在野生稻接種鑒定時,同一居群應(yīng)選取3 株以上進(jìn)行考察,或首先應(yīng)對參試材料進(jìn)行親緣關(guān)系分析,分類之后再開展抗性鑒定試驗,從而充分的發(fā)掘出新的抗源。