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    人類TBC1D7蛋白的表達純化及其在mTOR通路中的作用機制研究

    2020-03-14 03:10:36蓋中朝
    關(guān)鍵詞:復(fù)合物質(zhì)粒通路

    蓋中朝, 王 兵

    (1.陜西科技大學食品與生物工程學院, 西安 710021; 2.貴州醫(yī)科大學生物與醫(yī)學工程重點實驗室, 貴陽 550025)

    mTOR (mammalian Target of Rapamycin) 信號通路是真核生物細胞中控制分解代謝和合成代謝過程的關(guān)鍵通路之一,在細胞生長、增殖和死亡過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用[1-3].在mTOR信號通路中,存在兩種由mTOR蛋白組成的核心復(fù)合物:mTORC1 (mammalian target of rapamycin complex 1) 和mTORC2 (mammalian target of rapamycin complex 2),前者由mTOR, Raptor, mLST8, Deptor和PRAS40亞基組成,對雷帕霉素較為敏感;后者由mTOR, Rictor, mLST8, mSin1, Deptor和Proctor1/2亞基組成,對雷帕霉素不敏感[4-5].mTORC1主要控制生物大分子的合成代謝和分解代謝、細胞周期調(diào)控、細胞生長、細胞自噬等工程;mTORC2主要負責細胞骨架調(diào)配、細胞存活和部分細胞代謝過程.mTORC1和mTORC2在空間結(jié)構(gòu)上較為近似,整個復(fù)合物以二聚體形式組成一個近似菱形的擬二重軸結(jié)構(gòu)[6-7].

    在mTOR信號通路中,TSC(Tuberous Sclerosis Complex)蛋白復(fù)合物位于mTORC1上游,且對后者具有負調(diào)控作用,TSC復(fù)合物由TSC1(Tuberous Sclerosis Complex 1)、TSC2(Tuberous Sclerosis Complex 2)和TBC1D7(TBC1 domain family member 7)三個亞基組成[4, 8].目前已知,TSC復(fù)合物與結(jié)節(jié)性硬化綜合癥有直接聯(lián)系,該病多見于皮膚、腦、腎、心臟和肺組織,臨床病理特征表現(xiàn)為面部皮脂腺瘤、癲癇發(fā)作和智能減退等[9-11].當前認為,結(jié)節(jié)性硬化癥的發(fā)病原因主要是由于TSC1和TSC2兩個腫瘤抑制基因發(fā)生突變所引起,二者所編碼的TSC1、TSC2蛋白和TBC1D7蛋白形成一個穩(wěn)定的TSC三亞基復(fù)合物.人類TBC1D7基因位于6號染色體上,全長TBC1D7蛋白包含293個氨基酸.有研究顯示,TBC1D7基因的突變會導致智障和巨腦癥的發(fā)生,一些偏頭痛患者基因組樣品中也存在TBC1D7基因的突變[12-13].

    鑒于TBC1D7蛋白在mTOR通路和人類多種疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控功能,所以對其生物學功能的研究就顯得尤為重要.本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),TBC1D7可以穩(wěn)定結(jié)合TSC1蛋白C末端區(qū)域,促進后者發(fā)生二聚化并維持此二聚結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性[14].目前已知,TSC1與TSC2蛋白相互作用,通過TSC2蛋白C末端的Rap-GAP結(jié)構(gòu)域來調(diào)控溶酶體膜表面Rheb蛋白的GTP/GDP結(jié)合狀態(tài),最終負調(diào)控mTORC1的活性[15-16].但是,TBC1D7在mTOR通路中所扮演的角色及其對下游mTORC1的調(diào)控形式,均需要進一步探索.本文以人類全長TBC1D7蛋白為研究對象,借助一系列分子生物學研究手段,通過一系列嘗試和探索,獲得了純化的TBC1D7蛋白,并通過在人類心肌細胞系(HCM)中高表達和敲降TBC1D7基因的表達,分析了TBC1D7對mTORC1復(fù)合物活化的影響.研究結(jié)果顯示,當人類心肌細胞細胞HCM高表達Flag-TBC1D7時,細胞內(nèi)S6K1蛋白Thr389磷酸化程度降低,表明mTORC1活化程度降低,而當HCM細胞內(nèi)TBC1D7表達被敲降時,檢測發(fā)現(xiàn)胞內(nèi)S6K1蛋白Thr389磷酸化升高,表明mTORC1活化程度提高.這一系列實驗證實了TBC1D7對mTORC1的活性調(diào)控發(fā)揮了重要作用.

    1 材料與方法

    1.1 試劑與引物

    PCR實驗所使用的高保真DNA聚合酶(貨號:AP221-02)購自天根生物工程有限公司;限制性內(nèi)切酶NdeI(1161A)、XhoI(1094A)、HindIII(1094A)、BamHI(1094A)、EcoRI(1040A)以及T4 DNA連接酶(2011A)購自日本寶生物公司;質(zhì)粒抽提試劑盒(GK2002-200)、PCR產(chǎn)物純化以及膠回收試劑盒(GK2043-200)購自上海捷瑞生物工程有限公司;LB培養(yǎng)基(A507002)購自上海生工生物工程有限公司;Trizol試劑(10296010)購自Thermo公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒(KR116-02)和定量PCR試劑(FP215-02)均購自天根生物工程有限公司;凝血酶(605157)購自美國Sigma公司;GAPDH(ab181602)、S6K1(ab9366)、TBC1D7(ab234684)、pS6K1(Thr389)(ab60948)一抗以及Protein A Beads(ab193255)購自澳大利亞Abcam公司;引物及shRNA均由擎科生物工程有限公司合成,序列信息如表1所示.

    表1 本研究中所使用的引物及shRNA序列

    注:小寫字母部分為酶切位點序列

    Notes: The lowercase parts are the sequence of digestion sites

    1.2 菌株、細胞和質(zhì)粒

    克隆構(gòu)建和原核表達所使用菌株為大腸桿菌EscherichiacoliTOP10菌株、EscherichiacoliBL21 (DE3);細胞實驗所使用細胞為人心肌細胞系HCM;pET28a、pcDNA-Flag、pGreenPuro表達載體均為本實驗室保藏.

    1.3 序列保守性分析及進化樹構(gòu)建

    從Uniprot數(shù)據(jù)庫中分別下載人類(Homosapiens, Q9P0N9)、原雞(Gallusgallus, A0A1L1RR07)、斑馬魚(Daniorerio, F1QRX7)、非洲爪蟾(Xenopuslaevis, F6UMY3)、家蠶(Bombyxmori, H9JMN1)、果蠅(Drosophilamelanogaster, Q9VCC4)以及粗壯厭氧真菌(Anaeromycesrobustus, A0A1Y1XIW3)的TBC1D7蛋白氨基酸序列,使用Clustal W 程序?qū)ζ溥M行序列比對.

    1.4 表達質(zhì)粒的構(gòu)建

    以人類TBC1D7基因cDNA為模板,使用高保真DNA聚合酶對目的片段進行擴增,擴增完畢后通過瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增結(jié)果,并切膠回收目的條帶,將切回的包含目的條帶的凝膠使用膠回收試劑盒進行溶膠和NDA回收,完畢后使用Nano-Drop設(shè)備檢測回收產(chǎn)物濃度.將化學合成的TBC1D7 shRNA在PCR儀中退火,收集產(chǎn)物以待連入載體中.

    使用限制性內(nèi)切酶對回收的擴增產(chǎn)物以及pET28a、pcDNA-Flag、pGreenPuro空載體在37 ℃水浴條件下酶切過夜,酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后再次進行純化回收,隨后使用Nano-Drop設(shè)備檢測產(chǎn)物濃度后,按照目的片段和載體3∶1的摩爾比將二者混合,使用T4 DNA連接酶連接二者,連接反應(yīng)在16 ℃條件下進行4 h.

    連接完畢后,取10 μL連接產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化E.coliTOP10感受態(tài)細胞.經(jīng)熱激和冰浴后,將感受態(tài)細胞加入1 mL LB培養(yǎng)基中活化,隨后離心附近菌體并將感受態(tài)細胞均勻涂布至卡那霉素抗性的LB平板中,37 ℃培養(yǎng)過夜.通過菌落PCR檢測平板上的單克隆,并挑取陽性克隆進行搖管培養(yǎng),14 h后提取質(zhì)粒并將質(zhì)粒送測序公司進行測序驗證.測序正確的質(zhì)粒樣品可用于下一步研究.

    1.5 蛋白的原核表達

    將構(gòu)建完成的pET28a-TBC1D7質(zhì)粒熱激轉(zhuǎn) 化E.coliBL21感受態(tài)細胞.第二天挑取單菌落接種至50 mL LB培養(yǎng)基中進行活化培養(yǎng),當菌液濃度達到A600=0.8~1.0時,再將菌液擴大培養(yǎng)至2 L LB培養(yǎng)基中. 當擴大培養(yǎng)的菌液濃度達到A600=0.8時,將培養(yǎng)溫度降至16度并加入終濃度為0.2 mmol·L-1IPTG進行誘導.在16 ℃條件下繼續(xù)培養(yǎng)16 h,隨后離心收集所培養(yǎng)的菌體,并使用Ni柱平衡液(25 mmol·L-1Tris-HCl pH 8.0, 300 mmol·L-1NaCl, 20 mmol·L-1咪唑)進行重懸.

    1.6 Ni2+-NTA親和層析

    使用高壓細胞均質(zhì)儀,在4 ℃條件下,以100 Mpa的壓力下進行破壁.反復(fù)破壁3次后,將菌液在4 ℃,20 000 g條件下離心40 min,以去除不溶物.在離心的同時,使用預(yù)冷的Ni柱平衡液平衡Ni2+-NTA重力柱,離心完畢后立即將上清取出,加入Ni柱中,反復(fù)結(jié)合2遍后使用Ni柱平衡液沖洗5倍柱體積,隨后分別以60 mmol·L-1、200 mmol·L-1、500 mmol·L-1咪唑洗脫液進行梯度洗脫,各濃度洗脫10 mL.根據(jù) Bradford 法測定蛋白質(zhì)含量,并使用12%濃度SDS-PAGE跑膠檢測蛋白純化情況.

    1.7 凝血酶酶切去除組氨酸標簽

    取純化的His-TBC1D7蛋白,使用5 kDa孔徑的透析袋在4 ℃條件下對其進行透析,透析緩沖液為PBS.透析12 h后,取出His-TBC1D7蛋白,根據(jù) Bradford 法測定蛋白質(zhì)含量并按照凝血酶單位數(shù)與蛋白毫克數(shù)為2∶1的比例加入凝血酶,繼續(xù)在4 ℃條件下酶切12 h.酶切完畢后,將酶切產(chǎn)物跑12% SDS-PAGE檢測酶切是否完全,若殘存有部分His-TBC1D7,可以將酶切產(chǎn)物再次掛Ni2+-NTA層析柱,反復(fù)掛兩邊并收集流出液,通過此步驟去除存留的His-TBC1D7蛋白.使用Bradford法再次測蛋白產(chǎn)物濃度.

    1.8 凝膠排阻層析

    將去除標簽后的TBC1D7蛋白使用10 kDa截留孔徑的超濾濃縮管,在4 ℃,4 000 g條件下進行離心濃縮,直至總體積小于2 mL.隨后使用AKTA 蛋白液相層析系統(tǒng)(GE)結(jié)合Superdex200凝膠排阻層析柱(GE),進行層析分離.收集洗脫峰,跑SDS-PAGE膠檢測并將蛋白濃縮保存,最終獲得在溶液中狀態(tài)均一的TBC1D7蛋白.

    1.9 細胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染

    HCM細胞使用添加了10%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基,在37℃,5% CO2培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng),每2~3 d傳代一次.細胞轉(zhuǎn)染使用Lipo3000試劑,每6 cm培養(yǎng)皿使用15 μL轉(zhuǎn)染試劑以及10 μg質(zhì)粒(總量),轉(zhuǎn)染完畢5 h后換入新鮮培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24或48 h,收集細胞進行下一步實驗.

    1.10 定量PCR

    將細胞使用Trizol試劑提取總RNA,完畢后使用Nano-Drop設(shè)備測產(chǎn)物濃度.將總RNA使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒進行反轉(zhuǎn)錄,參照實際說明書進行,反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物再次測量濃度后分裝備用.使用反轉(zhuǎn)錄cDNA進行定量PCR擴增,使用2×SYBR qPCR mix試劑,設(shè)置20 μL擴增體系.使用BioRad CFX96 定量PCR儀進行擴增和數(shù)據(jù)讀取.擴增數(shù)據(jù)處理使用2-ΔΔCT方法進行處理分析,實驗重復(fù)3次.

    1.11 免疫沉淀及免疫印跡

    使用含0.1% BSA的細胞裂解液稀釋Flag抗體,將50 μL Protein A Beads加入1 mL抗體稀釋液,在4 ℃條件下孵育結(jié)合2 h.孵育完畢后將Beads清洗5遍.隨后加入裂解后的組織總蛋白,在4 ℃條件下旋轉(zhuǎn)孵育過夜,離心后收集Beads.使用細胞裂解液清洗5遍后,將Beads使用1×Loading buffer 煮沸,離心收集上清備用.

    將免疫沉淀獲取樣品使用10% SDS-PAGE電泳分離,完畢后將PAGE膠在200 mA橫流條件下濕轉(zhuǎn)75 min,于低溫條件下進行.轉(zhuǎn)膜完畢后使用含5%脫脂奶粉的TBS-Tween溶液進行封閉,隨后一抗4 ℃孵育過夜,洗膜3次后再次以HRP二抗室溫孵育60 min,完畢后洗膜3次并使用ECL藥水進行化學發(fā)光檢測.

    1.12 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)分析

    從PDB數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org)中下載TBC1D7結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)(PDB id: 4Z6Y),使用PyMOL軟件(版本:1.7)對TBC1D7分子進行靜電勢和保守性分析及顯示[17-18].

    2 結(jié)果與分析

    2.1 氨基酸序列保守性分析

    人類TBC1D7蛋白包含293個氨基酸,從功能方面而言,該蛋白具有TBC1結(jié)構(gòu)域(第50~231位氨基酸區(qū)域),具有Rab-GAP活性,可以直接激活Rab蛋白的GTPase活性[19].該功能在進化上較為保守,多物種來源的TBC1D7序列相似性較高,其在物種進化過程中保持高度的保守性,尤其是其N端結(jié)構(gòu)域(圖 1).一般而言,在進化上保持高度保守的蛋白在生命活動中大多扮演著重要角色,這也在一定程度上可以解釋為何TBC1D7基因突變與人類多種疾病有關(guān).

    圖1 多物種來源TBC1D7蛋白氨基酸序列比對Fig.1 Sequence alignment of TBC1D7 from different species

    2.2 人類TBC1D7蛋白分子表面殘基保守性及電勢能分析

    在得到TBC1D7蛋白氨基酸序列保守性結(jié)果后,進一步分析了人類TBC1D7蛋白三維結(jié)構(gòu)信息,計算了蛋白分子表面電勢能以及表面殘基保守性.

    結(jié)果顯示,人類TBC1D7蛋白空間結(jié)構(gòu)近似“半月形”,表面均勻分布了正負電荷,疏水區(qū)較少.進一步的表面保守性顯示,人類TBC1D7蛋白表面保守殘基較為集中,主要位于“半月形”結(jié)構(gòu)的背部,該結(jié)果說明有潛在的相互作用蛋白與TBC1D7在該區(qū)域結(jié)合(圖2).

    2.3 TBC1D7的克隆與表達

    目前用于蛋白表達的系統(tǒng)有使用較多的有大腸桿菌表達系統(tǒng)、昆蟲細胞表達系統(tǒng)和哺乳動物細胞表達系統(tǒng),相比較而言,三者中大腸桿菌表達系

    A) 人類TBC1D7蛋白三維結(jié)構(gòu)表面靜電勢,藍色為正電區(qū),紅色為負電區(qū),灰色為疏水中性區(qū)域;B) 人類TBC1D7蛋白三維結(jié)構(gòu)表面殘基保守性分析,青色區(qū)域為非保守氨基酸區(qū)域,灰色為中度保守區(qū),紫紅色區(qū)域為高度保守區(qū)A) Electrostatic potential of TBC1D7: blue regions represents positive, and red regions represents negative; B) Surface conversation of human TBC1D7: cyan region represents variable residues and purple means conversed residues圖2 人類TBC1D7蛋白分子表面殘基保守性及電勢能分析Fig.2 Electrostatic potential and surface conversation of human TBC1D7

    統(tǒng)最為經(jīng)濟、快捷,可以用于多種原核和真核生物來源基因的高效表達.pET28a質(zhì)粒是一種較為常用和高效的原核表達載體,在N 端和C 端各有一個6×His標簽,在His標簽之后存在thrombin酶切位點,載體啟動子為T7啟動子, 目的基因被克隆到質(zhì)粒載體上,受噬菌體強轉(zhuǎn)錄及翻譯信號控制,并且目的蛋白的表達將被T7終止子所終止蛋白翻譯,蛋白質(zhì)的表達可由IPTG誘導.

    全長TBC1D7基因包括882 bp,通過酶切位點分析后選擇了NdeI和XhoI兩個限制性酶切位點,通過引物合成和后續(xù)的PCR過程,將其連在了目的片段的兩端.將目的片段和pET28a載體分別通過酶切和回收,隨后完成連接、轉(zhuǎn)化和表達鑒定過程(圖3A、3B).

    由于采用了低溫誘導的策略來表達目的蛋白,所以得到的蛋白大多為可溶蛋白,通過高壓破碎細胞壁后,蛋白從菌體內(nèi)部釋放出來.由于TBC1D7蛋白融合表達His標簽,根據(jù)組氨酸與Ni2+離子特異性吸附的特點,使用Ni2+-NTA柱來純化目的蛋白.將破壁離心后的菌液反復(fù)掛柱數(shù)次,隨即使用平衡液沖洗除雜.最終,通過60 mmol·L-1、200 mmol·L-1和500 mmol·L-1咪唑溶液梯度洗脫,收集洗脫樣品.由于His-TBC1D7蛋白的理論分子量約為36 kDa,所以為了方便清楚地鑒定蛋白純化結(jié)果,使用12% SDS-PAGE凝膠來分離目的蛋白,發(fā)現(xiàn)在200 mmol·L-1咪唑濃度條件下,大部分蛋白可以被洗脫下來,并且純度較高(圖3C).

    2.4 TBC1D7蛋白的純化

    在親和層析完畢后,得到了在N端融合有His標簽的TBC1D7蛋白.考慮到His標簽可能會對后續(xù)蛋白功能研究存在影響,需要去除TBC1D7蛋白N端融合的His標簽.由于pET28a載體在His標簽與目的蛋白之間存在一個凝血酶酶切位點(Leu-Val-Pro-Arg-Gly-Ser)編碼序列,所以該載體表達的蛋白也存在著該酶切位點.

    由于通過Ni2+親和層析所得到蛋白融合中存在這較高濃度的咪唑,而高濃度的咪唑比例與酶切的進行,所以通過透析的手段去除了蛋白溶液中所含的高濃度咪唑.隨后通過使用凝血酶將His標簽與TBC1D7蛋白切開,并通過進一步的凝膠排阻層析手段來最終得到純化的TBC1D7蛋白.根據(jù)Superdex200凝膠排阻層析柱標準品洗脫相對分子量公式計算,發(fā)現(xiàn)TBC1D7蛋白的表觀相對分子量為38 k, 非常接近理論分子量36 k,由此推斷,TBC1D7蛋白在溶液中以單體形式存在.層析完畢后,收集最終的洗脫蛋白并通過Bradford方法測蛋白濃度,發(fā)現(xiàn)通過該策略最終每升大腸桿菌菌液可以獲得12 mg純化的TBC1D7蛋白(圖4A、B).

    圖3 TBC1D7的克隆與表達A) 雙酶切方法驗證所構(gòu)建的表達質(zhì)粒,左側(cè)泳道為空載體酶切產(chǎn)物,箭頭所指為目的片段;B)轉(zhuǎn)化后大腸桿菌表達檢測;C)Ni2+親和層析純化His-TBC1D7融合蛋白;WCL:全細胞裂解液;P:沉淀;SUP:上清;FT:流穿液;60、200、500分別為 60,200,500 mmol/L 咪唑緩沖液洗脫的蛋白組分Fig.3 Clone and expression of TBC1D7A)Double digestion of constructions;B)Expression of transformed E.coli;C)Purification of His tagged TBC1D7 protein through Ni2+ affinity chromatography; WCL:Whole cell lysate;P: Pellet;SUP:Supernatant;FT:Flow through;60、200、500: 60,200,500 mmol·L-1 imidazole buffer elution

    A) TBC1D7蛋白經(jīng)Superdex200凝膠排阻層析柱洗脫峰形圖;B) 12% SDS-PAGE 檢測A圖中的各洗脫組分A) Elution curve of SEC; B) Elution fractions dissolved in 12% SDS-PAGE圖4 凝膠排阻層析純化TBC1D7蛋白Fig.4 Purification of TBC1D7 through Size exclusion chromatography

    2.5 TBC1D7的過表達和敲降

    首先我們構(gòu)建了過表達質(zhì)粒:pcDNA-Flag-TBC1D7和敲降質(zhì)粒:pGreenPuro-shTBC1D7,并將構(gòu)建的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HCM細胞,分別于0 h(對照)、24 h和48 h收集細胞,提取總RNA并反轉(zhuǎn)錄.定量PCR實驗對檢測基因高表達和敲降水平,對擴增結(jié)果進行t-test分析,結(jié)果證實所構(gòu)建的TBC1D7過表達(圖5A)和敲降(圖5B)質(zhì)粒均可有效地發(fā)揮作用,在轉(zhuǎn)染后24 h即可顯著上調(diào)或下調(diào)TBC1D7的表達.

    A) TBC1D7的過表達檢測;B) TBC1D7的敲降檢測.圖中**表示p<0.01A) Overexpression of TBC1D7. B) Knock-down of TBC1D7. ** indicates p<0.01.圖5 定量PCR檢測TBC1D7的過表達和敲降Fig.5 Up-and down-regulation of TBC1D7 measured by qPCR

    A) WB檢測TBC1D7表達水平的改變對mTORC1下游S6K1磷酸化的影響;圖B)與C),WB條帶的相對灰度比例A) The phosphorylation level of S6K1(Thr389) that affected by up-and down-regulation of TBC1D7; B) and C) Quantitative of the gray scale of western blot bands in A圖6 TBC1D7表達水平的改變對mTORC1活性的影響Fig.6 The activity change of mTORC1 that affected by TBC1D7

    2.6 TBC1D7表達水平的改變對mTORC1活性的影響

    目前已知TBC1D7是TSC復(fù)合物的重要組成部分,然而TBC1D7在人類心肌細胞中對mTOR信號通路的影響尚有待確定[8].本研究中,以人心肌細胞系HCM為研究對象,通過高表達和敲降TBC1D7來改變胞內(nèi)TBC1D7的表達水平,檢測mTOR信號通路中mTORC1復(fù)合物活化水平標志物:S6K1蛋白Thr389殘基的磷酸化情況,以確定TBC1D7的表達對mTORC1活化水平的影響.實驗結(jié)果顯示,當在HCM細胞中高表達TBC1D7時,胞內(nèi)S6K1蛋白Thr389磷酸化程度降低,表明mTORC1活性受到抑制,而當HCM細胞內(nèi)TBC1D7被敲降時,胞內(nèi)S6K1蛋白Thr389磷酸化升高,表明mTORC1活化程度提高(圖6).這一系列實驗證實了在人心肌細胞中TBC1D7對mTORC1的活性調(diào)控發(fā)揮了重要的負調(diào)控作用.

    2.7 TBC1D7與mTOR信號通路蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡(luò)分析

    為進一步深入了解TBC1D7在mTOR信號通路中的作用和功能,從String數(shù)據(jù)庫下載并分析了人類TBC1D7蛋白的相互作用網(wǎng)絡(luò)[20].圖中綠色節(jié)點(Nodes),如TSC1,TSC2,AKT1等代表TBC1D7的第一層(Fist shell)相互作用蛋白,在功能上具有非常緊密的聯(lián)系(圖7).除此之外,TBC1D7的相互作用網(wǎng)絡(luò)中包含諸如mTOR,Rheb, EIF4EBP1, MAPK, GSK3B等mTOR信

    圖7 TBC1D7與mTOR信號通路蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)Fig.7 Protein-protein network of TBC1D7 and mTOR signaling pathway

    號通路關(guān)鍵蛋白.由此可見,TBC1D7蛋白在mTOR信號通路中發(fā)揮了重要的調(diào)控作用.

    3 討論

    作為真核細胞內(nèi)調(diào)節(jié)細胞代謝的關(guān)鍵途徑,當mTOR通路中某個或某些蛋白發(fā)能功能受損時,真核生物機體則產(chǎn)生對應(yīng)的病理性變化.對于人類而言,目前已在包括直腸癌、胃癌、乳腺癌和前列腺癌等惡性腫瘤疾病中發(fā)現(xiàn)mTOR蛋白的功能性突變[21-23];TSC1/TSC2的突變致使其對下游mTORC1復(fù)合物抑制作用減弱,導致結(jié)節(jié)性硬化癥的發(fā)病[9];此外,mTOR信號通路異常也被認為與阿爾茨海默癥和昆廷頓舞蹈病等神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病相關(guān)[24-26].正因為其在真核生物體內(nèi)發(fā)揮著極其關(guān)鍵的作用,mTOR信號通路從20世紀90年代初被發(fā)現(xiàn)至今仍在世界范圍內(nèi)被諸多實驗室深入研究,但截止當前,依然有許多未知之處等待深入研究.

    除了已知的TSC1/2蛋白,真核細胞內(nèi)還存在著其它效應(yīng)蛋白可以介導TBC1D7蛋白的功能發(fā)揮.有研究人員發(fā)現(xiàn)果蠅體內(nèi)TBC1D7蛋白可以通過胰島素信號來調(diào)控機體生長,而這一過程不依賴TSC1/2[27].本研究中,蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)顯示AKT1和AKT3均與TBC1D7存在相互作用,有相關(guān)研究證實AKT可以磷酸化TBC1D7蛋白第124位絲氨酸(Ser),通過磷酸化來調(diào)控后者與14-3-3ζ及β-TrCP2的相互作用,而14-3-3ζ又可通過與mTORC1復(fù)合物中Raptor亞基相互作用來抑制復(fù)合物的激酶活性[28-29].

    作為mTOR信號通路的重要一員,TBC1D7蛋白與TSC1、TSC2形成三元復(fù)合物,以復(fù)合物形式發(fā)揮功能,此TSC復(fù)合物的功能異??蓪е陆Y(jié)節(jié)性硬化的發(fā)病.結(jié)節(jié)性硬化通常會導致心臟組織發(fā)生病變,心臟橫紋肌瘤(cardiac rhabdomyoma)是結(jié)節(jié)性硬化癥常見的臨床表現(xiàn)之一,此癥狀常在胎兒時期出現(xiàn),嚴重影響了胎兒的正常發(fā)育[30-31].對TSC復(fù)合物的作用機理進行研究可進一步了解結(jié)節(jié)性硬化的發(fā)病,并促進新型診療手段的出現(xiàn).雖然目前尚未在結(jié)節(jié)性硬化癥患者中發(fā)現(xiàn)有TBC1D7基因突變的情況,但是目前已知TBC1D7基因的突變卻可以導致其他一些神經(jīng)系統(tǒng)疾病,例如巨頭癥、智障、視神經(jīng)萎縮等[12,32].此外,有研究者發(fā)現(xiàn),相較于野生型小鼠,糖尿病模型小鼠心臟組織中TBC1D7蛋白表達顯著下調(diào),進一步的相互作用網(wǎng)絡(luò)分析顯示TBC1D7作為一個潛在的調(diào)節(jié)因子參與至糖尿病性心肌病的調(diào)控之中[33].因此,對TBC1D7蛋白的生物學功能研究就顯得尤為重要.本研究建立了一種簡單有效的人類TBC1D7蛋白的表達純化策略,并研究了在人類心肌細胞中TBC1D7的表達與其下游mTOR信號通路之間的聯(lián)系,發(fā)現(xiàn)TBC1D7蛋白可負調(diào)控下游mTORC1復(fù)合物激酶活性,并與mTOR信號通路蛋白網(wǎng)絡(luò)存在緊密聯(lián)系.本研究為人類TBC1D7蛋白和mTOR信號通路的進一步研究打下了良好基礎(chǔ).

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